СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 609
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.07-04Б1.55

Yonesaki, Tetsuro.
The purification and characterization of gene 59 protein from bacteriophage T4 [Text] / Tetsuro Yonesaki // J. Biol. Chem. - 1994. - Vol. 269, N 2. - P1284-1289 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Очистка и характеристика белка гена 59 бактериофага T4
Аннотация: К группе генов, продукты к-рых участвуют в рекомбинации фага T4 (uvsX, uvsY, 32, 46, 47), относится и ген 59. В трансфектантах Escherichia coli, содержащих плазмиду с соотв. клоном, синтезируется белок 26 кД, после очистки его мол. м. оценили в 23 кД. Он представляет мономер, связывает как одно-, так и двунитевую ДНК (первую с большей эффективностью), связывание сопровождается образованием агрегатов. Ренатурация однонитевой ДНК в присутствии белка 59 происходит более интенсивно. В отличие от белков uvsX, uvsY или продукта гена 32 для образования комплекса белка 59 с фрагментом однонитевой ДНК требуется 5-минутная инкубация. Среди др. рекомбинационных белков изученный продукт гена 59 имеет максимальную аффинность к белку 32 - известному белковому компоненту фага T4, к-рый за счет кооперативного взаимодействия с однонитевой ДНК значительно увеличивает ее жесткость. Япония, Dep. Biol., Coll. Gen. Education, Osaka Univ., Osaka 560. Библ. 30

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
T4
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК ГЕНА 59
ОДНОНИТЕВАЯ ДНК
ОЧИСТКА
ХАРАКТЕРИСТИКА

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 95.07-04Б4.163

Boyd, Jessica M.
DNA sequences and characterization of dtxR alleles from Corynebacterium diphtheriae PW8-, 1030-, and C7hm723- [Text] / Jessica M. Boyd, Kimberly C. Hall, John R. Murphy // J. Bacteriol. - 1992. - Vol. 174, N 4. - P1268-1272 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Последовательность ДНК и характеристика аллелей dtxR из Corynebacterium diphteriae PW8-, 1030- и C7hm723-.
Аннотация: Клонировали, секвенировали и охарактеризовали DtxR (зависимый от железа регуляторный элемент гена дифтерийного токсина tox) из штаммов PW8-, 1030- и C7hm723- Corynebacterium diphteriae. Последовательность (ПС) dtxR из PW8- идентична таковой из С7-, секвенированной ранее, ПС из 1030- на 91,4% идентична ПС из С7-, однако предсказанная аминокислотная ПС DtxR из 1030- отличается только в 6 из 678 аминокислот. Более того, показано, что DtxD из всех 3 штаммов регулирует экспрессию 'бета'-галактозидазы с промотор-оператор. (toxPO)-lacZ транскрипционного слияния. В противоположность описанному аллель dtxR из нечувствительного к железу конститутивного мутанта C7hm723 имеет транзицию G-!A, что проявляется в замене Arg47'-'His47 и в потере регуляторной активности tox в рекомбинантном штамме Escherichia coli. Библ. 29. США, [J. R. Murphy], Evans Dep. of Clin. Res. and Dep. of Med., The Univ. Hosp., Boston Univ. Med. Ctr., Boston, MA 02118.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.25.07
Рубрики: CORYNEBACTERIUM DIPHTERIAE (BACT.)
ШТАММ PW8 (-), 1030 (-)
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК DTXR
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Hall, Kimberly C.; Murphy, John R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.71

Identification of linear DNA sequences that specifically bind the adeno-associated virus rep protein [Text] / Douglas M. McCarty [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 8. - P4988-4997 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Идентификация последовательностей линейной ДНК, специфически связывающих белок Rep аденоассоциированного вируса
Аннотация: Белок Rep68 (IA) аденоассоциированного вируса (ААВ) специфически связывается с синтетич. олигонуклеотидом, содержащим область стебля А (СА) длиной 25 п. н. в отсутствие других последовательностей из концевого повтора TR AAB. Белок Rep78 (1B) также связывается с СА и м. б. очищен методом аффинной хроматографии на колонке с ДНК, содержащей СА. Способность связываться с СА является механизмом, с помощью к-рого I ориентируется на ТR так, что только правильная нить ДНК разрезается в сайте trs терминального разрешения. Компьютерный анализ показал, что подобные СА последовательности содержатся в 3 промоторных областях ААВ. Методом задержки при электрофорезе доказано присутствие сайтов связывания I в промоторах p5 и p19 и в ДНК плазмид pBR322. В промоторе p5 этот сайт расположен между инициаторной последовательностью YY1 и блотом TATA. I, взаимодействуя c YY1 или TBP, может действовать как репрессор и как транс-активатор транскрипции p5. Сравнение сайтов связывания I в СА, p5 и pBR332 показало, что частью узнаваемой I последовательности является повторяющийся мотив ГАЦЦ. IA и IB могут разрезать в сайте tsr субстраты, не содержащие палиндромы B и C и не имеющие вторичной структуры. Это показывает, что для разрезания в tsr достаточно СА и функционального сайта tsr и что такой механизм может быть использован для процессинга димерных молекул в молекулы мономерной длины во время репликации ДНК AAB. Эти данные показывают, что концевой повтор AAB является областью начала репликации ДНК, состоящей из 3 частей: СА, сайта tsr и палиндромов B и C. США, Dep. Microbiol., School of Med., Univ. of Stony Brook, Stony Brook, NY 11794. Библ. 38

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУС
ДНК ВИРУСНАЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
McCarty, Douglas M.; Pereira, Daniel J.; Zolotukhin, Irene; Zhou, Xiaohuai; Ryan, John H.; Muzyczka, Nicholas

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.11-04Б1.48

Sun, Daekyu.
Cooperative binding of the 21-base-pair repeats of the SV40 viral early promoter by human Sp1 [Text] / Daekyu Sun, Laurence H. Hurley // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 32. - P9578-9587 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Кооперативное изгибание повторов 21 п. н. раннего промотора вируса SV40 белком Sp1 человека
Аннотация: Общая структура мультимерного комплекса фактора транскрипции Sp1 (I) с повтором 21 п. н. (II-21) в раннем промоторе вируса SV40 изучена методами футпринтинга ДНК радикалами OH{.}, взаимодействия с (+)-CC-1065 (зондом, связывающимся с малой канавкой и вызывающим изгибание ДНК) и анализа циркуляризации. Показано, что II-21 имеет характерный изгиб, к-рый стабилизируется при насыщающем связывании I за счет ДНК-белковых и белок-белковых взаимодействий с образованием выпетленной структуры. Стабилизированные I изгибы ДНК направлены в сторону малой канавки и расположены между каждым из сайтов связывания I. На основании этих данных предложена модель выпетленной структуры для мультимерных комплексов I с тремя II-21 в ДНК SV40. Эта модель позволяет объяснить ингибирование базального уровня транскрипции при образовании сайт-специфических триплексных комплексов ДНК. США, Coll Pharm., Univ. Texas, Austin, TX 78712-1074. Библ. 53?

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС SV40
ФАКТОР ТРАНСКРИПЦИИ SP1
ПРОМОТОР
ПОВТОРЯЮЩАЯСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ИЗГИБАНИЕ ДНК
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНГИБИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Hurley, Laurence H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.11-04Б1.121

Tinker, Rachel L.
Detecting the ability of viral, bacterial and eukaryotic replication proteins to track along DNA [Text] / Rachel L. Tinker, George A. Kassavetis, E.Peter Geiduschek // EMBO Journal. - 1994. - Vol. 13, N 22. - P5330-5337 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Обнаружение способности вирусного, бактериального и эукариотического белков репликации перемещаться вдоль ДНК
Аннотация: Белок gp45 (I) фага Т4, 'бета'-субъединица (II) ДНК-полимеразы III Escherichia coli и эукариотич. ядерный антиген пролиферирующих клеток PCNA (III) участвуют в репликации ДНК в роли факторов процессивности соответствующих ДНК-полимераз, а I служит также транскрипц. активатором, сопрягающим экспрессию поздних генов с репликацией ДНК. Репликативные и транскрипц. функции I зависят от его способности перемещаться вдоль ДНК. Способность I-III к перемещению вдоль ДНК изучена методом фотосшивки. Показано, что эти белки загружаются на ДНК только их видоспецифичными факторами сборки (gp44-62, 'гамма'-комплексом и фактором RF-C соотв.). Для I и II плотность потока вдоль ДНК определяется динамич. равновесием между непрерывно идущими процессами загрузки и разгрузки с ДНК и зависит от взаимодействия со связывающими однонитевую ДНК белками (gp32 и SSB). США, Dep. of Biol., Univ. of California, San Diego, La Jolla, CA 92093-0634. Библ. 44

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ПРОЦЕССИНГ
МЕХАНИЗМ
БЕЛОК
GP45
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА III
СУБЪЕДИНИЦА БЕТА
ЭУКАРИОТИЧЕСКИЙ АНТИ ГЕН ПРОЛИФЕРИРУЮЩИХ КЛЕТОК
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Kassavetis, George A.; Geiduschek, E.Peter

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.11-04Б1.277

An intrinsic-tryptophan-fluorescence study of phage 'ФИ'29 connector/nucleic acid interactions [Text] / Maria Angeles Urbaneja [et al.] // Eur. J. Biochem. - 1994. - Vol. 225, N 2. - P747-753 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Изучение взаимодействий коннектора фага 'ФИ'29 и нуклеиновых кислот методом характеристической флуоресценции триптофана
Аннотация: Белок р10 (I) фага 'ФИ'29, собранный в коннекторы, проявляет характеристич. флуоресценцию (ХФ) с максимумом при 335 нм, что указывает на гидрофобное окружение 3 остатков трп в I. При инкубации с линейной, но не с кольцевой ДНК ХФ коннектора уменьшается. Уменьшение ХФ не наблюдается при инкубации линейной ДНК с коннекторами, подвергнутыми протеолизу и лишенными домена связывания с ДНК, так что тушение ХФ вызвано связыванием I с ДНК. Изучение тушения ХФ акриламидом (II) обнаружило, что при связывании коннектора с ДНК остатки трп становятся более доступными для II. Денатурация белка гуанидином*HCl (III) в присутствии линейной ДНК происходит при более низкой концентрации III, чем в отсутствие ДНК, что указывает на изменение конформации коннектора 'ФИ'29 при взаимодействии с линейной ДНК. Подвергнутые протеолизы коннекторы денатурируются при одной и той же концентрации III независимо от присутствия ДНК. Коннекторы 'ФИ'29 связывают также РНК, но это взаимодействие не влияет на тушение ХФ II и на денатурацию III. Способность взаимодействовать с РНК сохраняется и после протеолиза коннекторов. Это подтверждает гипотезу, согласно к-рой коннекторы фага 'ФИ'29 имеют 2 независимых домена для связывания с ДНК и РНК. Испания, Dep. de Bioquimica y Biol. Molecular, Facultad de Ciencias, Univ. del Pais Vasco, E-48080 Bilbao. Библ. 34

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ФИ 29
СИНТЕЗ
БЕЛОК
P10
КОННЕКТОРЫ
СБОРКА
СТРУКТУРА
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Urbaneja, Maria Angeles; Rivas, Susana; Carrascosa, Jose L.; Valpuesta, Jose Maria

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 96.02-04К1.278

Promoter activity of the proliferating-cell nuclear antigen gene is associated with inducible CRE-binding proteins in interleukin 2-stimulated T lymphocytes [Text] / Danyang Huang [et al.] // Mol. and Cell. Biol. - 1994. - Vol. 14, N 6. - P4233-4243 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Активность промотора гена ядерного антигена размножающихся клеток (PCNA) в T-лимфоцитах, стимулированных интерлейкином-2, связана с индуцируемыми CRE-связывающими белками
Аннотация: Проводили измерения активности люциферазы под контролем 5' фланкирующего участка ДНК PCNA при временной экспрессии в клетках L2, стимулированных интерлейкином-2 (IL2). Сегмент 5' фланкирующей последовательности длиной 182 п. н. оказался достаточным для полной активности промотора. Наибольшее падение этой активности происходило при делеции тандема CRE сайтов в положении от -37 до -52. С помощью опытов по изменению подвижности в геле обнаружили несколько ДНК-белковых комплексов, образующихся после стимуляции клеток IL2. В них идентифицировали CRE-связывающий белок (CREB) и фактор, активирующий транскрипцию, (ATF1), специфически взаимодействующие с ДНК PCNA-CRE. Связывание этих белков с сайтами CRE подтверждено опытами по ингибированию метилирования. Мутации в участке PCNA-CRE приводили к исчезновению ДНК-белковых комплексов, индуцируемых обработкой IL2, и уменьшению активности промотора. США, Dep. Pathol. Labor. Med., Sch. Med., Univ. Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania 19104. Библ. 80

ГРНТИ	34.43.35

ВИНИТИ 341.43.35.15.05
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ЯДЕРНОГО АНТИГЕНА
ПРОМОТОР
АКТИВНОСТЬ
ИНТЕРЛЕЙКИН-2
СТИМУЛЯЦИЯ
БЕЛОК CRE
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
КЛЕТКИ L2
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Huang, Danyang; Shipman-Appasamy, Pierette M.; Orten, Dana J.; Hinrichs, Steven H.; Prystowsky, Michael B.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.12

Petri, Victoria.
Thermodynamic and kinetic characterization of the binding of the TATA binding protein to the adenovirus E4 promoter [Text] / Victoria Petri, Mark Hsieh, Michael Brenowitz // Biochemistry. - 1995. - Vol. 34, N 31. - P9977-9984 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Термодинамическая и кинетическая характеристика связывания с промотором E4 аденовируса связывающегося с TATA-блоком белка
Аннотация: Методом количественного ДНК-азного футпринтинга изучена термодинамика связывания с промотором E4 аденовируса белка ТВР (I) Saccharomyces cerevisial, связывающегося с TATA-блоком. Связывание хорошо описывается полиномом Лэнгмюра. Анализ по методу Ван-Гоффа обнаружил нелинейную зависимость связывания от т-ры с макс. сродством при 30'ГРАДУС'. Стандартное изменение теплоемкости 'ДЕЛЬТА'C[p]{o}=-3,5'+-'0,5 ккал/моль*К. Зависимость связывания I с промотором E4 от конц-ии KCl показала, что при образовании комплекса смещаются 3,6'+-'0,3 ионов K{+}. В интервале рН 5,9-8,7 взаимодействие I с промотором не ассоциировано со связыванием H{+}. Константа скорости второго порядка ассоциации I с промотором E4 k[a]=(5,2'+-'0,5)*10{8} M{-1} c{-1} при рН 7,4 и 30'ГРАДУС' в присутствии 100 мМ KCl, 5 мМ MgCl[2] и 1 мМ CaCl[2]. График Аррениуса также нелинеен и дает 'ДЕЛЬТА'C[p]{o}=-3,2'+-'0,3 ккал/моль*K. Т. обр. 'ДЕЛЬТА'C[p]{o} обусловлено в основном лимитирующей скорость стадией связывания I. Библ. 62

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
ГЕН E4
ПРОМОТОРЫ
БЕЛОК
БЕЛОК TBP, TATA-БЛОК СВЯЗЫВАЮЩИЙ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE
СВЯЗЫВАНИЕ
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Hsieh, Mark; Brenowitz, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.199

Rodda, David J.
Multi-strand binding of nuclear factors to a repressor of mouse mammary tumor virus transcription can be distinguished kinetically [Text] / David J. Rodda, Ward Giffin, Robert J. G. Hache // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1995. - Vol. 209, N 1. - P379-384 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Многонитевое связывание ядерных факторов с репрессором транскрипции вируса опухоли молочной железы мышей можно различить кинетически
Аннотация: Длинный концевой повтор (LTR) вируса опухоли молочной железы мышей содержит элемент NRE1, репрессирующий транскрипцию в зрелых Т-клетках. Ядерные экстракты Т-клеток Jurkat содержат белки, к-рые специфически связываются с днДНК NRE1 либо с "верхней" или "нижней" нитями этой ДНК. Показано, что связывание с 3 формами ДНК NRE1 можно различить кинетически. Скорости связывания белков с днДНК и с верхней и нижней нитями ДНК равны соотв. 1,5, 3 и 11 мин. Связывание очень стабильно и белки освобождаются из комплексов с днДНК и верхней нитью за 30-60 мин и из комплекса с нижней нитью за 12 ч. Укороченная форма NRE1, к-рая взаимодействует только в виде днДНК, связывается за 4 мин и освобождается за 4 ч

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ВИРУС ОПУХОЛИ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ МЫШЕЙ
РЕПРЕССОРЫ
ФАКТОРЫ ЯДЕРНЫЕ
МНОГОНИТЕВОЕ СВЯЗЫВАНИЕ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ЛИМФОЦИТЫ T
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Giffin, Ward; Hache, Robert J.G.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI16) 96.06-04В3.29

Kneidl, Christine.
An intrinsically bent region upstream of the transcription start site of the rRNA genes of Arabidopsis thaliana interacts with an HMG-related protein [Text] / Christine Kneidl, Erika Dinkl, Friedrich Grummt // Plant Mol. Biol. - 1995. - Vol. 27, N 4. - P705-713 . - ISSN 0167-4412
Перевод заглавия: Изогнутый участок ДНК, лежащий выше сайта инициации транскрипции генов рРНК Arabidopsis thaliana взаимодействует с белком, относимым к группе высоко подвижных белков
Аннотация: Между тандемно расположенными генами рРНК Arabidopsis thaliana обнаружили центр изгиба ДНК. Показали, что этот участок локализован в позициях -284 - -256 выше сайта инициации транскрипции. Фрагмент 143 п. н., содержащий центр изгиба, взаимодействует с несколькими ядерными белками, один из которых отнесли к группе высоко подвижных белков, к-рые, как полагают, участвуют в процессах транскрипции и репликации. Германия, Inst. Biochem., Biozentrum, Am Hubland, D-97074 Wurzburg. Библ. 34

ГРНТИ	34.31.19

ВИНИТИ 341.31.19.27.35
Рубрики: ДНК
ИЗОГНУТЫЙ УЧАСТОК
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
БЕЛОК
ГРУППЫ HMG
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ARABIDOPSIS THALIANA

Доп.точки доступа:
Dinkl, Erika; Grummt, Friedrich

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.08-04Б1.162

Interaction between a geminivirus replication protein and origin DNA is essential for viral replication [Text] / Elizabeth P. B. Fontes [et al.] // J. Biol. Chem. - 1994. - Vol. 269, N 11. - P8459-8465 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Взаимодействие между репликативным белком геминивируса и областью начала репликации ДНК существенно для вирусной репликации
Аннотация: Изучены взаимодействия in vitro и in vivo между белком AL1 (I) вируса золотистой мозаики томата (ВЗМТ) и областью начала репликации (ОНР) ДНК ВЗМТ. Конкуренция in vitro показала, что элемент длиной 13 п. н. (5'-GGTAGTAAGGTAG), состоящий из 2 прямых повторов 5 п. н. и центральной сердцевины длиной 3 п. н., является сайтом связывания с высоким сродством к I. ДНК, содержащие 3'-повтор и сердцевину (TAAGGTAG и CCTAGTAAGGTAG), более сильно конкурируют за I, чем ДНК, содержащие 5'-повтор и сердцевину (GGTAGTAA и GGTAGTAAACCTAG). Анализ репликации в протопластах табака показал, что связывание I с цис-элементом ОНР существенно для репликации ДНК ВЗМТ. ДНК, содержащие мутации в любом из 2 повторов, не реплицируются, если I экспрессируется в транс-положении с экспрессионного вектора. ДНК с мутацией в 5'-повторе (CCTAGTAAGGTAG) реплицируется, если в транс-положении экспрессированы I и белок AL3 (II). ДНК с мутацией в 3'-повторе (GGTAGTAACCTAG) не реплицируется даже в присутствии I и II. Эти данные позволяют предположить, что связывание I с 3'-повтором является существенной стадией в репликации ДНК ВЗМТ, а связывание I с 5'-повтором усиливает репликацию. США, Dep. Biochem., N. Carolina St. Univ., Raleigh, NC 27695-7622. Библ. 60

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ЗОЛОТИСТОЙ МОЗАИКИ ТОМАТА
ДНК
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ВАРИАЦИИ
БЕЛОК РЕПЛИКАТИВНЫЙ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РЕПЛИКАЦИЯ
ВИРУСНАЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕМИНИВИРУСЫ

Доп.точки доступа:
Fontes, Elizabeth P.B.; Eagle, Patricia A.; Sipe, Patrick S.; Luckow, Verne A.; Hanley-Bowdoin, Linda

12.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 96.09-04Н1.66

Targeted melting and binding of a DNA regulatory element by a transactivation of c-myc [Text] / Leonard Bazar [et al.] // J. Biol. Chem. - 1995. - Vol. 270, N 14. - P8241-8248 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Направленное плавление и связывание регуляторных элементов ДНК в результате трансактивации [гена] c-myc
Аннотация: Регуляторный элемент FUSE протоонкогена c-myc стимулирует активность промотора в случае, если с ним связан трансдействующий фактор FBP, к-рый связывает некодирующую цепь в одноцепочечном состоянии, т. е. для связывания фактора необходимо предварительное расплетание ДНК. Показано, что FBP обуславливает плавление ДНК на коротком участке. В силу негативной суперспирализации ДНК в области FUSE расплетание ДНК под действием FBP является более вероятном в этом месте. Обнаруженная связь между локальным расплетанием днДНК и связывание цис-элемента активатором транскрипции имеет широкое применение в регуляции экспрессии генов эукариот. США, Dep. Pathol., Georgetown Univ. Sch. Med., Washington, DC 20007. Библ. 33

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.15.15.09
Рубрики: ПРОТООНКОГЕНЫ
ГЕН C-MYC
ПРОМОТОР
ЭКСПРЕССИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЭЛЕМЕНТ FUSE
БЕЛОК FBP
КОМПЛЕКС FUSE/FBP
ДНК
РАСПЛЕТАНИЕ ЛОКАЛЬНОЕ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
КЛЕТКИ HL60

Доп.точки доступа:
Bazar, Leonard; Meighen, Deborah; Harris, Violaine; Duncan, Robert; Levens, David; Avigan, Mark

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.12-04Б1.101

Gu, Baohua.
Repression of activator-mediated transcription by herpes simplex virus ICP4 via a mechanism involving interactions with the basal transcription factors TATA-binding protein and TFIIB [Text] / Baohua Gu, Ruhul Kuddus, Neal A. DeLuca // Mol. and Cell. Biol. - 1995. - Vol. 15, N 7. - P3618-3626 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Репрессия опосредованной активатором транскрипции белком ICP4 вируса простого герпеса через механизм с участием взаимодействий с базальными факторами транскрипции: белком, связывающимся с TATA, и TFIIB
Аннотация: Белок ICP4 (I) вируса простого герпеса является как активатором, так и репрессором транскрипции. I подавляет активаторные функции белка VP16 и самого I. I ингибирует транскрипцию, мешая образованию комплексов инициации и не влияя на элонгацию. Для репрессии активаторной функции необходимо присутствие сайта связывания I на расстоянии 45 п. н. с 3'-стороны от TATA-блока. Связывание с ДНК необходимо, но не достаточно для репрессии. I образует тройные комплексы с белком TBP (II) и фактором TFIIB (III) на ДНК, содержащей сайт связывания I и TATA-блок. Для эффективной репрессии нужны домен связывания с ДНК и область I, дающая возможность образовывать комплексы I-II-III. Репрессия наблюдается только тогда, когда сайт связывания I находится в положении, благоприятном для образования комплекса I-II-III. Эти данные позволяют предположить, что I репрессирует транскрипцию, связываясь с ДНК специфически, взаимодействуя с базальным аппаратом транскрипции и ингибируя какой-то общий этап в действии активаторов. США, Dep. Mol. Genet. and Biochem., Univ. Pittsburg Sch. Med., Pittsburgh, PA 15261. Библ. 53

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС ПРОСТОГО ГЕРПЕСА
БЕЛОК ICP4
РЕПРЕССИЯ ЭФФЕКТИВНАЯ
БЕЛОК TATA-СВЯЗЫВАЮЩИЙ
ФАКТОР ТРАНСКРИПЦИИ TFIIB
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
МЕХАНИЗМЫ

Доп.точки доступа:
Kuddus, Ruhul; DeLuca, Neal A.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.01-04Б1.104

Schwartz, Ruth.
Site-specific binding of the human cytomegalovirus IE2 86 kDa protein to an early gene promoter [Text] : [Abstr.] Keystone Symp. "Basic Aspects Transcr.", Keystone, Colo, 13-20, 1994 / Ruth Schwartz, Marvin H. Sommer, Deborah H. Spector // J. Cell. Biochem. - 1994. - Suppl. 18c. - P53 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Сайт-специфическое связывание белка IE2 86 кД цитомегаловируса человека с промотором ранних генов
Аннотация: Предранний белок IE2 (I) цитомегаловируса (ЦМВ) человека является главным транс-активатором промотора ранних генов UL112-113. Стимуляция I этого промотора зависит не только от TATA-блока, но и от области между положениями -58 и -113, являющейся главной регуляторной областью промотора. В полную активацию вносят вклад и другие 5'-фланговые сайты. Методом связывания с глутатион-агарозой изучено связывание составного белка глутатион-S-трансфераза-I с ранним промотором в присутствии и в отсутствие ядерного экстракта клеток человека. Сайты связывания I картированы методом ДНК-азного футпринтинга. I связывается с 2 специфическими доменами раннего промотора ЦМВ: 1) очень сильно - с областью от -146 до -120, гомологичной цис-сигналу репрессии CRS главного предраннего гена ЦМВ; 2) более слабо - с не гомологичной CRS областью между -113 и -86. Связывание I с вторым доменом усиливается в 2 раза в присутствии ядерного экстракта клеток U373MG. С использованием набора делеционных мутантов I установлено, что домен связывания ДНК занимает большую область в C-концевой половине I. США, Dep. Biol., Univ. California, San Francisco, CA 92093-0116

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ЦИТОМЕГАЛОВИРУС
БЕЛОК IE2
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКОЕ СВЯЗЫВАНИЕ
ГЕНЫ
РАННИЕ
ПРОМОТОР
ЭКСПРЕССИЯ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Sommer, Marvin H.; Spector, Deborah H.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.01-04Б4.82

Michan, Carmen M.
The Escherichia coli MelR transcription activator: Production of a stable fragment containing the DNA-binding domain [Text] / Carmen M. Michan, Stephen J. W. Busby, Eva I. Hyde // Nucl. Acids Res. - 1995. - Vol. 23, N 9. - P1518-1523 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Активатор MelR Escherichia coli: продукция стабильного фрагмента, содержащего домен связывания с ДНК
Аннотация: Сконструирован набор делеций в клонированном гене melR Escherichia coli, кодирующем активатор транскрипции MelR (I) генов пути деградации мелибиозы. Получены 9 мутантных I с N-концевыми делециями разной длины и изучены их свойства in vivo и in vitro. Ни один из укороченных I не активирует транскрипцию с промотора melAB, но 3 мутанта I: MelR220, MelR183 (IА) и MelR173 (IВ) - ингибируют активацию промотора melАВ полноразмерным I, кодируемым хромосомным геном. IА и IВ замедляют электрофоретич. миграцию фрагментов ДНК, содержащих промотор melАВ. IВ гиперпродуцирован в экспрессионной системе Т7. IВ стабилен in vivo в течение 2 час. ДНК-азный футпринтинг показал, что IВ связывается с промотором melАВ и защищает те же сайты, что и I дикого типа. Великобритания, School of Biochem., Univ. of Birmingham, Birmingham B15 2TT. Библ. 29

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: БЕЛОК
MELR
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Busby, Stephen J.W.; Hyde, Eva I.

16.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 97.03-04Н1.130

DNA binding specificities of Spi-1/PU.1 and Spi-B transcription factors and identification of a Spi-1/Spi-B binding site in the c-fes/c-fps promoter [Text] / Dominique Ray-Gallet [et al.] // Oncogene. - 1995. - Vol. 11, N 2. - P303-313 . - ISSN 0950-9232
Перевод заглавия: Специфичность связывания с ДНК факторов транскрипции Spi-1/PU.2 и Spi-B и идентификация сайта связывания Spi-1/Spi-B в промоторе [гена] c-fes/c-fps
Аннотация: Факторы транскрипции (ТФ) Spi-1/PU.2 и Spi-B специфичны для гематопоетических клеток и являются наиболее дивергированными членами сем. Ets-ТФ. Это сем. ТФ характеризуется наличием консервативного N-концевого ДНК-связывающего домена (Ets-домен длиной 85 аминок-т), к-рый распознает ДНК-мишени с кором 5'-GGAA/T-3'. Проведен скрининг статистического набора олигонуклеотидов на связывание с этими ТФ и показано, что сайты связывания Spi-1 и Spi-B имеют очень сходные нуклеотидные последовательности и эти ТФ повидимому, не различатся по специфичности ДНК-мишеней. Сайт-связывания Spi-1/Spi-B идентифицирован в промоторной области протоонкогена c-fes/c-fps, кодирующего тирозинкиназу и экспрессируемого преимущественно в миелоидных клетках. Синтезированные in vitro ТФ Spi-1 и Spi-B связываются с этим сайтом и активируют промотор гена c-fes/c-fps в составе репортерных конструкций в трансфицированных клетках HeLa и эндогенный промотор в клетках линии HL-60. В то же время в клетках Raji, экспрессирующих оба ТФ, промотор гена c-fes/c-fps связывает только Spi-1. Обсуждаются функциональные различия 2-х ТФ с одинаковой специфичностью ДНК-мишеней in vitro. Франция, U.248 INSERM, Fac. Med. Lab. Saint-Louis, 75010 Paris Cedex. Библ. 27

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.03.15.09
Рубрики: ПРОТООНКОГЕНЫ
ГЕН C-FES/C-FPS
ПРОМОТОР
САЙТ СВЯЗЫВАНИЯ SPI-1/SPI-B
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ФАКТОР SPI-1/PU.2
ФАКТОР SPI-B
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ
МИЕЛОИДНЫЕ КЛЕТКИ

Доп.точки доступа:
Ray-Gallet, Dominique; Mao, Catherine; Tavitian, Armand; Moreau-Gachelin, Francoise

17.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 97.03-04Н1.135

Rozek, Dieter.
In vivo protein-DNA interaction at the c-jun promoter in quiescent and serum-stimulated fibroblasts [Text] / Dieter Rozek, Gerd P. Pfeifer // J. Cell. Biochem. - 1995. - Vol. 57, N 3. - P479-487 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Взаимодействие белок-ДНК in vivo в промоторе (гена) c-jun в покоящихся и стимулированных сывороткой фибробластах
Аннотация: Ген c-Jun является членом семейства генов раннего ответа на митогенную стимуляции и индуцируется в течение нескольких мин после добавления сыворотки в среду культивирования фибробластов. Методом футпринтинга in vivo проведен анализ взаимодействий белок-ДНК в промоторе c-jun в покоящихся и стимулированных сывороткой фибробластах. Комплексы белок-ДНК, дающие футпринты, идентифицированы в 6 участках промоторной зоны. Среди них 2 AP-1-сайта, CCAAT-блок, Sp1-сайт, сайт-NF-jun и элемент ответа на сыворотку, а также - последовательность, связывающая неизвестный фактор транскрипции. Все эти сайты связаны с белками в покоящихся клетках, а при стимуляции их роста сывороткой дополнительные ДНК-белковые взаимодействия в этой зоне не обнаружены. Предполагается, что экспрессия c-jun опосредуется через фосфорилирование трансактиваторных доменов факторов транскрипции, связанных с промотором этого гена. США, Dep. Biol., Beckman Res. Inst. of the City of Hope, Duarte, CA 91010. Библ. 41

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.03.15.09
Рубрики: ОНКОГЕНЫ
ГЕНЫ
ГЕНЫ РАННЕГО ОТВЕТА
ГЕН С-JUN
ПРОМОТОР
САЙТ AP-1
САЙТ SP1
ЭЛЕМЕНТ ОТВЕТА НА СЫВОРОТКУ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ФИБРОБЛАСТЫ
ПОКОЯЩИЕСЯ
СТИМУЛИРОВАННЫЕ СЫВОРОТКОЙ

Доп.точки доступа:
Pfeifer, Gerd P.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 97.03-04К1.262

A novel signal transduction pathway utilized by GM-CSF [Text] : abstr. Keystone Symp. "Hematopoiesis", Breckenridge, Jan. 4-11, 1994 / J. Rosen [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1994. - Suppl. 18a. - P30 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Новый путь передачи сигнала утилизируемый посредством колониестимулирующего фактора гранулоцитов-макрофагов

ГРНТИ	34.43.37

ВИНИТИ 341.43.37.17
Рубрики: КОЛОНИЕСТИМУЛИРУЮЩИЙ ФАКТОР ГРАНУЛОЦИТОВ-МАКРОФАГОВ
ИНДУЦИРУЮЩЕЕ ДЕЙСТВИЕ
ИНТЕРФЕРОН
ПЕРЕДАЧА СИГНАЛА
МЕХАНИЗМЫ
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Rosen, J.; Seidel, H.M.; Kessler, L.V.; Suto, C.; Stein, R.B.; Lamb, P.

19.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 97.06-04Н1.79

Nilsson, Mats.
Activated Ha-ras but not TPA induces transcription through binding sites for activating transcription factor 3/jun and a novel nuclear factor [Text] / Mats Nilsson, Rune Toftgard, Staffan Bohm // J. Biol. Chem. - 1995. - Vol. 270, N 20. - P12210-12218 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Активированный [белок] Ha-Ras, но не форболовый эфир (TPA), индуцирует транскрипцию посредством сайтов связывания для фактора активации транскрипции 3/Jun и для нового ядерного фактора
Аннотация: Для анализа сходства/различия сигнальных путей в кератиноцитах 12-O-тетрадеканоилфорбол-13-ацетата (TPA) и активированного Ha-Ras использовали CAT-конструкцию с длинными концевыми повторами ретротранспозона VL30. При котрансфекции клеток эпидермиса мыши выявили фрагмент 20 п. н., чувствительный к белку Ha-Ras (RRE) или фактору роста фибробластов, но не TPA. RRE имеет структуру 5'-GGACATGAC TCCTTAGTTAc-3' с мотивом TGACTCC в ср. части, к-рый отличается единственной заменой от канонического AP1-сайта. Методом сдвига ЭФ-подвижности установили, что выявленный фрагмент представляет адресную мишень для компонентов комплекса 3, включающих гомо- и/или гетеродимеры активируемого фактора транскрипции и различных изотипов Jun. Для образования ДНК-белкового комплекса наиболее критична структура блока TTAGTTAC, примыкающего с 3'-конца к AP1-подобному сайту. Кроме указанных белков, с этим блоком связывается активность, выделенная из ядерного экстракта BalB/MK мыши и очищенная на суперозе 12. Новый фактор имеет мол. м. 178 кД и представляет глобулу с радиусом Стокса 43,6 А. Швеция, Ctr Nutrit., Karolinska Inst., NOVUM, S-14157 Huddinge. Библ. 41

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.03.15.09
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ФАКТОР 3/JUN
ЯДЕРНЫЙ ФАКТОР
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ 20 П. Н.
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
МЫШИ
КЕРАТИНОЦИТЫ

Доп.точки доступа:
Toftgard, Rune; Bohm, Staffan

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.07-04Б1.77

E. coli SSB activates N4 virion RNA polymerase promoters by stabilizing a DNA hairpin required for promoter recognition [Text] / M.Alexandra Glucksmann-Kuis [et al.] // Cell. - 1996. - Vol. 84, N 1. - P147-154 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Белок SSB E. coli активирует промоторы для вирионной РНК-полимеразы фага N4, стабилизируя шпильку ДНК, требующуюся для узнавания промоторов
Аннотация: Для транскрипции вирионной РНК-полимеразой фага N4 (I) с ранних фаговых промоторов в двунитевой ДНК необходимы суперспирализация ДНК и белок SSB E. coli (II). Другие связывающиеся с однонитевой ДНК (оДНК) белки (III) не могут заменить II. Детерминантом связывания I c промоторами является маленькая шпилька в матричной нити ДНК. Потребность в II кажется парадоксальной, т. к. III дестабилизируют шпильки. Показано, что II активирует транскрипцию под действием I оДНК, содержащих ранние промоторы N4. ДНКазный футпринтинг нормальных и мутантных промоторов показал, что II стабилизирует шпильку в матричной нити из-за особенностей структуры шпильки, а III дестабилизируют промоторную шпильку. Эти данные позволили объяснить специфичность активации под действием II: II является активатором транскрипции, т. к. он обеспечивает правильную структуру матрицы для связывания I. Существование маленьких шпилек, стабильных в присутствии связывающегося с оДНК белка является новым механизмом, обеспечивающим структурные детерминанты для связывания РНК-полимераз. США, Dep. of Molecular Genetics and Cell Biol., Univ. of Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 32

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК SSB
ESCHERICHIA COLI
ОДНОНИТЕВАЯ ФАГОВАЯ ДНК
ШПИЛЬКА ПРОМОТОРНАЯ
СТАБИЛИЗАЦИЯ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ВИРИОННАЯ
УЗНАВАНИЕ
ПРОМОТОРЫ
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ N4

Доп.точки доступа:
Glucksmann-Kuis, M.Alexandra; Dai, Xing; Markiewicz, Peter; Rothman-Denes, Lucia B.

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска