СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=КОДОНЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 289
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 95.05-04И2.081

Ellis, J. T.
Schistosoma mansoni: patterns of codon usage and bias [Text] / J. T. Ellis, D. A. Morrison // Parasitology. - 1995. - Vol. 110, N 1. - P53-60 . - ISSN 0031-1820
Перевод заглавия: Schistosoma mansoni: типы использования кодонов и смещения
Аннотация: Приводятся данные по использованию кодонов (КД) и смещению в последовательностях генов шистосом Sch. mansoni. Величину использования КД и ее изменчивость определяли по 3 стандартным показателям: GC[3] (частота G+C в 3-м положении в КД), "эффективное" число КД (N[c]) и стандартизованный показатель смещения в аналогичных КД (В), на основе формулы средней генетической гомозиготности, используемой в популяционной генетике. Всего было исследовано 20 генов указанных шистосом. По упомянутым показателям установлена высокая степень гетерогенности использования КД и смещения. Установлено, что использование КД и его изменчивость в целом зависит от состава оснований в изученных генах, что, в свою очередь, отражает типы КД, представленных менее или более часто в изученных последовательностях. Австралия, Sch. Biol. and Biomed. Sci., Univ. Technol. Sydney, Westborne Street, Gore Hill, NSW 2065. Библ. 39.

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.17.11.02
Рубрики: SCHISTOSOMA MANSONI (TREM.)
ГЕНЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОДОНЫ
СТРУКТУРА
ИЗМЕНЧИВОСТЬ

Доп.точки доступа:
Morrison, D.A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 95.08-04М1.007

Whitfield, Tanya T.
Nonsense-mediated mRNA decay in Xenopus oocytes and embryos [Text] / Tanya T. Whitfield, Colin R. Sharpe, Christopher C. Wylie // Dev. Biol. - 1994. - Vol. 165, N 2. - P731-734 . - ISSN 0012-1606
Перевод заглавия: Опосредованный нонсенс-кодонами распад мРНК в ооцитах и зародышах шпорцевой лягушки
Аннотация: Существование мутантных мРНК, несущих кодоны преждевременной остановки (КПО), отличающиеся редукцией полупериода жизни, в клетках многих видов, по-видимому, связано с присутствием "надзирающих" механизмов, к-рые избирательно метят такие мРНК, затем деградирующие. Синтезированные in vitro транскрипты, к-рые у шпорцевой лягушки кодируют белок XLPOU-60, проявляют стабильность после инъекции их в ооциты и зародыши. Однако введение КПО в эти транскрипты приводит к деградации последних. Обсуждаются механизмы стабильности РНК в опытах с инъекцией мРНК в ооциты и эмбриональные клетки. Великобритания, CRC-Inst., Cambridge, CB2 1QR. Библ. 8.

ГРНТИ	34.41.02

ВИНИТИ 341.41.02.09
Рубрики: ООЦИТЫ
ЗАРОДЫШИ
МРНК
НОНСЕНС-КОДОНЫ
ШПОРЦЕВАЯ ЛЯГУШКА

Доп.точки доступа:
Sharpe, Colin R.; Wylie, Christopher C.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 95.08-04Я6.496

Terhune, Pamela Guay.
Only wild-type c-Ki-ras codons 12, 13, and 61 in human pancreatic acinar cell carcinomas [Text] / Pamela Guay Terhune, Clara S. Heffess, Daniel S. Longnecker // Mol. Carcinogenes. - 1994. - Vol. 10, N 2. - P110-114 . - ISSN 0899-1987
Перевод заглавия: Кодоны 12, 13 и 61 только дикого типа [присутствуют] в c-Ki-ras ацинарных клеток рака поджелудочной железы человека
Аннотация: Рак поджелудочной железы (ПЖ), в частности рак клеток (Кл) протоков, ассоциирован с активацией протоонкогена c-Ki-ras. При раке ацинарных Кл ПЖ мыши и крысы не обнаружено общих мутаций в протоонкогене. Для подобного анализа у человека использовали фиксированные в парафине препараты 11 различных видов рака ацинарных Кл ПЖ. В рез-те аллель-специфич. гибридизации с амплифицированными фрагментами, отвечающими норм. и мутированным областям этих кодонов, не обнаружено никаких изменений в структуре этих кодонов в опухолевых Кл. Т. обр., не мутации кодонов 12, 13 или 61, а иные факторы потенциально ответственны за опухолевую трансформацию в случае рака ацинарных Кл. Считают, что Кл рака протоков, содержащие c-Ki-ras с немутированными кодонами ('ЭКВИВ' 1/4 популяции) могут оказаться пр-ными трансформированных ацинарных Кл. США, Dep. Pathol., Dartmouth Med. Sch., Lebanon, NH 03756. Библ. 33

ГРНТИ	34.19.27

ВИНИТИ 341.19.27.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН С-KI-RAS
КОДОНЫ 12/13/61
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОТСУТСТВИЕ МУТАЦИЙ
РАК АЦИНАРНО-КЛЕТОЧНЫЙ
ПОДЖЕЛУДОЧНАЯ ЖЕЛЕЗА
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Heffess, Clara S.; Longnecker, Daniel S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.08-04Б1.23

Goergen, Bernd.
Mutation specific PCR and direct solid phase sequencing assay for the detection of hepatitis B virus-pre-C/C mutants in anti-HBe-positive, chronic hepatitis B [Text] / Bernd Goergen, Karl-Herrmann Meyer zum Buschenfelde, Guido Gerken // J. med. Virol. - 1994. - Vol. 43, N 1. - P97-102 . - ISSN 0146-6615
Перевод заглавия: Специфичная для мутации ПЦР и прямое секвенирование в твердой фазе для обнаружения мутантов пре-С/С вируса гепатита В при анти-HBe-позитивном, хроническом гепатите В
Аннотация: Секвенирование ДНК вируса гепатита В (ВГВ) из больных с анти-HBe-позитивным хроническим гепатитом В показало, что отсутствие HBeAg связано с появлением стоп-кодона в рез-те транзиции Г[1896]'-'А. Для обнаружения этого варианта ВГВ использован метод специфич. для точечной мутации ПЦР (см-ПЦР). Изучены 2 серологически определенных группы б-ных с симптоматич. гепатитом В (14 для HBeAg{+} и 11 для анти-HBe{+}). ДНК ВГВ из 43 сывороток (26 HBeAg{+} и 17 анти-HBe{+}) амплифицировали дважды с разными наборами праймеров. Каждый набор содержал один и тот же праймер (-)-нити, но праймеры (+)-нити имели разные 3'-концы и были комплементарны только ДНК дикого типа или только ДНК мутанта. Для предотвращения неспецифич. амплификации использован отжиг при высокой температуре (66'ГРАДУС'C). Эти данные сравнены с прямым секвенированием в твердой фазе амплифицированной ДНК ВГВ. Методом см-ПЦР мутация найдена в 4 из 26 сывороток HBeAg{+} и в 17 из 17 сывороток анти-HBe{+}. Смешанная популяция ВГВ обнаружена в 13 из 21 случаев. По сравнению с секвенированием метод см-ПЦР является более чувствительным и быстрым способом обнаружения стоп-кодона в ДНК ВГВ. Германия, 1 Med. Klinik und Poliklinik, Johannes Gutenberg Univ., 6500 Maint. Библ. 25

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА В
ДНК ВИРУСНАЯ
СТОП-КОДОНЫ
ВЫЯВЛЕНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Buschenfelde, Karl-Herrmann Meyer zum; Gerken, Guido

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 95.12-04Н1.572

Geballe, Adam P.
Initiation codons within 5'-leaders of mRNAs as regulators of translation [Text] / Adam P. Geballe, David R. Morris // Trends Biochem. Sci. - 1994. - Vol. 19, N 4. - P159-164 . - ISSN 0376-5067
Перевод заглавия: Инициаторные кодоны внутри 5'-лидеров мРНК как регуляторы трансляции
Аннотация: В 5'-нетранслируемых зонах нек-рых мРНК, кодирующих протоонкогены, факторы роста и их рецепторы, содержатся инициаторные AUG-кодоны и ассоциированные с ними открытые рамки считывания разной длины, к-рые могут функционировать как цис-регуляторные элементы и частично подавлять трансляцию нижележащей открытой кодирующей рамки. Рассмотрены варианты взаимной топографии этих цис-элементов и транслируемой зоны мРНК и возможные механизмы репрессии трансляции и ее регуляции. Возможно, в этой регуляции участвуют пептиды-продукты трансляции альтернативных рамок считывания. США, Dep. Mol. Med., Fred Hutchinson Canc. Res. Ctr, Seattle, WA 98104. Библ. 35

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.21.17.13
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РНК МАТРИЧНАЯ
ОБЛАСТИ 5'-НЕТРАНСЛИРУЕМЫЕ
ИНИЦИАТОРНЫЕ КОДОНЫ
ЦИС-РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ЭУКАРИОТЫ
ПРОТООНКОГЕНЫ
ФАКТОРЫ РОСТА
РЕЦЕПТОРЫ

Доп.точки доступа:
Morris, David R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.01-04Б1.183

Differential response of human cells to deletions and stop codons in the 'гамма'[1]34.5 gene of herpes simplex virus [Text] / Joany Chou [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 12. - P8304-8311 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Дифференциальный ответ человеческих клеток на делеции и стоп-кодоны в гене 'гамма'[1] 34.5 вируса простого герпеса
Аннотация: Делеция 1000 п. н. в гене 'гамма'[1] 34.5 у мутанта R3616 вируса простого герпеса типа 1 (ВПГ-1) вызывает преждевременное выключение синтеза белка в клетках нейробластомы человека SK-N-SH и фибробластах крайней плоти человека HFF. У мутантов R4009 и R930, имеющих стоп-кодоны во всех 6 рамках считывания на расстоянии 27 и 210 кодонов от инициирующего кодона гена 'гамма'[1]34.5, наблюдается выключение синтеза белка в клетках SK-N-SH, но не в HFF. В клетках HFF не образуется укороченный белок 'гамма'[1]34.5 (I) или его укороченная мРНК. Нек-рые клональные линии клеток SK-N-SH, несущие ген 'гамма'[1]34.5 под контролем металлотионеинового промотора, экспрессируют ген 'гамма'[1]34.5 конститутивно и не требуют для комплементации мутанта 'гамма'[1]34.5{-}. Одна из линий клеток комплементирует этот мутант только после индукции Cd{2+}. Эти данные подтвердили, что фенотип преждевременного выключения синтеза белка связан с отсутствием I, и показали, что кол-во I, необходимо для комплементации мутантов 'гамма'[1]34.5{-}, очень мало. Разные человеческие клетки по-разному отвечают на присутствие стоп-кодонов в гене I. Выключение синтеза белка в клетках HFF, зараженных стоп-мутантами ВПГ-1, может предотвращаться за счет образования небольшого кол-ва I в рез-те сплайсинга интрона за стоп-кодоном, супрессии стоп-кодона или инициации трансляции с 3'-стороны от него. США, M. B. Kovler Viral Oncol. Lab., Univ. of Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 22

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
ГЕНЫ
ДЕЛЕЦИИ
СТОП-КОДОНЫ
КУЛЬТУРА КЛЕТОК
БЕЛКОВЫЙ СИНТЕЗ

Доп.точки доступа:
Chou, Joany; Poon, Alice P.W.; Johnson, Jennifer; Roizman, Bernard

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 96.01-04Н1.101

Functional analysis of the AUG- and CUG-initiated forms of the c-Myc protein [Text] / Elizabeth M. Blackwood [et al.] // Mol. Biol. Cell. - 1994. - Vol. 5, N 5. - P597-609 . - ISSN 1059-1524
Перевод заглавия: Функциональный анализ белков c-myc, [синтез которых] инициирован с AUG и с CUG
Аннотация: Известно, что активация клеточного протоонкогена c-myc часто обусловлена пространственным разобщением его кодирующих и регуляторных элементов вследствие транслокации хромосом или инсерции провирусной ДНК. При таких перестройках часто элиминируется или инактивируется экзон 1 гена c-myc и синтез p64-c-myc инициируется с AUG-кодона в экзоне 2. Перестройки c-myc часто ассоциированы с утратой альтернативного инициаторного кодона CUG в экзоне 2, при инициации с к-рого образуется p67-c-myc с избыточной N-концевой зоной. Сравнительный функциональный анализ p67- и p64-c-myc - продуктов экспрессии c-myc-кДНК с сайт-адресованными мутациями инициаторных кодонов показал, что оба изо-c-myc взаимодействуют с bcr-abl в злокачественной трансформации фибробластов линии Rat-1 и являются сходными по активности трансактиваторами транскрипции слитых репортерных конструкций, содержащих сайты связывания для Myc/Max. Сделан вывод, что онкогенная активация c-myc имеет в основе общую стимуляцию его экспрессии, а не структурные изменения белков c-myc. США, Div. Basic Sci., Fred Hutchinson Canc. Ctr, Seattle, WA 98104. Библ. 82

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.15.15.09
Рубрики: ПРОТООНКОГЕНЫ
ГЕН C-MYC
АКТИВАЦИЯ
СТИМУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ
ОНКОБЕЛОК
БЕЛОК C-MYC
КОДОНЫ AUG И CUG
ИНИЦИАЦИЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Blackwood, Elizabeth M.; Lugo, Tracy Gross; Kretzner, Leo; King, Michael W.; Street, Alasdair J.; Witte, Owen N.; Eisenman, Robert N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.02-04Б1.408

Borman, Stu.
AIDS virus predicted to have up to four unexpected new genes [Text] / Stu Borman // Chem. and Eng. News. - 1994. - Vol. 72, N 34. - P23-25 . - ISSN 0009-2347
Перевод заглавия: Предсказано, что вирус СПИДа имеет до четырех неожиданных новых генов
Аннотация: Обзор. Анализ распределения в геномной РНК ВИЧ-1 псевдоузлов, к-рые могут вызвать сдвиг рамки при трансляции, позволил предположить, что ВИЧ-1 может кодировать до 4 новых составных белков. Для экспрессии этих белков необходима супрессия стоп-кодонов УГА, к-рую может вызвать включение остатков селеноцистеина (I). Одним из таких потенциальных содержащих I белков ВИЧ-1 является белок, связывающийся с ДНК и способный служить репрессором транскрипции ВИЧ-1

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
РНК ГЕНОМНАЯ
ПСЕВДОУЗЛЫ
СТОП-КОДОНЫ
СУПРЕССИЯ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.03-04Б1.51

Ranjan, Akash.
Influence of codon usage and translation initiation codon context in the AcNPV-based expression system: Computer analysis using homologous and heterologous genes [Text] / Akash Ranjan, Seyed E. Hasnain // Virus Genes. - 1995. - Vol. 9, N 2. - P149-153 . - ISSN 0920-8569
Перевод заглавия: Влияние использования кодонов и контекста кодона инициации трансляции в экспрессионной системе, основанной на вирусе ядерного полиэдроза Autographa californica: компьютерный анализ с использованием гомологичных и гетерологичных генов
Аннотация: Сравнено использование кодонов во всех известных генах вируса ядерного полиэдроза (ВЯП) A. californica и в генах люциферазы светлячка (I) и 'бета'-субъединицы (II) гонадотропина хориона человека. Хорошо экспрессируемый ген I по частоте использования кодонов мало отличается от генов ВЯП: среднеквадратичный статистический параметр D=0,76, а отношение Г/Ц в 3-м положении кодонов составляет 45%. Для плохо экспрессируемого гена II D=7,3 и Г/Ц=82,5%. Сравнение участков длиной 20 п.н. вокруг инициирующих кодонов в 23 генах ВЯП обнаружило новую консенсусную последовательность aag/ta/tat/aa/cAAaATGaa/ct/ag/aAan, к-рая сильно отличается от консенсусной последовательности Козака (GCC) GCCA/GCCATGC. Аналогичная тенденция отмечается для гетерологичных генов, хорошо и плохо экспрессируемых в системе ВЯП. Индия, Eukaryotic Gene Expression Lab., Nat. Inst. of Immunol., New Delhi 110067. Библ. 33

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.39
Рубрики: БАКУЛОВИРУСНЫЕ ВЕКТОРЫ
ЭКСПРЕССИОННЫЕ СИСТЕМЫ
ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
КОДОНЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Hasnain, Seyed E.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.03-04Б1.120

Cao, Jianhong.
Translational inhibiton by a human cytomegalovirus upstream open reading frame despite inefficient utilization of its AUG codon [Text] / Jianhong Cao, Adam P. Gebelle // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 2. - P1030-1036 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Ингибирование трансляции 5'-фланговой открытой рамкой считывания цитомегаловируса человека, несмотря на неэффективное использование ее кодона АУГ
Аннотация: В лидерной области транскрипта гена гликопротеина gp48 цитомегаловируса человека вторая из 3 открытых рамок считывания (uORF2) ингибирует в 10 раз трансляцию расположенного за ней цистрона. Показано, что экспрессия этого 3'-цистрона зависит от обхода рибосомами инициирующего кодона АУГ в uORF2 (АУГ-2) по механизму протекающего сканирования. Замена нуклеотидов, окружающих АУГ-2, на более оптимальные для инициации трансляции уменьшает трансляцию 3'-цистрона в 10 раз. Анализ мутантов, у к-рых uORF2 перекрывается с 3'-ORF или находится с ней в одной рамке считывания, обнаружило, что частота инициации на АУГ-2 дикого типа низка и большинство рибосомных субъединиц обходит АУГ-2 дикого типа из-за его субоптимального контекста. Предложена модель, объясняющая парадоксальное сильное ингибиторное влияние uORF2 на трансляцию, несмотря на неэффективное использование ее инициирующего кодона. США, Fred Hutehinson Cancer Res. Center, Seattle, WA 98104. Библ. 27

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ЦИТОМЕГАЛОВИРУСЫ
ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНГИБИРОВАНИЕ
ИНИЦИИРУЮЩИЕ КОДОНЫ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ
ГЕНЫ
ТРАНСКРИПТЫ

Доп.точки доступа:
Gebelle, Adam P.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.03-04Б1.160

Chenik, Mehdi.
Translation initiation at alternate in-frame AUG codons in the rabies virus phosphoprotein mRNA is mediated by a ribosomal leaky scanning mechanism [Text] / Mehdi Chenik, Karim Chebli, Danielle Blondel // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 2. - P707-712 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Инициация трансляции на альтернативных кодонах АУГ в одной рамке считывания в мРНК фосфопротеина вируса бешенства опосредована протекающим механизмом рибосомного сканирования
Аннотация: Фосфопротеин (I) вируса бешенства (ВБ) состоит из 297 остатков и кодируется самой длинной открытой рамкой считывания (ОРС) гена Р. Иммунопреципитация моноклональной антисывороткой к I обнаружила I и 4 более коротких белка в зараженных ВБ клетках, в клетках, трансфицированных плазмидой с геном Р дикого типа, и в вирионах ВБ (штамм CVS). Делеционный анализ показал, что эти белки транслируются со вторичных инициирующих дистальных кодонов АУГ в той же ОРС Р. Все продукты гена Р расположены в цитоплазме. Однако белки, инициированные на 3-м, 4-м и 5-м кодонах АУГ, в основном находятся в ядре. Сайт-специфические мутации в 5'-концевой области мРНК Р показали, что инициация трансляции мРНК Р на внутренних АУГ вызвана протекающим механизмом рибосомного сканирования. Франция, Lab. de Genet. de Virus, CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 33

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС БЕШЕНСТВА
ФОСФОПРОТЕИНЫ
МРНК
ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
АЛЬТЕРНАТИВНЫЕ КОДОНЫ

Доп.точки доступа:
Chebli, Karim; Blondel, Danielle

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.137

Pestova, T. V.
A conserved AUG triplet in the 5' nontranslated region of poliovirus can function as an initiation codon in vitro and in vivo [Text] / T. V. Pestova, C. U.T. Hellen, E. Wimmer // Virology. - 1994. - Vol. 204, N 2. - P729-737 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Консервативный триплет в 5'-нетранслируемой области вируса полиомиелита может функционировать как инициирующий кодон in vitro и in vivo
Аннотация: У вируса полиомиелита (ВП) трансляция инициируется на кодоне АУГ[743], на расстоянии 154 н. за консервативным гептануклеотидом ЦУУАУГГ на 3'-границе внутреннего сайта вхождения рибосом IRES. Кодон АУГ[586] является частью этого мотива и обычно не используется в качестве инициирующего кодона, но активируется после изменения контекста (ЦУУАУГГ'-'АЦЦАУГГ). Инициация на АУГ[586] эффективна и дает белок с мол. м. 7200, к-рый транслируется в открытой рамке считывания, перекрывающейся с АУГ[743] на 38 н. Однако активация АУГ[586] уменьшает инициацию на АУГ[743] лишь в 2 раза. Мутант ВП W1-5NC-1 с заменами ЦУУ'-'АЦЦ растет плохо, и нормальный рост не восстанавливается терминирующим кодоном, встроенным на расстоянии 4 кодона за АУГ[586] у мутанта W1-5NC-3. Мутант W1-5NC-6 с заменой Y[584]'-'A имеет такой же фенотип sp. Фенотип мутанта W1-5NC-1 вызван самой заменой в мотиве ЦУУАУГЦ, а не активацией АУГ[586]. Из W1-5NC-1 получен мутант sp (W1-5NC-3) с делецией остатков 588-745. Это показало, что АУГ[586] может инициировать трансляцию in vivo. Т. обр. хотя АУГ[586] может активироваться заменами с 5'-стороны от него, этот кодон легко обходится рибосомами в мРНК, содержащих 3'-фланговые элементы дикого типа, и трансляция инициируется на АУГ[743]. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., SUNY Health Sci. Center, Brooklyn, NY 11203-2098. Библ. 52

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ПОЛИОВИРУСЫ
КОНСЕРВАТИВНЫЕ ТРИПЛЕТЫ
ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ
ИНИЦИИРУЮЩИЕ КОДОНЫ
ТРАНСЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Hellen, C.U.T.; Wimmer, E.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 96.05-04И2.23

Char, Shobha.
Codon usage in the double-stranded RNA viruses of Giardia and Leishmania [Text] / Shobha Char, Michael J. G. Farthing // Exp. Parasitol. - 1994. - Vol. 79, N 4. - P542-545 . - ISSN 0014-4894
Перевод заглавия: Использование кодонов в двухцепочечной РНК у вирусов из лямблий и лейшманий
Аннотация: Сопоставлены особенности использования генетического кода (ГК) у лямблий, лейшманий и их РНК-содержащих вирусов. Проанализирована сравнительная частота использования различных синонимических (т. е. кодирующих одну и ту же аминокислоту) кодонов, а также соотношение в общем числе А-Т, (А-У) и Г-Ц пар в РНК и ДНК. Какого-либо параллелизма в характере использования ГК между простейшими-хозяевами и их вирусами не выявлено. Предполагают, что "независимость" использования ГК вирусом от его хозяина может иметь приспособительное значение. Великобритания, Digestive Dis. Res. Centre, The Med. College of St. Bartholomew's Hospital, Charterhouse Square, London EC1M 6BQ. Библ. 18

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.15.02
Рубрики: LAMBLIA SPP. (PROT.)
LEISHMANIA SPP. (PROT.)
ВИРУСЫ
КОДОНЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Farthing, Michael J.G.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 96.06-04И2.143

Kalinna, Bernd H.
Codon usage in Echinococcus [Text] / Bernd H. Kalinna, Donald P. McManus // Exp. Parasitol. - 1994. - Vol. 79, N 1. - P72-76 . - ISSN 0014-4894
Перевод заглавия: Использование кодонов у Echinococcus
Аннотация: Проанализировали характер использования кодонов в 15 опубликованных нуклеотидных последовательностях генов двух видов Echinococcus - E. granulosus и E. multilocularis. Не выявили различий в использовании кодонов и частотах встречаемости нуклеотидов в 3-м положении кодонов между двумя видами. Содержание A+T в открытых рамках трансляции составила 51 %, во фланкирующих участках - 56 %. Наиболее часто встречаемые кодоны кодируют Glu, Lys, Ala и Val (32 % всех кодонов). Используемые кодоны Glu, Ala и Val имеют в 1-м положении G, а Lys - A. Во 2-м положении кодонов Glu и Ala находится A. В 3-м положении кодонов аминок-т, для к-рых теоретически возможен любой из четырех нуклеотидов, T используется в 2,5 раза чаще,чем A, а C - в 2 раза чаще, чем G. Частоты встречаемости кодонов Glu, Lys, Ala и Val в генах Echinococcus и активно экспрессируемых генах Escherichia coli и дрожжей различны. В то же время открытые рамки трансляции генов Echinococcus и Drosophila близки по A+T-составу, предпочтительности использования нуклеотидов в 3-м положении кодонов и частоте использования кодонов, поэтому клетки насекомых являются наиболее подходящей системой для эффективной экспрессии генов Echinococcus. Австралия, Mol. Parasitol, Unit, Tropical Hlth. Prog., Queensland Inst., Med. Res., Brisbane, Queensland 4029. Библ. 14

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.17.09.17
Рубрики: КОДОНЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ОСОБЕННОСТИ
ГЕНЫ
ECHINOCOCCUS GRANULOSUS
ECHINOCOCCUS MULTILOCULARIS

Доп.точки доступа:
McManus, Donald P.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.07-04Б1.447

Different allelic effect of the codons 136 and 171 of the prion protein gene in sheep with natural scrapie [Text] / C. Cluscard [et al.] // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 8. - P2097-2101 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Различные аллельные эффекты кодонов 136 и 171 гена прионового белка у овец с природной скрепи
Аннотация: Известно, что в гене прионового белка скрепи овец PrP наблюдаются три типа полиморфизма: в позиции 136, 154 и 171. При этом показана связь между чувствительностью/резистентностью к природной инфекции скрепи и диморфизмом в кодоне 136, однако, это наблюдение не распространяется на все породы овец. Авторы сравнивали генотипы PrP породы овец Lacaune из эпизоотически неблагополучных по скрепи хозяйств со здоровыми овцами. Рез-ты были сопоставлены с изучением романовской породы овец, у к-рых отмечались вспышки скрепи с 80% падежом животных. Показано, что генетический фактор, контролирующий чувствительность/резистентность к скрепи, связан с кодоном 171, а модификации аллельных эффектов кодона 136 наблюдались у здоровых инфицированных животных. Франция, Centre INRA, BP 27, 31326 Castanet-Tolosan. Библ. 19

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.23
Рубрики: ПРИОНЫ
ГЕНЫ
КОДОНЫ
АЛЛЕЛЬНЫЕ ЭФФЕКТЫ
ОВЦЫ
СКРЕПИ

Доп.точки доступа:
Cluscard, C.; Beaudry, P.; Elsen, J.M.; Milan, D.; Dussaucy, M.; Bounneau, C.; Schelcher, F.; Chatelain, J.; Launay, J.M.; Laplanche, J.L.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.09-04Б1.111

Wills, Norma M.
Pseudoknot-dependent read-through of retroviral gag termination codons: Importance of sequences in the spacer and loop 2 [Text] / Norma M. Wills, Raymond F. Gesteland, John F. Atkins // EMBO Journal. - 1994. - Vol. 13, N 17. - P4137-4144 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Зависимое от псевдоузла "проскакивание" терминирующих стоп-кодонов в ретровирусном [гене] gag: важность последовательностей в спейсере и петле 2
Аннотация: При трансляции РНК ретровирусов, у к-рых гены gag и pol кодируются в одной рамке, в 5% случаев происходит проскакивание стоп-кодона gag UAG и образуется gag-pol пролипротеин. У вируса лейкоза мышей Молони это явление зависит от псевдоузла, отстоящего на 3 н. к 3'-концу от UAG. Вторичная структура этого участка и первичная последовательность спейсера и петли 2 псевдоузла консервативны у ретровирусов, имеющих гены gag и pol в одной рамке. Замена нескольких из этих консервативных нуклеотидов у вируса лейкоза мышей Молони существенно влияла на частоту проскакивания стоп-кодона. 2 нуклеотида в петле 2 псевдоузла, важность к-рых доказана с помощью мутагенеза, оказались гиперчувствительны к нуклеазе S1. США, Howard Hughes Med. Inst. Salt Lake City, UT 84112. Библ. 36

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ
ВИРУС ЛЕЙКОЗА МЫШЕЙ МОЛОНИ
РНК
ТРАНСЛЯЦИЯ
ГЕН GAG
СТОП-КОДОНЫ
ПРОСКАКИВАНИЕ
ПСЕВДОУЗЕЛ

Доп.точки доступа:
Gesteland, Raymond F.; Atkins, John F.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.402

Hemert, F. J.van
The tendency of lentiviral open reading frames to become A-rich: Constraints imposed by viral genome organization and cellular tRNA availability [Text] / F. J.van Hemert, B. Berkhout // J. Mol. Evol. - 1995. - Vol. 41, N 3. - P132-140 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Тенденция открытых рамок считывания лентивирусов становиться А-богатыми: ограничения, налагаемые организацией вирусного генома и доступностью клеточных тРНК
Аннотация: В геномах ВИЧ-1 и др. лентивирусов (ЛВ) 40% остатков в РНК составляют остатки А. Повышенное содержание А соответствует типичному использованию синонимических кодонов всеми членами семейства ЛВ и спумаретровирусами человека, но не др. ретровирусами (типа Т-лимфотропных вирусов человека типов I и II). Изучено предпочитание А во всех группах кодонов и во всех открытых рамках считывания (ОРС) нескольких ЛВ. Обнаружена обратная зависимость между степенью кодонового сдвига и скоростью трансляции индивидуальных ОРС. Сдвиг в сторону А-богатых кодонов выражен в генах pol сильнее, чем в генах gag. Т. к. белка Gag образуется в 20 раз больше, чем белка pol, из-за редкого рибосомного сдвига рамки при трансляции мРНК gag-pol, то можно предположить, что доступность аминоацил-тРНК в клетке хозяина ограничивает предпочтение А-богатых кодонов у ЛВ. Остатки А реже встречаются в областях генов ЛВ, кодирующих несколько ф-ций: в перекрывающихся ОРС (tat-rev-env) и в генах, перекрывающихся с регуляторными областями (nef-LTR). Построено филогенетическое дерево использования кодонов у ДВ. Нидерланды, Dep. Anatomy and Embryol., Acad. Med. Ctr, Univ. Amsterdam, 1100 DE Amsterdam. Библ. 27

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ЛЕНТИВИРУСЫ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ
ОСТАТКИ A
ОБОГАЩЕНИЕ
ТРАНСЛЯЦИЯ
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
ОРГАНИЗАЦИЯ
РНК ТРАНСПОРТНЫЕ
ДОСТУПНОСТЬ
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ФИЛОГЕНИЯ
КОДОНЫ

Доп.точки доступа:
Berkhout, B.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.11-04Б1.181

Thomas, Adri A. M.
Recognition of the initiation codon for protein synthesis in foot-and-mouth disease virus RNA [Text] / Adri A. M. Thomas, Rene Rijnbrand, Harry O. Voorma // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77, N 2. - P265-272 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Узнавание инициирующего кодона для синтеза белка у вируса ящура
Аннотация: Вирус ящура (ВЯ) использует 2 инициирующих кодона (ИК) в одной рамке считывания для синтеза 2 белков-предшественников с одинаковыми С-концами. Для анализа выбора ИК сконструировано слияние 5'-нетранслируемой области 5'-UTR РНК ВЯ с репортерским геном CAT. После транскрипции in vitro РНК-полимеразой фага Т7 и трансляции в лизате ретикулоцитов кролика обнаружены 2 белка САТ, инициированные на разных ИК. 3'-ИК АУГ (АУГ[I,b]) используется более эффективно в 5'-LTR дикого типа, а 5'-ИК (АУГ[Lab]) - в укороченной РНК ВЯ. Добавление факторов инициации синтеза белка eIF-2 (I) и eIF-2B (II) изменяет селекцию ИК: 5'-ИК начинает использоваться в 2,5 раза чаще в полноразмерной и укороченной РНК ВЯ. Изменения концентрации РНК также влияют на выбор ИК, но эффект I сохраняется в широком диапазоне концентраций мРНК. Эти данные показали, что I и II участвуют в узнавании ИК во время как кэп-зависимо инициации, так и инициации, зависящей от внутреннего сайта вхождения рибосом. Нидерланды, Dep. of Molecular Cell Biol., Utrecht Univ., 3584 Utrecht. Библ. 39

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ЯЩУРА
БЕЛКОВЫЙ СИНТЕЗ
ИНИЦИИРУЮЩИЕ КОДОНЫ
РАСПОЗНОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Rijnbrand, Rene; Voorma, Harry O.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 97.01-04И2.151

Milhon, Jon L.
Updated codon usage in Schistosoma [Text] / Jon L. Milhon, James W. Tracy // Exp. Parasitol. - 1995. - Vol. 80, N 2. - P353-356 . - ISSN 0014-4894
Перевод заглавия: Современные данные об использовании кодона у шистосом
Аннотация: Из различных банков данных по определенным последовательностям различных протеинов были выбраны последовательности открытых рамок считывания для шистосом Schistosoma mansoni и Sch. japonicum - соотв. 93 специфические для Sch. mansoni последовательности с 35 482 экспрессированными кодонами и 21 специфическая для Sch. japonicum последовательность с 4 740 экспрессированными кодонами. Затем с помощью компьютерной программы были получены таблицы частоты кодонов для шистосом указанных видов. Анализ этих таблиц показал доминирование в открытых рамках считывания оснований A/T - в последовательностях Sch. mansoni содержание этих оснований составляло 62,8%, Sch. japonicum - 58,4%. Соотношение оснований G:A:T:C в последовательностях Sch. mansoni и Sch. japonicum составляло 20,7:33,4:29,4:16,5 и 25,0:30,9:27,5:16,6 соотв., причем A немногим более часто находилось во 2-й, T - в 3-й и G - в 1-й позиции. Полученные данные обсуждаются в связи с вопросом о синтезе олигонуклеотидных праймеров для ДНК-зондов и цепной р-ции полимеризации. США, Dep. Comparative Biosci., Sch. Vet. Med., Univ. Wisconsin-Madison, 2015 Linden Drive West, Madison, WI 53706-1102. Факс: (608) 263-6573. Библ. 2

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.17.11.17
Рубрики: SCHISTOSOMA SPP. (TREM.)
ПРОТЕИНЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОДОНЫ
СТРУКТУРА
ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ
СИНТЕЗИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Tracy, James W.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.02-04Б1.43

Ranjan, Akash.
Codon usage in the prototype baculovirus - Autographa californica nuclear polyhedrosis virus [Text] / Akash Ranjan, Seyed E. Hasnain // Indian J. Biochem. and Biophys. - 1995. - Vol. 32, N 6. - P424-428 . - ISSN 0301-1208
Перевод заглавия: Использование кодона в прототипном бакуловирусе - вирусе ядерного полиэдроза Autographa californica
Аннотация: Уровень экспрессии гена векторной системы бакуловируса значительно варьирует. Предполагается, что за вариабильность экспрессии ответственен профиль используемого кодона. В то время как профиль используемого кодона индивидуальных генов был весьма сходным с используемым полным профилем кодона вируса ядерного полиэдроза калифорнийской совки (AcNPV, величина D 1,5), имелись и значительные различия (D 1,5). Перечисляются 10 генов, большая часть к-рых относится к позднему или очень позднему классу и экспрессия их более эффективна. Два высоко выраженных гена AcNPV-polh и p-10 отличаются от используемого полного профиля кодона AcNPV, в отношении, по крайней мере, 9 аминокислот. Индия, Eukaryotic Gene Expression Lab., National Inst. of Immunol., Aruna Asaf Ali Marg, New Delhi 110067. Библ. 22

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.39
Рубрики: БАКУЛОВИРУСЫ
ВЕКТОРЫ
ЭКСПРЕССИОННЫЕ СИСТЕМЫ
КОДОНЫ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Hasnain, Seyed E.

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска