СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ<.>)

Общее количество найденных документов : 88
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-88

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.01-04Б1.077

Witherell, Gary W.
Encephalomyocarditis virus internal ribosomal entry site RNA-protein interactions [Text] / Gary W. Witherell, Eckard Wimmer // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 5. - P3183-3192
Перевод заглавия: РНК протеин взаимодействие внутреннего рибосомального входного сайта вируса энцефаломиокардита
Аннотация: Трансляционная инициация мРНК вируса энцефаломиокардита (ЭМК) осуществляется путем рибосомального внедрения в 5'-нетранслируемый регион мРНК вируса ЭМК. Идентифицирован внутренний рибосомальный входной сайт (ВРВС). Его элементы вовлекаются в трансляцию мРНК пикорнавирусов и нек-рых клеточных мРНК. Пять клеточных протеинов (p52, р57, p70, p72 и p100) перекрестно связывали ВРВС вируса ЭМК или фрагментов ВРВС. У одного из этих протеинов (p57) связывание с ВРВС коррелировало с трансляцией. На основании результатов перекрестного связывания с 21 различным фрагментом ВРВС вируса ЭМК и экстрактов клеток HeLa или лизатов кроличьих ретикулоцитов, как источника полипептидов, выявлены связывающие сайты протеинов p52, p57, p70 и p100. На основе полученных данных предполагается, что каждый из этих протеинов распознает первичные структурные особенности РНК в большей степени, чем специфические последовательности. США, Dep. of Microbiol., St. Univ. of New York at Stony Brook, Stony Brook, NY 11794.

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ПИКОРНАВИРУСЫ
ВИРУС ЭНЦЕФАЛОМИОКАРДИТА
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
РИБОСОМАЛЬНЫЕ САЙТЫ

Доп.точки доступа:
Wimmer, Eckard

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.07-04Б1.41

Binding of an HIV Rev peptide to Rev responsive element RNA induces formation of purine-purine base pairs [Text] / John L. Battiste [et al.] // Biochemistry. - 1994. - Vol. 33, N 10. - P2741-2747 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Связывание кодируемого ВИЧ пептида Rev с элементом ответа на Rev РНК индуцирует образование пурин-пуриновых пар оснований
Аннотация: Элемент ответа на Rev (RRE), обладающий вторичной структурой и локализованный в гене env ВИЧ, является сайтом связывания вирусного белка Rev. В модельной системе с фрагментами RRE и Rev показали, что связывание Rev c RRE сопровождается конформационными изменениями РНК, приводящими к возникновению дополнительных пар оснований, включая две пары пурин-пурин. Авт. считают, что образование не Уотсон-Криковских пар является характерной чертой физиологических РНК-белковых взаимодействий. США, Dep. Chem. MIT, Cambridge, MA 02139. Библ. 29

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: НУКЛЕИНОВО-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
БЕЛОК REV
ЭЛЕМЕНТ ОТВЕТА НА REV
СВЯЗЫВАНИЕ
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Battiste, John L.; Tan, Ruoying; Frankel, Alan D.; Williamson, James R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.08-04Б1.88

Deletion and mutational analyses of bluetongue virus NS2 protein indicate that the amino but not the carboxy terminus of the protein is critical for RNA-protein interactions [Text] / Yuan Zhao [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 4. - P2179-2185 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Делеционный и мутационный анализ белка NS2 катаральной лихорадки овец показывают, что аминоконцевой, но не карбоксиконцевой участок белка необходим для взаимодействия РНК-белок
Аннотация: Для идентификации доменов неструктурного белка NS2 вируса катаральной лихорадки овец, осуществляющих связывание с РНК и олигомерацию белка, получен ряд мутантов с делециями в амино- и карбоксиконцевых участках белка. Оказалось, что карбоксиконцевой участок не вовлечен ни в связывание РНК, ни в олигомеризацию белка. Аминоконцевой участок необходим для связывания двухцепочечной РНК, но не для олигомеризации NS2. На аминоконцевом участке NS2 был проведен точечный мутагенез с целью замены различных заряженных аминокислотных остатков и полученные мутанты проверяли на способность связывания с двухцепочечной РНК. Оказалось, что в связывании участвуют аргинин в положении 6 и 7, а также лизин в положении 4, но не глютаминовая кислота в положении 2. Великобритания, NERC Inst. of Virol. and Environ. Microbiol., Oxford OX1 3SR. Библ. 23

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ОРБИВИРУСЫ
ВИРУС СИНЕГО ЯЗЫКА ОВЕЦ
ВИРУСНЫЕ БЕЛКИ
АМИНОКОНЦЫ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Zhao, Yuan; Thomas, Claire; Bremer, Christine; Roy, Polly

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.330

Nucleotide sequence and structural determinants of specific binding of coat protein or coat protein peptides to the 3' untranslated region of alfalfa mosaic virus RNA 4 [Text] / Felicia Houser-Scott [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 4. - P2194-2205 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Нуклеотидная последовательность и структурные детерминанты специфического связывания оболочечного белка или пептидов оболочечного белка с 3'-нетранслируемым участком РНК 4 вируса мозаики люцерны
Аннотация: The specific binding of alfalfa mosaic virus coat protein to viral RNA requires determinants in the 3' untranslated region (UTR). Coat protein and peptide binding sites in the 3' UTR of alfalfa mosaic virus RNA 4 have been analyzed by hydroxyl radical footprinting, deletion mapping, and site-directed mutagenesis experiments. The 3' UTR has several stable hairpins that are flanked by single-standed (A/U) UGC sequences. Hydroxyl radical footprinting data show that five sites in the 3' UTR of alfalfa mosaic virus RNA 4 are protected by coat protein, and four of the five protected regions contain AUGC or UUGC. Electrophoretic mobility band shift results suggest four coat protein binding sites in the 3' UTR. A 3'-terminal 39-nucleotide RNA fragment containing four AUGC repeats bound coat protein and coat protein peptides with high affinity; however, coat protein bound poorly to antisense 3' UTR transcripts and poly(AUGC)[10]. Site-directed mutagenesis of AUGC[865-868] resulted in a loss of coat protein binding and peptide binding by the RNA fragment. Alignment of alfalfa mosaic RNA sequences with those from several closely related ilarviruses demonstrates that AUGC[865-868] is perfectly conserved; moreover, the RNAs are predicted to form similar 3'-terminal secondary structures. The data strongly suggest that alfalfa mosaic virus coat protein and ilarvirus coat proteins recognize invariant AUGC sequences in the context of conserved structural elements

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУС МОЗАИКИ ЛЮЦЕРНЫ
ОБОЛОЧЕЧНЫЕ БЕЛКИ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
СТРУКТУРНЫЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ

Доп.точки доступа:
Houser-Scott, Felicia; Baer, Margaret L.; Liem, Karel F.; Cai, Jun-Ming; Gehrke, Lee

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.02-04Б1.89

The nucleocapsid protein NCp7 of HIV-1 increases catalytic activity of a ribozyme and efficiency of antisense oligodeoxynuckeotides [Text] : [Vortr.] 5.Dtsch. AIDS-Kongr., Hannover, 24-26 Nov., 1994 / K. Moelling [et al.] // AIDS-Forsch. - 1994. - Vol. 9, N 11. - P601
Перевод заглавия: Белок нуклеокапсида NCp7 вируса иммунодефицита человека типа 1 повышает каталитическую активность рибозима и эффективность антисмысловых олигодезоксинуклеотидов
Аннотация: Нуклеокапсидный белок NCp7 вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) содержит 2 группы основных аминокислот (А), прилегающих к высоко консервативному соединению с цинком. Координация цинком необходима для специфического узнавания упаковки участка PS1 ретровирусной РНК белком NC in vitro. Использовали синтетические пептиды для характеристики взаимодействия NCp7-PS 1-РНК in vitro. Тестировали различные мутанты белка NCp7, включая делеции, точечные мутации и замену цистина гистидином. Вторичная связь с цинком не заменяла первичную. Т. обр., для специфического узнавания PS1 необходимы первый цинковый палец и прилегающие остатки основных А. Установили также, что белок NC заметно повышает in vitro каталитическую активность рибозима, специфичного для онкогенного Ki-ras. Охарактеризовали с помощью мутантов активирующую область белка NC. Для нее необходимы обе группы основных А. Комплекс белка NC с олигодезоксинуклеотидами, направленными на опухолевые клетки, уменьшал необходимое кол-во олигодезоксинуклеотидов в 50 раз. Швейцария, Inst. of Med. Virol. Univ. of Zurich, CH-8028 Zurich. Библ. 3

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
НУКЛЕОКАПСИДНЫЕ БЕЛКИ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Moelling, K.; Strack, B.; Heincke, T.; Mueller, G.; Dannull, J.; Surovoy, A.; Jung, G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.114

Secondary structure is the major determinant for interaction of HIV rev protein with RNA [Text] / Henrik S. Olsen [et al.] // Science. - 1990. - Vol. 247, N 4944. - P845-848 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Вторичная структура служит основной детерминантой взаимодействия белка rev ВИЧ-1 с РНК
Аннотация: Взаимодействие с белком rev ВИЧ-1 области мРНК env ВИЧ-1 приводит к образованию вторичного структурного комплекса RRE, опосредующего экспорт мРНК для структурных белков ВИЧ-1 из ядра в цитоплазму. Исследовали характеристики и функциональную роль участка rev и комплекса rev-RRE. Идентифицирована первичная шпилька в составе RRE, с к-рой взаимодействует белок rev. Для эффективного взаимодействия белка rev с РНК требуется не только интактная первичная структура, но и в большей степени сохранение адекватной вторичной структуры, что отличает эту структуру от структурных компонентов, участвующих во взаимодействии cis-действующих элементов ДНК. Ограниченные изменения в 200 нуклеотидах, участвующих в сохранении необходимой конформации RRE, приводят к блокированию функции rev. Тем не менее вариации в составе элементов RRE, присутствующих у различных вариантов ВИЧ-1, не оказывают существенного воздействия на реакцию в ответ на воздействие белка rev. США, Roche Inst. for Mol. Biol., Roche Res. Center, Nutley, NJ 07110. Библ. 25

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ОСОБЕННОСТИ

Доп.точки доступа:
Olsen, Henrik S.; Nelbock, Peter; Cochrane, Alan W.; Rosen, Craig A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.09-04Б1.112

The RNA element encoded by the trans-activation-responsive region of human immunodeficiency virus type 1 is functional when displaced downstream of the start of transcription [Text] / Mark J. Churcher [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1995. - Vol. 92, N 6. - P2408-2412 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Элемент РНК, кодируемый отвечающей на трансактивацию областью вируса иммунодефицита человека типа 1, функционально-[активен] при смещении в 3'-сторону от старта транскрипции
Аннотация: В бесклеточной системе транскрипции изучен набор матриц ДНК ВИЧ-1, содержащих дуплицированные элементы TAR ответа на белок-активатор Tat (I). Если элемент TAR в нормальном положении (TAR-1) инактивирован мутациями в сайте связывания I или в апикальной петле (АП), являющейся сайтом связывания клеточного фактора, трансактивация спасается 2-ым элементом TAR дикого типа (TAR-2), расположенным с 3'-стороны от TAR-1. Элемент TAR-2 функционален, даже если он находится на расстоянии более 200 п.н. ниже TAR-1. Если TAR-1 имеет мутацию в АП, его не спасает элемент TAR-2 с мутацией в сайте связывания I. Замены нуклеотидов в TAR-1 показали, что 5'-половина TAR также является существенным элементом, необходимым для эффективной активации транскрипции. Эти данные позволяют предположить, что I и клеточные факторы, связывающиеся с РНК TAR, ассоциируются с транскрипционным комплексом во время его прохождения через TAR. Великобритания, MRC Lab. Mol. Biol., Cambridge, CB2 2QH. Библ. 36

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 8
ДНК
МАТРИЦЫ
ЭЛЕМЕНТ TAR, ДУПЛИЦИРОВАННЫЙ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ЭЛОНГАЦИЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ
РЕТРОВИРУСЫ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Churcher, Mark J.; Lowe, Anthony D.; Gait, Michael J.; Karn, Jonathan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.05-04Б1.90

Cooperative binding to nucleic acids by barley yellow mosaic bymovirus coat protein and characterization of a nucleic acid-binding domain [Text] / C. Reichel [et al.] // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77, N 4. - P587-592 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Кооперативное связывание с нуклеиновыми кислотами белка оболочки бимовируса желтой мозаики ячменя и характеристика домена связывания с нуклеиновыми кислотами
Аннотация: Рекомбинантный белок оболочки (I) выделенного в Германии изолята вируса желтой мозаики ячменя гиперэкспрессирован в Escherichia coli, выделен из тел включения и ренатурирован. Связывание I с однонитевыми олигонуклеотидами ДНК и РНК является кооперативным и не зависит от последовательности. Методом сайт-направленного мутагенеза сконструированы укороченные варианты I. Анализ их связывания с ДНК и РНК показал, что у I домен связывания с нуклеиновыми кислотами состоит из сердцевины длиной 23 остатка (положения 125-147) и смежного участка (остатки 148-184), стимулирующего связывание. Библ. 20

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС ЖЕЛТОЙ МОЗАИКИ ЯЧМЕНЯ
ОБОЛОЧЕЧНЫЕ БЕЛКИ
ДНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ДОМЕНЫ

Доп.точки доступа:
Reichel, C.; Maas, C.; Schulze, S.; Schell, J.; Steinbiss, H.-H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.08-04Б1.147

Inhibition of HIV-1 rev-RRE interaction by diphenylfuran derivatives [Text] / Lynda Ratmeyer [et al.] // Biochemistry. - 1996. - Vol. 35, N 42. - P13689-13696 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Ингибирование взаимодействия Rev-RRE у ВИЧ-1 производными дифенилфурана
Аннотация: Синтезированы и изучены 8 катионных производных дифенилфурана (I), избирательно ингибирующих связывание белка Rev (II) ВИЧ-1 с РНК RRE. Флуоресцентное титрование и сдвиг электрофоретической подвижности показали, что I связываются с RRE и ингибируют образование комплекса с II зависящим от структуры образом. I с наибольшим сродством к RRC имеет константу ассоциации более 10{7} м{-1} и ингибирует образование комплекса II-RRE при концентрациях ниже 1 мкМ. Этот I связывается с RRE гораздо сильнее, чем с простыми дуплексами РНК. Изменения спектра поглощения и перенос энергии при образовании комплекса позволяют предположить, что этот I связывается по неклассическому механизму интеркаляции. Анализ модифицированных шпилек RRE методом кругового дихроизма показал, что активные I связываются со структурированной внутренней петлей RRE и вызывают изменение конформации. Наиболее активные I являются тетракатионами и связываются с RRE по механизму интеркаляции, вызывая изменение конформации РНК, к-рое является существенным для ингибирования образования комплекса II с RRE. США, Dep. of Chem., Georgia State Univ., Athers, GA 30303. Библ. 36

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ПОДАВЛЕНИЕ
ДИФЕНИЛФУРАН
ПРОИЗВОДНЫЕ

Доп.точки доступа:
Ratmeyer, Lynda; Zapp, Maria L.; Green, Michael R.; Vinayak, Ravi; Kumar, Arvind; Boykin, David W.; Wilson, David W.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.10-04Б1.95

Moras, D.
Protein-RNA interactions: Getting into the major groove [Text] / D. Moras, A. Poterszman // Curr. Biol. - 1996. - Vol. 6, N 5. - P530-532 . - ISSN 0960-9822
Перевод заглавия: РНК-белковые взаимодействия: попадание в большую канавку
Аннотация: Обзор. Методом ЯМР определена структура в растворе комплекса связывающегося с РНК домена белка Tat (I; остатки 68-81) вируса лейкоза крупного рогатого скота (ВЛКРС) со шпилькой РНК TAR ВЛКРС. В этом комплексе важную роль играют электростатич. взаимодействия основных остатков I с отрицательно заряженными фосфатами РНК. Остатки арг[70] и арг[77] образуют водородные связи с Г[14] и Г[9] в большой канавке РНК. Гуанидиновая группа арг[73] взаимодействует с атомами 06 и N7 остатка Г[11] в большой канавке и атомом 0 фосфата. Франция, IGBMC, 67404 Illkirch, C. U. de Strasbourg. Библ. 15

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
БЕЛОК TAT
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 14

Доп.точки доступа:
Poterszman, A.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.254

Merino, Enrique.
trp RNA-binding attenuation protein (TRAP)-trp leader RNA interactions mediate translational as well as transcriptional regulation of the Bacillus subtilis trp operon [Text] / Enrique Merino, Paul Babitzke, Charles Yanofsky // J. Bacteriol. - 1995. - Vol. 177, N 22. - P6362-6370 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Взаимодействия между связывающимся с РНК trp белком аттенюации (TRAP) и лидерной РНК trp опосредуют как трансляционную, так и транскрипционную регуляцию оперона trp Bacillus subtilis
Аннотация: В регуляции экспрессии оперона trp EDCFBA Bac. subtilis по механизму аттенюации транскрипции участвует активируемый триптофаном (I) белок TRAP (II) - продукт гена mtrB, связывающийся с мРНК trp (III). Образование взаимоисключающих антитерминаторной и терминаторной структур в лидерной области (ЛО) III определяет, будет ли транскрипция терминирована в ЛО. Транскрипты, избежавшие терминации, подвергаются трансляционной регуляции за счет образования вторичной структуры, блокирующей доступ рибосом к сайту связывания рибосом гена trpE. Для оценки относительной роли транскрипционной и трансляционной регуляции методом сайт-направленного мутагенеза изменены элементы, участвующие в этих 2 механизмах контроля. С использованием репортерного слияния trpE'-'lacZ измерены выход трансляции и уровни специфической мРНК с конструкциями, имеющими разные ЛО, в шт. mtrB{+} и mtrB{-} в присутствии и в отсутствие избытка I. Поведение измененных регуляторных областей изучено и методом транскрипции in vitro. Полученные данные показали, что связывание II с ЛО регулирует терминацию транскрипции в опероне trp в диапазоне 88 раз и трансляцию trpE в диапазоне 13 раз. Эти данные подтвердили роли, приписываемые различным сегментам ЛО III в транскрипционной и трансляционной регуляции. США, Dep. Biol. Sci., Stanford Univ., Stanford, CA 94305. Библ. 42

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.02
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН TRP
РЕГУЛЯЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИОННАЯ
ТРАНСЛЯЦИОННАЯ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
БЕЛОК АТТЕНЮАЦИИ TRAP
ЛИДЕРНАЯ РНК TRP
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Babitzke, Paul; Yanofsky, Charles

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.284

Complexes of N antitermination protein of phage 'лямбда' with specific and nonspecific RNA target sites on the nascent transcript [Text] / Gilst Marc R. Van [et al.] // Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 6. - P1514-1524 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Комплексы антитерминирующего белка N фага 'лямбда' со специфическими и неспецифическими сайтами мишенной РНК на новосинтезируемом транскрипте
Аннотация: Описаны 2 моды связывания антитерминирующего белка N (I) фага 'лямбда' с РНК: неспецифическая и специфическая. Свободный I в р-ре и I в комплексе с неспецифической РНК не имеет наблюдаемой вторичной или третичной структуры и связывается с ДНК независимо от ее последовательности с K[d]'ЭКВИВ'10{-6} M. В отличие от этого I частично сворачивается с образованием упорядоченной 'альфа'-спирали из 16-18 аминокислотных остатков и более прочно (K[d]'ЭКВИВ'10{-9} M) при образовании специфического комплекса 1:1 с узнаваемой I шпилькой РНК boxB. Разработана модель 2-стадийной антитерминации, зависящей от I, согласно к-рой эти специфические и неспецифические взаимодействия контролируют связывание I с новосинтезированным транскриптом. Количественно оценена роль выпетливания РНК в доставке связанного I к комплексу транскрипции и в стабильности антитерминирующего взаимодействия I с РНК-полимеразой (т. е. в специфичности антитерминатора). США, Inst. Molec. Biol., Univ. Oregon, Eugene, OR 97403. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ 'ЛЯМБДА'
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
БЕЛОК-АНТИТЕРМИНАТОР N
РНК МИШЕННАЯ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ВЫПЕТЛИВАНИЕ РНК
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Van, Gilst Marc R.; Rees, William A.; Das, Asis; von, Hippel Peter H.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.143

Theron, J.
Stable protein - RNA interaction involves the terminal domains of bluetongue virus mRNA, but not the terminally conserved sequences [Text] / J. Theron, L. H. Nel // Virology. - 1997. - Vol. 229, N 1. - P134-142 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: В стабильном РНК-белковом взаимодействии участвуют концевые домены мРНК вируса синего языка, но не концевые консервативные последовательности
Аннотация: Методом УФ-фотосшивки синтезированной in vitro {32}P-РНК вируса синего языка (ВСЯ) с белками в цитоплазматич. экстрактах зараженных ВСЯ клеток показано, что из всех белков ВСЯ наиболее сильно связывается с РНК белок NS2 (I). Конкуренция показала, что I имеет наибольшее сродство к 3'-концевой области транскриптов. Анализ связывания I с мутантными транскриптами РНК ВСЯ, не содержащими высококонсервативных 5'- и/или 3'-концевых последовательностей длиной 6 н., обнаружил, что эти участки не нужны для оптимального связывания. Конкуренция с несколькими гомологич. и негомологич. РНК и с двунитевой РНК (дРНК) ВСЯ показала, что: 1) I не связывается с дРНК; 2) I с различным сродством связывается с разными транскриптами. ЮАР, Dep. of Microbiol. and Plant Pathol., Univ. of Pretoria, Pretoria 0002. Библ. 44

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ОРБИВИРУСЫ
НЕСТРУКТУРНЫЕ БЕЛКИ
МРНК
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Nel, L.H.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 98.11-04А1.66

Guarente, Leonard.
Link between aging and the nucleolus [Text] / Leonard Guarente // Genes and Dev. - 1997. - Vol. 11, N 19. - P2449-2455 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Связь между старением и ядрышками
Аннотация: Обсуждается возможная роль изменения РНК-белковых взаимодействий в ядрышках, обеспечивающих синтез рРНК в старении. Отмечено, что старение может сопровождаться изменением взаимодействия теломер и ядрышек. Отмечается определенный параллелизм процессов, происходящих в клетках человека и дрожжей: т. е. одноклеточные организмы оказываются репрезентативной моделью процессов старения. Они позволяют выделить биохимические и генетические факторы, специфичные для делящихся клеток и клеток, прекративших деления, т. е. состарившихся. Полученные данные использованы при обсуждении проблемы точного определения процесса старения и выделения его отдельных фаз. Анализируемые факторы (в частности, то, что ядрышки признаются ключевыми факторами контроля механизмов старения) рассмотрены в связи с перспективами направленного омоложения (замедления старения) клеток и целых организмов. США, Dep. Biol., MIT, Cambridge, MA 02139. Библ. 48

ГРНТИ	34.03.27

ВИНИТИ 341.03.27.02
Рубрики: СТАРЕНИЕ
МЕХАНИЗМЫ
ЯДРЫШКО
РОЛЬ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ТЕЛОМЕРЫ
ЭУКАРИОТЫ

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.01-04Б1.108

In vitro genetic selection analysis of alfalfa mosaic virus coat protein binding to 3'-terminal AUGC repeats in the viral RNAs [Text] / Felicia Houser-Scott [et al.] // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 3. - P2310-2319 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Анализ методом генетической селекции in vitro связывания белка оболочки вируса мозаики костра с 3'-концевыми повторами АУГЦ в вирусных РНК
Аннотация: Белок оболочки (I) вируса мозаики костра (ВМК) специфически связывается в 3'-нетранслируемой области вирусной РНК, содержащей 4 повтора тетрануклеотида АУГЦ. Методом генетической селекции in vitro из первичного фонда молекул РНК длиной 39 н. со случайными заменами в повторах АУГЦ отобраны молекулы, связывающие I. После 6 циклов селекции-амплификации 25% молекул РНК содержит все 4 повтора АУГЦ. Среди 31 изученных клонов АУГЦ является предпочитаемой последовательностью во всех 4 повторах. Однако некоторая вариация возможна в тетрануклеотиде АУГЦ[865-868], если присутствуют 3 остальных повтора. Изучение связывания I с транскрибированной in vitro РНК, содержащей различные замены нуклеотидов показало, что повторы АУГЦ являются специфическими детерминантами связывания I. Высказано предположение, что I сохраняет 3'-концы геномных РНК во время репликации, стабилизируя структуру РНК в сайте инициации синтеза (-)-нити РНК. США, HST Division, Massachusetts Inst. of Technol., Cambridge, MA 02139. Библ. 51

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МОЗАИКИ КОСТРА
РЕПЛИКАЦИЯ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Houser-Scott, Felicia; Ansel-McKinney, Patricia; Jun-Ming, Cai; Gehrke, Lee

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 99.02-04Я6.56

Will, Cindy L.
Protein functions in pre-mRNA splicing [Text] / Cindy L. Will, Reinhard Luhrmann // Curr. Opinion Cell Biol. - 1997. - Vol. 9, N 3. - P320-328 . - ISSN 0955-0674
Перевод заглавия: Функции белков в сплайсинге пре-мРНК
Аннотация: Обзор. Рассмотрены белок-белковые и РНК-белковые взаимодействия у Saccharomyces cerevisia во время образования раннего комплекса (Е) сплайсинга при привлечении sn-РНП U2 к сайту ветвления, при выборе 3{'}-сайта сплайсинга и во время конформац. изменений РНК в течение сплайсинга. Все эти взаимодействия являются динамическими. Новые данные показали, что белки принимают непосредственное участие в образовании активных центров сплайсосомы. Германия, Inst. fur Molekularbiol. und Tumorforschung, Philipps Univ. Marburg, 35037 Marburg. Библ. 92

ГРНТИ	34.19.19

ВИНИТИ 341.19.19.01
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
СПЛАЙСИНГ
РЕГУЛЯЦИЯ
ВЛИЯНИЕ
БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Luhrmann, Reinhard

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.344

Will, Cindy L.
Protein functions in pre-mRNA splicing [Text] / Cindy L. Will, Reinhard Luhrmann // Curr. Opinion Cell Biol. - 1997. - Vol. 9, N 3. - P320-328 . - ISSN 0955-0674
Перевод заглавия: Функции белков в сплайсинге пре-мРНК
Аннотация: Обзор. Рассмотрены белок-белковые и РНК-белковые взаимодействия у Saccharomyces cerevisia во время образования раннего комплекса (Е) сплайсинга при привлечении sn-РНП U2 к сайту ветвления, при выборе 3{'}-сайта сплайсинга и во время конформац. изменений РНК в течение сплайсинга. Все эти взаимодействия являются динамическими. Новые данные показали, что белки принимают непосредственное участие в образовании активных центров сплайсосомы. Германия, Inst. fur Molekularbiol. und Tumorforschung, Philipps Univ. Marburg, 35037 Marburg. Библ. 92

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.21.03.03
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
СПЛАЙСИНГ
РЕГУЛЯЦИЯ
ВЛИЯНИЕ
БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Luhrmann, Reinhard

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.04-04Б1.305

Viral coat protein peptides with limited sequence homology bind similar domains of alfalfa mosaic virus and tobacco streak virus RNAs [Text] / Maud M. Swanson [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 4. - P3227-3234 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Вирусные пептиды белковой оболочки с ограниченной гомологией последовательности связывают сходные области вирусных РНК вируса мозаики люцерны и вируса штриховатости табака
Аннотация: Для активации ранних стадий репликации вирусной РНК у вирусов мозаики люцерны (AMV) и иларивирусов (типовой член - вирус штриховатости табака TSV) необходим белок оболочки (феномен активации генома). Гомология белка оболочки AMV и TSV ограничена, однако, они взаимозаменяемы в активации вирусной репликации. Авторы сравнили биохимическое связывание химически синтезированных пептидов с фрагментами РНК двух вирусов. Пептиды белка оболочки TSV, богатые аргинином связывают вирусную РНК с более низкой степенью, чем пептиды AMV богатые лизином. При включении в инфекционный инокулум, 3{'}-концевые фрагменты РНК AMV и TSV подавляли репликацию РНК AMV, хотя РНК, неспособные связывать белок оболочки, не влияли значительно на репликацию. Очевидна уникальность белков оболочки AMV и иларивирусов. Великобритания, Scottish Crop Research Inst., Invergowrie Dundee, DD2 5DA. Библ. 58

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС МОЗАИКИ ЛЮЦЕРНЫ
ВИРУС ШТРИХОВАТОСТИ ТАБАКА
ОБОЛОЧЕЧНЫЕ БЕЛКИ
ПЕПТИДЫ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Swanson, Maud M.; Ansel-McKinney, Patricia; Houser-Scott, Felicia; Yusibov, Vidadi; Loesch-Fries, L.Sue; Gehrke, Lee

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.06-04Б1.69

RNA-protein interactions: Involvement of NS3, NS5, and 3' noncoding regions of Japanese encephalitis virus genomic RNA [Text] / Chun-Jung Chen [et al.] // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 5. - P3466-3473 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: РНК-белковые взаимодействия: участие NS3, NS5 и 3'-некодирующих областей геномной РНК вируса японского энцефалита
Аннотация: Для идентификации белков, связывающихся с 3'-некодирующей областью (3'-НКО) (+)-нити РНК вируса японского энцефалита (ВЯЭ), использован метод УФ-сшивки. Найдено, что с этой областью связываются белки р71 (I) и р110 (II) из экстрактов зараженных ВЯЭ клеток. Кол-во I и II увеличивается во время заражения ВЯЭ и коррелирует с уровнем синтеза РНК ВЯЭ. УФ-сшивка в сочетании с Вестерн-блотом и иммунопреципитацией показала, что I и II являются белками NS5 и NS3 ВЯЭ соотв. - компонентами РНК-репликазы. Для связывания I и II требуется шпилька в 3'-НКО (+)-нити. I и II взаимодействуют друг с другом и образуют белок-белковый комплекс in vivo. Эти данные позволили предположить, что 3'-НКО геномной РНК ВЯЭ образует с I и II репликативный комплекс, к-рый может участвовать в синтезе (-)-нити РНК ВЯЭ. Тайвань, Inst. Preventive Med., Nat. Defense Med. Ctr., Sanhsia, Taipei. Библ. 57

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС ЯПОНСКОГО ЭНЦЕФАЛИТА
РНК ГЕНОМНАЯ
НЕСТРУКТУРНЫЕ БЕЛКИ
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Chen, Chun-Jung; Kuo, Ming-Der; Chien, Li-Jung; Hsu, Shu-Ling; Wang, Yu-Ming; Lin, Ju-Hung

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.06-04Б1.85

Determinants of the human immunodeficiency virus type 1 p15NC-RNA interaction that affect enhanced cleavage by the viral protease [Text] / Nijing Sheng [et al.] // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 8. - P5723-5732 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Детерминанты взаимодействия p15NC-РНК вируса иммунодефицита человека типа 1 влияют на повышенное расщепление вирусной протеазой
Аннотация: При сборке вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) происходит расщепление предшественника белка Gag вирусной протеазой, что приводит к преходящему появлению промежуточного продукта p15NC. Использование белка-предшественника p15NC, продуцируемого in vitro в системе транскрипции-трансляции или очищенного после экспрессии в E. coli, показало, что РНК необходима для эффективного расщепления p15NC ВИЧ-1. Опыты по подвижности в геле и связыванию с нитроцеллюлезными фильтрами показали, что очищенный белок p15NC специфически связывается с соответствующими мРНК с определенной Kd в 1,5 нМ. На связывание не влияло присутствие или отсутствие цинка и ЕДТА. Более того мутагенез в остатках цистеина внутри каждой из двух областей цистеин-гистидин не влиял на связывание РНК или на зависимое от РНК расщепление вирусной протеазой. В то же время, уменьшение связывания РНК и снижение восприимчивости к расщеплению in vitro наблюдались при мутациях p15NC в одном или более остатках внутри триплета основных аминокислот, присутствующих в области между двумя цинковыми пальцами. В дополнение было обнаружено, что олигонуклеотиды ДНК или РНК из 21-24 нуклеотидов индивидуальной нуклеотидной последовательности (нукл. ПС) и вторичной структуры могли заменять РНК для p15 в повышении расщепления p15NC. Вирусные частицы, несущие мутации в триплете основных аминокислот NC (P3BE), обладают пониженным расщеплением p15NC и дефектом в формировании сердцевины, несмотря на случайное появление полностью подвергшихся процессингу вирусных белков. Таким образом, детерминанты во взаимодействии p15NC-РНК, к-рые приводят к повышению передающегося протеазой расщепления, определяют важность триплета из основных аминокислот для формирования сердцевины вируса. США, Molecular Biol. Dep., The DuPont Merck Pharmaceutical Co., Wilmington, DE 19880-0336. Библ. 72

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
РНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ДЕТЕРМИНАНТЫ
ПРОТЕАЗНОЕ РАСЩЕПЛЕНИЕ
УСИЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Sheng, Nijing; Pettit, Steve C.; Tritch, Radonna J.; Ozturk, Derya H.; Rayner, Marlene M.; Swanstrom, Ronald; Erickson-Viitanen, Susan

1-20 21-40 41-60 61-80 81-88

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска