Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Itoh, Yoshifumi$<.>)
Общее количество найденных документов : 27
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-27 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.188

   

    A new IS4 family insertion sequence, IS4Bsu1, responsible for genetic instability of poly-'гамма'-glutamic acid production in Bacillus subtilis [Text] / Toshiro Nagai [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 9. - P2387-2392 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новая инсерционная последовательность IS4Bsu1 семейства IS4, ответственная за нестабильность продукции поли-'гамма'-глутаминовой кислоты у Bacillus subtilis
Аннотация: У Bacillus subtilis natto синтез поли-'гамма'-глутаминовой кислоты (I) контролируется 2-компонентной системой ComP-ComA и индуцируется в начале стационарной фазы роста. У спонтанного мутанта Bac. subtilis natto NAF4, не продуцирующего I, в гене comP обнаружена новая инсерционная последовательность, названная IS4Bsu1. Она имеет длину 1406 п. н. и кодирует транспоназу (II) длиной 374 остатка (мол. м. 34 895), похожую на II семейства IS4. В хромосоме штаммов Bac. subtilis natto, включая NAF4, 3 коммерч. стартерных сайта для ферментации соевых бобов и 3 продуцирующих I штамма, обнаружены 6-11 копий IS4Bsu1, в т. ч. 6 копий в одних и тех же локусах. Все 8 спонтанных не продуцирующих I мутантов, выделенных из независимых культур штамма NAF4, имеют новую дополнительную копию IS4Bsu1 в 6 разных положениях в пределах 600 п. н. 5'-концевой области comP. Мишенными сайтами для IS4Bsu1 являются AT-богатые последовательности длиной 3 п. н. Полученные данные показали, что: 1) IS4Bsu1 транспонируется по репликативному, а не по консервативному механизму, как другие члены IS4; 2) большинство спонтанных не продуцирующих I мутантов образуется в результате интеграции IS4Bsu1 в ген comP, являющийся горячей точкой инсерции. Это объясняет высокую частоту спонтанных мутаций, блокирующих продукцию I и обусловленных IS4Bsu1. Япония, Nat. Food Res. Inst., Ministry Agr., Forestry and Fisheries, Tsukuba 305-8642. Библ. 49
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА ПОЛИ-ГАММА-ГЛУТАМИНОВОЙ КИСЛОТЫ

НЕСТАБИЛЬНОСТЬ

ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ IS4BSU1

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ФУНКЦИЯ

BACILLUS SUBTILIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Nagai, Toshiro; Tran, Lam-Son Phan; Inatsu, Yasuhiro; Itoh, Yoshifumi


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 97.05-04М1.286

    Itoh, Yoshifumi.

    Activation of the progelatinase A (PROMMP-2) complexed with tissue inhibitor of metalloproteinase (TIMP)-2 by a cell surface activator of human uterine cervical fibrolblasts [Text] / Yoshifumi Itoh, Sharon Binner, Hideaki Nagase // Ketsugo soshiki = Connect. Tissue. - 1995. - Vol. 27, N oct. Suppl. - P23 . - ISSN 0916-572X
Перевод заглавия: Активация прожелатиназы А (proMMP-2) в ее комплексе с тканевым ингибитором TIMP-2 металлопротеиназы активатором поверхности фибробластов из шейки матки человека
Аннотация: Культивируемые фибробласты из шейки матки человека конститутивно синтезируют и секретируют протеиназу матрикса MMP-2/желатиназу А в виде proMMP-2 в комплексе с TIMP-2. Инкубация proMMP-2 с 4-аминофенилмеркуриацетатом или с эндогенным связанным с мембранами активатором ведет к активации профермента с образованием MMP-2 67 кД. Комплекс не подвергается такой активации и подавляет активные металлопротеиназы матрикса. В составе комплекса TIMP-2 под действием 4-аминофенилмеркуриацетата утрачивает свою ингибиторную активность. США, Dep. Bioch. a. Mol. Biol., Univ. Kansas Med. Ctr, Kansas City, KS 66160-7421
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.41.15.09.07
Рубрики: ПРОЖЕЛАТИНАЗА А
АКТИВАЦИЯ

КОМПЛЕКС

ИНГИБИТОР МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗЫ

ФИБРОБЛАСТЫ

МАТКА

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Binner, Sharon; Nagase, Hideaki


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.210

   

    AxyR, an AraC family transcriptional activator of the xylanase 3 gene, requires xylo-oligosaccharides as a cofactor for DNA binding in Paenibacillus sp. strain W-61 [Text] / Mutsumi Fukuda [et al.] // Biosci., Biotechnol. and Biochem. - 2012. - Vol. 76, N 5. - P1051-1054 . - ISSN 0916-8451
Перевод заглавия: AxyR, транскрипционный активатор ксиланазы гена 3 из семейства AraC, нуждается в ксило-олигосахаридах как кофакторе для связывания ДНК в Paenibacillus sp. штамм W-61
Аннотация: Ксиланолитическая бактерия Paenibacillus sp. штамм W-61 кодирует три гена внеклеточной ксиланазы xyn1, xyn3 и xyn5. Идентифицировали транскрипционный активатор, необходимый для транскрипции гена xyn3 в штамме W-61. Активатор AxyR содержит ДНК-связывающий домен AraC-типа и требует ксилобиозу, ксилотриозу или ксилотетраозу как кофактор для связывания с промоторным районом xyn3. Япония, Dep. of Microbial Biotechnology, Graduate Sch. of Agricultural Sci., Tohoku Univ., 1-1 Tsutsumidori, Amamiyamachi, Sendai 981-8555
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ АКТИВАТОР AXYR

ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН ARAC-ТИПА

НУЖДАЕТСЯ

КОФАКТОРЫ ДЛЯ СВЯЗЫВАНИЯ ДНК

КСИЛО-ОЛИГОСАХАРИДЫ

ГЕНЫ

ГЕН ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ КСИЛАНАЗЫ XYN3

ТРАНСКРИПЦИЯ

PAENIBACILLUS (BACT.)

ШТАММ W-61


Доп.точки доступа:
Fukuda, Mutsumi; Yoshida, Shigeki; Itoh, Hiroya; Kato, Yoji; Watanabe, Seiji; Itoh, Yoshifumi; Kamio, Yoshiyuki; Kaneko, Jun


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.08-04Б2.178

   

    Cadaverine covalently linked to peptidoglycan is required for interaction between the peptidoglycan and the periplasm-exposed S-layer-homologous domain of major outer membrane protein Mep45 in Selenomonas ruminantium [Text] / Seiji Kojima [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 22. - P5953-5961 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Кадаверин, ковалентно, связанный с пептидогликаном, требуется для взаимодействия между пептидогликаном и гомологичным доменом S-слоя большого белка наружной мембраны Mep-45 в Selemonas ruminantium
Аннотация: Определили нуклеотидную последовательность гена mep-45 и исследовали взаимосвязь между PG-кадаверином, Mep-45 и структурой клеточной поверхности Selenomonas ruminantium. Анализ аминокислотной последовательности показал, что Мер-45 включает N-концевой гомологичный домен S-cлоя (SHL) с последующим включением альфа-спирального района и С-концевого богатого бета-нитями района. Установили, что SHL-домен отвечает за связывание с пептидогликаном. Определили, что Мер-45 связывается с пептидогликаном в зависимости от присутствия PG-кадаверина. Дефектный PG-кадаверин уменьшает структурные взаимодействия с пептидогликаном и наружной мембраной. Предположили, что PG-кадаверин функционально важен для осуществления структурной связи между пептидогликаном и наружной мембраной благодаря специфичному взаимодействию с SHL-доменом Мер-45. Япония, Lab of Applied Microbiology, Dep. of Microbial Biotechnology, Graduate Sch of Agricultural Sci., Tohoku Univ., Tsutsumi-dori Amamiya-machi 1-1, Aoba-ku, Sendai 981-8555
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.29
Рубрики: КЛЕТОЧНАЯ ПОВЕРХНОСТЬ
СТРУКТУРА

МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ

БЕЛОК НАРУЖНОЙ МЕМБРАНЫ MEP-45

ДОМЕН S-СЛОЯ

ПЕТИДОГЛИКАНЫ

КАДАВЕРИН

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

SELEMONAS RUMINANTIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Kojima, Seiji; Ko, Kyong-Cheol; Takatsuka, Yumiko; Abe, Naoki; Kaneko, Jun; Itoh, Yoshifumi; Kamio, Yoshiyuki


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.13

    Inatsu, Yasuhiro.

    Characterization of Bacillus subtilis strains isolated from fermented soybean foods in Southeast Asia: Comparison with B. subtilis (natto) starter strains [Text] / Yasuhiro Inatsu, Keitarou Kimura, Yoshifumi Itoh // JARQ: Jap. Agr. Res. Quart. - 2002. - Vol. 36, N 3. - P169-175 . - ISSN 0021-3551
Перевод заглавия: Описание штаммов Bacillus subtilis, выделенных из ферментированных соединений блюд, приготовляемых в юго-восточной Азии. Сравнение со штаммами B. subtilis - заквасок для приготовления [японского блюда] natto
Аннотация: Проводили сравнение 90 штаммов Bacillus subtilis, используемых в заквасках для изготовления ферментируемых соевых блюд в Восточной и Юго-восточной Азии, со штаммом-закваской B. subtilis (natto), применяемым в Японии при изготовлении несоленого соевого блюда натто. У штаммов сравнивали образование поли-'гамма'-глутамата, протеазы и амилазы, проводили фаготипирование и наследуемость вставочной последовательности (ВП) IS4Bsu1. У всех изолятов нашли высокий уровень протеазы при различных уровнях активности амилазы. Ни один из штаммов не принадлежал к стандартному фаготипу B. subtilis, но 11 иностранных штаммов принадлежали к тому же фаготипу, что и B. subtilis (natto). 63 изолята образовывали полиглутамат, главный компонент, отвечающий за слизистый материал в блюде натто. 28 изолятов в своем геноме содержали ВП-элемент, при этом число его копий колебалось от 1 до 17. Очевидно, ВП-элемент широко распространен среди штаммов B. subtilis, ферментирующих несоленые соевые блюда, подобные "Tua Nao" в Таиланде (90%) и "Kinema" в Непале (56%). В соленых блюдах из сои, например, в китайском "Douchi", только 15% штаммов B. subtilis несло в геноме элемент ВП. Связей между ВП и образованием полиглутамата не выявили. Нуклеотидная последовательность ВП-элементов у B. subtilis (natto) и у 9 штаммов из 90 в случайной выборке была одинаковой. У 4 других штаммов из 90 выявили только от одной до трех мутаций в этой последовательности. Делается заключение, что участок IS4Bsu1 в штаммах B. subtilis, встречающихся в соевых блюдах, имеет недавнее происхождение. Япония, Food Hygiene Res. Team, Nat. Food Res. Inst., Tsukuba, Ibaraki 305-8642, E-mail:inatu@nfri.affrc.go.jp. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.02
Рубрики: BACILLUS SUBTILIS (BACT)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ СОЕВОГО ПРОДУКТА

СРАВНЕНИЕ ШТАММОВ

ГЕНОМЫ

ВСТАВОЧНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

РАСПРОСТРАНЕНИЕ СРЕДЫ ШТАММОВ

ФЕРМЕНТЫ

ФАГОТИПИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Kimura, Keitarou; Itoh, Yoshifumi


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.11-04Б3.90

    Inatsu, Yasuhiro.

    Characterization of Bacillus subtilis strains isolated from fermented soybean foods in Southeast Asia: Comparison with B. subtilis (natto) starter strains [Text] / Yasuhiro Inatsu, Keitarou Kimura, Yoshifumi Itoh // JARQ: Jap. Agr. Res. Quart. - 2002. - Vol. 36, N 3. - P169-175 . - ISSN 0021-3551
Перевод заглавия: Описание штаммов Bacillus subtilis, выделенных из ферментированных соединений блюд, приготовляемых в юго-восточной Азии. Сравнение со штаммами B. subtilis - заквасок для приготовления [японского блюда] natto
Аннотация: Проводили сравнение 90 штаммов Bacillus subtilis, используемых в заквасках для изготовления ферментируемых соевых блюд в Восточной и Юго-восточной Азии, со штаммом-закваской B. subtilis (natto), применяемым в Японии при изготовлении несоленого соевого блюда натто. У штаммов сравнивали образование поли-'гамма'-глутамата, протеазы и амилазы, проводили фаготипирование и наследуемость вставочной последовательности (ВП) IS4Bsu1. У всех изолятов нашли высокий уровень протеазы при различных уровнях активности амилазы. Ни один из штаммов не принадлежал к стандартному фаготипу B. subtilis, но 11 иностранных штаммов принадлежали к тому же фаготипу, что и B. subtilis (natto). 63 изолята образовывали полиглутамат, главный компонент, отвечающий за слизистый материал в блюде натто. 28 изолятов в своем геноме содержали ВП-элемент, при этом число его копий колебалось от 1 до 17. Очевидно, ВП-элемент широко распространен среди штаммов B. subtilis, ферментирующих несоленые соевые блюда, подобные "Tua Nao" в Таиланде (90%) и "Kinema" в Непале (56%). В соленых блюдах из сои, например, в китайском "Douchi", только 15% штаммов B. subtilis несло в геноме элемент ВП. Связей между ВП и образованием полиглутамата не выявили. Нуклеотидная последовательность ВП-элементов у B. subtilis (natto) и у 9 штаммов из 90 в случайной выборке была одинаковой. У 4 других штаммов из 90 выявили только от одной до трех мутаций в этой последовательности. Делается заключение, что участок IS4Bsu1 в штаммах B. subtilis, встречающихся в соевых блюдах, имеет недавнее происхождение. Япония, Food Hygiene Res. Team, Nat. Food Res. Inst., Tsukuba, Ibaraki 305-8642, E-mail:inatu@nfri.affrc.go.jp. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.11
Рубрики: BACILLUS SUBTILIS (BACT)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ СОЕВОГО ПРОДУКТА

СРАВНЕНИЕ ШТАММОВ

ГЕНОМЫ

ВСТАВОЧНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

РАСПРОСТРАНЕНИЕ СРЕДЫ ШТАММОВ

ФЕРМЕНТЫ

ФАГОТИПИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Kimura, Keitarou; Itoh, Yoshifumi


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 00.02-04Б4.170

    Nagai, Toshirou.

    Chemical analysis of poly-'гамма'-glutamic acid produced by plasmid-free Bacillus subtilis (natto): Evidence that plasmids are not involved in poly-'гамма'-glutamic acid production [Text] / Toshirou Nagai, Kumiko Koguchi, Yoshifumi Itoh // J. Gen. and Appl. Microbiol. - 1997. - Vol. 43, N 3. - P139-143 . - ISSN 0022-1260
Перевод заглавия: Химический анализ поли-'гамма'-глутаминовой кислоты, продуцируемой свободными от плазмид клетками Bacillus subtilis (natto): доказательство того, что плазмиды не вовлечены в продуцирование поли-'гамма'-глутаминовой кислоты
Аннотация: Постулировано, что ген psf на малой плазмиде pUH1 положительно регулирует синтез капсулярной поли-'гамма'-глутаминовой к-ты у Bacillus subtilis (natto). Обнаружено, что этот штамм имеет вторую плазмиду pNAGL1. Свободный от плазмид штамм NAF4, полученный из B. subtilis (natto), продуцирует поли-'гамма'-глутаминовую к-ту, имеющую тот же мол. вес и содержание D-глутаминовой к-ты и в тех кол-вах, что и родительский штамм. Как и у родительских клеток, кол-во D-глутаминовой к-ты достигает 80% от общего кол-ва глутаминовой к-ты в поли-'гамма'-глутаминовой к-ты, продуцируемой штаммом NAF4, росшим в присутствии 0,1 мМ MnCl[2]. Считается, что плазмиды не кодируют никакого гена, важного для продуцирования поли-'гамма'-глутаминовой к-ты. Япония, Div. Appl. Microbiol., Nat. Food Res. Inst., Ministry Agr., Forestry and Fisheries, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba 305. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: ПОЛИ-'ГАММА'-ГЛУТАМИНОВАЯ КИСЛОТА
БИОСИНТЕЗ

B. SUBTILIS (NATTO)

ПЛАЗМИДА PNAGL1

ВЛИЯНИЕ


Доп.точки доступа:
Koguchi, Kumiko; Itoh, Yoshifumi


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 90.01-04Т4.162

   

    Cloning of the P. aeruginosa cytotoxin gene by oligonucleotide probe [Text] / Tetsuja Hayashi [et al.] // Jap. J. Med. Sci. and Biol. - 1988. - Vol. 41, N 5-6. - P211-212 . - ISSN 0021-5112
Перевод заглавия: Клонирование гена цитотоксина P. aeruginosa с помощью олигонуклеотидных зондов
Аннотация: Определена последовательность N-терминальных аминокислот (АК) очищенного цитотоксина (ЦТ) штамма 158 Pseudomonas aeruginosa. Синтезированы 17 аминонуклеотидных зондов, соответствующих последовательности первых шести АК. Определена последовательность нуклеотидов гена ЦТ. Авт. полагают, что неактивный предшественник гена ЦТ локализован в цитоплазме и что протеолиз N-терминальной области не задействован в процессе активации. Япония, Shinshu Univ., School of Med., Matsumoto-shi, Nagano 390. Библ. 3.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.47.21.29.15.02
Рубрики: БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ТОКСИНЫ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA

ЦИТОТОКСИН

СТРУКТУРА

ГЕН

КЛОНИРОВАНИЕ

МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ


Доп.точки доступа:
Hayashi, Tetsuja; Itoh, Yoshifumi; Kamio, Yoshiyuki; Terawaki, Yoshiro


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 02.12-04Я6.15

   

    Cytoplasmic tail-dependent internalization of membrane-type 1 matrix metalloproteinase is important for its invasion-promoting activity [Text] / Takamasa Uekita [et al.] // J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 155, N 7. - P1345-1356 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Интернализация металлопротеиназы матрикса мембранного типа 1, зависимая от цитоплазматического конца, важна для ее активности, стимулирующей инвазию
Аннотация: Показали, что в клетках CHO-K1 интернализация металлопротеиназы матрикса мембранного типа 1 (MT1-MMP) происходит от поверхности клеток и этот процесс зависит от остатков Di-Leu{571-572}, Leu{578-579} и тирозина{573} на ее цитоплазматическом конце. Интернализация MT1-MMP протекает также с участием 'мю'2-субъединицы адапторного белка 2, компонента ямок, покрытых клатрином. Интернализация MT1-MMP происходит преимущественно на адгезивном конце и колокализована с клатрин-покрытыми везикулами. Мутации вызывают нарушение интернализации и, хотя в этом случае MT1-MMP не способна к клеточной миграции, они не влияют на ее протеолитическую активность. Япония [Motoharu Seiki], Div. Cancer Cell Res., Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku, Tokyo 108-8639, Fax: 81-3-5449-5414. E-mail: mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp. Библ. 32
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.17.05.11
Рубрики: ПЛАЗМАТИЧЕСКАЯ МЕМБРАНА
МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА МЕМБРАННОГО ТИПА

ИНТЕРНАЛИЗАЦИЯ

СВЕРХЭКСПРЕССИЯ

КЛЕТКИ CHO-K1


Доп.точки доступа:
Uekita, Takamasa; Itoh, Yoshifumi; Yana, Ikuo; Ohno, Hiroshi; Seiki, Motoharu


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.226

    Nakada, Yuji.

    Divergent structure and regulatory mechanism of proline catabolic systems: Characterization of the putAP proline catabolic operon of Pseudomonas aeruginosa PAO1 and its regulation by PruR, an AraC/XylS family protein [Text] / Yuji Nakada, Takayuki Nishijyo, Yoshifumi Itoh // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 20. - P5633-5640 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Различная структура и регуляторный механизм систем катаболизма пролина: характеристика оперона putAP Pseudomonas aeruginosa PAO1 и его регуляция белком PruR из семейства AraC/XylS
Аннотация: Охарактеризовали локус pruR-putAP, кодирующий систему катаболизма пролина Pseudomonas aeruginosa PAO1. Показали, что в данном штамме, в отличие от других грамотрицательных бактерий два гена putA и putP, кодирующие пролин-пермеазу, формируют оперон. Установили филогенетическую связь с P. putida (80% идентичности по PutP белку и 47% - по PutA). PutA, в отличие от такового белка других бактерий, в данном штамме утратил регуляторную функцию. Ген pruR (регулятор утилизации пролина), кодировал транскрипционный активатор семейства белков AraC/XylS и участвовал в экспрессии putAP, индуцированной пролином. Идентифицировали PruR-зависимый промотор, ответственный за пролин в 5'-фланкированном районе putA. Сделан вывод, что система утилизации пролина P. aeruginosa отличается от таковой P. putida по структуре putA, организации генов putAB и регуляторному механизму экспрессии putA. Япония, Dep. of Applied Microbiol., Nat. Food Res. Inst., Tsukuba 305-8642. Библ. 44
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: КАТАБОЛИЗМ
ПРОЛИН

ФЕРМЕНТЫ

ПРОЛИН-ПЕРМЕАЗА

СИНТЕЗ

ФУНКЦИЯ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ОПЕРОН PUT AP

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ PRUR

PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Nishijyo, Takayuki; Itoh, Yoshifumi


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.06-04Б2.248

    Tran, Lam-Son Phan.

    Divergent structure of the ComQXPA quorum-sensing components: Molecular basis of strain-specific communication mechanism in Bacillus subtilis [Text] / Lam-Son Phan Tran, Toshiro Nagai, Yoshifumi Itoh // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 37, N 5. - P1159-1171 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Дивергентная структура компонентов чувства кворума ComQXPA: молекулярная основа штаммоспецифичного механизма коммуникации у Bacillus subtilis
Аннотация: Выделен индуцированный вставкой транспозона Tn917-LTV1 мутант Bacillus subtilis (natto) NAF4, дефектный по продукции поли-'гамма'-глутамата (I). Секвенирование показало, что вставка транспозона затронула ген comP системы чувства кворума ComQXPA. Это показало, что синтез I находится под контролем сигнальной системы ComP (II)-ComA (III). Первичные структуры белков ComQ и ComX и сенсорного домена II идентичны между Bac. subtilis (natto) NAF4 и Bac. subtilis 168 соотв. на 44, 26 и 36%. Однако некоторые домены сенсора II и регулятора ответа III совпадают (идентичность соотв. 95 и 100%). Гены comP штаммов NAF4 и 168 восстанавливают соотв. нарушенную компетентность Bac. subtilis BD1658 (comP::cat) и продукцию I у Bac. subtilis natto NAF12 (comP::Tn917-LTV1) лишь на 15%. Однако при введении вместе с родственными генами comQ и comX они полностью исправляют указанные дефекты у гетерологичных мутантов comP. Подобно системам comCDE Streptococcus и agrBCDE Staphylococcus aureus, согласованная вариация генов comQXP устанавливает специфич. межклеточную коммуникацию между штаммами Bac. subtilis, имеющими одну и ту же феромоновую систему. Япония, Div. Applied Microbiol., Nat. Food Res. Inst., Tsukuba 395-8642. Библ. 65
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ПОЛИ-'ГАММА'-ГЛУТАМАТ
СИНТЕЗ

КОММУНИКАЦИЯ

BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

ШТАММОСПЕЦИФИЧНЫЙ МЕХАНИЗМ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ОСНОВА

ГЕНЫ COMQXP

СОГЛАСОВАННАЯ ВАРИАЦИЯ

ЧУВСТВО КВОРУМА

КОМПОНЕНТЫ

ДИВЕРГЕНТНАЯ СТРУКТУРА


Доп.точки доступа:
Nagai, Toshiro; Itoh, Yoshifumi


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.03-04Б2.535

   

    Effects of mutations in the repA gene of plasmid Rts1 on plasmid replication and autorepressor function [Text] / Yoshiro Terawaki [et al.] // J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 2. - P786-792 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Влияние мутаций гена repA плазмиды Rts1 на ее репликцию и функцию авторепрессии
Аннотация: Сконструирована система, в к-рой белок RepA дикого типа либо белок RepA cop1 сосуществовал с mini-Rts1 плазмидами путем клонирования repA либо repA cop1 под контроль промотора дикого типа при наличии операторной последовательности, или без нее. Усановлено, что белок RepA cop1, даже будучи в избытке, может инициировать репликацию mini - Rts1 плазмиды как при 37'ГРАДУС', так и при 42'ГРАДУС' С. Напротив, избыток RepA дикого типа ингибировал репликацию плазмиды при 37'ГРАДУС', но не при 42'ГРАДУС' С. Два мутантных белка RepA, каждый из к-рых содержал по 4 аминокислотных инсерции в средней части, сохраняли авторепрессорную активность и свойства несовместимости, а также не теряли функции активации ori/Rts1/. Япония, Dep. Bacteriology, Shinshu Univ. School of Medicine, Asahi 3-1-1, Matsumoto 390.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ДНК ПЛАЗМИДНАЯ

РЕПЛИКАЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛКИ REP

ПОЛИФУНКЦИОНАЛЬНОСТЬ

АВТОРЕПРЕССОРНАЯ АКТИВНОСТЬ

АКТИВАЦИЯ ORI

ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН REPA

МУТАЦИИ


Доп.точки доступа:
Terawaki, Yoshiro; Nozue, Hatsumi; Zeng, Hong; Hayashi, Tetsuya; Kamio, Yoshiyuki; Itoh, Yoshifumi


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 06.05-04Я6.217

   

    Homophilic complex formation of MT1-matrix metalloproteinase is essential to express collagenolytic activity on the cell surface [Text] : тез.[Spring Meeting of the British Society for Matrix Biology, Liverpool, March 21-22, 2005] / Yoshifumi Itoh [et al.] // Int. J. Exp. Pathol. - 2005. - Vol. 86, N 6. - PA77 . - ISSN 0959-9673
Перевод заглавия: Образование гомофильного комплекса МТ1-металлопротеиназа матрикса необходимо для экспрессии коллагенолитической активности на клеточной поверхности
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.21.07
Рубрики: МТ1-МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА
СВЕРХЭКСПРЕССИЯ

КУЛЬТУРА КЛЕТОК

КУЛЬТУРАЛЬНЫЕ СРЕДЫ

ПЛЕНКА КОЛЛАГЕНА

КЛЕТКИ COS7


Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi; Ito, Noriko; Nagase, Hideaki; Seiki, Motoharu


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.06-04Б2.165

    Nakada, Yuji.

    Identification of the putrescine biosynthetic genes in Pseudomonas aeruginosa and characterization of agmatine deiminase and N-carbamoylputrescine amidohydrolase of the arginine decarboxylase pathway [Text] / Yuji Nakada, Yoshifumi Itoh // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 3. - P707-714 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Идентификация генов биосинтеза путресцина у Pseudomonas aeruginosa и характеристика агматин-деиминазы и N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы аргинин-декарбоксилазного пути
Аннотация: Путресцин у бактерий может образовываться в клетке непосредственно из орнитина с помощью фермента SpeC (орнитин-декарбоксилазы) (путь ODC) или обходным путем из аргинина при участии фермента SpeA (аргинин-декарбоксилазы) (путь ADC). Получен мутант Pseudomonas aeruginosa PAO1, дефектный по обоим гена speA и speC. Этот штамм оказался ауксотрофом по путресцину. Показано, что у P. aeruginosa в пути ADC могут участвовать также ферменты катаболизма агматина - AguA (агматин-деиминазы) и AguB (N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы). Мутант aguAB speC также является ауксотрофом по путресцину. Белки AguA и AguB очищены, изучены их биохимические характеристики. Фермент AguA структурно не похож на известные C-N-гидролазы, а фермент AguB является белков семейства нитрилаз. Япония [Itoh. Y.], Div. of Appl. Microbiol., National Food Res. Inst., Kannondai 2-1-12, Tsukuba Ibaraki 305-8642. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ПУТРЕСЦИН

БИОСИНТЕЗ

ФЕРМЕНТЫ

АГМАТИН-ДЕИМИНАЗА

N-КАРБАМОИЛПУТРЕСЦИН-АМИДОГИДРОЛАЗА

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ФУНКЦИЯ

PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.05-04Б4.71

    Nakada, Yuji.

    Identification of the putrescine biosynthetic genes in Pseudomonas aeruginosa and characterization of agmatine deiminase and N-carbamoylputrescine amidohydrolase of the arginine decarboxylase pathway [Text] / Yuji Nakada, Yoshifumi Itoh // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 3. - P707-714 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Идентификация генов биосинтеза путресцина у Pseudomonas aeruginosa и характеристика агматин-деиминазы и N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы аргинин-декарбоксилазного пути
Аннотация: Путресцин у бактерий может образовываться в клетке непосредственно из орнитина с помощью фермента SpeC (орнитин-декарбоксилазы) (путь ODC) или обходным путем из аргинина при участии фермента SpeA (аргинин-декарбоксилазы) (путь ADC). Получен мутант Pseudomonas aeruginosa PAO1, дефектный по обоим гена speA и speC. Этот штамм оказался ауксотрофом по путресцину. Показано, что у P. aeruginosa в пути ADC могут участвовать также ферменты катаболизма агматина - AguA (агматин-деиминазы) и AguB (N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы). Мутант aguAB speC также является ауксотрофом по путресцину. Белки AguA и AguB очищены, изучены их биохимические характеристики. Фермент AguA структурно не похож на известные C-N-гидролазы, а фермент AguB является белков семейства нитрилаз. Япония [Itoh. Y.], Div. of Appl. Microbiol., National Food Res. Inst., Kannondai 2-1-12, Tsukuba Ibaraki 305-8642. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ПУТРЕСЦИН

БИОСИНТЕЗ

ФЕРМЕНТЫ

АГМАТИН-ДЕИМИНАЗА

N-КАРБАМОИЛПУТРЕСЦИН-АМИДОГИДРОЛАЗА

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ФУНКЦИЯ

PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi


16.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI40) 00.02-04М7.10

   

    Matrix metalloproteinase-2 production and its binding to the matrix are increased in abdominal aortic aneunysms [Text] / Valerie Davis [et al.] // Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vasc. Biol. - 1998. - Vol. 18, N 10. - P1625-1633 . - ISSN 1079-5642
Перевод заглавия: Продуцирование металлопротеиназы-2 матрикса и ее связывание с матриксом возрастают при аневризме брюшной аорты
Аннотация: Исследовали уровень матриксной металлопротеиназ-2 и -9 (ММП-2 и ММП-9) в тканях абдоминальной аорты при аневризме (ААО) в сравнении с контролем и уровнем ММП из аорты при атеросклерозе (ААС) с помощью количественной конкурентной ревертазной полимеразной цепной реакции и зимографии с желатином. Уровень мРНК и белка ММП-2 выше всего в ААО, ММП-9 - одинаков в ААО и ААС, но выше, чем в контроле. Белки экстрагировали солевым раствором, диметилсульфоксидом (ДМСО) и мочевиной. С ДМСО показано увеличение экстракции ММП-2 из тканей ААО, причем в наиболее активной форме - 62 кД. Эта форма преобладает и в экстрактах мочевины. Данные указывают на более тесное связывание этой формы с матриксом и на усиление активации ММП-2 в ААО. Исследование иммунолокализации ММП-2 и ММП-9 показало, что ММП-9 образуется макрофагами, ММП-2 - клетками мезенхимы. Предполагается участие ММП-2 в деградации эластина и коллагена при заболеваниях аорты. США, Dep. Surgery Pathology Microbiol., Univ. Nebrasca Med. Center, NE, Omaha. Библ. 61
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.03.49.01.29
Рубрики: МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА-2
МАТРИКСНЫЙ ФЕРМЕНТ

ПРОДУКЦИЯ

СВЯЗЫВАНИЕ С МАТРИКСОМ

АОРТА

АНЕВРИЗМА АОРТЫ

АТЕРОСКЛЕРОЗ


Доп.точки доступа:
Davis, Valerie; Persidskaia, Raisa; Baca-Regen, Lisa; Itoh, Yoshifumi; Nagase, Hideaki; Persidsky, Yuri; Ghorpade, Anuja; Baxter, B.Timothy


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 02.08-04Я6.98

   

    Membrane-type 1 matrix metalloproteinase cleaves CD44 and promotes cell migration [Text] / Masahiro Kajita [et al.] // J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 153, N 5. - P893-904 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 расщепляет CD44 и способствует клеточной миграции
Аннотация: Показано, что металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 (MT1-MMP) культивируемых клеток карциномы и остеосаркомы человека служит ферментом процессинга для CD44, рецептора гиалуронана. Экспрессия в клетках мутантного CD44Н, дефектного по сайту процессинга, предотвращает деградацию этой м-лы и блокирует клеточную миграцию. К такому же рез-ту приводит обработка клеток ингибитором MT1-MMP. Сделан вывод, что миграция и инвазия раковых клеток осуществляется при участии одновременно и MT1-MMP, и CD44. Япония [M. S.], Dep. Cancer Cell Res. Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku, Tokyo 108-8639. Fax: 81-3-5449-5414. E-mail: mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.19.17
Рубрики: МИГРАЦИЯ КЛЕТОК
МОЛЕКУЛА АДГЕЗИИ CD44

МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА МЕМБРАННОГО ТИПА

МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА

РАКОВЫЕ КЛЕТКИ

КЛЕТКИ КАРЦИНОМЫ/САРКОМЫ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Kajita, Masahiro; Itoh, Yoshifumi; Chiba, Tadashige; Mori, Hidetoshi; Okada, Akiko; Kinoh, Hiroaki; Seiki, Motoharu


18.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 02.08-04Н1.67

   

    Membrane-type 1 matrix metalloproteinase cleaves CD44 and promotes cell migration [Text] / Masahiro Kajita [et al.] // J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 153, N 5. - P893-904 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 расщепляет CD44 и способствует клеточной миграции
Аннотация: Показано, что металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 (MT1-MMP) культивируемых клеток карциномы и остеосаркомы человека служит ферментом процессинга для CD44, рецептора гиалуронана. Экспрессия в клетках мутантного CD44Н, дефектного по сайту процессинга, предотвращает деградацию этой м-лы и блокирует клеточную миграцию. К такому же рез-ту приводит обработка клеток ингибитором MT1-MMP. Сделан вывод, что миграция и инвазия раковых клеток осуществляется при участии одновременно и MT1-MMP, и CD44. Япония [M. S.], Dep. Cancer Cell Res. Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku, Tokyo 108-8639. Fax: 81-3-5449-5414. E-mail: mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.03.25.21
Рубрики: МИГРАЦИЯ КЛЕТОК
МОЛЕКУЛА АДГЕЗИИ CD44

МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА МЕМБРАННОГО ТИПА

МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА

РАКОВЫЕ КЛЕТКИ

КЛЕТКИ КАРЦИНОМЫ/САРКОМЫ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Kajita, Masahiro; Itoh, Yoshifumi; Chiba, Tadashige; Mori, Hidetoshi; Okada, Akiko; Kinoh, Hiroaki; Seiki, Motoharu


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.05-04Б2.128

   

    Molecular characterization and regulation of an operon encoding a system for transport of arginine and ornithine and the ArgR regulatory protein in Pseudomonas aeruginosa [Text] / Takayuki Nishijyo [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 21. - P5559-5566 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Молекулярная характеристика и регуляция оперона, кодирующего систему транспорта аргинина и орнитина и регуляторный белок ArgR, у Pseudomonas aeruginosa
Аннотация: Полностью секвенирован оперон aot Pseudomonas aeruginosa PA01, состоящий из 6 генов. Продукты 4 генов (aotJ, aotQ, aotM и aotP) высокогомологичны компонентам периплазматич. АВС-транспортеров у кишечных бактерий. Изучение транспорта с делец. мутантами показало, что эти 4 гена участвуют в индуцируемом аргинином (I) транспорте I и орнитина (II), но не лизина. Ген aotO, к-рый кодирует белок, не гомологичный известным белкам, не нужен для поглощения I и II. Последний ген оперона кодирует белок ArgR (III), участвующий в регуляции метаболизма I. Изучение трансляц. слияния aotJ::lacZ показало, что экспрессия оперона aot сильно индуцируется I и что этот эффект опосредован III. Обнаружены 2 промотора оперона aot. 3'-промотор Р2 индуцируется I и чувствителен к углеродной катаболитной репрессии. 5'-промотор Р1 индуцируется глутаматом. Футпринтинг обнаружил сайт связывания III, перекрывающийся с блоком -35 промотора Р2 и блоком -10 промотора Р1. Подтверждены известные архитектура и консенсусная последовательность сайтов связывания I. США, Coll. Arts. and Sci., Georgia State Univ., Atlanta, GA 30302-4038. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН СИСТЕМЫ ТРАНСПОРТА АРГИНИНА И ОРНИТИНА AOT

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ЭКСПРЕССИЯ

ИНДУКЦИЯ

АРГИНИН

ПРОМОТОРЫ

ОБНАРУЖЕНИЕ

ИНДУКЦИЯ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА

PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Nishijyo, Takayuki; Park, Seung-Moon; Lu, Chung-Dar; Itoh, Yoshifumi; Abdelal, Ahmed T.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 06.09-04Я6.278

    Itoh, Yoshifumi.

    MT1-MMP: A potent modifier of pericellular microenvironment [Text] / Yoshifumi Itoh, Motoharu Seiki // J. Cell. Physiol. - 2006. - Vol. 206, N 1. - P1-8 . - ISSN 0021-9541
Перевод заглавия: MT1-MMP - потентный модификатор околоклеточного микроокружения
Аннотация: Изменения в окружающей клетку среде влияют на ее функции. Исследование роли трансмембранной протеазы MT1-MMP в околоклеточном протеолизе макромолекул внеклеточного матрикса показало важную роль этого фермента в развитии скелетных структур, инвазии раковых клеток, клеточном росте и ангиогенезе. MT1-MMP вызывает деградацию внеклеточного матрикса, распространение CD44 и синдекана 1 и активацию ERK. Исследования последних лет показали, что MT1-MMP воздействует на клеточные функции путем изменения свойств внеклеточного матрикса и что сами клетки регулируют активность этой матричной металлопротеиназы. Обсуждается роль последней в развитии таких заболеваний, как рак и ревматоидный артрит. Япония [M. Seiki], Univ. of Tokyo, 108-8639, mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp. Библ. 92
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.27.05
Рубрики: ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС
ДЕГРАДАЦИЯ

ПРОТЕОЛИЗ МАКРОМОЛЕКУЛ

ПРОТЕАЗА MT1-MMP

ТРАНСМЕМБРАННАЯ

АКТИВНОСТЬ

РОЛЬ В КАНЦЕРОГЕНЕЗЕ


Доп.точки доступа:
Seiki, Motoharu


 1-20    21-27 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)