СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Itoh, Yoshifumi$<.>)

Общее количество найденных документов : 27
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-27

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.210

AxyR, an AraC family transcriptional activator of the xylanase 3 gene, requires xylo-oligosaccharides as a cofactor for DNA binding in Paenibacillus sp. strain W-61 [Text] / Mutsumi Fukuda [et al.] // Biosci., Biotechnol. and Biochem. - 2012. - Vol. 76, N 5. - P1051-1054 . - ISSN 0916-8451
Перевод заглавия: AxyR, транскрипционный активатор ксиланазы гена 3 из семейства AraC, нуждается в ксило-олигосахаридах как кофакторе для связывания ДНК в Paenibacillus sp. штамм W-61
Аннотация: Ксиланолитическая бактерия Paenibacillus sp. штамм W-61 кодирует три гена внеклеточной ксиланазы xyn1, xyn3 и xyn5. Идентифицировали транскрипционный активатор, необходимый для транскрипции гена xyn3 в штамме W-61. Активатор AxyR содержит ДНК-связывающий домен AraC-типа и требует ксилобиозу, ксилотриозу или ксилотетраозу как кофактор для связывания с промоторным районом xyn3. Япония, Dep. of Microbial Biotechnology, Graduate Sch. of Agricultural Sci., Tohoku Univ., 1-1 Tsutsumidori, Amamiyamachi, Sendai 981-8555

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ АКТИВАТОР AXYR
ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН ARAC-ТИПА
НУЖДАЕТСЯ
КОФАКТОРЫ ДЛЯ СВЯЗЫВАНИЯ ДНК
КСИЛО-ОЛИГОСАХАРИДЫ
ГЕНЫ
ГЕН ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ КСИЛАНАЗЫ XYN3
ТРАНСКРИПЦИЯ
PAENIBACILLUS (BACT.)
ШТАММ W-61

Доп.точки доступа:
Fukuda, Mutsumi; Yoshida, Shigeki; Itoh, Hiroya; Kato, Yoji; Watanabe, Seiji; Itoh, Yoshifumi; Kamio, Yoshiyuki; Kaneko, Jun

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.08-04Б2.178

Cadaverine covalently linked to peptidoglycan is required for interaction between the peptidoglycan and the periplasm-exposed S-layer-homologous domain of major outer membrane protein Mep45 in Selenomonas ruminantium [Text] / Seiji Kojima [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 22. - P5953-5961 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Кадаверин, ковалентно, связанный с пептидогликаном, требуется для взаимодействия между пептидогликаном и гомологичным доменом S-слоя большого белка наружной мембраны Mep-45 в Selemonas ruminantium
Аннотация: Определили нуклеотидную последовательность гена mep-45 и исследовали взаимосвязь между PG-кадаверином, Mep-45 и структурой клеточной поверхности Selenomonas ruminantium. Анализ аминокислотной последовательности показал, что Мер-45 включает N-концевой гомологичный домен S-cлоя (SHL) с последующим включением альфа-спирального района и С-концевого богатого бета-нитями района. Установили, что SHL-домен отвечает за связывание с пептидогликаном. Определили, что Мер-45 связывается с пептидогликаном в зависимости от присутствия PG-кадаверина. Дефектный PG-кадаверин уменьшает структурные взаимодействия с пептидогликаном и наружной мембраной. Предположили, что PG-кадаверин функционально важен для осуществления структурной связи между пептидогликаном и наружной мембраной благодаря специфичному взаимодействию с SHL-доменом Мер-45. Япония, Lab of Applied Microbiology, Dep. of Microbial Biotechnology, Graduate Sch of Agricultural Sci., Tohoku Univ., Tsutsumi-dori Amamiya-machi 1-1, Aoba-ku, Sendai 981-8555

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.29
Рубрики: КЛЕТОЧНАЯ ПОВЕРХНОСТЬ
СТРУКТУРА
МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК НАРУЖНОЙ МЕМБРАНЫ MEP-45
ДОМЕН S-СЛОЯ
ПЕТИДОГЛИКАНЫ
КАДАВЕРИН
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
SELEMONAS RUMINANTIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kojima, Seiji; Ko, Kyong-Cheol; Takatsuka, Yumiko; Abe, Naoki; Kaneko, Jun; Itoh, Yoshifumi; Kamio, Yoshiyuki

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.10-04Б4.127

Poly-'гамма'-glutamate capsule-degrading enzyme treatment enhances phagocytosis and killing of encapsulated Bacillus anthracis [Text] / Angelo Scorpio [et al.] // Antimicrob. Agents and Chemother. - 2007. - Vol. 51, N 1. - P215-222 . - ISSN 0066-4804
Перевод заглавия: Обработка ферментом, расщепляющим поли-'гамма'-глутаматную капсулу, усиливает фагоцитоз и киллинг капсулосодержащих [бактерий] Bacillus anthracis
Аннотация: CapD - деполимераза 'гамма'-полиглутаминовой кислоты, кодируемая плазмидой Bacillus anthracis, разрушает капсулу B. anthracis и удаляет ее с поверхности бацилл. Обработка CapD макрофагов мышей усиливает фагоцитоз B. anthracis, а обработка CapD нейтрофилов человека стимулирует опосредуемый ими киллинг B. anthracis, лишенных капсулы. Глутамилаза PghP-гидролаза G-полиглутаминовой кислоты кодируется бактериофагом B. anthracis, но обладает минимальной активностью расщепления капсулы B. anthracis, не влияет на макрофагальный фагоцитоз и слабо стимулирует киллинг бацилл нейтрофилами. США, USAMRIID, MD21702 Frederick. Библ. 61

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: BACILLUS ANTHRACIS (BACT.)
ГЛУТАМАТНАЯ КАПСУЛА
РАСЩЕПЛЕНИЕ
CAPD БЕЛОК
РОЛЬ
ФАГОЦИТОЗ
МАКРОФАГИ
МЫШИ
КИЛЛИНГ
НЕЙТРОФИЛЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Scorpio, Angelo; Chabot, Donald J.; Day, William A.; O'Brien, David K.; Vietri, Nicholas J.; Itoh, Yoshifumi; Mohamadzadeh, Mansour; Friedlander, Arthur M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 06.09-04Я6.278

Itoh, Yoshifumi.
MT1-MMP: A potent modifier of pericellular microenvironment [Text] / Yoshifumi Itoh, Motoharu Seiki // J. Cell. Physiol. - 2006. - Vol. 206, N 1. - P1-8 . - ISSN 0021-9541
Перевод заглавия: MT1-MMP - потентный модификатор околоклеточного микроокружения
Аннотация: Изменения в окружающей клетку среде влияют на ее функции. Исследование роли трансмембранной протеазы MT1-MMP в околоклеточном протеолизе макромолекул внеклеточного матрикса показало важную роль этого фермента в развитии скелетных структур, инвазии раковых клеток, клеточном росте и ангиогенезе. MT1-MMP вызывает деградацию внеклеточного матрикса, распространение CD44 и синдекана 1 и активацию ERK. Исследования последних лет показали, что MT1-MMP воздействует на клеточные функции путем изменения свойств внеклеточного матрикса и что сами клетки регулируют активность этой матричной металлопротеиназы. Обсуждается роль последней в развитии таких заболеваний, как рак и ревматоидный артрит. Япония [M. Seiki], Univ. of Tokyo, 108-8639, mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp. Библ. 92

ГРНТИ	34.19.27

ВИНИТИ 341.19.27.05
Рубрики: ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС
ДЕГРАДАЦИЯ
ПРОТЕОЛИЗ МАКРОМОЛЕКУЛ
ПРОТЕАЗА MT1-MMP
ТРАНСМЕМБРАННАЯ
АКТИВНОСТЬ
РОЛЬ В КАНЦЕРОГЕНЕЗЕ

Доп.точки доступа:
Seiki, Motoharu

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 06.09-04Н1.71

Itoh, Yoshifumi.
MT1-MMP: A potent modifier of pericellular microenvironment [Text] / Yoshifumi Itoh, Motoharu Seiki // J. Cell. Physiol. - 2006. - Vol. 206, N 1. - P1-8 . - ISSN 0021-9541
Перевод заглавия: MT1-MMP - потентный модификатор околоклеточного микроокружения
Аннотация: Изменения в окружающей клетку среде влияют на ее функции. Исследование роли трансмембранной протеазы MT1-MMP в околоклеточном протеолизе макромолекул внеклеточного матрикса показало важную роль этого фермента в развитии скелетных структур, инвазии раковых клеток, клеточном росте и ангиогенезе. MT1-MMP вызывает деградацию внеклеточного матрикса, распространение CD44 и синдекана 1 и активацию ERK. Исследования последних лет показали, что MT1-MMP воздействует на клеточные функции путем изменения свойств внеклеточного матрикса и что сами клетки регулируют активность этой матричной металлопротеиназы. Обсуждается роль последней в развитии таких заболеваний, как рак и ревматоидный артрит. Япония [M. Seiki], Univ. of Tokyo, 108-8639, mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp. Библ. 92

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.03.25.21
Рубрики: ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС
ДЕГРАДАЦИЯ
ПРОТЕОЛИЗ МАКРОМОЛЕКУЛ
ПРОТЕАЗА MT1-MMP
ТРАНСМЕМБРАННАЯ
АКТИВНОСТЬ
РОЛЬ В КАНЦЕРОГЕНЕЗЕ

Доп.точки доступа:
Seiki, Motoharu

РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 06.05-04Я6.217

Homophilic complex formation of MT1-matrix metalloproteinase is essential to express collagenolytic activity on the cell surface [Text] : тез.[Spring Meeting of the British Society for Matrix Biology, Liverpool, March 21-22, 2005] / Yoshifumi Itoh [et al.] // Int. J. Exp. Pathol. - 2005. - Vol. 86, N 6. - PA77 . - ISSN 0959-9673
Перевод заглавия: Образование гомофильного комплекса МТ1-металлопротеиназа матрикса необходимо для экспрессии коллагенолитической активности на клеточной поверхности

ГРНТИ	34.19.21

ВИНИТИ 341.19.21.07
Рубрики: МТ1-МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА
СВЕРХЭКСПРЕССИЯ
КУЛЬТУРА КЛЕТОК
КУЛЬТУРАЛЬНЫЕ СРЕДЫ
ПЛЕНКА КОЛЛАГЕНА
КЛЕТКИ COS7

Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi; Ito, Noriko; Nagase, Hideaki; Seiki, Motoharu

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.02-04Б2.190

Nakada, Yuji.
Pseudomonas aeruginosa PAO1 genes for 3-guanidinopropionate and 4-guanidinobutyrate utilization may be derived from a common ancestor [Text] / Yuji Nakada, Yoshifumi Itoh // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 12. - P4055-4062 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Гены Pseudomonas aeruginosa PAO1 для утилизации 1-квинидинопропионата и 4-гуанидинобутирата могут происходить от общего предка
Аннотация: Pseudomonas aeruginosa PAO1 утилизирует 3-квинидионопропионат (3-GP) и 4-гуанидинобутират (4-GB), отличающиеся только одной метиленовой группой, благодаря двум различным энзимам: гуанидинпропионазе (EC 3.5.3.7), продукт гена gpuA) и гуанидинбутиразе (EC 3.5.3.17, продукт гена gbuA). Клонировали и охарактеризовали контиги генов gpuPAR, отвечающие за утилизацию 3-GP и сравнили укороченные последовательности генных продуктов и механизмы регуляции gpuPA с таковыми для генов gbu, кодирующими систему катаболизма 4-GB. Выявили три консервативные последовательности, общие между тремя функциональными парами белков Gpu и Gbu. Эти данные, а также отсутствие gpuAPR в близко родственных видах, свидетельствует о том, что триады генов gpu могли эволюционировать от общего с генами gbu предка, что привело к установлению независимой системы катаболизма 3-GP в P. aeruginosa. Япония, Dep. of Nursing, Faculty of Nursing and Rehabilitation, Aino Univ., Higashiohda 4-5-4, Ibaraki, Osaka 567-0012. Библ. 64

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: КАТАБОЛИЗМ
3-КВИНИДИНОПРОПИОНАТ
4-ГУАНИДИНОБУТИРАТ
ФЕРМЕНТЫ
ГУАНИДИНПРОПИОНАЗА
ГУАНИДИНБУТИРАЗА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ГЕНЫ
ГЕН ГУАНИДИНПРОПИОНАЗЫ GPUA
ГЕН ГУАНИДИНБУТИРАЗЫ GBUA
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.05-04Б4.71

Nakada, Yuji.
Identification of the putrescine biosynthetic genes in Pseudomonas aeruginosa and characterization of agmatine deiminase and N-carbamoylputrescine amidohydrolase of the arginine decarboxylase pathway [Text] / Yuji Nakada, Yoshifumi Itoh // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 3. - P707-714 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Идентификация генов биосинтеза путресцина у Pseudomonas aeruginosa и характеристика агматин-деиминазы и N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы аргинин-декарбоксилазного пути
Аннотация: Путресцин у бактерий может образовываться в клетке непосредственно из орнитина с помощью фермента SpeC (орнитин-декарбоксилазы) (путь ODC) или обходным путем из аргинина при участии фермента SpeA (аргинин-декарбоксилазы) (путь ADC). Получен мутант Pseudomonas aeruginosa PAO1, дефектный по обоим гена speA и speC. Этот штамм оказался ауксотрофом по путресцину. Показано, что у P. aeruginosa в пути ADC могут участвовать также ферменты катаболизма агматина - AguA (агматин-деиминазы) и AguB (N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы). Мутант aguAB speC также является ауксотрофом по путресцину. Белки AguA и AguB очищены, изучены их биохимические характеристики. Фермент AguA структурно не похож на известные C-N-гидролазы, а фермент AguB является белков семейства нитрилаз. Япония [Itoh. Y.], Div. of Appl. Microbiol., National Food Res. Inst., Kannondai 2-1-12, Tsukuba Ibaraki 305-8642. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ПУТРЕСЦИН
БИОСИНТЕЗ
ФЕРМЕНТЫ
АГМАТИН-ДЕИМИНАЗА
N-КАРБАМОИЛПУТРЕСЦИН-АМИДОГИДРОЛАЗА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.06-04Б2.165

Nakada, Yuji.
Identification of the putrescine biosynthetic genes in Pseudomonas aeruginosa and characterization of agmatine deiminase and N-carbamoylputrescine amidohydrolase of the arginine decarboxylase pathway [Text] / Yuji Nakada, Yoshifumi Itoh // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 3. - P707-714 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Идентификация генов биосинтеза путресцина у Pseudomonas aeruginosa и характеристика агматин-деиминазы и N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы аргинин-декарбоксилазного пути
Аннотация: Путресцин у бактерий может образовываться в клетке непосредственно из орнитина с помощью фермента SpeC (орнитин-декарбоксилазы) (путь ODC) или обходным путем из аргинина при участии фермента SpeA (аргинин-декарбоксилазы) (путь ADC). Получен мутант Pseudomonas aeruginosa PAO1, дефектный по обоим гена speA и speC. Этот штамм оказался ауксотрофом по путресцину. Показано, что у P. aeruginosa в пути ADC могут участвовать также ферменты катаболизма агматина - AguA (агматин-деиминазы) и AguB (N-карбамоилпутресцин-амидогидролазы). Мутант aguAB speC также является ауксотрофом по путресцину. Белки AguA и AguB очищены, изучены их биохимические характеристики. Фермент AguA структурно не похож на известные C-N-гидролазы, а фермент AguB является белков семейства нитрилаз. Япония [Itoh. Y.], Div. of Appl. Microbiol., National Food Res. Inst., Kannondai 2-1-12, Tsukuba Ibaraki 305-8642. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ПУТРЕСЦИН
БИОСИНТЕЗ
ФЕРМЕНТЫ
АГМАТИН-ДЕИМИНАЗА
N-КАРБАМОИЛПУТРЕСЦИН-АМИДОГИДРОЛАЗА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Itoh, Yoshifumi

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.11-04Б3.90

Inatsu, Yasuhiro.
Characterization of Bacillus subtilis strains isolated from fermented soybean foods in Southeast Asia: Comparison with B. subtilis (natto) starter strains [Text] / Yasuhiro Inatsu, Keitarou Kimura, Yoshifumi Itoh // JARQ: Jap. Agr. Res. Quart. - 2002. - Vol. 36, N 3. - P169-175 . - ISSN 0021-3551
Перевод заглавия: Описание штаммов Bacillus subtilis, выделенных из ферментированных соединений блюд, приготовляемых в юго-восточной Азии. Сравнение со штаммами B. subtilis - заквасок для приготовления [японского блюда] natto
Аннотация: Проводили сравнение 90 штаммов Bacillus subtilis, используемых в заквасках для изготовления ферментируемых соевых блюд в Восточной и Юго-восточной Азии, со штаммом-закваской B. subtilis (natto), применяемым в Японии при изготовлении несоленого соевого блюда натто. У штаммов сравнивали образование поли-'гамма'-глутамата, протеазы и амилазы, проводили фаготипирование и наследуемость вставочной последовательности (ВП) IS4Bsu1. У всех изолятов нашли высокий уровень протеазы при различных уровнях активности амилазы. Ни один из штаммов не принадлежал к стандартному фаготипу B. subtilis, но 11 иностранных штаммов принадлежали к тому же фаготипу, что и B. subtilis (natto). 63 изолята образовывали полиглутамат, главный компонент, отвечающий за слизистый материал в блюде натто. 28 изолятов в своем геноме содержали ВП-элемент, при этом число его копий колебалось от 1 до 17. Очевидно, ВП-элемент широко распространен среди штаммов B. subtilis, ферментирующих несоленые соевые блюда, подобные "Tua Nao" в Таиланде (90%) и "Kinema" в Непале (56%). В соленых блюдах из сои, например, в китайском "Douchi", только 15% штаммов B. subtilis несло в геноме элемент ВП. Связей между ВП и образованием полиглутамата не выявили. Нуклеотидная последовательность ВП-элементов у B. subtilis (natto) и у 9 штаммов из 90 в случайной выборке была одинаковой. У 4 других штаммов из 90 выявили только от одной до трех мутаций в этой последовательности. Делается заключение, что участок IS4Bsu1 в штаммах B. subtilis, встречающихся в соевых блюдах, имеет недавнее происхождение. Япония, Food Hygiene Res. Team, Nat. Food Res. Inst., Tsukuba, Ibaraki 305-8642, E-mail:inatu@nfri.affrc.go.jp. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.11
Рубрики: BACILLUS SUBTILIS (BACT)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ СОЕВОГО ПРОДУКТА
СРАВНЕНИЕ ШТАММОВ
ГЕНОМЫ
ВСТАВОЧНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
РАСПРОСТРАНЕНИЕ СРЕДЫ ШТАММОВ
ФЕРМЕНТЫ
ФАГОТИПИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Kimura, Keitarou; Itoh, Yoshifumi

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.226

Nakada, Yuji.
Divergent structure and regulatory mechanism of proline catabolic systems: Characterization of the putAP proline catabolic operon of Pseudomonas aeruginosa PAO1 and its regulation by PruR, an AraC/XylS family protein [Text] / Yuji Nakada, Takayuki Nishijyo, Yoshifumi Itoh // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 20. - P5633-5640 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Различная структура и регуляторный механизм систем катаболизма пролина: характеристика оперона putAP Pseudomonas aeruginosa PAO1 и его регуляция белком PruR из семейства AraC/XylS
Аннотация: Охарактеризовали локус pruR-putAP, кодирующий систему катаболизма пролина Pseudomonas aeruginosa PAO1. Показали, что в данном штамме, в отличие от других грамотрицательных бактерий два гена putA и putP, кодирующие пролин-пермеазу, формируют оперон. Установили филогенетическую связь с P. putida (80% идентичности по PutP белку и 47% - по PutA). PutA, в отличие от такового белка других бактерий, в данном штамме утратил регуляторную функцию. Ген pruR (регулятор утилизации пролина), кодировал транскрипционный активатор семейства белков AraC/XylS и участвовал в экспрессии putAP, индуцированной пролином. Идентифицировали PruR-зависимый промотор, ответственный за пролин в 5'-фланкированном районе putA. Сделан вывод, что система утилизации пролина P. aeruginosa отличается от таковой P. putida по структуре putA, организации генов putAB и регуляторному механизму экспрессии putA. Япония, Dep. of Applied Microbiol., Nat. Food Res. Inst., Tsukuba 305-8642. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: КАТАБОЛИЗМ
ПРОЛИН
ФЕРМЕНТЫ
ПРОЛИН-ПЕРМЕАЗА
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН PUT AP
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ PRUR
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nishijyo, Takayuki; Itoh, Yoshifumi

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.13

Inatsu, Yasuhiro.
Characterization of Bacillus subtilis strains isolated from fermented soybean foods in Southeast Asia: Comparison with B. subtilis (natto) starter strains [Text] / Yasuhiro Inatsu, Keitarou Kimura, Yoshifumi Itoh // JARQ: Jap. Agr. Res. Quart. - 2002. - Vol. 36, N 3. - P169-175 . - ISSN 0021-3551
Перевод заглавия: Описание штаммов Bacillus subtilis, выделенных из ферментированных соединений блюд, приготовляемых в юго-восточной Азии. Сравнение со штаммами B. subtilis - заквасок для приготовления [японского блюда] natto
Аннотация: Проводили сравнение 90 штаммов Bacillus subtilis, используемых в заквасках для изготовления ферментируемых соевых блюд в Восточной и Юго-восточной Азии, со штаммом-закваской B. subtilis (natto), применяемым в Японии при изготовлении несоленого соевого блюда натто. У штаммов сравнивали образование поли-'гамма'-глутамата, протеазы и амилазы, проводили фаготипирование и наследуемость вставочной последовательности (ВП) IS4Bsu1. У всех изолятов нашли высокий уровень протеазы при различных уровнях активности амилазы. Ни один из штаммов не принадлежал к стандартному фаготипу B. subtilis, но 11 иностранных штаммов принадлежали к тому же фаготипу, что и B. subtilis (natto). 63 изолята образовывали полиглутамат, главный компонент, отвечающий за слизистый материал в блюде натто. 28 изолятов в своем геноме содержали ВП-элемент, при этом число его копий колебалось от 1 до 17. Очевидно, ВП-элемент широко распространен среди штаммов B. subtilis, ферментирующих несоленые соевые блюда, подобные "Tua Nao" в Таиланде (90%) и "Kinema" в Непале (56%). В соленых блюдах из сои, например, в китайском "Douchi", только 15% штаммов B. subtilis несло в геноме элемент ВП. Связей между ВП и образованием полиглутамата не выявили. Нуклеотидная последовательность ВП-элементов у B. subtilis (natto) и у 9 штаммов из 90 в случайной выборке была одинаковой. У 4 других штаммов из 90 выявили только от одной до трех мутаций в этой последовательности. Делается заключение, что участок IS4Bsu1 в штаммах B. subtilis, встречающихся в соевых блюдах, имеет недавнее происхождение. Япония, Food Hygiene Res. Team, Nat. Food Res. Inst., Tsukuba, Ibaraki 305-8642, E-mail:inatu@nfri.affrc.go.jp. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.02
Рубрики: BACILLUS SUBTILIS (BACT)
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ СОЕВОГО ПРОДУКТА
СРАВНЕНИЕ ШТАММОВ
ГЕНОМЫ
ВСТАВОЧНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
РАСПРОСТРАНЕНИЕ СРЕДЫ ШТАММОВ
ФЕРМЕНТЫ
ФАГОТИПИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Kimura, Keitarou; Itoh, Yoshifumi

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 02.06-04Я6.13

Itoh, Yoshifumi.
Роль матриксных металлопротеиназ клеточной поверхности [Text] / Yoshifumi Itoh, Motoharu Seiki // Ketsugo soshiki = Connect. Tissue. - 2001. - Vol. 33, N 1. - С. 19-25 . - ISSN 0916-572X
Аннотация: В обзоре представлены данные о подгруппе матриксных металлопротеиназ (MMP) - мембранном типе MMP (MT-MMP), которая насчитывает 6 представителей. 4 из них являются трансмембранными ферментами, а 2 заякорены в мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитола. Все MI-MMP синтезируют в виде проферментов, активация которых происходит внутриклеточно под действием пропротеинконвертаз; на поверхности клетки ферменты появляются в активной форме. Из всех MT-MMP лучше других охарактеризована MT1-MMP, которая участвует в процессах инвазии опухолей, ангиогенезе, морфогенезе костей. MT1-MMP действует на компоненты внеклеточного матрикса (ВКМ) как непосредственно, так и путем активации про-MMP-2. Все MT-MMP экспрессируются на поверхности клетки и вызывают деградацию ВКМ в периклеточном пространстве. Полагают, что их роль связана непосредственно с функциями клетки. Япония, Dep. Canc. Cell Res. Inst. Med. Sci. Univ. Tokyo. Библ. 35

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.05.11
Рубрики: МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗЫ
МАТРИКСНЫЕ ФЕРМЕНТЫ МЕМБРАННОГО ТИПА
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
АКТИВАЦИЯ
МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ
ФУНКЦИИ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 35

Доп.точки доступа:
Seiki, Motoharu

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 02.08-04Я6.98

Membrane-type 1 matrix metalloproteinase cleaves CD44 and promotes cell migration [Text] / Masahiro Kajita [et al.] // J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 153, N 5. - P893-904 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 расщепляет CD44 и способствует клеточной миграции
Аннотация: Показано, что металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 (MT1-MMP) культивируемых клеток карциномы и остеосаркомы человека служит ферментом процессинга для CD44, рецептора гиалуронана. Экспрессия в клетках мутантного CD44Н, дефектного по сайту процессинга, предотвращает деградацию этой м-лы и блокирует клеточную миграцию. К такому же рез-ту приводит обработка клеток ингибитором MT1-MMP. Сделан вывод, что миграция и инвазия раковых клеток осуществляется при участии одновременно и MT1-MMP, и CD44. Япония [M. S.], Dep. Cancer Cell Res. Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku, Tokyo 108-8639. Fax: 81-3-5449-5414. E-mail: mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp

ГРНТИ	34.19.19

ВИНИТИ 341.19.19.17
Рубрики: МИГРАЦИЯ КЛЕТОК
МОЛЕКУЛА АДГЕЗИИ CD44
МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА МЕМБРАННОГО ТИПА
МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА
РАКОВЫЕ КЛЕТКИ
КЛЕТКИ КАРЦИНОМЫ/САРКОМЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Kajita, Masahiro; Itoh, Yoshifumi; Chiba, Tadashige; Mori, Hidetoshi; Okada, Akiko; Kinoh, Hiroaki; Seiki, Motoharu

15.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 02.08-04Н1.67

Membrane-type 1 matrix metalloproteinase cleaves CD44 and promotes cell migration [Text] / Masahiro Kajita [et al.] // J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 153, N 5. - P893-904 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 расщепляет CD44 и способствует клеточной миграции
Аннотация: Показано, что металлопротеиназа матрикса мембранного типа 1 (MT1-MMP) культивируемых клеток карциномы и остеосаркомы человека служит ферментом процессинга для CD44, рецептора гиалуронана. Экспрессия в клетках мутантного CD44Н, дефектного по сайту процессинга, предотвращает деградацию этой м-лы и блокирует клеточную миграцию. К такому же рез-ту приводит обработка клеток ингибитором MT1-MMP. Сделан вывод, что миграция и инвазия раковых клеток осуществляется при участии одновременно и MT1-MMP, и CD44. Япония [M. S.], Dep. Cancer Cell Res. Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku, Tokyo 108-8639. Fax: 81-3-5449-5414. E-mail: mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.03.25.21
Рубрики: МИГРАЦИЯ КЛЕТОК
МОЛЕКУЛА АДГЕЗИИ CD44
МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА МЕМБРАННОГО ТИПА
МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА
РАКОВЫЕ КЛЕТКИ
КЛЕТКИ КАРЦИНОМЫ/САРКОМЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Kajita, Masahiro; Itoh, Yoshifumi; Chiba, Tadashige; Mori, Hidetoshi; Okada, Akiko; Kinoh, Hiroaki; Seiki, Motoharu

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 02.12-04Я6.15

Cytoplasmic tail-dependent internalization of membrane-type 1 matrix metalloproteinase is important for its invasion-promoting activity [Text] / Takamasa Uekita [et al.] // J. Cell Biol. - 2001. - Vol. 155, N 7. - P1345-1356 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Интернализация металлопротеиназы матрикса мембранного типа 1, зависимая от цитоплазматического конца, важна для ее активности, стимулирующей инвазию
Аннотация: Показали, что в клетках CHO-K1 интернализация металлопротеиназы матрикса мембранного типа 1 (MT1-MMP) происходит от поверхности клеток и этот процесс зависит от остатков Di-Leu{571-572}, Leu{578-579} и тирозина{573} на ее цитоплазматическом конце. Интернализация MT1-MMP протекает также с участием 'мю'2-субъединицы адапторного белка 2, компонента ямок, покрытых клатрином. Интернализация MT1-MMP происходит преимущественно на адгезивном конце и колокализована с клатрин-покрытыми везикулами. Мутации вызывают нарушение интернализации и, хотя в этом случае MT1-MMP не способна к клеточной миграции, они не влияют на ее протеолитическую активность. Япония [Motoharu Seiki], Div. Cancer Cell Res., Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku, Tokyo 108-8639, Fax: 81-3-5449-5414. E-mail: mseiki@ims.u-tokyo.ac.jp. Библ. 32

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.05.11
Рубрики: ПЛАЗМАТИЧЕСКАЯ МЕМБРАНА
МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА МАТРИКСА МЕМБРАННОГО ТИПА
ИНТЕРНАЛИЗАЦИЯ
СВЕРХЭКСПРЕССИЯ
КЛЕТКИ CHO-K1

Доп.точки доступа:
Uekita, Takamasa; Itoh, Yoshifumi; Yana, Ikuo; Ohno, Hiroshi; Seiki, Motoharu

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.09-04Б2.264

Nishijyo, Takayuki.
The CbrA-CbrB two-component regulatory system controls the utilization of multiple carbon and nitrogen sources in Pseudomonas aeruginosa [Text] / Takayuki Nishijyo, Dieter Haas, Yoshifumi Itoh // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 40, N 4. - P917-931 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Двухкомпонентная регуляторная система GbrA-GbrB контролирует использование многих источников углерода и азота у Pseudomonas aeruginosa
Аннотация: Мутанты cbrA и cbrB Pseudomonas aeruginosa PAO1 не используют в кач-ве источников N и C полиамины, агматин и несколько аминокислот, включая аргинин (I), гистидин (II) и пролин (III). Они не используют также многие другие источники C, включая маннит, глюкозу, пируват и цитрат. Клонирован и секвенирован EcoRI-фрагмент длиной 7 т. п. н., содержащий гены cbrA и cbrB. Показано, что эти гены кодируют 2-компонентную систему передачи сигнала: сенсорную киназу CbrA (IV; мол. м. 108379, 983 остатка) и регулятор ответа CbrB (V; мол. м. 52245, 478 остатков). N-концевая половина IV (490 остатков) является сенсорным мембранным доменом с 12 трансмембранными спиралями, а C-концевая половина гомологична гистидиновым киназами семейства NtrB. V похож на члены семейства NtrC. Показано, что гены cbrA и cbrB транскрибируются с разных промоторов. У мутантов cbrB и cbrB, как и у аллельных мутантов argR9901 и argR9902, оперон aot-argR не индуцируется I. Это показало, что система IV-V играет существенную роль в экспрессии зависящих от ArgR путей катаболизма, включая оперон aruCFGDB. Гистидаза, являющаяся главным ферментом катаболизма II, не экспрессируется у мутантов cbrAB даже в присутствии II. Однако пролиндегидрогеназа, ответственная за фенотип использования III (Pru), нормально экспрессируется в мутанте cbrB. При добавлении в среду 1 мМ сукцината или других C[4]-дикарбоновых кислот у мутанта cbrB восстанавливается фенотип Pru{+}, к-рый устраняется в присутствии 20 мМ аммония. Таким образом, система IV-V координирует несколько катаболич. путей и вместе с системой NtrB-NtrC обеспечивает внутриклеточный баланс C и N у Ps. aeruginosa. Япония, Div. Applied Microbiol., Nat. Food Res. Inst., Tsukuba, Ibaraki 305-8642. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.03
Рубрики: КАТАБОЛИЗМ
АМИНОКИСЛОТЫ
САХАРА
МЕХАНИЗМ
БЕЛОК
ДВУХКОМПОНЕНТНАЯ СИСТЕМА ПЕРЕДАЧИ СИГНАЛА CBRA-CBRB
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Haas, Dieter; Itoh, Yoshifumi

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.06-04Б2.248

Tran, Lam-Son Phan.
Divergent structure of the ComQXPA quorum-sensing components: Molecular basis of strain-specific communication mechanism in Bacillus subtilis [Text] / Lam-Son Phan Tran, Toshiro Nagai, Yoshifumi Itoh // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 37, N 5. - P1159-1171 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Дивергентная структура компонентов чувства кворума ComQXPA: молекулярная основа штаммоспецифичного механизма коммуникации у Bacillus subtilis
Аннотация: Выделен индуцированный вставкой транспозона Tn917-LTV1 мутант Bacillus subtilis (natto) NAF4, дефектный по продукции поли-'гамма'-глутамата (I). Секвенирование показало, что вставка транспозона затронула ген comP системы чувства кворума ComQXPA. Это показало, что синтез I находится под контролем сигнальной системы ComP (II)-ComA (III). Первичные структуры белков ComQ и ComX и сенсорного домена II идентичны между Bac. subtilis (natto) NAF4 и Bac. subtilis 168 соотв. на 44, 26 и 36%. Однако некоторые домены сенсора II и регулятора ответа III совпадают (идентичность соотв. 95 и 100%). Гены comP штаммов NAF4 и 168 восстанавливают соотв. нарушенную компетентность Bac. subtilis BD1658 (comP::cat) и продукцию I у Bac. subtilis natto NAF12 (comP::Tn917-LTV1) лишь на 15%. Однако при введении вместе с родственными генами comQ и comX они полностью исправляют указанные дефекты у гетерологичных мутантов comP. Подобно системам comCDE Streptococcus и agrBCDE Staphylococcus aureus, согласованная вариация генов comQXP устанавливает специфич. межклеточную коммуникацию между штаммами Bac. subtilis, имеющими одну и ту же феромоновую систему. Япония, Div. Applied Microbiol., Nat. Food Res. Inst., Tsukuba 395-8642. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ПОЛИ-'ГАММА'-ГЛУТАМАТ
СИНТЕЗ
КОММУНИКАЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
ШТАММОСПЕЦИФИЧНЫЙ МЕХАНИЗМ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ОСНОВА
ГЕНЫ COMQXP
СОГЛАСОВАННАЯ ВАРИАЦИЯ
ЧУВСТВО КВОРУМА
КОМПОНЕНТЫ
ДИВЕРГЕНТНАЯ СТРУКТУРА

Доп.точки доступа:
Nagai, Toshiro; Itoh, Yoshifumi

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.188

A new IS4 family insertion sequence, IS4Bsu1, responsible for genetic instability of poly-'гамма'-glutamic acid production in Bacillus subtilis [Text] / Toshiro Nagai [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 9. - P2387-2392 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новая инсерционная последовательность IS4Bsu1 семейства IS4, ответственная за нестабильность продукции поли-'гамма'-глутаминовой кислоты у Bacillus subtilis
Аннотация: У Bacillus subtilis natto синтез поли-'гамма'-глутаминовой кислоты (I) контролируется 2-компонентной системой ComP-ComA и индуцируется в начале стационарной фазы роста. У спонтанного мутанта Bac. subtilis natto NAF4, не продуцирующего I, в гене comP обнаружена новая инсерционная последовательность, названная IS4Bsu1. Она имеет длину 1406 п. н. и кодирует транспоназу (II) длиной 374 остатка (мол. м. 34 895), похожую на II семейства IS4. В хромосоме штаммов Bac. subtilis natto, включая NAF4, 3 коммерч. стартерных сайта для ферментации соевых бобов и 3 продуцирующих I штамма, обнаружены 6-11 копий IS4Bsu1, в т. ч. 6 копий в одних и тех же локусах. Все 8 спонтанных не продуцирующих I мутантов, выделенных из независимых культур штамма NAF4, имеют новую дополнительную копию IS4Bsu1 в 6 разных положениях в пределах 600 п. н. 5'-концевой области comP. Мишенными сайтами для IS4Bsu1 являются AT-богатые последовательности длиной 3 п. н. Полученные данные показали, что: 1) IS4Bsu1 транспонируется по репликативному, а не по консервативному механизму, как другие члены IS4; 2) большинство спонтанных не продуцирующих I мутантов образуется в результате интеграции IS4Bsu1 в ген comP, являющийся горячей точкой инсерции. Это объясняет высокую частоту спонтанных мутаций, блокирующих продукцию I и обусловленных IS4Bsu1. Япония, Nat. Food Res. Inst., Ministry Agr., Forestry and Fisheries, Tsukuba 305-8642. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА ПОЛИ-ГАММА-ГЛУТАМИНОВОЙ КИСЛОТЫ
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ IS4BSU1
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФУНКЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nagai, Toshiro; Tran, Lam-Son Phan; Inatsu, Yasuhiro; Itoh, Yoshifumi

20.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI40) 00.02-04М7.10

Matrix metalloproteinase-2 production and its binding to the matrix are increased in abdominal aortic aneunysms [Text] / Valerie Davis [et al.] // Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vasc. Biol. - 1998. - Vol. 18, N 10. - P1625-1633 . - ISSN 1079-5642
Перевод заглавия: Продуцирование металлопротеиназы-2 матрикса и ее связывание с матриксом возрастают при аневризме брюшной аорты
Аннотация: Исследовали уровень матриксной металлопротеиназ-2 и -9 (ММП-2 и ММП-9) в тканях абдоминальной аорты при аневризме (ААО) в сравнении с контролем и уровнем ММП из аорты при атеросклерозе (ААС) с помощью количественной конкурентной ревертазной полимеразной цепной реакции и зимографии с желатином. Уровень мРНК и белка ММП-2 выше всего в ААО, ММП-9 - одинаков в ААО и ААС, но выше, чем в контроле. Белки экстрагировали солевым раствором, диметилсульфоксидом (ДМСО) и мочевиной. С ДМСО показано увеличение экстракции ММП-2 из тканей ААО, причем в наиболее активной форме - 62 кД. Эта форма преобладает и в экстрактах мочевины. Данные указывают на более тесное связывание этой формы с матриксом и на усиление активации ММП-2 в ААО. Исследование иммунолокализации ММП-2 и ММП-9 показало, что ММП-9 образуется макрофагами, ММП-2 - клетками мезенхимы. Предполагается участие ММП-2 в деградации эластина и коллагена при заболеваниях аорты. США, Dep. Surgery Pathology Microbiol., Univ. Nebrasca Med. Center, NE, Omaha. Библ. 61

ГРНТИ	76.03.49

ВИНИТИ 761.03.49.01.29
Рубрики: МЕТАЛЛОПРОТЕИНАЗА-2
МАТРИКСНЫЙ ФЕРМЕНТ
ПРОДУКЦИЯ
СВЯЗЫВАНИЕ С МАТРИКСОМ
АОРТА
АНЕВРИЗМА АОРТЫ
АТЕРОСКЛЕРОЗ

Доп.точки доступа:
Davis, Valerie; Persidskaia, Raisa; Baca-Regen, Lisa; Itoh, Yoshifumi; Nagase, Hideaki; Persidsky, Yuri; Ghorpade, Anuja; Baxter, B.Timothy

1-20 21-27

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска