СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Dopazo, Joaquin$<.>)

Общее количество найденных документов : 22
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-22

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 96.01-04А3.296

An image - processing approach to dotplots: An X-Window-based program for interactive analysis of dotplots derived from sequence and strucral data [Text] / Oswaldo Trelles-Salazar [et al.] // Comput. Appl. Biosci. - 1995. - Vol. 11, N 3. - P301-308 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Подход, основанный на обработке изображений, в анализе точечных графиков: Программа под X. Windows для интерактивного анализа графиков, построенных по последовательным и структурным данным
Аннотация: Предложен подход к изучению связей между биологическими последовательностями и структурами, основанный на изучении графиков с помощью методов анализа изображений. Выделен класс цифровых фильтров, оказывающихся эффективными в данной задаче. Показано, что многие типичные операции над графиками сводятся к операциям математической морфологии. Описана реализация разработанной методики по X. Windows. Представлены результаты испытаний на реальной информации, показывающие ее эффективность. Испания, Dep. de Agricultura y Tecnologia de Ordenadores, Univ. de Malaga. Ил. 4. Библ. 16

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.09.13
Рубрики: ОБРАБОТКА ИЗОБРАЖЕНИЙ
ПРОГРАММЫ
ПОСТРОЕННЫЕ ПО ТОЧКАМ ГРАФИКИ
БИОЛОГИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Trelles-Salazar, Oswaldo; Zapata, Emilio L.; Dopazo, Joaquin; Coulson, Andrew F.W.; Carazo, Jose-Maria

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 96.06-04А1.87

Calvo, Dominica.
The CD36, CLA-1 (CD36L1), and LIMPII (CD36L2) gene family: Cellular distribution chromosomal location, and genetic evolution [Text] / Dominica Calvo, Joaquin Dopazo, Miguel A. Vega // Genomics. - 1995. - Vol. 25, N 1. - P100-106 . - ISSN 0888-7543
Перевод заглавия: Семейство генов CD36, CLA-1 (CD36L1) и LIMPII (CD36L2): распределение транскриптов, эволюция и хромосомная локализация и генетическая эволюция
Аннотация: Продолжены исследования группы мембранных гликопротеинов, составляющих недавно идентифицированное семейство - они являются мономерными полипептидами, прикрепляющимися к мембране лимфоцита двумя доменами, расположенными по концам полипептидной цепи. Подтверждено, что все 3 гена - CD36, CD36L1 и CD36L2 - характеризуются сродством к большей группе белковых лигандов. Выделена кДНК, соотв. гену CD36L2 (LIMPII): показано, что, в отличие от др. генов, он характеризуется существенно большей тканевой широтой экспрессии. Анализируемые гены не составляют геномный кластер и локализованы на разных хромосомах человека: 12 (ген CD36), 4 (CD36L1) и 7 (CD36L2). Тем не менее не отрицается единство происхождения этих генов (от общей предковой последовательности), хотя их дифференцировка произошла относительно давно, вероятно, до разделения ветвей членистоногих и позвоночных животных. Испания, Inst. Parasitol. y Biomed. Lopez-Neyra, C/Ventanilla 11, E-18001 Granada. Библ. 48

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: ГЛИКОПРОТЕИНЫ
ГЕНЫ
ГЕН CD36
ГЕН CD36L1
ГЕН CD36L2
ДНК КОМПЛЕМЕНТАРНАЯ
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ
ХРОМОСОМНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Dopazo, Joaquin; Vega, Miguel A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.06-04Б1.426

Comparative study of the genetic variability in thymidine kinase and glycoprotein B genes of herpes simplex viruses by the RNase A mismatch cleavage method [Text] / Jose M. Rojas [et al.] // Virus Res. - 1995. - Vol. 35, N 2. - P205-214 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Сравнительное изучение генетической вариабельности генов тимидинкиназы и гликопротеина B вирусов простого герпеса с помощью метода ошибочного расщепления РНК-азой А
Аннотация: Используя метод ошибочного расщепления РНК-азой А, исследовали вариабельность двух генов вирусов простого герпеса. Полученное филогенетическое древо позволило выделить группы вирусов, циркулирующих в определенной географической зоне. Показано, что ген тимидинкиназы более вариабелен сравнительно с геном гликопротеина B, а в целом оба гена более гетерогенны для вируса герпеса типа 1 сравнительно с вирусом герпеса типа 2. Испания, Inst. de Salud Carlos III, 28220 Majadahonda, Madrid

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.09
Рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
ГЕНЫ
ТИМИДИНКИНАЗА
ГЛИКОПРОТЕИН B
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ДРЕВО

Доп.точки доступа:
Rojas, Jose M.; Dopazo, Joaquin; Santana, Milagros; Lopez-Galindez, Cecilio; Tabares, Enrique

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.06-04Б1.471

Large deletions in the 5'-untraslated region of foot-and -mouth disease virus of serotype C [Text] / Cristina Escarmis [et al.] // Virus Res. - 1995. - Vol. 35, N 2. - P155-167 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Большие делеции в 5'-нетранслируемой области вируса ящура серотипа С
Аннотация: Сравнены нуклеотидные последовательности 5'-нетранслируемой области (5'-НТО) с 3'-стороны от тракта поли(Ц) у 21 изолята вируса ящура серотипа С (ВЯ-С) из Европы, Южной Америки и Филиппин. Европейские изоляты по сравнению с большинством южноамериканских ВЯ-С имеют делецию 43 н. Нек-рые ВЯ-С из Южной Америки и Филиппин содержат более длинную делецию длиной 86 н. Делеции вызывают утрату одного или 2-х псевдоузлов в этой области 5'-НТО. Множественные точечные мутации позволили построить филогенетическое древо, разбивающее изоляты на группы, к-рые близки к группам, основанным на последовательности капсидного гена ВЯ-С. Делеции или вставки являются очень частыми событиями во время эволюции ВЯ-С, т. к. очень филогенетически близкие изоляты, относящиеся к одной ветви древа, могут иметь или не иметь эти делеции. Испания, Centro de Biol. Mol. "Severo Ochoa", Univ. Autonoma de Madrid, 28049 Cantoblanco, Madrid. Библ. 36

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.35
Рубрики: ВИРУС ЯЩУРА
СЕРОТИП С
ДЕЛЕЦИИ
ЭВОЛЮЦИЯ
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Escarmis, Cristina; Dopazo, Joaquin; Davila, Mercedes; Palma, Eduardo L.; Domingo, Esteban

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.07-04Б1.430

Evolutionary pattern of human respiratory syncytial virus (subgroup A): Cocirculating lineages and correlation of genetic and atigenic changes in the G glycoprotein [Text] / Olga Garcia [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 9. - P5448-5459 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Картина эволюции респираторно-синцитиального вируса (РСВ) человека (подгруппа А): совместная циркуляция видов и корреляция генетических и антигенных изменений в гликопротеине G
Аннотация: Изучали генетическую и антигенную вариабельность гликопротеинов G у 76 изолятов РСВ, выделенных в течение 6 последовательных эпидемий в Уругвае и Испании. Филогенетическое древо РСВ подгруппы А, полученное на основе изучения нуклеотидных последовательностей этих изолятов, а также 6 изолятов, выделенных ранее в Великобритании и референс-штаммов РСВ А2 и Long, содержало две основные ветви и несколько субветвей. В течение одной и той же эпидемии выделяли изоляты, пренадлежащие к разным ветвям. Кроме того, близкородственные вирусы обнаруживали в удаленных друг от друга местах и в различные годы. Антигенный анализ всех изолятов выявил штаммоспецифические эпитопы G. Наблюдали корреляцию между генетическим и антигенным родством белка G. Эти рез-ты вместе с аккумуляцией аминокислотных изменений в основной антигенной области G позволили предположить, что иммунный отбор м. б. фактором, влияющим на дивергенцию РСВ. Картина эволюции РСВ близка к эволюции вирусов гриппа В, за исключением того, что уровень генетической дивергенции среди гликопротеинов изолятов РСВ наиболее высок среди генных продуктов РНК-содержащих вирусов. Испания, Centro Nacional de Microbiol., Inst. de Salud "Carlos III", Majadahonda, 28220 Madrid. Ил. 7. Библ. 54

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.37
Рубрики: РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫЕ ВИРУСЫ
ЭВОЛЮЦИЯ
ЦИРКУЛЯЦИЯ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Garcia, Olga; Martin, Mercedes; Dopazo, Joaquin; Arbiza, Juan; Frabasile, Sandra; Russi, Jose; Hortal, Maria; Perez-Brena, Pilar; Martinez, Martinez; Isidoro, Isidoro; Garcia-Barreno, Blanca; Melero, Jose A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.05-04Б1.78

Phylogenetic relationships of European strains of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) inferred from DNA sequences of putative ORF-5 and ORF-7 genes [Text] / Paloma Suarez [et al.] // Virus Res. - 1996. - Vol. 42, N 1-2. - P159-165 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Филогенетические взаимоотношения европейских штаммов вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней (ВРРСС), выведенные из последовательностей ДНК предполагаемых генов ORF-5 и ORF-7
Аннотация: Целый ген ORF-5 и часть гена ORF-7 14 европейских изолятов ВРРСС амплифицированы методом обратной транскрипции-ПЦР и секвенированы. Идентичность на нуклеотидном и аминокислотном уровнях среди изолятов из разных стран равны соотв. 94,1-99,6% и 95,3-100% для ORF-7 и 97,1-99,2% и 88% для ORF-5. Сравнены последовательности ORF-5 и ORF-7 этих изолятов и других штаммов ВРРСС из Европы и Сев. Америки. Филогенетические деревья для генов ORF-5 и ORF-7 согласуются друг с другом и показывают, что европейские и североамериканские штаммы ВРСС представляют 2 разных генотипа. Обнаружена идеальная корреляция между штаммами и странами, в к-рых они были выделены. Изучено филогенетическое положение европейских и североамериканских штаммов ВРРСС в новом семействе Arteriviridae. Испания, Dep. de Patol. Animal, Fac. de Vet., Univ. Complutense, 28040 Madrid. Библ. 22

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС РЕСПИРАТОРНО-РЕПРОДУКТИВНОГО СИНДРОМА СВИНЕЙ
ШТАММЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВЗАИМОСВЯЗИ
АРТЕРИВИРУСЫ

Доп.точки доступа:
Suarez, Paloma; Zardoya, Rafael; Martin, M.Jesus; Prieto, Cinta; Dopazo, Joaquin; Solana, Alfredo; Castro, Jose M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.07-04Б1.160

Martinez, Isidoro.
Antigenic structure of the human respiratory syncytial virus G glycoprotein and relevance of hypermutation events for the generation of antigenic variants [Text] / Isidoro Martinez, Joaquin Dopazo, Jose A. Melero // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78, N 10. - P2419-2429 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Антигенная структура гликопротеина G респираторно-синцитиального вируса (РСВ) человека и отношение гипермутабельности к возникновению антигенных вариантов
Аннотация: Получен набор моноклональных антител (МАТ), специфически реагирующих с гликопротеином G недавно выделенного изолята РСВ Mon/3/88. Взаимодействие этих МАТ с серией изолятов РСВ, принадлежащих к антигенным группам А и В, позволило идентифицировать три категории эпитопов: 1) штаммспецифические или вариабельные; 2) группоспецифические; 3) консервативные. Штаммспецифические эпитопы локализованы преимущественно в вариабельной С-концевой трети полипептида G. Кроме того, новый штаммспецифический эпитоп был картирован в др. участке, который ранее не считался относящимся к антигенности. Группоспецифические и консервативные эпитопы картированы в центральной области эктодомена белка G. Т. обр., полученные данные в совокупности с проведенным ранее анализом штамма Long позволили получить детальную антигенную карту белка G. Нек-рые мутанты, селекционированные группоспецифическими антителами, содержали множественные замены A'-'G (гипермутабельность) и теряли от 1-2 до 4 цистеинов, к-рые консервативны во всех изолятах РСВ. Обсуждается генетический механизм образования гипермутирующих вирусов и их роль в естественной истории РСВ. Испания, Centro Nacional de Biol. Fundamental, Inst. de Salud "Carlos III", Majadahonda, 28220 Madrid. Библ. 15

ГРНТИ	34.25.23

ВИНИТИ 341.25.23.07
Рубрики: РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫЕ ВИРУСЫ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ
ЭПИТОПЫ
АНТИГЕННЫЕ ВАРИАНТЫ
ГИПЕРМУТАБЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Dopazo, Joaquin; Melero, Jose A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 98.08-04К1.28

Martinez, Isidoro.
Antigenic structure of the human respiratory syncytial virus G glycoprotein and relevance of hypermutation events for the generation of antigenic variants [Text] / Isidoro Martinez, Joaquin Dopazo, Jose A. Melero // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78, N 10. - P2419-2429 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Антигенная структура гликопротеина G респираторно-синцитиального вируса (РСВ) человека и отношение гипермутабельности к возникновению антигенных вариантов
Аннотация: Получен набор моноклональных антител (МАТ), специфически реагирующих с гликопротеином G недавно выделенного изолята РСВ Mon/3/88. Взаимодействие этих МАТ с серией изолятов РСВ, принадлежащих к антигенным группам А и В, позволило идентифицировать три категории эпитопов: 1) штаммспецифические или вариабельные; 2) группоспецифические; 3) консервативные. Штаммспецифические эпитопы локализованы преимущественно в вариабельной С-концевой трети полипептида G. Кроме того, новый штаммспецифический эпитоп был картирован в др. участке, который ранее не считался относящимся к антигенности. Группоспецифические и консервативные эпитопы картированы в центральной области эктодомена белка G. Т. обр., полученные данные в совокупности с проведенным ранее анализом штамма Long позволили получить детальную антигенную карту белка G. Нек-рые мутанты, селекционированные группоспецифическими антителами, содержали множественные замены A'-'G (гипермутабельность) и теряли от 1-2 до 4 цистеинов, к-рые консервативны во всех изолятах РСВ. Обсуждается генетический механизм образования гипермутирующих вирусов и их роль в естественной истории РСВ. Испания, Centro Nacional de Biol. Fundamental, Inst. de Salud "Carlos III", Majadahonda, 28220 Madrid. Библ. 15

ГРНТИ	34.43.27

ВИНИТИ 341.43.27.15
Рубрики: РЕСПИРАТОРНО-СИНЦИТИАЛЬНЫЕ ВИРУСЫ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ
ЭПИТОПЫ
АНТИГЕННЫЕ ВАРИАНТЫ
ГИПЕРМУТАБЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Dopazo, Joaquin; Melero, Jose A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.01-04А3.196

Dopazo, Joaquin.
Phylogenetic reconstruction using an unsupervised growing neural network that adopts the topology of a phylogenetic tree [Text] / Joaquin Dopazo, Jose Maria Carazo // J. Mol. Evol. - 1997. - Vol. 44, N 2. - P226-233 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Филогенетическая реконструкция с применением нейронной сети с обучением без учителя, которая адаптируется к топологии филогенетического древа
Аннотация: Разработан новый вариант растущей самоорганизующейся нейронной сети (НС), к-рая соблюдает бинарные таксономические взаимоотношения между последовательностями, подлежащими классификации. Растущий характер НС дает возможность остановки на желаемом таксономическом уровне до завершения реконструкции всего филогенетического древа. Обсуждаются преимущества НС нового типа в филогенетических исследованиях. Испания, Dep. I+D, TDI, 28028 Madrid. Библ. 38

ГРНТИ	34.53.19

ВИНИТИ 341.53.19.09
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
РЕКОНСТРУКЦИЯ
НЕЙРОННАЯ СЕТЬ
САМООРГАНИЗУЮЩАЯСЯ
РАСТУЩАЯ
ВАРИАНТ
КОНСТРУИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Carazo, Jose Maria

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.12-04А3.988

Dopazo, Joaquin.
A new index to find regions showing an unexpected variability or conservation in sequence alignments [Text] / Joaquin Dopazo // Comput. Appl. Biosci. - 1997. - Vol. 13, N 3. - P313-317 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Новый индекс для обнаружения областей с неожиданной вариабельностью или консерватизмом при выравнивании последовательностей
Аннотация: Разработаны показатели для идентификации областей неожиданной вариабельности или консерватизма при выравнивании аминок-тных последовательностей белков. Индекс основан на определении наблюдаемого и ожидаемого уровней вариабельности с использованием табличных данных о вероятности аминок-тных замен. Испания, Dep. Bioinformatica, TDI, c/Severo Ochoa S/N, Edificio B3, Nave 103, 28100 Alcobendas, Madrid. Библ. 15

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫРАВНИВАНИЕ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ И КОНСЕРВАТИЗМ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ИНДЕКС
РАЗРАБОТКА
МЕТОДЫ

11.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 00.07-04В5.70

Potato virus Y group C isolates are a homogeneous pathotype but two different genetic strains [Text] / Begona Blanco-Urgoiti [et al.] // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 79, N 8. - P2037-2042 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Изоляты вируса картофеля Y группы С являются однородным патотипом, но разными генетическими штаммами
Аннотация: Изучены биологические, молекулярные и генетические св-ва изолятов вируса картофеля Y группы С (ВК-Y{C}). На основании генетических расстояний между ними и по отношению к др. штаммам ВК-Y, круга хозяев (способности или неспособности заражать перец), узнавания моноклональным антителом (МКА) 10Е3 и различий сайта процессинга белка оболочки идентифицированы 2 разных штамма: ВК-Y{C1} и ВК-Y{C2}. Однако нек-рые др. св-ва не коррелируют с такой классификацией. Все штаммы вызывают гиперчувствительный ответ у растений картофеля с геном Nc, т. е. образуют однородный патотип. Испания, Dep. Med. Interna, Univ. Navarra, 48008 Pampleona. Библ. 24

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.15.07.23
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС КАРТОФЕЛЯ Y
ВИРУСЫ ГРУППЫ С
ИЗОЛЯТЫ
ПАТОТИПЫ

Доп.точки доступа:
Blanco-Urgoiti, Begona; Sanchez, Flora; Perez, de San Roman Cristina; Dopazo, Joaquin; Ponz, Fernando

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.07-04Б1.284

Potato virus Y group C isolates are a homogeneous pathotype but two different genetic strains [Text] / Begona Blanco-Urgoiti [et al.] // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 79, N 8. - P2037-2042 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Изоляты вируса картофеля Y группы С являются однородным патотипом, но разными генетическими штаммами
Аннотация: Изучены биологические, молекулярные и генетические св-ва изолятов вируса картофеля Y группы С (ВК-Y{C}). На основании генетических расстояний между ними и по отношению к др. штаммам ВК-Y, круга хозяев (способности или неспособности заражать перец), узнавания моноклональным антителом (МКА) 10Е3 и различий сайта процессинга белка оболочки идентифицированы 2 разных штамма: ВК-Y{C1} и ВК-Y{C2}. Однако нек-рые др. св-ва не коррелируют с такой классификацией. Все штаммы вызывают гиперчувствительный ответ у растений картофеля с геном Nc, т. е. образуют однородный патотип. Испания, Dep. Med. Interna, Univ. Navarra, 48008 Pampleona. Библ. 24

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС КАРТОФЕЛЯ Y
ВИРУСЫ ГРУППЫ С
ИЗОЛЯТЫ
ПАТОТИПЫ

Доп.точки доступа:
Blanco-Urgoiti, Begona; Sanchez, Flora; Perez, de San Roman Cristina; Dopazo, Joaquin; Ponz, Fernando

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI20) 01.07-04И3.642

Taberner, Ana.
Genetic characterization of populations of a de novo arisen sugar beet pest, Aubeonymus mariaefranciscae (Coleoptera, Curculionidae), by RAPD analysis [Text] / Ana Taberner, Joaquin Dopazo, Pedro Castanera // J. Mol. Evol. - 1997. - Vol. 45, N 1. - P24-31 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Генетическая характеристика популяций нового вредителя сахарной свеклы, Aubeonymus mariaefranciscae, полученная с помощью RAPD-анализа
Аннотация: A. mariaefranciscae (A. m.) - важный вредитель сахарной свеклы на юге Испании - впервые был описан как новый вид в 1979 г. Используя 8 праймеров, методом RAPD-анализа на 122 особях изучали генетическую изменчивость жука. Дано подробное описание экологии и эволюции популяций A. m. на юге Испании, хорошо сопоставимое с уникальной историей колонизации области из соседних р-нов. Показано, что RAPD-анализ является эффективным средством реконструкции филогенетической истории популяций. Испания, Dep. de Biol. de Plantas, Centro de Invest. Biol., CSIC, c/Velazques 144, 28006 Madrid. Библ. 45

ГРНТИ	34.33.19

ВИНИТИ 341.33.19.53.59.43.07
Рубрики: AUBEONYMUS MARIAEFRANCISCAE (COL.)
САХАРНАЯ СВЕКЛА
ПОПУЛЯЦИИ
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ЖЕСТКОКРЫЛЫЕ

Доп.точки доступа:
Dopazo, Joaquin; Castanera, Pedro

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 02.05-04А3.776

Herrero, Javier.
A hierarchical unsupervised growing neural network for clustering gene expression patterns [Text] / Javier Herrero, Alfonso Valencia, Joaquin Dopazo // Bioinformatics. - 2001. - Vol. 17, N 2. - P126-136 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Иерархическая неконтролируемая растущая нервная сеть для [изучения] паттернов экспрессии кластеризованных генов
Аннотация: Разработан новый подход к анализу данных по экспрессии генов с использованием неконтролируемой нервной сети. Алгоритм самоорганизующегося дерева (SOTA) описывает нервную сеть, к-рая растет в соответствии с топологией бинарного дерева. В SOTA процесс кластеризации генов по паттернам экспрессии идет сверху вниз, т. е. происходит разрешение высших уровней перед движением к нижним уровням. Определен критерий остановки роста дерева, основанный на примерном распределении вероятностей, полученных при рандомизации исходного набора данных. Посредством этого критерия, разработан статистический метод определения кластеров генов. Различные нейроны, определяющие разные уровни иерархии, представляют средние значения паттерна экспрессии генов, содержащихся в кластерах. Этот метод применим для обработки большого кол-ва данных. Адрес программы SOTA: http://bioinfo.cnio.es/sotarray. Испания, Bioinform., CNIO, Ctra. Majadahonda-Pozuelo, Km 2, Majadahonda, 28220 Madrid. Библ. 26

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ
АЛГОРИТМ SOTA
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ПАТТЕРН
КЛАСТЕРЫ
ВЫЯВЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Valencia, Alfonso; Dopazo, Joaquin

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.07-04Б1.56

Phylogenetic analysis of viroid and viroid-like satellite RNAs from plants: A reassessment [Text] / Santiago F. Elena [et al.] // J. Mol. Evol. - 2001. - Vol. 53, N 2. - P155-159 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Филогенетический анализ вироидных и вироидоподобных сателлитных РНК растений: переоценка
Аннотация: Показано, что несмотря на низкую общую гомологию последовательностей вироидных и вироидоподобных сателлитных РНК, выравнивание их последовательностей вручную, учитывающее все локальные области сходства и описанные в литературе вставки-делеции и дупликации-перестройки, позволяет получить набор данных, вполне пригодных для филогенетич. анализа. С использованием метода правдоподобия этот набор данных позволяет построить филогенетич. древо с более высоким уровнем правдоподобия, чем без учета локального сходства. Анализ методом зашнуровки подтвердил главные группы вироидов и сателлитных РНК, предсказанные ранее. Реконструкция согласуется с биологич. св-вами этих РНК. Испания, Dep. Genet., Univ. Valencia, 46071 Valencia. Библ. 20

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
РНК
ВИРОИДНАЯ
ВИРОИДОПОДОБНАЯ
САТЕЛЛИТНАЯ
РАСТЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Elena, Santiago F.; Dopazo, Joaquin; de, la Pena Marcos; Flores, Ricardo; Diener, Theodor O.; Moya, Andres

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 03.08-04К1.69

Methods and approaches in the analysis of gene expression data [Text] / Joaquin Dopazo [et al.] // J. Immunol. Meth. - 2001. - Vol. 250, N 1-2. - P93-112 . - ISSN 0022-1759
Перевод заглавия: Методы и подходы к анализу данных по экспрессии генов
Аннотация: Усовершенствование методов анализа экспрессии генов привело к тому, что в одном эксперименте удается получить информацию о значительной части генома человека и животных. Это потребовало создания новых методов анализа подобного материала. Статья представляет собой обзор существующих методов такого анализа. Особое внимание уделено анализу данных об экспрессии иммунологически значимых генов. В этом отношении оказались полезным данные о профилях координированной экспрессии генов при активации клеток, а также о генных сигнатурах, специфичных для клеточных типов. Последний показатель особенно важен при анализе механизмов развития заболеваний. Испания, Ctr. Nacional Investigaciones Oncologicas III, Madrid. Библ. 57

ГРНТИ	34.43.29

ВИНИТИ 341.43.29.07
Рубрики: ИММУНОКОМПЕТЕНТНЫЕ КЛЕТКИ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
МЕТОДЫ ВЫЯВЛЕНИЯ
АКТИВАЦИЯ КЛЕТОК
ГЕННЫЕ СИГНАТУРЫ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 57

Доп.точки доступа:
Dopazo, Joaquin; Zanders, Edward; Dragoni, Ilaria; Amphlett, Gillian; Falciani, Francesco

17.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 06.03-04Н1.154

Gene expression analysis of chromosomal regions with gain or loss of genetic material detected by comparative genomic hybridization [Text] / Barbara Melendez [et al.] // Genes, Chromosomes and Cancer. - 2004. - Vol. 41, N 4. - P353-365 . - ISSN 1045-2257
Перевод заглавия: Анализ экспрессии генов в областях хромосом с избыточным или утраченным генетическим материалом методом сравнительной геномной гибридизации
Аннотация: Для изучения влияния изменений в копийности генов на генную экспрессию исследовали 16 случаев T-клеточной лимфомы методом сравнительной геномной гибридизации (CGH) и специально приготовленного микрочипа, содержащего 7657 генов и маркеры экспрессии, типичных для опухолеобразования. Минимально перекрывающиеся CGH-области генов кандидатов (6q25, 13q21-q22 и 19q13.1) проявили слабую зависимость активности экспрессии от степени представленности в геноме. У некоторых генов-кандидатов экспрессия была модифицирована в большинстве опухолей. Этот эффект подтвердился в 23 T-клеточных лимфомах. Общий обзор результатов показал значительное усиление или ослабление экспрессии в областях хромосом с избыточным или утраченным генетическим материалом, соответственно. Различные гены могут по-разному отвечать на избыточность или утрату генетического материала. Испания, Dep. Human Genet., Spanish Natl. Cancer Ctr. (CNIO), Madrid. Библ. 36

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.17.05
Рубрики: ЛИМФОМА
T-КЛЕТОЧНАЯ
ГЕНОМ ЧЕЛОВЕКА
ХРОМОСОМЫ
АНОМАЛИИ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Melendez, Barbara; Diaz-Uriarte, Ramon; Cuadros, Marta; Martinez-Ramirez, Angel; Fernandez-Piqueras, Jose; Dopazo, Ana; Cigudosa, Juan-Cruz; Rivas, Carmen; Dopazo, Joaquin; Martinez-Delgado, Beatriz

18.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 06.03-04Н1.184

A novel candidate region linked to development of both pheochromocytoma and head/neck paraganglioma [Text] / Alberto Cascon [et al.] // Genes, Chromosomes and Cancer. - 2005. - Vol. 42, N 3. - P260-268 . - ISSN 1045-2257
Перевод заглавия: Новая кандидатная область, сцепленная с развитием одновременно феохромоцитомы и параганглиомы головы/шеи
Аннотация: Сравнительной геномной гибридизацией провели цитогенетический анализ набора раков, 24 параганглиом (PGL) головы/шеи и 29 феохромоцитом (PCC). Наиболее частыми были полная/частичная утрата хромосомы 1, причем утрату 1q отмечали только в PGLs (67%), а утрату 1p - в PCCs (69%). Для 72% PCCs и 37% PGLs характерна частичная или полная утрата хромосомы 3, при этом утрата 3q происходила с большей частотой в PCCs, а утрата 1q - только в PGLs. В обоих раках зарегистрировали частое увеличение хромосомного материала в 11q13 и утрату области 8p22-23 (62% PCCs и 33% PGLs); последняя область может включать, как считают, кандидатные гены, ассоциированные со спорадическим развитием обеих аномалий. Испаний, Dep. Human Genet., Ctr. Nac. Invest. Oncol., 28029 Madrid. Библ. 33

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.17.07
Рубрики: ФЕОХРОМОЦИТОМА
ПАРАГАНГЛИОМА ГОЛОВЫ/ШЕИ
ГЕНОМ ЧЕЛОВЕКА
ОБЛАСТЬ 8P22-23
УТРАТА

Доп.точки доступа:
Cascon, Alberto; Ruiz-Llorente, Sergio; Rodriguez-Perales, Sandra; Honrado, Emiliano; Martinez-Ramirez, Angel; Leton, Rocio; Montero-Conde, Cristina; Benitez, Javier; Dopazo, Joaquin; Cigudosa, Juan C.; Robledo, Mercedes

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.05-04А3.714

Al-Shahrour, Fatima.
FatiGO: A web tool for finding significant associations of gene ontology terms with groups of genes [Text] / Fatima Al-Shahrour, Ramon Diaz-Uriarte, Joaquin Dopazo // Bioinformatics. - 2004. - Vol. 20, N 4. - P578-580 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: FatiGO: web-инструмент нахождения значимых ассоциаций терминов Онтологии генов с группами генов

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ
FATIGO
ГЕНЫ
ОНТОЛОГИЯ
ТЕРМИНЫ
АССОЦИАЦИИ
ВЫЯВЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Diaz-Uriarte, Ramon; Dopazo, Joaquin

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.12-04А3.415

Vaquerizas, Juan M.
DNMAD: Web-based diagnosis and normalization for microarray data [Text] / Juan M. Vaquerizas, Joaquin Dopazo, Ramon Diaz-Uriarte // Bioinformatics. - 2004. - Vol. 20, N 18. - P3656-3658 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: DNMAD: основанная на web диагностика и нормализация данных микрочипов

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: КОМПЬЮТЕРНЫЕ МЕТОДЫ
DNMAD
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ДАННЫЕ МИКРОЧИПОВ
НОРМАЛИЗАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Dopazo, Joaquin; Diaz-Uriarte, Ramon

1-20 21-22

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска