СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=PSI<.>)

Общее количество найденных документов : 68
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-68

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.96

Specific binding of HIV-1 nucleocapsid protein to PSI RNA in vitro requires N-terminal zinc finger and flanking basic amino acid residues [Text] / Jens Dannull [et al.] // EMBO Journal. - 1994. - Vol. 13, N 7. - P1525-1533 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Специфическое связывание нуклеокапсидного белка ВИЧ-1 с РНК PSI in vitro требует N-концевого [мотива типа] цинкового пальца и фланкирующих основных аминокислотных остатков
Аннотация: Нуклеокапсидный белок NCp7 (I) ВИЧ-1 длиной 55 остатков содержит 2 мотива типа цинковых пальца (ЦП), из к-рых лишь первый ЦП высококонсервативен среди ретровирусов. Методом конкурентного связывания на фильтрах показано, что химически синтезированный I специфически связывается с вирусной РНК, содержащей сайт упаковки PSI. Для связывания с РНК достаточно 35 N-концевых остатков I, образующих первый ЦП. Анализ мутантных форм I показал, что мотив C-C-C/H-C/H необходим для специфичного связывания с РНК и координационного связывания Zn{2+}. Остатки Phe[16] и Tre[24], но не Lys[20], Glu[21] и Gly[22] в этом ЦП также существенны для связывания с сайтом PSI. Второй ЦП не может заменить первый ЦП. Анализ основных остатков, фланкирующих первый ЦП, показал, что остатки Arg в положениях 3, 7, 10, 29 и 32, но не остатки Lys в положениях 11, 14, 33 и 34, также требуются для связывания с РНК. Рекомбинантные белки NCp15 и Pr55Gag также специфически связываются с РНК PSI. Германия, MPI fur Molekulare Genetik, Abteilung Schuster, D-14159 Berlin. Библ. 55

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
БЕЛОК НУКЛЕОКАПСИДА
РНК PSI
СВЯЗЫВАНИЕ
РЕТРОВИРУСЫ
УПАКОВКА

Доп.точки доступа:
Dannull, Jens; Surovoy, Andrej; Jung, Gunther; Moelling, Karin

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.03-04Б1.74

Berglund, J. Andrew
A high affinity binding site for the HIV-1 nucleocapsid protein [Text] / J.Andrew Berglund, Bruno Charpentier, Michael Rosbash // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 5. - P1042-1049 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Сайт связывания с высоким сродством для нуклеокапсидного белка ВИЧ-1
Аннотация: Нуклеокапсидный белок NC (I) ВИЧ-1 вносит вклад в правильное инкапсидирование РНК ВИЧ, взаимодействуя с элементом Psi на 5'-конце РНК. Специфичность I для Psi и РНК в целом изучена плохо. Для идентификации лигандов РНК, связывающихся с I с высоким родством, использован метод SELEX. Взаимодействие I с РНК-"победителем" SelPsi (II) и ее мутантной версией указало на существование сайта связывания с высоким сродством к I в области Psi ВИЧ-1. Высокое сродство II к I отчасти обусловлено тем, что II похожа на шпилечную область 3 в Psi, включая однонитевой участок с 5'-стороны от стебля шпильки. США, Dep. Biol., Brandeis Univ., Waltham, MA 02254. Библ. 34

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
НУКЛЕОКАПСИДНЫЙ БЕЛОК NC
РНК
ЭЛЕМЕНТ PSI
САЙТ СВЯЗЫВАНИЯ NC
ХАРАКТЕРИСТИКА

Доп.точки доступа:
Charpentier, Bruno; Rosbash, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.05-04Б2.320

Genesis and variability of [PSI] prion factors in Saccharomyces cerevisiae [Text] / Irina L. Derkatch [et al.] // Genetics. - 1996. - Vol. 144, N 4. - P1375-1386 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Генезис и вариабельность прионовых факторов [PSI] у Saccharomyces cerevisiae
Аннотация: Мультикопийные плазмиды, содержащие целиком ген SUP35, способны индуцировать появление неменделирующего фактора [PSI], к-рый, предположительно представляет собой самомодифицируемое прионоподобное конформационное производное белка Sup35. В согласии с такой интерпретацией появление [PSI] способна вызывать сверхпродукция белка Sup35, а не избыток ДНК или мРНК SUP35. "Прион-индуцирующий домен" (ПИД) Sup35p является N-концевой обл., к-рая, как и ПИД др. приона дрожжей Ure2p, отлична от функционального домена белка. По-видимому, такая химерная организация является общей чертой нек-рых прионовых элементов. Сверхпродукция белка Sup35 у одного и того же штамма индуцирует [PSI]-факторы, различающиеся эффективностью и митотич. стабильностью. Предполагается, что этим различным факторам соответствуют различные конформации Sup35p. США, Lab. for Molecular Biol., Dep. of Biol. Sci., Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, Illinois 60607. Библ. 62

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.02
Рубрики: ФАКТОРЫ
ПРИОНОПОДОБНЫЕ [PSI]
ГЕНЕЗИС
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
БЕЛОК
БЕЛОК SUP35
СВЕРХПРОДУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
Derkatch, Irina L.; Chernoff, Yury O.; Kushnirov, Vitaly V.; Inge-Vechtomov, Sergey G.; Liebman, Susan W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 98.10-04Я6.268

p53-Dependent induction of apoptosis by proteasome inhibitors [Text] / Lopes Ulisses Gazos [et al.] // J. Biol. Chem. - 1997. - Vol. 272, N 20. - P12893-12896 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: p53-зависимая индукция апоптоза ингибиторами протеасом
Аннотация: Протеолиз системой убиквитин-протеасомы является мех-змом контроля внутриклеточного содержания ряда белков, регулирующих пролиферацию и прогрессию клеточного цикла. В опытах на клетках Rat-1 и PC12 показано, что пептидоальдегиды PSI и MG115, ингибирующие химотрипсиноподобную активность протеасом, индуцируют апоптоз. Этой активностью не обладают ингибиторы лизосомальных протеаз и алкоголь - аналог PSI. Ингибиторы протеасом вызывают быстрое аккумулирование в клетках белка p53 и белков-продуктов генов p21 и Mdm-2, индуцируемых p53. Доминантно-негативный мутант p53 подавляет развитие апоптоза под действием ингибиторов протеасом. США, Dana-Farber Cancer Inst., Boston, MA 02115. Библ. 25

ГРНТИ	34.19.19

ВИНИТИ 341.19.19.23
Рубрики: ПЕПТИДОАЛЬДЕГИД PSI
ПЕПТИДОАЛЬДЕГИД MG115
ИНДУКЦИЯ АПОПТОЗА
БЕЛОК P53
ПОДАВЛЕНИЕ АПОПТОЗА
КЛЕТКИ RAT-1
КЛЕТКИ PC12

Доп.точки доступа:
Gazos, Lopes Ulisses; Erhardt, Peter; Yao, Ryoji; Cooper, Geoffrey M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.608

Волков, К. В.
Свойства мутантного фактора [PSI]-прионоподобного элемента дрожжей [Текст] / К. В. Волков, Е. А. Ильмов, Л. Н. Миронова // Докл. РАН. - 1997. - Т. 357, N 1. - С. 123-125 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: Изучали свойства у дрожжей фактора [PSI], идентифицированного у мутантов sup35 и sup45. Для этого индуцировали мутации sup35 и sup45 у штамма [Psi{-}] и анализировали мутанты с целью выявления у них фактора [PSI]. Элиминацию фактора [PSI] проводили путем 3-кратного пересева штаммов на среде YPD с гуанидин гидрохлоридом (ГГХ). Снижение эффективности супрессии после воздействия ГГХ, показало, что мутанты содержат фактор [PSI], проявляющий аллосупрессорный эффект типичный для него. Усиление эффективности супрессии говорит о присутствии в клетках мутантов антисупрессорного [PSI]. Его взаимодействие с мутациями sup35 снижает эффективность супрессии, а элиминация приводит к усилению эффективности. Показано, что в тесте на аллелизм мутациям sup35 и sup45 не проявлялось присутствие обеих форм [PSI], что свидетельствовало об их рецессивности. Предполагают, что рецессивное проявление фактора [PSI] у мутантов sup35 и sup45 может свидетельствовать о том, что такой [PSI] представляет собой прион, неспособный индуцировать прионизацию нормального eRF3. Вследствие этого "мутантный" фактор [PSI] проявляется только у гаплоидов, а у диплоидов сохраняется только в латентном состоянии. Проявление мутантной формы белка в прион проявляется на фенотипическом уровне как антисупрессия. Россия, Санкт-Петербургский государственный университет. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.21.07.03
Рубрики: ФАКТОРЫ
[PSI]
ПРИОНОПОДОБНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
МУТАНТЫ
СВОЙСТВА
ДРОЖЖИ
ГЕНЫ SUP35
ФАКТОР ТЕРМИНАЦИИ ТРАНСЛЯЦИИ ERF3

Доп.точки доступа:
Ильмов, Е.А.; Миронова, Л.Н.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 99.12-04А1.223

Price, Donald L.
Mutant genes in familial Alzheimer's disease and transgenic models [Text] / Donald L. Price, Sangram S. Sisodia // Annu. Rev. Neurosci. - Palo Alto (Calif.), 1998. - Vol. .21. - P479-505 . - ISBN 0-8243-2421-8
Перевод заглавия: Мутантные гены при семейной болезни Альцгеймера и трансгенные модели
Аннотация: Некоторые случаи болезни Альцгеймера, особенно с ранним началом, являются семейными и наследуются как аутосомно доминантное заболевание, связанное с мутациями пресинильных генов, кодирующих амилоидный белок-предшественник (АРР) или пресинилины (PS1 или PS2). Эти продукты мутантных генов обусловливают дисфункцию и гибель случайных популяций нервных клеток, важных для памяти, процессов высшего распознавания и поведения. Болезнь Альцгеймера затрагивает 7-10% индивидов старше 65 лет и 40% индивидов старше 80 лет. При позднем начале болезни apoE4 аллель является чувствительным фактором. В обзоре основное внимание уделено болезни Альцгеймера с ранним началом, мутантным генам, связанным с этой формой, последним достижениям генной инженерии на животных моделях. США, The John Hopkins Univ. School of Med., Baltimore, Maryland 21205-2196. Библ. 165

ГРНТИ	34.03.27

ВИНИТИ 341.03.27.15
Рубрики: БОЛЕЗНЬ АЛЬЦГЕЙМЕРА
ТРАНСГЕННЫЕ МОДЕЛИ
РОЛЬ АРР
РОЛЬ PSI И PSII
ЧЕЛОВЕК
МЫШЬ

Доп.точки доступа:
Sisodia, Sangram S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 00.02-04В2.144

Amyloid fibres of Sup35 support a prion-like mechanism of inheritance in yeast [Text] / S. Linqvist [et al.] // Biochem. Soc. Trans. - 1998. - Vol. 26, N 3. - P484-490 . - ISSN 0300-5127
Перевод заглавия: Амилоидные нити Sup35 подтверждают прионоподобный механизм наследования у дрожжей
Аннотация: Обзор. Генетический элемент PSI{+} у Saccharomyces cerevisiae является аномальной прионоподобной формой субъединицы Sup35 (I) фактора терминации трансляции. В клетках PSI{+} большая часть I секвестрирована в неактивной форме. Это приводит к уменьшению эффективности терминации и супрессии всех 3 типов нонсенс-мутаций. Сильным модулятором фактора PSI{+} является белок теплового шока Hsp104. Приведены новые данные об агрегации составного белка-продукта слияния зеленого флуоресцентного белка с N-концевым прионовым доменом I в клетках PSI{+} и psi{-}. США, Dep. Mol. Genet. and Cell Biol., Univ. Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 24

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: ФАКТОРЫ ТРАНСЛЯЦИИ
ФАКТОР ТЕРМИНАЦИИ
ПРИОНОПОДОБНАЯ СУБЪЕДИНИЦА SUP35
ЭЛЕМЕНТ PSI{+}
АКТИВНОСТЬ
ФУНКЦИИ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
МЕХАНИЗМ НАСЛЕДОВАНИЯ
ПРИОНОПОДОБНЫЙ

Доп.точки доступа:
Linqvist, S.; DebBurman, S.K.; Glover, J.R.; Kowal, A.S.; Liu, J.-J.; Schirmer, E.C.; Serio, T.R.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.03-04Б2.253

Doerks, Tobias.
Protein annotation: Detective work for function prediction [Text] / Tobias Doerks, Amos Bairoch, Peer Bork // Trends Genet. - 1998. - Vol. 14, N 6. - P248-250 . - ISSN 0168-9525
Перевод заглавия: Аннотация белков: детективная работа по предсказанию функций
Аннотация: Семейства неохарактеризованных белков (UPF) функционально определены как семейства, к-рые содержат члены из по меньшей мере 3 таксономически отдельных и филогенетически далеких друг от друга видов и не содержат биохимически охарактеризованные белки. В базах данных SWISS-PROT и PROSITE предпринята попытка предсказать ф-ции для 58 семейств UPF с использованием программы PSI-BLAST и др. итеративных методов. У 13 UPF обнаружены трансмембранные сегменты. 25 UPF являются родственными белкам с аннотированными ф-циями. Обсуждаются случаи ошибочного приписывания ф-ций семействам UPF. Германия, EMBL, 69012 Heidelberg. Библ. 18

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛКИ UPF 58 СЕМЕЙСТВ
ФУНКЦИИ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
БАЗА ДАННЫХ SWISS-PROT
PROSITE
МАШИННАЯ ПРОГРАММА PSI-BLAST

Доп.точки доступа:
Bairoch, Amos; Bork, Peer

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.04-04В2.442

Eaglestone, Simon S.
Translation termination efficiency can be regulated in Saccharomyces cerevisiae by environmental stress through a prion-mediated mechanism [Text] / Simon S. Eaglestone, Brian S. Cox, Mick F. Tuite // EMBO Journal. - 1999. - Vol. 18, N 7. - P1974-1981 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Эффективность терминации трансляции может регулироваться у Saccharomyces cerevisiae стрессом окружающей среды по опосредованному прионом механизму
Аннотация: У Saccharomyces cerevisiae фенотип [PSI{+}] отражает прионоподобное поведение эндогенного освобождающего фактора Sup35p. У штаммов [PSI{+}] понижена эффективность терминации трансляции (ЭТТ), что дает возможность декодировать сигналы терминации трансляции и продуцировать аномальные удлиненные полипептиды. Показано, что в нормальных лабораторных условиях штаммы [PSI{+}] и [psi{-}] имеют одинаковую скорость роста, но штаммы [PSI{+}] имеют повышенную толерантность к теплу и химическому стрессу. Прионоподобный детерминант [PSI{+}] способен регулировать ЭТТ в ответ на стресс окружающей среды, т. к. выращивание в присутствии этанола вызывает временно увеличение ЭТТ и утрату фенотипа [PSI{+}]. Предложена модель опосредованной прионом регуляции ЭТТ. Обсуждается физиологическая роль прионов у S. cerevisiae и др. грибов. Великобритания, Res. Sch. Biosci., Univ. Kent, Canterbury, Kent CT2 7NJ. Библ. 42

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: СТРЕСС
ТЕПЛОВОЙ
ХИМИЧЕСКИЙ
ТРАНСЛЯЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФАКТОРЫ
SUP35P
ПРИОНОПОДОБНОЕ ПОВЕДЕНИЕ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
ШТАММ [PSI{+}]

Доп.точки доступа:
Cox, Brian S.; Tuite, Mick F.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.06-04Б2.245

Gouzy, Jerome.
Whole genome protein domain analysis using a new method for domain clustering [Text] / Jerome Gouzy, Florence Corpet, Daniel Kahn // Comput. and Chem. - 1999. - Vol. 23, N 3-4. - P333-340 . - ISSN 0097-8485
Перевод заглавия: Анализ белковых доменов в целых геномах с использованием нового метода группировки доменов
Аннотация: Предпринят систематический анализ перетасовки белковых доменов (БД) в 17 полностью секвенированных геномах микроорганизмов. Анализ использует 2 версии программы MKDOM, основанных на рекурсивных поисках гомологии PSI-BLAST. Этот метод позволяет идентифицировать наиболее часто встречающиеся строительные блоки БД, в к-рых БД принадлежат специфически бактериям, археям или дрожжам либо являются общими для 2 или 3 царств жизни. Статистика мультидоменных белков показала, что такие организмы, как Bacillus subtilis и Mycobacterium tuberculosis, содержат аномально большое число крупных мультидоменных белков. Приведены примеры сильной перетасовки БД и кольцевых перестановок БД. Полученные данные доступны в сети Internet (http://www.toulouse. inra.fr./prodomCG.html). Библ. 13

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: БЕЛОК
ДОМЕНЫ
ПЕРЕТАСОВКА
ГЕНОМЫ
МИКРООРГАНИЗМЫ
ПРОГРАММА MKDOM
ВЕРСИИ
ГОМОЛОГИЯ PSI-BLAST

Доп.точки доступа:
Corpet, Florence; Kahn, Daniel

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 01.06-04А3.22

Gouzy, Jerome.
Whole genome protein domain analysis using a new method for domain clustering [Text] / Jerome Gouzy, Florence Corpet, Daniel Kahn // Comput. and Chem. - 1999. - Vol. 23, N 3-4. - P333-340 . - ISSN 0097-8485
Перевод заглавия: Анализ белковых доменов в целых геномах с использованием нового метода группировки доменов
Аннотация: Предпринят систематический анализ перетасовки белковых доменов (БД) в 17 полностью секвенированных геномах микроорганизмов. Анализ использует 2 версии программы MKDOM, основанных на рекурсивных поисках гомологии PSI-BLAST. Этот метод позволяет идентифицировать наиболее часто встречающиеся строительные блоки БД, в к-рых БД принадлежат специфически бактериям, археям или дрожжам либо являются общими для 2 или 3 царств жизни. Статистика мультидоменных белков показала, что такие организмы, как Bacillus subtilis и Mycobacterium tuberculosis, содержат аномально большое число крупных мультидоменных белков. Приведены примеры сильной перетасовки БД и кольцевых перестановок БД. Полученные данные доступны в сети Internet (http://www.toulouse. inra.fr./prodomCG.html). Библ. 13

ГРНТИ	34.03.23

ВИНИТИ 341.03.23.09.09
Рубрики: БЕЛОК
ДОМЕНЫ
ПЕРЕТАСОВКА
ГЕНОМЫ
МИКРООРГАНИЗМЫ
ПРОГРАММА MKDOM
ВЕРСИИ
ГОМОЛОГИЯ PSI-BLAST

Доп.точки доступа:
Corpet, Florence; Kahn, Daniel

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.114

Muller, Arne.
Benchmarking PSI-BLAST in genome annotation [Text] / Arne Muller, Robert M. MacCallum, Michael J. E. Sternberg // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 293, N 5. - P1257-1271 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Оценка программы PSI-BLAST в аннотации геномов
Аннотация: Оценены чувствительность и частота ошибок программы поиска гомологии PSI-BLAST в аннотации секвенированных геномов. Сконструирован модельный геном SCOP из 1300 последовательностей общей длиной 299 910 п. н., взятых из базы данных SCOP структурной классификации белков. Программа PSI-BLAST использована для нахождения в этом геноме слабо гомологичных структурных доменов (идентичность менее 20%) из мишенной библиотеки SCOP. К аннотации предъявлено требование выбора одного гомолога из нескольких возможных. Найдено, что программа PSI-BLAST правильно аннотировала 40% последовательностей и доменов и дала частоту ошибочных аннотаций, не превышающую 1%. Этот метод применен также к геномам Mycoplasma genitalium и Mycobacterium tuberculosis. Показано, что в первом случае очень мало белков не имеют гомологов с аннотированными функциями. Однако в геноме M. tuberculosis имеется гораздо больше открытых рамок считывания с неизвестными функциями. Великобритания, Biomol. Modelling Lab., ICR Fund, London WC2A 3PX. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: ГЕНОМ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
АННОТАЦИЯ
ПРОГРАММА
ПРОГРАММА ПОИСКА
ГОМОЛОГИИ PSI-BLAST
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ЧАСТОТА ОШИБОК
МОДЕЛЬНЫЙ ГЕНОМ SCOP
ГЕНОМ MYCOPLASMA GENITALIUM
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
MacCallum, Robert M.; Sternberg, Michael J.E.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 01.08-04Б4.154

Muller, Arne.
Benchmarking PSI-BLAST in genome annotation [Text] / Arne Muller, Robert M. MacCallum, Michael J. E. Sternberg // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 293, N 5. - P1257-1271 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Оценка программы PSI-BLAST в аннотации геномов
Аннотация: Оценены чувствительность и частота ошибок программы поиска гомологии PSI-BLAST в аннотации секвенированных геномов. Сконструирован модельный геном SCOP из 1300 последовательностей общей длиной 299 910 п. н., взятых из базы данных SCOP структурной классификации белков. Программа PSI-BLAST использована для нахождения в этом геноме слабо гомологичных структурных доменов (идентичность менее 20%) из мишенной библиотеки SCOP. К аннотации предъявлено требование выбора одного гомолога из нескольких возможных. Найдено, что программа PSI-BLAST правильно аннотировала 40% последовательностей и доменов и дала частоту ошибочных аннотаций, не превышающую 1%. Этот метод применен также к геномам Mycoplasma genitalium и Mycobacterium tuberculosis. Показано, что в первом случае очень мало белков не имеют гомологов с аннотированными функциями. Однако в геноме M. tuberculosis имеется гораздо больше открытых рамок считывания с неизвестными функциями. Великобритания, Biomol. Modelling Lab., ICR Fund, London WC2A 3PX. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.25.09
Рубрики: ГЕНОМ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
АННОТАЦИЯ
ПРОГРАММА
ПРОГРАММА ПОИСКА
ГОМОЛОГИИ PSI-BLAST
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ЧАСТОТА ОШИБОК
МОДЕЛЬНЫЙ ГЕНОМ SCOP
ГЕНОМ MYCOPLASMA GENITALIUM
MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
MacCallum, Robert M.; Sternberg, Michael J.E.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.08-04В2.502

Prions of yeast and fungi. Proteins as genetic material [Text] / Reed B. Wickner [et al.] // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 2. - P555-558 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Прионы дрожжей и грибов. Белки как генетический материал
Аннотация: Обзор. Приведены доказательства того, что внехромосомные генетические элементы [URE3] и [PSI] Saccharomyces cerevisiae и [Het-3] Podospora anserina являются прионными формами кодируемых хромосомой белков Ure2p, Sup35p и Het-s соотв. США, Lab. Biochem. and Genet., NIDDK, NIH, Bethesda, MD 20892-0830. Библ. 40

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: ВНЕХРОМОСОМНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ
URE3 И PSI
ПРИОННЫЕ ФОРМЫ
БЕЛОК
URE2P, SUP35P И HET-S
ХАРАКТЕРИСТИКА
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
PODOSPORA ANCERINA (FUNGI)
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 40

Доп.точки доступа:
Wickner, Reed B.; Edskes, Herman K.; Maddelein, Marie-Lise; Taylor, Kimberly L.; Moriyama, Hiromitsu

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.09-04Б1.7

Прионоподобный фактор терминации трансляции у дрожжей [Текст] // Прил. к "Вестн. РФФИ". - 1998. - N 6. - С. 7-8
Аннотация: Основной целью данного проекта является создание на основе дрожжей Saccharomyces cerevisiae модельной системы для изучения прионов. Удалось получить доказательства того, что белок Sup35p (гомолог фактора терминации трансляции eRF3 высших эукариот) проявляет прионоподобные свойства и выявить домен белка, отвечающий за эти свойства. Разработана бесклеточная система, с помощью которой прионная концепция для детерминанта [PSI+] получила существенное подтверждение. Получены свидетельства того, что прионоподобное превращение белка Sup35p in vivo может быть связано с частичным протеолизом белка, в результате которого в клетке появляются его N-концевые последовательности, проявляющие повышенную склонность к спонтанному переходу в прионоподобную форму. Результаты свидетельствуют о справедливости "полимеризационной" модели "репликации" прионоподобного состояния белка Sup35p. Предпринята попытка количественно оценить частоту появления [PSI+] при амплификации различных аллелей гена SUP35. Россия, РФФИ

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: ПРИОНЫ
ИЗУЧЕНИЕ
МОДЕЛЬНЫЕ СИСТЕМЫ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
БЕЛОК SUP35P
ПРИОНОПОДОБНЫЕ СВОЙСТВА
ДЕТЕРМИНАНТ [PSI+]
ПРИОНОПОДОБНОЕ ПРЕВРАЩЕНИЕ
МЕХАНИЗМЫ

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.320

Genetic study of interactions between the cytoskeletal assembly protein Sla1 and prion-forming domain of the release factor Sup35 (eRF3) in Saccharomyces cerevisiae [Text] / Peggy A. Bailleul [et al.] // Genetics. - 1999. - Vol. 153, N 1. - P81-94 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Генетическое изучение взаимодействий между белком сборки цитоскелета Sla1 и образующим прион освобождающим фактором Sup35 (eRF3) у Saccharomyces cerevisiae
Аннотация: Показали, что С-концевой домен Sla1C белка сборки цитоскелета Sla1 специфически взаимодействует с N-концевым образующим прион [PSI) доменом Sup35N освобождающего фактора Sup35 (eRF3) Saccharomyces cerevisiae в дрожжевой 2-гибридной системе. В этой системе Sla1C и несколько других белков, взаимодействующих с Sup35N, взаимодействуют с имеющим полиглутаминовое удлинение N-проксимальным фрагментом хантингтина человека, способствующим агрегации при болезни Хантингтона. Взаимодействие Sup35N-Sla1C устраняется изменением Sup35N, делающим белок Sup35 неспособным размножать состояние [PSI]{+}, и отсутствием шаперонового белка Hsp104, существенного для размножения [PSI]{+}. На фоне Sla1{-} излечивание от [PSI] супероксидом или избытком Hsp104 усиливается, а трансляционное сквозное считывание и образование [PSI] de novo, вызванные избытком Sup35 или Sup35N, уменьшаются. Эти данные позволили предположить, что Sla1 помогает образованию и размножению [PSI], но не требуется абсолютно для этих процессов. Штаммы Sla1{-} чувствительны к некоторым ингибиторам трансляции, а некоторые мутанты sup35, полученные на фоне Sla1{-}, чувствительны к Sla1, так что взаимодействие Sla1-Sup35 может играть роль в нормальной работе аппарата трансляции. Высказано предположение, что Sup35N участвует в регуляторных взаимодействиях с внутриклеточными структурными сетями и что прион [PSI] является побочным продуктом этого процесса. США, Sch. Biol., Georgia Inst. Technol., Atlanta, GA 30332-0230. Библ. 72

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.02
Рубрики: БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК СБОРКИ ЦИТОСКЕЛЕТА SLAL
C-КОНЦЕВОЙ ДОМЕН
ОСВОБОЖДАЮЩИЙ ФАКТОР SUP35
ДОМЕН SUP35N
ПРИОН
PSI
ОБРАЗОВАНИЕ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Bailleul, Peggy A.; Newnam, Gary P.; Steenbergen, Judith N.; Chernoff, Yury O.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.12-04Б1.362

Molecular basis of a yeast prion species barrier [Text] / Alex Santoso [et al.] // Cell. - 2000. - Vol. 100, N 2. - P277-288 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Молекулярная основа видового барьера для дрожжевого приона
Аннотация: Дрожжевой фактор [PSI{+}] наследуется по прионному механизму с участием саморазмножающихся агрегатов белка Sup35p (I). Клонированы и изучены I из 7 новых видов почкующихся дрожжей Saccharomycetales. Показано, что прионная ф-ция I сохраняется среди отдаленно родственных дрожжей и что межвидовой барьер ингибирует индукцию приона между I из разных видов дрожжей. Этот барьер хорошо воспроизводится в системе in vitro, в к-рой продолжающаяся полимеризация I одного вида не влияет на конверсию I другого вида. Анализ химер обнаружил короткий домен (остатки 8-26 в I), достаточный для пересечения этого барьера чужеродными I. Полученные данные показали, что: 1) межвидовой барьер является результатом специфичности растущих агрегатов I, обусловленной хорошо определенным доменом на амилоидной поверхности; 2) множественные, основанные на прионе наследуемые состояния могут размножаться независимо в одной клетке. США, Dep. Cell. and Mol. Pharmacol., Univ. California, San Francisco, CA 94143-0450. Библ. 34

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.23
Рубрики: ФАКТОРЫ
[PSI{+}]
ПРИОННАЯ ФУНКЦИЯ
ИНДУКЦИЯ
ВИДОВОЙ БАРЬЕР
АНАЛИЗ
ПОЧКУЮЩИЕСЯ ДРОЖЖИ

Доп.точки доступа:
Santoso, Alex; Chien, Peter; Osherovich, Lev Z.; Weissman, Jonathan S.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.12-04В2.416

Genetic study of interactions between the cytoskeletal assembly protein Sla1 and prion-forming domain of the release factor Sup35 (eRF3) in Saccharomyces cerevisiae [Text] / Peggy A. Bailleul [et al.] // Genetics. - 1999. - Vol. 153, N 1. - P81-94 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Генетическое изучение взаимодействий между белком сборки цитоскелета Sla1 и образующим прион освобождающим фактором Sup35 (eRF3) у Saccharomyces cerevisiae
Аннотация: Показали, что С-концевой домен Sla1C белка сборки цитоскелета Sla1 специфически взаимодействует с N-концевым образующим прион [PSI) доменом Sup35N освобождающего фактора Sup35 (eRF3) Saccharomyces cerevisiae в дрожжевой 2-гибридной системе. В этой системе Sla1C и несколько других белков, взаимодействующих с Sup35N, взаимодействуют с имеющим полиглутаминовое удлинение N-проксимальным фрагментом хантингтина человека, способствующим агрегации при болезни Хантингтона. Взаимодействие Sup35N-Sla1C устраняется изменением Sup35N, делающим белок Sup35 неспособным размножать состояние [PSI]{+}, и отсутствием шаперонового белка Hsp104, существенного для размножения [PSI]{+}. На фоне Sla1{-} излечивание от [PSI] супероксидом или избытком Hsp104 усиливается, а трансляционное сквозное считывание и образование [PSI] de novo, вызванные избытком Sup35 или Sup35N, уменьшаются. Эти данные позволили предположить, что Sla1 помогает образованию и размножению [PSI], но не требуется абсолютно для этих процессов. Штаммы Sla1{-} чувствительны к некоторым ингибиторам трансляции, а некоторые мутанты sup35, полученные на фоне Sla1{-}, чувствительны к Sla1, так что взаимодействие Sla1-Sup35 может играть роль в нормальной работе аппарата трансляции. Высказано предположение, что Sup35N участвует в регуляторных взаимодействиях с внутриклеточными структурными сетями и что прион [PSI] является побочным продуктом этого процесса. США, Sch. Biol., Georgia Inst. Technol., Atlanta, GA 30332-0230. Библ. 72

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК СБОРКИ ЦИТОСКЕЛЕТА SLAL
C-КОНЦЕВОЙ ДОМЕН
ОСВОБОЖДАЮЩИЙ ФАКТОР SUP35
ДОМЕН SUP35N
ПРИОН
PSI
ОБРАЗОВАНИЕ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Bailleul, Peggy A.; Newnam, Gary P.; Steenbergen, Judith N.; Chernoff, Yury O.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.01-04Б2.315

True, Heather L.
A yeast prion provides a mechanism for genetic variation and phenotypic diversity [Text] / Heather L. True, Susan L. Lindquist // Nature. - 2000. - Vol. 407, N 6803. - P477-483 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Дрожжевой прион обеспечивает механизм генетической вариации и фенотипического разнообразия
Аннотация: У Saccharomyces cerevisiae прион [PSI{+}] является эпистатич. модификатором точности терминации трансляции. Сравнены ростовые характеристики штаммов [PSI{+}] и [psi{-}] по 150 фенотипич. показателям, включая рост на сбраживаемых источниках C, на простых и сложных источниках N в присутствии солей и металлов, в присутствии ингибиторов репликации ДНК, сигнализации, гликозилирования белков или динамики микротрубочек, в условиях общего стресса и при разных т-рах. Показано, что элемент [PSI{+}] дает возможность проявляться скрытой генетич. вариации и вызывает новые наследуемые фенотипы. Набор этих фенотипов уникален для каждого из 7 изученных генетич. фонов. Высказано предположение, что эпигенетич и метастабильная природа наследования [PSI{+}] дает клеткам дрожжей возможность жить в флуктуирующих условиях окружающей среды. Способность [PSI{+}] превращать нейтральную генетич. вариацию в ненейтральную может облегчать эволюцию новых признаков. США, Dep. Mol. Genet. and Cell Biol., Univ. Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.17.03
Рубрики: ЭВОЛЮЦИЯ
НОВЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ
ВОЗНИКНОВЕНИЕ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРИОН [PSI{+}]
ФУНКЦИЯ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Lindquist, Susan L.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.217

Dual transcriptional regulation of the Escherichia coli phosphate-starvation-inducible psiE gene of the phosphate regulon by PhoB and the cyclic AMP (cAMP)-cAMP receptor protein complex [Text] / Soo-Ki Kim [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 19. - P5596-5599 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Двойная транскрипционная регуляция индуцируемого гена psiE фосфатного регулона Escherichia coli белком PhoB и комплексом цикло-АМФ (цАМФ) - белок-рецептор цАМФ
Аннотация: С использованием слияния с репортерскими генами lacZ и cat показано, что индуцируемый фосфатным голоданием ген psiE Escherichia coli регулируется фосфатом и источником C. Во всех использованных условиях методом удлинения праймера обнаружен один стартовый сайт транскрипции на расстоянии 7 п. н. с 3'-стороны от блока - 10. ДНКазный футпринтинг показал, что белок-активатор PhoB (I) защищает 2 блока pho, расположенных с 5'-стороны от блока - 25 и рядом с ним. Комплекс цАМФ (II) с его белком-рецептором CRP (III) связывается с областью, к-рая перекрывается с 3'-блоком pho. Эти данные и измерение активности промотора psiE показали, что экспрессия гена psiE позитивно контролируется I и негативно - комплексом II-III. Корея, Res. Ctr. for Biomedicinal Resources, Paichai Univ., Taejon 302-735. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН PSI
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ПОЗИТИВНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК-АКТИВАТОР PHOB
НЕГАТИВНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
ЦАМФ - БЕЛОК-РЕЦЕПТОР CRP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kim, Soo-Ki; Kimura, Sigenobu; Shinagawa, Hideo; Nakata, Atsuo; Lee, Ki-Sung; Wanner, Barry L.; Makino, Kozo

1-20 21-40 41-60 61-68

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска