СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ШПИЛЬКА<.>)

Общее количество найденных документов : 45
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-45

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.12-04Б1.177

A study on the integration of adeno-associated virus inverted terminal repeat fold structure in eukaryotic chromosome in vitro [Text] / Baoyu Guo [et al.] // J. Med Coll. PLA. - 1994. - Vol. 9, N 4. - P267-270 . - ISSN 1000-1948
Перевод заглавия: Исследование интеграции свернутой структуры инвертированных концевых повторов аденоассоциированного вируса в эукариотической хромосоме in vitro
Аннотация: Adeno-associated virus (AAV) is a single-stranded linear defective parvovirus. Using the model proposed by Cavalier-Smith for replication of ss-DNA virus, the linear fragment of inverted terminal repeats (ITRs) from PAAV/neo was isolated, denatured and refolded over. The daughter DNA was synthesized by using 3'-OH terminus as a primer with the new strand covalently linked to the parental strand. After the palindromic structure with neomycin resistance gene controlled by SV40 early promoter into eukaryotic cells. Southern blot showed that the molecule of hairpin structure could facilitate the copies into mammalian cells in vitro. The experiment supports the Cavalier-Smith's replication model of ss-DNA virus and provides another new system for DNA transduction. КНР, Dep. of Mol. Genetics, Second Military Med. Univ., Shanghai 200433. Библ. 9

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ПАРВОВИРУСЫ
АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУС
ИНВЕРТИРОВАННЫЙ КОНЦЕВОЙ ПОВТОР
СВЕРТЫВАНИЕ
ШПИЛЬКА
ИНТЕГРАЦИЯ IN VITRO
ЭУКАРИОТИЧЕСКАЯ ХРОМОСОМА
ГЕН УСТОЙЧИВОСТИ К НЕОМИЦИНУ
ТРАНСДУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
Guo, Baoyu; Hu, Zonglin; Xu, Huimin; Kong, Xiantao; Lu, Deru

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.03-04Б1.75

Song, Chuanzheng.
Requirement of a 3'-terminal stem-loop in in vitro transcription by an RNA-dependent RNA polymerase [Text] / Chuanzheng Song, Anne E. Simon // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 254, N 1. - P6-14 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Потребность в 3'-концевой шпильке для транскрипции in vitro РНК-зависимой РНК-полимеразой
Аннотация: Частично очищенная РНК-зависимая РНК-полимераза (I) вируса морщинистости турнепса (ВМТ), выделенная из зараженных растений, способна к зависящему от матрицы синтезу ВМТ-ассоциированных РНК. Чтобы обнаружить цис-последовательности, требующиеся для синтеза in vitro (-)-нитей сателлитной РНК C ВМТ, использованы матрицы с различными внутренними делециями. Показано, что промотор для синтеза (-)-нити находится в пределах 3'-концевого участка (+)-нити длиной 29 н., образующей шпилечную структуру. Комплементарные обмены 4 н. в нижнем стебле и изменение размера и последовательности петли показали, что первичная последовательность петли и нижней части шпильки несущественны для взаимодействия с I. Однако одиночные замены в основании стебля или двойные замены в его верхней части значительно понижают матричную активность in vitro, что указывает на важную роль стабильности шпильки. Перенос шпильки ВМТ в составе 3'-концевого участка длиной 37 н. в неактивную матрицу РНК делает ее активной в транскрипции in vitro под действием I. Это показывает, что промотор для синтеза (-)-нити целиком содержится в 3'-концевой области (+)-нити. США, Dep. Biochem. and Mol. Biol., Univ. of Massachusetts, Amherst, МА 01003. Библ. 30

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС МОРЩИНИСТОСТИ ТУРНЕПСА
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
РНК-ЗАВИСИМАЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
РНК САТЕЛЛИТНАЯ
3'-КОНЦЕВАЯ ШПИЛЬКА
СТАБИЛЬНОСТЬ
ВЛИЯНИЕ

Доп.точки доступа:
Simon, Anne E.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI26) 97.04-04М4.54

The importance of the second hairpin loop of cystatin C for proteinase binding. Characterization of the interaction of Trp-106 variants of the inhibitor with cysteine proteinases [Text] / Ingemar Bjork [et al.] // Biochemistry. - 1996. - Vol. 35, N 33. - P10720-10726 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Значение петли второй шпильки цистатина С для связывания с протеазами. Характеристика взаимодействия мутантов ингибитора по Trp106 с цистеиновыми протеазами
Аннотация: Замена Trp106 в петле второй шпильки цистатина С (ЦС) человека на Gly вызывает спектральные изменения, сопровождающие его связывание с папаином и снижает сродство к папаину, актинидину и катепсинам В и Н в 300-900 раз. Это значит, что Trp106 дает вклад в 14-17 кДж/моль (20-30%) в свободную энергию связывания ЦС с протеазами. Мутация W106F приводит к снижению сродства лишь в 30-120 раз, т. е. фенильная группа лишь частично заменяет индольное кольцо. Снижение сродства мутантов ЦС ко всем четырем протеазам почти полностью определяется ростом скорости диссоциации. Следовательно, петля второй шпильки участвует в заякоривании ЦС в м-ле протеазы после образования комплекса. В этом роль второй шпильки противоположна роли N-концевой области, к-рая увеличивает сродство ЦС к катепсину В за счет увеличения скорости ассоциации. Удаление N-концевой области из мутанта W106G резко снижает сродство к папаину и катепсину В. Остающаяся интактной в таком ЦС петля первой шпильки (область QVVAG) вносит вклад в 40-60% в общую свободную энергию связывания ЦС с обеими протеазами. Швеция, Dep. Vet. Med. Chem., Swedish Univ. Agr. Sci., Box 575, S-751 23 Uppsala; факс: +46-18-550762; e-mail: "ingemar.bjork

ГРНТИ	34.39.41

ВИНИТИ 341.39.41.07.25
Рубрики: ЦИСТАТИН С
ШПИЛЬКА
СВЯЗЫВАНИЕ
ЦИСТЕИНОВЫЕ ПРОТЕАЗЫ

Доп.точки доступа:
Bjork, Ingemar; Brieditis, Ingrid; Raub-Segall, Elke; Pol, Ewa; Hakansson, Katarina; Abrahamson, Magnus

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.07-04Б1.77

E. coli SSB activates N4 virion RNA polymerase promoters by stabilizing a DNA hairpin required for promoter recognition [Text] / M.Alexandra Glucksmann-Kuis [et al.] // Cell. - 1996. - Vol. 84, N 1. - P147-154 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Белок SSB E. coli активирует промоторы для вирионной РНК-полимеразы фага N4, стабилизируя шпильку ДНК, требующуюся для узнавания промоторов
Аннотация: Для транскрипции вирионной РНК-полимеразой фага N4 (I) с ранних фаговых промоторов в двунитевой ДНК необходимы суперспирализация ДНК и белок SSB E. coli (II). Другие связывающиеся с однонитевой ДНК (оДНК) белки (III) не могут заменить II. Детерминантом связывания I c промоторами является маленькая шпилька в матричной нити ДНК. Потребность в II кажется парадоксальной, т. к. III дестабилизируют шпильки. Показано, что II активирует транскрипцию под действием I оДНК, содержащих ранние промоторы N4. ДНКазный футпринтинг нормальных и мутантных промоторов показал, что II стабилизирует шпильку в матричной нити из-за особенностей структуры шпильки, а III дестабилизируют промоторную шпильку. Эти данные позволили объяснить специфичность активации под действием II: II является активатором транскрипции, т. к. он обеспечивает правильную структуру матрицы для связывания I. Существование маленьких шпилек, стабильных в присутствии связывающегося с оДНК белка является новым механизмом, обеспечивающим структурные детерминанты для связывания РНК-полимераз. США, Dep. of Molecular Genetics and Cell Biol., Univ. of Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 32

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК SSB
ESCHERICHIA COLI
ОДНОНИТЕВАЯ ФАГОВАЯ ДНК
ШПИЛЬКА ПРОМОТОРНАЯ
СТАБИЛИЗАЦИЯ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ВИРИОННАЯ
УЗНАВАНИЕ
ПРОМОТОРЫ
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ N4

Доп.точки доступа:
Glucksmann-Kuis, M.Alexandra; Dai, Xing; Markiewicz, Peter; Rothman-Denes, Lucia B.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.04-04Б1.134

Berkhout, Ben.
Forced evolution of a regulatory RNA helix in the HIV-1 genome [Text] / Ben Berkhout, Bep Klaver, Atze T. Das // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 5. - P940-947 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Форсированная эволюция регуляторной спирали РНК в геноме ВИЧ-1
Аннотация: Ранее показано, что у мутантных геномов ВИЧ-1 со стабилизированной или дестабилизированной шпилькой поли(A) (ШПА) в элементе R, нарушена репликация. Установлено, что мутант с дестабилизированной ШПА условно дефектен: репликация понижена при 37'ГРАДУС', но не при 33'ГРАДУС'; мутант более приспособлен, чем ВИЧ-1 дикого типа. Это подтвердило, что стабильность ШПА критична для репликации ВИЧ-1. В нескольких независимых опытах из мутантов с дестабилизированной или стабилизированной ШПА выделены ревертанты, у к-рых восстановилась такая же стабильность ШПА, как у ВИЧ-1 дикого типа, в результате компенсаторных мутаций. Идентифицированы 19 различных ревертантных форм ВИЧ-1 с улучшенными репликативными характеристиками. Нидерланды, Acad. Med. Ctr, Univ. Amsterdam, Dep. Human Retrovirol., 1100 DE Amsterdam. Библ. 44

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ЭВОЛЮЦИЯ
ФОРСИРОВАННАЯ
ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
РНК
ШПИЛЬКА ПОЛИ(A)
СТАБИЛИЗАЦИЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
ЭФФЕКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Klaver, Bep; Das, Atze T.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.256

Klovins, J.
Rescue of the RNA phage genome from RNase III cleavage [Text] / J. Klovins, Duin J. van, R. C.L. Olsthoorn // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 21. - P4201-4208 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Спасение генома РНК-содержащего фага от расщепления РНК-азой III
Аннотация: В некодирующую область РНК фага MS2 введена полностью двунитевая шпилька длиной 17 п. н., являющаяся мишенью для РНКазы III (I). Полученные фаги выживают в мутантах Escherichia coli, дефектных по I, но не в клетках дикого типа, в к-рых шпилька подвергается дарвиновской эволюции в структуру, не являющуюся субстратом для I. Это достигается 3 разными путями: 1) идеальный стебель сохраняется, но укорачивается за счет удаления почти всей вставки; 2) стебель приобретает супрессорные мутации, заменяющие уотсон-криковские пары ошибочно спаренными основаниями; 3) стебель приобретает маленькие вставки или делеции, создающие выступы. Вставки состоят из коротких участков нематричных остатков А или У, к-рые можно приписать полиаденилирование в сайте разрезания в (+)- или (-)-нити под действием поли(А)-полимеразы или задержанной репликазы MS2. Нидерланды, Dep. of Biochem., Leiden Inst. of Chem., Leiden Univ., 2300 RA Leiden. Библ. 35

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
СПАСЕНИЕ
РНК
ВВЕДЕНИЕ
ДВУНИТЕВАЯ ШПИЛЬКА
МИШЕНЬ РНКАЗЫ
ФАГИ
ВЫЖИВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАНТЫ

Доп.точки доступа:
van, Duin J.; Olsthoorn, R.C.L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.88

Kolk, M. H.
The structure of the isolated, central hairpin of the HDV antigenomic ribozyme: Novel structural features and similarity of the loop in the ribozyme and free in solution [Text] / M. H. Kolk, H. A. Heus, C. W. Hilbers // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 12. - P3685-3692 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Структура изолированной центральной шпильки антигеномного рибозима вируса гепатита дельта: новые структурные признаки и сходство структуры петли в рибозиме и в свободном состоянии в растворе
Аннотация: Структура шпильки РНК, содержащей петлю длиной 7 н. (П-7), в антигеномном рибозиме вируса гепатита 'дельта' изучена в растворе методом ЯМР. П-7 (YCCYCGC) имеет стабильную структуру, поддерживаемую водородными связями OH-групп рибозы и стэкинг-взаимодействиями оснований друг с другом и с фосфатами. По сравнению с антикодоновой П-7 в тРНК в рибозимной П-7 поворот, вызывающий изменение на 180'ГРАДУС' направления сахарофосфатного остова РНК, смещен на 1 н. в 3'-направлении. Это изменение направления названо "перевернутым Y-поворотом". Получены доказательства существования не-Уотсон-криковского спаривания Y;C между первым и последним основаниями в П-7. Остальные основания П-7 направлены наружу и доступны для растворителя. Изучение химической модификации, мутагенеза и фотосшивки показало, что структуры свободной П-7 и П-7 в растворе похожи. Нидерланды, Lab. Biophys. Chem., Univ. Nijmegen, 6525 ED Nijmegen. Библ. 38

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА ДЕЛЬТА
РИБОЗИМЫ
АНТИГЕНОМНЫЙ
ЦЕНТРАЛЬНАЯ ШПИЛЬКА
СТРУКТУРА
В РИБОЗИМЕ
В РАСТВОРЕ

Доп.точки доступа:
Heus, H.A.; Hilbers, C.W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.366

Inhibition of HIV-1 replication using a mutated tRNA{Lys-3} primer [Text] / Yuanan Lu [et al.] // J. Biol. Chem. - 1997. - Vol. 272, N 23. - P14523-14531 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Ингибирование репликации ВИЧ-1 с использованием мутированной затравки тРНК{лиз3}
Аннотация: Сконструировано мутантное производное тРНК{лиз3} (I) с мутациями в области сайта связывания с сайтом связывания затравки PBS ВИЧ-1. У этой I специфичность праймирования изменена и направлена на шпильку TAR в РНК ВИЧ-1. Мутант I с высоким сродством связывается с обратной транскриптазой ВИЧ-1, включается в вирионы и может праймировать обратную транскрипцию на мишенной последовательности TAR и на PBS. Конститутивная экспрессия мутантной I ингибирует репликацию ВИЧ-1, уменьшая инфекционность, образование синцитиев и продукцию антигена p24. США, Univ. Rochester Canc. Ctr, Rochester, NY 14642. Библ. 48U

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНГИБИРОВАНИЕ
ПРАЙМЕР-СВЯЗЫВАЮЩИЙ САЙТ PBS
ШПИЛЬКА TAR
РНК ТРАНСПОРТНАЯ
ЛИЗИНОВАЯ МУТАНТНАЯ
СВЯЗЫВАНИЕ С TAR И PBS

Доп.точки доступа:
Lu, Yuanan; Planelles, Vicente; Li, Xinqiang; Palaniappan, Chockalingam; Day, Brian; Challita-Eid, Pia; Amado, Rafael; Stephens, Dennis; Kohn, Donald B.; Bakker, Andreas; Fay, Philip; Bambara, Robert A.; Rosenblatt, Joseph D.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.10-04Б2.179

From genetic to structural characterization of a new class of RNA-binding domain within the SacY/BglG family of antiterminator proteins [Text] / Xavier Manival [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 16. - P5019-5029 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: От генетической к структурной характеристике нового класса доменов связывания с РНК в семействе SacY/BglG антитерминаторных белков
Аннотация: Белок SacY (I) Bacillus subtilis является прототипом семейства антитерминаторных белков, к-рые связываются в лидерной области мРНК с шпилькой RAT длиной 29-30 н., частично перекрывающейся с терминатором транскрипции. N-концевой фрагмент I SacY (1-55) (IA) и соответствующие фрагменты других членов семейства также являются антитерминаторами, по эффективности и специфичности идентичными полноразмерным белкам. Эта активность in vitro коррелирует со специфич. сродством к РНК RAT. Изучение УФ-плавления показало, что связывание IA стабилизирует структуру РНК RAT. Спектры ЯМР показали, что IA в растворе имеет такую же структуру, как и в кристалле: он свернут в симметричный димер, не имеющий структурной гомологии с другими доменами связывания с РНК. Димер I не разрушается при связывании с РНК, несколько остатков, участвующих в узнавании РНК, расположены на краю области контакта субъединиц в димере I. Франция, Faculte de Pharmacie, Univ. Montpellier, 34060 Montpellier. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БЕЛОК
SACY АНТИТЕРМИНАТОРНЫЙ БЕЛОК
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
МРНК
ЛИДЕРНАЯ ОБЛАСТЬ
ШПИЛЬКА
RAT
ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Manival, Xavier; Yang, Yinshan; Strub, Marie Paule; Kochoyan, Michel; Steinmetz, Michel; Aymerich, Stephane

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 98.11-04А3.341

New bioresorbable pin for the reduction of small bony fragments: Design, mechanical properties and in vitro degradation [Text] / L. E. Claes [et al.] // Biomaterials. - 1996. - Vol. 17, N 16. - P1621-1626 . - ISSN 0142-9612
Перевод заглавия: Новая биорезорбируемая шпилька для восстановления мелких костных фрагментов. Конструкция, механические свойства и разрушение in vitro

ГРНТИ	34.53.47

ВИНИТИ 341.53.47.21.23
Рубрики: ОРТОПЕДИЧЕСКИЕ УСТРОЙСТВА
ШПИЛЬКА
БИОРЕЗОРБИРУЕМОЕ УСТРОЙСТВО
МЕЛКИЕ КОСТНЫЕ ФРАГМЕНТЫ
IN VITRO

Доп.точки доступа:
Claes, L.E.; Ignatius, A.A.; Rehm, K.E.; Scholz, C.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.03-04Б1.77

Multiple biological roles associated with the Rous sarcoma virus 5' untranslated RNA U5-IR stem andd loop [Text] / Jennifer T. Miller [et al.] // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 10. - P7648-7656 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Множественные биологические роли, ассоциированные с 5'-нетранслируемой шпилькой РНК U5-IR вируса саркомы Рауса
Аннотация: Длина стебля шпильки U5-IR в РНК вируса саркомы Рауса (ВСР), расположенной около 5'-конца сайта связывания затравки PBS увеличена вставками различных последовательностей, к-рые понижают эффективность обратной транскрипции (ОТ) in vitro и in vivo. ОТ частично восстанавливается, если в середине удлиненного стебля находятся однонитевые выступы. Замены нуклеотидов или вставки в области петли шпильки U5-IR также понижают эффективность ОТ, так что эти последовательности могут специфически взаимодействовать с обратной транскриптазой. Все мутации удлинения стебля, но не изменения петли U5-IR, значительно понижают эффективность упаковки РНК. Эти данные показали, что комплекс инициации ОТ и аппарат упаковки РНК зависят от одной и той же области РНК ВСР. США, Dep. Biochem., Case Western Reserve Univ. Sch. Med., Cleveland, OH 44106-4935. Библ. 50

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС САРКОМЫ РАУСА
РНК ВИРУСНАЯ
ШПИЛЬКА 5'-НЕТРАНСЛИРУЕМАЯ
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Miller, Jennifer T.; Ge, Zheng; Morris, Shannon; Das, Kingshuk; Leis, Jonathan

12.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 99.03-04Н1.339

Multiple biological roles associated with the Rous sarcoma virus 5' untranslated RNA U5-IR stem andd loop [Text] / Jennifer T. Miller [et al.] // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 10. - P7648-7656 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Множественные биологические роли, ассоциированные с 5'-нетранслируемой шпилькой РНК U5-IR вируса саркомы Рауса
Аннотация: Длина стебля шпильки U5-IR в РНК вируса саркомы Рауса (ВСР), расположенной около 5'-конца сайта связывания затравки PBS увеличена вставками различных последовательностей, к-рые понижают эффективность обратной транскрипции (ОТ) in vitro и in vivo. ОТ частично восстанавливается, если в середине удлиненного стебля находятся однонитевые выступы. Замены нуклеотидов или вставки в области петли шпильки U5-IR также понижают эффективность ОТ, так что эти последовательности могут специфически взаимодействовать с обратной транскриптазой. Все мутации удлинения стебля, но не изменения петли U5-IR, значительно понижают эффективность упаковки РНК. Эти данные показали, что комплекс инициации ОТ и аппарат упаковки РНК зависят от одной и той же области РНК ВСР. США, Dep. Biochem., Case Western Reserve Univ. Sch. Med., Cleveland, OH 44106-4935. Библ. 50

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.21.11.07.07
Рубрики: ВИРУС САРКОМЫ РАУСА
РНК ВИРУСНАЯ
ШПИЛЬКА 5'-НЕТРАНСЛИРУЕМАЯ
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Miller, Jennifer T.; Ge, Zheng; Morris, Shannon; Das, Kingshuk; Leis, Jonathan

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.229

Chan, Cathleen L.
Multiple interactions stabilize a single paused transcription intermediate in which hairpin to 3' end spacing distinguishes pause and termination pathways [Text] / Cathleen L. Chan, Daguang Wang, Robert Landick // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 268, N 1. - P54-68 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Множественные взаимодействия стабилизируют один задержанный интермедиат транскрипции, в котором расстояние между шпилькой и 3'-концом различает пути паузы и терминации
Аннотация: В лидерных областях оперонов trp и his у Escherichia coli транскрипция задерживается сигналами паузы, состоящими из 4 компонентов: шпильки паузы (ШП), участка РНК длиной 10-11 н. между ШП и 3'-концом РНК, оснований в активном центре РНК-полимеразы (I) и области ДНК длиной 14 п. н. с 3'-стороны от сайта паузы (СП). Эти сигналы замедляют присоединение к РНК следующего нуклеотида в одном кинетич. интермедиате. В образовании задержанного комплекса транскрипции (ЗТК) синергично действуют последовательности ДНК и РНК, вызывающие выбор СП среди нескольких ближайших возможных. Удлинение ШП на одну пару Г*Ц уменьшает задержку, мешая взаимодействию ШП с поверхностью I. Добавление второй пары Ц*Г, уменьшающей расстояние до 3'-конца РНК до 9 н., вызывает освобождение транскрипта. Высказано предположение, что вывод I из СП управляется изомеризацией элонгирующего комплекса, к-рая требует связывания НТФ для восстановления геометрии активного центра I. Освобождение транскрипта (терминация) наблюдается, когда взаимодействие с ШП ослаблено и изомеризация в активную конформацию блокирована. США, Dep. of Bacteriol., Univ. of Wisconsin, Madison, WI 53706. Библ. 54

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН TRP
ОПЕРОН HIS
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ШПИЛЬКА-ПАУЗА
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wang, Daguang; Landick, Robert

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.393

Larsen, Bente.
Structural probing and mutagenic analysis of the stem-loop required for Escherichia coli dnaX ribosomal frameshifting: Programmed eficiency of 50% [Text] / Bente Larsen, Raymond F. Gesteland, John F. Atkins // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 271, N 1. - P47-60 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Зондирование структуры и мутагенный анализ шпильки, требующейся для рибосомного сдвига рамки в гене dnaX Escherichia coli: программированная эффективность 50%
Аннотация: Для программированного трансляц. сдвига рамки (ТСР) в мРНК dnaX важны 3 элемента: последовательность Шайна-Далгарно (ПШД), сайт двойного сдвига и 3'-структура. Конформация мРНК, содержащей эти 3 элемента, изучена с использованием химич. и ферментных зондов. Обнаружена специфич. шпилька, нижняя половина стебля к-рой более стабильна, чем верхняя. Мутац. анализ показал, что понижение стабильности нижней половины стебля сильнее уменьшает ТСР, чем изменение верхней половины. Страбилизация верхней половины стебля делает эффективность ТРС более высокой, чем в случае шпильки дикого типа. Природа последовательности РЕК в шпильке несущественна, если сохраняется общая структура. Взаимодействия с ПШД и с элементом шпильки независимо повышают эффективность ТРС. США, Dep. of Human Genetics, Univ. of Utah, Salt Lake City, UT 84112. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН DNA
ТРАНСЛЯЦИЯ
СДВИГ РАМКИ
ВЛИЯНИЕ
МРНК
СПЕЦИФИЧЕСКАЯ ШПИЛЬКА
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Gesteland, Raymond F.; Atkins, John F.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.428

Three modified nucleosides present in the anticodon stem and loop influence the in vivo aa-tRNA selection in a tRNA-dependent manner [Text] / Ji-nong Li [et al.] // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 271, N 2. - P209-221 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Три модифицированных нуклеозида присутствуют в антикодоновой шпильке и влияют на селекцию аминоацил-тРНК in vivo зависящим от тРНК образом
Аннотация: У Salmonella typhimurium в антикодоновой шпильке у семи тРНК содержится 1-метилгуанозин (I), у 5 тРНК - 2-метилтио-N-6-/цис-гидрокси/изопентениладенозин (II) и у 4 тРНК - псевдоуридин (III). С использованием мутантов, дефектных по синтезу I, II или III, изучена роль I-III на первой стадии элонгации трансляции - стадии селекции аминоацил-тРНК (IV) во время связывания комплекса EF-Tu-ГТФ-IV с кодоном в А-сайте рибосом. Показано, что; 1) III в положении 38 антикодоновой петли стимулирует селекцию тРНК{лей}, но III в антикодоновом стебле (положения 39-40) не влияет на селекцию тРНК{про}; 2) I в положении 37 стимулирует селекцию 3 тРНК{про} и одной тРНК{арг}, но не влияет на селекцию 3 тРНК{лей}; 3) II в положении 37 стимулирует селекцию тРНК{тир} и в меньшей степени тРНК{цис} и тРНК{трп}, но не влияет на селекцию тРНК{фен}. Швеция, Dep. of Microbiol., Univ. of Umea, S-901 87 Umea. Библ. 56

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ЭЛОНГАЦИЯ
РНК ТРАНСПОРТНАЯ
АНТИКОДОНОВАЯ ШПИЛЬКА
МОДИФИЦИРОВАННЫЕ НУКЛЕОЗИДЫ
ВЛИЯНИЕ НА
АМИНОАЦИЛ-ТРНК
СЕЛЕКЦИЯ
КОДОН-АНТИКОДОН ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Li, Ji-nong; Esberg, Birgitta; Curran, James F.; Bjork, Glenn R.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.09-04Б1.78

Puglisi, Elisabetta Viani.
HIV-1 A-rich RNA loop mimics the tRNA anticodon structure [Text] / Elisabetta Viani Puglisi, Jospeh D. Puglisi // Nature Struct. Biol. - 1998. - Vol. 5, N 12. - P1033-1036 . - ISSN 1072-8368
Перевод заглавия: Богатая А-петля ВИЧ-1 имитирует структуру антикодона тРНК
Аннотация: Богатая аденином шпилька (БАШ), расположенная на расстоянии 8 н. с 5'-стороны от сайта связывания затравки PBS в РНК ВИЧ-1, в области петли комплементарна антикодону YYY тРНК{лиз}[3] (I) и участвует в образовании комплекса с I при инициации обратной транскрипции. Методом ЯМР определена структура олигонуклеотида БАШ (остатки 163-175). Структура петли стабилизируется неканонической парой G*A и мотивом Y-поворота, к-рый приводит к стэкингу консервативных остатков A. Структура БАШ похожа на структуру антикодона тРНК. Обсуждаются механизмы участия БАШ в иниции и обратной транскрипции. США, Dep. Structural Biol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5400. Библ. 30

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1
ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ
A-БОГАТАЯ ШПИЛЬКА
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Puglisi, Jospeh D.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 99.12-04В2.195

Lin, Jia-Hwei.
Reverse transcription of a self-primed retrotransposon requires an RNA structure similar to the U5-IR stem-loop of retroviruses [Text] / Jia-Hwei Lin, Henry L. Levin // Mol. and Cell. Biol. - 1998. - Vol. 18, N 11. - P6859-6869 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Обратная транскрипция самопраймируемого ретротранспозона требует структуры РНК, похожей на шпильку U5-IR ретровирусов
Аннотация: Инвертированный повтор IR в области U5 мРНК вируса саркомы Рауса (ВСР) образует шпильку со стеблем из 7 п. н. и петлей из 5 н., требующуюся для инициации обратной транскрипции. мРНК ретротранспозона Tf1 Schizosaccharomyces pombe также потенциально способна образовывать шпильку U5-IR как у ВСР со стеблем длиной 7 п. н. но с петлей длиной 25 н. Методом мутагенеза показано, что эта шпилька в мРНК Tf1 действительно образуется и требуется для транспозиции Tf1, хотя ее нуклеотидная последовательность несущественна. Уменьшение длины петли до 6 н. вызывает утрату способности к транспозиции, к-рая возобновляется при увеличении содержания ГЦ в стебле. Это позволило предположить, что более длинная петля у Tf1 по сравнению с ВСР нужна для компенсации более слабого стебля U5-IR. Мутации в структуре U5-IR не влияют на уровень экспрессии белков Tf1 и кол-во РНК Tf1, упаковываемой в вирусоподобные частицы. Однако все мутации в U5-IR, приводящие к дефекту по транспозиции, вызывают образование низкого кол-ва обратных транскриптов. Уникальной особенностью инициации обратной транскрипции Tf1 является использование первых 11 н. мРНК Tf1 в кач-ве затравки для синтеза (-)- нити ДНК. Анализ 5'-конца мРНК Tf1 показал, что мутации в U5-IR, вызывающие дефект по обратной транскрипции, уменьшают расщепляющую активность, требующуюся для образования затравки Tf1. Полученные данные показали, что стебли U5-IR у Tf1 и ВСР консервативны по положению, размеру и ф-ции. США, Lab. Eukaryotic Gene Regulation, Nat. Inst. Child Hlth. and Devel., NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 27

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ
TF1
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПЦИЯ
РНК МАТРИЧНАЯ
ШПИЛЬКА U5-IR
ОБРАЗОВАНИЕ
ФУНКЦИИ
SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Levin, Henry L.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.01-04Б1.70

Lin, Jia-Hwei.
Reverse transcription of a self-primed retrotransposon requires an RNA structure similar to the U5-IR stem-loop of retroviruses [Text] / Jia-Hwei Lin, Henry L. Levin // Mol. and Cell. Biol. - 1998. - Vol. 18, N 11. - P6859-6869 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Обратная транскрипция самопраймируемого ретротранспозона требует структуры РНК, похожей на шпильку U5-IR ретровирусов
Аннотация: Инвертированный повтор IR в области U5 мРНК вируса саркомы Рауса (ВСР) образует шпильку со стеблем из 7 п. н. и петлей из 5 н., требующуюся для инициации обратной транскрипции. мРНК ретротранспозона Tf1 Schizosaccharomyces pombe также потенциально способна образовывать шпильку U5-IR как у ВСР со стеблем длиной 7 п. н. но с петлей длиной 25 н. Методом мутагенеза показано, что эта шпилька в мРНК Tf1 действительно образуется и требуется для транспозиции Tf1, хотя ее нуклеотидная последовательность несущественна. Уменьшение длины петли до 6 н. вызывает утрату способности к транспозиции, к-рая возобновляется при увеличении содержания ГЦ в стебле. Это позволило предположить, что более длинная петля у Tf1 по сравнению с ВСР нужна для компенсации более слабого стебля U5-IR. Мутации в структуре U5-IR не влияют на уровень экспрессии белков Tf1 и кол-во РНК Tf1, упаковываемой в вирусоподобные частицы. Однако все мутации в U5-IR, приводящие к дефекту по транспозиции, вызывают образование низкого кол-ва обратных транскриптов. Уникальной особенностью инициации обратной транскрипции Tf1 является использование первых 11 н. мРНК Tf1 в кач-ве затравки для синтеза (-)- нити ДНК. Анализ 5'-конца мРНК Tf1 показал, что мутации в U5-IR, вызывающие дефект по обратной транскрипции, уменьшают расщепляющую активность, требующуюся для образования затравки Tf1. Полученные данные показали, что стебли U5-IR у Tf1 и ВСР консервативны по положению, размеру и ф-ции. США, Lab. Eukaryotic Gene Regulation, Nat. Inst. Child Hlth. and Devel., NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 27

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ
TF1
ОБРАТНАЯ ТРАНСКРИПЦИЯ
РНК МАТРИЧНАЯ
ШПИЛЬКА U5-IR
ОБРАЗОВАНИЕ
ФУНКЦИИ
SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Levin, Henry L.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.02-04Б1.128

Initiation of DNA replicaton at palindromic telomeres is mediated by a duplex-to-hairpin transition induced by the minute virus of mice nostructural protein NS1 [Text] / Kurt Willwand [et al.] // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 2. - P1165-1174 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Инициация репликации ДНК на палиндромных теломерах опосредована переходом дуплекс-шпилька, индуцированным неструктурным белком NS1 карликового вируса мышей
Аннотация: В системе репликации in vitro с матрицей клонированной ДНК карликового вируса мышей (КВМ) обнаружена праймируемая шпилькой репликация на обоих концах ДНК КВМ, причем инициация преимущественно идет на правом конце. Инициации репликации способствуют ядерные компоненты экстракта клеток A9. Инициацию сильно стимулирует неструктурный белок NS1 (I) КВМ. Праймированная шпилькой репликация ДНК наблюдается в присутствии I и кленовского фрагмента ДНК-полимеразы-I Escherichia coli. АТФ'гамма'S блокирует инициацию репликации, но не элонгацию предсуществующих шпилечных затравок, образовавшихся в присутствии одного I. Опосредованное I раскручивание палиндрома правого конца ДНК может объяснить способность I направлять синтез димерной репликативной формы ДНК in vitro. Германия, Dep. Appl. Tumor Virol., German Ctr. Canc. Res., D-69009 Heidelberg. Библ. 73

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: КАРЛИКОВЫЙ ВИРУС МЫШЕЙ
БЕЛОК NS1
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
ДНК
ПАЛИНДРОМНЫЕ ТЕЛОМЕРЫ
ПЕРЕХОД ДУПЛЕКС-ШПИЛЬКА
ИНДУКЦИЯ

Доп.точки доступа:
Willwand, Kurt; Mumtsidu, Eleni; Kuntz-Simon, Gaelle; Rommelaere, Jean

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 00.04-04И1.59

Secondary structure of some elements of 18S rRNA suggests that strongylid and a part of rhabditid nematodes are monophyletic [Text] / Vladimir V. Aleshin [et al.] // FEBS Lett. - 1998. - Vol. 429, N 1. - P4-8 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Вторичная структура некоторых элементов 18S-рРНК показывает, что нематоды-стронгилиды и частично - рабдитиды являются монофилетическими
Аннотация: Исследовали сравнительно структуру шпильки-17 в 18S-рРНК нек-рых видов нематод. Нек-рые элементы втор. структуры рРНК являются общими для всех изученных видов, а нек-рые специфичны только для порядка Rhabditida. Отсутствие единственной пары нуклеотидов в шпильке-17 рРНК отличает нематод-стронгилид и нек-рых видов Rhabditida от других нематод и вообще - от остальных организмов. Предполагается, что Strongilida и часть видов Rhabditida (в том числе, Caenorhabditis elegans) образуют новый монофилетический таксон. Россия, Ин-т физ.-хим. биол. им. А. Н. Белозерского, МГУ, Москва 119899. Библ. 20

ГРНТИ	34.33.15

ВИНИТИ 341.33.15.23.09.11
Рубрики: РНК
18S-РРНК
ШПИЛЬКА-17
ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
СРАВНЕНИЕ
НЕМАТОДЫ
RHABDITIDA
STRONGYLIDA

Доп.точки доступа:
Aleshin, Vladimir V.; Kedrova, Olga S.; Milyutina, Irina A.; Vladychenskaya, Natalia S.; Petrov, Nikolai B.

1-20 21-40 41-45

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска