Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ<.>)
Общее количество найденных документов : 166
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.02-04Б1.062

   

    Open reading frames in a 4556 nucleotide sequence within MDV-1 BamHI-D DNA fragment: Evidence for splicing of mRNA from a new viral glycoprotein gene [Text] / Yechiel Becker [et al.] // Virus Genes. - 1994. - Vol. 8, N 3. - P55-69 . - ISSN 0920-8569
Перевод заглавия: Открытая рамка считывания в фрагменте ДНК BamHI-D (4556 нукл.) вируса болезни Марека типа 1: доказательство сплайсинга мРНК из гена нового вирусного гликопротеина
Аннотация: Определили нуклеотидную последовательность (нукл. ПС) фрагмента ВамНI D ДНК вируса болезни Марека типа 1 (ВБМ-I) из 4556 нукл. (приведена распечатка). Проанализировали на компьютере расположение открытых рамок считывания (ОРС) в этом фрагменте. Идентифицировали 19 предполагаемых ОРС, к-рые кодируют от 37 аминокислот (ОРС-1а) до 684-х. (ОРС-1). Изучили св-ва 4-х ОРС (1а, 1,2 и 3), а также 2 транскриптов РНК: :РНК-предшественника и его расшепленной формы, к-рые транскрибируются с промотора на 5'-конце ОРС-1а. Расщепление РНК происходило в области нукл. 71. Считают ОСР-1 и 1а интронами нового гена гликопротеина ВБМ-1. Содержащий ОРС-1 фрагмент ДНК экспрессировался преходяще в клетках COS-1. Полученный т. обр. белок взаимодействовал с моноклональными антителами против антигена В ВБМ-1. Гены, гомологичные ОРС-1, обнаружены в геномах ВБМ-2 и 3, к-рые используется, как вакцинные. ОРС-2 кодировала белок из 333 аминокислот, к-рый начинается в U[1] и заканчивается в TR[1], до места начала репликации. ОРС-3 кодирует полипептид из 155 аминокислот, гомологичный частично фосфопротеину рр31, к-рый кодируется фрагментом ВамНIH. 65 N-концевых аминокислот были идентичны. Дополнительные участки гомологии были гидрофобными аминокислотами. Израиль, Dep. Molec. Virol. Fac. of Med., Hebrew Univ. of Jerusalem, Jerusalem. Библ. 37.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС БОЛЕЗНИ МАРЕКА
ДНК ВИРУСНАЯ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ


Доп.точки доступа:
Becker, Yechiel; Asher, Yael; Tabor, Eynat; Davidson, Irit; Malkinson, Mertyn

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.08-04Б1.187

    Boldogkoi, Zsolt.

    A novel explanation for the existence of open reading frames on latency-associated transcripts of alphaherpesviruses [Text] / Zsolt Boldogkoi, Janos Murvai // Virus Genes. - 1994. - Vol. 9, N 1. - P47-51 . - ISSN 0920-8569
Перевод заглавия: Новое объяснение существования открытых рамок считывания в ассоциированных с латентностью транскриптах альфагерпесвирусов
Аннотация: Альфагерпесвирусы экспрессируют ассоциированные с латентностью транскрипты LAT с антисмысловой нити ДНК предранних генов IE. Высказывалось предположение, что LAT, содержащие длинные открытые рамки считывания (ОРС), могут транслироваться в белковые продукты. Показано, что для нек-рых герпесвирусных ДНК характерно преобладание ГЦ в третьем положении кодонов, вследствие чего вероятность появления стоп-кодонов в 2 из 6 потенциальных рамок считывания очень низка. Области, не содержащие стоп-кодонов, часто начинаются с кодона АТГ и представляют собой длинные ОРС. Это позволяет предположить, что присутствие в LAT длинных ОРС вовсе не означает, что эти ОРС действительно транслируются. Венгрия, Agricultural Biotechnol. Center, Inst. for Biochem. and Protein Research, Godolo. Библ. 16
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: АЛЬФАГЕРПЕСВИРУСЫ
ЛАТЕНТНОСТЬ

ТРАНСКРИПТЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ РОЛЬ


Доп.точки доступа:
Murvai, Janos

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.12-04Б1.145

    Lagunoff, Michael.

    Expression of a herpes simplex virus 1 open reading frame antisense to the 'гамма'[1]34.5 gene and transcribed by an RNA 3' coterminal with the unspliced latency-associated transcript [Text] / Michael Lagunoff, Bernard Roizman // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 9. - P6021-6028 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Экспрессия открытой рамки считывания вируса простого герпеса, антисмысловой по отношению к гену 'гамма'[1]34.5 и транскрибируемой в РНК, имеющую общий 3'-конец с несплайсированным ассоциированным с латентностью транскриптом
Аннотация: Сенсорные нейроны, несущие латентный вирус простого герпеса типа 1 (ВПГ-1), экспрессируют РНК ВПГ-1, принадлежащие одной или нескольким транскрипционным единицам в инвертированых повторах (ИП), фланкирующих область U[L], но терминируются в ИП, фланкирующих U[S]. Эти транскрипты обнаруживаются и в продуктивно зараженных ВПГ-1 клетках. В домене самого длинного из известных несплайсированных транскриптов идентифицировали 16 потенциальных открытых рамок считывания (ОРС) длиной более 50 кодонов. 5 ОРС изучены методом встраивания последовательности, к-рая кодирует эпитоп для моноклонального антитела, реагирующего с белком цитомегаловируса человека. Найдено, что ОРС Р, совпадающая с геном 'гамма'[1] 34.5, но являющаяся антисмысловой по отношению к нему, экспрессируется только в условиях, когда нефункционален белок ICP4. Вторая вырожденная последовательность, кодирующая тот же эпитоп, встроена в другой сайт ОРС Р. Белок, экспрессированный ОРС Р с 2 вставками, мигрирует более медленно, чем белок с одной вставкой. Это указывает на экспрессию ОРС Р. США, M. B. Kovler Virol. Oncology Lab., Univ. of Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 49
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
НЕСКЛАЙСИРОВАННЫЕ ТРАНСКРИПТЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ЭКСПРЕССИЯ


Доп.точки доступа:
Roizman, Bernard

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.12-04Б1.349

    Fareed, Moin U.

    Two open reading frames (ORF1 and ORF2) within the 2.0-kilobase latency-associated transcript of herpes simplex virus type 1 are not essential for reactivation from latency [Text] / Moin U. Fareed, Jordan G. Spivack // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 12. - P8071-8081 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Две открытые рамки считывания (ORF1 и ORF2) в составе ассоциированного с латенцией транскрипта длиной 2,0 тыс. оснований вируса простого герпеса типа 1 не являются необходимыми для реактивации из состояния латенции
Аннотация: Изучали роль ассоциированных с латенцией транскриптов вируса простого герпеса в реактивации из состояния латенции. С помощью делеционного и инсерционного анализа показано, две открытые рамки считывания (ORF1 и ORF2) в составе ассоциированного с латенцией транскрипта длиной 2,0 тыс. оснований не являются необходимыми для реактивации из состояния латенции. США, Wistar Inst., Philadelphia, PA 19104. Библ. 72
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.09
Рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
ЛАТЕНЦИЯ

РЕАКТИВАЦИЯ

ТРАНСКРИПТЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

НЕСУЩЕСТВЕННОСТЬ


Доп.точки доступа:
Spivack, Jordan G.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.88

    Cohen, Jeffrey I.

    Varicella-zoster virus open reading frame 1 encodes a membrane protein that is dispensable for growth of VZV in vitro [Text] / Jeffrey I. Cohen, Karen E. Seidel // Virology. - 1995. - Vol. 206, N 2. - P835-842 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Открытая рамка считывания 1 (ОРС1) вируса ветряной оспы-герпеса зостер (ВВОГЗ) кодирует мембранный белок, несущественный для размножения ВВОГЗ in vitro
Аннотация: ВВОГЗ кодирует 69 ОРС, 5 из к-рых не имеют гомологов у вируса герпеса простого типа 1. Одна из 5, ОРС1, несет информацию для кодирования белка в 108 аминокислот. Идентифицирована РНК в 470 н., соответствующая ОРС1. Для выяснения, кодирует ли ОРС1 какой-либо белок в действительности, после 9-го кодона в ОРС1 был встроен "в рамку" участок ДНК, кодирующий эпитоп в 11 аминокислот. Несущий эпитоп рекомбинантный вирус экспрессировал белок, к-рый преципитировался моноклональными телами к этому эпитопу. Белок ОРС1 детектирован в мембране инфицированных клеток. Размер белка ОРС1, экспрессированного в инфицированных ВВОГЗ клетках, был несколько больше размера белка, экспрессируемого при трансляции in vitro, т. е. в инфицированной клетке белок может подвергаться пострансляционной модификации. Введение стоп-кодона непосредственно перед эпитопом в гене ОРС1 приводило к получению рекомбинантного вируса, не экспрессирующего белок ОРС1, однако не ингибировало размножение вируса в клеточной культуре. Т. обр., ОРС1 кодирует белок, к-рый локализуется в мембране ВВОГЗ-инфицированных клеток и несущественен для размножения вируса in vitro. США, Med. Virol. Sec., Lab. of Clin. Investigation, National Inst. of Allergy and Infec. Dis., National Inst. of Health, Bethesda, MD 20892. Ил. 6. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС ВЕТРЯНОЙ ОСПЫ-ГЕРПЕСА ЗОСТЕР
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

РЕКОМБИНАНТНЫЕ БЕЛКИ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

ФУНКЦИИ

КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК


Доп.точки доступа:
Seidel, Karen E.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 96.06-04И2.45

   

    An amplified DNA element in Leishmania encodes potential integral membrane and nucleotide-binding proteins [Text] / Peter J. Myler [et al.] // Mol. and Biochem. Parasitol. - 1994. - Vol. 66, N 1. - P11-20 . - ISSN 0166-6851
Перевод заглавия: Амплифицированный элемент ДНК Leishmania кодирует потенциальные интегральный мембранный и нуклеотид-связывающий белки
Аннотация: Различные амплифицированные ДНК Leishmania, существующие в виде кольцевых или небольших линейных хромосом, ассоциированы, как правило, с возникновением лекарственной устойчивости. В то же время одна из амплифицированных ДНК 'ЭКВИВ'27.5 т. п. н., названная LD1, присутствует в изоляте L. infantum MHOM/BL/67/ITMAP263 и является частью его многокопийной эписомы. В проанализированном фрагменте LD1, включающем 7873 п. н., выявили 6 рамок считывания (ORF) длиной 225 н. на одной нити и 13 - на др., 4 из этих ORF по своим структурным характеристикам потенциально способны кодировать белковые продукты. Каждая из белок-кодирующих ORF экспрессируется. В популяции РНК найдены стабильные транскрипты, их содержание в различных штаммах пропорционально числу LD1. одна из ORF кодирует продукт с 10-12 потенциальными трансмембранными доменами, в др. продукте присутствует мотив АТФ/ГТФ-связывающего сайта. Обсуждают белок-кодирующий потенциал LD1. США, Seattle Biomed. Res. Inst., Seattle, WA 98109-1651. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.23.15.13.07.11.17
Рубрики: ДНК
ЭЛЕМЕНТ LD1

АМПЛИФИЦИРОВАННЫЙ

ЭПИСОМНЫЙ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

БЕЛОК

ИНТЕГРАЛЬНЫЙ МЕМБРАННЫЙ

НУКЛЕОТИД-СВЯЗЫВАЮЩИЙ

LEISCHMANIA

ЛЕКАРСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ


Доп.точки доступа:
Myler, Peter J.; Lodes, Michael J.; Merlin, Gilles; Vos, Theo de; Stuart, Kenneth D.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.09-04Б1.100

   

    Sequence comparison of open reading frames 2 to 5 of low high virulence United States isolates of porcine reproductive and respiratory syndrome virus [Text] / Xiang-Jin Meng [et al.] // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 12. - P3181-3188 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Сравнение последовательностей открытых рамок считывания 2-5 низко- и высоковирулентных изолятов из США вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней
Аннотация: Определены последовательности открытых рамок считывания (ОРС) 2-5 пяти изолятов различной вирулентности вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней (РРСС) из США и сравнены с известными последовательностями других изолятов этого вируса. Идентичность аминокислотных последовательностей между семью американскими изолятами составляла 91-99% для ОРС 2, 86-98% для ОРС 3, 92-99% для ОРС 4 и 88-97% для ОРС 5. Низковирулентный американский изолят обладал наибольшей вариабельностью в ОРС 2-4 по сравнению с другими американскими изолятами. Внутри главного оболочечного гликопротеина обнаружен гипервариабельный участок с антигенным потенциалом. Филогенетический анализ ОРС 2-5 выявил существование по крайней мере трех минорных генотипов внутри основного американского генотипа. Низковирулентный американский изолят образует ветвь, отличающуюся от других американских изолятов. США, Vet. Med. Res., Iowa State Univ., 1802 Elwood Drive, Ames, IA 50011. Библ. 20
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС РЕПРОДУКТИВНО-РЕСПИРАТОРНОГО СИНДРОМА СВИНЕЙ
ИЗОЛЯТЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ


Доп.точки доступа:
Meng, Xiang-Jin; Paul, Prem S.; Halbur, Patrick G.; Morozov, Igor

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.402

    Hemert, F. J.van

    The tendency of lentiviral open reading frames to become A-rich: Constraints imposed by viral genome organization and cellular tRNA availability [Text] / F. J.van Hemert, B. Berkhout // J. Mol. Evol. - 1995. - Vol. 41, N 3. - P132-140 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Тенденция открытых рамок считывания лентивирусов становиться А-богатыми: ограничения, налагаемые организацией вирусного генома и доступностью клеточных тРНК
Аннотация: В геномах ВИЧ-1 и др. лентивирусов (ЛВ) 40% остатков в РНК составляют остатки А. Повышенное содержание А соответствует типичному использованию синонимических кодонов всеми членами семейства ЛВ и спумаретровирусами человека, но не др. ретровирусами (типа Т-лимфотропных вирусов человека типов I и II). Изучено предпочитание А во всех группах кодонов и во всех открытых рамках считывания (ОРС) нескольких ЛВ. Обнаружена обратная зависимость между степенью кодонового сдвига и скоростью трансляции индивидуальных ОРС. Сдвиг в сторону А-богатых кодонов выражен в генах pol сильнее, чем в генах gag. Т. к. белка Gag образуется в 20 раз больше, чем белка pol, из-за редкого рибосомного сдвига рамки при трансляции мРНК gag-pol, то можно предположить, что доступность аминоацил-тРНК в клетке хозяина ограничивает предпочтение А-богатых кодонов у ЛВ. Остатки А реже встречаются в областях генов ЛВ, кодирующих несколько ф-ций: в перекрывающихся ОРС (tat-rev-env) и в генах, перекрывающихся с регуляторными областями (nef-LTR). Построено филогенетическое дерево использования кодонов у ДВ. Нидерланды, Dep. Anatomy and Embryol., Acad. Med. Ctr, Univ. Amsterdam, 1100 DE Amsterdam. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ЛЕНТИВИРУСЫ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ОСТАТКИ A

ОБОГАЩЕНИЕ

ТРАНСЛЯЦИЯ

ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ

ОРГАНИЗАЦИЯ

РНК ТРАНСПОРТНЫЕ

ДОСТУПНОСТЬ

ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА

ФИЛОГЕНИЯ

КОДОНЫ


Доп.точки доступа:
Berkhout, B.

9.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 96.12-04Н1.373

   

    Bovine leukemia virus as a model for the human T-cell leukemia viruses: In vivo attenuation by deletion of R3 and G4 open reading frames [Text] : [Rapp.] 159 Reun. Soc. belge biochim. et biol. mol., 11 mars, 1995 / L. Willems [et al.] // Arch. Physiol. and Biochem. - 1995. - Vol. 103, N 2. - P31 . - ISSN 1381-3455
Перевод заглавия: Вирус лейкоза крупного рогатого скота как модель вирусов T-клеточного лейкоза человека: аттенюация in vivo делецией открытых рамок считывания R3 и G4
Аннотация: При инъекции овцам вирус лейкоза крупного рогатого скота (ВЛКРС) вызывает трансформацию B-лимфоцитов. Делеции альтернативных открытых рамок считывания (ОРС) R3 и G4 у инфекционного и онкогенного штамма ВЛКРС значительно ухудшают его размножение in vivo. Эти данные показали, что ОРС R3 и G4 нужны для поддержания высокой вирусной нагрузки во время персистентной инфекции in vivo. Бельгия, Fac. Agronomy, B5030 Gembloux
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.21.11.07.07
Рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
ГЕНЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

R3

G4

ДЕЛЕТИРОВАНННЫЕ ФОРМЫ

ФУНКЦИИ


Доп.точки доступа:
Willems, L.; Kerkhofs, P.; Dequiedt, F.; Portetelle, D.; Mammerickx, M.; Burny, A.; Kettmann, R.

10.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI05) 97.01-04И8.484

   

    Bovine leukemia virus as a model for the human T-cell leukemia viruses: In vivo attenuation by deletion of R3 and G4 open reading frames [Text] : [Rapp.] 159 Reun. Soc. belge biochim. et biol. mol., 11 mars, 1995 / L. Willems [et al.] // Arch. Physiol. and Biochem. - 1995. - Vol. 103, N 2. - P31 . - ISSN 1381-3455
Перевод заглавия: Вирус лейкоза крупного рогатого скота как модель вирусов T-клеточного лейкоза человека: аттенюация in vivo делецией открытых рамок считывания R3 и G4
Аннотация: При инъекции овцам вирус лейкоза крупного рогатого скота (ВЛКРС) вызывает трансформацию B-лимфоцитов. Делеции альтернативных открытых рамок считывания (ОРС) R3 и G4 у инфекционного и онкогенного штамма ВЛКРС значительно ухудшают его размножение in vivo. Эти данные показали, что ОРС R3 и G4 нужны для поддержания высокой вирусной нагрузки во время персистентной инфекции in vivo. Бельгия, Fac. Agronomy, B5030 Gembloux
ГРНТИ  
ВИНИТИ 681.03.05.21.02
Рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
ГЕНЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

R3

G4

ДЕЛЕТИРОВАНННЫЕ ФОРМЫ

ФУНКЦИИ


Доп.точки доступа:
Willems, L.; Kerkhofs, P.; Dequiedt, F.; Portetelle, D.; Mammerickx, M.; Burny, A.; Kettmann, R.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.01-04Б1.65

   

    Human papillomavirus type 16 (HPV 16) gene expression: Specific probes generation of late open reading frames (ORFs) expression [Text] : [Abstr.] Miami Bio/Technol. Winter Symp. "Adv. Gene Technol.: Protein Eng. and Struct. Biol.", Miami, Fla, Febr. 4-9, 1995 / M. M. Ennaij [et al.] // Protein Eng. - 1995. - Vol. 8, Suppl. - P6 . - ISSN 0269-2139
Перевод заглавия: Экспрессия генов вируса папилломы человека типа 16 (ВПЧ-16): получение специфических зондов для обнаружения экспрессии поздних открытых рамок считывания (ОРС)
Аннотация: Поздние ОРС ВПЧ-16 амплифицировали методом ПЦР, клонировали на плазмиде pUC18 и субклонировали на поокариотическом (pET11) и эукариотическом (pMam neo luc) экспрессионных векторах. Клонирование поздние ОРС ВПЧ-16 можно использовать в качестве зондов для ранней диагностики заражения ВПЧ-16. Канада, Nat. Res. Council, Ottawa, Ontario, K1A OR6. Библ. 8
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.05.39
Рубрики: ВИРУС ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА
ТИП 16

ГЕНЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ПОЗДНИЕ

КЛОНИРОВАНИЕ

РАННЯЯ ДИАГНОСТИКА ЗАРАЖЕНИЯ


Доп.точки доступа:
Ennaij, M.M.; Arella, M.; Belbarka, L.; Merzouki, A.; Phipps, J.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.06-04Б1.75

   

    Identification of a ribosomal frameshift in Leishmania RNA virus 1-4 [Text] / Sang Eun Lee [et al.] // J. Biochem. - 1996. - Vol. 120, N 1. - P22-25 . - ISSN 0021-924X
Перевод заглавия: Идентификация рибосомного сдвига рамки у содержащего РНК вируса 1-4 Leishmania
Аннотация: У вируса 1-4 Leishmania открытые рамки считывания (ОРС) 2 и 3 кодируют соотв. главный капсидный белок с мол. м. 82 кД (I) и РНК-зависимую РНК-полимеразу с мол. м. 98 кД (II) и перекрываются на участке длиной 71 н. Отсутствие у ОРС3 консенсусного сайта инициации трансляции позволяет предположить, что II синтезируется в виде составного белка I (III), имеющего мол. м. 180 кД, с II. Доказано, что III синтезируется по механизму рибосомного сдвига рамки (РСР). С использованием трансляции in vitro и антисыворотки к II показано, что участок перекрывания ОРС2 и ОРС3 длиной 71 н. расположен в области, способствующей РСР. Компьютерный анализ предполагаемой области РСР обнаружил потенциальную псевдоузловую структуру, расположенную на участке перекрывания длиной 71 н. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУС 1-4
LEISHMANIA

БЕЛОК

КАПСИДНЫЙ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

РНК-ЗАВИСИМАЯ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

РИБОСОМНЫЙ СДВИГ РАМКИ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Lee, Sang Eun; Suh, Jae Myoung; Scheffter, Scott; Patterson, Jean L.; Chung, In Kwon

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.06-04Б1.98

    Rho, Jaerang.

    Transforming activities of human papillomavirus type 59 E5, E6 and E7 open reading frames in mouse C127 cells [Text] / Jaerang Rho, Viliers Ethel-Michele de, Joonho Choe // Virus Res. - 1996. - Vol. 44, N 1. - P57-65 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Трансформирующие активности открытых рамок считывания E5, E6 и E7 папилломавируса человека типа 59 в мышиных клетках C127
Аннотация: Геном папилломавируса человека типа 59 (ВПЧ-59) состоит из 7896 нукл. Ранее была определена его первичная структура. ВПЧ-59 обладает наибольшей гомологией с ВПЧ-18 (71%). Сконструировали серию плазмид, экспрессирующих различные открытые рамки считывания (ОРС) ВПЧ-59. Изучали трансформирующую активность этих ОРС, трансфицируя мышиные клетки C127 рекомбинантными плазмидами pRc, содержащими промотор цитомегаловируса и экспрессирующими ОРС E5, E6 и E7 ВПЧ-59. Эти ОРС могли независимо трансформировать клетки C127 в присутствии Г418, хотя полногеномные ДНК ВПЧ-59 не индуцировали формирование фокусов. Наибольшей трансформирующей активностью обладала ОРС E7, наименьшей - E5. Трансформированные E5, E6 и E7 клетки становились перевиваемыми и формировали колонии в полужидком агаре. Присутствие в трансформированных клетках ОРС ДНК ВПЧ-59 доказывалось методами полимеразной цепной реакции и блот-гибридизации по Соузерну. Южная Корея, Dep. of Biol. Sci., Korea Advanced Inst. of Sci. and Technol., Taejon 305-701. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ПАПИЛЛОМАВИРУСЫ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ТРАНСФОРМИРУЮЩАЯ АКТИВНОСТЬ


Доп.точки доступа:
de, Viliers Ethel-Michele; Choe, Joonho

14.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 97.06-04Н1.335

    Rho, Jaerang.

    Transforming activities of human papillomavirus type 59 E5, E6 and E7 open reading frames in mouse C127 cells [Text] / Jaerang Rho, Viliers Ethel-Michele de, Joonho Choe // Virus Res. - 1996. - Vol. 44, N 1. - P57-65 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Трансформирующие активности открытых рамок считывания E5, E6 и E7 папилломавируса человека типа 59 в мышиных клетках C127
Аннотация: Геном папилломавируса человека типа 59 (ВПЧ-59) состоит из 7896 нукл. Ранее была определена его первичная структура. ВПЧ-59 обладает наибольшей гомологией с ВПЧ-18 (71%). Сконструировали серию плазмид, экспрессирующих различные открытые рамки считывания (ОРС) ВПЧ-59. Изучали трансформирующую активность этих ОРС, трансфицируя мышиные клетки C127 рекомбинантными плазмидами pRc, содержащими промотор цитомегаловируса и экспрессирующими ОРС E5, E6 и E7 ВПЧ-59. Эти ОРС могли независимо трансформировать клетки C127 в присутствии Г418, хотя полногеномные ДНК ВПЧ-59 не индуцировали формирование фокусов. Наибольшей трансформирующей активностью обладала ОРС E7, наименьшей - E5. Трансформированные E5, E6 и E7 клетки становились перевиваемыми и формировали колонии в полужидком агаре. Присутствие в трансформированных клетках ОРС ДНК ВПЧ-59 доказывалось методами полимеразной цепной реакции и блот-гибридизации по Соузерну. Южная Корея, Dep. of Biol. Sci., Korea Advanced Inst. of Sci. and Technol., Taejon 305-701. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.21.11.09.07
Рубрики: ПАПИЛЛОМАВИРУСЫ
ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ТРАНСФОРМИРУЮЩАЯ АКТИВНОСТЬ


Доп.точки доступа:
de, Viliers Ethel-Michele; Choe, Joonho

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.08-04Б1.261

   

    Homologies and internal repeats in the ORFs of bacteriophage T4 [Text] / E. Kutter [et al.] // 15th Int. CODATA Conf. "Sci. Data Age Networking: Their Use Glob. Prosper. and Better Human Life", Tsukuba, 29 Sept.-3 Oct., 1996. - Tsukuba, 1996. - P76
Перевод заглавия: Гомологии и внутренние повторы в ORF бактериофага Т4
Аннотация: Для уточнения функций имеющихся у фага Т4 148 неидентифицированных рамок считывания проведен поиск гомологий в открытых рамках считывания (ORFs), основанный на методе расчета слабой гомологии со структурными подобиями. Определены значительные подобия между ORFs и внутренними повторами. Предполагаемая вторичная структура представлена для белков Т4. Сделана попытка классифицировать эти белки с точки зрения общего структурного лейтмотива
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ Т4

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ГОМОЛОГИИ

ВНУТРЕННИЕ ПОВТОРЫ


Доп.точки доступа:
Kutter, E.; Arisaka, F.; Tsugita, A.; Kunisawa, T.; Miyazaki, K.; Batts, D.; Nishikawa, K.

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.220

   

    Organizational characteristics and information content of an archaeal genome: 156 kb of sequence from Sulfolobus solfataricus P2 [Text] / C. W. Sensen [et al.] // Mol. Microbiol. - 1996. - Vol. 22, N 1. - P175-191 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Организационные характеристики и информационное содержание генома архебактерий: последовательность 156 т. п. н. из Sulfolobus solfataricus P2
Аннотация: Размер генома термоацидофильной архебактерии Sulfolobus solfaricus P2 составляет 3 млн.п.н. Получили космидную клонотеку генов этой бактерии, отобрали перекрывающиеся клоны, к-рые субклонировали в плазмидном векторе pUC18 и секвенировали. Выделили 2 непрерывные последовательности (ПС) размерами 100389 и 56105 п. н. В этих ПС обнаружили 163 открытые рамки считывания, составляющие предположительно 26-29 оперонов. С наибольшей вероятностью идентифицированы 56 открытых рамок считывания. К ним относятся кластеры потенциально кодирующие белки биосинтеза гликогена, окислительного декарбоксилирования пирувата, АТФ-зависимого мембранного транспорта, биосинтеза изопрена, белки аппарата трансляции и рибосомные белки. Перед большинством открытых рамок считывания обнаружены предполагаемые промоторы. 30% сильных и средних промоторов могут, по-видимому, инициировать транскрипцию со стартового кодона или в пределах предшествующих 10 п. н., что свидетельствует о наличии инициирующего контакта между мРНК и рибосомой, не характерного для большинства генов эубактерий. При анализе 15 терминаторов обнаружен новый терминаторный мотив. Секвенированные ПС отличаются по плотности открытых рамок считывания, наличию IS-элементов и повторяющихся ПС. Помимо известного ISC1217 обнаружены 5 новых IS-элементов, 4 класса длинных повторов и множество коротких несовершенных повторов. Канада, Can. Inst. Advan. Res., Prog. Evol. Biol., 1411 Oxford Str., Halifax, Nova Scotia B3H 4H7. Библ. 90
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ АРХЕБАКТЕРИАЛЬНЫЙ
ФРАГМЕНТ 156 Т. П. Н.

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ

SULFOLOBUS SOLFATARICUS P2 (BACT.)


Доп.точки доступа:
Sensen, C.W.; Klenk, H.-P.; Singh, R.K.; Allard, G.; Chan, C.C.-Y.; Liu, Q.Y.; Penny, S.L.; Young, F.; Schenk, M.E.; Gaasterland, T.; Doolittle, W.F.; Ragan, M.A.; Charlebois, R.L.

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 98.01-04Б4.91

   

    The Bacillus subtilis clpC operon encodes DNA repair and competence proteins [Text] / Elke Kruger [et al.] // Microbiology. - 1997. - Vol. 143, N 4. - P1309-1316 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Оперон clpC Bacillus subtilis кодирует белки репарации ДНК и компетентности
Аннотация: Белок ClpC Bacillus subtilis, контролирующий экспрессию генов компетентности и выживаемости в стрессовых условиях, кодируется 4-ым геном в опероне из 6 генов. Продукт orf1 содержит мотив спираль-поворот-спираль, но не похож на известные белки. Ген orf2 кодирует белок с мотивом цинкового пальца (МЦП), а ген orf3 - белок, похожий на аргининовые киназы. Продукт orf5 содержит МЦП и домен связывания АТФ и очень похож на продукт гена sms Escherichia coli. Штамм с разрушением гена orf5 имеет повышенную чувствительность к метилметансульфонату и пониженную способность к генетической рекомбинации. Ген orf6 кодирует белок с ограниченной гомологией в C-концевой части с продуктом гена comEA B. subtilis и с эксцинуклеазой UvrC репарации ДНК. Инактивация orf5 значительно понижает уровень трансформации всеми типами ДНК. Мутации, влияющие на orf5 или orf6, понижают устойчивость к УФ-облучению в стационарной фазе, так что эти белки участвуют в развитии неспецифич. устойчивости к УФ-свету в стационарной фазе. Германия, Inst. fur Mikrobiol. und Molekular Biol., Ernst-Moritz. Arndt Univ., D-17487 Greifswald. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН БЕЛКОВ РЕПАРАЦИИ И КОМПЕТЕНТНОСТИ CLPC

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

СТРУКТУРА

УСТОЙЧИВОСТЬ

УФ

BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА


Доп.точки доступа:
Kruger, Elke; Msadek, Tarek; Ohlmeier, Steffen; Hecker, Michael

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 98.04-04И8.258

   

    Nucleotide sequences of open reading frames 1,24 and 71 of an attenuated equine herpesvirus-1 [Text] / Rikio Kirisawa [et al.] // J. Equine Sci. - 1996. - Vol. 7, N 4. - P79-87 . - ISSN 1340-3516
Перевод заглавия: Нуклеотидные последовательности открытых рамок считывания 1, 24 и 71 аттенуированного лошадиного герпесвируса 1
Аннотация: Исследовали нуклеотидную последовательность трех открытых рамок считывания (ОРС) - 1, 24 и 71 аттенуированного лошадиного герпесвируса ВК 243 и его родительского вирулентного штамма НН1. Показано, что вставка двух копий повторяющихся элементов размером в 299 п. о. в ОРС-1 приводила к образованию двух транслируемых областей, кодирующих 59 аминокислот, обозначенных как ОРС 1-1. Выявлено наличие в составе ОРС 24 и 71 различного количества копий повторных последовательностей, не влияющих на считывание обеих ОРС. Показано также наличие в ОРС 71 двух точечных мутаций, к-рые влияют на аминокислотные последовательности. Япония, Dep. of Vet. Microbiol., Fac. of Vet. Med., Rakuno Gakuen Univ., Ebetsu, Hokkaido 069. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.23.59.02.25
Рубрики: ГЕРПЕСВИРУС ЛОШАДЕЙ
АТТЕНУИРОВАННЫЕ ШТАММЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Kirisawa, Rikio; Kobayashi, Tsutomu; Kawakami, Yoshimi; Iwai, Hiroshi

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.04-04Б1.306

   

    Nucleotide sequences of open reading frames 1,24 and 71 of an attenuated equine herpesvirus-1 [Text] / Rikio Kirisawa [et al.] // J. Equine Sci. - 1996. - Vol. 7, N 4. - P79-87 . - ISSN 1340-3516
Перевод заглавия: Нуклеотидные последовательности открытых рамок считывания 1, 24 и 71 аттенуированного лошадиного герпесвируса 1
Аннотация: Исследовали нуклеотидную последовательность трех открытых рамок считывания (ОРС) - 1, 24 и 71 аттенуированного лошадиного герпесвируса ВК 243 и его родительского вирулентного штамма НН1. Показано, что вставка двух копий повторяющихся элементов размером в 299 п. о. в ОРС-1 приводила к образованию двух транслируемых областей, кодирующих 59 аминокислот, обозначенных как ОРС 1-1. Выявлено наличие в составе ОРС 24 и 71 различного количества копий повторных последовательностей, не влияющих на считывание обеих ОРС. Показано также наличие в ОРС 71 двух точечных мутаций, к-рые влияют на аминокислотные последовательности. Япония, Dep. of Vet. Microbiol., Fac. of Vet. Med., Rakuno Gakuen Univ., Ebetsu, Hokkaido 069. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.09
Рубрики: ГЕРПЕСВИРУС ЛОШАДЕЙ
АТТЕНУИРОВАННЫЕ ШТАММЫ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Kirisawa, Rikio; Kobayashi, Tsutomu; Kawakami, Yoshimi; Iwai, Hiroshi

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.05-04Б1.73

    Smith, Sharon L.

    Sequence of the 3' end of the simian hemorrhagic fever virus genome [Text] / Sharon L. Smith, Xiaochum Wang, Elmer K. Godeny // Gene. - 1997. - Vol. 191, N 2. - P205-210 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Последовательность 3'-конца генома вируса геморрагической лихорадки обезьян
Аннотация: Клонирована и секвенирована область длиной 6314 н. из 3'-конца генома вируса геморрагической лихорадки обезьян (ВГЛО). Обнаружены 9 целых открытых рамок считывания (ОРС): 2a, 2b, 3, 4, 5, 6, 7, 8 и 9, к-рые кодируют белки с мол. м. 12,2-31,8 кД. На 5'-конце этой области имеется часть ОРС 1b длиной 1590 н., а на 3'-конце - некодирующая область длиной 76 н. и тракт поли(A). По морфологии, порядку генов, организации генома и стратегии репликации ВГЛО следует отнести к р. Arterivirus. Однако, ВГЛО содержит на 3 ОРС больше, чем др. артеривирусы. США, Dep. Vet. Microbiol. and Parasitol., Louisiana St. Univ., Sch. Vet. Med., Baton Rouge, LA 70803. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ГЕМОРРАГИЧЕСКОЙ ЛИХОРАДКИ ОБЕЗЬЯН
3'-ОБЛАСТЬ ГЕНОМА

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ХАРАКТЕРИСТИКА


Доп.точки доступа:
Wang, Xiaochum; Godeny, Elmer K.

 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)