Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ИНТЕГРАЗЫ<.>)
Общее количество найденных документов : 137
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.06-04Б1.047

    Vink, Cornelis.

    Activities of the feline immunodeficiency virus integrase protein produced in Escherichia coli [Text] / Cornelis Vink, Karin H.van der Linden, Ronald H. A. Plasterk // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 3. - P1468-1474
Перевод заглавия: Активность белка интегразы вируса иммунодефицита кошек, продуцируемого в Escherichia coli
Аннотация: Клонирована и экспрессирована в виде гибридного белка в рекомбинантной кишечной палочке интеграза вируса иммунодефицита кошек. Белок активно осуществляет специфическое расщепление конца ДНК и перенос нити ДНК. Высокий уровень активности показан на ДНК гомологичного вируса иммунодефицита кошек, вируса иммунодефицита человека типа 1 и вируса лейкоза мышей Молони. Для осуществления концевого расщепления ДНК фермент связывается с ДНК вблизи ее конца специфической фосфсодиэфирной связью. Нуклеофильность реакции обеспечивается молекулами воды, глицерина или 3'-ОН группами. Нидерланды, The Netherlands Cancer Inst., 1066 СХ Amsterdam.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА КОШЕК
ИНТЕГРАЗЫ

РЕКОМБИНАНТНЫЕ ФЕРМЕНТЫ

КЛОНИРОВАНИЕ

ЭКСПРЕССИЯ

АКТИВНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Linden, Karin H.van der; Plasterk, Ronald H.A.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.08-04Б1.136

    Polard, P.

    Bacterial transposases and retroviral integrases [Text] / P. Polard, M. Chandler // Mol. Microbiol. - 1995. - Vol. 15, N 1. - P13-23 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Бактериальные транспозазы и ретровирусные интегразы
Аннотация: Обзор. Сравнены стратегии транспозиции бактериальных транспозонов и интеграции ДНК ретровирусов и ретротранспозонов, катализируемых соотв. транспоназами (I) и интегразами (II). Стадия встраивания ДНК в обоих процессах является химически идентичной. Это согласуется с наличием у II и многих I гомологич. областей. Сходство I и II наиболее велико в мотивах DDE, образующих часть активного центра I и II. Франция, Molecular Genetics and Microbiol., 31062 Toulouse. Библ. 87
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ТРАНСПОЗАЗЫ

РЕТРОВИРУСНЫЕ ИНТЕГРАЗЫ

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 87


Доп.точки доступа:
Chandler, M.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.09-04Б1.153

    Katzman, Michael.

    Mapping domains of retroviral integrase responsible for viral DNA specificity and target site selection by analysis of chimeras between human immunodeficiency virus type 1 and visna virus integrases [Text] / Michael Katzman, Malgorzata Sudol // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 9. - P5687-5696 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Картирование доменов ретровирусных интеграз, ответственных за специфичность вирусной ДНК и селекцию мишенных сайтов с помощью анализа химер между интегразами вируса иммунодефицита человека и вируса визны
Аннотация: Выделены экспрессированные в бактериальной системе интегразы (I) ВИЧ-1 (IА) и вируса визны (IВ) и изучена их активность с олигонуклеотидными субстратами, соответствующими концам линейных ДНК этих вирусов. Обнаружены различия между I на уровнях процессинга 3'-концов ДНК, переноса нитей и предпочтения мишенных сайтов (МС). Сконструированы 6 химерных I с обменами N-концевыми, центральными или С-концевыми областями между IА и IВ. Все химерные I активны в реакции дезинтеграции, что указывает на сохранение активной конфигурации активным центром в центральной области. Анализ эндонуклеазной активности показал, что N-конец I не вносит вклад в специфичность по отношению к вирусной ДНК. Эта функция определяется центральной или С-концевой областями I. В реакции интеграции вирусной ДНК химерные I не похожи на IА и IВ. Т. обр., селекция МС в реакции, в к-рой роль нуклеофила играют концы вирусной ДНК, зависит от взаимодействия между разными областями I. Однако, в новой реакции, в к-рой глицерин стимулирует опосредованное I расщепление невирусных ДНК, химерные I ведут себя как IА или IВ. В этой неспецифической реакции алкоголиза выбор МС определяется только центральной областью I. США, Dep. of Med., Pennsylvania State Univ. College of Med., Hershey, PA 17033. Библ. 62
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ЛЕНТИВИРУСЫ
ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА

ВИРУС ВИЗНА

ИНТЕГРАЗЫ

ДОМЕНЫ

КАРТИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Sudol, Malgorzata

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.12-04Б1.76

    Rice, Phoebe.

    Retroviral integrases and their cousins [Text] / Phoebe Rice, Robert Craigie, David R. Davies // Curr. Opinion Struct. Biol. - 1996. - Vol. 6, N 1. - P76-83 . - ISSN 0959-440X
Перевод заглавия: Ретровирусные интегразы и их кузины
Аннотация: Работа посвящена структурно-функциональным свойствам интеграз (Ин), кодируемых ретровирусными геномами. Сравнительный анализ последовательностей обнаруживает выраженное сходство между Ин ВИЧ-1 и вируса саркомы птиц, а также - между ретровирусными Ин, Mu-транспозазой и нек-рыми нуклеазами (РНКаза H, RuvC и другие). Эти ферменты расщепляют полинуклеотиды с образованием свободных 3'-OH и 5'-фосфатных групп. Ин и транспозаза обладают также активностью переноса нитей ДНК при рекомбинации. Структурное сходство между полинуклеотид-трансферазами этого суперсем-ва указывает, повидимому, на общие мех-змы их каталитической активности. США, Lab. Mol. Biol., NIDDKD, Bldg 5, NIH, Bethesda, MD 20892-0540. Библ. 65
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ИНТЕГРАЗЫ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

КАТАЛИТИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ

МЕХАНИЗМ

РЕТРОВИРУСЫ


Доп.точки доступа:
Craigie, Robert; Davies, David R.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.04-04Б1.195

   

    Differential inhibition of HIV-1 preintegration complexes and purified integrase protein by small molecules [Text] / Chris M. Farnet [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1996. - Vol. 93, N 18. - P9742-9747 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Дифференциальное ингибирование преинтегративных комплексов ВИЧ-1 и очищенного белка интегразы маленькими молекулами
Аннотация: Сравнено действие ингибиторов in vitro на очищенную интегразу (I) ВИЧ-1 и на субвирусные преинтегративные комплексы (ПИК), выделенные из зараженных ВИЧ-1 лимфоидных клеток. Найдено, что многие из ингибиторов, активных против очищенной I, не действуют на ПИК. С использованием ПИК для первичного скрининга идентифицированы 3 новых антрахиноновых ингибитора (хинализарин, пурпурин и ализарин), к-рые активны по отношению как к I, так и к ПИК. Высказано предположение, что ПИК наиболее хорошо воспроизводит in vitro реакцию интеграции in vivo и годится для идентификации ингибиторов I. США, Infect. Dis. Lab., Salk Inst. Biol. Studies, La Jolla, CA 92037. Библ. 40
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

ПРЕИНТЕГРАТИВНЫЕ КОМПЛЕКСЫ

ИНГИБИРОВАНИЕ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЕ

ИНГИБИТОРЫ

АНТРАХИНОНОВЫЕ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Farnet, Chris M.; Wang, Beibei; Lepford, J.Russell; Bushman, Frederic D.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.05-04Б1.115

    Heuer, Timothy S.

    Mapping features of HIV-1 integrase near selected sites on viral and target DNA molecules in an active enzyme - DNA complex by photo-cross-linking [Text] / Timothy S. Heuer, Patrick O. Brown // Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 35. - P10655-10665 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Картирование признаков интегразы ВИЧ-1 рядом с избранными сайтами молекул вирусной и мишенной ДНК в активном комплексе фермент - ДНК методом фотосшивки
Аннотация: Методом фотосшивки изучены число и природа сайтов связывания с ДНК в интегразе (I) ВИЧ-1. Показано, что контакты I с консервативными элементами на концах вирусной ДНК опосредованы аминокислотными остатками в 2 пептидах (остатки 49-69 и 139-152) в консервативном сердцевинном домене I. Обнаружены также дополнительные сшивки между ДНК ВИЧ-1 и C-концевым доменом связывания с ДНК. Отмечено, что с ДНК сшиваются многочисленные сайты в I, включая пептиды из N-концевого домена цинкового пальца, сердцевинного домена и домена связывания с ДНК. Т. к. I функционирует в форме мультимера, остается определить, какие из специфических контактов находятся в положениях цис или транс относительно активного центра I. США, Dep. Biochem., Stanford Univ. Med. Ctr, Stanford, CA 94305-5428. Библ. 49
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК

КАРТИРОВАНИЕ

МЕТОД ФОТОСШИВКИ


Доп.точки доступа:
Brown, Patrick O.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.41

   

    Disruption of the terminal base pairs of retroviral DNA during integration [Text] / Brian P. Scottoline [et al.] // Genes and Dev. - 1997. - Vol. 11, N 3. - P371-382 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Разрушение концевых пар оснований ретровирусной ДНК во время интеграции
Аннотация: Один активный центр интегразы (I) ВИЧ-1 катализирует 2 разные реакции: процессинг концов (ПК) геномной ДНК и перенос нити. Высказано предположение, что I искажает структуру субстратов ДНК, чтобы приспособить обе реакции к одному активному центру. Обнаружено разрушение спаривания оснований на конце вирусной ДНК во время ПК. Этот этап является обязательной стадией в ПК и происходит после начального связывания конца вирусной ДНК. Потребность в разрушении спаривания оснований может объяснить неспособность I использовать внутренние сайты в молекулах ДНК в качестве вирусных сайтов att. Специфичность I для концов ДНК помогает предотвратить транспозицию интегрированных провирусов. США, Dep. Biochem., Stanford Univ. Med. Sch., Stanford, CA 94305-5428. Библ. 73
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

ДНК

КОНЦЕВЫЕ ПАРЫ ОСНОВАНИЙ

РАЗРУШЕНИЕ


Доп.точки доступа:
Scottoline, Brian P.; Chow, Samson; Ellison, Viola; Brown, Patrick O.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.193

   

    Complementation of integrase function in HIV-1 virions [Text] / Thomas M. Fletcher [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 16. - P5123-5138 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Комплементация функции интегразы в вирионах ВИЧ-1
Аннотация: Для изучения ф-ции интегразы (I) ВИЧ-1 разработана новая экспериментальная система, в к-рой мутантные по I полноразмерные клоны ВИЧ-1 комплементируются в транс-положении составными белками Vpr (II)-I. Показано, что: 1) II-I эффективно упаковываются в вирионы независимо от полипротеина Gag-Pol; 2) II-I, содержащие природный сайт процессинга RT-IN, расщепляются протеазой ВИЧ-1; 3) только расщепленная I эффективно комплементирует дефектные по I мутанты ВИЧ-1, опосредованная II упаковка I восстанавливает ф-ции I у различных дефектных по I мутантов ВИЧ-1, включая мутанты по домену цинкового пальца, каталитической сердцевине и C-концевому домену и мутанты с полной делецией I. При транс-комплементации I вызывает точный процессинг провирусных концов ДНК (5'-TG...CA-3') и вызывает дупликацию 5 п. н. в мишенной ДНК хозяина. Обнаружена внутригенная комплементация между мутантами I, дефектными по разным доменам. Т. обр., впервые доказана мультимеризация I in vivo. США, Dep. Med., Univ. Alabama, Birmingham, AL 35294. Библ. 78
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

ФУНКЦИИ

КОМПЛЕМЕНТАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Fletcher, Thomas M.; Soares, Marcelo A.; McPhearson, Silvia; Hui, Huxiong; Wiskerschen, Mary Ann; Muesing, Mark A.; Shaw, George M.; Leavitt, Andrew D.; Boeke, Jef D.; Hahn, Beatrice H.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.01-04Б1.111

    Bushman, Frederic D.

    Tethering human immunodeficiency virus type 1 preintegration complexes to target DNA promotes integration at nearby sites [Text] / Frederic D. Bushman, Michael D. Miller // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 1. - P458-464 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Прикрепление преинтегративных комплексов вируса иммунодефицита человека типа 1 к мишенной ДНК способствует интеграции в соседние сайты
Аннотация: Сконструирована новая химерная интеграза IN-zif (I) ВИЧ-1 - продукт слияния нормальной интегразы (II) с доменом связывания с ДНК, имеющего мотив цинковых пальцев клеточного белка zif 268 (III). Изучены свойства I в контексте провируса ВИЧ-1. Найдено, что I очень вредна для репликации ВИЧ-1. Однако, вирусы, содержащие I и II одновременно, инфекционны. Из клеток, зараженных такими вирусами, выделены преинтегративные комплексы ВИЧ-1. Найдено, что эти комплексы с повышенной частотой вызывают интеграцию ДНК ВИЧ-1 рядом с сайтами, узнаваемыми III. США, Infect. Disease Lab., Salk Inst. for Biol. Studies, La Jolla, CA 92037. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ПРЕИНТЕГРАТИВНЫЕ КОМПЛЕКСЫ

ПРИКРЕПЛЕНИЕ

ДНК МИШЕННАЯ

ИНТЕГРАЦИЯ

ИНТЕГРАЗЫ


Доп.точки доступа:
Miller, Michael D.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.03-04Б1.140

   

    Lack of infectivity of HIV-1 integrase zinc finger-like domain mutant with morphologically normal maturation [Text] / Tahei Nakamura [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1997. - Vol. 239, N 3. - P715-722 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Отсутствие инфекционности мутанта ВИЧ-1 по похожему на цинковый палец домену интегразы с морфологически нормальным созреванием
Аннотация: Сконструированы мутации, затрагивающие мотив HHCC в домене цинкового пальца на N-конце интегразы (I) ВИЧ-1, и изучено их влияние на инфекционность, адсорбцию и вхождение в мишенные клетки в контексте полноразмерного молекулярного клона ВИЧ-1. У этих мутантов полностью отсутствуют инфекционность и синтез вирусной ДНК in vitro в бесклеточной системе и в мишенных клетках MT-2 и HeLa-CD4-LTR-'бета'-gal. Уровень ассоциированного с клетками белка p24 одинаков при заражении клеток MT-2 ВИЧ дикого типа и мутантами по I. Эти данные показали, что мутации мотива HHCC блокируют репликацию ВИЧ-1 на стадии после проникновения в клетки и до инициации обратной транскрипции (вероятно, на стадии раздевания). Электронная микроскопия показала, что эти мутации не всегда вызывают аномальную морфологию вирионов ВИЧ-1. Япония, Dep. Biodefense and Med. Virol., Kumamoto Univ. Sch. Med., Kumamoto 860. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

ДОМЕН ЦИНКОВОГО ПАЛЬЦА

МОТИВ HHCC

МУТАЦИИ

РЕПЛИКАЦИЯ

ПОДАВЛЕНИЕ

КЛЕТКИ ЛИНИИ MT-2 И HELA-CD4-LTR-'БЕТА'-GAL


Доп.точки доступа:
Nakamura, Tahei; Masuda, Takao; Goto, Toshiyuki; Sano, Kouichi; Nakai, Masuyo; Harada, Shinji

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.05-04Б1.95

   

    Structure of the catalytic domain of avian sarcoma virus integrase with a bound HIV-1 integrase-targeted inhibitor [Text] / Jacek Lubkowski [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 9. - P4831-4836 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Структура каталитического домена интегразы вируса саркомы птиц со связанным ингибитором, адресованным к интегразе ВИЧ-1
Аннотация: Проведен рентгено-кристаллографический анализ структуры каталитического кора интегразы вируса саркомы птиц с разрешением 1,9-2,0 A. Ингибитор Y-3, первоначально выделенный при скрининге ингибиторов интегразы ВИЧ-1, подавляет также активность интегразы вируса саркомы птиц и связывается с ней в области, непосредственно примыкающей к активному центру. При этом Y-3 взаимодействует с гибкой петлей и изменяет конформацию этой петли и аминок-тных остатков активного центра интегразы. США, Macromol. Structure Lab., Adv. Biosci. Lab.-Basic Res. Program, NCI-Frederick Cancer Res., Dev. Ctr., Frederick, MD 21702. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ИНТЕГРАЗА
КАТАЛИТИЧЕСКИЙ ДОМЕН

ИНГИБИТОР ИНТЕГРАЗЫ ВИЧ-1

СВЯЗЫВАНИЕ

КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА

АКТИВНЫЙ ЦЕНТР

ВИРУС САРКОМЫ

ПТИЦЫ


Доп.точки доступа:
Lubkowski, Jacek; Yang, Fan; Alexandratos, Jerry; Wlodawer, Alexander; Zhao, He; Burke, Terrence R.; Neamati, Nouri; Pommier, Yves; Merkel, George; Skalka, Anna Marie

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.06-04Б1.185

   

    Identification of a nucleotide binding site in HIV-1 integrase [Text] / Richard R. Drake [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 8. - P4170-4175 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Идентификация сайтов связывания нуклеотидов в интегразе ВИЧ-1
Аннотация: Известно, что 3'-азидо-3'-тиминидин-5'-монофосфат (I) является ингибитором интегразы (II) ВИЧ-1. Фотоаффинное мечение II аналогом I 3',5'-диазидо-2',3'-дидезоксиуридин-5'-монофосфатом (III) и протеолитическое картирование показали, что сайты фотосшивки расположены в области остатков 153-167 II. Молекулярное моделирование позволило предположить, что III образует сильные водородные связи с остатками лиз в положениях 156, 159 и 160. Мутация этих остатков избирательно уменьшает фотосшивку III. Полученные данные идентифицировали сайт связывания нуклеозидных ингибиторов с II, к-рый, вероятно, является компонентом сайта связывания полинуклеотидов. США, Dep. Biochem. and Mol. Biol., Univ. Arkansas for Med. Sci., Little Rock, AR 72205. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ НУКЛЕОТИДОВ

КАРТИРОВАНИЕ

ИНГИБИТОРЫ

АЗИДОТИМИДИНМОНОФОСФАТ


Доп.точки доступа:
Drake, Richard R.; Neamati, Nouri; Hong, Huixiao; Pilon, Andre A.; Sunthankar, Prasanna; Hume, Steven D.; Milne, George W.A.; Pommier, Yves

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.11-04Б1.48

    Wei, Shui-Qing.

    Footprints on the viral DNA ends in Moloney murine leukemia virus preintegration complexes reflect a specific association with integrase [Text] / Shui-Qing Wei, Kiyoshi Mizuuchi, Robert Craigie // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 18. - P10535-10540 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Футпринты на концах вирусной ДНК в преинтегративных комплексах вируса лейкоза мышей Молони отражают ассоциацию с интегразой
Аннотация: Для изучения нуклеопротеиновой организации преинтегративных комплексов (ПИК) вируса лейкоза мышей Молони (ВЛММ) использован метод ПЦР, опосредованной системой транспоназы фага Mu. Обнаружены области защиты длиной несколько сот п. н. на обоих концах ДНК ВЛММ и усиление на самых концах ДНК. Эти футпринты отражают специфическую ассоциацию интегразы ВЛММ с концами ДНК в функциональных ПИК. В образовании футпринтов на концах ДНК косвенно участвует и фактор BAF - клеточный белок, блокирующий автоинтеграцию ДНК ВЛММ. Способный к репликации мутант ВЛММ с делецией на одном конце ДНК проявляет сильное усиление на расстоянии 20 п. н. от мутантного конца ДНК. Т. обр., сайт усиления находится на фиксированном расстоянии от концов ДНК ВЛММ. Мутация на одном конце вирусной ДНК, делающая ВЛММ неспособным к репликации, устраняет усиление и защиту на концах U3 и U5. Согласно полученным данным перед химической стадией процессинга 3'-концов необходимо функциональное взаимодействие пары функциональных концов вирусной ДНК. США, Lab. Mol. Biol., NIDDKD, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА МЫШЕЙ МОЛОНИ
ПРЕИНТЕГРАТИВНЫЕ КОМПЛЕКСЫ

ИНТЕГРАЗЫ

АССОЦИАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Mizuuchi, Kiyoshi; Craigie, Robert

14.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 99.11-04Н1.385

    Wei, Shui-Qing.

    Footprints on the viral DNA ends in Moloney murine leukemia virus preintegration complexes reflect a specific association with integrase [Text] / Shui-Qing Wei, Kiyoshi Mizuuchi, Robert Craigie // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 18. - P10535-10540 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Футпринты на концах вирусной ДНК в преинтегративных комплексах вируса лейкоза мышей Молони отражают ассоциацию с интегразой
Аннотация: Для изучения нуклеопротеиновой организации преинтегративных комплексов (ПИК) вируса лейкоза мышей Молони (ВЛММ) использован метод ПЦР, опосредованной системой транспоназы фага Mu. Обнаружены области защиты длиной несколько сот п. н. на обоих концах ДНК ВЛММ и усиление на самых концах ДНК. Эти футпринты отражают специфическую ассоциацию интегразы ВЛММ с концами ДНК в функциональных ПИК. В образовании футпринтов на концах ДНК косвенно участвует и фактор BAF - клеточный белок, блокирующий автоинтеграцию ДНК ВЛММ. Способный к репликации мутант ВЛММ с делецией на одном конце ДНК проявляет сильное усиление на расстоянии 20 п. н. от мутантного конца ДНК. Т. обр., сайт усиления находится на фиксированном расстоянии от концов ДНК ВЛММ. Мутация на одном конце вирусной ДНК, делающая ВЛММ неспособным к репликации, устраняет усиление и защиту на концах U3 и U5. Согласно полученным данным перед химической стадией процессинга 3'-концов необходимо функциональное взаимодействие пары функциональных концов вирусной ДНК. США, Lab. Mol. Biol., NIDDKD, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.21.11.07.07
Рубрики: ВИРУС ЛЕЙКОЗА МЫШЕЙ МОЛОНИ
ПРЕИНТЕГРАТИВНЫЕ КОМПЛЕКСЫ

ИНТЕГРАЗЫ

АССОЦИАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Mizuuchi, Kiyoshi; Craigie, Robert

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.01-04Б1.121

    Dorgai, Laszlo.

    Recognition of core binding sites by bacteriophage integrases [Text] / Laszlo Dorgai, Sieghild Sloan, Robert A. Weisberg // J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 277, N 5. - P1059-1070 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Узнавание сердцевидных сайтов связывания интегразами бактериофагов
Аннотация: Интегразы (I) фагов 'лямбда' (IA) и НКО22 (IB) близкородственны, но IA не вызывает рекомбинацию сайтов прикрепления HKO22, и наоборот. Нуклеотиды, ответственные за различие специфичности, расположены в расширенном сердцевинном сайте связывания (РССС). Каждый набор сайтов прикрепления содержит 4 неидеальных повтора РССС, но только 2 (B{'} и С) содержат главные детерминанты специфичности. При замене этих детерминантов одного фага на детерминанты др. фага мутантная последовательность может рекомбинировать под действием IA и IB. Т. обр. детерминанты блокируют рекомбинацию под действием неродственной I. Одинаковые замены нуклеотидов в разных копиях РССС оказывают разное влияние на рекомбинацию, так что I по-разному узнают каждый из РССС. Замена нескольких аминок-тных остатков IA на соотв. остатки IB предотвращают рекомбинацию сайтов att фага 'лямбда'. Этот дефект аллель-специфичным образом супрессируется заменами на нуклеотиды HKO22 в РССС фага 'лямбда'. США, Lab. Mol. Genet., Nat. Inst. Child Hlth. and Human Development, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ИНТЕГРАЗЫ

САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ

УЗНАВАНИЕ

ДНК

РЕКОМБИНАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Sloan, Sieghild; Weisberg, Robert A.

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 00.02-04В2.159

   

    Invading the yeast nucleus: A nuclear localization signal at the C terminus of ty1 integrase is required for transposition in vivo [Text] / Margaret A. Kenna [et al.] // Mol. and Cell. Biol. - 1998. - Vol. 18, N 2. - P1115-1124 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Вторжение в ядро дрожжей: сигнал ядерной локализации на C-конце интегразы Ty1 требуется для транспозиции
Аннотация: Изучен механизм транспорта промежуточных продуктов транспозиции элемента Ty1 Saccharomyces cerevisiae из цитоплазмы, где синтезируется ДНК Ty1, в ядро, где она интегрируется в геном. Интеграза Ty1 (I) имеет на C-конце сигнал ядерной локализации NLS. Полноразмерная I и ее C-концевой фрагмент расположены в ядре. Делеционное картирование показало, что NLS находится в пределах последних 74 остатков I. Мутации в основных сегментах в этой области уменьшают ретротранспозицию Ty1 по меньшей мере в 50 раз. Эти мутанты I е попадают в ядро. Образование вирусоподобных частиц, активность обратной транскриптазы и полная интеграция Ty1 in vitro остаются нормальными, так что дефект in vivo связан с неспособностью мутантов I входить в ядро. США, Dep. Mol. Biol. and Genet., Johns Hopkins Univ. Sch. Med., Baltimore, MD 21205. Библ. 58
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ
TY1

ТРАНСПОЗИЦИЯ В ЯДРО

МЕХАНИЗМ

ИНТЕГРАЗЫ

C-КОНЕЦ

СИГНАЛ ЯДЕРНОЙ ЛОКАЛИЗАЦИИ

УЧАСТИЕ

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Kenna, Margaret A.; Brachmann, Carrie Baker; Devine, Scott E.; Boeke, Jef D.

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.04-04Б1.116

    Bujacz, Grzegorz.

    Binding of different divalent cations to the active site of avian sarcoma virus integrase and thier effects on enzymatic activity [Text] / Grzegorz Bujacz, Jerry Alexandratos, Alexander Wlodawer // J. Biol. Chem. - 1997. - Vol. 272, N 29. - P18161-18168 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Связывание различных двухвалентных катионов с активным центром интегразы вируса саркомы птиц и их влияние на ферментативную активность
Аннотация: Интегразы ретровирусов содержат 2 металл-связывающих домена. N-концевой домен включает мотив цинкового пальца и связывает Zn{2+}, тогда как основной центральный каталитический домен содержит триаду аминок-т, к-рые связывают Mn{2+} или Mg{2+}, необходимые для ферментативной активности. Установлено, что ионы Ca{2+}, Zn{2+} и Cd{2+} также могут связываться с активным центром каталитического домена. Катионы Cd{2+} и Zn{2+} связываются в активном центре, и все остатки триады активного центра (Asp64, Asp121 и Gln157) участвуют в их координации. Ионы Zn{2+} могут служить в качестве кофактора для эндонуклеолитических р-ций, а полинуклеотидилтрансферазные активности сильно нарушаются в присутствии Zn{2+}. Считается, что стадии процессинга и соединения четко различаются по их предпочтению к металлам. США, Macromol. Struct. Lab., NCI-Frederick Canc. Res. and Dev. Ctr., ABL-Basic Res. Program, Frederick, MD 21702. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУСЫ
ВИРУС САРКОМЫ ПТИЦ

ИНТЕГРАЗЫ

АКТИВНОСТЬ

ДВУХВАЛЕНТНЫЕ ИОНЫ


Доп.точки доступа:
Alexandratos, Jerry; Wlodawer, Alexander

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.05-04Б1.63

    Katzman, Michael.

    Mapping viral DNA specificity to the central region of integrase by using functional human immunodeficiency virus type 1/visna virus chimeric proteins [Text] / Michael Katzman, Malgorzata Sudol // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 3. - P1744-1753 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Картирование специфичности вирусной ДНК для центральной области интегразы при использовании функциональных химерных белков из вируса иммунодефицита человека типа 1/вируса висны
Аннотация: Ранее авторы описали конструкцию и анализ первой порции функциональных химерных лентивирусных интеграз, включающих обмен N-концевыми, центральными и C-концевыми областями белков интегразы (Ин) вирусов иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) и висна (ВВ). Получили и очистили новые химерные белки Ин ВИЧ-1/ВВ. Каждый из химерных ферментов функционировал, по крайней мере, в основанном на олигонуклеотиде определении Ин. 3 из 12 химерных белков Ин вызывали специфический процессинг РНК. 9 - катализировали вставку концов вирусной ДНК. 12 - могли аннулировать эти реакции, а 11 - были активны при неспецифическом алкоголизе. За специфичность вирусной ДНК отвечала центральная часть Ин. Отбор участка мишени для неспецифического алкоголиза картировался в центральном домене Ин. Это подтвердило раннее предположение авторов, что эта область может подвергать нуклеофильной атаке невирусную ДНК. Однако, химерные белки обладали способностью к вставке вирусной ДНК в участки, отличающиеся от вставок под действием Ин природного типа. Считают, что первоначально взаимодействия между областями Ин влияют на отбор мишени для интеграции вирусной ДНК. Считают, что первоначально вирусная ДНК связывается неспецифически с C-концом Ин, но центральная каталитическая часть Ин играет ведущую роль как в специфическом узнавании концов вирусной ДНК, так и в позиции ДНК хозяина для интеграции вирусной ДНК. США, Dep. of Med., Sec. of Infect. Dis., Pennsylvania St. Univ. Coll. of Med., The Milton S. Hershey Medical Center, P. O. Box 850, Mail Services H036, Hershey, PA 17033-0850. Библ. 73
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ЛЕНТИВИРУСЫ
ИНТЕГРАЗЫ

ДНК-СПЕЦИФИЧНОСТЬ

КАРТИРОВАНИЕ

ХИМЕРНЫЕ БЕЛКИ


Доп.точки доступа:
Sudol, Malgorzata

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.05-04Б1.64

    Esposito, Dominic.

    Sequence specificity of viral end DNA binding by HIV-1 integrase reveals critical regions for protein-DNA interaction [Text] / Dominic Esposito, Robert Craigie // EMBO Journal. - 1998. - Vol. 17, N 19. - P5832-5843 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Специфичность в отношении последовательности связывания интегразы ВИЧ-1 с концами вирусной ДНК обнаруживает критические области для ДНК-белкового взаимодействия
Аннотация: Для идентификации областей интегразы (I) ВИЧ-1, взаимодействующих со специфическими основаниями в концевой последовательности (КП) LTR, использованы мутационный анализ этих КП, селекция in vitro оптимальных КП и специфические фотосшивки. Обнаружено участие в связывании с терминальной частью КП LTR ВИЧ-1 неупорядоченной петли сердцевины I, особенно остатков Q148 и Y143. Идентифицированы положения в КП LTR, взаимодействующие с C-концевым доменом I, к-рый участвует в стабилизации связывания с ДНК ВИЧ-1. Область с центром на расстоянии 12 п. н. от концов ДНК ВИЧ-1 существенна для связывания I в присутствии Mg{2+}, но не Mn{2+}. Это позволяет предположить, что 2-валентные катионы по-разному влияют на специфичность связывания I, зависящую от последовательности. США, Lab. Mol. Biol., NIDDK, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 56
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ТИП 1

ИНТЕГРАЗЫ

ДЛИННЫЕ КОНЦЕВЫЕ ПОВТОРЫ

ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ


Доп.точки доступа:
Craigie, Robert

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 00.06-04К1.381

    Katzman, Michael.

    Mapping viral DNA specificity to the central region of integrase by using functional human immunodeficiency virus type 1/visna virus chimeric proteins [Text] / Michael Katzman, Malgorzata Sudol // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 3. - P1744-1753 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Картирование специфичности вирусной ДНК для центральной области интегразы при использовании функциональных химерных белков из вируса иммунодефицита человека типа 1/вируса висны
Аннотация: Ранее авторы описали конструкцию и анализ первой порции функциональных химерных лентивирусных интеграз, включающих обмен N-концевыми, центральными и C-концевыми областями белков интегразы (Ин) вирусов иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) и висна (ВВ). Получили и очистили новые химерные белки Ин ВИЧ-1/ВВ. Каждый из химерных ферментов функционировал, по крайней мере, в основанном на олигонуклеотиде определении Ин. 3 из 12 химерных белков Ин вызывали специфический процессинг РНК. 9 - катализировали вставку концов вирусной ДНК. 12 - могли аннулировать эти реакции, а 11 - были активны при неспецифическом алкоголизе. За специфичность вирусной ДНК отвечала центральная часть Ин. Отбор участка мишени для неспецифического алкоголиза картировался в центральном домене Ин. Это подтвердило раннее предположение авторов, что эта область может подвергать нуклеофильной атаке невирусную ДНК. Однако, химерные белки обладали способностью к вставке вирусной ДНК в участки, отличающиеся от вставок под действием Ин природного типа. Считают, что первоначально взаимодействия между областями Ин влияют на отбор мишени для интеграции вирусной ДНК. Считают, что первоначально вирусная ДНК связывается неспецифически с C-концом Ин, но центральная каталитическая часть Ин играет ведущую роль как в специфическом узнавании концов вирусной ДНК, так и в позиции ДНК хозяина для интеграции вирусной ДНК. США, Dep. of Med., Sec. of Infect. Dis., Pennsylvania St. Univ. Coll. of Med., The Milton S. Hershey Medical Center, P. O. Box 850, Mail Services H036, Hershey, PA 17033-0850. Библ. 73
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.41.13.05.09
Рубрики: ЛЕНТИВИРУСЫ
ИНТЕГРАЗЫ

ДНК-СПЕЦИФИЧНОСТЬ

КАРТИРОВАНИЕ

ХИМЕРНЫЕ БЕЛКИ


Доп.точки доступа:
Sudol, Malgorzata

 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)