Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Katayama, Tsutomu$<.>)
Общее количество найденных документов : 19
Показаны документы с 1 по 19
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 96.04-04Б2.150

   

    Isolation and characterization of inhibitory factors of DNA polymerase III holoenzyme from Escherichia coli [Text] / Masakazu Hase [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 1995. - Vol. 130, N 2-3. - P215-220 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Выделение и характеристика ингибиторных факторов холофермента ДНК-полимеразы III из Escherichia coli
Аннотация: В ходе хроматографии на моно-Q в клетках E. coli обнаружены две фракции, к-рые ингибируют активность холофермента ДНК-полимеразы III. Активности ингибиторов инактивировались нагреванием при 100'ГРАДУС'C в течение 10 мин, что указывает на их белковую природу. Эти белки не ингибировали РНК-полимеразу из E. coli. В меньшей степени эти белки ингибировали большой фрагмент (Кленова) ДНК-полимеразы I и ДНК-полимеразы фага T4. Установлено, что это ингибирование не является следствием расщепляющего действия ингибиторов на одно- и двунитевые ДНК. Япония, [Sekimizu K.], Fac. of Pharmaceutical Scie., Kyushu Univ., Fukuoka. Библ. 16
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: ДНК-ПОЛИМЕРАЗА III
ХОЛОФЕРМЕНТ

АКТИВНОСТЬ

ИНГИБИТОРЫ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hase, Masakazu; Mizushima, Tohru; Katayama, Tsutomu; Sekimizu, Kazuhisa

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.63

    Katayama, Tsutomu.

    CedA is a novel Escherichia coli protein that activates the cell division inhibited by chromosomal DNA overreplication [Text] / Tsutomu Katayama, Makoto Takata, Kazuhisa Sekimizu // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 4. - P687-697 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: CedA является новым белком Escherichia coli, который активирует клеточное деление, ингибированное сверхрепликацией хромосомной ДНК
Аннотация: При 30'ГРАДУС' у мутанта dnaAcos наблюдается сверхрепликация хромосомы и образуются филаменты из-за ингибирования образования перегородки, не зависящего от белка SfiA. Выделены 7 многокопийных супрессоров холодочувствительного фенотипа мутанта dnaAcos. Один из них оказался новым геном cedA, к-рый картирован на 38,9-й мин и кодирует белок с мол. м. 12 кД. Многокопийность гена cedA не предотвращает сверхрепликацию ДНК, но стимулирует клеточное деление, в результате чего образуются клетки с аномально большим числом копий хромосомы. Т. обр., уровень экспрессии cedA важен для ингибирования деления клеток dnaAcos при 30'ГРАДУС'. На генетическом фоне dnaA{+} ген cedA также влияет на клеточное деление. Япония, Dep. of Microbiol., Kyushu Univ. Faculty of Pharmaceutical Sci., Fukuoka 812-82. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН CEDA

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНА

УРОВЕНЬ

ВЛИЯНИЕ НА

АКТИВАЦИЯ

КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ

ИНГИБИРОВАНИЕ

СВЕРХРЕПЛИКАЦИЯ

ХРОМОСОМНАЯ ДНК

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Takata, Makoto; Sekimizu, Kazuhisa

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.351

   

    Overinitiation of chromosome replication in the Escherichia coli dnaAcos mutant depends on activation of oriC function by the dam gene product [Text] / Tsutomu Katayama [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 25, N 4. - P661 - 670 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Гиперинициация репликации хромосомы у мутанта dnaAcos Escherichia coli зависит от активации функции oriC продуктом гена dam
Аннотация: Белок DnaA (I) Escherichia coli активен в комплексе с АТФ, но не с АДФ, а мутантный белок DnaAcos нечувствителен к негативной регуляции АДФ. В мутанте dnaAcos при непермиссивной температуре 30'ГРАДУС' наблюдается избыточная репликация хромосомы. Изучены супрессоры мутанта dnaAcos, индуцированные вставками транспозона Tn5. Три супрессора содержат Tn5 в генах aroK или aroB - первых 2 цистронах оперона dam. Комплементация показала, что за супрессию отвечает ген dam. Гиперрепликация хромосомы подавлена у двойного мутанта dnaAcos aroK::Tn5, а у одиночного мутанта dnaA{+} aroK::Tn5 частично ингибирована, инициация репликации хромосомы. Клетки aroK(B)::Tn5 содержат нормальное кол-во I. Супрессия dnaAcos зависит от функции гена SeqA. Эти данные показали, что: 1) активность ДНК-метилазы Dam позитивно регулирует инициацию репликации хромосомы; 2) функция SeqA не заключается в контроле активности I связыванием адениновых нуклеотидов. Япония, Dep. of Microbiol., Kyushu Univ. Faculty of Pharmacentical Sci., Fukuoka 812-82. Библ. 64
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

МЕХАНИЗМ

УЧАСТОК ORI

ORI C

ФУНКЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

ДНК-МЕТИЛАЗА DAM

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Katayama, Tsutomu; Akimitsu, Nobuyoshi; Mizushima, Tohru; Miki, Takeyoshi; Sekimizu, Kazuhisa

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.189

   

    Negative control of DNA replication by hydrolysis of ATP bound DnaA protein, the initiator of chromosomal DNA replication in Escherichia coli [Text] / Tohru Mizushima [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 12. - P3724-3730 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Негативный контроль репликации ДНК гидролизом АТФ, связанного с белком DnaA - инициатором репликации хромосомной ДНК у Escherichia coli
Аннотация: АТФ, связанный с белком DnaA (I) Escherichia coli, медленно гидролизуется, но физиологич. роль гидролиза была неясна. Методом сайт-направленного мутагенеза сконструирован мутант I с заменой глу[204]'-'глн (IA), у к-рого АТФ-азная активность понижена в 3 раза. Мутация не повлияла на сродство к АТФ или АДФ. Мутантный ген dnaA летален в клетках дикого типа, но не в клетках, рост к-рых не зависит от функции oriC. Введение IA в клетки дикого типа вызывает гиперинициацию репликации ДНК. Высказано предположение, что характеристич. АТФ-азная активность I негативно регулирует репликацию хромосомной ДНК. Япония, Faculty of Pharmaceutical Sci., Kynshu Univ., Fukuoka 812-82. Библ. 32
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК

DNAA

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ГИДРОЛИЗ АТФ

МЕХАНИЗМ

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Mizushima, Tohru; Nishida, Satoshi; Kurokawa, Kenji; Katayama, Tsutomu; Miki, Takeyoshi; Sekimizu, Kazuhisa

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.225

    Katayama, Tsutomu.

    CedA is a novel Escherichia coli protein that activates the cell division inhibited by chromosomal DNA overreplication [Text] / Tsutomu Katayama, Makoto Takata, Kazuhisa Sekimizu // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 4. - P687-697 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: CedA является новым белком Escherichia coli, который активирует клеточное деление, ингибированное сверхрепликацией хромосомной ДНК
Аннотация: При 30'ГРАДУС' у мутанта dnaAcos наблюдается сверхрепликация хромосомы и образуются филаменты из-за ингибирования образования перегородки, не зависящего от белка SfiA. Выделены 7 многокопийных супрессоров холодочувствительного фенотипа мутанта dnaAcos. Один из них оказался новым геном cedA, к-рый картирован на 38,9-й мин и кодирует белок с мол. м. 12 кД. Многокопийность гена cedA не предотвращает сверхрепликацию ДНК, но стимулирует клеточное деление, в результате чего образуются клетки с аномально большим числом копий хромосомы. Т. обр., уровень экспрессии cedA важен для ингибирования деления клеток dnaAcos при 30'ГРАДУС'. На генетическом фоне dnaA{+} ген cedA также влияет на клеточное деление. Япония, Dep. of Microbiol., Kyushu Univ. Faculty of Pharmaceutical Sci., Fukuoka 812-82. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН CEDA

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНА

УРОВЕНЬ

ВЛИЯНИЕ НА

АКТИВАЦИЯ

КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ

ИНГИБИРОВАНИЕ

СВЕРХРЕПЛИКАЦИЯ

ХРОМОСОМНАЯ ДНК

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Takata, Makoto; Sekimizu, Kazuhisa

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.266

   

    Conformational transition of DnaA protein by ATP: Structural analysis of DnaA protein, the initiator of Escherichia coli chromosome replication [Text] / Toshio Kubota [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1997. - Vol. 232, N 1. - P130-135 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Конформационный переход белка DnaA под действием АТФ: структурный анализ белка DnaA - инициатора репликации хромосомы Escherichia coli
Аннотация: Разработан новый эффективный метод очистки белка DnaA (I), повышающий в 6 раз выход I по сравнению с описанными ранее методами и позволяющий выделить более 22 мг I из 100 г клеток. Полученный препарат I имеет нормальное сродство к АДФ и активен в репликации in vitro плазмиды oriC. Процесс тепловой денатурации I, блокируемый АТФ, изучен методами характеристич. флуоресценции и кругового дихроизма. Показано, что I имеет высокое содержание 'альфа'-спиралей и что связывание АТФ вызывает изменение конформации I с уменьшением содержания 'альфа'-спиралей. Япония, Dep. of Microbiol., Kyushu Univ., Faculty of Pharmaceutical Sci., Fakuoka 812. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

ИНИЦИАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

DNAA

КОНФОРМАЦИОННЫЙ ПЕРЕХОД

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Kubota, Toshio; Katayama, Tsutomu; Ito, Yuji; Mizushima, Tohru; Sekimizu, Kazuhisa

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.221

   

    A stimulation factor for hydrolysis of ATP bound to DnaA protein, the initiator of chromosomal DNA replication in Escherichia coli [Text] / Kenji Kurokawa [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1998. - Vol. 243, N 1. - P90-95 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Стимулирующий фактор для гидролиза АТФ, связанного с белком DnaA, инициатором репликации хромосомной ДНК у Escherichia coli
Аннотация: Гидролиз АТФ, связанного с белком DnaA (I), под действием характеристич. АТФазной активности I негативно контролирует репликацию хромосомной ДНК у Escherichia coli. Новая система анализа гидролиза АТФ in vitro использована для поиска факторов, влияющих на АТФазную активность I. Методом гель-фильтрации из неочищенного экстракта клеток E. coli выделен белок с мол. м. 170 кД, усиливающий гидролиз АТФ, связанного с I и инактивирующий способность I инициировать репликацию ДНК на oriC. Этим белком оказался описанный ранее белок idaA-негативный фактор для I. Япония, Fac. Pharm. Sci., Kyushu Univ., Fukuoka 812-82. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМЫ

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ DNA A

АКТИВНОСТЬ

ПОДАВЛЕНИЕ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

НЕГАТИВНЫЙ ФАКТОР IDAA

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Kurokawa, Kenji; Mizushima, Tohru; Kubota, Toshio; Tsuchiya, Tomofusa; Katayama, Tsutomu; Sekimizu, Kazuhisa

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.234

   

    Mutant DnaA proteins defective in duplex opening of oriC, the origin of chromosomal DNA replication in Escherichia coli [Text] / Makoto Takata [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 2. - P454-462 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Мутантные белки DnaA, дефектные по открыванию дуплекса в области начала репликации хромосомной ДНК oriC у Escherichia coli
Аннотация: Изучены 3 мутанта белка DnaA (I) с заменами R334H (IA), R342H (IB) и E361G (IC), делающие репликацию хромосомы холодочувствительной (20'ГРАДУС'). IA-IC гиперэкспрессировали и очистили и изучили их репликативную активность в системе репликации oriC in vitro. При 30'ГРАДУС' IA-IC имеют такую же уд. активность, как и I дикого типа, но при 20'ГРАДУС' гораздо менее активны в системе с неочищенным экстрактом. IA-IC не отличаются от I дикого типа по сродству к АТФ и связыванию с ДНК oriC. Способность расплетать ДНК oriC у IA и IB при низкой т-ре гораздо ниже, чем у I дикого типа, что и объясняет их холодочувствительный фенотип. Остатки R334 и R342 расположены в мотиве I, к-рый похож на мотив белка NtrC, участвующий в образовании открытого комплекса. Остаток E361 может участвовать во взаимодействии I с др. белками в неочищенном экстракте. Япония, Dep. Mol. Microbiol., Kyushu Univ. Graduate Sch. Pharm. Sci., Fukuoka 812-8582. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

ИНИЦИАЦИЯ

УЧАСТОК ORI

ДУПЛЕКС

ОТКРЫВАНИЕ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ DNAA

СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ ОТНОШЕНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Takata, Makoto; Guo, Lei; Katayama, Tsutomu; Hase, Masakazu; Seyama, Yousuke; Miki, Takeyoshi; Sekimizu, Kazuhisa

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.228

    Katayama, Tsutomu.

    Inactivation of Escherichia coli DnaA protein by DNA polymerase III and negative regulations for initiation of chromosomal replication [Text] : pap. Bacter. Cell Cycle Meet., Abondance, 10-14 March, 1999 / Tsutomu Katayama, Kazuhisa Sekimizu // Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 8-9. - P835-840 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Инактивация DnaA-белка Escherichia coli ДНК-полимеразой III и негативная регуляция инициации репликации хромосомы
Аннотация: Инициация репликации хромосомы Escherichia coli происходит в нуклеопротеидном комплексе, образованном белком DnaA и участком начала репликации (oriC). Частота инициации репликации в oriC жестко регулируется, чтобы обеспечить удвоение только одной хромосомы за один цикл клеточного деления. Показано, что функционирование белка DnaA контролируется голоферментом ДНК-полимеразы III, репликазой хромосомы. Активная, связанная с АТФ форма DnaA, инактивируется при отщеплении фосфата, которое стимулируется субъединицей ДНК-полимеразы, и при переходе в АДФ-DnaA. В обзоре рассмотрена роль этой системы в регуляции инициации репликации ДНК в клеточном цикле. Япония, Dep. Microbiol., Fac. Pharmaceut. Sci., Kyushu Univ., 3-1-1 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka 812-8582. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
РЕПЛИКАЦИЯ

ИНИЦИАЦИЯ

НЕГАТИВНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК

DNAA

ИНАКТИВАЦИЯ

ДНК-ПОЛИМЕРАЗА III

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 47


Доп.точки доступа:
Sekimizu, Kazuhisa

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.212

    Katayama, Tsutomu.

    Multiple pathways regulating DnaA function in Escherichia coli: Distinct roles for DnaA titration by the datA locus and the regulatory inactivation of DnaA [Text] / Tsutomu Katayama, Kazuyuki Fujimitsu, Tohru Ogawa // Biochimie. - 2001. - Vol. 83, N 1. - P13-17 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Множественные пути, регулирующие функции DnaA у Escherichia coli: разные роли титрования DnaA локусом datA и регуляторной инактивации DnaA
Аннотация: Сайт datA в хромосоме Escherichia coli может связывать сотни молекул белка DnaA (I) и участвует в предотвращении несвоевременной инициации репликации хромосомы. Показано, что в растущих клетках datA{+} и мутанта 'ДЕЛЬТА'datA, не имеющего этого сайта, на долю активной формы I-АТФ инициатора репликации приходится одинаковая доля (25-30%) общего кол-ва I. Это показало, что ф-ция RIDA регуляторной инактивации I под действием 'бета'-субъединицы ДНК-полимеразы III работает и в отсутствие datA. В синхронизированных клетках 'ДЕЛЬТА'datA уровень I-АТФ флуктуирует так же, как и в клетках datA{+}. Это позволило предположить, что механизм RIDA функционирует независимо от титрования I на сайте data. Вероятно, оба механизма играют комплементарные роли в предотвращении несвоевременной инициации репликации во время клеточного цикла E. coli. Япония, Dep. Mol. Microbiol., Grad. Sch. Pharm. Sci., Kyushu Univ., Fukuoka 812-8582. Библ. 30
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: БЕЛОК
DNAA

РЕГУЛЯТОРНАЯ ИНАКТИВАЦИЯ

ТИТРОВАНИЕ

ЛОКУС DATA

МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

РЕПЛИКАЦИЯ

ИНИЦИАЦИЯ

НЕСВОЕВРЕМЕННАЯ

ПРЕДОТВРАЩЕНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

АТФ


Доп.точки доступа:
Fujimitsu, Kazuyuki; Ogawa, Tohru

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.187

   

    DNA replication-coupled inactivation of DnaA protein in vitro: A role for DnaA arginine-334 of the AAA{+} Box VIII motif in ATP hydrolysis [Text] / Masayuki Su'etsugu [et al.] // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 40, N 2. - P376-386 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Сопряженная с репликацией ДНК инактивация белка DnaA in vitro: роль аргинина-334 в мотиве VIII блока AAA{+} DnaA в гидролизе АТФ
Аннотация: Показано, что когда кол-во минихромосом (МХ) в системе репликации in vitro ограничено, стимулируемый МХ гидролиз АТФ, связанного с белком DnaA (I) Escherichia coli, дает неактивную форму I-АДФ. Число скользящих зажимов ДНК-полимеразы III, образовавшихся во время репликации, равно по меньшей мере 5 на МХ, что в 2,7 раза больше, чем при инкубации без репликации. Эти данные согласуются с предположением, что сопряжение гидролиза I-АТФ с репликацией ДНК является результатом усиленного образования зажима. Найдено также, что замена R334H в I сильно ингибирует гидролиз связанного АТФ in vitro. АТФ, связанный с I дикого типа, гидролизуется зависящим от ДНК характеристич. образом или зависящим от скользящего зажима образом. В тех же условиях АТФ, связанный с I-R334H, устойчив к гидролизу. Остаток apг[334] расположен рядом с сайтом связывания АТФ и может играть существенную роль в гидролизе АТФ. Этот остаток высококонсервативен среди гомологов I и в мотиве блока VIII семейства белков AAA{+}. Япония, Dep. Mol. Microbiol., Kyushu Univ. Grad. Sch. Pharm. Sci., Fukuoka 812-8582. Библ. 45
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК DNAA

СВЯЗЫВАНИЕ

ИНАКТИВАЦИЯ

АТФ

ГИДРОЛИЗ

СТИМУЛЯЦИЯ

МИНИХРОМОСОМЫ

РЕПЛИКАЦИЯ

APR-334

МОТИВ VIII

БЛОК AAA{+}

БЕЛОК DNAA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Su'etsugu, Masayuki; Kawakami, Hironori; Kurokawa, Kenji; Kubota, Toshio; Takata, Makoto; Katayama, Tsutomu

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.10-04Б2.244

   

    Isolation and characterization of novel cold-sensitive dnaA mutants of Escherichia coli [Text] / Lei Guo [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 1999. - Vol. 176, N 2. - P357-366 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Выделение и характеристика новых холодочувствительных мутантов dnaA Escherichia coli
Аннотация: Разработан эффективный метод выделения новых мутаций dnaA у Escherichia coli, основанный на ПЦР-мутагенезе в присутствии Mn{2+} и перетасовке несущих dnaA плазмид в бактериальном делеционном мутанте dnaA. Среди 4000 клонов, несущих плазмиды с подвергнутым мутагенезу геном dnaA, идентифицированы 30 холодочувствительных мутантов. Все 27 детально изученных холодочувствительных мутантов дефектны по репликации, и ни один из них не имеет фенотип DnaAcos гиперинициации. Секвенирование показало, что за холодочувствительный фенотип отвечают 15 новых аллелей (мутаций, затрагивающих 14 аминокислотных остатков, расположенных в C-концевой части белка DnaA). Япония, Fac. Pharm. Sci., Kyushu Univ., Fukuoka 812-8582. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.17.07.03
Рубрики: МУТАЦИИ
DNAA

МЕТОДЫ ВЫДЕЛЕНИЯ

ХОЛОДОЧУВСТВИТЕЛЬНЫЕ МУТАНТЫ

ДЕФЕКТНОСТЬ ПО РЕПЛИКАЦИИ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Guo, Lei; Katayama, Tsutomu; Seyama, Yousuke; Sekimizu, Kazuhisa; Miki, Kateyoshi

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.05-04Б2.207

    Katayama, Tsutomu.

    Суперсемейство белков AAA+, вовлеченных в инициацию хромосомной репликации у E. coli [Text] / Tsutomu Katayama // Seikagaku = J. Jap. Biochem. Soc. - 2004. - Vol. 76, N 11. - С. 1440-1443 . - ISSN 0037-1017
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

СУПЕРСЕМЕЙСТВО БЕЛКОВ ААА+

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.274

   

    A nucleotide switch in the Escherichia coli DnaA protein initiates chromosomal replication. Evidence from a mutant DnaA protein defective in regulatory ATP hydrolysis in vitro and in vivo [Text] / Satoshi Nishida [et al.] // J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277, N 17. - P14986-14995 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Переключение нуклеотидов в белке DnaA Escherichia coli инициирует хромосомную репликацию. Доказательство, что мутантный белок DnaA дефективен по регуляции гидролиза АТФ in vitro и in vivo
Аннотация: Белок DnaA Escherichia coli открывает двойную ДНК в участке начала репликации, что ведет к серии инициаций реакции in vitro. ДНК-полимераза III стимулирует гидролиз связи DnA-АТФ в присутствии белка IdaB/Hda, что приводит к выходу АДФ-DnaA, который инактивируется для инициации in vitro. Предположили, что эта негативная обратная регуляция играет важную роль в цикле репликации. Показали, что мутантный белок DnaA R334A - инертен для гидролиза связи с АТФ, хотя его сродство к АТФ и АДФ не меняется. АТФ-связывающий белок DnaA R334A, но не АДФ-форма, инициирует минихромосомную репликацию in vitro почти на уровне дикого типа. In vivo, DnaA R334A преобладает в АТФ-связанной форме, в отличие от белков DnaA E204Q, и способствует ориентации хромосомной репликации. Полученные данные подтверждают роль в связывании нуклеотидов регуляции активности DnaA во время репликации и позволяют сделать вывод о том, что остаток Arg-334 тесно взаимодействует со связанными нуклеотидами. Япония, Dep. of Mol. Microbiol., Kyushi Univ., Graduate School of Pharmaceutical Sci., Higashi-ku, Fukuoka 812-8582. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

ИНИЦИАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ НУКЛЕОТИДОВ

МЕХАНИЗМ

АМИНОКИСЛОТЫ

АРПЕНИН ARG-334

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Nishida, Satoshi; Fujimitsu, Kazuyuki; Sekimizu, Kazuhids; Ohmura, Tadshiro; Ueda, Tadashi; Katayama, Tsutomu

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.12-04Б2.238

   

    Involvement of the Escherichia coli folate-binding protein YgfZ in RNA modification and regulation of chromosomal replication initiation [Text] / Tomotake Ote [et al.] // Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 59, N 1. - P265-275 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Участие фолат-связывающего белка YgfZ Escherichia coli в модификации РНК и регуляции инициации репликации хромосомы
Аннотация: Идентифицирован ген ygfZ Escherichia coli, кодирующий фолат-связывающий белок, выступающий супрессором мутации hda, гена существенного для регуляции инициации репликации хромосомы. Показано, что О-мутация ygfZ подавляет О-мутацию hda. Фенотипы повторной инициации и абортивной элонгации, полученные в результате мутаций hda, частично исчезают в hdaygfZ исходном типе. Накопление активной формы DnaA, ATP-DnaA, в hda мутанте подавляется разрушением гена ygfZ, что указывает на участие YgfZ в регуляции уровня ATP-DnaA. Хотя ген ygfZ не является существенным для жизнеспособности, все же он важен для пролиферации, поскольку его разрушение приводит к снижению скорости роста у мутантов особенно при пониженных температурах. Установлено, что у мутантов ygfZ снижен уровень содержания 2-метилтио-6-иодаденозина, т. е. YgfZ участвует в модификации этого нуклеозида в тРНК. Таким образом, YgfZ является одним из ключевых факторов в регуляторной цепи репликации хромосомы, который действует через модификацию тРНК. Япония, Dep. Biol., Graduete Sch. Sci., Tokyo Metropolitan Univ., Minamiohsawa, Hachioji, Tokyo 192-0397. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИИ

РЕГУЛЯТОРНЫЙ КАСКАД

РЕГУЛЯТОРНЫЙ БЕЛОК YGFZ

РНК ТРАНСПОРТНАЯ

МОДИФИКАЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Ote, Tomotake; Hashimoto, Masayuki; Ikeuchi, Yoshiho; Su'etsugu, Masayuki; Suzuki, Tsutomu; Katayama, Tsutomu; Kato, Jun-ichi

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.01-04Б2.222

   

    Replication cycle-coordinated change of the adenine nucleotide-bound forms of DnaA protein in Escherichia coli [Text] / Kenji Kurokawa [et al.] // EMBO Journal. - 1999. - Vol. 18, N 23. - P6641-6652 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Координируемые циклом репликации изменения связанных с адениннуклеотидом форм белка DnaA Escherichia coli
Аннотация: АТФ-, но не АДФ-связанная форма белка DnaA участвует в инициации репликации с участка начала репликации Escherichia coli. Гидролиз АТФ, связанной с DnaA, ускоряется взаимодействием с 'бета'-субъединицей (продуктом гена dnaN) ДНК-полимеразы III и неидентифицированным белком IdaB. Показано, что образование связанных с АТФ молекул DnaA зависит от синтеза белка de novo, но не от SOS-ответа, Dam или SegA. Выявлена также регенерация АТФ-DnaA из АДФ-DnaA. Т. обр., сдвиг нуклеотидных форм белка DnaA сцеплен с эпистатическими событиями клеточного цикла и с системой репликации хромосомы. Япония, Dep. Molec. Microbiol., Kyushu Univ. Graduate Sch. Pharm. Sci., 3-1-1 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka, 812-8582. Библ. 78
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ

ИНИЦИАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК DNAA

АТФ-, АДФ-СВЯЗАННЫЕ ФОРМЫ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Kurokawa, Kenji; Nishida, Satoshi; Emoto, Akiko; Sekimizu, Kazuhisa; Katayama, Tsutomu

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.12-04Б2.201

   

    DiaA, a novel DnaA-binding protein, ensures the timely initiation of Escherichia coli chromosome replication [Text] / Takuma Ishida [et al.] // J. Biol. Chem. - 2004. - Vol. 279, N 44. - P45546-45555 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: DiaA, новый DnaA-связывающий белок, обеспечивающий [соблюдение временных параметров] инициации репликации хромосомы Escherichia coli
Аннотация: DnaA инициирует репликацию хромосомы Escherichia coli. Из мутанта dnaA с повышенной частотой инициации репликации выделен супрессорный ген, продукт которого был идентифицирован как новый белок DiaA, ассоциированный с DnaA. Установлено, что белок DiaA существенен для своевременного начала репликации в клеточном цикле. С помощью проточной цитометрии показано, что у мутанта diaA нарушен контроль за временем вступления в репликацию, как и у клеток дикого типа, суперэкспрессирующих diaA. Очищенный белок DiaA представляет собой стабильный гомодимер, а иммуноблотинг позволил определить содержание DiaA на клетку - 280 молекул гомодимера. In vitro DiaA стимулирует репликацию минихромосом при ограниченном содержании DnaA. Кроме того, продемонстрировано специфическое и непосредственное связывание DiaA с DnaA, причем для связывания существенен N-концевой район DnaA. С той же аффинностью DiaA связывается с АТФ- и АДФ-формами DnaA. Т. обр., DiaA представляет собой новый ассоциированный с DnaA фактор, существенный для соблюдения времени вступления в репликацию. Япония, Dep. Mol. Biol., Grad. Sch. Pharmaceutical Sci., Kyushu Univ., 3-1-1 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka 812-8582. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ДНК

ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

DNAA ИНДУКТОР РЕПЛИКАЦИИ

DIAA - ФАКТОР

МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Ishida, Takuma; Akimitsu, Nobuyoshi; Kashioka, Tamami; Hatano, Masakazu; Kubota, Toshio; Ogata, Yasuyuki; Sekimizu, Kazuhisa; Katayama, Tsutomu

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.338

   

    Genetic suppression of a dnaG mutation in Escherichia coli [Text] / Tsutomu Katayama [et al.] // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 3. - P1485-1491 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Генетическая супрессия мутации dnaG у Escherichia coli
Аннотация: Температурочувствительный мутант dnaG 2907 с повреждением гена ДНК-праймазы (I) с высокой частотой (105}) спонтанно ревертирует к нетемпературочувствительному фенотипу. Многие из ревертантов содержат внегенные супрессоры sdg. Изучено около 100 независимо выделенных супрессоров sdg, к-рые разбиты на 2 класса. Мутации sdgA картированы рядом с геном dnaG с 5'-стороны от него и цисдоминантны. Секвенирование 2 мутаций sdgA показало, что они являются заменами Г А и Ц А на расстоянии 43 или 62 п. н. от стартового кодона dnaG. В этой области содержится терминатор транскрипции, вносящий вклад в контроль экспрессии гена dnaG. Супрессоры второго класса (sdgB) являются мутантными аллелями гена rpoB, кодирующего 'бета'-субъединицу (II) РНК-полимеразы (III). Некоторые из них вызывают устойчивость к рифампицину. Супрессоры sdgA и sdgB увеличивают транскрипционную активность гена dnaG. Эти данные позволяют предположить, что мутации sdgA и sdgB супрессируют ts-шт. dnaG 2907 за счет гиперпродукции мутантной I, количественное перепроизводство к-рой компенсирует ее качественный дефект. Возможно также, что изменение II у мутантов sdgB восстанавливает взаимодействие между I и III, нарушенное мутацией dnaG 2907. Библ. 41. Япония, Inst. for Virus Research, Kyoto Univ., Kyoto 606, T. Nagata.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАЦИИ

МУТАЦИИ ГЕНА

ДНК-ПРАЙМАЗЫ DNAG

СУПРЕССИЯ

СУПРЕССОРНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН СУБЪЕДИНИЦЫ*БЕТА РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ RPOB

СУПРЕССОР SDGA

КАРТИРОВАНИЕ

ФУНКЦИИ


Доп.точки доступа:
Katayama, Tsutomu; Murakami, Yota; Wada, Chieko; Ohmori, Haruo; Yura, Takashi; Nagata, Toshio

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.04-04Б2.451

    Katayama, Tsutomu.

    Inhibition of cell growth and stable DNA replication by overexpression of the bla gene of plasmid pBR 322 in Escherichia coli [Text] / Tsutomu Katayama, Toshio Nagata // Mol. and Gen. Genet. - 1990. - Vol. 223, N 3. - P353-360 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Ингибирование роста клетки и стабильной репликации ДНК повышенной экспрессией гена bla плазмиды pBR 322 Escherichia coli
Аннотация: Хромосома Escherichia coli содержит участки ori K, к-рые определяют конститутивную стабильную репликацию ДНК. Они не требуют функции генов dnaA и rnh, необходимых для ori C-репликации. Провели генетич. анализ условных мутантов, у к-рых гены dnaA и rnh являются активными при 30'ГРАДУС' С и инактивируются при 42'ГРАДУС' С. Показали, что гибридная плазмида pZK 58, содержащая репликоны плазмид мини-F и pBR322 ингибирует рост таких мутантных клеток при 42'ГРАДУС' С. Отдельно мини-F и pBR 322 такого эффекта не оказывают. Установили, что район оперона sop мини-F репликона, клонированный перед геном bla, кодирующего 'бета'лактамазу, инициирует повышенную продукцию данного фермента. Делают вывод, что сверхсинтез 'бета'-лактамазы приводит к подавлению роста клетки и конститутивной стабильной репликации ДНК. Библ. 27. Япония, Inst. for Virus Res., Kyoto Univ., Kyoto 606.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ КН 5402-1

РОСТ

РЕПЛИКАЦИЯ

ORIK ОБЛАСТЬ

ПОДАВЛЕНИЕ

ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕН ЛАКТАМАЗЫ X БЕТА-

СУПЕРПРОДУКЦИЯ ФЕРМЕНТА

РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДА PZK58

СИНТЕЗ ДНК

СИНТЕЗ БЕЛКОВ


Доп.точки доступа:
Nagata, Toshio

 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)