СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ<.>)

Общее количество найденных документов : 24
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-24

РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 97.03-04И8.207

Dufresne, Catherine.
The presence of tandem repeats and the initiation of replication in rabbit mitochondrial DNA [Text] / Catherine Dufresne, Francoise Mignotte, Monique Gueride // Eur. J. Biochem. - 1996. - Vol. 235, N 3. - P593-600 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Присутствие тандемных повторов и инициация репликации в митохондриальной ДНК кролика
Аннотация: Подтверждено присутствие в некодирующем сегменте мтДНК кролика Oryctolagus cuniculus высокополиморфного участка, обусловливающего интенсивную гетероплазмию в популяциях и линиях - между консервативным блоком CSB1 и геном тРНК фенилаланина имеется короткий (20 п. н.) и длинный (ДП: 153 п. н.) повторы. Эти повторы локализованы вблизи точки начала репликации Н-цепи мтДНК, поэтому не исключается участие повторов в регуляции этого процесса. Молекулярный анализ подтверждает гетерогенность 5'- и 3'-концевых участков D-петли. Установлена локализация точки начала репликации вплотную к консервативному сегменту CSB1, что также является консервативным признаком митохондриальных геномов млекопитающих. Сайты инициации репликации картированы на самом краю одного из повторов в составе ДП: этот участок характеризуется повышенным содержанием пары АТ - соотв., на каждом ДП инициируется синтез РНК, соотв. Н-цепи мтДНК. Амплификация регуляторного сегмента приводит к мультипликации сайтов инициации и образованию семейства различающихся репликационных РНК-затравок. Полученные данные обсуждаются с точки зрения выяснения роли пространственной структуры анализируемого участка мтДНК в процессе репликации Н-цепи. Франция [M. Gueride], CNRS Ctr Genet. Mol., av. de la Terrasse, F-91198 Gif-sur-Yvette Cedex. Библ. 22

ГРНТИ	34.23.59

ВИНИТИ 341.23.59.02.07
Рубрики: ГЕНОМ МИТОХОНДРИАЛЬНЫЙ
ДНК
НЕКОДИРУЮЩИЙ СЕГМЕНТ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
РЕПЛИКАЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
КАРТИРОВАНИЕ
КРОЛИКИ

Доп.точки доступа:
Mignotte, Francoise; Gueride, Monique

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.04-04Б1.85

Chen, I-Hsiung.
Overlapping initiator and TATA box functions in the basal core promoter of hepatitis B virus [Text] / I-Hsiung Chen, Chiu-Jung Huang, Ling-Pai Ting // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 6. - P3647-3657 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Перекрывающиеся функции инициатора и ТАТА-блока в базальном сердцевинном промоторе вируса гепатита В
Аннотация: Базальный сердцевинный промотор вируса гепатита В содержит 4 ТА-богатые последовательности (ТА1-ТА4), но не имеет канонического ТАТА-блока. Этот промотор направляет образование предсердцевинной и предгеномной РНК, сайты инициации к-рых находятся на расстоянии 30 н. друг от друга. Показано, что участка длиной 15 н., содержащего ТА4, достаточно для точной инициации обеих РНК. Эта последовательность может функционировать как инициатор и как ТАТА-элемент. Мутационный анализ показал, что последовательности, существенные для обеих функций, перекрываются. Библ. 42

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА В
СЕРДЦЕВИННЫЙ ПРОМОТОР
РНК ВИРУСНАЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Huang, Chiu-Jung; Ting, Ling-Pai

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.274

Jeong, Woojin.
Start site selection at lacUV5 promoter affected by the sequence context around the initiation sites [Text] / Woojin Jeong, Changwon Kang // Nucl. Acids Res. - 1994. - Vol. 22, N 22. - P4667-4672 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Селекция стартового сайта в промоторе lacUV5, связанная с последовательностью в районе сайтов инициации
Аннотация: Исследовали влияние замен единичных пар оснований в сайтах инициации промотора lacUV5 на выбор стартового сайта транскрипции РНК-полимеразой E. coli. Стартовые сайты транскрипции были картированы с помощью специфически терминированных продуктов транскрипции in vitro. Показали, что все замены в районе сайтов инициации транскрипции приводят к изменению числа стартовых сайтов и (или) к изменению главного стартового сайта. При этом ни один из стартовых сайтов не выходил за пределы района из 3 п. н. промотора lacUV5. Показали, что последовательности нуклеотидов в районе сайтов инициации влияют на выбор инициирующих нуклеотидов РНК-полимеразой E. coli. Корея, Dep. of Life Science Korea Advanced Inst. of Sci. and Technology, 373-1 Kusong-dong, Yusong-gu, Taejon 305-701. Ил. 4. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ВЫБОР
ИНИЦИИРУЮЩИЕ НУКЛЕОТИДЫ
ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР LAC UV5
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
ЗАМЕНА НУКЛЕОТИДОВ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kang, Changwon

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.602

Plus-strand DNA synthesis of the yeast retrotransposon Ty1 is initiated at two sites, PPT1 next to the 3' LTR and PPT2 within the pol gene. PPT1 is sufficient for TY1 transposition [Text] / T. Heyman [et al.] // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 253, N 2. - P291-303 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Синтез (+)-нити ДНК ретротранспозона дрожжей Ty1 инициируется в двух сайтах: PPT1 рядом с 3'-длинным концевым повтором и PPT2 в гене pol. PPT1 достаточно для транспозиции Ty1
Аннотация: Генетическими методами показано, что синтез (+)-нити ДНК ретротранспозона дрожжей Ty1 инициируется в 2 сайтах: 1) PPT1 на 5'-границе 3'-длинного концевого повтора; 2) PPT2 в середине гена pol в последовательности, кодирующей интегразу. Эти полипуриновые тракты PPT имеют одинаковую последовательность GGGTGGTA. Из-за присутствия двух PPT (+)-ДНК Ty1 в течение нек-рого времени при репликации существует в виде сегментов. Идентифицированы 3 таких фрагмента: 1) strong-stop-ДНК (+)-нити, инициированной на PPT1; 2) 5'-фрагмент, инициированный на PTT2; 3) фрагмент, занимающий 5'-концевую часть Ty1 и часть гена TyB. Характеристика 3'-концов (+)-нитевых фрагментов ДНК показала, что: 1) 5'-фрагмент элонгируется за сайт PPT2, создавая перекрывание (+)-нитей; 2) большинство strong-stop-фрагментов (+)-нити несет копию сайта связывания затравки (-)-нити, в соответствии с признанной моделью транскрипции геномных РНК ретровирусов. Мутации, вызывающие замены пуринов на пиримидины в PPT, уменьшают или устраняют инициацию синтеза (+)-нити. Элементы Ty1 с мутантным трактом PPT2 не дефектны по транспозиции. Мутации в тракте PPT1 устраняют транспозицию. Франция, Inst. Curie-Biol., Centre Universitaire, 91405 Orsay. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.19.09
Рубрики: РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСПОЗОН TY1
ДНК
(+)-НИТЬ
РЕПЛИКАЦИЯ
СИНТЕЗ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
САЙТ PPT1
SACCHAROMYCES CEREVISIAE

Доп.точки доступа:
Heyman, T.; Agoutin, B.; Friant, S.; Wilhelm, F.X.; Wilhelm, M.L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 00.06-04Я6.188

Hwang, Arlene.
Cell cycle-dependent usage of transcriptional start sites. A novel mechanism for regulation of cyclin B[1] [Text] / Arlene Hwang, W.Gilles McKenna, Ruth J. Muschel // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 47. - P31505-31509 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Зависящее от клеточного цикла использование сайтов старта транскрипции: новый механизм регуляции циклина В1
Аннотация: Циклин В1 является регуляторной субъединицей митоз-промотирующего фактора. Зависимая от клеточного цикла (КЦ) экспрессия циклина В1 необходима для обеспечения правильного времени вхождения клеток в митоз. Циклин В1 и его мРНК накапливаются в течение интерфазы с пиком при переходе из фазы G2 в M. Экспрессия мРНК циклина В1 регулируется на транскрипционном и посттранскрипционном уровне. Авт. обнаружены 2 главных транскрипта циклина В1 - конститутивно экспрессируемый транскрипт и регулируемый КЦ транскрипт, который экспрессируется преимущественно в течение фаз G2-M. Эти мРНК образуются в результате альтернативного использования сайтов старта транскрипции. Изменение стабильности мРНК не контролирует, по-видимому, экспрессию КЦ-специфичного транскрипта. Однако в промоторе гена циклина В1 обнаружен участок из 24 п. н., затрагивающий сайт старта КЦ-зависимой мРНК, и критичный для КЦ-регулируемой активности промотора. Участок 24 п. н. необходимый для регуляции КЦ, содержит 3 повтора GGCT. Показано, что в системе in vitro КЦ-специфичный транскрипт транслируется более эффективно, чем конститутивный транскрипт. Т. обр., показано, что существует новый механизм регуляции циклина В1 в течение КЦ, который основан на использовании различных сайтов старта транскрипции. США, Dep. Pathol. Lab. Med., Univ. Pennsylvania Sch. Med., Philadelphia, PA 19104. Библ. 15

ГРНТИ	34.19.19

ВИНИТИ 341.19.19.11.03.01
Рубрики: ЦИКЛИН B1
ГЕНЫ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
АЛЬТЕРНАТИВНОЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
McKenna, W.Gilles; Muschel, Ruth J.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 01.06-04Н1.54

Analysis of the promoter of the MUC1 gene overexpressed in breast cancer [Text] / Joseph Z. Zaretsky [et al.] // FEBS Lett. - 1999. - Vol. 461, N 3. - P189-195 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Анализ промотора гена MUC1, экспрессия которого повышена в [клетках] рака молочной железы
Аннотация: Ген MUC1 человека кодирует гликопротеин муцин и сверхэкспрессируется в клетках рака молочной железы. С целью изучения регуляции транскрипции гена MUC1 анализировали функциональную активность различных делеционных вариантов промотора этого гена. Показано, что цис-элементы, локализованные в SacI/XmnI-фрагменте промотора обеспечивают экспрессию, по меньшей мере, тандемных повторов, содержащих изоформы белка MUC1. Транскрипционной активностью обладают и 3'- и 5'-участки фрагмента SacI/XmnI. Промоторная активность этого участка подтверждена методом защиты от РНКаз, который выявил множественные сайты инициации транскрипции в гене MUC1, транскрибируемом в эпителиальных клетках T47D. Показано также, что обработка клеток T47D трансформирующим фактором роста 'бета'1 приводит к активации дополнительных сайтов инициации транскрипции в гене MUC1. Израиль, Dep. Cell Res. Immunol., George S. Wise Fac. Life Sci., Tel Aviv Univ., Ramat Aviv 69978. Библ. 37

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.03.19
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН MUC1
МУЦИН
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОРЫ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
ОПУХОЛЕВЫЕ КЛЕТКИ
РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Zaretsky, Joseph Z.; Sarid, Ronit; Aylon, Yael; Mittelman, Leonid A.; Wreschner, Daniel H.; Keydar, Iafa

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 02.08-04А3.842

Frishman, Dmitrij.
Starts of bacterial genes: Estimating the reliability of computer predictions [Text] / Dmitrij Frishman, Andrei Mironov, Mikhail Gelfand // Gene. - 1999. - Vol. 234, N 2. - P257-265 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: [Сайты инициации трансляции] в генах бактерий: оценка точности компьютерных предсказаний
Аннотация: Точное картирование сайтов инициации в генах является важной проблемой в функциональном анализе секвенированных прокариотических геномов, проводимом с использованием компьютерных методов. Рассмотрен алгоритм выявления сайтов связывания рибосом. Этот алгоритм полезен для анализа геномов, в которых отсутствуют экспериментально картированные гены или так их генов мало. Обнаружена корреляция между свойствами сайтов связывания рибосом и точностью предсказания сайтов инициации трансляции. Показано, что свойства сайта связывания рибосом зависят от филогенетического положения генома. Германия, GSF-Forschungszentrum f. Umwelt Gesundheit, Munich Informat. Ctr Protein Sequencies MPI Biochem., D-82152 Martinsried. Библ. 38

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРЕДСКАЗАНИЯ
ТОЧНОСТЬ
САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ РИБОСОМ
АЛГОРИТМЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ПОЛОЖЕНИЕ
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Mironov, Andrei; Gelfand, Mikhail

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.10-04Б2.126

PromEC: An updated database of Escherichia coli mRNA promoters with experimentally identified transcriptional start sites [Text] / Ruti Hershberg [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2001. - Vol. 29, N 1. - P277 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: PromEC: усовершенствованная база данных промоторов мРНК Escherichia coli с экспериментально идентифицированными сайтами инициации транскрипции
Аннотация: Усовершенствованная база данных промоторов мРНК Escherichia coli содержит сведения о локализации экспериментально идентифицированных сайтов инициации транскрипции на хромосоме, а также о регуляторных элементах промоторной области. База содержит 472 документа и доступна по адресу http://bioinfo.md.huji.ac.il/marg/promec. Израиль, Dep. Molec. Genet. Biotechnol., Hebrew Univ.-Hadassah Med. Sch., POB 12272 Jerusalem 91120. Библ. 3

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
БАЗЫ ДАННЫХ
PROMEC
ПРОМОТОРЫ
РНК МАТРИЧНАЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Hershberg, Ruti; Bejerano, Gill; Santos-Zaveleta, Alberto; Margalit, Hanah

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.222

Frishman, Dmitrij.
Starts of bacterial genes: Estimating the reliability of computer predictions [Text] / Dmitrij Frishman, Andrei Mironov, Mikhail Gelfand // Gene. - 1999. - Vol. 234, N 2. - P257-265 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: [Сайты инициации трансляции] в генах бактерий: оценка точности компьютерных предсказаний
Аннотация: Точное картирование сайтов инициации в генах является важной проблемой в функциональном анализе секвенированных прокариотических геномов, проводимом с использованием компьютерных методов. Рассмотрен алгоритм выявления сайтов связывания рибосом. Этот алгоритм полезен для анализа геномов, в которых отсутствуют экспериментально картированные гены или так их генов мало. Обнаружена корреляция между свойствами сайтов связывания рибосом и точностью предсказания сайтов инициации трансляции. Показано, что свойства сайта связывания рибосом зависят от филогенетического положения генома. Германия, GSF-Forschungszentrum f. Umwelt Gesundheit, Munich Informat. Ctr Protein Sequencies MPI Biochem., D-82152 Martinsried. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРЕДСКАЗАНИЯ
ТОЧНОСТЬ
САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ РИБОСОМ
АЛГОРИТМЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ПОЛОЖЕНИЕ
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Mironov, Andrei; Gelfand, Mikhail

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 04.12-04Я6.7

Recognizing translation initiation sites of eukaryotic genes based on the cooperatively scanning model [Text] / Yonghong Wang [et al.] // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 15. - P1972-1977 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Узнавание сайтов инициации трансляции эукаоритических генов основывается на модели кооперативного сканирования
Аннотация: Предлагается кооперативная сканирующая модель для узнавания сайтов инициации трансляции (TISs) и первых экзонов эукариотических генов на основании структурной характеристики мульти-экзонных генов. Модель использовали для сканирования TISs и первых экзонов для 132 генов млекопитающих. Точность узнавания соответствует 64,4 и 51,5%. Модель может оказаться полезной для описания геномов и может быть включена в другие алгоритмы для достижения более точных результатов. КНР, Dep. Phys.,Hebei Univ. Techn., Tianjin 300130. Библ. 25

ГРНТИ	34.19.05

ВИНИТИ 341.19.05.99
Рубрики: МЕТОДЫ
МОДЕЛЬ TISS
ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
ГЕНЫ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
УЗНАВАНИЕ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Wang, Yonghong; Liu, Jinwei; Zhao, Tongju; Ji, Qing

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.01-04Б2.257

Characterization of the expression and activity of the periplasmic nitrate reductase of Paracoccus pantotrophus in chemostat cultures [Text] / M. J.K. Ellington [et al.] // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 6. - P1533-1540 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Характеристика экспрессии и активности периплазматической нитратредуктазы в хемостатируемых культурах Paracoccus pantotrophus
Аннотация: Периплазматическая нитраредуктаза (Nap) Paracoccus pantotrophus принимает участие в поддержании клеточного редокс потенциала. Известно, что при периодическом культивировании уровень экспрессии nap зависит от степени восстановленности субстрата: он выше на более восстановленном субстрате (бутиратсукцинат). Изучено влияние скорости роста на экспрессию nap в хемостатируемых культурах при дефиците сукцината, ацетата и бутирата. Во всех 3-х случаях отмечена строгая корреляция между транскрипцией nap-промотора и активностью фермента Nap. При самом быстром росте на всех 3-х субстратах nap-экспрессия и активность фермента были максимальными при росте на более восстановленном субстрате (бутиратацетатсукцинат). Однако, во всех 3-х случаях наблюдался колоколо-образный характер экспрессии как функции от скорости роста, с наивысшим уровнем экспрессии и активности фермента при промежуточных скоростях роста. Этот эффект был наиболее выражен на сукцинате, где были отмечены 5-кратные различия, а при промежуточных скоростях экспрессия nap и активности фермента были сравнимы на всех 3-х углеводных субстратах. Анализ мРНК, полученной из культур, выращенных на сукцинате, показал, что при изменении скорости роста для экспрессии nap-оперона используются различные сайты инициации транскрипции. Представлена новая схема регуляции экспрессии nap у P. pantotrophus, которая функционирует на уровне транскрипции в ответ на скорость роста в культурах при дефиците углерода. Великобритания, Dep. Biochem., Univ. Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
СКОРОСТЬ РОСТА
ТРАНСКРИПЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
МНОЖЕСТВЕННОСТЬ
ГЕНЫ
ГЕНЫ НИТРАТРЕДУКТАЗЫ
PARACOCCUS PANTOTROPHUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ellington, M.J.K.; Sawers, G.; Sears, H.J.; Spiro, S.; Richardson, D.J.; Ferguson, S.J.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 07.12-04Б1.41

The translational and tanscriptional initiation sites of BmNPV lef-7 gene [Text] / Fang Wang [et al.] // Virus Genes. - 2006. - Vol. 33, N 3. - P351-357 . - ISSN 0920-8569
Перевод заглавия: Трансляционные и транскрипционные сайты инициации гена lef-7 вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori (GmNPV)
Аннотация: В работе проведено сравнение ранее установленной рамки считывания гена lef-7 BmNPV, которая на 5' терминальном конце длиннее на 45 п. о. и в которой в направлении 5' конца содержится 42 п. о. делеция, и такой же рамки считывания мультикапсидного NPV Autograph california (AcMNPV). Цель - определить, отличается ли транслируемый BmNPV lef-7 сайт инициации от такового lef-7 AcMNPV. В работе были изучены трансляционные и транскрипционные сайты инициации гена lef-7 BmNPV. Сначала был сконструирован мутант BmNPV-Bmlef7M1{-}, полученный путем удаления 11 нуклеотидов, включая предполагаемый инициирующий кодон ATG. Анализ в Вестерн-блоте продемонстрировал, что размер LEF-7 из инфицированных BmNPV и Bmletf7M1{-} клеток идентичен. В конфокальном микроскопе было видно, что в инфицированных клетках LEF7 BmNPV и Bmlef7M1{-} были оба локализованы в ядрах, что дает возможность полагать, что инициирующий кодон ATG, по-видимому, при трансляции lef-7 не функционален. Анализ 5-RACE обнаружил, что транскрипция мРНК lef-7 в BmNPV и Bmlef7M1{-} инфицированных клетках инициировалась из мотива АТСАТТ, локализованного в обратном направлении вторичного ATG, генома BmNPV, и в прямом направлении предполагаемого стартового кодона. КНР, Coll. of Life Sci., Zhejiang Univ., Hangzhou, 310012

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: БАКУЛОВИРУСЫ
ВИРУСЫ ЯДЕРНОГО ПОЛИЭДРОЗА
ГЕН LEF-7
ТРАНСЛЯЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ

Доп.точки доступа:
Wang, Fang; Yang, Li-Rong; Tang, Xu-Dong; Mo, Jian-Chu; Yang, Wei-Jun; Zhang, Chuan-Xi

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 11.07-04М1.76

The regulated retrotransposon transcriptome of mammalian cells [Text] / Geoffrey J. Faulkner [et al.] // Nature Genet. - 2009. - Vol. 41, N 5. - P563-571 . - ISSN 1061-4036
Перевод заглавия: Транскриптом регуляторных ретротранспозонов в клетках млекопитающих
Аннотация: В рамках проекта FANTOM4 установили, что от 6 до 30% содержащих кепструктур транскриптов мыши и человека, инициируются с повторяющихся элементов генома. Анализ примерно 250000 сайтов инициации транскрипции, кратированных в ретротранспозонах, показал, что синтезируемые с них транскрипты являются преимущественно тканеспецифическими, совпадают с обогащенными генами областями генома и образуют выраженные кластеры при выравнивании с полноразмерными ретротранспозонами. Ретротранспозоны, расположенные перед белоккодирующими генами, часто действуют как альтернативные промоторы и/или направляют экспрессию некодирующих РНК. Более четверти транскриптов в базе RefSeq содержат нетротранспозоны в 3'-нетранслируемых областях. Полногеномный анализ выявил 23000 потенциальных регуляторных участков, происходящих из ретротранспозонов и 200 примеров двунаправленной транскрипции

ГРНТИ	34.19.19

ВИНИТИ 341.19.19.11.03.09
Рубрики: РЕТРОТРАНСПОЗОНЫ
ТРАНСКРИПТОМ
ТРАНСКРИПЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
ЧЕЛОВЕК
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Faulkner, Geoffrey J.; Kimura, Yasumasa; Daub, Carsten O.; Wani, Shivangi; Plessy, Charles; Irvine, Katharine M.; Schroder, Kate; Clo'-'onan, Nicole; Steptoe, Anita; Lassmann, Timo; Waki, Kazunori; Hornig, Nadine

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.04-04Б1.707

Replicative intermediates of hepatitis B virus in HepG2 cells that produce infectious virions [Text] / Mary Ann Sells [et al.] // J. Virol. - 1988. - Vol. 62, N 8. - P2836-2844
Перевод заглавия: Репликативные интермедиаты вируса гепатита B в клетках HepG2, продуцирующих инфекционные вирионы
Аннотация: Сообщают о характеристике репликативных промежуточных комплексов вируса гепатита B в Кл HepG2, трансфицированных плазмидой, содержащей полный геном вируса. Кл HepG2 продуцируют инфекционные вирионы, к-рые вызывают острый гепатит в шимпанзе. С помощью блот-гибридизации по Саузерну с использованием меченых зондов на нити ДНК вируса изучили кинетику накопления вирусной ДНК в ядрах и цитоплазме клеток, а также в среде культивирования. В стационарной фазе роста клеток идет с повышенной скоростью накопление вирусной ДНК. Неполные двух и однонитевые формы генома вируса выявляются в ядре, цитоплазме и среде культивирования. Ядерная ДНК также содержит множественные полные копии генома, интегрированные в хромосому, а также полные кольцевые ДНК вируса. Обнаружены вирусспецифич. полиаденилированные РНК, размер к-рых составляет 3,5, 2,5 и 2,1 т. п. н. С помощью картирования нуклеазой SI сайты инициации были идентифицированы перед областью пре-SI, а также выше и внутри пре-S2 области. США, Mount Sinai School of Medicine, I Gustave L. Levy Place, NY 10029-6574. Библ. 48.

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.21.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА B
РЕПЛИКАЦИЯ
ДНК ВИРУСНАЯ
ДНК ЯДЕРНАЯ
СТРУКТУРА
НАКОПЛЕНИЕ
КАРТИРОВАНИЕ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ

Доп.точки доступа:
Sells, Mary Ann; Zelent, Arthur Z.; Shvartsman, Marina; Acs, George

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.07-04Б1.232

Salas, M.
Control of transcription of the B. subtilis phage 'сигма'20 DNA [Text] / M. Salas, I. Barthelemy, R. P. Mellado // Biol. Zbl. - 1988. - Vol. 107, N 6. - P680 . - ISSN 0006-3304
Перевод заглавия: Контроль транскрипции ДНК фага 'сигма'29 B. subtilis
Аннотация: Сайты инициации транскриптов, синтезированных in vivo в зараженных фагом 'сигма'29 Кл Bac. subtilis, картированы методом защиты от нуклеазы S1. 8 из этих сайтов соответствуют ранним транскриптам и лишь один - позднему транскрипту. Эти же сайты используются in vitro холоферментом РНК-полимеразы Bac. subtilis (I). Определены нуклеотидные последовательности ранних и позднего промоторов. В узнавании ранних промоторов участвует форма Е'сигма'{3}{7} I, а поздний промотор несет лишь специфичный для Е'сигма'{3}{7} белок-10. Очищен белок р4 (II), контролирующий позднюю транскрипцию 'сигма' 29 in vivo. При добавлении II к I образуется транскрипт, к-рый по размеру совпадает с поздней мРНК. Идентифицирована область позднего промотора, необходимая для действия II. Испания, Centro de Biol. Molecular, Univ. Autonoma, 28049 Madrid.

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ФИ29
BACILLUS SUBTILIS
ДНК
ТРАНСКРИПТЫ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
КАРТИРОВАНИЕ
ПРОМОТОРЫ
БЕЛОК Р4
ТРАНСКРИПЦИЯ

Доп.точки доступа:
Barthelemy, I.; Mellado, R.P.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.08-04Б2.379

Double-strand breaks at an initiation site for meiotic gene conversion [Text] / Hong Sun [et al.] // Nature. - 1989. - Vol. 338, N 6210. - P87-90 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Двунитевые разрывы в сайте инициации мейотической генной конверсии
Аннотация: Установлено, что в сайте инициации мейотической нереципрокной рекомбинации (генной конверсии) в промоторной области гена ARG4 дрожжей Saccharomyces cerevisiae образуется двунитевой разрыв, появление к-рого приходится на время рекомбинации. Разрыв появляется уже в первые 3 ч в процессе мейоза. Разорванные молекулы ДНК оканчиваются протяженными однонитевыми участками. Авт. полагают, что эти результаты подтверждают участие двунитевых разрывов ДНК в инициации мейотической рекомбинации. Ил. 4. Библ. 29. США, Dep. of Mol Biol. Massachusetts General Hospital, Boston, MA 02114.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.07 + 341.27.21.11.07.03
Рубрики: SACCHARAMYCES CEREVISIAE (FEMGI)
РЕКОМБИНАЦИЯ
РЕКОМБИНАЦИЯ МИОТИЧЕСКАЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
ГЕНЫ
ARG4
РАЗРЫВЫ ДНК

Доп.точки доступа:
Sun, Hong; Treco, Douglas; Schultes, Neil P.; Szostak, Jack W.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 89.10-04А4.30

Особенности деградации ДНК лимфоцитов тимуса на ранних сроках после облучения [Текст] / В. А. Солдатенков [и др.] // Радиобиология. - 1989. - Т. 29, N 3. - С. 291-295 . - ISSN 0033-8192
Аннотация: Снижение среднечисленной длины фрагментов ДНК тимоцитов по данным электрофореза в 0,7%-ной агарозе проявляется к 45-й мин после Обл мышей в дозе 10 Гр. Скорость деградации ДНК падает, когда средний размер фрагментов составляет 1000-1500 н. п. Сделан вывод о неслучайном расположении сайтов инициации пострадиационного расщепления ДНК вдоль генома. Отмечено сходство распада ДНК хроматина лимфоцитов после облучения животных с закономерностями ее фрагментации Ca{2}+, Mg{2}+-эндонуклеазой in vitro. Показано, что циклогексимид снижает активность этого фермента в ядерных экстрактах из тимуса уже через 30 мин после Обл. мышей. Ил. 3. Библ. 25.

ГРНТИ	34.49.21

ВИНИТИ 341.49.21.11.17.19
Рубрики: ДНК
ДЕГРАДАЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
ФЕРМЕНТЫ
CA, MG-ЭНДОНУКЛЕАЗА
ЦИКЛОГЕКСИМИД
ЛИМФОЦИТЫ
ТИМУС
ГАММА-ИЗЛУЧЕНИЕ
МЫШИ
ЖИВОТНЫЕ

Доп.точки доступа:
Солдатенков, В.А.; Денисенко, М.Ф.; Ходарев, Н.Н.; Вотрин, И.И.; Филиппович, И.В.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.254

Glaser, David.
Buoyant density, growth rate, and the cell cycle in Streptococcus faecium [Text] / David Glaser, Michael Higgins // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 2. - P669-673 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Плавучая плотность, скорость роста и клеточный цикл Streptococcus faecium
Аннотация: Показано, что плавучая плотность быстрорастущей культуры Streptococcus faecium изменяется в течение клеточного цикла. Значение и коэффициент вариации плотности популяции увеличиваются с увеличением скорости роста. Кроме того, с увеличением плотности увеличивается доля крупных Кл и число сайтов инициации роста клеточной стенки. Этот эффект более выражен в быстрорастущей культуре. Среднее значение плотности определено для каждого значения объема Кл. Во всех популяциях Кл плотность снижается, а затем увеличивается по мере увеличения центрального сайта роста клеточной стенки. Рост стенки в периферических сайтах начинается при макс. значении плотности. Авт. предполагают, что скорость увеличения плотности в клеточном цикле коррелирует с образованием новых сайтов роста клеточной стенки у S. faecium. Ил. 5. Библ. 14. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Temple Univ. School of Med., Philadelphia, PA 19140.

ГРНТИ	34.27.19

ВИНИТИ 341.27.19.09.09
Рубрики: КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
ПЛОТНОСТЬ ПОПУЛЯЦИИ
КЛЕТОЧНАЯ СТЕНКА
РОСТ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
STREPTOCOCCUS FAECIUM (BACT.)
ПЛАВУЧАЯ ПЛОТНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Higgins, Michael

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.12-04Б2.412

Sites of initiation and pausing in the Escherichia coli rnpB (М1 RNA) transcript [Text] / Younghoon Lee [et al.] // J. Biol. Chem. - 1989. - Vol. 264, N 9. - P5098-5103 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Сайты инициации и остановки в транскрипте гена rnpB (М1 РНК) Escherichia coli
Аннотация: Рибонуклеаза Р Escherichia coli содержит РНК (М1 РНК), как каталитическую субъединицу. Эта М1 РНК кодируется геном rnpB. Промоторный район этого гена содержит 3 консенсусные промоторные последовательности Р1, Р2, Р3. Исследовали роль данных промоторов в экспрессии гена М1 РНК. Показали, что все три промотора инициируют транскрипцию, но промотор Р1 в 100 раз активнее промоторов Р2 и Р3. Считают, что Р1 промотор является основным в процессе транскрипции М1 РНК in vivo. С помощью транскрипции в условиях in vitro определили сайты остановки транскрипции М1 РНК, которые находятся в районе нуклеотидов +118 и +121. Остановка транскрипции прекращается, если в реакционную смесь вместо ИТФ добавляли ГТФ. Полагают, что причиной остановки в данных сайтах являются две находящиеся рядом шпильки в структуре М1 РНК. Библ. 25. США, From the Dep. of Biochem., Univ. of Missouri-Columbia, Missouri 65212.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ФЕРМЕНТЫ
РИБОНУКЛЕАЗА Р
СИНТЕЗ
РНК
М1 РНК
ГЕНЫ
ГЕН RNPB
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТРАНСКРИПЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ
САЙТЫ ОСТАНОВКИ
ПРОМОТОРЫ
СИЛА ПРОМОТОРА Р1
ПРОМОТОР Р2
ПРОМОТОР Р3
ХАРАКТЕРИСТИКА

Доп.точки доступа:
Lee, Younghoon; Ramamoorthy, Ramesh; Park, Chung-Ung; Schmidt, Francis J.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.12-04Б1.122

The tymobox, a sequence shared by most tymoviruses: its use in molecular studies of tymoviruses [Text] / Shouwei Ding [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1990. - Vol. 18, N 5. - P1181-1187 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: "Тимобокс" - последовательность, имеющаяся у большинства тимовирусов: ее использование при молекулярном исследовании тимовирусов
Аннотация: Определены 5'-концевые последовательности субгеномных РНК вируса желтой мозаики стальника-tin и вируса желтой мозаики кеннедии - JB (тимовирусов), а также положения в геномах их сайтов инициации транскрипции. Сравнение геномных последовательностей тимовирусов обнаружило две хорошо сохраненные области - одна у сайта инициации, другая более длинная последовательность из 16 нуклеотидов, находящаяся на расстоянии нескольких нуклеотидов от 5'-стороны старта матричной субгеномной РНК. Последнюю назвали "тимобоксом" ("tymobox"). Экспериментально доказано, что "тимобокс", как важный элемент промотора субгеномной РНК, может служить в качестве специфической мишени для рибозима, к-рый расщепляет соответствующие геномные фрагменты трех тимовирусов. Синтетический олигонуклеотид с последовательностью, комплементарной "тимобоксу", служит в качестве тимовирусспецифич. зонда для диагностики и идентификации тимовирусов, кроме вируса мозаики дикого огурца. Австралия, Res. School of Biological Sci., The Australian Nat. Univ., Canberra, ACT 2601. Библ. 37.

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ТИМОВИРУСЫ
ГЕНОМ
ТРАНСКРИПЦИЯ
САЙТЫ ИНИЦИАЦИИ

Доп.точки доступа:
Ding, Shouwei; Wohe, Jennifer; Keese, Paul; Mackenzie, Anne; Meek, Drew; Osorio-Keese, Marlene; Skotnicki, Mary; Srifah, Pattana; Torronen, Marjo; Gibbs, Adrian

1-20 21-24

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска