СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=РНК МАЛЫЕ<.>)

Общее количество найденных документов : 31
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-31

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.12-04Б1.384

Determination and comparative analysis of the small RNA genomic sequences of California encephalitis, Jamestown Canyon, Jerry Slough, Melao, Keystone and Trivittatus viruses (Bunyaviridae, genus Bunyavirus, California serogroup) [Text] / Michael D. Bowen [et al.] // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 3. - P559-572 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Обнаружение и сравнительный анализ геномных последовательностей малых РНК вирусов калифорнийского энцефалита, каньона Джеймстоун, болот Джерри, Мелао, Кейстоун, Тривиттатус (Bunyaviridae, род Bunyavirus, серогруппа Калифорния)
Аннотация: Определена нуклеотидная последовательность малых (S) геномных РНК шести представителей буньявирусов серогруппы Калифорния. РНК содержали перекрывающиеся открытые рамки считывания белка нуклеокапсида N и неструктурного белка NSs. Все открытые рамки считывания белка нуклеокапсида N имели длину в 708 нуклеотидов и кодировали полипептид из 235 аминокислотных остатков. Рамки считывания неструктурного белка кодировали полипептиды из 92 или 97 аминокислотных остатков. Высокий консерватизм показан для комплементарных концевых и богатых пурином последовательностей 3'-концевой некодирующей области малых РНК. США, Univ. of California at Berkeley, Berkeley, CA 94720. Библ. 69

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.31
Рубрики: БУНЬЯВИРУСЫ
СЕРОГРУППА КАЛИФОРНИЯ
РНК МАЛЫЕ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Bowen, Michael D.; Jackson, Andrew O.; Bruns, Thomas D.; Hacker, David L.; Hardy, James L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.08-04Б1.97

Epstein-Barr virus small RNA (EBER) genes: Differential regulation during lytic viral replication [Text] / Norbert Greifinegger [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 11. - P9323-9328 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Гены маленьких РНК (EBER) вируса Эпштейна-Барр: дифференциальная регуляция во время литической вирусной инфекции
Аннотация: Гены EBER-1 и EBER-2 вируса Эпштейна-Барр (ВЭБ) транскрибируются РНК-полимеразой III во всех клетках, в литически инфицированных клетках экспрессия генов EBER не обнаруживается. Изучение транскрипционной активности генов EBER в ядрах из литически инфицированных клеток показало, что гены EBER-1 и EBER-2 дифференциально регулируются негативно на уровне транскрипции во время переключения к литич. репликации ВЭБ. Эта негативная регуляция является ранним событием во время литич. репликации ВЭБ. Германия, Inst. Med. Mikrobiol. und Hygiene, Univ. Regensburg, D-93053 Regensburg. Библ. 26

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ЭПШТЕЙНА-БАРР
РНК МАЛЫЕ
ГЕНЫ
ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
ЛИТИЧЕСКАЯ ВИРУСНАЯ РЕПЛИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Greifinegger, Norbert; Jager, Michael; Kunz-Schughart, Leoni A.; Wolf, Hans; Schwarzmann, Fritz

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.06-04Б2.259

Identification and characterization of novel small RNAs in the aspS-yrvM intergenic region of the Bacillus subtilis genome [Text] / Satoru Suzuma [et al.] // Microbiology. - 2002. - Vol. 148, N 8. - P2591-2598 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Идентификация и характеристика новых малых РНК в межгенном районе aspS-yrvM в геноме Bacillus subtilis
Аннотация: Из Bacillus subtilis выделен и секвенирован новый вид РНК - BS190 РНК, определено положение соответствующего гена - межгенный спейсер aspS-yrvM. С помощью гибридизации по-Нозерну показано, что ген BS190 РНК транскрибируется в вегетативных клетках в виде предшественника BS201 РНК. После транскрипции 5'-конец первичного продукта гена процессируется с образованием зрелой BS190 РНК. Проведено компьютерное моделирование вторичной структуры данной РНК. Показано, что мутации гена BS190 РНК приводит к снижению скорости роста мутанта по сравнению с клетками дикого типа. Филогенетическое сравнение последовательности гена BS190 РНК с последовательностями из баз данных позволило выявить родственные гены в геномах Bacillus halodurans и Listeria monocytogenes. Inst. Biol. Sci., Univ. Tsukuba, Tsukuba-shi, Ibaraki 305-8572. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
BS190 РНК
ВЫДЕЛЕНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОЦЕССИНГ
BS201 РНК
КАРТИРОВАНИЕ
МЕЖГЕННЫЙ РАЙОН ASPS-YRVM
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Suzuma, Satoru; Asari, Sayaki; Bunai, Keigo; Yoshino, Keiko; Ando, Yoshinari; Kakeshita, Hiroshi; Fujita, Masaya; Nakamura, Kouji; Yamane, Kunio

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.04-04Б2.257

A novel sRNA component of the carbon storage regulatory system of Escherichia coli [Text] / Thomas Weilbacher [et al.] // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 48, N 3. - P657-670 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: sРНК - новый компонент регуляторной системы запасания углерода Escherichia coli
Аннотация: Малая нетранслируемая РНК (sРНК) CsrC из Escherichia coli, состоящая из 245 н., участвует в регуляции биосинтеза гликогена. CsrC связывает множественные копии CsrA, белка, регулирующего основной поток углерода на посттранскрипционном уровне, а также образование биопленок и подвижность у E. coli. CsrC дублирует функции сходной sРНК - CsrB; обе sРНК содержат одинаковые неполные повторы (18 в CsrB и 9 в CsrC), локализованные в основном на петлях предсказанных булавовидных выростов, на которых идет связывание CsrA. Транскрипция гена csrC увеличивается при вступлении в стационарную фазу роста и косвенно активируется CsrA через регулятор ответа UvrY. Поскольку CsrB и CsrC инактивируют CsrA и одновременно их синтез зависит от CsrA, csrB нулевой мутант вызывает компенсаторное увеличение уровня CsrC и наоборот. Показано присутствие гомологов csrC у нек-рых энтеробактерий. Обсуждаются регуляторные и эволюционные приложения полученных результатов. США, Dept. Mol. Biol. & Immunol., Univ. North Texas Yealth Sci. Cent. at Fort Worth, Fort Worth, TX 76107-2699. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
CSRA
РНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ СИСТЕМЫ
ГЛОКОБАЛЬНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ГЛИКОГЕН
БИОСИНТЕЗ
РЕГУЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Weilbacher, Thomas; Suzuki, Kazushi; Dubey, Ashok K.; Wang, Xin; Gudapaty, Seshigirao; Morozov, Igor; Baker, Carol S.; Georgellis, Dimitris; Babitzke, Paul; Romeo, Tony

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.02-04Б2.297

Adamidi, Catherine.
A group II intron inserted into a bacterial heat-shock operon shows autocatalytic activity and unusual thermostability [Text] / Catherine Adamidi, Olga Fedorova, Anna Marie Pyle // Biochemistry. - 2003. - Vol. 42, N 12. - P3409-3418 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Интрон группы II, встроенный в бактериальный оперон теплового шока, обладает аутокаталитической активностью и необычной термостабильностью
Аннотация: Интронные РНК группы II складываются в каталитически активные структуры, которые катализируют свой собственный сплайсинг и последующую транспозицию в ДНК. Описано клонирование, секвенирование и механистические характеристики нового интрона группы II из бактерии Azotobacter vinelandii (AV интрон). AV интрон во многом сходен с интронами группы IIВ 1 класса, в то же время AV интрон отличается высоким содержанием Г+Ц-пар и присутствием необычных инсерционных последовательностей. Интрон AV является первым бактериальным интроном, который обнаружен в генах "домашнего хозяйства", который в данном случае кодируют белок теплового шока (hsp60). Локализация интрон AV указывает на его потенциальную роль в регуляции ответа на тепловой шок. Кинетический анализ установил, что самосплайсинг интрона AV активируется только при повышенных температурах. Таким образом, получены указания на существование нового пути регуляции ответа на тепловой шок у прокариотов и приводится первый пример термотолерантной интронной РНК группы II. США, Howard Hughes Med. Inst., Yale Univ., New Haven, Connecticut 06520. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ИНТРОНЫ
ГРУППА II ИНТРОН AV
РНК МАЛЫЕ
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ТЕПЛОВОЙ ШОК
РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ ТЕПЛОВОГО ШОКА
AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)

Доп.точки доступа:
Fedorova, Olga; Pyle, Anna Marie

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.03-04Б2.234

Loss of Hfq activates the 'сигма'{E}-dependent envelope stress response in Salmonella enterica [Text] / Nara Figueroa-Bossi [et al.] // Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 62, N 3. - P838-852 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Утрата Hfq активирует 'сигма'{E}-зависимый стрессовый ответ оболочки у Salmonella enterica
Аннотация: С целью идентификации мишеней для Hfq-зависимой sРНК (малой РНК) регуляции у Salmonella enterica был проведен скрининг библиотеки случайных lagZ хромосомных вставок и отобраны клоны, содержащие трансляционные lacZ слияния, 'бета'-галактозидазная активность которых изменяется в присутствии или отсутствии Hfq. У большинства полученных изолятов Hfq вызывал подавление экспрессии lacZ-слияний и оказалось, что эти гены относятся к 'сигма'{E}-регулону, активация которого является стрессовым ответом на реакцию оболочки клетки на внешние воздействия. Активации 'сигма'{E}-регулона предшествует протеолитический гидролиз анти-'сигма'{E} фактора RseA. Было установлено, что гидролиз RseA идет более интенсивно в штаммах, утративших Hfq и он может быть полностью остановлен экспрессией hfq с индуцибельного промотора. Таким образом, утрата функции Hfq влияет на биогенез оболочки и имитирует стрессовые условия и, следовательно, индуцирует конститутивный 'сигма'{E}-зависимый ответ. У мутанта RseA, активация 'сигма'{E}-зависимого ответа вызывает Hfq-зависимое подавление экспрессии генов белков наружной мембраны (lamB, ompA, ompC, ompF). Показано, что частично подавление экспрессии ompA определяется 'сигма'{E}-зависимым накоплением sРНК MicA. Было установлено, что ген micA находится под контролем 'сигма'{E} и что определяемой протеазой DegS высвобождение 'сигма'{E} и необходимое условие для накопления MicA РНК перед вступлением в стационарную фазу. Подобный механизм, с участием еще неидентифицированных sРНК может быть основой, зависимой от стадии роста культуры регуляции других мРНК белков наружной мембраны. Франция, Centre Genet. Mol., CNRS, 91198, Gif-sur-Yvette. Библ. 56

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
HFQ SРНК
СТРЕССОВЫЙ ОТВЕТ
ВНЕШНИЕ УСЛОВИЯ
КЛЕТОЧНАЯ ОБОЛОЧКА
БИОГЕНЕЗ
СИГМА E-РЕГУЛОН
БЕЛОК
БЕЛКИ НАРУЖНОЙ МЕМБРАНЫ
SALMONELLA ENTERICA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Figueroa-Bossi, Nara; Lemire, Sebastien; Maloriol, Daniela; Balbontin, Roberto; Casadesus, Josep; Bossi, Lionello

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.04-04Б2.85

The small RNA GlmY acts upstream of the sRNA GlmZ in the activation of glmS expression and is subject to regulation by polyadenylation in Escherichia coli [Text] / Birte Reichenbach [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2008. - Vol. 36, N 8. - P2570-2580 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Малая РНК GlmY действует перед sРНК GlmZ при активации экспрессии glmS и является объектом регуляции путем аденилирования у Escherichia coli
Аннотация: Экспрессия гена glmS, кодирующего глюкозамин-6-фосфатсинтазу, регулируется по механизму обратной связи глюкозамин-6-фосфатом при участии малых РНК GlmZ и GlmY. Установлено, что на фоне снижения концентрации глюкозамин-6-фосфата в клетке накапливается непроцессированная форма GlmZ, которая стабилизует транскрипт glmS, за счет чего активируется экспрессия последнего. Кроме того, известно, что мутации в генах yhbJ и pcnB (поли(А)-полимераза - PAP-I) вызывают накопление GlmZ и как следствие активацию экспрессии glmS. В данной работе показано, что sРНК GlmY не связана непосредственно с экспрессией гена glmS (глюкозоамин-G-фосфатсинтаза), но именно ее накопление при дефиците глюкозамин-6-фосфата приводит к увеличению содержания GlmZ, который в итоге активирует экспрессию glmS. У glmZ мутантов GlmY не влияет на экспрессию glmS, тогда как в отсутствии GlmY искусственная экспрессия GlmZ активирует синтез GlmS. Кроме того, установлено, что PAP-I действует в самом начале этого регуляторного пути, осуществляя полиаденилирование, а, следовательно, дестабилизацию GlmY: в pcnB мутантах наблюдается накопление GlmY и индукция glmS за счет стабилизации полноразмерной GlmZ. Таким образом, описан регуляторный каскад, содержащий две малые РНК, которые реагируют на содержание глюкозамин-6-фосфата, и стабильность которых контролируется полиаденилированием. Германия, Dep. Gen. Microbiol., Inst. Microbiol. & Genet., Gejrg-August Univ., Grisebachstrasse 8, D-37077 Gottingen. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
GLMY SРНК
GLMZ SРНК
ГЕНЫ
ГЕН GLMS ГЛЮКОЗАМИН-6-P-СИНТАЗЫ
РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Reichenbach, Birte; Maes, Alexandre; Kalamorz, Falk; Hajnsdorf, Eliane; Gorke, Boris

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.10-04Б2.84

Pichon, Christophe.
Small RNA gene identification and mRNA target predictions in bacteria [Text] / Christophe Pichon, Brice Felden // Bioinformatics. - 2008. - Vol. 24, N 24. - P2807-2813 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Идентификация генов малых РНК и предсказания мишеней мРНК в бактериях
Аннотация: Большинство малых РНК играют роль в регуляции экспрессии генов в ответ на изменения окружающей среды. Показали, что большинство малых РНК действует по антисмысловому механизму благодаря взаимодействию с мишенями мРНК, обычно окружающих сайты старта трансляции, чтобы модулировать экспрессию генов на посттранскрипционном уровне. Некоторые sРНК модулируют активность белков или искажают структуру других макромолекул. Разработаны методы in silico для детекции большинства sРНК. Компьютерный анализ позволил предсказать существование избытка sРНК, что подтверждено экспрессией in vivo. В обзоре представлены результаты последних достижений в области детекции генов малых РНК и мишеней мРНК в бактериях и методы их экспериментального тестирования. Контакт: bfelden@univ-rennes1.fr. Франция, Unite Pathogenie Bacterienne des Muqueuses, Inst. Pasteur, 25-28 Rue du Docteur Roux, 75724, Paris

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
ГЕНЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
МИШЕНИ
МРНК
ПРЕДСКАЗАНИЕ
МЕТОДЫ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
SРНК МАЛЫЕ
ИЗБЫТОК
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Felden, Brice

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.04-04Б2.157

Mandin, Pierre.
A genetic approach for finding small RNAs regulators of genes of interest identifies RybC as regulating the DpiA/DipB two-component system [Text] / Pierre Mandin, Susan Gottesman // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 72, N 3. - P551-565 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Генетический подход к поиску регуляторов генов малых РНК позволил идентифицировать RybC как регулятор двухкомпонентной системы DpiA/DpiB
Аннотация: В Escherichia coli самый большой класс малых регуляторных РНК связывается с РНК шапероном Hfq и регулирует стабильность или трансляцию специфичных мРНК. Недавние исследования показали, что некоторые мРНК могут подвергаться пост-трансляционной регуляции sРНК, но пока нет метода для идентификации регуляторов. В данной работе представили метод для получения сшивок интересующих генов с репортерным геном lacZ под контролем P[BAD] - индуцибельного промотора. Затем можно использовать библиотеку мультикопийных плазмид E. coli для скрининга малых РНК, влияющих на активность сшивки. Метод такого скрининга был впервые применен к гену dpiB из оперона dpiBA, кодирующего двухкомпонентную систему сигнальной трансдукции, вовлеченную в SOS-ответ на бета-лактамы. Малая РНК-RybC отрицательно регулировала экспрессию dpiB. С помощью сшивки и компенсаторных мутаций в sРНК RybC показали, что RybC направленно спаривается с мРНК dpiBA. США, Laboratory of Molecular Biology, National Cancer Inst., Center for Cancer Research, Bethesda, MD 20892. Библ. 46

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН ДВУХКОМПОНЕНТНОЙ СИСТЕМЫ DPIBA
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОТРИЦАТЕЛЬНАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
РНК МАЛЫЕ
SРНК RYBC
СШИВКИ
ГЕН LACZ
ФУНКЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Gottesman, Susan

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.06-04Б2.134

Identification and gene disruption of small noncoding RNAs in Streptomyces griseus [Text] / Takeaki Tezuka [et al.] // J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 5. - P4896-4904 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Идентификация и разрушение генов малых некодирующих РНК у Streptomyces griseus
Аннотация: Идентифицировали 12 малых некодирующих РНК (sРНК), кодируемых на межгенных районах (IGRs) хромосомы Streptomyces griseus и высококонсервативных у S. coelicolor A3 и S. avermitilis. Показали, что на экспрессию семи из них влияет мутация adpA. Для исследования функций sРНК in vivo делетировали каждый из двенадцати генов sРНК на хромосоме S. griseus и сравнили фенотипы полученных мутантов с таковым дикого типа. Детектируемых фенотипических изменений не обнаружили. Данная работа представляет первый функциональный анализ sРНК у Streptomyces. Япония, Dep. of Biotechnology, Graduate School of Agriculture and Life Sciences, Univ. of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657. Ил. 6. Табл. 2. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ НЕКОДИРУЮЩИХ МАЛЫХ РНК
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИИ
ДЕЛЕЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ФЕНОТИПЫ
МУТАНТОВ
РНК МАЛЫЕ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
STEPTOMYCES GRISEUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Tezuka, Takeaki; Hara, Hirofumi; Ohnishi, Yasuo; Horinouchi, Sueharu

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.10-04Б2.150

Photooxidative stress-induced and abundant small RNAs in Rhodobacter sphaeroides [Text] / Bork A. Berghoff [et al.] // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 6. - P1497-1512 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Индуцируемые фотоокислительным стрессом и представленные в большом количестве малые РНК Rhodobacter sphaeroides
Аннотация: В результате поиска в геноме Rhodobacter sphaeroides малых РНК (sРНК), участвующих в регуляторном ответе на синглетный кислород {1}O[2], индуцируемый при фотооксидативном стрессе, было обнаружено 20 sРНК-18sРНК транскрибируемых с межгенных районов и 2 антисмысловых sHYR. Четыре из идентифицированных sРНК могут участвовать в регуляции генов при окислительном и фотоокислительном стрессе. Одна из них индуцируется {1}O[2] и ее экспрессия зависит от внецитоплазматического фактора транскрипции RpoE. Две SРНК, индуцируемые {1}O[2] и супероксидом O{-}[2] котранскрибируются с предшествующим генами, находящимися под контролем промотора, регулируемого альтернативными сигма факторами RpoH[1] и RPOH[II]. Наиболее представленная sРНК процессировалась в присутствии {1}O[2], но не O{-}[2]. Отсутствие РНК чаперона Hfg изменяло время полу-жизни. представленность и процессинг SРНК, индуцируемых {1}O[2]. Ортологи трех генов SРНК присутстувуют у различных альфа-протеобактерий, но большинство из них уникальны для R. sphaeroides или других видов Rhodobacter. Германия, Inst. Mikrobiol. & Molekulabiol., Univ. Giesstn, Heinrich-Buff-Ring 26, 35392, Gessen. Библ. 77

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФОТООКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС
СИНГЛЕТНЫЙ КИСЛОРОД
{1}O[2]
РНК МАЛЫЕ
ПРОЦЕССИНГ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
SРНК
RHODOBACTER SPHAEROIDES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Berghoff, Bork A.; Glaeser, Jens; Sharma, Cynthia M.; Vogel, Jorg; Klug, Gabriele

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.10-04Б2.182

Hobbs, Errett C.
Small RNAs and small proteins involved in resistance to cell envelope stress and acid shock in Escherichia coli: Analysis of a bar-coded mutant collection [Text] / Errett C. Hobbs, Jilian L. Astarita, Gisela Storz // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 1. - P59-67 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Малые РНК и малые белки, участвующие в устойчивости клеточной оболочки к стрессу и кислотному шоку в Escherichia coli: анализ bar-кодируемой коллекции мутантов
Аннотация: Более 80 малых регуляторных РНК (sРНК) и 60 белков, состоящих из 16-50 аминокислот (малых белков) кодируются геномом Escherichia coli. Провели скрининг ДНК 125 bar-кодируемых мутантов для идентификации новых фенотипов стресса клеточной оболочки и кислотного шока, связанных с делецией генов, кодирующих sРНК и малые белки. 9 делеционных мутантов (ssrA, micA, ybaM, ryeE, yqcG, sroH, ybhT, yobF и glmY) были чувствительны к стрессу клеточной оболочки, а два - устойчивы (rybB и blr). Делеционные мутанты генов, кодирующие четыре малых белка (yqgB, mgrB, yobF и yceO) были чувствительны к острому кислотному стрессу. Более детальное исследование фенотипа SsrA привело к заключение, что освобождение рибосомы критически важно для устойчивости к стрессу клеточной оболочки. Коллекция bar-кодируемых мутантов может быть проверена на чувствительность или устойчивость к любым стрессовым условиям. США, Cell Bi0logy and Metabolism Program, Eunice Kennedy Shriver National Inst. of Child Health and Human Development, Bethesda, Maryland 20892-5430. Библ. 56

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РНК МАЛЫХ РЕГУЛЯТОРНЫХ
ГЕНЫ МАЛЫХ БЕЛКОВ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
РНК МАЛЫЕ
МАЛЫЕ БЕЛКИ
УЧАСТИЕ В
УСТОЙЧИВОСТЬ
СТРЕСС
КЛЕТОЧНАЯ ОБОЛОЧКА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
BAR-МУТАНТЫ
КОЛЛЕКЦИЯ

Доп.точки доступа:
Astarita, Jilian L.; Storz, Gisela

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.11-04Б4.134

Moon, Kyung.
A PhoQ/P-regulated small RNA regulates sensitivity of Escherichia coli to antimicrobial peptides [Text] / Kyung Moon, Susan Gottesman // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 6. - P1314-1330, 1289-1294 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: PhoQ/P - регулируемые малые РНК регулируют чувствительность Escherichia coli к антимикробным пептидам
Аннотация: Среди 80 малых РНК, идентифицированных в Escherichia coli, примерно одна треть связывается с РНК шапероном Hfg. Hfg стабилизирует эти РНК in vivo и стимулирует спаривание c мишенями in vitro. Идентифицировали новую Hfg-зависимую РНК, названную MgrR. Экспрессия MgrR требует двухкомпонентной системы PhoQ/PhoP, регулятор ответа PhoP активен при низких концентрациях Mg{2+} и является важным регулятором вирулентности в Salmonella, mgrR также обнаружен во многих видах сальмонелл. Идентифицированные с помощью микрочипов отрицательно регулируемые мишени MgrR, включают ген eptB, участвующий в липополисахаридной модификации, и mgrR, были десятикратно более устойчивы к полимиксину В, чем клетки дикого типа. Таким обрзом, снижение коцентрации Ng{2+} ведет к экспрессии MgrR, изменяющей липополисахариды. Ранее показали, что малые РНК регулируют многие белки наружной мембраны. В данной работе установили, что липополисахариды также подвержены регуляции малыми РНК. США, Lab of Molecular Biology, Center for Cancer Res. Nat. Cancer Unst., Bethesda, MD 20892. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
HFG-ЗАВИСМАЯ РНК
MGRR
ВЛИЯНИЕ НА
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
АНТИМИКРОБНЫЕ ПЕПТИДЫ
ПОЛИМИКСИН В
SALMONELLA (BACT.)
ВЫЖИВАЕМОСТЬ

Доп.точки доступа:
Gottesman, Susan

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.02-04Б2.168

Durand, Sylvain.
Reprogramming of anaerobic metabolism by the FnrS small RNA [Text] / Sylvain Durand, Gisela Storz // Mol. Microbiol. - 2010. - Vol. 75, N 5. - P1215-1231 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Репрограммирование анаэробного метаболизма под действием малой РНК FnrS
Аннотация: Малые РНК(sРНК) модулируют метаболизм в ответ на стимулы внешней среды. Описали Hfq-связывающую sРНК (FnrS), экспрессия которой индуцируется переходом от аэробных к анаэробным условиям, и которые снижают уровни мРНК, кодирующих ферменты метаболизма. На минимальной среде анаэробная индукция сильно зависела от FnrS, а также и от регуляторов транскрипции ArcA и CRP. Анализ экспрессии показал, что под действием сверхэкспрессии FnrS снижаютя уровни примерно 32 мРНК, 15 из которых предсказаны при помощи TargetRNA. Мутационный анализ выявил, что два отдельных района оснований FnrS спариваются с различными наборами мишеней мРНК. Предположили, что FnrS простирается вдоль регулона FNR и повышает эффективность анаэробного метаболизма путем репрессирования синтеза ферментов, не являющихся необходимыми при этих условиях. США, Cell Biology and Metabolism Program, Eunice Kennedy Shriver National Inst. of Child Health and Human Development, Bethesda, MD. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АНАЭРОБНЫЙ МЕТАБОЛИЗМ
РЕПРОГРАММИРОВАНИЕ
РНК МАЛЫЕ
FNRS
СПАРИВАНИЕ
МИШЕННЫЕ МРНК
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Storz, Gisela

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.06-04Б2.190

The importance of the small RNA chaperone Hfq for growth of epidemic Yersinia pestis, but not Yersinia pseudotuberculosis, with implications for plaque biology [Text] / Guangchun Bai [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 16. - P4239-4245 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Важность малой РНК шаперона Hfq для роста эпидемичной Yersinia pestis, но не для Yersinia pseudotuberculosis, в связи с биологией чумы
Аннотация: Возбудитель чумы Yersinia pestis совсем "недавно" эволюционировал из Yersinia pseudotuberculosis. Показано, что делеция в гене hfq вызывает серьезное угнетение роста при 37'ГРАДУС'С у Y. pestis, но не влияет на рост Y. pseudotuberculosis. Штаммы известных эпидемических биоваров Y. pestis реагируют на мутацию в hfq аналогичным образом. Таким образом Hfq, как и, возможно, малые РНК, определяют уникальную биологию чумной палочки. США, Wadsworth Center, New York St. Dept. Health, 120 New Scotland Av., P.O. Box 22002, Albany, New York 12201-2002. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: ЧУМА
БИОЛОГИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
РНК МАЛЫЕ
ПОСТТРАНСКРИПЦИОННЫЕ РЕГУЛЯТОРЫ
HFQ ШАПЕРОН
YERSINIA PESTIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bai, Guangchun; Golubov, Andrey; Smith, Eric A.; McDonough, Kathleen A.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.07-04Б2.183

A single qrr gene is necessary and sufficient for LuxO-mediated regulation in Vibrio fischeri [Text] / Tim Miyashiro [et al.] // Mol. Microbiol. - 2010. - Vol. 77, N 6. - P1556-1567 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Единственный ген qrr необходим и достаточен для LuxO-опосредованной регуляции в Vibrio fischeri
Аннотация: Используя биоинформативный подход, определили число генов qrr в полностью секвенированных членах семейства Vibrionaceae. Филогенетический анализ привел к заключению, что наиболее общий предок всех Vibrionaceae нес одиночный ген qrr, который дуплицировался и дивергировал в многочисленные гены qrr у настоящих родов вибрионов. Чтобы продемонстрировать, что единственный ген qrr достаточен, чтобы опосредовать репрессию LitR, общего регулятора в Vibrio fischeri, провели серию генетических и фенотипических анализов пути LuxO. Полученные результаты внесли вклад в лучшее понимание происхождения этих путей в вибрионах, а также эволюции и дивергенции других sРНК внутри различных бактериальных родов. США, Dep. of Med. Microbiology and Immunology, Univ. of Visconsin School of Med. And Public Health, 1550 Linden Drive, Madison, WI 53706-1521

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ОБЩИЙ РЕГУЛЯТОР LITR
РЕПРЕССИЯ
LUXO-ОПОСРЕДОВАННАЯ
НЕОБХОДИМОСТЬ
ГЕН QRR
РНК МАЛЫЕ
QRR
ЭВОЛЮЦИЯ
ДИВЕРГЕНЦИЯ
VIBRIO FISCHERI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Miyashiro, Tim; Wolenberg, Michael S.; Cao, Xiaodan; Oehlert, Dane; Ruby, Edward G.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.04-04Б2.177

CodY activates transcription of a small RNA in Bacillus subtilis [Text] / Heike Preis [et al.] // J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 17. - P5446-5457 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: CodY активирует транскрипцию малой РНК у Bacillus subtilis
Аннотация: Исследовали экспрессию и регуляцию одной из малых РНК (sRNAs), ранее описанных у Bacillus subtilis, - BsrF (ранее обьзначаемую как SR2). Показали, что BsrF экспрессируется в сложной и минимальной средах на всех стадиях роста B. subtilis. При этом на рост B. subtilis не влияет ни сверхэкспрессия, ни деелция bsrF. Используя технику биоттинга по Нозерну, генных слияний (репортерного гена lacZ), in vitro транскрипции и футпринтинга с ДНК-азой I, показали, что транскрипция bsrF активируется CodY (глобальным регулятором экспрессии различных генов у B. subtilis) в присутствию разветвленных аминокислот и ГТФ. Германия, Friedrich-Schiller-Universitat, Jena, Biologisch-Pharmazeutische Fakultat, AG Bakteriengenetik, Philosophenweg 12, Jena D-07743. Ил.8. Табл.2. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
BSRF ЭКСПРЕССИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
АКТИВАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ CODY
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Preis, Heike; Eckart, Rita A.; Gudipati, Rajani K.; Heidrich, Nadja; Brantl, Sabine

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.04-04Б2.185

Pervasive post-transcriptional control of genes involved in amino acid metabolism by the Hfq-dependent GcvB small RNA [Text] / Cynthia M. Sharma [et al.] // Mol. Microbiol. - 2011. - Vol. 81, N 5. - P1144-1163, 1129-1132 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Первазивный пост-транскрипционный контроль генов, участвующих в метаболизме аминокислот под влиянием Hfq-зависимой малой РНК GcvB
Аннотация: GcvB - одна из наиболее консервативных Hfq-зависимых малых РНК в грамотрицательных бактериях, репрессирующая несколько АВС транспортеров аминокислот. Использовали комбинацию двух методов - биокомпьютерного предсказания мишени и общегеномного подхода и установили, что GcvB управляет большим посттранскрипционным регулоном, влияющим на 1% генов Salmonella благодаря консервативному G/U - богатому домену R1. Число валидированных мишеней GcvB в результате увеличилось до 20 и более, а также удвоилось число регулируемых аминокислотных транспортеров. В отличие от ранее описанного действия через единственный R1 домен, GcvB репрессирует транспортер глицина путем спаривания оснований. Эта новая способность GcvB ведет к возможности регулирования по принципу обратной связи глицин-ответного синтеза GcvB. Новые открытые мишени мРНК вовлечены в метаболизм аминокислот, включая общий регулятор Lrp. Германия, Inst. of Molecular Infection Biology, Research Centre of Infectious Disease, Univ. of Wurzburg

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.03
Рубрики: АМИНОКИСЛОТЫ
МЕТАБОЛИЗМ
УЧАСТИЕ
РНК МАЛЫЕ
HFQ-ЗАВИСИМЫЕ
GCVB
ТРАНСПОРТЕРЫ
АВС
РЕПРЕССИЯ
МЕТОДЫ
МИШЕНИ БИОКОМПЬЮТЕРНОЕ ПРЕДСКАЗАНИЕ

Доп.точки доступа:
Sharma, Cynthia M.; Papenfort, Kai; Pernitzsch, Sandy R.; Mollenkopf, Hans-Joachim; Hinton, Jay C.D.; Vogel, J`:org

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 13.03-04Б4.121

Small regulatory RNAs control the multi-cellular adhesive lifestyle of Escherichia coli [Text] / Mikkel Girke Jorgensen [et al.] // Mol. Microbiol. - 2012. - Vol. 84, N 1. - P36-50, 1-5 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Малые регуляторные РНК контролируют способ жизни Escherichia coli в виде многоклеточной адгезивной пленки
Аннотация: Рассматриваются молекулярно-генетические основы перехода способа жизни Escherichia coli от единичных подвижных клеток в неподвижное состояние многоклеточной адгезивности, способствующее формированию поверхностных биопленок. При этом происходит репрограммирование генной экспрессии, связанное с ингибированием флагеллярного синтеза и активацией синтеза внеклеточных образований, важных для аггрегации клеток и адгезии на биотической или абиотической поверхности. С помощью биоинформатики, генетического и биохимического анализов идентифицировали три малые РНК (sРНКs), являющиеся репрессорами трансляции главного регулятора внеклеточного синтеза CsgD: неохарактеризованную Hfg-связывающую sРНК McaS и описанные ранее активатор трансляции proS RprA и глобальный регулятор метаболизма аминокислот GcvB. Дания, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Univ. of Southern Denmark, Odense

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
РЕПРЕССОРЫ ТРАНСЛЯЦИИ ГЛАВНОГО РЕГУЛЯТОРА ВНЕКЛЕТОЧНОГО СИНТЕЗА CSGD
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ПЛЕНКА
ФОРМИРОВАНИЕ
АДГЕЗИЯ КЛЕТОК
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ЕДИНИЧНЫЕ КЛЕТКИ
ПЕРЕХОД
МНОГОКЛЕТОЧНАЯ АДГЕЗИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Jorgensen, Mikkel Girke; Nielsen, Jesper S.; Boysen, Anders; Franch, Thomas; Moller-Jensen, Jakob; Valentin-Hansen, Poul

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.216

A small RNA that regulates motility and biofilm formation in response to changes in nutrient availability in Escherichia coli [Text] / Maureen K. Thomason [et al.] // Mol. Microbiol. - 2012. - Vol. 84, N 1. - P17-35, 1-5 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Малые РНК, регулирующие подвижность и образование биопленки в ответ на изменения доступности питательных веществ у Escherichia coli
Аннотация: Малые регуляторные РНК бактерий (sРНКs) индуцируются в ответ на специфические сигналы окружающей среды и посредством комплементарного связывания с мишеневыми м/РНК влияют на процесс трансляции или стабильность мРНК. Приведены результаты исследования sPHK IS061/TsrA, предсказанной ранее с помощью компьютерного скрининга. Показали, что данная sPHK регулирует три аспекта формирования биопленки у Escherichia coli, в связи с чем ей дали новое название McaS (sРНК многоклеточной адгезивности). McaS репрессирует транскрипционный регулятор биогенеза внеклеточных образований "curli" csgD, активирует основной транскрипционный регулятор флагеллярного синтеза flhD и регулирует трансляцию порина PgaA. На основании полученных данных предположили, что в ответ на ограничение доступных нутриентов повышенные уровни McaS модулируют переход от подвижного к неподвижному образу жизни, связанному с образованием биопленки. США, Cell Biology and Metabolism Program, Eunice Kennedy Shriver National Inst. of Child Health and Human Development, Bethesda, MD

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: РНК МАЛЫЕ
SPHK МНОГОКЛЕТОЧНОЙ АДГЕЗИВНОСТИ
MCAS
ВЛИЯНИЕ НА
ПОДВИЖНОСТЬ
БИОПЛЕНКА
ОБРАЗОВАНИЕ
РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПИТАТЕЛЬНЫЕ ВЕЩЕСТВА
ОГРАНИЧЕНИЕ ДОСТУПНОСТИ

Доп.точки доступа:
Thomason, Maureen K.; Fontaine, Fanette; De, Lay Nicholas; Storz, Gisela

1-20 21-31

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска