СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=PPGPP<.>)

Общее количество найденных документов : 40
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.11-04Б2.110

A transcriptional regulator and ABC transporters link stress tolerance, (p)ppGpp, and genetic competence in Streptococcus mutans [Text] / Kinda Seaton [et al.] // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 4. - P862-874 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Транскрипционный регулятор и транспортеры АВС связывают толерантность к стрессу, (p)ppGpp и генетическую компетентность и Streptococcus mutans
Аннотация: С помощью биоинформативного анализа предсказали, что SMu0836 и SMu0837 кодируют АВС экспортеры, которые обозначили rcrPQ. Smu0835 (rcrR) кодирует трансркипционный регулятор семейства MarR. Используя обратно-транскриптазную ПЦР и количественную ПЦР, установили, что RcrR функционирует как аутогенный негативный регулятор экспрессии оперона rcrRPQ. Мутант, в котором имеется полярная инсерция, рос медленнее штамма дикого типа. Замена rcrR на неполярный маркер устойчивости к антибиотикам ('ДЕЛЬТА'835np), ведующая к сверхэкспрессии rcrPQ, привела к получению штамма, не трансформируемого эндогенной ДНК. Совокупность всех полученных результатов привела к заключению, что продукты генов rcrRPQ играют важную роль в физиологическом гомеостазе и толерантности к стрессу за счет связи метаболизма (p)ppGpp, толерантности к кислотному и окислительному стрессу и генетич. компетентности. США, Dep. of Oral Biology, College of Dentistry, Univ. of Florida, Gainesville, Florida 32610. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ГЕНЫ АВС ЭКСПОРТЕРОВ RCRRPQ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ АУТОГЕННЫЙ НЕГАТИВНЫЙ РЕГУЛЯТОР RCRR
ТОЛЕРАНТНОСТЬ
СТРЕСС
МЕТАБОЛИЗМ (P)PPGPP СИНТАЗ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОМПЕТЕНТНОСТЬ
STREPTOCOCCUS MATUNS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Seaton, Kinda; Ahn, Sang-Joon; Sagstetter, Ann M.; Burne, Robert A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.342

Acid- and multistress-resistant mutants of Lactococcus lactis: Identification of intracellular stress signals [Text] / Fabien Rallu [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 3. - P517-528 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Кислото- и мультистресс-устойчивые мутанты Lactococcus lactis: идентификация внутриклеточных стрессовых сигналов
Аннотация: Для изучения механизмов адаптации к кислым средам у лактококков в Lactococcus lactis MG1363 получен ряд инсерционных мутаций, приводящих к кислотоустойчивости. 21 независимая мутация локализована в 18 локусах. Часть этих локусов детерминирует транспортные системы или основной метаболизм. Получ. мутации разделены на 4 фенотипич. класса, 2 из к-рых проявляли резистентность ко многим стрессам. Показано, что у L. lactis сигналом, определяющим уровень индукции ответа на стресс, является внутриклеточ. кол-во фосфатов и (p)ppGpp. Получ. рез-ты указывают на связь между физиологич. состоянием клетки и степенью ее устойчивости к стрессам, а также на роль строгого контроля в регуляции ответа на кислотный стресс. Франция [Maguin E.], Genet. Microb., URLGA, INRA, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex. Библ. 82

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)
ШТАММ MG1363
ГЕНЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ МУТАЦИИ
КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ МУТАЦИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КИСЛОТНЫЙ СТРЕСС
ВНУТРИКЛЕТОЧНЫЙ СИГНАЛ
СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ
(P)PPGPP

Доп.точки доступа:
Rallu, Fabien; Gruss, Alexandra; Ehrlich, S.Dusko; Maguin, Emmanuelle

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.266

Activities of constitutive promoters in Escherichia coli [Text] / S. -T. Liang [et al.] // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 292, N 1. - P19-37 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Активности конститутивных промоторов в Escherichia coli
Аннотация: Сконструировали коллекцию изогенных штаммов Escherichia coli. Каждый штамм содержал нуклеотидную последовательность (НП), представляющую смесь промотора и гена lacZ. Исследовали следующие промоторы: P[spc] spc рибосомного оперона, P[L] фага 'лямбда', P[bla] 'бета'-лактамазного гена, P[РНКI] и P[РНКII] из РНКI репликационного контрольного гена и РНК II праймера из плазмиды pBR 322, P1 и P2 из рРНК оперона rrn. Указанные промоторы являются конститутивными. Для исследования промоторов применили метод определения дозы гена, гибридизацию мРНК и подсчет 'бета'-галактозидазной активности. Значения активностей промоторов для различных мРНК(т) имели тенденцию к снижению в процессе роста бактериальных клеток в LB среде, по сравнению с результатами, полученными в среде с глюкозой и аминокислотами. Предполагают, что нек-рые изученные промоторы имеют низкие значения K[m], к-рые показывают, что они насыщаются РНК-полимеразой при высоких скоростях роста бактериальных клеток и их активности становятся независимыми от концентрации свободной РНК-полимеразы. Предполагают, что активности промотора rrn зависят как от изменения концентрации РНК-полимеразы, так и от концентрации ppGpp. Вероятно, мРНК промоторы P[spc], P[L], P[bla] и P[РНКI], также как рРНК промотор P2rrnB не находится под сильным влиянием концентрации ppGpp во время экспоненциальной фазы роста. США, Program in Molecular and Cell Biology, Univ. of Texas at Dallas, Richardson TX, 75083-0688. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
P[SPC]
P[L]
P[BLA]
P[РНКI]
КОНСТИТУТИВНЫЕ
АКТИВНОСТЬ
ЗАВИСИМОСТЬ
КОНЦЕНТРАЦИЯ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Liang, S.-T.; Bipathnath, M.; Xu, Y.-C.; Chen, S.-L.; Dennis, P.; Ehrenberg, M.; Bremer, H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 15.04-04Б4.125

Characterization of a bifunctional enzyme with (p)ppGpp-hydrolase/synthase activity in Leptospira interrogans [Text] / P. He [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2013. - Vol. 348, N 2. - P133-142 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Характеристика у Leptospira interrogans бифункционального фермента с активностями (р)ррGрр-гидролазы/синтазы
Аннотация: Считается, что за изменения внутриклеточной конц-ии (р)ppGpp (I) у E. coli ответственны 2 гомолога, RelA и SpoT, в то время кау у грамположительных бактерий существует только единичный RelA/SpoT-фермент. У L. interrogans (L.i.) выявили бифункциональный белок с активностями I-гидролазы/синтазы, к-рый способен полностью комплементировать двойной relA/spoT-мутант E. coli. Он кодируется геном rel[Lin], белок функционирует в качестве I-деградазы и I-синтазы в условиях аминокислотного стресса L.i. и недостаточности С-источников. Способностью восстанавливать рост двойных мутантов E. coli обладают N-концевые HD и PSD домены. Очищенные полноразмерный белок и его N-домены проявляют высокую активность синтеза I in vitro. Обсуждают роль бифункционального белка Rel[Lin] у L.i. в поддержании базального уровня I для регуляции стрессового ответа. Китай, Inst. Med. Sci., Jiao Tong Univ. Sch. Med., Shanghai. Библ. 58

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.02
Рубрики: ГИДРОЛАЗЫ/СИНТАЗЫ
ТИП (P)PPGPP-ГИДРОЛАЗА/СИНТАЗА
ГЕНЫ
REL[LIN]
КЛОНИРОВАНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ
LEPTOSPIRA INTERROGANS (BACT.)

Доп.точки доступа:
He, P.; Deng, C.; Liu, B.; Zeng, L.; Zhao, W.; Zhang, Y.; Jiang, X.; Guo, X.; Qin, J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.159

Choy, Hyon E.
The study of guanosine 5'-diphosphate 3'-diphosphate-mediated transcription regulation in vitro using a coupled transcription-translation system [Text] / Hyon E. Choy // J. Biol. Chem. - 2000. - Vol. 275, N 10. - P6783-6789 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Изучение опосредованной гуанозин-5'-дифосфат-3'-дифосфатом регуляции транскрипции in vitro с использованием системы сопряженной транскрипции-трансляции
Аннотация: С использованием ДНК-зависимой системы транскрипции (Тр)-трансляции S-30 анализировали влияние "алармона" гуанозин-5'-дифосфат-3'-дифосфата (ppGpp) на регуляцию in vitro гистидинового оперона Salmonella typhimurium и оперона тРНК{Leu} Escherichia coli. Тр промотора hisG позитивно регулируется ppGpp, тогда как промотор leuV регулируется негативно. Для понимания глобальных регуляторных механизмов контроля Тр ppGpp на этих промоторах, как на моделях, изучали взаимосвязи между ppGpp-зависимой активацией и репрессией. Предположили, что ppGpp-зависимая активация является следствием репрессии стабильной Тр генов в условиях недостатка РНК-полимеразы. Чтобы проверить эту модель одновременно определяли ppGpp-зависимую регуляцию активируемого промотора hisGp и репрессируемого промотора leuVp на смешанных матрицах in vitro. Не обнаружили корреляции между активацией и репрессией транскрипции и лимитированным содержанием РНК-полимеразы в условиях in vitro. Сделан вывод, что ppGpp-зависимая активация не зависит от репрессии. Кроме того, ppGpp-зависимая активация и репрессия зависят от титруемых факторов, каждый из которых действует независимо. Ю. Корея, Dep. Biochem., Dankook Univ. Med. Coll., Chungnam, Chonan, Anseo, San 29. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ОПЕРОН HIS
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)
ОПЕРОН ТРНК{LEU}
ESCHERICHIA COLI
PPGPP
СИСТЕМА СОПРЯЖЕННОЙ ТРАНСКРИПЦИИ-ТРАНСЛЯЦИИ IN VITRO S-30

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.202

Da, Costa Xavier J.
Mutations that render the promoter of the histidine operon of Salmonella typhimurium insensitive to nutrient-rich medium repression and amino acid downshift [Text] / Costa Xavier J. Da, Stanley W. Artz // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 16. - P5211-5217 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Мутации, делающие промотор гистидинового оперона Salmonella typhimurium нечувствительным к репрессии богатой питательной средой и аминокислотному сдвигу вниз
Аннотация: Сконструированы мутации в блоке -10 и в дискриминаторной последовательности (ДП) между блоком -10 и стартовой точкой транскрипции оперона his S. typhimurium и введены в транскрипционные слияния his-lacz. Изучено влияние этих мутаций на экспрессию 'бета'-галактозидазы в богатой питательной среде и в минимальных средах в условиях, вызывающих предсказуемые изменения внутриклеточного уровня ppGpp (I), а также в условиях аминокислотного сдвига вниз, вызванного добавлением серингидроксамата, когда уровень I повышается. Полученные данные подтвердили in vivo рез-ты опытов в сопряженной системе транскрипции-трансляции in vitro, и показали, что: 1) I регулирует взаимодействие РНК-полимеразы с промотором his; 2) для стимуляции I транскрипции нужны белок -10 и ДП промотора his. США, Sec. Microbiol., Univ. California, Davis, CA 95616. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН HIS
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОРЫ
МУТАЦИИ
PPGPP
ИЗМЕНЕНИЯ ВНУТРИКЛЕТОЧНОГО УРОВНЯ
ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ
БОГАТЫЕ
МИНИМАЛЬНЫЕ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Artz, Stanley W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.09-04Б4.77

Dalebroux, Zachary D.
SpoT governs Legionella pneumophila differentiation in host macrophages [Text] / Zachary D. Dalebroux, Rachel L. Edwards, Michele S. Swanson // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 71, N 3. - P640-658 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: SpoT регулировала дифференциацию Legionella pneumophila в хозяйских макрофагах
Аннотация: В течение цикла жизни Legionella pneumophila изменяется между репликативным и трансмиссивным состояним. Чтобы определить вклад двух ppGpp-синтез RelA и SpoT в дифференциацию L. pneumophila разрушали эти ppGpp-синтезы в изучаемом микроорганизме. Синтез ppGpp был необходим для трансмиссии и мутанты relAspoT были убиты при входе в макрофаги и при выходе из макрофагов. Rel A, который реагирует на аминокислотное голодание, вызванное гидроксаматом серина, распределяется в макрофагах и мутанты relA распределяются в макрофагах эффективно. SpoT контролирует биосинтез жирных кислот (FAB). После обработки церулинином штамма дикого типа и штамма relA эти штаммы экспрессировали трансмиссивный ген fla A, но мутанты relAspoT не экспрессировали трансмиссивный ген fla A. Для ответа SpoT к изменениям FAB в Escherichia coli, вероятно, необходимо, взаимодействие с ацилированным белком-переносчиком, изученный с помощью штамма, в котором отсутствие аллели spoT-A413E обуславливало экспрессию трансмиссивного пути relAspoT бактерии. SpoT была существенной для трансмиссии между макрофагами, так как вторичные инфекции, вызываемые мутантами relAspoT, были восстановлены посредством индукции spo T, но не relA. Для осуществления репликации ppGpp должна быть гидролизована и мутанты, не имеющие spoT-гидролазной активности, не обладают способностью превращаться из трансмиссивной фазы в репликативную фазу в какой-либо бактериологической среде или макрофагах. L. pneumophila необходим SpoT, чтобы контролировать FAB и изменения между репликацией и трансмиссией в макрофагах. США, Dep. of. Microbiology and Immunology and Celluar and Molecular Biology Program, Univ. of Michigan Medical Sch., Ann Arbor, MI. И.Э.Б. Библ. 54

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.19
Рубрики: LEGIONELLA PNEUMOPHILA (BACT.)
ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
РЕПЛИКАЦИЯ
ИЗМЕНЕНИЕ
ТРАНСМИССИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP-СИНТЕЗА SPOT
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
БАКТЕРИИ-МАКРОФАГИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

Доп.точки доступа:
Edwards, Rachel L.; Swanson, Michele S.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.07-04Б2.205

EshA accentuates ppGpp accumulation and is conditionally required for antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2) [Text] / Natsumi Saito [et al.] // J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188, N 13. - P4952-4961 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: EshA способствует накоплению ppGpp и условно необходим для продукции антибиотиков
Аннотация: Разрушение гена eshA, кодирующего 52-кДа белок, продуцируемый в позднюю фазу роста Streptomyces coelicolor A3(2), ведет к прекращению продукции актинородина. Разрушение eshB, близкого гомолога eshA, не оказывает подобного эффекта на выход антибиотика. В мутанте eshA накопление ppGpp было намного ниже, чем в штамме дикого типа. Экспрессия укороченного гена повышала уровень ppGpp до уровня штамма дикого типа. Продукция антибиотика также восстанавливалась в мутанте eshA введением мутации в rpoB (кодирующего бета-субъединицу РНК полимеразы), что позволяло обойти потребность в ppGpp, в соответствии с ролью EshA в модуляции уровней ppGpp. EshA содержит нуклеотид-связывающий домен, необходимый для его роли в запуске продукции актинородина. Полученные результаты позволяют по-новому оценить молекулярные события во время физиологической дифференциации стрептококков. Япония, National Food Research Inst., Tsukuba, Ibaraki. Библ. 62

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: АНТИБИОТИКИ
СТРЕПТОМИЦИН
АКТИНОРОДИН
БИОСИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕН СИНТЕЗА АКТИНОРОДИНА ESHA
ФУНКЦИЯ
PPGPP
НАКОПЛЕНИЕ
STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)

Доп.точки доступа:
Saito, Natsumi; Xu, Jun; Hosaka, Takeshi; Okamoto, Susumu; Aoki, Hiroyuki; Bibb, Mervyn J.; Ochi, Kozo

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.146

Fusidic acid-resistant EF-G perturbs the accumulation of ppGpp [Text] / Mirjana Macvanin [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 37, N 1. - P98-107 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: У мутантов EF-G, устойчивых к фузидиевой кислоте, нарушена аккумуляция ppGpp
Аннотация: В норме наблюдается позитивная корреляция между скоростью роста клеток и их размножением. Роль координатора в этом процессе выполняет глобальный транскрипционный регулятор - молекула ppGpp, и ее базальный уровень обычно находится в обратном соотношении с размером клетки при делении. Обнаружен мутант Salmonella typhimurium, устойчивый к фузидиевой кислоте (ФК), в к-ром снижение скорости роста коррелирует с увеличением среднего размера клетки. Этот феномен вызван изменением уровня ppGpp в клетках EF-G, к-рые приобрели устойчивость к ФК, нарушив, таким образом, нормальное соотношение между скоростью роста клеток и их размером. Швеция, Dep. of Cell and Molecular Biol., Box 596, The Biomed. Center, Uppsala Univ., S-751 24 Uppsala. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: МУТАНТЫ
EF-G
УСТОЙЧИВОСТЬ К ФУЗИДИЕВОЙ КИСЛОТЕ
СКОРОСТЬ РОСТА
СНИЖЕНИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
СРЕДНИЙ РАЗМЕР КЛЕТОК
УВЕЛИЧЕНИЕ
УРОВЕНЬ PPGPP
ИЗМЕНЕНИЕ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Macvanin, Mirjana; Johanson, Urban; Ehrenberg, Mans; Hughes, Diarmaid

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.02-04Б4.120

Global regulation by (p)ppGpp and CodY in Streptococcus mutans [Text] / Jose A. Lemos [et al.] // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 15. - P5291-5299 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Глобальная регуляция с помощью (p) ppGpp и Cod Y у Streptococcus mutans
Аннотация: Ферменты Rel A, Rel P и RelQ отвечают за продукцию алармона (p) ppGpp в Streptococcus mutans. Штамм, который не содержит все три синтетазы ('ДЕЛЬТА' relAPQ), не растет в минимальной среде, не содержащей аминокислот с боковыми цепями (BCAA), лейцин или валин, но растет хорошо, если в среде отсутствует изолейцин. В данной работе исследовали корреляцию между ростом в отсутствии лейцина и валина с пулом (p) pp Gpp и активацией Cod Y. Используя комбинацию одиночных, двойных и тройных мутантов, не имеющих (p) ppGpp синтетаз, показали, что для роста в отсутствии лейцина или валина необходимы базальные уровни продукции (p) ppGpp с помощью Rel P и RelQ. Восстановление мутации cod Y в штамме 'ДЕЛЬТА' relAPQ полностью восстановило рост в среде, не содержащий лейцина или валина, что позволило обнаружить, что штамм 'ДЕЛЬТА' relAPQ, дефектный в отношении роста, был непосредственно связан с Cod Y. Уменьшение уровней GTP с помощью прибавления декоинина не увеличило репрессию CodY и не повлияло на экспрессию генов, участвующих в биосинтезе BCAA. Предположили, что CodY у S. mutans не активируется посредством GTP. Результаты фенотипических исследований позволили обнаружить, что мутант codY характеризуется уменьшенной способностью образовывать биопленки и рост этого мутанта более чувствителен к низкому pH. Предположили, что CodY играет роль в двух ключевых механизмах вирулентности S. mutans. Использование микрочипа позволило установить размер регулона Cod Y. Обнаружение предполагаемых CodY-связывающих боксов выше генов, которые инактивированы в мутанте codY, показало, что CodY может активизировать транскрипцию в S. mutans. США, Dep. of Microbiology and Immunology and Center for Oral Biology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York 14642. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.99
Рубрики: РОСТ
БАКТЕРИИ
ЛЕЙЦИН
ВАЛИН
ОТСУТСТВИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
АЛАРМОНЫ
PPGPP
ПУЛ
БЕЛОК CODY
АКТИВАЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
АКТИВАЦИЯ
STUPTOCOCCUS MUTANS (BACT.)
ОБРАЗОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Lemos, Jose A.; Nascimento, Marcelle M.; Lin, Vanessa K.; Abranches, Jacqueline; Burne, Robert A.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.08-04Б4.188

Global regulation by (p)ppGpp and CodY in Streptococcus mutans [Text] / Jose A. Lemos [et al.] // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 15. - P5291-5299 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Глобальная регуляция с помощью (p) ppGpp и Cod Y у Streptococcus mutans
Аннотация: Ферменты Rel A, Rel P и RelQ отвечают за продукцию алармона (p) ppGpp в Streptococcus mutans. Штамм, который не содержит все три синтетазы ('ДЕЛЬТА' relAPQ), не растет в минимальной среде, не содержащей аминокислот с боковыми цепями (BCAA), лейцин или валин, но растет хорошо, если в среде отсутствует изолейцин. В данной работе исследовали корреляцию между ростом в отсутствии лейцина и валина с пулом (p) pp Gpp и активацией Cod Y. Используя комбинацию одиночных, двойных и тройных мутантов, не имеющих (p) ppGpp синтетаз, показали, что для роста в отсутствии лейцина или валина необходимы базальные уровни продукции (p) ppGpp с помощью Rel P и RelQ. Восстановление мутации cod Y в штамме 'ДЕЛЬТА' relAPQ полностью восстановило рост в среде, не содержащий лейцина или валина, что позволило обнаружить, что штамм 'ДЕЛЬТА' relAPQ, дефектный в отношении роста, был непосредственно связан с Cod Y. Уменьшение уровней GTP с помощью прибавления декоинина не увеличило репрессию CodY и не повлияло на экспрессию генов, участвующих в биосинтезе BCAA. Предположили, что CodY у S. mutans не активируется посредством GTP. Результаты фенотипических исследований позволили обнаружить, что мутант codY характеризуется уменьшенной способностью образовывать биопленки и рост этого мутанта более чувствителен к низкому pH. Предположили, что CodY играет роль в двух ключевых механизмах вирулентности S. mutans. Использование микрочипа позволило установить размер регулона Cod Y. Обнаружение предполагаемых CodY-связывающих боксов выше генов, которые инактивированы в мутанте codY, показало, что CodY может активизировать транскрипцию в S. mutans. США, Dep. of Microbiology and Immunology and Center for Oral Biology, Univ. of Rochester Medical Center, Rochester, New York 14642. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.29

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.07-04Б2.182

Harinarayanan, Rajendran.
Synthetic growth phenotypes of Escherichia coli lacking ppGpp and transketolase A (tktA) are due to ppGpp-mediated transcriptional regulation of tktB [Text] / Rajendran Harinarayanan, Helen Murphy, Michael Cashel // Mol. Microbiol. - 2008. - Vol. 69, N 4. - P882-894 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Фенотипы искусственного роста Escherichia coli, утративших ppGpp и транскетолазу A (tktA), обусловлены ppGpp-опосредованной транскрипционной регуляцией tktB
Аннотация: ppGpp участвует во многих физиологических адаптациях к изменениям питания. Используя случайный скрининг искусственных леталей, обнаружили ppGpp-зависимый функциональный путь, действующий через транскетолазу B (tktB) и который затруднен в штамме дикого типа присутствием изозима - транскетолазы А (TktA). Активность транскетолазы требуется в клетках для эритрозо-4-фосфата - предшественника ароматических аминокислот и витаминов. Выявили положительную транскрипционную регуляцию оперона talA-tktB под действием ppGpp. Полученные результаты показали существование RpoS-зависимых и RpoS-независимых моделей положительной регуляции под влиянием ppGpp, что подтвердил анализ мутаций spotT (spot-R39A), вызывающих дефект гидролазы, и супрессорных мутаций rpoB-A532'ДЕЛЬТА' или rpoB-T563P. США, Lab. of Mol. Genetics, Nat. Inst. of Child Health and Human Develop., Nat. Inst. of Health, Bethesda, MD 20892. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН TAL A=TKTB
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP
ФЕРМЕНТЫ
ТРАНСКЕТОЛАЗА A
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Murphy, Helen; Cashel, Michael

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.07-04Б2.457

Hecker, Michael.
Escherichia coli rel A-mutanten als neue klonierungs- und expressionswirte [Text] / Michael Hecker, Sabine Riethdorf, Andreas Schroeter // Wiss. Z. E. M. Arndt-Univ., Greifswald. Math-naturwiss. R. - 1990. - Vol. 39, N 1. - S37-45 . - ISSN 0138-2853
Перевод заглавия: relA-мутанты Escherichia coli как новые хозяева для клонирования и экспрессии
Аннотация: Плазмиды ColE1-типа накапливаются в большом кол-ве в неспособных синтезировать ppGpp мутантах relA E. coli, подвергнутых АК-голоданию. В Кл relA+, голодающих по АК, подобной амплификации не происходит. Сделано заключение, что ppGpp действует как негативный эффектор репликации плазмид в голодающих по АК Кл E. coli. Предполагается, что это свойство мутантов relA E. coli делает их перспективными для использования в биотехнологии для получения плазмидной ДНК и гиперэкспрессии продуктов плазмидных генов. Представлена модель репликации плазмид ColE1-типа. Сконструирована серия векторов экспрессирующего типа. Вектор pCEG 16 (7,65 т. п. н.) несет фрагмент, кодирующий 'бета'-глюканазу, являющейся удобным маркером для слежения за уровнем синтеза плазмидных генов. Ил. 10. Табл. 3. Библ. 41. ФРГ, Ernst-Moritz-Arndt-Universitat Greifswald Friedrich-Ludwig-Jahn-StraSSe 15 Greifswald.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.11.02
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАНТЫ
МУТАНТЫ ПО ГЕНАМ СИНТЕЗА PPGPP RELA
ХАРАКТЕРИСТИКА
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДЫ ТИПА COLE1
МЕХАНИЗМ АМПЛИФИКАЦИИ
ВЕКТОРЫ
ПЛАЗМИДА-ВЕКТОР PCEG16
КОНСТРУИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Riethdorf, Sabine; Schroeter, Andreas

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.251

Hirsch, Matthew.
Role of ppGpp in rpoS stationary-phase regulation in Escherichia coli [Text] / Matthew Hirsch, Thomas Elliott // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 18. - P5077-5087 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Роль ppGpp в регуляции у Escherichia coli в стационарной фазе rpoS [фактора]
Аннотация: Бактериальный сигма фактор RpoS строго индуцируется при ряде стрессовых условий и в течение стационарной фазы роста. В данной работе использовали rpoS-lac гибриды в Escherichia coli, чтобы исследовать контроль действующий на уровне синтеза RpoS, который особенно хорошо доказывается, когда клетки достигают стационарной фазы в богатой среде. Ранее было показано, что маленькая молекула ppGpp необходима для нормальных уровней RpoS в стационарной фазе. Несмотря на привлекательность модели, в которой уровень ppGpp контролирует индукцию RpoS в стационарной фазе роста, тщательное измерение экспрессии rpoS-lac в мутанте, не имеющем ppGpp, показало наличие сходных эффектов как в экспоненциальной, так и в стационарной фазе роста. Главный эффект ppGpp был направлен на базальную экспрессию. Кроме того умеренный регуляторный дефект был связан с мутантом, не имеющим ppGpp и характеризующимся задержкой времени, при котором полная экспрессия осуществляется в течение 2-3 ч. Делеционный анализ показал, что дефект в базальной экспрессии был распределен по нескольким элементам последовательности, тогда как регуляторный дефект был картирован в области, расположенной выше rpoS рибосомсвязывающего сайта (RBS), который содержит активирующий антисенсорный элемент. Протестировали ряд других генов, которые считали регуляторами rpoS, включая dksA, dsrA, barA, ppkx и hfg. За исключением мутанта dksA, который имел умеренный дефект в среде Luria-Bertani, ни один из этих мутантов не был дефектным в отношении индукции rpoS в стационарной фазе. Даже короткий сегмент rpoS, начинающийся на 24 нуклеотида выше AUG инициирующего кодона был достаточен, чтобы поддержать существенную регуляцию в стационарной фазе, которая была главным образом посттранскрипционная. Эффект RBS проксимальной последовательности был независим для всех известных трансактивирующих факторов, включая ppGpp. США, Dep. of Microbiology, Immunology and Cell Biology, West Virginia Univ. Health Sciences Center, Morgantown, West Virginia 26506. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: РОСТ
СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА
ГЕНЫ
ГЕН ФАКТОРА RPOS
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Elliott, Thomas

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.223

In vivo and in vitro effects of (p)ppGpp on the 'сигма'{54} promoter Pu of the TOL plasmid of Pseudomonas putida [Text] / Manuel Carmona [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 17. - P4711-4718 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: In vivo и in vitro влияние (p)ppGpp на 'сигма'{54}-[зависимый] промотор Pu плазмиды TOL Pseudomonas putida
Аннотация: Анализировали связь in vivo и in vitro между физиологическим контролем 'сигма'{54}-зависимого промотора Pu плазмиды TOL pWW0 Pseudomonas putida и жестким ответом, опосредованным (p)ppGpp. Ключевые регуляторные элементы этой системы были получены в клетках Escherichia coli, а их активность проверена в слияниях c lacZ в отсутствие (p)ppGpp или при сверхэкспрессии relA. В штаммах relA/spoT не обнаружено реакции Pu на 3-метилбензиловый спирт, опосредованной соотв. активатором XylR, или негативной регуляции промотора быстрым ростом, уровень которой можно рассматривать как физиологический контроль промотора. Сверхэкспрессия гена relA (предположительно повышает внутриклеточный уровень (p)ppGpp) не приводит к заметному повышению активности Pu. Такая активация может быть результатом непрямых эффектов, поэтому авт. анализировали влияние (p)ppGpp в системе транскрипции in vitro. Обнаружили, что активность Pu возрастает в определенном диапазоне концентраций 'сигма'{54}, но не более, чем в 2 раза. Испания, Ctr Nacional Biotecnol. CSIC, 28049 Madrid. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА TOL
'СИГМА'{54}-ЗАВИСИМЫЙ ПРОМОТОР PU
РЕГУЛЯЦИЯ
(P)PPGPP
ВЛИЯНИЕ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Carmona, Manuel; Rodriguez, Maria J.; Martinez-Costa, Oscar; De, Lorenzo Victor

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.02-04Б4.69

Iron limitation induces SpoT-dependent accumulation of ppGpp in Escherichia coli [Text] / Daniel Vinella [et al.] // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 56, N 4. - P958-970 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Недостаток железа индуцирует SpoT-зависимое накопление ppGpp в Escherichia coli
Аннотация: В Escherichia coli бета-лактаммециллинам специфично ингибирует пенициллинсвязывающий белок 2 (PBP2), пептидогликан транспептидазу, важную для поддержания формы клетки. Ранее показали, что инактивация PBP2 ведет к блокированию клеточного деления, а повышение концентрации ppGpp приводит к устойчивости к мециллинаму и позволяет клеткам делиться в отсутствии PBP. В данной работе охарактеризовали инсерционную мутацию, несущую устойчивость к мециллинаму в штамме дикого типа и штамме 'ДЕЛЬТА'relA, но не в штаммах 'ДЕЛЬТА'relA'ДЕЛЬТА'spoT с отсутствием ppGpp. Мутант имел инсерцию в гене fes, кодирующем энтерохелинэстеразу. Этот энзим гидролизует комплекс энтерохелин-Fe{3+}, что приводит к доступности железа для клеток. Показали, что инактивация гена fes вызывает ограничение железа на чашках с богатой средой и увеличение пула ppGpp. Недостаток железа в жидкой среде продуцирует SpoT-зависимое увеличение ppGpp, что свидетельствует о роли железа в балансе двух активностей SpoT - синтезе и гидролизе (p)ppGpp. Представили доказательства, что ppGpp осуществляет прямой и опосредованный положительный контроль над поглощением железа, что подтверждает его регуляторную роль в гомеостазе: недостаток железа ведет к увеличению пула ppGpp, что увеличивает экспрессию генов поглощения железа. Франция, Inst. Jaques Monod (C. N. R. S., Univ. Paris 6, Univ. Paris 7). 2 place Jiussieu, 75251 Paris Cedex 05. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
МЕЦИЛЛИНАМ
МЕХАНИЗМ
ТРАНСПОРТ ИОНОВ
ИОНЫ ЖЕЛЕЗА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН ТРАНСПОРТА ЖЕЛЕЗА SPOT
ТРАНСКРИПЦИЯ
СИНТЕЗ PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Vinella, Daniel; Albrecht, Christian; Cashel, Michael; D'Ari, Richard

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.52

Korch, Shaleen B.
Characterization of the hipA7 allele of Escherichia coli and evidence that high persistence is governed by (p)ppGpp synthesis [Text] / Shaleen B. Korch, Thomas A. Henderson, Thomas M. Hill // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 50, N 4. - P1199-1213 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Характеристика аллели hipA7 Escherichia coli и подтверждение того, что высокая устойчивость клеток определяется (p)ppGpp синтезом
Аннотация: Охарактеризовали аллель hipA7, определяющую высокую устойчивость клеток Escherichia coli и установили, что HipA7 не токсичен, содержит две мутации (G22S и D291A), необходимые для проявления фенотипа мутантов hip. Высокая устойчивость клеток наблюдалась при экспрессии hipA7 в отсутствии hipB. Обнаружили высокую корреляцию между частотой устойчивых клеток в штаммах hipA7 и клеточной плотностью. Результаты, полученные с помощью нокаут-мутантов relA и экспрессией relA' с плазмид привели к заключению о том, что hipA7 увеличивает уровень (p)ppGpp синтеза, позволяя значительному количеству клеток в популяции приобрести устойчивость к антибиотикам. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Univ. of North Dakota School of Med. and Health Sci., Grand Forks, ND 58202-9037. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: АЛЛЕЛИ
АЛЛЕЛЬ HIPA7
МУТАЦИИ HIP
ФЕНОТИП
УСТОЙЧИВОСТЬ
КЛЕТКИ
АНТИБИОТИКИ
КОРРЕЛЯЦИЯ
(P)PPGPP
СИНТЕЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Henderson, Thomas A.; Hill, Thomas M.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.05-04Б2.180

Krol, Elizaveta.
ppGpp in Sinorhizobium meliloti: biosynthesis in response to sudden nutritional downshifts and modulation of the transcriptome [Text] / Elizaveta Krol, Anke Becker // Mol. Microbiol. - 2011. - Vol. 81, N 5. - P1233-1254 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: ppGpp в Sinorhizobium meliloti: биосинтез в ответ на внезапный сдвиг питания и модуляция транскриптом
Аннотация: Sinorhizobium meliloti отвечает на внезапный сдвиг к условиям голодания по азоту и углероду накоплением алармона ppGpp и ремоделированием транскриптомы. Продукт гена relA-RelSm имеет сходство с SpoT E. coli. С помощью сшивки промотор-egfp показали, что в Rm2011 relA экспрессируется с низкой скоростью с промотора proZ и со своего слабого промотора. Низкий уровень экспрессии физиологически объясним, поскольку сверхэкспрессия RelSm ингибирует накопление ppGpp. N-концевая часть RelSm требуется для деградации ppGpp и может участвовать в регуляции синтазной и гидролазной активности белка. Выявили, что репрессия генов домашнего хозяйства зависит от relA, тогда как активация мишени стрессового сигма фактора RpoE2 происходит независимо от relA. dksA требуется для relA-зависимой регуляции. Германия, Faculty of Biology and Center for Systems Biology. Univ. of Freiburg, Schanzlestr., 1, 79104, Freiburg

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АЛАРМОН
PPGPP
НАКОПЛЕНИЕ
ГОЛОДАНИЕ
АЗОТ
УГЛЕРОД
ТРАНСКРИПТОМА
МОДУЛЯЦИЯ
SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Becker, Anke

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.10-04Б2.152

Lemke, Justin J.
DksA and ppGpp directly regulate transcription of the Escherichia coli flagellar cascade [Text] / Justin J. Lemke, Tim Durfee, Richard L. Gourse // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 74, N 6. - P1368-1379 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: DksA и ppGpp напрямую регулируют транскрипцию флагеллярного каскада у Escherichia coli
Аннотация: Установлено, что в клетках Escherichia coli, лишенных транскрипционных регуляторов DksA или ррGрр, наблюдаются изменения экспрессии компонентов жгутика, причем, описанные эффекты чаще всего непрямые и противоречивые. Показано, что активности промоторов всех трех уровней флагеллярного транскрипционного каскада существенно выше у штаммов, лишенных DksA, следствием чего является супрепродукция флагеллина и появление гиперфлагеллярных клеток. In vitro DksA/ppGpp ингибируют промотор flhDC и 'сигма'{70}-зависимый промотор fliA, транскрибирующий ген 'сигма'{28}. Однако, DksA и ppGpp не влияют на 'сигма'{28}-зависимый промотор fliA или на 'сигма'{28}-зависимый промотор fliC in vitro, то есть наблюдаемые in vivo эффекты DksA и ppGpp на экспрессию этих генов носят опосредованный характер через влияние DksA/ppGpp на экспрессию FlhDC и 'сигма'{28}. Полагают, что DksA/ppGpp ингибирует экспрессию флагеллярного каскада в стационарной фазе и при последующем голодании. Таким образом, осуществляется координация между образованием жгутиков и сборкой рибосом, а также сохраняются ограниченные энергетические ресурсы. США, Dept. Bcteriol., 1550 Linden Drive, Univ. Wisconsin-Madison, WI 53706. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЖГУТИКИ
БИОСИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕНЫ БИОСИНТЕЗА ЖГУТИКОВ
ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ РЕГУЛЯТОРЫ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯТОР DKSA
PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Durfee, Tim; Gourse, Richard L.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.197

Masuda, Shinji.
Null mutation of HvrA compensates for loss of an essential relA/spoT-like gene in Rhodobacter capsulatus [Text] / Shinji Masuda, Carl E. Bauer // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 1. - P235-239 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Нуль мутация HvrA компенсирует утрату важного relA/spoT-подобного гена в Rhodobacter capsulatus
Аннотация: Показали, что relA/spoT-подобный ген находится в хромосоме Rhodobacter capsulatus и его утрата приводит к летальности. Получили мутации в данном гене на основе нуль мутации в белке нуклеоида HvrA. Полученные результаты привели к заключению, что имеется прямая связь между HrvA-регулируемыми промоторами и ppGpp-связанным строгим ответом. Япония, Lab. for Photobiology, RIKEN Photodynamycs Res. Center, Sendai 980-0845. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГОЛОДАНИЕ
АМИНОКИСЛОТЫ
АДАПТАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН PPGPP-СИНТАЗЫ HVRA
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИЯ
RHODOBACTER CAPSULATUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bauer, Carl E.

1-20 21-40

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска