СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ<.>)

Общее количество найденных документов : 61
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-61 61-61

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.02-04Б4.126

High, Nicola J.
Tandem repeats of the tetramer 5'-CAAT-3' present in lic2A are required for phase variation but not lipopolysaccharide biosynthesis in Haemophilus influenzae [Text] / Nicola J. High, Michael P. Jennings, E.Richard Moxon // Mol. Microbiol. - 1996. - Vol. 20, N 1. - P165-174 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Тандемные повторы тетрамера 5'-ЦААТ-3', присутствующие в lic2A, требуются для фазовой вариации, но не для биосинтеза липополисахарида у Haemophilus influenzae
Аннотация: Описан новый ген lic2B, требующийся для биосинтеза фазовариабельной структуры липополисахарида (I) у Haemophilus in fluenzae RM7004. Продукт этого гена Lic2B (II) гомологичен белку Lic2A (III) и ферментам биосинтеза I: LgtB из Neisseria gonorrhoeae, LgtE из N. meningitidis и LpsA из Posteurella haemolytica. Из этого семейства ферментов только III имеет повторяющийся тетрадный мотив (ПТЛ) (SINQ)[n], кодируемый множественными тандемными повторами 5'-ЦААТ-3'. Это позволяет предположить, что ПТМ не нужны для каталитич. активности III. Для проверки этой гипотезы из гена lic2A делетировали повторы 5'-ЦААТ-3', так что продукт модифицированного гена стал аналогичным II. Эта мутация не влияет на мол. м I и на способность I реагировать с моноклональным антителом НС4. Это подтвердило, что ПТМ необязательны для ферментативной функции III, так что повторы 5'-ЦААТ-3' в гене lic2A нужны только для обеспечения фазовой вариации. Найдено, что число этих повторов в гене lic2A варьирует у разных штаммов H. influenzae. Предсказанной вторичной структурой ПТМ (SINQ)[n] является гибкий статистич. клубок, так что ПТМ не должен мещать образованию доменов, требующихся для каталитич. активности III. Аналогичными свойствами обладают и другие ПТМ, кодируемые другими тетрамерными повторами в кодирующих областях генов H. influenzae Rd. Великобритания, Dep. of Paediatrics, Univ. of Oxford, Inst. of Molecular Biol., John Radcliffe Hospital, Headington, Oxford 0X3 9DU. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.99
Рубрики: ЛИПОПОЛИСАХАРИДЫ
СИНТЕЗ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН СИНТЕЗА ЛИПОПОЛИСАХАРИДА LIC2A
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
HAEMOPHILUS INFLUENZAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jennings, Michael P.; Moxon, E.Richard

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.09-04Б4.103

Clegg, Steven.
Salmonella typhimurium fimbrial phase variation and FimA expression [Text] / Steven Clegg, Lisa S. Hancox, Kuang-Sheng Yeh // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 2. - P542-545 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Фазовые вариации фимбрий Salmonella typhimurium
Аннотация: Показано, что бактерии, не имеющие фимбрий, при культивировании в жидкой среде в условиях аэрации могут продуцировать Fim A в количествах, сравнимых с фимбриальными штаммами. Fim A в небольших количествах обнаруживается также в отсутствии фимбрий при культивировании на плотных средах в анаэробных условиях. Представлены данные, полученные при исследовании регуляции транскрипции гена fim A у Salmonella typhimurium. Ил. 4. Табл. 2. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.13
Рубрики: SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)
ФИМБРИИ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
КУЛЬТИВИРОВАНИЕ
УСЛОВИЯ

Доп.точки доступа:
Hancox, Lisa S.; Yeh, Kuang-Sheng

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.259

Dove, S. L.
Control of Escherichia coli type 1 fimbrial gene expression in stationary phase: A negative role for RpoS [Text] / S. L. Dove, S. G.J. Smith, C. J. Dorman // Mol. and Gen. Genet. - 1997. - Vol. 254, N 1. - P13-20 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Контроль экспрессии гена фимбрий типа 1 Escherichia coli в стационарной фазе: негативная роль RpoS
Аннотация: Фазовая вариация экспрессии гена fimA субъединицы фимбрий типа 1 у E. coli регулируется инверсией сегмента ДНК, кодирующего промотор гена fimA. Показано, что транскрипция fimA репрессируется при переходе в стационарную фазу. Эта репрессия не отмечена у мутантов rpoS, дефектных по 'сигма'-фактору стационарной фазы RpoS (I). У этих мутантов изменена также частота инверсии промотора fimA, катализируемой интегразоподобной сайт-специфической рекомбиназой, кодируемой геном fimB. В клетках дикого типа, но не в мутантах rpoS, транскрипция fimB сильно подавлена в стационарной фазе. Полагают, что I является негативным регулятором (возможно, косвенным) на промоторах fimA и fimB. Ирландия, Dep. Microbiol., Moyne Inst. of Preventive Med., Univ. of Dublin, Trinity College, Dublin 2. Библ. 42.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕН FIMA
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
РЕГУЛЯЦИЯ
МУТАЦИИ
МУТАНТЫ RPOS
СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА РОСТА
'СИГМА'-ФАКТОР RPOS
ФИМБРИИ ТИПА 1
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Smith, S.G.J.; Dorman, C.J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 98.06-04Б4.104

Invasion of primary nasopharyngeal epithelial cells by Neisseria meningitidis is controlled by phase variation of multiple surface antigens [Text] / Vries F. P. de [et al.] // Infec. and Immun. - 1996. - Vol. 64, N 8. - P2998-3006 . - ISSN 0019-9567
Перевод заглавия: Инвазия Neisseria meningitidis в назофарингеальные эпителиальные клетки первичной [линии] контролируется фазовыми вариациями множественных поверхностных антигенов
Аннотация: На первичной линии назофарингеального эпителия (НФЭ), полученной при аденэктомии у детей, изучалась инвазия N. meningitidis (N. m.) в клетки слизистой оболочки. Путем пассажей и последующей селекции из исходного штамма N. m. B:15:P1.7,16:L3,7,9, выделенного от б-ного генерализованной формой, получены варианты, лишенные капсул, пилей, имеющие и не имеющие белки 5 класса Opc (30 кD) и Opa (28 кD), содержащие сиализированные и несиализированные ЛПС. На модели НФЭ подтверждены ранее известные положения, что капсулы, пили и сиализированные ЛПС не способствуют инвазии N. m. в эпителий. Однако, в отличие от прежних рез-тов, полученных на эпителиальных линиях клеток конъюнктивы глаза и различных карцином человека, показано, что если Opa-белок лишенных капсул и пилей клеток N. m. способствует инвазии в НФЭ, то Opc-белок препятствует этой инвазии с помощью Opa. Сделан вывод, что Opc-белок ответственен за тканевой тропизм N. m. Сиализация ЛПС или ее отсутствие важнее для инвазии, нежели принадлежность N. m. к тому или иному иммунотипу. Фазовые вариации N. m. приводят к экспрессии взаимно-контролирующих поверхностных компонентов, что необходимо для инвазии N. m. в НФЭ. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.17
Рубрики: NEISSERIA MENINGITIDIS (BACT.)
ИНВАЗИЯ
МЕХАНИЗМЫ
НАЗОФАРИНГЕАЛЬНЫЕ КЛЕТКИ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ АНТИГЕНЫ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ

Доп.точки доступа:
de, Vries F.P.; van, der Ende A.; van, Putten J.P.M.; Dankert, J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.01-04Б4.72

Simple sequence repeats in the Helicobacter pylori genome [Text] / Nigel J. Saunders [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 27, N 6. - P1091-1098 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Простые нуклеотидные повторы в геноме Helicobacter pylori
Аннотация: Микроанализ. Недавно группой исследователей из TIGR была опубликована полная нуклеотидная последовательность генома Helicobacter pylori. В данной работе предложена интегрированная система поиска определенных мотивов внутри генома. Она разработана на основании базы данных ACeBD. Эта система сочетает несколько стратегий идентификации ДНК-овых повторов. С ее помощью удалось обнаружить гены, вероятно, гомологичные, но измененные благодаря фазовым вариациям со внутренними повторами. Обсуждается их возможная роль во взаимодействии хозяин-паразит. Одним из преимуществ разработанной системы является то, что рез-ты каждого поиска можно анализировать дальше и сравнивать с рез-тами, полученными при анализе других геномов. Великобритания, (Moxon E. R.) Mol. Infect. Diseases Group, Inst. of Mol. Med., Headington, Oxford OX3 9DS. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.09
Рубрики: HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
ГЕНОМ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
ГЕНЫ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ВНУТРЕННИЕ ПОВТОРЫ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ХОЗЯИН-ПАРАЗИТ

Доп.точки доступа:
Saunders, Nigel J.; Peden, John F.; Hood, Derek W.; Moxon, E.Richard

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.203

Simple sequence repeats in the Helicobacter pylori genome [Text] / Nigel J. Saunders [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 27, N 6. - P1091-1098 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Простые нуклеотидные повторы в геноме Helicobacter pylori
Аннотация: Микроанализ. Недавно группой исследователей из TIGR была опубликована полная нуклеотидная последовательность генома Helicobacter pylori. В данной работе предложена интегрированная система поиска определенных мотивов внутри генома. Она разработана на основании базы данных ACeBD. Эта система сочетает несколько стратегий идентификации ДНК-овых повторов. С ее помощью удалось обнаружить гены, вероятно, гомологичные, но измененные благодаря фазовым вариациям со внутренними повторами. Обсуждается их возможная роль во взаимодействии хозяин-паразит. Одним из преимуществ разработанной системы является то, что рез-ты каждого поиска можно анализировать дальше и сравнивать с рез-тами, полученными при анализе других геномов. Великобритания, (Moxon E. R.) Mol. Infect. Diseases Group, Inst. of Mol. Med., Headington, Oxford OX3 9DS. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: HELICOBACTER PYLORI (BACT.)
ГЕНОМ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
ГЕНЫ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ВНУТРЕННИЕ ПОВТОРЫ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ХОЗЯИН-ПАРАЗИТ

Доп.точки доступа:
Saunders, Nigel J.; Peden, John F.; Hood, Derek W.; Moxon, E.Richard

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.361

Brmann, N. E.
Transcriptional analysis of mga, a regulatory gene in Streptococcus pyogenes: Identification of monocistronic and bicistronic transcripts that phase vary [Text] / N. E. Brmann, P. P. Cleary // Gene. - 1997. - Vol. 200, N 1-2. - P125-134 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Транскрипционный анализ регуляторного гена mga у Streptococcus pyogenes: идентификация моноцистронного и бицистронного транскриптов, подверженных фазовой вариации
Аннотация: Изучена регуляция гена mga Streptococcus pyogenes, кодирующего белок Mga (I), к-рый регулирует транскрипцию ряда генов поверхностных белков вирулентности. Обнаружены 2 транскрипта: бицистронная мРНК длиной 3,8 т.н. (II) для генов mga и emm12 и моноцистронная мРНК mga длиной 1,6 т. н. (III). II и III чувствительны к фазовой вариации: их количество в клетках M{+} больше, чем в клетках M{-}. Инкубация РНК с рифампицином показала, что III не является процессированным транскриптом. С 5'-стороны от гена mga обнаружены 2 промотора: Р1 в положении -395 и Р2 в положении -83. В штамме CS46 ('ДЕЛЬТА'mga) транскрипция не инициируется на Р1, в области Р2 имеется несколько стартовых сайтов транскрипции. Комплементация показала, что последовательности перед промотором Р2 требуется для активации еmm12 и scpA под действием I в транс-положении. США, Dep. of Microbiol., Univ. of Minnesota, Minneapolis, MN 55455. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН MGA
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
РНК МАТРИЧНАЯ
МРНК ГЕНА MGA
БИЦИСТРОННАЯ МРНК
МОНОЦИСТРОННАЯ МРНК
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
STREPTOCOCCUS PYOGENES

Доп.точки доступа:
Cleary, P.P.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.07-04Б4.197

Weiser, Jaffrey N.
Adaptation of Haemophilus influenzae to acquired and innate humoral immunity based on phase variation of lipopolysaccharide [Text] / Jaffrey N. Weiser, Nina Pan // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 30, N 4. - P767-775 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Адаптация Haemophilus influenzae к приобретенному и врожденному гуморальному иммунитету, основанная на фазовой вариации липополисахарида
Аннотация: У Haemophilus influenzae обнаружена связь между патогенностью и фазовыми вариациями морфологии колоний. Оказалось, что прозрачность колоний нетипируемой H. influenzae (NTHi) H233 зависит от состояния липополисахарида (ЛПС), а это состояние определяется генами lic1 и lic2. (Ген lic1 участвует в экспрессии фосфорилхолина (ChoP), а ген lic2 кодирует предположительную галактозилтрансферазу, присоединяющую терминальную галактозу к остатку Gal'альфа'1-4Gal ЛПС). Гены lic1 и lic2 содержат "переключатели" трансляции, состоящие из межгенных тандемных повторов 5'-CAAT-3'. Показано, что у клеток NTHi, формирующих непрозрачные колонии, гены lic1 и lic2 "выключены" благодаря такому кол-ву повторов, что значащая часть гена не попадает в рамку считывания. При изучении чувствительности NTHi к сыворотке показано, что добавление ChoP к ЛПС придает клеткам резистентность. Также, без концевой галактозы NTHi становятся крайне чувствительны к человеческой сыворотке. США, Dep. of Pediatr. and Microbiol., 301B Johnson Pavilion, Univ. of Pennsylvania School of Med., Philadelphia, PA 19104-6076. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.09
Рубрики: HAEMOPHILUS INFLUENZAE (BACT.)
НЕТИПИРУЕМАЯ H. INFLUENZAE
ШТАММ H233
ГЕНЫ
ГЕН LIC1
ГЕН LIC2
ТРАНСЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ЛИПОПОЛИСАХАРИДЫ
СТРУКТУРА
РЕЗИСТЕНТНОСТЬ К СЫВОРОТКЕ
ЭКСПРЕССИЯ ФОСФОРИЛХОЛИНА
ГАЛАКТОЗИЛТРАНСФЕРАЗА

Доп.точки доступа:
Pan, Nina

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.207

Norris, Tracy L.
Expression and transcriptional control of the Salmonella typhimurium lpf fimbrial operon by phase variation [Text] / Tracy L. Norris, Robert A. Kingsley, Andreas J. Baumler // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 1. - P311-320 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Экспрессия и транскрипционный контроль оперона фимбрий Cpf Salmonella typhimurium фазовой вариацией
Аннотация: Оперон lpf опосредует адгезию Salmonella typhimurium на пейеровых бляшках (ПБ) кишечника мышей. Сконструировано транскрипц. слияние оперона lpf и генов lacZYA Escherichia coli и введено в хромосому S. typhimurium. Полученный штамм образует колонии Lac{+} и Lac{-}. Чередование фенотипов Lac{+} (фаза ON) и Lac{-} (фаза OFF) происходит по механизму наследуемой фазовой вариации, т. к. инокуляция бульонных культур клетками из колонии Lac{+} дает гораздо больше колоний Lac{+}, чем инокуляция клетками из колонии Lac{-}. Во время роста in vitro переходы ON'-'OFF и OFF'-'ON идут с частотой 6,8*10{-3} и 2,4*10{-4} событий на клетку за поколение соотв. На органной культуре кишечника мышей идет селекция состояния ON при выделении бактерий, прикрепленных к ПВ. Это позволяет предположить, что фазовая вариация Lac коррелирует с экспрессией адгезии, опосредованной lpf. Обнаружена сильная селекция против клеток в фазе ON у мышей, иммунизированных составным белком GST-LpfA. Эти данные доказали наличие белка фимбрий LpfA у клеток фазы ON и его доступность для иммунной системы. США, Dep. Med. Microbiol. and Immunol., Coll. Med., Texas A and M Univ., College Station, TX 77843-1114. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФИМБРИИ
СИНТЕЗ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ФИМБРИЙ LPF
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
МЕХАНИЗМ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kingsley, Robert A.; Baumler, Andreas J.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.244

Blomfield, Ian C.
Integration host factor stimulates both FimB- and FimE-mediated site-specific DNA inversion that controls phase variation of type 1 fimbriae expression in Escherichia coli [Text] / Ian C. Blomfield, Don H. Kulasekara, Barry I. Eisenstein // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 4. - P705-717 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Хозяйский фактор интеграции стимулирует FimB- и FimE-опосредованную сайт-специфичную инверсию ДНК, контролирующую фазовую вариацию экспрессии фимбрий типа 1 у Escherichia coli
Аннотация: Две рекомбиназы, FimB и FimE, обеспечивают сайт-специфичную инверсию ДНК, контролирующую фазовую вариацию экспрессии фимбрий типа 1 у Escherichia coli. Для обеспечения этого процесса необходим также регуляторный белок Lrp. Кроме того, рекомбинация, контролируемая белком FimB, стимулируется хозяйским фактором интеграции IHF. Показано, что IHF стимулирует также рекомбинацию, обеспечиваемую рекомбиназой FimE. У мутантного штамма E. coli, дефектного либо по 'альфа'-субъединице (ihfA), либо по 'бета'-субъединице (ihfB) IHF, заметно снижение фазовых вариаций, обеспечиваемых FimB (в 100 раз) и FimE (в 15 000 раз). Показано, что IHF имеет высокое сродство к инвертируемому элементу fim. Снижение сродства IHF к элементу fim in vitro приводит к снижению рекомбинации in vivo. США, Dep. Microbiol. Immunol., Bowman Gray Sch. Med., Med. Ctr Boulevard, Winston-Salem, NC 27157-106. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.13.07
Рубрики: ДНК
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧНАЯ ИНВЕРСИЯ
РЕКОМБИНАЗЫ FIMB
FIME
ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР ИНТЕГРАЦИИ
ФИМБРИИ
ТИП 1
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kulasekara, Don H.; Eisenstein, Barry I.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 00.12-04Б4.142

The length of a tetranucleotide repeat tract in Haemophilus influenzae determines the phase variation rate of a gene with homology to type III DNA methyltransferases [Text] / Bolle Xavier De [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 1. - P211-222 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Длина тракта тетрануклеотидных повторов у Haemophilus influenzae определяет скорость фазовой вариации гена с гомологией с ДНК-метилтрансферазами типа III
Аннотация: У Haemophilus influenzae Rd ген mod гомологичен генам ДНК-метилтрансфераз систем рестрикции-модификации типа III и содержит в открытой рамке считывания 40 тетрануклеотидных повторов (ТНП) 5'-АГТЦ. Этот ген найден у 21 из 23 генетических различных штаммов H. influenzae и содержит ТНП у 13 штаммов. Сконструированы штаммы H. influenzae, у к-рых репортерский ген lacZ слит с хромосомным геном mod с 3'-стороны от ТНП. Найдено, что фазовая вариация (ФВ) происходит с высокой частотой у штаммов с таким же числом ТНП, как у дикого типа. Сконструированы штаммы с разным числом ТНП. Показано, что частота ФВ линейно увеличивается с ростом числа ТНП в диапазоне 17-38. Большинство изменений тракта ТНП является вставками и делециями одного ТНП (в соотношении 2:1). Эти данные показали, что число повторов является главным детерминантом скорости ФВ у гена H. influenzae, содержащего микросателлитную ДНК. Великобритания, Dep. Pediatrics, Inst. Mol. Med., John Radcliffe Hosp., Headington, Oxford OX3 9DU. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.99
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ MOD
СТРУКТУРА
ТЕТРАНУКЛЕОТИДНЫЕ ПОВТОРЫ
ВЛИЯНИЕ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
СКОРОСТЬ
HAEMOPHILUS INFLUENZAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
De, Bolle Xavier; Bayliss, Christopher D.; Field, Dawn; van, de Ven Tamsin; Saunders, Nigel J.; Hood, Derek W.; Moxon, E.Richard

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.197

The length of a tetranucleotide repeat tract in Haemophilus influenzae determines the phase variation rate of a gene with homology to type III DNA methyltransferases [Text] / Bolle Xavier De [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 1. - P211-222 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Длина тракта тетрануклеотидных повторов у Haemophilus influenzae определяет скорость фазовой вариации гена с гомологией с ДНК-метилтрансферазами типа III
Аннотация: У Haemophilus influenzae Rd ген mod гомологичен генам ДНК-метилтрансфераз систем рестрикции-модификации типа III и содержит в открытой рамке считывания 40 тетрануклеотидных повторов (ТНП) 5'-АГТЦ. Этот ген найден у 21 из 23 генетических различных штаммов H. influenzae и содержит ТНП у 13 штаммов. Сконструированы штаммы H. influenzae, у к-рых репортерский ген lacZ слит с хромосомным геном mod с 3'-стороны от ТНП. Найдено, что фазовая вариация (ФВ) происходит с высокой частотой у штаммов с таким же числом ТНП, как у дикого типа. Сконструированы штаммы с разным числом ТНП. Показано, что частота ФВ линейно увеличивается с ростом числа ТНП в диапазоне 17-38. Большинство изменений тракта ТНП является вставками и делециями одного ТНП (в соотношении 2:1). Эти данные показали, что число повторов является главным детерминантом скорости ФВ у гена H. influenzae, содержащего микросателлитную ДНК. Великобритания, Dep. Pediatrics, Inst. Mol. Med., John Radcliffe Hosp., Headington, Oxford OX3 9DU. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ MOD
СТРУКТУРА
ТЕТРАНУКЛЕОТИДНЫЕ ПОВТОРЫ
ВЛИЯНИЕ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
СКОРОСТЬ
HAEMOPHILUS INFLUENZAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
De, Bolle Xavier; Bayliss, Christopher D.; Field, Dawn; van, de Ven Tamsin; Saunders, Nigel J.; Hood, Derek W.; Moxon, E.Richard

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.03-04Б2.215

Richardson, Anthony R.
HmbR, a hemoglobin-binding outer membrane protein of Neisseria meningitidis, undergoes phase variation [Text] / Anthony R. Richardson, Igor Stojiljkovic // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 7. - P2067-2074 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Связывающий гемоглобин белок HmbR внешней мембраны Neisseria meningitidis подвергается фазовой вариации
Аннотация: Анализ 25 эпидемиологически неродственных клинич. изолятов Neisseria meningitidis серогрупп А, В, С и D показал, что 64% штаммов имеет гены рецепторов HmbR и HpuB гемоглобина (I). Изучение экспрессии hmbR у штаммов, у к-рых генетически инактивирован ген hpuB, обнаружило 2 разных фенотипа использования I. 5 штаммов способны расти в виде сплошного газона, а 7 штаммов образуют отдельные колонии вокруг дисков с I. Образование отдельных колоний некоторыми мутантами hpuB позволило предположить фазовую вариацию гена hmbR. Длина тракта поли(Г) /ТПГ/, начинающегося в положении +1164 hmbR, абсолютно коррелирует с 2 фенотипами использования I. 5 штаммов, образующих сплошной газон вокруг дисков с I, имеют 9 или 12 последовательных остатков Г. Все 7 штаммов, дающих отдельные колонии, имеют ТПГ, длина к-рых отличается от 9 или 12 остатков. Варианты в отдельных колониях, выросших вокруг дисков с I, имеют ТПГ из 9 или 12 остатков, восстанавливающие открытую рамку считывания hmbR. Инактивация hmbR у этих штаммов приводит к утрате использования I, так что мутации в гене hmbR отвечают за фенотип. переключения. Скорость переключения hmbR из фазы off в фазу on равна 5*10{-4} у 4 штаммов серогруппы С, 2*10{-2} у изолята серогруппы А и 7*10{-6} у изолята серогруппы В. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Emory Univ. Sch. Med., Atlanta, GA 30322. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК ВНЕШНЕЙ МЕМБРАНЫ HMBR
СВЯЗЫВАЮЩИЙ ГЕМОГЛОБИН
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
СКОРОСТЬ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЯ
NEISSERIA MENINGITIDIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stojiljkovic, Igor

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 01.05-04Б4.144

Richardson, Anthony R.
HmbR, a hemoglobin-binding outer membrane protein of Neisseria meningitidis, undergoes phase variation [Text] / Anthony R. Richardson, Igor Stojiljkovic // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 7. - P2067-2074 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Связывающий гемоглобин белок HmbR внешней мембраны Neisseria meningitidis подвергается фазовой вариации
Аннотация: Анализ 25 эпидемиологически неродственных клинич. изолятов Neisseria meningitidis серогрупп А, В, С и D показал, что 64% штаммов имеет гены рецепторов HmbR и HpuB гемоглобина (I). Изучение экспрессии hmbR у штаммов, у к-рых генетически инактивирован ген hpuB, обнаружило 2 разных фенотипа использования I. 5 штаммов способны расти в виде сплошного газона, а 7 штаммов образуют отдельные колонии вокруг дисков с I. Образование отдельных колоний некоторыми мутантами hpuB позволило предположить фазовую вариацию гена hmbR. Длина тракта поли(Г) /ТПГ/, начинающегося в положении +1164 hmbR, абсолютно коррелирует с 2 фенотипами использования I. 5 штаммов, образующих сплошной газон вокруг дисков с I, имеют 9 или 12 последовательных остатков Г. Все 7 штаммов, дающих отдельные колонии, имеют ТПГ, длина к-рых отличается от 9 или 12 остатков. Варианты в отдельных колониях, выросших вокруг дисков с I, имеют ТПГ из 9 или 12 остатков, восстанавливающие открытую рамку считывания hmbR. Инактивация hmbR у этих штаммов приводит к утрате использования I, так что мутации в гене hmbR отвечают за фенотип. переключения. Скорость переключения hmbR из фазы off в фазу on равна 5*10{-4} у 4 штаммов серогруппы С, 2*10{-2} у изолята серогруппы А и 7*10{-6} у изолята серогруппы В. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Emory Univ. Sch. Med., Atlanta, GA 30322. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.17
Рубрики: МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК ВНЕШНЕЙ МЕМБРАНЫ HMBR
СВЯЗЫВАЮЩИЙ ГЕМОГЛОБИН
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
СКОРОСТЬ ПЕРЕКЛЮЧЕНИЯ
NEISSERIA MENINGITIDIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Stojiljkovic, Igor

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.297

Lewis antigens in Helicobacter pylori: Biosynthesis and phase variation [Text] / Ge Wang [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 36, N 6. - P1187-1196 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Антигены Льюиса у Helicobacter pylori: биосинтез и фазовая вариация
Аннотация: Обзор. У большинства штаммов Helicobacter pylori липополисахариды (I) содержат сложные углеводы - антиген Льюиса (II), структурно родственный антигенам групп крови человека. У H. pylori идентифицированы фукозилтрансферазы (III), к-рые по субстратной специфичности отличаются от III млекопитающих. По сравнению с человеком H. pylori использует др. путь синтеза дифукозилированных I-y и I-b. H. pylori модулирует вариабельные эпитопы I на поверхности, т. к. в генах III имеются гомополимерные тракты, опосредующие ошибочное спаривание нитей с проскальзыванием, и элементы, регулирующие трансляц. сдвиг рамки. Обсуждается роль молекулярной мимикрии и фазовой вариации I у H. pylori в персистетной инфекции и патогенезе. Канада, Dep. Med. Microbiol. and Immunol., Univ. Alberta, Edmonton, Alberta. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: УГЛЕВОДЫ
ЛИПОПОЛИСАХАРИДЫ
АНТИГЕН ЛЬЮИСА
БИОСИНТЕЗ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ФЕРМЕНТЫ
ФУКОЗИЛТРАНСФЕРАЗЫ
СИНТЕЗ
СТРУКТУРА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wang, Ge; Ge, Zhongming; Rasko, David A.; Taylor, Diane E.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 01.08-04Б4.96

Lewis antigens in Helicobacter pylori: Biosynthesis and phase variation [Text] / Ge Wang [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 36, N 6. - P1187-1196 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Антигены Льюиса у Helicobacter pylori: биосинтез и фазовая вариация
Аннотация: Обзор. У большинства штаммов Helicobacter pylori липополисахариды (I) содержат сложные углеводы - антиген Льюиса (II), структурно родственный антигенам групп крови человека. У H. pylori идентифицированы фукозилтрансферазы (III), к-рые по субстратной специфичности отличаются от III млекопитающих. По сравнению с человеком H. pylori использует др. путь синтеза дифукозилированных I-y и I-b. H. pylori модулирует вариабельные эпитопы I на поверхности, т. к. в генах III имеются гомополимерные тракты, опосредующие ошибочное спаривание нитей с проскальзыванием, и элементы, регулирующие трансляц. сдвиг рамки. Обсуждается роль молекулярной мимикрии и фазовой вариации I у H. pylori в персистетной инфекции и патогенезе. Канада, Dep. Med. Microbiol. and Immunol., Univ. Alberta, Edmonton, Alberta. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.09
Рубрики: УГЛЕВОДЫ
ЛИПОПОЛИСАХАРИДЫ
АНТИГЕН ЛЬЮИСА
БИОСИНТЕЗ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ФЕРМЕНТЫ
ФУКОЗИЛТРАНСФЕРАЗЫ
СИНТЕЗ
СТРУКТУРА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wang, Ge; Ge, Zhongming; Rasko, David A.; Taylor, Diane E.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.290

Eikenella corrodens phase variation involves a posttranslational event in pilus formation [Text] / Maria T. Villar [et al.] // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 14. - P4154-4160 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: В фазовой вариации Eikenella corrodens участвуют посттрансляционные события в образовании фимбрий
Аннотация: Для изучения фазовой вариации у Eikenella corrodens клонирован и секвенирован фрагмент ДНК S-фазового варианта клинического изолята VA1. Обнаружены 4 тандемно организованных гена pilA1, pilA2, pilB и hagA. Гены pilA1 и pilA2 кодируют нити типа IV, продукт гена pilB гомологичен белку сборки фимбрий FimB Dichelobacter nodosus, а продукт гена hagA - гемагглютинину. Гибридизация ДНК и секвенирование показали, что локус pilA идентичен у L- и S-фазовых вариантов штамма VA. Главный транскрипт pilA1 инициируется перед локусом pilA и терминируется на шпильке между pilA1 и pilA2, а минорный транскрипт содержит pilA1, pilA2 и pilB. Транскрипция локуса pilA почти одинакова у L- и S-фазовых вариантов. Электронная микроскопия и иммунологич. анализ показали, что S-фазовый вариант синтезирует, экспортирует и собирает пилин в фимбрии. Не имеющий фимбрий L-фазовый вариант синтезирует пилин, но не экспортирует его и не собирает в фимбрии. Эти данные позволили предположить, что в фазовой вариации E. corrodens участвует посттрансляционное событие, изменяющее экспорт и сборку пилина. США, Division Mol. Biol. and Biochem., Sch. Biol. Sci., Univ. Missouri, Kansas City, MO 64110. Библ. 54

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: КОЛОНИИ
МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЕНИЯ
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА ФИМБРИЙ PIL
ГЕН СБОРКИ ФИМБРИЙ FIMB
ФУНКЦИЯ
EIKENELLA CORRODENS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Villar, Maria T.; Helber, Jennifer T.; Hood, Becky; Schaefer, Michael R.; Hirschberg, Rona L.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.255

Tinker, Juliette K.
Control of FimY translation and type 1 fimbrial production by the arginine tRNA encoded by fimU in Salmonella enterica serovar Typhimurium [Text] / Juliette K. Tinker, Steven Clegg // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 40, N 3. - P757-768 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Контроль трансляции FimY и продукция фимбрий типа I аргининовой тРНК, кодируемой fimU, у Salmonella enterica серовар Typhimurium
Аннотация: Экспрессия фимбрий типа I у Salmonella enterica серовар Typhimurium подвергается фазовым вариациям, которые зависят от условий in vitro и являются сложным процессом. Кластер гена fim содержит регуляторные гены fimZ, fimY и fimW. Ген fimU кодирует аргининовую тРНК. Ген fimU влияет на экспрессию фимбрий типа I, он функционально родствен гену argU Escherichia coli. Регуляторные гены fim содержат много редких кодонов arg, причем 5 таких кодонов образуют кластер в гене fimY. Для изучения влияния fimU на продукцию FimY получили гибридный ген, состоящий из fimY и гена мальтово-связывающего белка E. coli, экспрессировали его в E. coli с мутацией в argU. С помощью Вестерн-блотинга экстрактов arg-мутантов и родительского штамма показано, что продукция FimY заметно снижается в отсутствие функциональной тРНК{Arg}(UGU). Продукция FimY в этих мутантах может быть восстановлена, если fimU вводится в составе плазмиды и если 3 редких аргининовых кодона, расположенных в первых 14 позициях fimY, заменены главными аргининовыми кодонами. Методом ОТ-ПЦР подтверждено, что транскрипт fimY примерно на одном уровне содержится в родительском штамме и в мутанте fimU. Т. обр., показано, что подавление синтеза белка происходит не на уровне транскрипции. Отсутствие функционального fimU подавляет эффективную трансляцию fimY и соотв. продукцию фимбрий типа I. США, Dep. Microbiol., Coll. Med., Univ. Iowa City, IA 52242. Библ. 46

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
БЕЛОК FIMY
РЕГУЛЯЦИЯ
ФИМБРИИ
ТИП 1
ЭКСПРЕССИЯ
ГЕНЫ
FIM
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
ГЕН FIMU
АРГИНИНОВАЯ ТРНК
SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОВАР TYPHIMURIUM

Доп.точки доступа:
Clegg, Steven

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 02.12-04Б4.95

Lysnyansky, Innesa.
Juxtaposition of an active promoter to vsp genes via site-specific DNA inversions benerates antigenic variation in Mycoplasma bovis [Text] / Innesa Lysnyansky, Yael Ron, David Yogev // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 19. - P5698-5708 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Непосредственное соседство активного промотора с генами vsp, вызванное сайтспецифической рекомбинацией, порождает антигенную вариацию у Mycoplasma bovis
Аннотация: Изучен молекулярный механизм высокой частоты фазовой вариации (ФВ) поверхностных липопротеиновых антигенов VspA (I) и VspC (II) у Mycobacterium bovis. Анализ клональных вариантов, проявляющих ФВ I или II (ON'-'OFF'-'ON), показал, что во время ФВ происходит инверсия ДНК. 5'-область каждого из генов vsp содержит 2 кассеты последовательностей. Кассета 1 (К-1) длиной 71 п. н. с 5'-стороны от стартового кодона АТГ на 98% гомологична среди всех генов vsp, а К-2 длиной 50-180 п. н., расположенная перед К-1, более дивергентна. Изучение концов инвертированных фрагментов во время ФВ I и II показало, что в обоих случаях изменяется организация 5'-кассет vsp с участием 3 генов vsp. Анализ методами удлинения праймера и Нозерн-блота показал, что специфич. К-2 (A[2]) является активным промотором и что перенос этого регуляторного элемента к молчащему гену vsp в результате инверсии ДНК разрешает транскрипцию реципиентного гена. В ФВ I и II участвуют две сайт-специфич. инверсии ДНК между инвертированными копиями специфич. элемента длиной 35 п. н. в консервативной К-1. Предложена модель контроля ФВ vsp. Израиль, Dep. Membrane and Ultrastructure Res., Hebrew Univ.- Hadassah Med. Sch., Jerusalem 91120. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.29
Рубрики: АНТИГЕНЫ
ЛИПОПРОТЕИНОВЫЕ АНТИГЕНЫ VSP AC
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
МЕХАНИЗМ
ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОРЫ ГЕНОВ АНТИГЕНОВ VSP
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ВЛИЯНИЕ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
MYCOPLASMA BOVIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ron, Yael; Yogev, David

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.206

Lysnyansky, Innesa.
Juxtaposition of an active promoter to vsp genes via site-specific DNA inversions benerates antigenic variation in Mycoplasma bovis [Text] / Innesa Lysnyansky, Yael Ron, David Yogev // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 19. - P5698-5708 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Непосредственное соседство активного промотора с генами vsp, вызванное сайтспецифической рекомбинацией, порождает антигенную вариацию у Mycoplasma bovis
Аннотация: Изучен молекулярный механизм высокой частоты фазовой вариации (ФВ) поверхностных липопротеиновых антигенов VspA (I) и VspC (II) у Mycobacterium bovis. Анализ клональных вариантов, проявляющих ФВ I или II (ON'-'OFF'-'ON), показал, что во время ФВ происходит инверсия ДНК. 5'-область каждого из генов vsp содержит 2 кассеты последовательностей. Кассета 1 (К-1) длиной 71 п. н. с 5'-стороны от стартового кодона АТГ на 98% гомологична среди всех генов vsp, а К-2 длиной 50-180 п. н., расположенная перед К-1, более дивергентна. Изучение концов инвертированных фрагментов во время ФВ I и II показало, что в обоих случаях изменяется организация 5'-кассет vsp с участием 3 генов vsp. Анализ методами удлинения праймера и Нозерн-блота показал, что специфич. К-2 (A[2]) является активным промотором и что перенос этого регуляторного элемента к молчащему гену vsp в результате инверсии ДНК разрешает транскрипцию реципиентного гена. В ФВ I и II участвуют две сайт-специфич. инверсии ДНК между инвертированными копиями специфич. элемента длиной 35 п. н. в консервативной К-1. Предложена модель контроля ФВ vsp. Израиль, Dep. Membrane and Ultrastructure Res., Hebrew Univ.- Hadassah Med. Sch., Jerusalem 91120. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АНТИГЕНЫ
ЛИПОПРОТЕИНОВЫЕ АНТИГЕНЫ VSP AC
ФАЗОВЫЕ ВАРИАЦИИ
МЕХАНИЗМ
ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОРЫ ГЕНОВ АНТИГЕНОВ VSP
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ВЛИЯНИЕ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
MYCOPLASMA BOVIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ron, Yael; Yogev, David

1-20 21-40 41-61 61-61

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска