СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ<.>)

Общее количество найденных документов : 30
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-30

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 97.05-04К1.126

Regulation of IgM and IgD heavy chain gene expression: Effect of abrogation of intergenic transcriptional termination [Text] / Dorothy Yuan [et al.] // J. Immunol. - 1996. - Vol. 157, N 5. - P2073-2081 . - ISSN 0022-1767
Перевод заглавия: Регуляция экспрессии генов тяжелых цепей IgM и IgD. Влияние устранения межгенной терминации транскрипции
Аннотация: Между 'мю'- и 'дельта'-генами иммуноглобулинов расположен интрон, обусловливающий регуляцию транскрипционной терминации. Исследовали влияние делеции этого интрона на экспрессию генов H-цепей IgM и IgD в системе с трансфекцией транскрибируемых генов 'мю' и 'дельта'. Несмотря на полноценную экспрессию 'мю'-'дельта'-транскриптов мРНК в пре-В-клетках, процессинга мРНК 'дельта'-цепи не происходило до момента экспрессии IgM на мембранах В-клеток. Удаление интрона, ответственного за терминацию транскрипции, нарушает процессинг 'мю'-'дельта'-мРНК. Т. обр., экспрессия IgD находится под влиянием экспрессии IgM и тесно с ней связана. США, Dep. Pathology, Univ. Texas Southwestern Med. Ctr., Dallas, TX 75235. Библ. 34

ГРНТИ	34.43.33

ВИНИТИ 341.43.33.11
Рубрики: ИММУНОГЛОБУЛИНЫ M И D
ТЯЖЕЛЫЕ ЦЕПИ
КОДИРУЮЩИЕ ГЕНЫ
ЭКСПРЕССИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ЛИМФОЦИТЫ ПРЕ-B

Доп.точки доступа:
Yuan, Dorothy; Witte, Pamela L.; Tan, Jing; Hawley, Judith; Dang, Tam

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.05-04Б2.248

Du, Hansen.
trp RNA-binding attenuation protein-meidated long distance RNA refolding regulates translation of trpE in Bacillus subtilis [Text] / Hansen Du, Paul Babitzke // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 32. - P20494-20503 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Опосредованное связывающимся с РНК trp аттенюирующим белком изменение сворачивания РНК на большом расстоянии регулирует трансляцию trpE у Bacillus subtilis
Аннотация: Связывание активированного триптофаном белка TRAP (I) с 5'-концом вновь синтезирующейся мРНК trpEDCFBA вызывает терминацию транскрипции, но ее эффективность никогда не достигает 100%. Связывание I с 5'-нетранслируемым лидерным сегментом транскриптов trp, избежавших терминации, разрушает большую вторичную структуру, содержащую часть сайта связывания I. Это вызывает изменение сворачивание мРНК на большом расстоянии, в результате к-рого последовательность Шайна-Дальгарно (ПШД), расположенная на расстоянии более 100 н. с 3'-стороны от сайта связывания I, оказывается секвестрированной в стабильную шпильку. Образование этой структуры уменьшает синтез TrpE, т. к. блокирует доступ рибосом к ПШД trpE. Роль блокирующей ПШД в контроле трансляции trp подтверждена изучением влияния множественных замен нуклеотидов, разрушающих шпильку, но не изменяющих саму ПШД. Т. обр. I контролирует экспрессию оперона trp не только на уровне транскрипции, но и на уровне трансляции. США, Dep. Biochem. and Mol. Biol., Pennsylvania State Univ., University Park, PA 16802. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: БЕЛОК
TRAP БЕЛОК
СВЯЗЫВАНИЕ
5'-КОНЕЦ МРНК TRPEDCFBA
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
РНК МАТРИЧНОЕ
СВОРАЧИВАНИЕ
ИЗМЕНЕНИЕ
БОЛЬШОЕ РАССТОЯНИЕ
ВЛИЯНИЕ НА
ТРАНСЛЯЦИЯ
ОПЕРОН TRP
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Babitzke, Paul

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.280

Nonequilibrium mechanism of transcription termination from observations of single RNA polymerase molecules [Text] / Hong Yin [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1999. - Vol. 96, N 23. - P13124-13129 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Неравновесный механизм терминации транскрипции из наблюдений за одиночными молекулами РНК-полимеразы
Аннотация: Для установления кинетич. механизма терминации транскрипции на характеристич. терминаторах (ХТ) у кишечных бактерий методами световой микроскопии изучено поведение молекул РНК-полимеразы Escherichia coli (I), иммобилизированных на поверхности in vitro. Молекула I остается на канонич. ХТ в течение 'ПРИБЛ='64 сек перед освобождением ДНК. Это указало на существование неспособного к элонгации интермедиата /НЭИ/ у терминирующих транскрипц. комплексов, но не у комплексов, вызывающих сквозное считывание ХТ. Анализ времени жизни НЭИ указал на полный минимальный механизм терминации, в к-ром образование НЭИ необходимо и достаточно для индукции освобождения I на ХТ. Полученные данные позволили предположить, что ХТ функционируют в неравновесном процессе, в к-ром эффективность ХТ определяется относительными скоростями включения нуклеотидов в РНК и вхождения транскрипц. комплекса в состояние НЭИ. США, Dep. Biochem., Brandeis Univ., Waltham, MA 02454-9110. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ХАРАКТЕРИСТИЧЕСКИЙ ТЕРМИНАТОР
ИНТЕРМЕДИАТ
НЕСПОСОБНОСТЬ К ЭЛОНГАЦИИ
НЕРАВНОВЕСНЫЙ МЕХАНИЗМ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Yin, Hong; Artsimovetch, Irina; Landick, Robert; Gelles, Jeff

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.287

Pasman, Zvi.
Regulation of Rho-dependent transcription termination by NusG is specific to the Escherichia coli elongation complex [Text] / Zvi Pasman, Hippel Peter H. von // Biochemistry. - 2000. - Vol. 39, N 18. - P5573-5585 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Регуляция Rho-зависимой терминации транскрипции белком NusG специфична для комплекса элонгации Escherichia coli
Аннотация: Изучена регуляция зависящей от белка Rho (I) терминации транскрипции, катализируемой РНК-полимеразой Escherichia coli (II), белком NusG (III). Аналитич. центрифугирование обнаружило стабильный комплекс I-III со стехиометрией один мономер III на гексамер I. Изучение кинетики образования и распада комплекса I-III методом поверхностного плазменного резонанса позволило определить константу скорости ассоциации k[on]=(2,8'+-'0,8)*10{5} M{-1} сек{-1}, константу скорости диссоциации k[off]=(3,9'+-'0,1)*10{-3} сек{-1} и константу диссоциации K[d]=(1,5'+-'0,3)*10{-5} М. Стабильность комплекса I-II нечувствительна к изменению конц-ии соли (ацетата K) в диапазоне 0,05-0,15 М. Однако активность I в транслокации и в терминации транскрипции зависит от конц-ии соли при насыщающей конц-ии III, т. е. не отражает стабильность комплекса I-III. Зависящая от I терминация обнаружена также с РНК-полимеразами фагов SP6 и Т7. Однако в этих случаях III не влияет на терминацию транскрипции. Эти данные показали, что III модулирует зависящую от I терминацию транскрипции, специфически взаимодействуя с элонгирующим комплексом II и делая его более чувствительным к терминирующей активности I. США, Dep. Chem., Univ. Oregon, Eugene, OR 97403. Библ. 58

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК RHO
КАТАЛИЗ
ЭЛОНГИРУЮЩИЙ КОМПЛЕКС
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК NUSG
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
von, Hippel Peter H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.03-04Б2.286

Boss, Amarelle.
Characterization of the dimerization domain in BglG, an RNA-binding transcriptional antiterminator from Escherichia coli [Text] / Amarelle Boss, Anat Nussbaum-Shochat, Orna Amster-Choder // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 6. - P1755-1766 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика домена димеризации в связывающемся с РНК транскрипционном антитерминаторе BglG из Escherichia coli
Аннотация: Активность антитерминатора транскрипции BglG (I), ингибирующего терминацию транскрипции оперона bgl в ответ на 'бета'-глюкозиды, определяется его димерным состоянием, к-рое модулируется обратимым фосфорилированием. Только нефосфорилированный димер I связывается с мишенной РНК и разрешает транскрипцию. С использованием генетич. системы для изучения димеризации и антитерминации in vivo показано, что последние 104 остатка I необходимы для димеризации. Укорачивание этой области с концов или введение внутренних делеций устраняет димеризацию. На N-конце этой области расположен мотив лейциновой застежки (ЛЗ). Замена канонич. остатков лей в ЛЗ влияет на димеризацию. С-концевые 70 остатков I, расположенные за ЛЗ, содержат еще один необычный мотив димеризации. Каждая из этих 2 областей необходима, но не достаточна для димеризации. На стыке 2 доменов димеризации расположен сайт фосфорилирования I (гис[208]). Обсуждается механизм влияния фосфорилирования I на димеризацию. Израиль, Dep. Mol. Biol., Hebrew Univ. - Hadassah Med. Sch., Jerusalem 91120. Библ. 75

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АНТИТЕРМИНАТОР ТРАНСКРИПЦИИ BGLG
СВЯЗЫВАНИЕ С
РНК
ДОМЕНЫ ДИМЕРИЗАЦИИ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ИНГИБИРОВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nussbaum-Shochat, Anat; Amster-Choder, Orna

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.09-04Б1.43

Briani, Federica.
Antisense RNA-dependent transcription termination sites that modulate lysogenic development of satellite phage P4 [Text] / Federica Briani, Daniela Ghisotti, Gianni Deho // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 36, N 5. - P1124-1134 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Сайты зависящей от антисмысловой РНК терминации транскрипции, модулирующие лизогенное развитие сателлитного фага P4
Аннотация: С использованием фага ФR73 в кач-ве клонирующего вектора и супрессорной тРНК{гли} в кач-ве репортерского гена у сателлитного фага P4 охарактеризованы еще 2 терминатора транскрипции: t[1] между промотором P[LE] и геном cI и t[4] между cI и ранее описанным терминатором t[imm]. Терминация транскрипции на обоих сайтах не требует фактора Rho (I), хотя только t[1] имеет типичную структуру не зависящего от I терминатора. Эффективная терминация на t[1] требует нетранслируемой РНК CI и ее мишенной последовательности seqA. В системе in vitro РНК CI усиливает терминацию на t[1] в отсутствие каких-либо клеточных факторов. Мутант P4, у к-рого делетирован сайт t[1], может лизогенизовать штаммы Rho{+} и Rho{-} и проявляет усиленную экспрессию РНК CI. Эти данные показали, что: 1) терминаторы t[1] и t[imm] несущественны для лизогенизации P4; 2) t[4] является главным терминатором, необходимым для предотвращения in vivo экспрессии литич. генов в лизогенном состоянии. Италия, Dip. Genet. e Biol. Microorganismi, Univ. Studi Milano, Milan. Библ. 35

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ТЕРМИНАТОР ТРАНСКРИПЦИИ T[1]
T[4]
НЕТРАНСЛИРУЕМАЯ РНК CI
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ P4
ЛИЗОГЕННОЕ РАЗВИТИЕ

Доп.точки доступа:
Ghisotti, Daniela; Deho, Gianni

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.210

Konan, Kouacou Vincent.
Rho-dependent transcription termination in the tna operon of Escherichia coli: Roles of the boxA sequence and the rut site [Text] / Kouacou Vincent Konan, Charles Yanofsky // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 14. - P3981-3988 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Зависящая от Rho терминация транскрипции в опероне tna Escherichia coli: роли последовательности boxA и сайта rut
Аннотация: Изучена роль последовательности boxA и сайта rut в зависящей от фактора Rho (I) терминации транскрипции триптофаназного оперона tna у Escherichia coli. Делеции 6 н. boxA (ЦГЦЦЦТ) или введение в boxA специфич. точечных мутаций вызывают высокий уровень конститутивной экспрессии оперона. Некоторые из конститутивных замен, введенных в boxA, не изменяют последовательности лидерного пептида TnaC (II). Подтверждено, что делеция сайта rut связывания I вызывает конститутивную экспрессию. Во всех конститутивных конструкциях замена стартового кодона tnaC на стоп-кодон УГА значительно понижает экспрессию, так что конститутивная экспрессия требует трансляции II. Добавление бицикломицина (ингибитора I) к этим конструкциям с УГА усиливает экспрессию, так что уменьшение экспрессии было связано с действием I. Сочетание точечной мутации в boxA с делецией сайта rut вызывает такой же конститутивный уровень экспрессии, как у максимально индуцированного оперона tna. Эти данные подтверждают гипотезу, согласно к-рой в присутствии триптофана рибосомы, транслирующие tnaC, блокируют доступ I к сайтам boxA и rut и предотвращают терминацию транскрипции. США, Dep. Biol. Sci., Stanford Univ., Stanford, CA 94305-5020. Библ. 52

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ЗАВИСИМОСТЬ RHO
ОПЕРОН ТРИПТОФАНА TNA
BOXA ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
САЙТ RUT
РОЛЬ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Yanofsky, Charles

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 04.11-04Б1.168

King, Rodney A.
Suppression of factor-dependent transcription termination by antiterminator RNA [Text] / Rodney A. King, Robert A. Weisberg // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 24. - P7085-7091 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Супрессия фактор-зависимой терминации транскрипции антитерминаторной РНК
Аннотация: Образующиеся транскрипты сайта put фага HK022 модифицируют комплекс элонгации транскрипции так, что она заканчивается менее эффективно. Показали, что модификация также супрессирует терминацию in vivo при двух фактор-зависимых терминаторах, один из которых зависит от бактериального белка Rho, а второй - от HK022-кодируемого белка Nun. Супрессия эффективна, когда факторы терминации присутствуют на физиологических уровнях, но увеличение внутриклеточной концентрации Nun усиливает терминацию как в присутствии, так и в отсутствии put. Отсутствие терминаторной специфичности put-опосредованной антитерминации привело к заключению, что put ингибирует этап, общий для различных типов терминаторов. США, Section on Microbial Genetics, Laboratory of Molecular Genetics, National Inst. of Child Health and Human Development, bethesda, Maryland 20892-2785. Библ. 48

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
IN VIVO
ФАКТОР-ЗАВИСИМАЯ
СУПРЕССИЯ
АНТИТЕРМИНАТОРНАЯ РНК
ТРАНСКРИПТЫ САЙТА PUT
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ HK022

Доп.точки доступа:
Weisberg, Robert A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.351

REP3-mediated silencing in Saccharomyces cerevisiae [Text] / Laurie Ann Papacs [et al.] // Genetics. - 2004. - Vol. 166, N 1. - P79-87 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: REP3-опосредованное молчание в Saccharomyces cerevisiae
Аннотация: В дрожжах белки Sir и Rap1p - ключевые регуляторы транскрипционного молчания на теломерах и молчащих локусах типа спаривания. Rap1 и Sir4 также обладают якорной активностью. Для исследования механической связи между присоединением к ДНК и регуляцией транскрипции изучали способность кольцевого REP3 сегрегационного элемента опосредовать транскрипционное молчание. Установили, что замена последовательности REP3, соседней с локусом HML в делеционном штамме вызывает транскрипционную репрессию HML. Эта репрессия требует Sir - белков и уменьшается в штаммах, утративших REP3 - связывающие факторы Rep1 и Rep2. Дрожжевой комплекс сцепления ассоциирует с REP3. Также показали, что молчание REP3 уменьшается в штаммах с мутантным аллелем гена сцепления MCD1/SCC1. Полученные результаты привели к заключению, что белки Rep - антагонисты условного молчания. США, Dep. of Mol. Biol. and Biochemistry, Wesleyan Univ., Midlletown, Connecticut 96459. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.21.03.03
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
ТЕЛОМЕРЫ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОЛЬЦЕВОЙ ЭЛЕМЕНТ REP3
СЕГРЕГАЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Papacs, Laurie Ann; Sun, Yu; Anderson, Erica L.; Sun, Jianjun; Holmes, Scott G.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 06.09-04Б1.57

Kuzmine, Iaroslav.
Structure in nascent RNA leads to termination of slippage transcription by T7 RNA polymerase [Text] / Iaroslav Kuzmine, Philip A. Gottlieb, Craig T. Martin // Nucl. Acids Res. - 2001. - Vol. 29, N 12. - P2601-2606 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Структура зарождающейся РНК приводит к терминации транскрипции по типу проскальзывания, осуществляемой РНК-полимеразой T7
Аннотация: В присутствии GTP в качестве единственного субстрата на матрице, кодирующей последовательность GGGA..., РНК-полимераза T7 синтезирует транскрипционные продукты длиной до 14 нуклеотидов. После этого синтез, идущий по механизму проскальзывания, резко падает. Это снижение процесса элонгации обусловлено образованием в зарождающейся РНК внутримолекулярной G-квартетной структуры. Замена GTP на 7-деазаGTP полностью устраняет этот процесс, и синтез продолжается с постоянной эффективностью элонгации. Комплекс ДНК - фермент не создает никаких барьеров для роста зарождающейся РНК. Эта РНК не взаимодействует с белком. США, Dep. Chem., Univ. Massachusetts, Amherst, MA 01003-4510. Библ. 33

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: РНК-ПОЛИМЕРАЗА
СИНТЕЗ РНК
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ПРОСКАЛЬЗЫВАНИЕ
G-КВАРТЕТНАЯ СТРУКТУРА
ОБРАЗОВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ
ФАГ T7

Доп.точки доступа:
Gottlieb, Philip A.; Martin, Craig T.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.11-04Б2.172

Корреляции оперонной структуры с длиной генома у 14 видов микоплазм [Текст] : докл. [6 Международная конференция по биоинформатике регуляции и струтуры генома (BGRS'2008), Новосибирск, 22-28 июня, 2008] / С. А. Лашин [и др.] // Инф. вестн. ВОГиС. - 2009. - Т. 13, N 1. - С. 84-90 . - ISSN 1814-554X
Аннотация: Анализируются геномы 14 видов Mycoplasma существенно различающихся размерами своих геномов. Показано, что при уменьшении длины генома у Mycoplasma уменьшаются плотность предсказанных сайтов терминации транскрипции (количество сайтов, нормирование на число генов), плотность предсказанных единиц транскрипции и возрастает среднее количество генов, входящих в предсказанные единицы транскрипции. Для предсказания сайтов терминации транскрипции (термотивы) разработан новый метод. В работе формируется и обосновывается гипотеза о существовании эволюционной тенденции к укрупнению оперонных структур в процессе уменьшения размеров генома в ходе дегенеративной эволюции у Mycoplasma. Россия, Учреждение РАН Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск, e-mail: lashin@bionet.nsc.ru. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
УЧАСТКИ
ПРЕДСКАЗАНИЕ
МЕТОДЫ
ОПЕРОНЫ
СТРУКТУРА
УКРУПНЕНИЕ
ГЕНОМ
РАЗМЕРЫ
УМЕНЬШЕНИЕ
ЭВОЛЮЦИЯ
MYCOPLASMA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Лашин, С.А.; Матушкин, Ю.Г.; Хлебодарова, Т.М.; Лихошвай, В.А.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.158К

Еремина, С. Ю.
Роль сенсорных РНК в регуляции биосинтеза рибофлавина у Escherichia coli и Bacillus subtilis [Текст] / С. Ю. Еремина. - М. : Гос. НИИ генет. и селекции пром. микроорганизмов, 2008. - 25 с. : ил.
Аннотация: Результаты проведенного мутационного анализа лидерной области rib-оперона Bacillus subtilis и лидерной области гена ribB Escherichia coli позволили получить новую информацию для расшифровки механизма регуляции биосинтеза рибофлавина с участием сенсорных РНК. Показано, что специфические мутации в лидерной области rib-оперона B. subtilis, стабилизирующие формирование терминирующей шпильки, приводят к полной репрессии этого оперона. С другой стороны, мутации, нарушающие образование шпильки, обеспечивают конститутивную ФМН-независимую экспрессию rib-оперона. Эти данные уточняют модель регуляции rib-оперона B. subtilis с участием специфической ФМН-зависимой сенсорной РНК. В опытах in vitro показано, что ФМН модулирует вторичную структуру сенсорной РНК и влияет на уровень терминации транскрипции rib-оперона. Впервые проведен структурно-функциональный анализ гена ribB E. coli. На основании данных сайт-направленного мутагенеза и анализа поведения полученных мутантов установлено, что лидерная область гена ribB E. coli кодирует специфическую ФМН-зависимую сенсорную РНК. Из результатов опытов по гибридизации 30S-субъединицы рибосомы с сенсорной РНК гена ribB можно сделать вывод о том, что ФМН участвует в формировании шпильки, перекрывающей сайт связывания рибосомы. На основе полученных данных была построена модель регуляции гена ribB E. coli, основанная на изменении конформации сенсорной РНК в зависимости от присутствия эффектора - ФМН. Согласно этой модели, связывание ФМН с сенсорной РНК стабилизирует шпилечную структуру, перекрывающую сайт связывания рибосомы, и тем самым блокирует инициацию трансляции гена ribB. В ходе проведенной работы было установлено, что главное отличие механизмов регуляции экспрессии генов биосинтеза рибофлавина у B. subtilis и E. coli с участием ФМН-специфической сенсорной РНК состоит в том, что в rib-опероне B. subtilis контроль осуществляется на уровне терминации транскрипции, в то время как в гене ribB E. coli - на уровне инициации трансляции

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ БИСИНТЕЗА РИБОФЛАВИНА RIB
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ИНИЦИАЦИЯ ТРАНСЛЯЦИИ
КОНТРОЛЬ
ФМН-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ СЕНСОРНАЯ РНК
РОЛЬ
ДИССЕРТАЦИЯ
РОССИЯ
2008 ГОД
Свободных экз. нет

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.12-04Б2.261

Irnov, Irnov.
A regulatory RNA required for antitermination of biofilm and capsular polysaccharide operons in Bacillales [Text] / Irnov Irnov, Wade C. Winkler // Mol. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 3. - P559-575, 535-539 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Регуляторная РНК необходимая для антитерминации биопленки и оперонов капсульных полисахаридов у бацилл
Аннотация: Показали, что дополнительный слой котранскрипционной регуляции необходим для экспрессии экзополисахарида (eps). Этот механизм опосредуется новым cis-действующим РНК элементом, названным EAR, который локализован между вторым и третьием геном оперона eps. И выполняет функцию процессивной антитерминации. Идентифицировали EAR элемент в других видах бациил, что позволило предположить наличие сходного механизма для синтеза биопленки и наличия оперонов капсулярного полисахарида в других микроорганизмах. США, Dep. of Biochemistry, The Univ. of Texas Southwestem Medical Center, Dallas, Texas 75390-9038

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БИОПЛЕНКИ
ФОРМИРОВАНИЕ
ГЕННАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
ОПЕРОНЫ
КАПСУЛЯРНЫЕ ПОЛИСАХАРИДЫ EPS
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
РНК РЕГУЛЯТОРНАЯ
ЭЛЕМЕНТ EAR
ФУНКЦИИ
BACILLUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Winkler, Wade C.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 11.09-04Б4.233

Rho-dependent termination of ssrS (6S RNA) transcription in Escherichia coli. Implication for 3' processing of 6S RNA and expression of downstream ygfA (putative 5-formyl-tetrahydrofolate cyclo-ligase) [Text] / Huiseok Chae [et al.] // J. Biol. Chem. - 2011. - Vol. 286, N 1. - P114-122 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Rho-зависимая терминация транскрипции ssrS (6S PHK) Escherichia coli
Аннотация: Описали несколько Rho-зависимых сайтов терминации транскрипции ssrS (6S PHK) Escherichia coli, локализованных 90 п.н. ниже зрелого 3'-конца 6S РНк. Полученные данные позволили предположить, что 3'-конец 6S РНК генерируется через экзорибонуклеотич. зачистку, а не через экзорибонуклеотич. разрез с последующей терминацией транскрипции. Идентифицированные сайты терминации находятся внутри открытой рамки считывания ниже гена ygfA, части высоко консервативного бактериального оперона ssrS-ygfA, активируемого во время образования биопленки. Установили, что экспрессия 6S РНК, направленная на образование толерантных клеток, может регулировать Rho-зависимой терминационной активностью в клетке. Корея, Dep. of Chemistry, KAIST, Daejeon 305-701. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: РНК 6S
ЭКСПРЕССИЯ
ГЕНЫ
ГЕН SSRS
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
RHO-ЗАВИСИМАЯ
БИОПЛЕНКИ
ОБРАЗОВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ТОЛЕРАНТНЫЕ КЛЕТКИ

Доп.точки доступа:
Chae, Huiseok; Han, Kook; Kim, Kwang-sun; Park, Hongmarn; Lee, Jungmin; Lee, Younghoon

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.11-04Б2.197

Saxena, Shivalika.
Modulation of Rho-dependent transcription termination in Escherichia coli by the H-NS family of proteins [Text] / Shivalika Saxena, J. Gowrishankar // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 15. - P3832-3841 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Модуляция Rho-зависимой терминации транскрипции белками семейства H-NS y Escherichia coli
Аннотация: Установлено, что экспрессия мутантных белков H-NS в клетках Escherichia coli, дефектных по тому, или иному интерфейсу олигомеризации, но не в области ДНК-связывающего домена, ассоциирована с восстановлением транскрипционной полярности у мутантов rho и nusG. Предлагается модель сборки полимерного скаффолда H-NS и StpA, которая определяет эффективность терминации транскрипции у мутантных штаммов rho и nusG. Индия, Lab. Bact. Genet., Centre DNA Fingerprinting & Diagnostics, Hyderabad 500 001. Библ. 67

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
RHO-ЗАВИСИМОСТЬ
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛКИ H-NS
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Gowrishankar, J.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.208

Functions of the DnaA protein of Escherichia coli in replication and transciption [Text] / Walter Messer [et al.] // Biochim et biophys. acta. N. Gene Struct. and Express. - 1988. - Vol. 22, N 2-3. - P351-358 . - ISSN 0167-4781
Перевод заглавия: Функции белка DnaA Escherichia coli в репликации и транскрипции
Аннотация: Исследовался вопрос о том, является ли белок DnaA реплисомным организатором, играющим в действительности ключевую роль в инициации репликации хромосомы у E. coli. Картирование стартовых сайтов двунаправленного синтеза ДНК в плазмидах, содержащих локус oriC хромосомы, показало, что в лидирующей нити все эти сайты находятся вблизи dnaA-боксов. Репликация таких минихромосом in vitro в экстрактах клеток, дефектных по ДНК-лигазе, приводит к образованию открытых кольцевых молекул плазмидных ДНК, содержащих надрезы в стартовых сайтах. Получены данные показывающие, что комплекс белка DnaA с dnaA-боксом может обеспечивать терминацию транкрипции, однако это происходит лишь в одной из ориентаций dnaA-бокса. Анализ свойств мутации в dnaA-боксе выявил, что опосредованная белком DnaA терминация транскрипции существенна для ауторегуляции гена dnaA. Ил. 6. Табл. 2. Библ. 56.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
РЕГУЛЯЦИЯ
ДНКСВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ
БЕЛОК DNA
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Messer, Walter; Seufert, Wolfgang; Schaefer, Christoph; Gielow, Annette; Hartmann, Heidi; Wende, Martina

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.234

Roland, Kenneth L.
Role of the ribosome in suppressing transcriptional termination at the pyrBI attenuator of Escherichia coli K-12 [Text] / Kenneth L. Roland, Chongguang Liu, Chanles L. (Jr.) Turnbongh // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1988. - Vol. 85, N 19. - P7149-7153 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Роль рибосом в супрессии терминации транскрипции в pyr BI аттенюаторе Escherichia coli К-17
Аннотация: pyrBI-оперон Escherichia coli кодирует структурную (pyrB) и регуляторную (pyrJ) субъединицы аспартаттранскарбоксилазы (карбомоилфосфат: L - аспартаткарбомоилтрансфераза ЕС 2.1.3.2, АТК). Фермент участвует в биосинтезе пиримидинов. pyrBI-аттенюатор является 'ро' - независимым терминатором транскрипции и расположен перед pyrB-геном. Терминация транс крипции в pyrBI-аттенюаторе регулируется соотношением скоростей транскрипции и трансляции внутри района pyrBI, кодирующего лидерный пептид (ЛП). Исследовали роль рибосом в подавлении терминации транскрипции в pyrBI-аттенюаторе. С помощью сайт - специфического мутагенеза встроили терминирующие кодоны в рамку считывания ЛП для того, чтобы определить расстояние, которое должны транслировать рибосомы, чтобы супрессировать терминацию транскрипции. Установили, что рибосомы должны транслировать последовательность РНК длиной 14- 16 нуклеотидов для того, чтобы эффективно ингибировать терминицию транскрипции. Эта последовательность мРНК кодируется аттенюатором и образует в мРНК шпильку. Кроме того. установили, что целый ряд ранее неизвестных факторов влияет на экспрессию pyrBI-оперона. В частности, oehr - мутация может изменять св-ва мРНК, кодирующей ЛП (стабильность, способность образовывать шпильку) и влияет на уровень экспрессии АТК. Библ. 23. США, Dep. of Microbiol., Univ of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL 35294.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.17
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН PYRBI
ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
АТТЕНОЮАТОР
СУПРЕССИЯ
РИБОСОМЫ
МРНК ЛИДЕРНОГО ПЕПТИДА
МУТАЦИИ OCHR

Доп.точки доступа:
Liu, Chongguang; Turnbongh, Chanles L.(Jr.)

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.349

Schaefer, Christoph.
Directionality of DnaA protein/DNA interaction. Active orientation of the DnaA protein/dnaA box complex in transcription termination [Text] / Christoph Schaefer, Walter Messer // EMBO Journal. - 1989. - Vol. 8, N 5. - P1609-1613 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Направленность взаимодействия белок DnaA/ /ДНК. Активная ориентация комплекса DnaA/dnaA в терминации транскрипции
Аннотация: Белок DnaA, необходимый для инициации репликации хромосомы, а также являющийся репрессором транскрипции различных генов, в том числе и гена dnaA в Escherichia coli, связывается с "box"-последовательностью гена dnaA 5'TT(А/Т)Т(А/С)СА(А/С)А, представленной 4 раза в oriC Escherichia coli. Была исследована зависимость степени терминации транскрипции dnaA/DnaA-комплексом от ориентации "box" dnaA-последовательности. В качестве модельной системы была выбрана последовательность 5'-ТТТТССАСА (I). Полученные данные показывают, что только прямая ориентация последовательности I активно терминирует транскрипцию, следовательно белок DnaA взаимодействует только с одной цепью ДНК-спирали. Данные мутационного анализа dnaA-последовательности, расположенной внутри гена dnaA, свидетельствуют о том, что регуляция экспрессии гена dnaA осуществляется путем взаимодействия белка DnaA с геном dnaA. Т. обр. ген dnaA является саморегулирующимся. Ил. 3. Библ. 45. Зап. Берлин, Max-Planc-Inst. fur Mol. Gen. Abtelung Trauter. Ihnestrasse 73, D-1000 Berlin 33.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕПРЕССОРЫ
ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ
РЕПРЕССОР DNAA
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ПРОМОТОР ГЕНА DNA
КОМПЛЕКС DNAA/DNA
ОРИЕНТАЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ

Доп.точки доступа:
Messer, Walter

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.330

An escherichia coli cis-acting antiterminator sequence: The dnaG nut site [Text] / N. Almond [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1989. - Vol. 216, N 2-3. - P195-203 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Цис-активная антитерминаторная последовательность у Escherichia coli: сайт dnaG nut
Аннотация: Оперон gpsU-dnaG-proD escherichia coli содержит внутренний терминатор транскрипции Т[1], локализованный ранее в межгенном районе между генами rpsU и duaG. Путем клонирования Т[1] в составе фрагмента 127 п. н. в специальном векторе для выявления терминаторов pDR720, позволяющим вставлять терминатор между оператор-промоторным участком гена trp и служащим для определения активости клонируемого терминатора геном galK, выявлено, что Т[1] является мощным терминатором транскрипции, сравнимым по силе с терминатором Т[2], находящимся на 3'-конце оперона. Вместе с тем, установлено, что транскрипция через Т[1], обеспечивающая экспрессию гена galK может осуществляться в результате наличия в кодирующем районе гена rpsU в 5'-положении к Т[1], последовательности, гомологичной сайту nut фага 'лямбда'. Включение этой последовательности в плазмиду pDR720 в 5'-положении к Т[1] обеспечивает транскрипцию стоящего позади гена. Показано, что эта последовательность, обозначенная duaG nut может также модифицировать терминаторную активность Т[2]. Предполагается, что duaG nut является цис-активным элементом антитерминаторной системы E. coli. Ил. 7. Табл. 2. Библ. 45. США, NYU Medical Center, 550 First Avenue, New York, NY 10016.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
DNAGNUT
ТЕРМИНАТОР Т1
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Almond, N.; Yajnik, V.; Svec, P.; Godson, G.N.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.03-04Б1.98

Connelly, Sheila.
A CCAAT box sequence in the adenovirus major late promoter functional as part of an RNA polymerase II termination signal [Text] / Sheila Connelly, James L. Manley // Cell. - 1989. - Vol. 57, N 4. - P561-571 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: ССААТ последовательность главного позднего промотора аденовируса функционирует как часть терминирующего сигнала РНК-полимеразы II
Аннотация: Терминация транскрипции генов РНК-полимеразой II в ряде случаев происходит в районе сайтов полиаденилирования, хотя обычно терминация происходит значительно дальше. Авторы использовали для картирования терминации транскрипции химерную плазмидную ДНК, содержащую главный поздний промотор аденовирусов, направляющий транскрипцию ранних генов SV 40. Обнаружено, что в Кл, трансфецированных рекомбинантной ДНК, происходит терминация транскрипции в определенной, проксимальной по отношению к промотору, области, к-рая содержит ССААТ-последовательность. Данный участок главного позднего промотора аденовируса способен терминировать транскрипцию независимо от ориентации, когда она расположена за сайтом полиаденилирования. В Кл, зараженных аденовирусом, инициация транскрипции с предшествующего промотора на хромосоме аденовируса терминируется в том же месте, указывая на терминирующую функцию ССААТ-последовательности. США, Dep. of Biological Sciences Columbia Univ. New York, New York 10027. Ил. 6. Библ. 41.

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07 + 341.25.29.17.17
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ
ГЛАВНЫЙ ПОЗДНИЙ ПРОМОТОР
ССААТ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГЕНЫ
РНК ПОЛИМЕРАЗА II
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ

Доп.точки доступа:
Manley, James L.

1-20 21-30

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска