СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=РНКАЗА III<.>)

Общее количество найденных документов : 21
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-21

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.68

The effect of Srb, a homologue of the mammalian SRP receptor 'альфа'-subunit, on Bacillus subtilis growth and protein translocation [Text] / Akihiro Oguro [et al.] // Gene. - 1996. - Vol. 172, N 1. - P17-24 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Влияние Srb - гомолога 'альфа'-субъединицы рецептора SRP млекопитающих - на рост Bacillus subtilis и транслокацию белков
Аннотация: Клонирован фрагмент ДНК длиной 6098 п. н., к-рый содержит ген srb Bacillus subtilis, кодирующий белок Srb (I) - гомолог 'альфа'-субъединицы рецептора частицы узнавания сигнала SRP млекопитающих. Анализ удлинения затравки и Нозерн-блот-гибридизация показали, что srb образует оперон с еще 2 открытыми рамками считывания, одна из к-рых кодирует гомолог РНКазы III Escherichia coli (идентичность 36%), а вторая - гомолог дрожжевого белка SmcI (идентичность 26,6%). Сконструирован мутант Bac. subtilis, у к-рого экспрессия srb индуцируется изопропил - 'бета'-D-тиогалактозидом (II). Истощение I в отсутствие II вызывает дефект роста клеток, а клетки становятся нитевидными и скрученными. Методом импульсного мечения показано, что предшественник 'бета'-лактамазы почти полностью переходит в зрелую форму через 1 мин в присутствии II и лишь на 83% через 4 мин в отсутствие II. Япония, Inst. of Biol. Sci., Univ. of Tsukuba, Tsukuba-shi, Ibaraki 305. Библ. 19

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК УЗНАВАНИЯ СИГНАЛА SRB
СИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕН РЕЦЕПТОРА SRB
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
РОСТ
РНКАЗА III

Доп.точки доступа:
Oguro, Akihiro; Kakeshita, Hiroshi; Takamatsu, Hiromu; Nakamura, Kouji; Yamane, Kunio

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.08-04Б2.94

Structure of the dsRNA binding domain of E.coli RNase III [Text] / Abilhakim Kharrat [et al.] // EMBO Journal. - 1995. - Vol. 14, N 14. - P3572-3584 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Структура связывающего днРНК домена РНКазы III E. coli
Аннотация: Методами двумерной {1}H-ЯМР спектроскопии TOCSY и NOESY достигнуто полное отнесение сигналов домена РНКазы III E. coli (74 аминокислотных остатка), связывающего двунитевую РНК. Анализ данных о ЯЭО показал, что домен содержит область антипараллельной структуры 'бета'-листка (остатки 21-27, 35-42, 47-54) и 'альфа'-спиральные сегменты (5-17 и 59-74). Определение пространственной структуры проводили методами дистанционной геометрии и имитационной обработки по программе X-PLOR. На основе полученных данных предложена модель пространственной структуры домена. Обсуждаются результаты исследований гомологичных РНК-связывающих доменов из различных источников и молекулярные механизмы связывания РНК. Германия, Eur. Mol. Biol. Lab., Postfach 102209, D-69012 Heidelberg. Библ. 66

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: РНКАЗА III
ДНРНК-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН
СТРУКТУРА
МОДЕЛЬ
ЯМР СПЕКТРОСКОПИЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Kharrat, Abilhakim; Macias, Maria J.; Gibson, Toby J.; Nilges, Michael; Pastore, Annalisa

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.397

Genetic uncoupling of the dsRNA-binding and RNA cleavage activities of the Escherichia coli endoribonuclease RNase III - the effect of dsRNA binding on gene expression [Text] / S. Dasgupta [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 28, N 3. - P629-640 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Генетическое разобщение активностей в связывании днРНК и расщеплении РНК эндорибонуклеазы РНКазы III Escherichia coli - влияние связывания с днРНК на экспрессию генов
Аннотация: Описаны фенотипы мутантов Escherichia coli с точечными мутациями в гене rnc РНКазы III (I). Узнавание субстратов и процессинг РНК мутантными I исследованы in vivo по экспрессии известных модулируемых I, генов in vivo и по связыванию днРНК и их расщеплению in vitro. I мутанта rnc70 (IA) проявляет все фенотипы нулевых мутантов rnc, но мутация rnc70 доминантна по отношению к rnc{+}. Многокопийная экспрессия rnc70 супрессирует летальный фенотип rnc{+} в штамме ssyA3 и ингибирует опосредованную I активацию трансляции гена cI фага 'лямбда', т. к. IA конкурирует с I за сайт связывания с РНК. IA не расщепляет стандартные субстраты I in vitro, но при хроматографии на колонках из поли(рИ):поли(рЦ) проявляет сродство к днРНК. IA связывается с известными субстратами I сайт-специфич. образом. Доказано, что доминантный эффект IA in vivo не обязательно вызван образованием смешанных димеров IA-I. Т. обр. у IA нарушена эндонуклеазная активность, но сохранилась способность узнавать субстраты днРНК и связываться с ними. США, Gene Replication and Chromosome Biol. Lab., ABL-Basic Res. Program, NCI-FRDC, Frederick, MD 21702. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
РНКАЗА III
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
МУТАНТЫ
МУТАНТЫ ПО ГЕНУ РНКАЗЫ III RNC
ПОЛУЧЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Dasgupta, S.; Fernandez, L.; Kameyama, L.; Inada, T.; Nakamura, Y.; Pappas, A.; Court, D.L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.284

Matusunaga, James.
Escherichia coli RNase III (rnc) autoregulation occurs independently of rnc gene translation [Text] / James Matusunaga, Elizabeth L. Simons, Robert W. Simons // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 5. - P1125-1135 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Авторегуляция РНК-азы III (rnc) Escherichia coli происходит независимо от трансляции гена rnc
Аннотация: РНКаза III (I) Escherichia coli негативно авторегулирует экспрессию своего гена rnc в 10 раз, расщепляя нетранслируемый лидер и индуцируя более быстрый распад мРНК rnc, после чего I не нужна. Мутации, усиливающие трансляцию rnc, увеличивают в 10 раз стабильность расщепляемого I транскрипта. Мутации, ухудшающие трансляцию, дестабилизируют мРНК rnc независимо от присутствия I, что указывает на существование пути распада, не зависящего от I. Ослабление трансляции не влияет на транскрипт "мини-rnc", содержащий лидерную область и только первые 2 кодона гена rnc. Этот транскрипт нормально регулируется I. Транскрипты rnc, синтезированные in vitro, не распадаются в не содержащих рибосом бесклеточных экстрактах, если только они вначале не расщеплены I. Эти данные показали, что расщепление I может инициировать распад мРНК rnc независимо от ее трансляции. США, Dep. of Microbiol. and Molecular Genetics, Univ. of California, Los Angeles, CA 90085. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РНКАЗА III
ФУНКЦИИ
АВТОРЕГУЛЯЦИЯ
РНК МАТРИЧНАЯ
МРНК RNC
РАСЩЕПЛЕНИЕ
ОТСУТСТВИЕ КОРРЕЛЯЦИИ
ТРАНСЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Simons, Elizabeth L.; Simons, Robert W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.309

Ajit, K. Srivastava Rai
The multifaceted roles of the RNA processing enzyme ribonuclease III [Text] / K.Srivastava Rai Ajit, Neelam Srivastava // Indian J. Biochem. and Biophys. - 1996. - Vol. 33, N 4. - P253-260 . - ISSN 0301-1208
Перевод заглавия: Многогранная роль рибонуклеазы III - фермента, процессирующего РНК
Аннотация: Обзор. РНКаза III участвует в процессинге и созревании рРНК, мРНК и маленьких стабильных РНК, а также в конверсии полицистронного транскрипта ранней области фага Т7 в моноцистронных мРНК, в контроле экспрессии различных генов по механизму процессинга транскриптов, в авторегуляции собственного гена, в регуляции стабильности мРНК и в стимуляции трансляции. США, Dep. Internal Med., Washington Univ. Sch. Med., St. Louis, MO 63110. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК
ПРОЦЕССИНГ
ФЕРМЕНТЫ
РНКАЗА III
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 47

Доп.точки доступа:
Srivastava, Neelam

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.247

The role of Escherichia coli RNase E and RNase III in the processing of the citQRP operon mRNA from Lactococcus lactis biovar diacetylactis [Text] / Djamel Drider [et al.] // J. Mol. Microbiol. and Biotechnol. - 1999. - Vol. 1, N 2. - P337-346 . - ISSN 1464-1801
Перевод заглавия: Роль РНКазы E. и РНКазы III Escherichia coli в процессинге мРНК оперона citQRP из Lactobacillus lactis биовара diacetilactis
Аннотация: Показано, что мРНК оперона citQRP Lactobacillus lactis subsp. diacetilactis, содержащий ген citP цитратпермеазы P, подвергается в клетках L. diacetilactis и Escherichia coli одинаковому специфич. расщеплению в сложной вторичной структуре, содержащей центральную область citQ и 5'-конец citR. С использованием мутантов E. coli установлено, что в процессинге этой мРНК участвуют РНКаза Е (I) и РНКаза III (II). I отвечает за расщепление в citQ и с 5'-стороны от citR, а II расщепляет citR в сайте связывания рибосом. Предварительные данные показали, что мутант, похожий на II, существует у L. diacetilactis. Предложена модель, объясняющая роль процессинга мРНК cit в экспрессии гена citP. Испания, Ctr. Investigaciones Biol., CSIC, 28006 Madrid. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
МРНК ОПЕРОНА CITQRP
ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
РАСЩЕПЛЕНИЕ
РНКАЗА E
РНКАЗА III
СПЕЦИФИЧНОСТЬ ДЕЙСТВИЯ
LACTOBACILLUS LACTIS (BACT.)
SUBSP. DIACETILACTIS

Доп.точки доступа:
Drider, Djamel; Santos, Jorge M.; Garcia-Quintans, Nieves; Arraiano, Cecilia M.; Lopez, Paloma

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.191

Absence of RNase III alters the pathway by which RNAI, the antisense inhibitor of ColE1 replication, decays [Text] / Uta Binnie [et al.] // Microbiology. - 1999. - Vol. 145, N 11. - P3089-3100 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Отсутствие РНКазы III изменяет путь, по которому распадается РНК I - антисмысловой ингибитор репликации плазмиды ColE1
Аннотация: Изучена роль различных нуклеаз в распаде антисмысловой РНК I (I) - ингибитора репликации плазмиды ColE1 - в клетках Escherichia coli. Показано, что: 1) полинуклеотидфосфорилаза, поли(А)-полимераза и РНКаза Е (II) могут работать независимо друг от друга, облегчая распад I, 2) РНКаза-II не ускоряет распад I; 3) в отсутствие РНКазы III (III) накапливается полиаденилированная I, не процессированная II; 4) III разрезает I в положениях 82 и 98 in vitro; 5) более длинный из этих фрагментов I можно обнаружить в экстрактах штамма rnc{+}pcnB, продуцирующего III, но не в мутанте rnc pcnB, так что I является субстратом III in vivo. Предложен путь ранних стадий распада I. Великобритания, Inst. Cell and Mol. Biol., Univ. Edinburgh, Edinburgh EH9 3JR. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНГИБИТОРЫ РЕПЛИКАЦИИ
АНТИСМЫСЛОВАЯ РНК1
РАСПАД
РНКАЗА III
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН RNC{+}PCNB
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Binnie, Uta; Wong, Kenny; McAteer, Sean; Masters, Millicent

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.256

Evguenieva-Hackenberg, Elena.
RNase III processing of intervening sequences found in helix 9 of 23S rRNA in the alpha subclass of Proteobacteria [Text] / Elena Evguenieva-Hackenberg, Gabriele Klug // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 17. - P4719-4729 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Процессинг РНКазой III интронных последовательностей, найденных в спирали 9 рРНК 23S альфа-подтипа Proteobacteria
Аннотация: Секвенирована область остатков 109-205 (в нумерации Escherichia coli) рРНК 23S, содержащая спираль 9 и интронные последовательности IVS, из 12 штаммов Rhodobacter, Rhizobium, Sinorhizobium, Rhodopseudomonas и Bartonella. Предложены потенциальные вторичные структуры этой области. Сравнение IVS обнаружило большие различия скоростей эволюции в некоторых филогенетич. ветвях, горизонтальный перенос генов и эволюцию с образованием вставок и/или делеций. Процессинг IVS у Rhodobacter capsulatus in vivo зависит от РНКазы III (I), причем I расщепляет in vitro дополнительные сайты. Все содержащие IVS транскрипты процессируются in vitro I из Rhodobacter capsulatus, но I из E. coli использует в кач-ве субстратов только некоторые из них и часто расщепляет другие связи. Следовательно, субстратные специфичности этих двух I неодинаковы. Сравнение IVS спирали 9 не позволило идентифицировать мотивы последовательности, участвующие в узнавании I, но показали, что модель "антидетерминанта", предложенная для объяснения специфичности I E. coli, неприменима к субстратам из 'альфа'-Proteobacteria. Германия, Inst. Mikrobiol. und Molekularbiol., Justus-Liebig-Univ. Gissen, 35392 Giessen. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 23S
СПИРАЛЬ 9
ИНТРОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ IVS
ПРОЦЕССИНГ
ФЕРМЕНТЫ
РНКАЗА III
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
PROTEOBACTERIA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Klug, Gabriele

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.09-04Б2.202

Klein, Franziska.
RNase E is involved in 5'-end 23S rRNA processing in 'альфа'-Proteobacteria [Text] / Franziska Klein, Elena Evguenieva-Hackenberg // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 2002. - Vol. 299, N 5. - P780-786 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: РНКаза E участвует в процессинге 5'-конца 23S рРНК у 'альфа'-протобактерий
Аннотация: У Rhodobacter capsulatus и Rhizobium leguminosarum при процессинге 23SрРНК вырезается внутренний спейсерный участок, захватывающий спирали 9 и 10, при этом получается структура, подобная таковой 5,8S рРНК. Конкретные этапы созревания рРНК неизвестны, за исключением того, что вначале РНКаза III деградирует спираль 9. Показано, что сразу же GT-богатые структуры спирали 9 разрушаются. Деградация спирали 10 происходит медленнее, у изученных видов ее кинетика различна. Однако механизмы процессинга спирали 10 консервативны и требуют участия РНКазы E. Германия, (Evguenieva-Hackenberg E.). Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
23SРРНК
ПРОЦЕССИНГ
ФЕРМЕНТЫ
РНКАЗА Е
РНКАЗА III
ФУНКЦИЯ
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
RHODOBACTER CAPSULATUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Evguenieva-Hackenberg, Elena

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.05-04Б2.196

Both RNase E and RNase III control the stability of sodB mRNA upon translational inhibition by the small regulatory RNA RyhB [Text] / Taras Afonyushkin [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2005. - Vol. 33, N 5. - P1678-1689 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: РНК-аза E и РНК-аза III контролируют стабильность мРНК sodB при трансляционном ингибировании при помощи малой регуляторной РНК RyhB
Аннотация: Ранее продемонстрировали, что железо-зависимое варьирование в равновесной концентрации и транслируемости мРНК sodB моделируется малой регуляторной РНК RyhB, чапероном Hfg и РНК-азой E. Установили, что разрушение мРНК sodB задерживается инактивацией РНК-азы E in vivo, и данный энзим делает разрез внутри sod5'-нетранслируемого района (5'-UTR) in vitro, удаляя структуру 5'-петли, что облегчает связывание Hfg и рибосомы. Разрез может происходить в криптическом сайте и становиться достижимым при sod5'-UTR/RyhB спаривании оснований. Обнаружили, что Hfg не удерживается в комплексе RyhB-sodB мРНК и может быть выведен из него путем взаимодействия с другими РНК, добавляемыми in trans. Распад RyhB in vivo, в основном, зависит от РНК-азы III, а действием РНК-азы III in vitro облегчается спариванием основания с sod5'-UTR. Полученные результаты поддерживают модель, учитывающую роли РНК-азы E и РНК-азы III в обороте мРНК sodB. Австрия, Max F. Perutz Laboratories, Dep. of Microbiol. and Immunology, Univ. Dep. at the Vienna Biocenter, Dr. Bohrgasse 9/4, A-1030 Vienna. Библ. 58

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН ЖЕЛЕЗО-СУПЕРОКСИДДИСМУТАЗЫ SODB
ТРАНСКРИПЦИЯ
МРНК
СТАБИЛЬНОСТЬ
ФЕРМЕНТЫ
РНКАЗА E
РНКАЗА III
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Afonyushkin, Taras; Vecerek, Branislav; Moll, Isabelle; Blasi, Udo; Kaberdin, Vladimir R.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.160

Xu, Weijing.
Autoregulation of AbsB (RNase III) expression in Streptomyces coelicolor by endoribonucleolytic cleavage of absB operon transcripts [Text] / Weijing Xu, Jianqiang Huang, Stanley N. Cohen // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 15. - P5526-5530 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Авторегуляция экспрессии AbsB (РНКазы III) с помощью эндорибонуклеолитического разрыва транскриптов оперона absB у Streptomyces coelicolor
Аннотация: Ген absB Streptomyces coelicolor кодирует РНКазу III из семейства эндорибонуклеаз и существенен для синтеза антибиотиков. Авторы показали AbsB контролирует свою собственную экспрессию с помощью последовательного и сайт-специфического разрыва сегментов стебля шпильки собственного полицистронного транскрипта. Была показана рибонуклеолитическая регуляторная роль AbsB in vivo. США, Dep. of Genetics, MC5120, Stanford Univ. Sch. of Medicine, Stanford, CA 94305. Библ. 15

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПТЫ
ПОЛИЦИСТРОННЫЙ ТРАНСКРИПТ ОПЕРОНА ABSB
СТЕБЕЛЬ ШПИЛЬКИ
ЭНДОРИБОНУКЛЕОТИЧЕСКИЙ РАЗРЫВ
IN VIVO
РНКАЗА III
БЕЛОК ABSB
ГЕНЫ
ГЕН РНКАЗЫ III ABSB
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
АВТОРЕГУЛЯЦИЯ
STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)

Доп.точки доступа:
Huang, Jianqiang; Cohen, Stanley N.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 10.12-04М1.45

RNAase-III enzyme Dicer maintains signaling pathways for differentiation and survival in mouse cortical neural stem cells [Text] / Yoko Kawase-Koga [et al.] // J. Cell Sci. - 2010. - Vol. 123, N 4. - P586-594 . - ISSN 0021-9533
Перевод заглавия: Фермент РНКаза III-Dicer поддерживает сигнальные пути, [участвующие] в дифференцировке и выживании нейральных стволовых клеток коры головного мозга мыши
Аннотация: Показали, что Dicer играет ключевую роль в контроле развития нейральных стволовых клеток (NSC) коры головного мозга мыши. Идентифицировали популяцию Dicer-дефицитных NSC, которые способны к самообновлению, имеют нормальный кариотип и уровень экспрессии белков гетерохроматина и содержат укрупненные ядра. У этих клеток нарушена нормальная дифференцировка, при удалени митогенов они подвергаются апоптозу. Делеция гена Dicer влияет на содержание многих белков. Установлено, что Dicer играет ключевую роль в защите NSC от апоптоза. Т. обр., обнаружено, что Dicer играет важную роль в регуляции развития NSC, контролируя сигнальные пути, связанные с регуляцией выживания клеток и их дифференцировки. США, Dep. Cell Devel. Biol., Weill Med. Cool. Comell Univ., Mew York, NY 10065

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.15
Рубрики: СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ
НЕЙТРАЛЬНЫЕ
ДИФФЕРЕНЦИРОВКА
АПОПТОЗ
РНКАЗА III
DICER
МИКРОРНК
ЭПИГЕНЕТИКА
МЫШИ

Доп.точки доступа:
Kawase-Koga, Yoko; Low, Roger; Otaegi, Gaizka; Pollock, Andrew; Deng, Haiteng; Eisenhaber, Frank; Maurer-Stroh, Sebastian; Sun, Tao

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.181

RNA-Seq and RNA immunoprecipitation analyses of the transcriptome of Streptomyces coelicolor identify substrates for RNase III [Text] / Marcha L. Gatewood [et al.] // J. Bacteriol. - 2012. - Vol. 194, N 9. - P2228-2237 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: РНК-Seq и иммунопреципитационный анализ РНК транскриптома Streptomyces coelicolor позволил идентифицировать субстраты для РНК-азы III
Аннотация: Используя РНК-Seq, исследовали транскриптомы Streptomyces coelicolor M145 и РНК-III (rnc) нуль-мутант этого штамма. Идентифицировали 7800 транскриптов и кодирующих белки генов в этих штаммах и штамме ISE1880, среди транскриптов 21 генов рРНК и 65 генов тРНК. Около 2100 транскриптов кодирующих генов отнeсли в категорию транскриптов с низким содержанием. Выделили 16 функциональных категорий транскриптов. Провели анализ методом иммунопреципитации РНК, используя мутантный белок РНК-азы III, связывающийся с транскриптом, но не разрезающий его. Сравнили результаты с таковыми, полученными на микрочипах и сделали вывод о возможности использования метода иммунопреципитации РНК для идентификации новых субстратов для разрезания РНК-азой III. США, Dep. of Biology and Emory Genome Center, Emory Univ., Atlanta, Georgia

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК
ИММУНОПРЕЦИПИТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ТРАНСКРИПТОМ
РНК SEQ
СУБСТРАТЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
РАЗРЕЗАНИЕ
РНКАЗА III
STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)
M145

Доп.точки доступа:
Gatewood, Marcha L.; Bralley, Patricia; Weill, M.Ryan; Jones, George H.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.02-04Б2.83

Pines, Ophry.
Expression of double-stranded-RNA-specific RNase III of Escherichia coli is lethal to Saccharomyces cerevisiae [Text] / Ophry Pines, Hye-Joo Yoon, asayori Inouye // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 7. - P2989-2993
Перевод заглавия: Экспрессия специфичной по отношению к двунитевой РНК РНКазы III Escherichia coli является летальной для Saccharomyces cerevisia
Аннотация: Исследовали экспрессию гена, кодирующего РНКазу III E. coli, в Кл S. cerevisiae. Установили, что индукция экспрессии этого гена приводит к нарушению морфологии Кл и их гибели. Несмотря на то, что двунитевая киллерная РНК in vitro расщепляется РНКазой III, при индукции гена РНКазы III в Кл S. cerevisiae киллерная РНК, рРНК и некоторые виды мРНК оставались стабильными. С частотой 4*105} - 5*105} были получены мутанты, устойчивые к индукции гена РНКазы III. В 10% устойчивых мутантов была элиминирована двунитевая М-РНК, кодирующая синтез киллерного токсина, однако присутствовала L-РНК. С помощью генетического анализа устойчивых штаммов показали, что мутация, обеспечивающая возникновение устойчивости, локализуется вне дрожжевой хромосомы и располагается в гене, кодирующем РНКазу III. Полученные рез-ты свидетельствуют о том, что в дрожжевых Кл присутствует необходимая для их жизнедеятельности двунитевая РНК, расщепление к-рой приводит к гибели Кл. Библ. 27. США, Dept. of Biochem., Robert Wood Johnson Med. School at Rutgers, Univ. of Med. and Dentistry of New Jersey, Piscataway, NJ 08854.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.11.07
Рубрики: SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)
РОСТ
ЛЕТАЛЬНОСТЬ
РНКАЗА III
СПЕЦИФИЧНАЯ РНК
ЭКСПРЕССИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РНК ДРОЖЖЕВАЯ
РАСЩЕПЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Yoon, Hye-Joo; Inouye, asayori

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.06-04Б2.202

Takata, Renkichi.
Differential degradation of the Escherichia coli polynucleotide phosphorylase mRNA [Text] / Renkichi Takata, Mika Izuhara, Katsuji Hori // Nucl. Acids Res. - 1989. - Vol. 17, N 18. - P7441-7451 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Дифференциальная деградация полинуклеотидфосфорилазной мРНК в клетках Escherichia coli
Аннотация: Изучали процесс деградации мРНК полинуклеотидфосфорилазы (ПНФ) в Е. coli. Известно, что после синтеза эта мРНК процессируется на 5'-конце с помощью РНК-азы III. В данной работе использовали клетки Е. coli, дефектные по этому ферменту. Обнаружено, что присутствие неотщепленной последовательности на 5'-конце мРНК ПНФ существенно повышает стабильность этой мРНК. мРНК ПНФ синтезируется с нескольких промоторов и поэтому длина отщепляемой последовательности у разных молекул составляет от 70 до 540 н. Показано также, что разные участки непроцессированной мРНК ПНФ характеризуются разной стабильностью и эта стабильность увеличивается по направлению от 3'- к 5'-концу молекулы. Обсуждается природа агентов, ответственных за деградацию ПНФ-мРНК в клетках Е. coli. Библ. 21. Япония, Saga Medical School, Nabeshima, Saga.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (ВRACT.)
РНК МАТРИЧНАЯ
МРНК ПОЛИНУКЛЕОТИДФОСФОРИЛАЗЫ
ПРОЦЕССИНГ
РНКАЗА III
ТРАНСЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Izuhara, Mika; Hori, Katsuji

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.03-04Б2.728

A gene from S. pombe with homology to E. coli RNAse III blocks conjugation and sporulation when overexpressed in wild type cells [Text] / Hao-Peng Xu [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1990. - Vol. 18, N 17. - P5304 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Ген из S. pombe, гомологичный РНКазе III E. coli, блокирует конъюгацию и споруляцию при сверхэкспрессии в клетках дикого типа
Аннотация: Клонирован ген дрожжей Schizosaccharomyces pombe, к-рый при экспрессии в составе многокопийной плазмиды блокирует конъюгацию и споруляцию Кл дикого типа. Клонированный ген обозначен hes (high copy sterile). Открытая рамка считывания hcs способна кодировать белок из 363 аминокислот, гомологичный (уровень идентичности 24%) РНКазе III Escherichia coli. Предполагается, что ген hcs кодирует рибонуклеазу, к-рая избирательно разрушает мРНК, кодирующие белки, необходимые для конъюгации и споруляции. Ил. 2. Библ. 5. США, Cold Spring Harbor Lab., PO Box 100, Cold Spring Harbor, NY 11724.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.09
Рубрики: SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE (FUNGI)
СПОРООБРАЗОВАНИЕ
КОНЪЮГАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РНКАЗА III
ФУНКЦИИ
ГОМОЛОГИЯ
ESCHERICHIA
ГЕНЫ
ГЕН РНКАЗЫ III HCS
ОТКРЫТАЯ РАМКА СЧИТЫВАНИЯ

Доп.точки доступа:
Xu, Hao-Peng; Riggs, Michael; Rodgers, Linda; Wigler, Michael

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.07-04Б2.401

Regnier, P.
RNase III cleavages in non-coding leaders of Escherichia coli transcripts control mRNA stability and genetic expression [Text] / P. Regnier, M. Grunberg-Manago // Biochimie. - 1990. - Vol. 72, N 11. - P825-834 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Разрезы, производимые РНКазой III в некодирующих лидерных последовательностях транскриптов Escherichia coli, контролируют стабильность мРНК и экспрессию генов
Аннотация: Первичные транскрипты (I) оперонов rpsO-pnp,rncera-recO и met-musA-infB E. coli процессируются РНКазой III. Исследовали механизм процессирования РНКазой III. Показали, что РНКаза III разрезает I на 5{1}-конце перед сайтом инициации трансляции. Процессированные I подвергаются быстрой деградации нуклеазами, а непроцессированные - нет. Делают, вывод, что последовательность на 5{1}-конце I необходима для их стабильности. Библ. 61. Франция, Inst. de Biol. Physico Chimique, 13, rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РНК МАТРИЧНАЯ
МЕХАНИЗМ СТАБИЛЬНОСТИ
ФЕРМЕНТЫ
РНКАЗА III
ПРОЦЕССИНГ
УЧАСТИЕ

Доп.точки доступа:
Grunberg-Manago, M.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.08-04Б2.337

Srivastava, R. K.
Maturation of precursor 10SaRNA in Escherichia coli is a two-step process: the first reaction is catalyzed by RNase III in presence of Mn{2}+ [Text] / R. K. Srivastava, A. Miczak, D. Apirion // Biochimie. - 1990. - Vol. 72, N 11. - P791-802 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Созревание предшественника 10SРНК Escherichia coli - двухэтапный процесс: первая реакция катализируется РНКазой III в присутствии Mn{2}+
Аннотация: Установили, что созревание предшественника 10SРНК (р10Sa) Escherichia coli является двухэтапным процессом. Сначала под действием РНКазы III образуется p10Sa РНК, причем для проявления активности РНКазы III необходимы особые условия: 0,3-0,4 мМ Mn{2}+ (вместо 10 мМ Mg{2}+) и 20 мМ NH[4]Cl (вместо 100 мМ). 2-й этап превращения р10Sa в 10SaРНК катализируется неизвестной эндорибонуклеазой. Эта РНКаза отлична от РНКаз Е, Р, F и III, теряет активность при обработке протеиназой К или 90'ГРАДУС' С, 5 мин. Возможно, что для функционирования новой РНКазы необязательно присутствие двухвалентных ионов металлов. Ил. 15. Библ. 28. США, Dep. of Molecular Microbiology, Washington Univ. Medical School, Box 8230, St Louis, MO 63110.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РНК
РНК 10S
ПРЕДШЕСТВЕННИК РНК 10SA
ПРОЦЕССИНГ
РНКАЗЫ
РНКАЗА III
ЭНДОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕАЗА
УСЛОВИЯ АКТИВНОСТИ

Доп.точки доступа:
Miczak, A.; Apirion, D.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.09-04Б2.307

Physical map and genetic early region of the T7-related coliphage, BA14 [Text] / Joseph Michalewicz [et al.] // Gene. - 1991. - Vol. 98, N 1. - P89-93 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Физическая карта и генетическая ранняя область родственного T7 колифага BA14
Аннотация: Измерена длина генома фага ВА14, относящегося к группе Т7 литич. колифагов, и построена его рестрикц. карта. По размеру генома (39,6 т. п. н.) фаг ВА14 совпадает с фагом Т7 (39,9 т. п. н.), не содержит большого числа рестрикц. сайтов, к-рого следовало бы ожидать для ДНК такой длины и не имеет сайтов модификации для ДНК-метилтрансфераз Dam и Dcm Escherichia coli. Изучение способности различ. рестрикц. фрагментов ДНК ВА14 направлять синтез РНК под действием РНК-полимеразы E. coli и анализ продуктов расщепления транскриптов in vitro РНК-азой III позволил идентифицировать раннюю область генома ВА14. Полученные данные подтверждают, что ВА14 относится к особой подгруппе родственных Т7 фагов. Библ. 26. (A. Nicholson). США, Dept. of Biol. Sci., Wayna State Univ., Detroit, MI 48202.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: БАКТЕРИОФАГ ВА 14Й
СРАВНЕНИЕ
БАКТЕРИОФАГ Т7
ГЕНОМ
ФИЗИЧЕСКОЕ КАРТИРОВАНИЕ
ТРАНСКРИПТЫ
РНКАЗА III
ГЕНЫ
РАННИЕ ГЕНЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ХОЗЯЙСКИЕ КЛЕТКИ

Доп.точки доступа:
Michalewicz, Joseph; Hsu, Evelyn; Larson, Jeffrey J.; Nicholson, Allen W.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.08-04Б2.145

Nus transcription elongation factors and RNase III modulate small ribosome subunit biogenesis in Escherichia coli [Text] / Mikhall Bubenenko [et al.] // Mol. Microbiol. - 2013. - Vol. 87, N 2. - P382-393 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Факторы элонгации транскрипции Nus и РНКаза III модулируют биогенез малых рибосомных субчастиц у Escherihia coli
Аннотация: Белки NusA и NusB связываются со специфическими сайтами, расположенными в частности в лидерной и спейсерной последовательностях, фланкирующих транскрипт 16S рРНК, образуя комплекс с РНК-полимеразой, который супрессирует Rho-зависимую терминацию транскрипции. Еще одной функцией этого комплекса в оперонах rrn может быть шапероноподобное действие, обеспечивающее фолдинг 16S рРНК и ее процессинг РНКазой III в ходе сборки 30S субчастиц рибосомы. Это предположение основано на изучении холодочувствительных мутаций nusA и nusB, у которых нарушена трансляция и при низких температурах накапливаются предшественники 30S субчастиц. Оба фенотипа супрессируются делецией гена РНКазы III. Предположили, что белки Nus стабилизируют петлю в РНК между сайтами связывания в 5'-лидерной последовательности, обеспечивая правильный фолдинг и процессинг РНК. США, Frederick Nat. Lab. Cancer Res, m NCI, Frederick, MD 21702

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.29
Рубрики: РИБОСОМЫ
МАЛАЯ СУБЧАСТИЦА
БИОГЕНЕЗ
РНКАЗА III
ФАКТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ
ФАКТОР ЭЛОНГАЦИИ NUS
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bubenenko, Mikhall; Court, Donald L.; Al, Refeaii Abdalla; Saxena, Shivalika; Korepanov, Alexey; Friedman, David I.; Gottesman, Max E.; Alix, Jean-Herve

1-20 21-21

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска