СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ДЕГРАДАЦИИ<.>)

Общее количество найденных документов : 634
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.42

3- and 4-alkyephenol degradation pathway in Pseudomonas sp. strain KL28: Genetic organization of the Lap gene cluster and substrate specificities of phenol hydroxylase and catechol 2,3-dioxygenase [Text] / Jae Jun Jeong [et al.] // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 11. - P3265-3277 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Пути 3- и 4-алкилфенольной деградации у Pseudomonas sp. штамма KL28: генетическая организация генного кластера lap и субстратная специфичность фенолгидроксилазы и катехол-2,3-диоксигеназы
Аннотация: Ферменты и гены, ответственные за катаболизм высших алкилфенолов, не охарактеризованы у аэробных, бактерий. Pseudomonas sp. штамм KL28 может утилизировать широкий круг алкилфенолов, который включает 4-n-алкилфенолы (C[1]-C[5]). Гены, названные lap (для длиноцепочечных алкилфенолов) и кодирующие ферменты для катаболитного пути, были клонированы с использованием хромосомной ДНК и секвенированы. Гены lap локализованы в области размером 13,2 т. п. н., содержащей 14 ORFs, расположенных в порядке lap RBKLMNOPCEHJFG и имеющих одну и ту же транскрипционную ориентацию. Ген lap R транскрибируется независимо и кодирует член XylR/DmpR положительных транскрипционных регуляторов. Ген lap B, первый ген в опероне lap, кодирует катехол 2,3-диоксигеназу (C230). Гены lap KLMNOP и lap CEHJFG кодируют мультикомпонентную фенолгидроксилазу (mPH) и ферменты, которые деградируют производные 2-гидроксимукониевого полуальдегида (HMS) до промежуточных соединений TCA цикла, соответственно. Промотор P[labB] содержит звенья в положениях -24(GG) и -12(GC), которые обычно обнаруживаются в 'сигма'{54}-зависимых промоторах. Промоторный подсчет с использованием P[labB]: :gfp транскрипционной гибридной плазмиды показал, что lapB - промоторная активность индуцибельна. Промотор P[labB] отвечает на широкий круг (алкил)фенолов. Структурные гены, кодирующие ферменты, необходимые для этого катаболизма, являются сходными (42-69%) с генами, расположенными на катаболитной плазмиде pVJ150 из архея Pseudomonas sp. CF600, деградирующего фенол. Однако локус lap не включает гены, кодирующие HMS-гидролазу и ферредоксин. Известно, что последний функционально связан с C23O в процессе использования 4-алкилкатехолов, как субстратов. Окружение катаболитных генов lap обычно не обнаруживается в других оперонах, кодирующих метаразрыв. Исследования по субстратной специфичности показали, что mPH преимущественно окисляет 3- и 4-алкилфенолы до 4-алкилкатехолов. C23O преимущественно окисляет 4-алкилкатехолы через проксимальный (2,3)-разрыв. Данные процессы указывают, что два ключевых фермента имеют уникальную субстратную специфичность и определяют первоначальные процессы lap-пути у штамма KL28. Корея, Dep. of Microbiol., Changwon National Univ., Kyongnam 641-773. Библ. 83

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
ФЕНОЛЫ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ ФЕНОЛОВ LAP
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФЕРМЕНТЫ
ФЕНОЛГИДРОЛАЗА
СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ
PSEUDOMONAS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jeong, Jae Jun; Kim, Ji Hyun; Kim, Chi-Kyung; Hwang, Ingyu; Lee, Kyoung

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.299

3- and 4-alkyephenol degradation pathway in Pseudomonas sp. strain KL28: Genetic organization of the Lap gene cluster and substrate specificities of phenol hydroxylase and catechol 2,3-dioxygenase [Text] / Jae Jun Jeong [et al.] // Microbiology. - 2003. - Vol. 149, N 11. - P3265-3277 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Пути 3- и 4-алкилфенольной деградации у Pseudomonas sp. штамма KL28: генетическая организация генного кластера lap и субстратная специфичность фенолгидроксилазы и катехол-2,3-диоксигеназы
Аннотация: Ферменты и гены, ответственные за катаболизм высших алкилфенолов, не охарактеризованы у аэробных, бактерий. Pseudomonas sp. штамм KL28 может утилизировать широкий круг алкилфенолов, который включает 4-n-алкилфенолы (C[1]-C[5]). Гены, названные lap (для длиноцепочечных алкилфенолов) и кодирующие ферменты для катаболитного пути, были клонированы с использованием хромосомной ДНК и секвенированы. Гены lap локализованы в области размером 13,2 т. п. н., содержащей 14 ORFs, расположенных в порядке lap RBKLMNOPCEHJFG и имеющих одну и ту же транскрипционную ориентацию. Ген lap R транскрибируется независимо и кодирует член XylR/DmpR положительных транскрипционных регуляторов. Ген lap B, первый ген в опероне lap, кодирует катехол 2,3-диоксигеназу (C230). Гены lap KLMNOP и lap CEHJFG кодируют мультикомпонентную фенолгидроксилазу (mPH) и ферменты, которые деградируют производные 2-гидроксимукониевого полуальдегида (HMS) до промежуточных соединений TCA цикла, соответственно. Промотор P[labB] содержит звенья в положениях -24(GG) и -12(GC), которые обычно обнаруживаются в 'сигма'{54}-зависимых промоторах. Промоторный подсчет с использованием P[labB]: :gfp транскрипционной гибридной плазмиды показал, что lapB - промоторная активность индуцибельна. Промотор P[labB] отвечает на широкий круг (алкил)фенолов. Структурные гены, кодирующие ферменты, необходимые для этого катаболизма, являются сходными (42-69%) с генами, расположенными на катаболитной плазмиде pVJ150 из архея Pseudomonas sp. CF600, деградирующего фенол. Однако локус lap не включает гены, кодирующие HMS-гидролазу и ферредоксин. Известно, что последний функционально связан с C23O в процессе использования 4-алкилкатехолов, как субстратов. Окружение катаболитных генов lap обычно не обнаруживается в других оперонах, кодирующих метаразрыв. Исследования по субстратной специфичности показали, что mPH преимущественно окисляет 3- и 4-алкилфенолы до 4-алкилкатехолов. C23O преимущественно окисляет 4-алкилкатехолы через проксимальный (2,3)-разрыв. Данные процессы указывают, что два ключевых фермента имеют уникальную субстратную специфичность и определяют первоначальные процессы lap-пути у штамма KL28. Корея, Dep. of Microbiol., Changwon National Univ., Kyongnam 641-773. Библ. 83

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.31.09
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
ФЕНОЛЫ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ ФЕНОЛОВ LAP
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФЕРМЕНТЫ
ФЕНОЛГИДРОЛАЗА
СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ
PSEUDOMONAS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jeong, Jae Jun; Kim, Ji Hyun; Kim, Chi-Kyung; Hwang, Ingyu; Lee, Kyoung

Патент 5543139 Соединенные Штаты Америки, МКИ A61K 38/19.

Fruehauf, John P.
5,5 kD TNF degradation product [Текст] / John P. Fruehauf. - № 259137 ; Заявл. 12.06.1994 ; Опубл. 06.08.1996
Перевод заглавия: Продукт деградации фактора некроза опухолей (TNF) с молекулярной массой 5,5 кД
Аннотация: Конкретный продукт распада TNF является эффективным в качестве цитотоксина в отношении как TNF-чувствительных, так и TNF-устойчивых опухолевых клеток. Фармацевтическая композиция, содержащая этот продукт, полезна при лечении опухолей, которые устойчивы к TNF. Кроме того, TNF-устойчивость может измеряться как функция экспрессии рецепторов EGF опухолевых клеток

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.19.19
Рубрики: ОПУХОЛИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ
ИММУНОТЕРАПИЯ
ФАКТОР НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ
ПРОДУКТ ДЕГРАДАЦИИ
Свободных экз. нет

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.55.11.02
Рубрики: ОПУХОЛИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫЕ
ИММУНОТЕРАПИЯ
ФАКТОР НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ
ПРОДУКТ ДЕГРАДАЦИИ
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.258

Barnes, Michael R.
A 3-(3-hydroxyphenyl)propionic acid catabolic pathway in Rhodococcus globerulus PWD1: Cloning and characterization of the hpp operon [Text] / Michael R. Barnes, Wouter A. Duetz, Peter A. Williams // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 19. - P6145-6153 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Катаболический путь 3-(3-оксифенил)пропионовой кислоты у Rhodococcus globerulus PWD1: клонирование и характеристика оперона hpp
Аннотация: Клонирована и секвенирована область длиной 7 т.п.н. из генома выделенного в Нидерландах почвенного изолята Rhodococcus globerulus PWD1, кодирующая ферменты пути деградации 3-(3-оксифенил)пропионата (I). Обнаружены 5 генов, к-рые экспрессируются во время роста на I и 3-оксифенилацетате (II), но не на м-крезоле или сукцинате. Первый ген hppA транскрибируется отдельно и кодирует белок, гомологичный гидроксилазам. Следующие 4 гена hppCBKR образуют один оперон, к-рый кодирует оксимуконатполуальдегиддегидрогеназу HppC (III), экстрадиолдиоксигеназу HppB (IV), мембранный транспортный белок HppK и регуляторный белок HppR - член семейства IclR. Ферментативная активность III и IV подтверждена клонированием в Escherichia coli. По субстратной специфичности рекомбинантная II совпадает с диоксигеназой мета-пути расщепления, экспрессируемой при выращивании Rhodococcus дикого типа на I и II, и гораздо более активна с кислыми, чем с нейтральными катехинами. По аминокислотным последовательностям продукты оперона hppCBKR гомологичны ферментам и белкам, участвующим в биодеградации, и наиболее похожи на белки оперона mhp E. coli K-12, также участвующие в деградации I. Великобритания, School of Biol., Sci., Univ. of Wales, Bangor, Gwynedd LL 57 2UW. Библ. 55

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН ПУТИ ДЕГРАДАЦИИ 3-(3-ОКСИФЕНИЛ)ПРОПИОНАТА
ГЕН HPPA
ТРАНСКРИПЦИЯ
ОПЕРОН HPPCBKR
ХАРАКТЕРИСТИКА
RHODOCOCCUS GLOBERULUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Duetz, Wouter A.; Williams, Peter A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.272

Smith, Daryl J.
A cytochrome P450 involved in the metabolism of abietane diterpenoids by Pseudomonas abietaniphila BKME-9 [Text] / Daryl J. Smith, Vincent J. J. Martin, William W. Mohn // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 11. - P3631-3639 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Цитохром P450 участвует в метаболизме абиетановых дитерпеноидов у Pseudomonas abietaniphila BKME-9
Аннотация: Секвенирован участок 10,4 т. п. н. кластера dit Pseudomonas abietaniphila BKME-9, содержащий гены деградации абиетановых дитерпеноидов. Установлено, что ген ditQ кодирует цитохром-Р450-монооксидазу, Р450[dit], и гомологичен гену tdtD Pseudomonas diterpeniphila A19-6a. Нокаут гена ditQ не влияет на рост BKME-9 с абиетиковой кислотой, но замедляет его в присутствии дегидроабиетиковой и палюстриковой кислот (время удвоения увеличивается с 3,8 до 15 часов и с 5,6 до 18,5 часов, соответственно). С помощью транскрипционного слияния с xylE показано, что транскрипция ditQ индуцируется рядом дитерпеноидов. Анализ связывания субстрата P450[dit], экспрессированной в Escherichia coli, показал, что дегидроабиетиковая кислота связывается с ферментом (спектр взаимодействия типа I с K[d]=0,4 мкМ). Таким образом, доказано участие Р450[dit] в метаболизме дегидроабиетиковоей и палюстриковой кислот. Кроме того, отмечают, что идентичность аминокислотных последовательностей (72%) и организация генов, подтверждают гипотезу о присутствии функциональных гомологов в кластерах dit P. abietaniphila BKME-9 и tdt P. diterpeniphila A19-6a. Канада, Dept. Microbiol. & Immunol., Univ. British Columbia, Vancouver, British Columbia V6T 1Z3. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ДИТЕРПЕНОИДЫ
АБИЕТАНОВЫЕ
ДИССИМЯЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ ДИТЕРПЕНОИДОВ DIT
ГЕН ЦИТОХРОМ-Р450-МОНООКСИДАЗЫ DITQ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНДУКЦИЯ
ДИТЕРПЕНОИДЫ
PSEUDOMONAS ABIETANIPHILA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Martin, Vincent J.J.; Mohn, William W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.06-04Б2.258

Armengaud, Jean.
A functional 4-hydroxysalicylate/hydroxyquinol degradative pathway gene cluster is linked to the initial dibenzo-p-dioxin pathway genes in Sphingomonas sp. strain RW1 [Text] / Jean Armengaud, Kenneth N. Timmis, Rolf-Michael Wittich // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 11. - P3452-3461 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Кластер генов функционального пути деградации 4-оксисалицилата/оксихинола сцеплен с генами начального пути дибензо-п-диоксина у Sphingomonas sp., штамм RW1
Аннотация: Sphingomonas sp. RW1 может использовать дибензо-п-диоксин и дибензофуран и их гидроксилированные производные в кач-ве единственных источников C и энергии. Клонирован и секвенирован HindIII-фрагмент ДНК (9997 п. н.) с 3'-стороны от цистронов dxnA1A2 диоксигеназного компонента начальной диоксигеназной системы. Он содержит 10 колинеарных открытых рамок считывания (ОРС), образующих компактный оперон. Ферментативные активности кодируемых ими белков изучены в штамме RW1 и после гиперэкспрессии в Escherichia coli. Первые 3 ОРС (dnxC, ORF2 и fdx3) кодируют соотв. белок с низкой гомологией с бактериальными рецепторами сидерофоров, белок, не гомологичный известным белкам, и ферредоксин. Белок DxnD (I) с мол. м. 69 кД похож на фенолмонооксигеназу и катализирующий оборот 4-оксимуконата (II). Белок DxnE (III) с мол. м. 37 кД по последовательности и активности похож на известные малеилацетатредуктазы. Белок DxnE (IV) с мол. м. 33 кД является экстрадиолдиоксигеназой, эффективно расщепляющей оксихинол (V) с образованием малеилацетата (кетоформы 3-окси-цис,цис-муконата). Гетеродимерный белок DxnGH (VI) является 3-кетоадипат-сукцинил-KoA-трансферазой, а белок DxnI (VII) гомологичен ацетил-KoA-ацетилтрансферазам (тиолазам). Последняя ОРС кодирует предполагаемую транслоказу. I, IV, III, VI и VII образуют целый путь деградации II/V. Предложен путь минерализации ростовых субстратов 3-оксибензофурана и 2-оксидибензо-п-диоксина у Sphingomonas sp. RW1. Германия, Div. Microbiol., GBF - Nat. Res. Ctr. for Biotechnol., D-38124, Braunschweig. Библ. 46

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ДИБЕНЗО-П-ДИОКСИН
ДИБЕНЗОФУРАН
ГИДРОКСИЛИРОВАННЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ
ИСТОЧНИКИ С
ИСТОЧНИКИ ЭНЕРГИИ
ФРАГМЕНТЫ
ДНК
ГЕНЫ DNX
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
КЛАСТЕР ГЕНОВ ДЕГРАДАЦИИ 4-ОКСИСАЛИЦИЛАТА/ОКСИХИНОЛА
СЦЕПЛЕННОСТЬ
ГЕНЫ НАЧАЛЬНОГО ПУТИ ДИБЕНЗО-П-ДИОКСИНА
SPHINGOMONAS (BACT.)
ШТАММ RW1

Доп.точки доступа:
Timmis, Kenneth N.; Wittich, Rolf-Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.11-04Б3.163

A GntR-like negative regulator of the biphenyl degradation genes of the transposon Tn4371 [Text] / S. Mouz [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1999. - Vol. 262, N 4-5. - P790-799 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Подобный GntR негативный регулятор генов деградации бифенилов транспозона Tn4371
Аннотация: Tn4371 - транспозон длиной 55 т.п.н., выделенный из Ralstonia eutropha A5. Он несет гены деградации бифенил/4-хлор- бифенилов, образующие кластер длиной 13 т.п.н., локализованный посередине. Секвенирование ДНК выявило два потенциально регуляторных гена, bphR и bphS, фланкирующих этот район. Эксперименты по слиянию генов с использованием в качестве репортерного гена bphC, Нозерн-гибридизация и анализ удлинения затравки позволили сделать вывод, что гены bphEFGA1A2A3BCD транспозона образуют оперон, транскрибируемый с промотора pE ('сигма'70). На транскрипцию с pE не влияли делеции гена bphR, кодирующего предположительно LySR-подобный регулятор. Продукт гена bphS негативно регулировал pE и обнаруживал значительное сходство с GntR-подобными регуляторами. Это первое сообщение об участии GntR-подобного регулятора в деградации ароматических ксенобиотиков. Бельгия, Lab. Genet. des Procaryotes, Univ. Libre de Bruxelles, IBM, 12 rue des Pr. Jeneer et Brachet, B-6041 Gosselies. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.21
Рубрики: RALSTONIA EUTROPHA (BACT.)
ТРАНСПОЗОНЫ
TN4371
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН ДЕГРАДАЦИИ БИФЕНИЛОВ
ГЕНЫ-РЕГУЛЯТОРЫ
GNTR-ПОДОБНЫЙ НЕГАТИВНЫЙ РЕГУЛЯТОР
ИДЕНТИФИКАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Mouz, S.; Merlin, C.; Springael, D.; Toussaint, A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.269

A linear megaplasmid, p1 CP, carrying the genes for chlorocatechol catabolism of Rhodococcus opacus 1 CP [Text] / Christina Konig [et al.] // Microbiology. - 2004. - Vol. 150, N 9. - P3075-3087 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Линейная мегаплазмида p1CP, несущая гены катаболизма хлорокатехола Rhodococcus opacus 1CP
Аннотация: Грамположительная актинобактерия Rhodococcus opacus 1CP способна утилизировать хлороароматические соединения в качестве источника углерода. Методом пульс-электрофореза показали наличие в ней 740 т. п. н. мегаплазмиды p1CP, исследовали ее линейную топологию и выявили присутствие ковалентно связанных белков. Сравнение последовательностей на концах привело к обнаружению 13 п. н. инвертированных повторов (TIR) как части 583/587 п. н. TIR, а также двух копий высоко консервативного центра (GCTXCGC) палиндромного мотива. Провели рестрикционный анализ p1CP. При помощи ПЦР и гибридизационных методов провели скрининг нескольких генов, кодирующих ферменты деградации хлороароматических соединений. Обнаружили ген малеилацетат редуктазы macA, c/c генный кластер 4-хлоро-3,5-дихлокатехол деградации и c/c2 генный кластер 3-хлорокатехол деградации, тогда как генные кластеры cat и pca катехольного пути на плазмиде отсутствовали. При неселективных условиях выделили c/c- и c/c2-дефектные мутанты 1CP.01 и 1CP.02, несущие укороченные плазмидные варианты p1CP.01 (500 т. п. н.) и p1CP.02 (400 т. п. н.). Германия, Interdisziplinares Okologisches Zentrum, Technishe Univ. Bergakademie Freiberg, Leipziger Str., 29, D-09599 Freiberg. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.11.07
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
ХЛОРОКАТЕХОЛ
МЕХАНИЗМ
ПЛАЗМИДЫ
ЛИНЕЙНАЯ МЕГАПЛАЗМИДА P1CP
СТРУКТУРА
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ ХЛОРОКАТЕХОЛА
ХАРАКТЕРИСТИКА
RHODOCOCCUS OPACUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Konig, Christina; Eulberg, Dirk; Groning, Janosch; Lakner, Silvia; Seibert, Volker; Kaschabek, Stefan R.; Schlomann, Micahel

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 01.10-04Б3.36

A modellistic view of the kinetics of metabolic processes: Differences in the glucose and xylose degradation pathway [Text] / Simone Bastianoni [et al.] // Chem. Phys. Lett. - 1999. - Vol. 310, N 1-2. - P38-42 . - ISSN 0009-2614
Перевод заглавия: Моделирование кинетики метаболических процессов: различия в пути деградации глюкозы и ксилозы
Аннотация: Метод ЯМР-спектроскопии in vivo и избирательно меченые {13}C-сахара были использованы для изучения кинетики метаболических превращений глюкозы и ксилозы, характерных для изолированного штамма Klebsiella planticola G11. Экспериментальные данные были затем использованы для разработки модели, основанной на нелинейных дифференциальных уравнениях. Подсчитаны кинетические константы, относящиеся к различным путям метаболизма. Италия, Dep. Chem. and Biosyst. Sci. and CSGI, Univ. Siena. Pian Mantellini, 44-53100 Siena. Библ. 6

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: KLEBSIELLA PLANTICOLA (BACT.)
ШТАММ G11
ОСОБЕННОСТИ МЕТАБОЛИЗМА
КИНЕТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ
ГЛЮКОЗА
КСИЛОЗА
ПУТИ ДЕГРАДАЦИИ
ИЗУЧЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Bastianoni, Simone; Donati, Alessandro; Gastaldelli, Amalia; Marchettini, Nadia; Martini, Silvia; Rossi, Claudio

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI26) 01.07-04М4.67

A modellistic view of the kinetics of metabolic processes: Differences in the glucose and xylose degradation pathway [Text] / Simone Bastianoni [et al.] // Chem. Phys. Lett. - 1999. - Vol. 310, N 1-2. - P38-42 . - ISSN 0009-2614
Перевод заглавия: Моделирование кинетики метаболических процессов: различия в пути деградации глюкозы и ксилозы
Аннотация: Метод ЯМР-спектроскопии in vivo и избирательно меченые {13}C-сахара были использованы для изучения кинетики метаболических превращений глюкозы и ксилозы, характерных для изолированного штамма Klebsiella planticola G11. Экспериментальные данные были затем использованы для разработки модели, основанной на нелинейных дифференциальных уравнениях. Подсчитаны кинетические константы, относящиеся к различным путям метаболизма. Италия, Dep. Chem. and Biosyst. Sci. and CSGI, Univ. Siena. Pian Mantellini, 44-53100 Siena. Библ. 6

ГРНТИ	34.39.41

ВИНИТИ 341.39.41.07.21
Рубрики: KLEBSIELLA PLANTICOLA (BACT.)
ШТАММ G11
ОСОБЕННОСТИ МЕТАБОЛИЗМА
КИНЕТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ
ГЛЮКОЗА
КСИЛОЗА
ПУТИ ДЕГРАДАЦИИ
ИЗУЧЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Bastianoni, Simone; Donati, Alessandro; Gastaldelli, Amalia; Marchettini, Nadia; Martini, Silvia; Rossi, Claudio

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 13.08-04Б3.111

Santhoskumar, A. U.
A new additive formulation to enhance photo and biodegradation characteristics of polypropylene [Text] / A. U. Santhoskumar, K. Palanivelu // Int. J. Polym. Mater. - 2012. - Vol. 61, N 10. - P793-808 . - ISSN 0091-4037
Перевод заглавия: Новый дополнительный состав для усиления характеристик фото- и биодеградации полипропилена
Аннотация: Новая добавка, Кобальт (Со) 12-гидроксилолеат, была синтезирована и тестировалась для оценки ее усиливающего действия на фото- и биодеградацию пленки полипропилена (РР). Приготовлены РР пленки, смешанные с различными препаратами (1, 2 и 3% по весу) Со12-гидроксилолеата. Фотодеградированные пленки стали субъектами биодеградации в присутствии микроорганизмов, выделенных со свалки, таких как Aspergillus niger и Penicillium funculosum

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.11
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
ПОЛИПРОПИЛЕН
ФОТОДЕГРАДАЦИЯ
БИОДЕГРАДАЦИЯ
СО12-ГИДРОКСИОЛЕАТ
СИНТЕЗ
УСИЛЕНИЕ ДЕГРАДАЦИИ ПОЛИПРОПИЛЕНА
ASPERGILLUS NIGER (FUNGI)
PENICILLIUM FUNCULOSUM (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Palanivelu, K.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI27) 00.03-04М6.165

A new biological contribution of cyclo(His-Pro) to the peripheral inhibition of pancreatic secretion [Text] / Pascal Fragner [et al.] // Amer. J. Physiol. - 1997. - Vol. 273, N 6. - PE1127-E1132 . - ISSN 0002-9513
Перевод заглавия: Новый биологический вклад цикло(Гис-Про) в периферическое подавление секреции поджелудочной железой
Аннотация: Синтезируемый в гипоталамусе ТРГ обладает широким спектром центрального действия, включая стимуляцию секреции экзокринной части поджелудочной железы (экзПЖ). Эндокринная часть ПЖ также синтезирует ТРГ и секретирует его в периферическую циркуляцию. Ферментная деградация ТРГ приводит к образованию других биологических пептидов, включая цикло(Гис-Про), к-рые характеризуются значительно более продолжительным временем полужизни в циркуляции по сравнению с ТРГ. Показали, что цикло(Гис-Про), как и ТРГ, дозозависимо подавлял индуцированную 2-дезокси-D-глюкозой секреторную активность ПЖ, и не влияет на базальную и стимулированную холецистокинином секрецию амилазы изолированными ацинарными клетками ПЖ. Обсуждают роль цикло(Гис-Про) в обнаруженных ранее периферических эффектах ТРГ. Франция, Inst. Nat. de la Sante et de la Rech. Med. Unite 30, Mechanismt d'Action Cell. Hormones, Hopital Necktr-Enfants-Malades, 75743 Paris Cedex 15. Библ. 35

ГРНТИ	34.39.39

ВИНИТИ 341.39.39.21.61.02
Рубрики: ТИРОЛИБЕРИН
ПРОДУКТ ДЕГРАДАЦИИ ЦИКЛО(ГИС-ПРО)
ВЛИЯНИЕ
ПОДЖЕЛУДОЧНАЯ ЖЕЛЕЗА
СЕКРЕЦИЯ
АМИЛАЗА

Доп.точки доступа:
Fragner, Pascal; Presset, Olivier; Bernard, Nicole; Martinez, Jean; Roze, Claude; Aratan-Spire, Sonia

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.01-04Б2.58

A new modified ortho cleavage pathway of 3-chlorocatechol degradaton by Rhodococcus opacus 1CP: Genetic and biochemical evidence [Text] / Olga V. Moiseeva [et al.] // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 19. - P5282-5292 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новый модифицированный путь ortho-разрыва 3-хлорокатехол деградации Rhodococcus opacus 1CP: генетическое и биохимическое доказательство
Аннотация: 4-хлоро- и 2,4-дихлорофенол-деградирующий штамм Rhodococcus opacus 1CP обладает способностью минерализовать 2-хлорофенол при длительной адаптации, а также достаточно активен в отношении 3-хлоркатехола. Разработали ПЦР-праймеры и с их помощью клонировали соответствующий ген из генома Rhococuccus opacus 1CP. На плазмиде pROP1 получили 9,5 т. п. н. фрагмент ДНК, содержащий 9 рамок считывания. Идентифицировали генный кластер из 4-х генов катаболизма хлорокатехола. Исследование методом высокоэффективной жидкостной хроматографии продуктов соответствующих генов привело к заключению, что во время деградации 3-хлоркатехола в Rhodocuccus opacus 1CP дехлоринация катализируется муконолактон изомеразосвязанным энзимом, а не специализированной хлоромуконатциклоизомеразой. Германия, Inst. fur Mikrobiologie, Univ. of Stuttgart, 70550. Библ. 50

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.13
Рубрики: БИОДЕГРАДАЦИЯ
3-ХЛОРКАТЕХОЛ
МЕХАНИЗМ
ORTO-РАЗРЫВ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ 3-ХЛОРОКАТЕХОЛА
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ
МУКОНОЛАКТОН ИЗОМЕРАЗОСВЯЗАННЫЙ ЭНЗИМ
RHODOCOCCUS OPACUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Moiseeva, Olga V.; Solvanikova, Inna P.; Kaschabek, Stefan R.; Groning, Janosch; Thiel, Monika; Golovleva, Ludmila A.; Schlomann, Michael

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 03.06-04Б3.226

A novel degradative pathway of 2-nitrobenzoate via 3-hydroxyanthranilate in Pseudomonas fluorescens strain KU-7 [Text] / Yoshie Hasegawa [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2000. - Vol. 190, N 2. - P185-190 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Новый путь деградации 2-нитробензоата через 3-гидроксиантранилат штаммом Pseudomonas fluorescens KU-7
Аннотация: Бактериальный штамм, идентифицированный как Pseudomonas fluorescens KU-7, является одним из 12 новых изолятов, способных расти на 2-нитробензоате как источнике углерода, азота и энергии. Хроматографический анализ метаболитов указывал, что 3-гидроксиантранилат является полупродуктом метаболизма 2-нитробензоата в клетках KU-7. Необработанные экстракты клеток KU-7 конвертировали 2-нитробензоат до 3-гидроксиантранилата с окислением 2 молекул NADPH. Разрушение кольца 3-гидроксиантранилата ведет к образованию промежуточного желтого продукта, идентифицированного на 2-амино-3-карбоксимуконовый 6-полуальдегид, характеризующимся максимум абсорбции при 360 нм. Исходные ферменты пути деградации 2-нитробензоата являлись индуцибельными, т. к. растущие на сукцинате клетки продуцировали очень низкие ферментативные активности. Япония, Dep. Biotechnol., Fac. Eng. and High Technol. Res. Cent., Kansai Univ., Yamate-cho, Suita, Osaka 564-8680

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.17.21
Рубрики: ОХРАНА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ
БИОДЕГРАДАЦИЯ
НИТРОАРОМАТИЧЕСКИЕ СОЕДИНЕНИЯ
2-НИТРОБЕНЗОАТ
МЕХАНИЗМ
НОВЫЙ ПУТЬ ДЕГРАДАЦИИ
ПОЛУПРОДУКТЫ
PSEUDOMONAS FLUORESCENS (BACT.)
ШТАММ KU-7
ФЕРМЕНТАТИВНАЯ АКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Hasegawa, Yoshie; Muraki, Takamichi; Tokuyama, Tai; Iwaki, Hiroaki; Tatsuno, Michiaki; Lau, Peter C.K.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.221

Kitagawa, Wataru.
A novel p-nitrophenol degradation gene cluster from a gram-positive bacterium, Rhodococcus opacus SAO101 [Text] / Wataru Kitagawa, Nobutada Kimura, Yoichi Kamagata // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 15. - P4894-4902 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новый кластер генов деградации п-нитрофенола из грамположительной бактерии Rhodococcus opacus SAO101
Аннотация: Идентифицирован и охарактеризован новый кластер генов деградации п-нитрофенола (4-NP) из Rhodococcus opacus SAO101. Предсказанные аминокислотные последовательности продуктов генов npcB, npcA и npcC идентичны таковым у фенол-2-гидролазного компонента В (редуктаза, PheA2) Geobacillus thermoglucosidasius A7 (32%), 2,4,6-трихлорфенолмонооксигеназы (TcpA) Ralstonia eutropha JMPI34 (44%) и гидроксихинол-1,2-диоксигеназы (ORF2) Arthrobacter sp. BA-5-17 (76%), соответственно. В результате клонирования генов npcB, npcA и npcC в pET-17b были получены экспрессирующие векторы pETnpcB, pETnpcA и pETnpcC. Грубые клеточные экстракты Escherichia coli осуществляли превращение п-нитрофенола и 4-нитрокатехола (4-NPC) в гидроксихинол в присутствии pETnpcB и pETnpcA. В свою очередь гидроксихинол превращается в малеилацетат клеточными экстрактами E. coli, содержащими pETnpcC. Таким образом, npcB и npcA кодируют 2-компонентную 4-NP/4-NPC-монооксигеназу, а npcC - гидроксихинол-1,2-диоксигеназу. Мутанты npcA и npcC полностью лишены способности расти на п-нитрофеноле, в качестве источника углерода. Япония, Inst. Biol. Resources & Functions, Nat. Inst. Advanced Indastrial Sci. & Technol. (AIST), Tsukuba, Ibaraki 305-8566. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: КАТАБОЛИЗМ
П-НИТРОФЕНОЛ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ П-НИТРОФЕНОЛА NPC
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
RHODOCOCCUS OPACUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kimura, Nobutada; Kamagata, Yoichi

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 05.06-04Я6.51

Yoshida, Yukiko.
A novel role for N-glycans in the ERAD system [Text] / Yukiko Yoshida // J. Biochem. - 2003. - Vol. 134, N 2. - P183-190 . - ISSN 0021-924X
Перевод заглавия: Новая роль N-гликанов в системе ERAD
Аннотация: Обзор. В эндоплазматическом ретикулуме (ER) имеется система контроля за качеством и деградации (ERAD) синтезируемых белков, результатом действия которой является направление неправильно сложенных белков в протеасомы и разрушение их после убиквитинилирования. Рассмотрены возможные механизмы узнавания и транспорта таких белков, роль N-связанных олигосахаридов как мишени при связывании белков компонентами ERAD и E[3]-убиквитинлигазы, как важного связующего звена между гликозилированием и убиквитинилированием. Япония, Lab. Frontier Sci., Tokyo Metropol. Inst. Med. Sci., Tokyo 113-8613. Библ. 60

ГРНТИ	34.19.19

ВИНИТИ 341.19.19.01
Рубрики: БЕЛОК
СИСТЕМА FRAD
КОНТРОЛЬ КАЧЕСТВА И ДЕГРАДАЦИИ БЕЛКОВ
ГЛИКОПРОТЕИНЫ
N-СВЯЗАННЫЕ ГЛИКАНЫ
РОЛЬ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 60

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.261

A positive feedback mechanism controls expression of AlkS, the transcriptional regulator of the Pseudomonas oleovorans alkane degradation pathway [Text] / Ines Canosa [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 4. - P791-799 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Механизм положительной обратной связи контролирует экспрессию AlkS - транскрипционного регулятора пути деградации алканов у Pseudomonas oleovorans
Аннотация: Белок AlkS (I), кодируемый геном alkS плазмиды ОСТ Pseudomonas oleovorans, активирует экспрессию ферментов ассимиляции алканов (II) и позитивно и негативно регулирует экспрессию собственного гена alkS. В отсутствие II alkS экспрессируется с промотора PalkS1, узнаваемого РНК-полимеразой E'сигма'{S} и гораздо более активного в стационарной, чем в экспоненциальной фазе роста. I негативно регулирует этот промотор и ограничивает экспрессию I в стационарной фазе в отсутствие II. I в присутствии II более сильно репрессирует PalkS1 и одновременно активирует второй промотор PalkS2, расположенный на расстоянии 37 п. н. с 3'-стороны от PalkS1. Активация PalkS2 обеспечивает эффективную экспрессию alkS в присутствии II. Транскрипция с PalkS2 модулируется катаболитной репрессией в присутствии хороших источников С. Высказано предположение, что экспрессия alkS регулируется механизмом положительной обратной связи, вызывающим быстрое увеличение транскрипции alkS в присутствии II и быстрое выключение при исчерпании II. Испания, Dep. Biotecnol. Microbiana, Ctr. Nac. Biotecnol., CSIC-UAU, Cantoblanco, 28049 Madrid. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: КАТАБОЛИЗМ
АЛКАНЫ
ДЕГРАДАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ПЛАЗМИДНЫЕ БЕЛКИ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК-АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ ALKS
ФУНКЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ДЕГРАДАЦИИ АЛКАНОВ ALK
РЕГУЛЯЦИЯ
PSEUDOMONAS OLEOVORANS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Canosa, Ines; Sanchez-Romero, Juan Manuel; Yuste, Luis; Rojo, Fernando

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.02-04Б4.108

A putrescine-inducible pathway comprising PuuE-YneI in which 'гамма'-aminobutyrate is degraded into succinate in Escherichia coli K-12 [Text] / Shin Kurihara [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 18. - P4582-4591 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Индуцируемый путресцином путь деградации 'гамма'-аминобутирата до сукцината при участии PuuE-YneI y Escherichia coli
Аннотация: Escherichia coli обладает двумя наборами ферментов диссимиляции 'гамма'-аминобутирата в сукцинат (GabT-GabD и PuuE-YneI). Охарактеризованы ферменты второй пары - PuuE-YneI и изучена их экспрессия. Анализ профилей аминокислот в мутантных клетках 'ДЕЛЬТА'puuE и/или 'ДЕЛЬТА'gabT показал, что PuuE играет важную роль в метаболизме янтарного семиальдегида у E. coli. Установлено, что аминокислотные последовательности GabT и PuuE сходны на 67,4%, причем активный центр ферментов отличается высоким уровнем консерватизма, существенным для катализа является Lys-247. Однако, регуляция экспрессии PuuE существенно отличается от таковой у GabT:PuuE индуцируется путресцином и подавляется сукцинатом и в условиях слабой аэрации, тогда как GabT экспрессируется конститутивно. Аналогично YneI индуцируется путресцином, тогда как на GabD к нему безразличен. Таким образом, y E. coli пара PuuE-YneI важна при утилизации путресцина как единственного источника азота и углерода. Япония, Div. Appl. Biol., Grad. Sch. Sci. & Technol., Kyoto Inst. Technol., Goshokaido-cho, Matsugasaki, Sakyoku, Kyoto 606-8585. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ДИССИМИЛЯЦИЯ
ГАММА-АМИНОБУТИРАТ
ДЕГРАДАЦИЯ
ПУТРЕСЦИН
УТИЛИЗАЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ ДЕГРАДАЦИИ ПОЛИАМИНОВ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kurihara, Shin; Kato, Kenji; Asada, Kei; Kumagai, Hidehiko; Suzuki, Hideyuki

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.02-04Б2.175

A putrescine-inducible pathway comprising PuuE-YneI in which 'гамма'-aminobutyrate is degraded into succinate in Escherichia coli K-12 [Text] / Shin Kurihara [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 18. - P4582-4591 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Индуцируемый путресцином путь деградации 'гамма'-аминобутирата до сукцината при участии PuuE-YneI y Escherichia coli
Аннотация: Escherichia coli обладает двумя наборами ферментов диссимиляции 'гамма'-аминобутирата в сукцинат (GabT-GabD и PuuE-YneI). Охарактеризованы ферменты второй пары - PuuE-YneI и изучена их экспрессия. Анализ профилей аминокислот в мутантных клетках 'ДЕЛЬТА'puuE и/или 'ДЕЛЬТА'gabT показал, что PuuE играет важную роль в метаболизме янтарного семиальдегида у E. coli. Установлено, что аминокислотные последовательности GabT и PuuE сходны на 67,4%, причем активный центр ферментов отличается высоким уровнем консерватизма, существенным для катализа является Lys-247. Однако, регуляция экспрессии PuuE существенно отличается от таковой у GabT:PuuE индуцируется путресцином и подавляется сукцинатом и в условиях слабой аэрации, тогда как GabT экспрессируется конститутивно. Аналогично YneI индуцируется путресцином, тогда как на GabD к нему безразличен. Таким образом, y E. coli пара PuuE-YneI важна при утилизации путресцина как единственного источника азота и углерода. Япония, Div. Appl. Biol., Grad. Sch. Sci. & Technol., Kyoto Inst. Technol., Goshokaido-cho, Matsugasaki, Sakyoku, Kyoto 606-8585. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ДИССИМИЛЯЦИЯ
ГАММА-АМИНОБУТИРАТ
ДЕГРАДАЦИЯ
ПУТРЕСЦИН
УТИЛИЗАЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ ДЕГРАДАЦИИ ПОЛИАМИНОВ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kurihara, Shin; Kato, Kenji; Asada, Kei; Kumagai, Hidehiko; Suzuki, Hideyuki

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска