Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=TRFA<.>)
Общее количество найденных документов : 11
Показаны документы с 1 по 11
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.326

    Jagura-Burdzy, Grazyna.
    Dissection of the switch between genes for replication and transfer of promiscuous plasmid RK2: basis of the dominance of trfAp over trbAp and specificity for KorA in controlling the switch [Text] / Grazyna Jagura-Burdzy, Christopher M. Thomas // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 265, N 5. - P507-518 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Анализ переключателя между генами репликации и переноса плазмиды без определенного круга хозяев RK2: основа доминантности trfAp над trbAp и специфичность KorA в контроле переключателя
Аннотация: Опероны trfA и trb плазмиды RK2 участвуют соотв. в репликации и конъюгативном переносе и контролируются дивергентными, расположенными лицом к лицу промоторами trfAp и trbAp. Очень сильный промотор trfAp выключает trbAp до тех пор, пока не ингибируется регулятором KorA (I). Хотя trfAp репрессируется вторым регулятором KorB (II), активация trbAp наблюдается только в присутствии I, а II ингибирует активацию под действием I. Промотор trfAp связывает РНК-полимеразу (III) in vitro в 10 раз сильнее, чем trpAp. Ингибиторный эффект trfAp наблюдается на уровне комплексов элонгации транскрипции. I и II могут смещать III с trfAp, но если на промоторах образовался открытый комплекс, он имеет возможность породить транскрипты, даже если встречает III, движущуюся в противоположном направлении. II репрессирует trbAp in vivo даже при дерепрессии trbAp мутацией trfAp-1, устраняющей потребность в I. Это позволяет предположить, что II репрессирует trbAp, хотя оператор для II расположен на расстоянии 90 п. н. с 3'-стороны от старта транскрипции. I активирует trbAp даже после увеличения или уменьшения расстояния между промоторами, когда одновременное связывание III с 2 промоторами невозможно. Т. обр. I играет доминирующую роль в балансе экспрессии оперонов trf и trb, но его действие модулируется II. Великобритания, School of Biol. Sci., Univ. of Birmingham, Birmingham B15 2TT. Библ. 36
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
RK2
РЕПЛИКАЦИЯ
КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС
МЕХАНИЗМ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН TRFA
TRB
РЕГУЛЯЦИЯ
ПРОМОТОРЫ
АКТИВАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Thomas, Christopher M.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.212

   
    Species-dependent phenotypes of replication-temperature-sensitive trfA mutants of plasmid RK2: A codon-neutral base substituion stimulates temperature sensitivity by leading to reduced levels of trfA expression [Text] / Ponniah Karunakaran [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 15. - P3793-3798 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Видозависимые фенотипы температурочувствительных по репликации мутантов trfA плазмиды RK2: нейтральная для кодона замена основания стимулирует температурочувствительность, приводя к пониженному уровню экспрессии trfA
Аннотация: Для инициации репликации плазмиды RK2 требуется только один плазмидный белок TrfA (I). Выделены 4 мутанта trfA, т-рочувствительных по репликации в Pseudomonas aeruginosa. Одна из мутаций вызывает известную замену R247C, приводящую к т-рочувствительности репликации плазмиды в Escherichia coli. Остальные 3 мутанта тождественны и имеют 2 мутации: мутация 163С вызывает замену R163C в I, а мутация 235 - нейтральное изменение кодона гли[235] (ГГЦ'-'ГГУ). Обе мутации порознь не вызывают т-рочувствительный фенотип в Escherichia coli. Эффект нейтральной мутации обусловлен ее способностью значительно понижать уровень экспрессии trfA. Двойной мутант и мутант 163C не могут стабильно сохраняться в E. coli, а мутант 235 сохраняется и проявляет т-рочувствительный фенотип. Мутация 235 значительно понижает экспрессию trfA в E. coli. Изменение кодона гли[85] (ГГУ'-'ГГЦ) не влияет на экспрессию trfA. Ген trfA дикого типа экспрессируется в E. coli гораздо хуже, чем в Ps. aeruginosa. Т. обр. уровень I определяет т-рочувствительный фенотипы в различных видах. Трансляц. слияние гена lacZ E. coli с 3'-концом или внутренним положением trfA устраняет влияние мутации 235 на экспрессию. Высказано предположение, что мутация 235 влияет на структуру или стабильность мРНК trfA. Библ. 30. Норвегия, Dep. Biotechnol., Norwegian Univ. Sci. and Technol., 7005 Trondheim. Библ. 26
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА RK2
РЕПЛИКАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ПЛАЗМИДНЫЕ БЕЛКИ
РЕГУЛЯТОР РЕПЛИКАЦИИ TRFA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
МУТАЦИИ
МУТАЦИИ В ГЕНЕРЕПЛИКАЦИИ TRFA
ПОЛУЧЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Karunakaran, Ponniah; Blatny, Janet Martha; Ertesvag, Helga; Valla, Svein

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.256

   
    Repression at a distance by the global regulator KorB of promiscuous IncP plasmids [Text] / Grazyna Jagura-Burdzy [et al.] // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 32, N 3. - P519-532 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Репрессия на расстоянии глобальным регулятором KorB неразборчивых плазмид IncP
Аннотация: Белок KorB (I) длиной 358 остатков связывается с 12 высококонсервативными последовательностями в плазмиде RK2 и координирует экспрессию 5 оперонов, участвующих в стабильном наследовании и переносе плазмид. I репрессирует промоторы trfA, korA и klaA, связываясь с операторами O[B] типа I на расстоянии 4 п. н. с 5'-стороны от старта транскрипции (операторы класса 2). С-концевая делеция 17 остатков устраняет способность I репрессировать операторы класса 2, но не класса 1. Эта делеция уменьшает мультимеризацию I-(гис)[6] in vitro и значительно понижает специфичность связывания с фрагментами ДНК, содержащими O[B]. В области trbBp, где O[B]9 расположен в положении -189, мутагенез вторичного предполагаемого сайта связывания, перекрывающегося с блоком -35, не влияет на способность I репрессировать промотор. Методом задержки ЭФ-миграции показано, что связыванию I способствуют последовательности с 5'- и 3'-стороны от O[B]9 и что I образует на ДНК комплекс высшего порядка. ДНКазный футпринтинг показал, что РНК-полимераза может прямо контактировать с I, связанным с O[B]9. Этот контакт отвечает за действие I на расстоянии. Великобритания, Sch. Biol. Sci., Univ. Birmingham, Edgbaston, Birmingham B15 2TT. Библ. 45
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛОК KORB
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ОПЕРАТОР O[B]
ВЛИЯНИЕ НА
ПРОМОТОРЫ
TRFA
KORA
KLAA
РЕПРЕССИЯ
ПЛАЗМИДЫ INCP

Доп.точки доступа:
Jagura-Burdzy, Grazyna; Macartney, Donia P.; Zatyka, Molgorzata; Conliffe, Lesley; Cooke, Dunstan; Huggins, Cerys; Westblade, Lars; Khanim, Farhat; Thomas, Christopher M.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.12-04Б2.259

    Toukdarian, Aresa E.
    TrfA dimers play a role in copy-number control of RK2 replication [Text] / Aresa E. Toukdarian, Donald R. Helinski // Gene. - 1998. - Vol. 223, N 1-2. - P205-211 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Димеры TrfA играют роль в контроле числа копий при репликации RK2
Аннотация: Сравнены св-ва белка-инициатора TrfA (I) плазмиды RK2 дикого типа, контролирующего число копий, и его мутантов TrfA33 (G254D, S267L) (IA), TrfA33(P151S) (IB) и TrfA33(S257F) (IC). Гель-фильтрация и ЭФ показали, что I, IB и IC находятся в димерной форме, а IA является мономером. IB и IC не поддерживают репликацию RK2 in vivo, а IA поддерживает в транс-положении репликацию плазмиды RK2 в очень большом числе копий. В цис-положении плазмида проявляет "убегающую" репликацию, к-рая супрессируется при одновременной экспрессии IB или IC. Сочетание мутаций trfA(P151S) или trfA(S257F) с мутацией trfA(G254D, S267L) вызывает экспрессию мутантных I, к-рые являются мономерами и не восстанавливают контроль числа копий, направляемый IA. Эти данные подтвердили модель "наручников" для контроля числа копий RK2, согласно к-рой связанные с oriV мономеры I сопрягаются димерными молекулами I. США, Dep. Biol., Univ. California, San Diego, La Jolla, CA 92093-0322. Библ. 16
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ПЛАЗМИДА RK2
ЧИСЛО КОПИЙ
КОНТРОЛЬ
ДИМЕРЫ TRFA
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ИТЕРОНЫ

Доп.точки доступа:
Helinski, Donald R.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.200

    Banack, Trevor.
    TrfA-dependent inner membrane-associated plasmid RK2 DNA synthesis and association of TrfA with membranes of different gram-negative hosts [Text] / Trevor Banack, Peter D. Kim, William Firshein // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 16. - P4380-4383 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Зависимый от TrfA синтез ДНК плазмиды RK2, ассоциированной с внутренней мембраной, и связь TrfA с мембранами различных грамотрицательных хозяев
Аннотация: Анализировали способность белка инициации репликации TrfA плазмиды с широким кругом хозяев RK2 связываться с мембранами таких грамотрицательных бактерий, как Pseudomonas aeruginosa, P. putida, Salmonella enterica серовар Typhimurium и Rhodobacter sphaeroides, помимо Escherichia coli. Показано, что в клетках, содержащих плазмиду RK2, белок TrfA находится во фракциях мембран, но только фракция внутренних мембран способна к эндогенному синтезу плазмидной ДНК. Этот синтез подавляется антителами к TrfA. Фракция внешних мембран обладала незначительной способностью к синтезу ДНК, причем синтез слабо подавлялся антителами к TrfA. Для плазмидной ДНК P. aeruginosa характерно образование суперскрученных и промежуточных форм. У R. sphaeroides синтезировать плазмидную ДНК могла растворимая фракция, но на него не влияли антитела к TrfA, что указывает либо на репаративный характер этого синтеза, либо на неспецифическое удлинение фрагментов плазмидной ДНК. США, Dep. Molec. Biol. Biochem., Wesleyan Univ., Middletown, CT 06459. Библ. 14
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА RK2
АССОЦИИРОВАННАЯ С ВНУТРЕННЕЙ МЕМБРАНОЙ
ДНК
СИНТЕЗ
БЕЛОК
РЕПЛИКАТИВНЫЙ БЕЛОК TRFA
МЕМБРАНЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Kim, Peter D.; Firshein, William

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.147

   
    Identification of a novel membrane-associated gene product that suppresses toxicity of a TrfA peptide from plasmid RK2 and its relationship to the DnaA host initiation protein [Text] / Peter D. Kim [et al.] // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 6. - P1817-1824 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Идентификация нового мембрано-связанного генного продукта, который супрессирует токсичность пептида TrfA из плазмиды RK2 и его взаимодействие с инициирующим белком хозяина DnaA
Аннотация: Токсичность пептидного производного амино-концевой части 33 кДа TrfA, одного из белков, кодируемых плазмидой RK2, супрессируется белком хозяина, сходным с DnaA, инициирующим белком Escherichia coli. Новый идентифицированный белок в 28,4 кДа назвали паралогом Dna (Dp), потому что он подобен району Dna, но имеет отличие в функции инициации репликации плазмиды RK2, взаимодействует с инициирующим белком TrfA. Имеется сходство в распределении Dp и TrfA, обнаруженным ранее во фракции внутренней мембраны и почти отсутствующим в растворимой фракции E. coli. Сохранение и репликация плазмиды RK2 увеличивались в Dp-нокаут штамме и ингибировались в штаммах, содержащих экстра-копии гена Dp или в мембранных экстрактах с добавленной меченой формой Dp. Недавно показали, что Dp помогает предупреждать сверхинициацию в E. coli, и он получил название Hda. (S. Kato and T. Katayama, EMBO J. 20:4253-4262, 2001). США, Dep. of Mol. Biol. and Biochem., Wesleyan Univ. Middletown, Connecticut 06459. Библ. 41
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДНЫЕ БЕЛКИ
ПЛАЗМИДА RK2
ТОКСИЧНЫЙ ПЕПТИД TRFA
ТОКСИЧНОСТЬ
СУПРЕССИЯ
БЕЛОК
МЕМБРАННЫЙ БЕЛОК HDA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kim, Peter D.; Banack, Trevor; Lerman, Daniel M.; Tracy, Jeremiah C.; Camara, Johanna Eltz; Crooke, Elliot; Oliver, Don; Firshein, William

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.06-04Б2.202

    Zhong, Zhenping.
    A specific region in the N terminus of a replication initiation protein of plasmid RK2 is required for recruitment of Pseudomonas aeruginosa DnaB helicase to the plasmid origin [Text] / Zhenping Zhong, Donald Helinksi, Aresa Toukdarian // J. Biol. Chem. - 2003. - Vol. 278, N 46. - P45305-45310 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Специфическая область N-конца белка инициации репликации плазмиды RK2 требуется для вербовки хеликазы DnaB на участке начала репликации плазмиды
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ХЕЛИКАЗЫ
DNAB ВЕРБОВКА
НАГРУЗКА
БЕЛОК
БЕЛОК ИНИЦИАЦИИ РЕПЛИКАЦИИ
TRFA
N-КОНЕЦ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ПЛАЗМИДА RK2
РЕПЛИКАЦИЯ
ДНК
PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Helinksi, Donald; Toukdarian, Aresa

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.06-04Б2.415

   
    НОВЫЙ ГЕН ИНИЦИАТОРА РЕПЛИКАЦИИ TrfA-ТИПА ОБНАРУЖЕН В СОСТАВЕ ПЛАЗМИДЫ БИОДЕГРАДАЦИИ КАПРОЛАКТАМА/САЛИЦИЛАТА pBS270 [Текст] / О. В. Волкова [и др.] // Молекул. биол. - 2013. - Т. 47, N 2. - С. 356 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Получен мини-репликон плазмиды биодеградации капролактама/салицилата pBS270 (105 т.п.н.), выделенной из бактерий рода Pseudomonas и несущей детерминанты несовместимости группы P-7. Определена нуклеотидная последовательность pBS270mini. В составе репликона обнаружен новый ген инициатора репликации TrfA-типа, уровень гомологии которого с известными белками семейства позволяет классифицировать репликон как IncP-1-подобный. Выявлена химерная природа pBS270mini
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
РВS270
МИНИРЕПЛИКОН
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГЕНЫ
TRFA
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
БАКТЕРИИ РОДА PSEUDOMONAS

Доп.точки доступа:
Волкова, О.В.; Панов, А.В.; Кошелева, И.А.; Есикова, Т.З.; Боронин, А.М.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.07-04Б4.94

   
    The Staphylococcus aureus thiol/oxidative stress global regulator Spx controls trfA, a gene implicated in cell wall antibiotic resistance [Text] / Ambre Jousselin [et al.] // Antimicrob. Agents and Chemother. - 2013. - Vol. 57, N 7. - P3283-3284 . - ISSN 0066-4804
Перевод заглавия: Глобальный регулятор тиолового/окислительного стресса Spx Staphylococcus aureus контролирует trfA - ген, связанный с устойчивостью к антибиотикам, [действующим] на клеточную стенку
Аннотация: Изучили регуляцию транскрипции гена trfA Staphylococcus aureus, родственного гену necA Bacillus subtilis, кодирующему адапторный белок. Делеция гена trfA ведет к полной потере устойчивости к оксациллину и гликопептидным антибиотикам. Ген trfA экспрессируется моноцистронно с 3 промоторов. В присутствии действующих на клеточную стенку антибиотиков усиливается транскрипция гена trfA и повышается стационарный уровень белка TrfA. Транскрипция гена trfA не зависит от таких сенсорных стрессовых систем, как VraSK, GraRS, SigB и др., но контролируется глобальным регулятором окислительного стресса Spx. Швейцария, Serv. Infect. Dis., Univ. Hosp. Med. Sch. Geneva, Geneva. Библ. 74
ГРНТИ  
34.27.29
ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕН TRFA
АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
БЕЛОК
SPX
РЕГУЛЯТОР ТИОЛОВОГО/ОКИСЛИТЕЛЬНОГО СТРЕССА
STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jousselin, Ambre; Kelley, William L.; Barras, Christine; Lew, Daniel P.; Renzoni, Adriana

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.02-04Б2.429

    Shanmugasundaram, S.
    OriV[2] replicon function in the absence of trfA in Azotobacter vinelandii [Text] / S. Shanmugasundaram, P. M. Murali // J. Biosci. - 1988. - Vol. 13, N 4. - P353-358 . - ISSN 0250-5991
Перевод заглавия: Репликон OriV[2] фукнционирует в отсутствие trfA у Azotobacter vinelandii
Аннотация: Сконструирована гибридная плазмида pSBS-1, содержащая ori-сайт плазмиды ColE1, oriV плазмиды RK2, а также гены устойчивости к ампициллину, тетрациклину и канамицину, но не содержащая оперон trfA и kor-гены RK2. Частота трансформации полученной плазмидой Azotobacter vinelandii составляет 104} на клетку реципиента PSBS-1 стабильно наследуется трансформантами в течение чем 20 поколений. Библ. 16. Индия, Dep. of Microbiology, School of Biological Sciences, Madurai Kamaraj Univ. Madurai 725021.
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: РЕКОМБИНАНТНЫЕ ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PSBS-1
ГРУППА НЕСОВМЕСТИМОСТИ INCP-1
ПОДДЕРЖАНИЕ ПЛАЗМИД
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIV(RK2)
ДЕЛЕЦИЯ TRFA
AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)
ХОЗЯЙСКИЕ КЛЕТКИ

Доп.точки доступа:
Murali, P.M.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.05-04Б2.482

   
    Mutations in the trfA replication gene of the broad-host-range plasmid RK2 result in elevated plasmid copy numbers [Text] / Ross H. Durland [et al.] // J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 7. - P3859-3867 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Мутации в гене репликации плазмиды RK2 с широким кругом хозяев приводят к увеличению числа копий плазмиды
Аннотация: Выделен и клонирован структурный ген trfA, кодирующий белок репликации плазмиды RK2. Получены мутации клонированного гена, к-рые вызывают увеличение копийности RK2 в 28 раз по сравнению с диким типом. 6 мутаций вызывают замены различ. аминокислот и картированы в области размером 69 п. н., кодирующей 24 аминокислоты. Данные мутации супрессируются геном trf A дикого типа в транс-положении и эффективность супрессии зависит от кол-ва белка дикого типа. Т. обр. полученные мутации влияют на регуляторную активность белка репликации, к-рый контролирует инициацию репликации RK2. Ил. 6. Табл. 3. Библ. 47. (D. R. Helinski). США, Center for Molecular Genetics and Dep. of Biol., Univ. of California, San Diego, La Jolla, CA 92093.
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ЕSCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ
РЕПЛИКАЦИЯ
ПЛАЗМИДА RK2
ПЛАЗМИДНЫЕ ГНЕНЫ
ГЕН TRFA
КЛОНИРОВАНИЕ
МУТАЦИИ
МУТАЦИИ ГЕНА TRFA
КАРТИРОВАНИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
КОПИЙНОСТЬ ПЛАЗМИД

Доп.точки доступа:
Durland, Ross H.; Toukdarian, Aresa; Fang, Ferric; Helinski, Donald R.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)