Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ORIC<.>)
Общее количество найденных документов : 62
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-62 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.251

    Eliasson, Asa.

    Replication of minichromosomes in a host in which chromosome replication is random [Text] / Asa Eliasson, Kurt Nordstrom // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 6. - P1215-1220 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Репликация минихромосом в хозяине, у которого репликация хромосомы является случайной
Аннотация: Минихромосомы (МХ) являются плазмидами, у к-рых единственной областью начала репликации (ОНР) является хромосомная ОНР oriC. В клетках Escherichia coli МХ совместимы с хромосомой и реплицируются в тот же период клеточного цикла (КЦ), в к-рый ОНК oriC инициирует репликацию хромосомы. В штаммах int ОНР oriC инактивирована и замещена плазмидной ОНР. Т. к. плазмиды контролируют свою репликацию, репликация хромосомы становится разобщенной от КЦ и является случайной по отношению к КЦ у шт. int. Шт. intP1 использован для того, чтобы установить, сопряжена ли репликация МХ с репликацией хромосомы или управляется специфическими сигналами КЦ. Анализ репликации МХ методом плотностного сдвига показал, что она не является случайной в произвольно реплицирующем хромосому хозяине intP1. Это позволяет предположить, что специфические для КЦ контрольные ф-ции репликации oriC действуют и штамме intP1. Швеция, Dep. Microbiol., Biomed. Ctr, Uppsala Univ., S-751 23 Upplasa. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: МИНИХРОМОСОМЫ
РЕПЛИКАЦИЯ

ОБЛАСТЬ ORIC

КОНТРОЛЬНЫЕ ФУНКЦИИ

КЛЕТКИ INTP1

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Nordstrom, Kurt


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.273

   

    Transcriptional activation of promoters of the superoxide and multiple antibiotic resistance regulons by Rob, a binding protein of the Escherichia coli origin of chromosomal replication [Text] / Kam-Wing Jair [et al.] // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 9. - P2507-2513 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Транскрипционная активность промоторов супероксидного регулона и регулона множественной лекарственной устойчивости белком Rob, связывающимся с областью начала репликации хромосом Escherichia coli
Аннотация: Белок Rob (I), связывающийся с правым плечом области oriC начала репликации хромосомы E. coli, на 50% идентичен регулятору SoxS (II) супероксидного регулона soxRS и регулятору MarA (III) регулона mar множественной лекарственной устойчивости. Изучение св-в I как регулятора транскрипции показало, что: 1) I активирует транскрипцию генов zwf, fpr, fumC, micF, nfo и sodA; 2) для активации I транскрипции zwf нужна последовательность длиной 21 п. н. с блоком sox-mar-rob; 3) I защищает этот блок от ДНКазы; 4) для активации zwf, но не fumC или micF, I нуждается в С-концевом домене 'альфа'-субъединицы РНК-полимеризы; 5) I изгибает ДНК zwf и fumC, связываясь с ними в форме мономера. Св-ва I в активации транскрипции такие же, как у II и III. Т. обр. в геноме E. coli имеются 3 гена с одинаковой функциональной способностью. Однако, если синтез II и III индуцируется специфичными стимулами окружающей среды и нужен для защитных ответов, то I экспрессируется конститутивно и его нормальная ф-ция неизвестна. США, Dep. Biol. Sci., Univ. Maryland Baltimore County, Baltimore, MD 21228. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕГУЛОНЫ
СУПЕРОКСИДНЫЙ РЕГУЛОН SOXRS

РЕГУЛОН МНОЖЕСТВЕННОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ MAR

ТРАНСКРИПЦИЯ

ПРОМОТОРЫ

АКТИВАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК ROB, СВЯЗЫВАЮЩИЙ ORIC

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Jair, Kam-Wing; Yu, Xin; Skarstad, Kirsten; Thony, Beat; Fujita, Nobuyuki; Ishihama, Akira; Wolf, Richard E.


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 98.02-04Б4.99

   

    Transcriptional activation of promoters of the superoxide and multiple antibiotic resistance regulons by Rob, a binding protein of the Escherichia coli origin of chromosomal replication [Text] / Kam-Wing Jair [et al.] // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 9. - P2507-2513 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Транскрипционная активность промоторов супероксидного регулона и регулона множественной лекарственной устойчивости белком Rob, связывающимся с областью начала репликации хромосом Escherichia coli
Аннотация: Белок Rob (I), связывающийся с правым плечом области oriC начала репликации хромосомы E. coli, на 50% идентичен регулятору SoxS (II) супероксидного регулона soxRS и регулятору MarA (III) регулона mar множественной лекарственной устойчивости. Изучение св-в I как регулятора транскрипции показало, что: 1) I активирует транскрипцию генов zwf, fpr, fumC, micF, nfo и sodA; 2) для активации I транскрипции zwf нужна последовательность длиной 21 п. н. с блоком sox-mar-rob; 3) I защищает этот блок от ДНКазы; 4) для активации zwf, но не fumC или micF, I нуждается в С-концевом домене 'альфа'-субъединицы РНК-полимеризы; 5) I изгибает ДНК zwf и fumC, связываясь с ними в форме мономера. Св-ва I в активации транскрипции такие же, как у II и III. Т. обр. в геноме E. coli имеются 3 гена с одинаковой функциональной способностью. Однако, если синтез II и III индуцируется специфичными стимулами окружающей среды и нужен для защитных ответов, то I экспрессируется конститутивно и его нормальная ф-ция неизвестна. США, Dep. Biol. Sci., Univ. Maryland Baltimore County, Baltimore, MD 21228. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: РЕГУЛОНЫ
СУПЕРОКСИДНЫЙ РЕГУЛОН SOXRS

РЕГУЛОН МНОЖЕСТВЕННОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ MAR

ТРАНСКРИПЦИЯ

ПРОМОТОРЫ

АКТИВАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК ROB, СВЯЗЫВАЮЩИЙ ORIC

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Jair, Kam-Wing; Yu, Xin; Skarstad, Kirsten; Thony, Beat; Fujita, Nobuyuki; Ishihama, Akira; Wolf, Richard E.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.104

   

    Gene arrangement and organization in a 'ЭКВИВ'76 kb fragment encompassing the oriC region of the chromosome of Mycobacterium leprae [Text] / Hafida Fsihi [et al.] // Microbiology. - 1996. - Vol. 142, N 11. - P3147-3161 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Расположение и организация генов в 'ЭКВИВ'76 т. п. н. фрагменте, включающем область oriC хромосомы Mycobacterium leprae
Аннотация: Секвенирован протяженный (75 627 т. п. н.) сегмент хромосомы Mycobacterium leprae, включающий в себя область начала репликации oriC. Порядок генов в этом локусе подобен расположению генов в области начала репликации многих других прокариот, в частности, Mycobacterium tuberculosis и Streptomyces coelicolor. Обнаружены, как и в случае нек-рых других грамположительных микроорганизмов, гены, участвующие в основных клеточных функциях, таких как метаболизм ДНК или РНК (dnaA, dnaB, dnaN, gyrB, gyrA, pcnB, recF, rnpA, ssb), синтез клеточной стенки (ponA, pbpA) и, вероятно, клеточное деление (gidB, rodA). Неожиданным оказался тот факт, что ген gidA отсутствовал в этой части генома и вблизи oriC отсутствовал оперон рРНК. Внутри гена gyrA обнаружена внутренняя кодирующая последовательность, что указывает на необходимость сплайсинга белка для получения зрелой формы А-субъединицы ДНК-гиразы. Среди многих других заслуживающих внимания свойств следует отметить наличие открытых рамок считывания, предположительно кодирующих сериновую и треониновую протеинкиназы и протеинфосфатазу, 3 гена тРНК, один специфичный для M. leprae повторяющийся элемент и псевдоген glnQ. Франция, [S.'ПЕРПЕН'.Cole], Unite de Genetique Moleculaire Bacterienne, Inst. Pasteur, 28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 84
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ
ORIC

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ГЕНЫ ТРНК

ГЕНЫ ПРОТЕИНКИНАЗЫ

ОБНАРУЖЕНИЕ

ОРГАНИЗАЦИЯ

MYCOBACTERIUM LEPRAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Fsihi, Hafida; De, Rossi Edda; Salazar, Leiria; Cantoni, Rita; Labo, Monica; Riccardi, Giovanna; Takiff, Howard E.; Eiglmeier, Karin; Bergh, Staffan; Cole, Stewart T.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.191

   

    DnaA protein binding to individual DnaA boxes in the Escherichia coli replication origin, oriC [Text] / Christoph Weigel [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 21. - P6574-6583 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Связывание белка DnaA с индивидуальными боксами DnaA в ориджине репликации oriC Escherichia coli
Аннотация: В экспериментах in vitro изучено формирование нуклеопротеиновых комплексов между белком-инициатором репликации Dna (I) Escherichia coli и отдельными боксами DnaA в участке начала репликации oriC. I связывался с равной эффективностью с линейными и суперскрученными субстратами oriC, однако выявлено предпочтительное связывание I в пределах боксов RI, M, R2 и R3. В частности, более высокая конц-ия I была необходима для связывания DnaAc M. Показатели низкого сродства у этого сайта позволяют считать его еще одним кандидатом на роль регулятора бокса DnaA. Германия, Max-Planck-Institut fur molekulare Genetik, Ihnestrasse 73, D-14195 Berlin-Dahlem. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: БЕЛОК
DNAA БЕЛОК

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

БОКС DNAA

УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Weigel, Christoph; Schmidt, Andrea; Ruckert, Beate; Lurz, Rudi; Messer, Walter


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.274

   

    Are minichromosomes valid model systems for DNA replication control? Lessons learned from Escherichia coli [Text] / Tsuneaki Asai [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 3. - P671-675 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Являются ли минихромосомы достоверными модельными системами контроля репликации ДНК? Выводы, сделанные на Escherichia coli
Аннотация: Инициация хромосомной репликации является ключевым событием в жизненном цикле любого организма. Инициация хромосомной репликации микроорганизмов обычно исследуется с помощью плазмид, в составе к-рых клонирован участок начала хромосомной репликации. Последние исследования хромосомной репликации Escherichia coli, к-рые проводились на самой хромосоме с последовательным введением в нее определенных модификаций, показали, что потребности для инициации репликации в хромосомном oriC значительно отличаются от факторов, требуемых для ее инициации на клонированном oriC. Например, могут быть пересмотрены границы oriC. Белок Fis, абсолютно необходимый для плазмидной репликации с oriC, необходим для репликации хромосомы только при повышенных температурах. Норвегия, Dep. Cell Biol., Inst. Can. res., Montebello, 0310 Oslo. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

МИНИХРОМОСОМЫ

УЧАСТОК ORIC

КЛОНИРОВАНИЕ

СРАВНЕНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Asai, Tsuneaki; Bates, David B.; Boye, Erik; Kogoma, Tokio


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.318

    Niki, Hironori.

    Polar localization of the replication origin and terminus in Escherichia coli nucleoids during chromosome partitioning [Text] / Hironori Niki, Sota Hiraga // Genes and Dev. - 1998. - Vol. 12, N 7. - P1036-1045 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Полярная локализация сайтов начала и конца репликации в нуклеоиде Escherichia coli во время расхождения хромосом
Аннотация: С помощью ранее разработанного авторами метода "FISH" удалось продемонстрировать локализацию сайтов начала и конца репликации хромосомы при делении клеток Escherichia coli. Как известно, репликация хромосомы начинается в сайте oriC, возникают две репликационные вилки, к-рые движутся навстречу друг другу и встречаются в сайте конца репликации ter, находящемся диаметрально противоположно сайту oriC. Показано, что перед делением сайты oriC и ter локализуются у противоположных полюсов клетки. Из двух сайтов oriC один перемещается к противоположному концу, а другой - остается на прежнем месте, при этом сайт ter перемещается в центр клетки и остается там до конца репликации, т. е. до дупликации. Путем использования проб ДНК, соответствующих различным участкам хромосомы и меченных разными флюоресцентными соединениями, в гибридизационных опытах in situ показана зависимая от клеточ. цикла организация нуклеоида E. coli. Такие динамич. изменения наводят на мысль о существовании у E. coli митотического аппарата. Япония, Dep. of Mol. Cell Biol., Inst. of Mol. Embryol. and Genet., Kumamoto Univ. School of Medicine, Kumamoto 862-0976. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ХРОМОСОМА

НУКЛЕОИД

ДЕЛЕНИЕ

РАСХОЖДЕНИЕ

САЙТ ORIC

САЙТ TER

ЛОКАЛИЗАЦИЯ В КЛЕТКЕ

ДИНАМИКА ПЕРЕМЕЩЕНИЯ


Доп.точки доступа:
Hiraga, Sota


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.235

   

    Conversion to bidirectional replication after unidirectional initiation from R1 plasmid origin integrated at oriC in Escherichia coli [Text] / Sophie Maisnier-Patin [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 30, N 5. - P1067-1079 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Конверсия и двунаправленная репликация после однонаправленной инициации в области начала репликации плазмиды R1, интегрированной в OriC у Escherichia coli
Аннотация: Фенотипы клеточного деления штаммов Escherichia coli, у к-рых репликация хромосомы направляется областью oriR плазмиды R1, изучены методами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии. Характер репликации хромосомы у этих штаммов исследован анализом частоты маркеров. У одного из штаммов однонаправленная oriR ориентирована так, что репликативная вилка движется по часовой стрелке от oriC. Этот штамм растет и делится, как родитель дикого типа, и превращает однонаправленную инициацию на oriC в двунаправленную репликацию. Сайт конверсии однонаправленной репликации в двунаправленную картирован генетическими методами на расстоянии 6 мин справа от минимальной области oriC. Репликация, начинающаяся в направлении против часовой стрелки из репликона R1, интегрированного в тот же сайт в противоположной ориентации, не является ни одно-, ни двунаправленной. Этот штамм проявляет выраженную филаментацию, нерегулярное распределение нуклеоидов и присутствие безъядерных клеток. Это указывает на дефекты по сегрегации и делению. Сравнение производных intR1 с различным положением интегрированной oriR позволило предположить, что сама последовательность oriC не нужна для конверсии к двунаправленности. Для двунаправленной репликации и нормального клеточного деления необходимо прохождение репликативной вилки через область в пределах 6 мин справа от oriC. Швеция, Dep. Microbiol., Biomed. Ctr., Uppsala Univ., S-751 23 Uppsala. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА R1

РЕПЛИКАЦИЯ

ДВУНАПРАВЛЕННАЯ

ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ

ИНТЕГРАЦИЯ В ORIC

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Maisnier-Patin, Sophie; Dasgupta, Santanu; Krabbe, Margareta; Nordstrom, Kurt


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.158

   

    Gene organization in the trxA/B-oriC region of the Streptomyces coelicolor chromosome and comparison with other eubacteria [Text] / Ohad Gal-Mol [et al.] // Gene. - 1998. - Vol. 217, N 1-2. - P83-90 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Организация генов в области trxA/B-oriC хромосомы Streptomyces coelicolor и сравнение с другими эубактериями
Аннотация: Космида Н24 содержит гены trxA и trxB, кодирующие тиоредоксин и тиоредоксиредуктазу, и область oriC хромосомы Streptomyces coelicolor. Показано, что локус trxAB находится на расстоянии 9,4 т. п. н. от oriC. Секвенирование области trxAB-rnpA обнаружило 7 ориентированных в одном направлении генов, 5 из к-рых кодируют гомологи белков SpoIIIJ, Jag, GidB, Soj и SpoOJ Bacillus subtilis. Продукты этих генов участвуют в репликации ДНК, распределении хромосом и морфологич. развитии. Организация генов указанных 5 белков у S. coelicolor такая же, как у Mycobacterium leprae, M. tuberculosis, Bac. subtilis и Pseudomonas putida. Однако у последних 2 видов в этой группе генов отсутствуют гены trxAB. Израиль, Dep. Mol. Microbiol. and Biotechnol., Fac. Life Sci., Tel-Aviv Univ., Ramat Aviv 69978. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ЛОКУСЫ
ЛОКУС TRXA13

НАХОЖДЕНИЕ

ORIC

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ГЕНЫ

ОРГАНИЗАЦИЯ

СРАВНЕНИЕ

STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)

MYCOBACTERIUM LEPRAE (BACT.)

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)

BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Gal-Mol, Ohad; Borovok, Ilya; Av-Gay, Yossi; Cohen, Gerald; Aharonowitz, Yair


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.08-04Б2.146

    Niki, Hironori.

    Subcellular localization of plasmids containing the oriC region of the Escherichia coli chromosome, with or without the sopABC partitioning system [Text] / Hironori Niki, Sota Hiraga // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 34, N 3. - P498-503 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Субклеточная локализация плазмид, содержащих область oriC хромосомы Escherichia coli с системой распределения sopABC или без нее
Аннотация: Методом флуоресцентной гибридизации in situ изучена субклеточная локализация специфич. хромосомных сегментов и плазмид во время цикла клеточного деления Escherichia coli. Сегменты области начала репликации (ОНР) oriC в хромосоме расположены на границах нуклеоидов. Активно распределяющаяся плазмида мини-F и плазмиды с ОНР oriC и сегментом sopABC F-плазмиды находятся в положениях 1/4 и 3/4. Плазмиды мини-F, не имеющая сегмента sopABC, и плазмиды oriC, содержащие минимальную ОНР E. coli без sopABC, расположены случайным образом в цитоплазме на полюсах клеток. Эти данные показали, что ОНР oriC и ее фланговых областей недостаточно для позиционирования СНР хромосомы E. coli в клетке. Япония, Dep. Mol. Cell Biol., Inst. Mol. Embryol. and Genet., Kumamoto Univ. Sch. Med., Kumamoto 862-0976. Библ. 19
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ХРОМОСОМА
СЕГМЕНТЫ

ПЛАЗМИДЫ

ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

ПЛАЗМИДА МИНИ-F

ОТСУТСТВИЕ СЕГМЕНТА SOPABC

СУБКЛЕТОЧНАЯ ЛОКАЛИЗАЦИЯ

КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hiraga, Sota


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.12-04Б2.254

   

    Drunken-cell footprints: Nuclease treatment of ethanol-permeabilized bacteria reveals an initiation-like nucleoprotein complex in stationary phase replication origins [Text] / Michael R. Cassler [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1999. - Vol. 27, N 23. - P4570-4576 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Футпринты пьяных клеток: обработка нуклеазами пермеабилизированных этанолом бактерий обнаруживает похожий на инициирующий нуклеопротеиновый комплекс в областях начала репликации стационарной фазы
Аннотация: Разработан метод футпринтинга in situ ("футпринтинг пьяных клеток") для изучения структуры нуклеопротеиновых комплексов (НПК) на области начала репликации oriC Escherichia coli. Он основан на том, что кратковременная обработка клеток этанолом делает внутриклеточные НПК доступными для модифицирующих ДНК ферментов. Этим методом обнаружено связывание с oriC in vivo белка Fis в экспоненциально растущих клетках и белков DnaA (I) и IHF (II) в клетках стационарной фазы (СФ). Т. к. связывание I и II вызывает расплетание oriC in vitro, для изучения внутриклеточного расплетания oriC in vivo использована эндонуклеаза P1 (III). Кол-во сайтов расщепления III, расположенных в области расплетания oriC длиной 13 п. н., значительно увеличивается в СФ в случае oriC дикого типа, но не мутантов oriC, неспособных к расплетанию. Эти данные позволили предположить, что большинство копий oriC расплетается во время СФ, образуя НПК, похожие на инициирующие. США, Dep. Biol. Sci., Florida Inst. Technol., Melbourne, FL 32901. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: МЕТОДЫ
ФУТПРИНТ ПЬЯНЫХ КЛЕТОК

НУКЛЕОПРОТЕИНОВЫЙ КОМПЛЕКС

ИНИЦИИРУЮЩИЙ

ПЕРМЕАБИЛИЗИРУЮЩИЙ ЭТАНОЛОМ

ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Cassler, Michael R.; Grimwade, Julia E.; McGarry, Kevin C.; Mott, Ryan T.; Leonard, Alan C.


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.241

   

    DNA replication errors produced by the replicative apparatus of Escherichia coli [Text] / Shingo Fujii [et al.] // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 289, N 4. - P835-850 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Ошибки репликации репликативного аппарата Escherichia coli
Аннотация: Ген rpsL из Escherichia coli кодирует маленький рибосомный белок S 12, к-рый связывает стрептомицин. На основании этого свойства бактериальных клеток создали экспериментальную систему, позволяющую оценивать природу различных мутаций, к-рые являются модификацией нуклеотидной последовательности (НП) генов бактерий in vitro и in vivo. Проанализировали коллекцию из 1000 rpsL{-} мутантов с замещениями оснований в НП генов. Разработали систему, используя плазмидную ДНК с ориджином репликации oriC, позволяющую оценить точность работы репликативного аппарата E. coli in vitro. Сконструировали плазмиду (П) pMOL 3, к-рая несет область oriC и ген rpsL. Применив электрофоретические методы и рестрикционный анализ изучили с помощью этой П модель репликации под названием модель катящегося кольца. Установили, что средний размер фрагмента Оказаки для этой модели репликация составляет величину от 'ЭКВИВ'6 до 20 т. п. н. Оценили частоту rpsL мутаций в процессе репликации oriL плазмидной ДНК in vitro. Среди мутаций генерированных in vitro в связи с ошибками репликативного аппарата, наиболее часто встречаются мутации по сдвигу рамки считывания на один или несколько нуклеотидов как in vitro, так in vivo. Кроме этого встречаются мутации по замещению оснований типа транзиций и трансверсий, а также делеции и дупликации разного размера. Обсуждают модели механизмов мутаций со сдвигом рамки считывания, обусловленных ошибками репликативного аппарата E. coli. Япония, Dep. of Molecular Biology, Graduate Sch. of Biological Sci., Nara Inst. of Sci. and Technology, Koma Nara 630-0101. Библ. 45
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ORIC

ГЕН RPSL

ПЛАЗМИДА PMOL 3

КОНСТРУИРОВАНИЕ

ОШИБКА РЕПЛИКАЦИИ

МУТАЦИИ ПО СДВИГУ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

ТРАНЗИЦИИ

ТРАНСВЕРСИИ

МОДЕЛИ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Fujii, Shingo; Akiyama, Masahiro; Aoki, Kazuhiro; Sugaya, Yutaka; Higuchi, Kumiko; Hiraoka, Mina; Miki, Youhei; Saitoh, Naotoshi; Yoshiyama, Kaoru; Ihara, Keiichi


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.226

   

    Cellular localization of oriC during the cell cycle of Escherichia coli as analysed by fluorescent in situ hybridization [Text] : pap. Bacter. Cell Cycle Meet., Abondance, 10-14 March, 1999 / Marco Roos [et al.] // Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 8-9. - P797-802 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Анализ локализации oriC в клетках Escherichia coli в течение клеточного цикла с помощью флуоресцентной гибридизации in situ
Аннотация: С помощью флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) определяли положение участка начала репликации oriC Escherichia coli K12. Клетки выращивали до достижения стационарной фазы со временем удвоения 79 мин при 28'ГРАДУС'C. В этих условиях репликация ДНК начинается на 33 мин предыдущего цикла. Новая клетка содержит 2 участка начала репликации, которые видны в виде 2 отдельных фокусов. Число фокусов возрастает с увеличением длины клетки. Расстояние от фокуса до ближайшего клеточного полюса определяли в клетках различной длины. Предполагается, что 2 наиболее близких к поверхности фокуса располагаются на одном и том же расстоянии от полюса клетки и двигаются постепенно в соотв. с элонгацией клетки. Инициация репликации происходит вблизи центра будущей дочерней клетки. Нидерланды, Inst. Molec. Cell Biol., BioCentrum Amsterdam, Univ. Amsterdam, 1098 SM Amsterdam. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

РЕПЛИКАЦИЯ

ХРОМОСОМЫ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Roos, Marco; van, Geel Anton B.M.; Aarsman, Mirjam E.G.; Veuskens, Jacques T.M.; Woldringh, Conrad L.; Nanninga, Nanne


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.227

   

    Replication cycle dependent association of SeqA to the outer membrane fraction of E. coli [Text] : pap. Bacter. Cell Cycle Meet., Abondance, 10-14 March, 1999 / Emmanuelle d'Alencon [et al.] // Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 8-9. - P841-846 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Зависимая от цикла репликации связь SeqA с фракцией внешних мембран Escherichia coli
Аннотация: С использованием футпринтинга с ДНКазой I изучали способность внешней мембраны Escherichia coli PC-2 (dnaCts), выделенной на разных стадиях цикла репликации, связывать полуметилированный oriC. Максимальная связывающая активность наблюдалась в начале цикла репликации, а затем она постепенно снижалась. Такой же характер связывания наблюдали и у белка SeqA. Показано, что SeqA действительно связан с внешней мембраной и прочность этой связи зависит от стадии цикла репликации. Сайт-специфическое связывание внешней мембраны клеток, мутантных по seqA, с полуметилированным oriC может быть восстановлено добавлением небольших количеств белка SeqA, сшитого с гистидиновой меткой. Франция, Equipe Biochim. Genet., Inst. Jacques Monod, CNRS-Univ. Paris 6-7, 75251 Paris cedex 05. Библ. 11
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК SEQA

ВНЕШНЯЯ МЕМБРАНА

СВЯЗЬ

ДНК

РЕПЛИКАЦИЯ

УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ

ПОЛУМЕТИЛИРОВАННЫЙ ORIC

ESCHERICHIA COLI PC-2 (BACT.)


Доп.точки доступа:
d'Alencon, Emmanuelle; Taghbalout, Aziz; Kern, Renee; Kohiyama, Masamichi


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.229

   

    Chromosomal insertions localized around oriC affect the cell cycle in Escherichia coli [Text] : pap. Bacter. Cell Cycle Meet., Abondance, 10-14 March, 1999 / Felipe Molina [et al.] // Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 8-9. - P811-818 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Хромосомные инсерции, локализованные вокруг oriC, влияют на клеточный цикл Escherichia coli
Аннотация: Анализировали влияние инсерций в область oriC Escherichia coli на параметры клеточного цикла. Эти инсерции увеличивают период C, причем влияние тем больше, чем меньше расстояние от oriC. Инсерция 'ОМЕГА' увеличивает число вилок репликации на хромосому, а инсерция Tn10 снижает скорость роста клеток. Показано также, что инсерции вне oriC негативно влияют на продолжительность периода C. Предполагается, что инсерции, локализованные ближе 2 т. п. н. от oriC могут влиять на структуру участка начала репликации. Испания, Dep. Bioquim. Biol. Molec. Genet., Fac. Ciencias, Univ. Extremadura Badajoz, 06080. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ

ДНК

ОБЛАСТЬ ORIC

ИНСЕРЦИИ

ВЛИЯНИЕ


Доп.точки доступа:
Molina, Felipe; Jimenez-Sanchez, A.; Zyskind, J.W.; Guzman, Elena C.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.233

    Salazar, Leiria.

    Inhibition of chromosome replication in Mycobacterium smegmatis: Effect of the rpmH-dnaA promoter region [Text] / Leiria Salazar // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 9. - P2199-2207 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Ингибирование репликации хромосомы у Mycobacterium smegmatis: влияние промоторного участка rpmH-dnaA
Аннотация: У Mycobacterium smegmatis сконструирована серия плазмид, содержащих хромосомный сайт oriC и различные делеции и замены в следующей после oriC регуляторной области гена dnaA (промотор rpmH-dnaA и DnaA-боксы). Эти делеции и замены изменяют активность промотора (превращают сильный промотор в слабый или неактивный), а также заменяют район DnaA-боксов на последовательность, не содержащую консенсусных мотивов DnaA-боксов. Показано, что короткая последовательность длиной 270 нуклеотидов, содержащая сильный промотор rpmH-dnaA, ингибирует активность oriC. Три DnaA-бокса перед геном dnaA не очень сильно влияют на активность oriC. Если область промотора rpmH-dnaA с геном dnaA клонировали в транс-положении, невозможно было добиться возникновения трансформантов. Венесуэла, Lab. de Genet. Mol., Centro de Microbiol. y Biol. Celular, Inst. Venezolano de Investigaciones Cient'иота'ficas, Apartado 21827, Caracas 1020A. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: MYCOBACTERIUM SMEGMATIS (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ

САЙТ ORIC

КЛОНИРОВАНИЕ

ДЕЛЕЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

РЕГУЛЯЦИЯ

ПРОМОТОР RPMH-DNAA



17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.05-04Б2.198

   

    Identification of the chromosomal replication origin from Thermus thermophilus and its interaction with the replication initiator DnaA [Text] / Sigrid Schaper [et al.] // J. Mol. Biol. - 2000. - Vol. 299, N 3. - P655-665 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Идентификация ориджина репликации хромосомы из Thermus thermophilus и его взаимодействие с инициатором репликации DnaA
Аннотация: Хромосомный ориджин репликации oriC и ген, кодирующий инициатор репликации DnaA из Thermus thermophilus, были идентифицированы и клонированы с использованием векторной системы Escherichia coli. В состав ориджина репликации входят 13 характерно окруженных DnaA боксов, связывающие сайты для белка DnaA, и АТ-богатое пространство, а также следующий за ним ген dnaN. Ген dnaA локализован выше участка ori и при экспрессии образует типичный белок DnaA, который включает 4 домена как другие члены семейства DnaA белков. В данной работе описали очистку Thermus-DnaA (Tth-DnaA) и охарактеризовали взаимодействие очищенного белка с ориджином репликации в отношении кинетики связывания и стехиометрии этого взаимодействия. Подсчеты задержки подвижности в геле, поверхностный плазмоновый резонанс (ППР) и электронная микроскопия позволили продемонстрировать, что в отличие от DnaA из Escherichia coli, Tth-DnaA не узнавал одиночный DnaA бокс. Минимальной потребностью для специфического связывания служил кластер из трех тандемно повторенных DnaA боксов. Самую высокую аффинность для связывания наблюдали для полной длины oriC или 6 собранных в кластер, тандемно повторенных DnaA боксов. Кроме этого, высокоаффинное ДНК связывание Tth-DnaA зависело от присутствия АТФ. Thermus DnaA/oriC взаимодействие сравнили с образованием oriC комплекса, полученного с другими DnaA белками. Германия, Max-Planck-Institut fur moleculare Genetik, Iwnestrasse 73, D-14195, Berlin. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАТОР РЕПЛИКАЦИИ DNAA

THERMUS THERMOPHILUS

ОЧИСТКА

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ОРИДЖИН РЕПЛИКАЦИИ ORIC

КИНЕТИКА СВЯЗЫВАНИЯ

СТЕХИОМЕТРИЯ СВЯЗЫВАНИЯ


Доп.точки доступа:
Schaper, Sigrid; Nardmann, Judith; Luder, Gerhild; Lurz, Rudi; Speck, Christian; Messer, Walter


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.05-04Б2.204

    Qin, Ming-Hui.

    Characterization of the functional replication origin of Mycobacterium tuberculosis [Text] / Ming-Hui Qin, Murty V. V.S. Madiraju, Malini Rajagopalan // Gene. - 1999. - Vol. 233, N 1-2. - P121-130 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Характеристика функциональной области начала репликации Mycobacterium tuberculosis
Аннотация: Фрагмент ДНК Mycobacterium tuberculosis, содержащий межгенную область dnaA-dnaN, функционирует как область начала репликации (ОНР) oriC, т. е. обеспечивает автономную репликацию плазмид в M. tuberculosis H37Ra и M. bovis BCG. Удаление ОНР ColE1 Escherichia coli из плазмид с oriC M. tuberculosis не устраняет их автономную репликацию. Делеционный анализ показал, что минимальная ОНР oriC имеет длину 814 п. н. Число копий плазмид с oriC M. tuberculosis и ori ColE1 по отношению к хромосомной ОНР oriC равно 1. 5'-фланговая область минимальной ОНР oriC содержит элементы, поддерживающие стабильную репликацию плазмид. ОНР oriC M. tuberculosis не функционирует в быстро растущих микобактериях, напр. в M. smegmatis. ОНР oriC M. smegmatis функционирует только в M. fortuitum, но не в медленно растущих видах микобактерий (M. tuberculosis и BCG). Эти данные показали, что механизмы инициации репликации неодинаковы у быстро и медленно растущих микобактерий. США, Dep. Biochem., Univ. Texas Hlth. Ctr., Tyler, TX 75708-3154. Библ. 20
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

РЕГУЛЯЦИЯ

УЧАСТОК ORJ

ОБЛАСТЬ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ХАРАКТЕРИСТИКА

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Madiraju, Murty V.V.S.; Rajagopalan, Malini


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.188

   

    Bacterial mode of replication with eukaryotic-like machinery in a hyperthermophilic archaeon [Text] / Hannu Myllykallio [et al.] // Science. - 2000. - Vol. 288, N 5474. - P2212-2215 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Бактериальная мода репликации с аппаратом, похожим на эукариотический, у гипертермофильного архея
Аннотация: Единственная область oriC начала двунаправленной репликации хромосомы у Pyrococcus abyssi идентифицирована методом компьютерного кумулятивного анализа распределения тетрануклеотидов ГГГТ и АЦЦЦ и выделением рано реплицирующегося сегмента хромосомы. Область oriC у 3 видов Pyrococcus высококонсервативна и не похожа на области oriC эубактерий. Вокруг oriC у Pyrococcus обнаружены гены репликации ДНК, похожие на эукариотические. Они кодируют ортологи белков, участвующих в стадиях инициации (Cdc6/Orc1) и элонгации (RF-C) репликации эукариотич. ДНК. Как и у Bacteria, область терминации транскрипции у Pyrococcus является горячей точкой перетасовок геномов. Таким образом, хотя белки репликации археев и бактерий различаются, они используются для одинаковой моды репликации хромосомы в обоих прокариотич. царствах. Франция, Inst. Genet. et Microbiol., Univ. Paris-Sud, 91405 Orsay. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
МОДА

ОБЛАСТЬ НАЧАЛА ДВУНАПРАВЛЕННОЙ

РЕПЛИКАЦИИ ORIC

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕНЫ ИНИЦИАЦИИ CDC6/ORC1

ГЕНЫ ЭЛОНГАЦИИ RF-C

БЕЛКИ

СХОДСТВО

ЭУКАРИОТИЧЕСКИЕ БЕЛКИ

PYROCOCCUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Myllykallio, Hannu; Lopez, Philippe; Lopez-Garcia, Purificacion; Heilig, Roland; saurin, William; Zicvanovic, Yvan; Philippe, Herve; Forterre, Patrick


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.192

    Weitao, Tao.

    Role of the mukB gene in chromosome and plasmid partition in Escherichia coli [Text] / Tao Weitao, Santanu Dasgupta, Kurt Nordstrom // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 38, N 2. - P392-400 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Роль гена mukB в разделении хромосомы и плазмид в Escherichia coli
Аннотация: За внутриклеточной локализацией ориджина репликации хромосомы oriC и плазмиды oriR1 в экспоненциально растущих клетках Escherichia coli наблюдали в опытах по флюоресцентной in situ гибридизации (FISH). В клетках дикого типа локализации oriC и oriR1 (из Par{+}R1 плазмиды) были уникальна. У mukB мутанта расположение обоих ориджинов нарушается, а именно, у Par{+}R1 плазмид oriR1 рендомизированы, что аналогично состоянию oriR1 в Par{-}R1 плазмидах клеток дикого типа. Однако, эта рендомизация в мутантах mukB не является результатом нестабильности наследования Par{+}R1 плазмид. Она может быть следствием предпочтительной ассоциации Par{+}R1 плазмид с очень объемным деконденсированным нуклеоидом дочерних клеток, во время деления MukB{-} клеток. С другой стороны Par{+}R1 плазмиды между дочерними клетками распределяются случайным образом, вследствие чего часто образуются безнуклеоидные клетки. Швеция, Dep. Cell&Mol. Biol., Uppsalaa Univv., Biomed. Cent., Box 596, S-751 24 Uppsala. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ
ХРОМОСОМЫ

ПЛАЗМИДЫ

ОРИДЖИНЫ РЕПЛИКАЦИИ

ORIC

ORIR1

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН MUKB

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Dasgupta, Santanu; Nordstrom, Kurt


 1-20    21-40   41-60   61-62 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)