СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ПЛАЗМИДА COLE1<.>)

Общее количество найденных документов : 35
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-35

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.02-04Б2.42

Merlin, Sean.
Assessment of quantitative models for plasmid ColE1 copy number control [Text] / Sean Merlin, Barry Polisky // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 248, N 2. - P211-219 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Оценка количественных моделей контроля числа копий плазмиды ColE1
Аннотация: Две количественные модели контроля числа копий плазмиды ColE1: модель Бреннера-Томизавы и модель Бренделя-Перельсона сравнены с точки зрения математической логики их построения и применения к экспериментальным данным. Подчеркнуты различия этих моделей. Предложены эксперименты, позволяющие различить предсказания этих моделей. США, Dep. Biol., Indiana Univ., Bloomington, IN 47407. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА COLE1
КОПИЙНОСТЬ
КОНТРОЛЬ
МОДЕЛИ
КОЛИЧЕСТВЕННЫЕ

Доп.точки доступа:
Polisky, Barry

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.153

Unger, Thomas F.
Show me the money! Prokaryotic expression vectors and purification systems [Text] / Thomas F. Unger // Scientist. - 1997. - Vol. 11, N 17. - P20-22 . - ISSN 0890-3670
Перевод заглавия: Покажи мне деньги! Прокариотические экспрессионные системы и системы очистки
Аннотация: Представлен список коммерчески доступных экспрессионных векторов. Все векторы - на основе репликона ColE1, содержат гены резистентности к канамицину, тетрациклину или ампициллину. Нек-рые векторы имеют ориджин M13, позволяющий получать однонитевую ДНК. Каждый вектор содержит один из известных индуцибельных промоторов. Это промотор, регулируемый арабинозой, T7-экспрессионная система, а так же промоторная система Trc/Tac или промоторы бактериофага лямбда P[L] и P[R]. Современные экспрессионные вектора конструируются таким образом, чтобы нарабатываемый рекомбинантный белок был соединен со специфическим пептидом, с помощью к-рого возможна очистки этого белка в одну стадию за счет высокоспецифичного связывания. Во многих векторах используется система шести гистидиновых остатков, с помощью к-рой рекомбинантный белок очищается на колонке с никелем. После чего, пептид-мишень удаляется с помощью ферментативного расщепления и благодаря специально сконструированному сайту для такого расщепления. Нек-рые вектора кодируют сигнальную последовательность, обеспечивающую секрецию рекомбинантного белка в периплазматическое пространство. Все вектора содержат полилинкеры, клонирование в к-рых обеспечивает экспрессию клонированного продукта. Нек-рые вектора позволяют клонирование PCR-продуктов без рестрикции-лигирования, благодаря комплементации между праймером, используемым для амплификации и концами вектора

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ВЕКТОРЫ
ПЛАЗМИДА COLE1
УСТОЙЧИВОСТЬ К АНТИБИОТИКАМ
ЭКСПРЕССИОННЫЕ СИСТЕМЫ
СИСТЕМЫ ОЧИСТКИ
КОНСТРУИРОВАНИЕ
БАКТЕРИИ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.269

Gregorian, Razmic S.
Determinants of RNA hairpin loop-loop complex stability [Text] / Razmic S. Gregorian, Donald M. Crothers // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 248, N 5. - P968-984 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Детерминанты стабильности комплексов петля шпильки РНК - петля
Аннотация: Изучены комплексы, образованные петлями шпилек РНК с комплементарными петлями в РНК I и РНК II Escherichia coli, участвующими в контроле репликации ДНК плазмиды ColE1. Предпринята попытка определить элементы последовательности и структуры, требующиеся для полной стабильности. Особый интерес представляет изучение повышенной стабильности комплекса, образуемого петлями шпилек с инвертированными в направлении 5''-'3' по сравнению с диким типом последовательностями петель. Показано, что для полной или усиленной стабильности требуется полная комплементарность 2 взаимодействующих петель, но стебли 2 шпилек могут различаться. Главной детерминантой повышенной стабильности являются пары оснований, образующиеся в положениях 1 и 7 петель, и 2 пары оснований каждого стебля, ближайшие к петлям. Вариация последовательности в середине петель или в положениях стеблей, более далеких от петель, лишь умеренно влияют на стабильность комплекса. Предложена модель взаимодействия петля-петля, к-рая учитывает важность положений 1 и 7 и первых 2 н стебля, к-рые обеспечивают оптим. структуры для узнавания РНК I модуляторным белком. США, Dep. Chem., Yale Univ. New Haven, CT 06520. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА COLE1
РНК
КОМПЛЕКС ПЕТЛЯ ШПИЛЬКИ-ПЕТЛЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Crothers, Donald M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.233

Paulsson, Johan.
Trade-off between segregational stability and metabolic burden: A mathematical model of plasmid ColE1 replication control [Text] / Johan Paulsson, Mans Ehrenberg // J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 279, N 1. - P73-88 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: [Сделка] между сегрегационной стабильностью и метаболическим временем: математическая модель контроля репликации плазмиды ColE1
Аннотация: Разработана математическая модель числа копий (ЧК) плазмиды ColE1, в к-рой молекулярные детали репликации связаны с сегрегационной стабильностью (СС) и метаболическим бременем. Эффективный контроль репликации понижает вариации ЧК и повышает СС. Вариация ЧК зависит от механизма ингибирования и от констант скорости оборота РНК I (I) и РНК II (II). Если частоты транскрипции I и II и константа скорости диффузии I очень велики, гиперболический механизм ингибирования должен компенсироваться увеличением среднего ЧК в 1,4 раза, чтобы обеспечить такую же СС, как и экспоненциальный механизм ингибирования. Чувствительность ответа частоты репликации на изменения конц-ии I зависит от типа механизма ингибирования и числа попыток образовать репликативный праймер II за клеточный цикл. Если I слишком стабильна, она не следует за изменением конц-ии плазмиды. Если частота транскрипции для I лишь чуть выше, чем для II, конц-ия I становится рандомизированной. В обоих случаях исчезает пропорциональность между конц-иями I и плазмиды в одной клетке и нарушается контроль ЧК. Рассчитаны пороговые значения скорости деградации свободной I и частот транскрипции I и II. Увеличение этих констант скорости не влияет на СС, но уменьшение приводит к сегрегационной катастрофе. Эти данные указали на существование оптимального набора констант скорости, при к-ром система регуляции ЧК работает хорошо без излишней метаболической нагрузки. Швеция, Dep. Mol. Biol., BMC, S-75124 Uppsala. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА COLE1
РЕПЛИКАЦИЯ
КОНТРОЛЬ
МОДЕЛИ
СЕГРЕГАЦИОННАЯ СТАБИЛЬНОСТЬ
МЕТАБОЛИЧЕСКАЯ НАГРУЗКА

Доп.точки доступа:
Ehrenberg, Mans

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.191

Absence of RNase III alters the pathway by which RNAI, the antisense inhibitor of ColE1 replication, decays [Text] / Uta Binnie [et al.] // Microbiology. - 1999. - Vol. 145, N 11. - P3089-3100 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Отсутствие РНКазы III изменяет путь, по которому распадается РНК I - антисмысловой ингибитор репликации плазмиды ColE1
Аннотация: Изучена роль различных нуклеаз в распаде антисмысловой РНК I (I) - ингибитора репликации плазмиды ColE1 - в клетках Escherichia coli. Показано, что: 1) полинуклеотидфосфорилаза, поли(А)-полимераза и РНКаза Е (II) могут работать независимо друг от друга, облегчая распад I, 2) РНКаза-II не ускоряет распад I; 3) в отсутствие РНКазы III (III) накапливается полиаденилированная I, не процессированная II; 4) III разрезает I в положениях 82 и 98 in vitro; 5) более длинный из этих фрагментов I можно обнаружить в экстрактах штамма rnc{+}pcnB, продуцирующего III, но не в мутанте rnc pcnB, так что I является субстратом III in vivo. Предложен путь ранних стадий распада I. Великобритания, Inst. Cell and Mol. Biol., Univ. Edinburgh, Edinburgh EH9 3JR. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНГИБИТОРЫ РЕПЛИКАЦИИ
АНТИСМЫСЛОВАЯ РНК1
РАСПАД
РНКАЗА III
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН RNC{+}PCNB
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Binnie, Uta; Wong, Kenny; McAteer, Sean; Masters, Millicent

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.206

Yang, Yun-Liang.
Allele-specific suppression of ColE1 high-copy-number mutants by a rpoB mutation of Escherichia coli [Text] / Yun-Liang Yang, Barry Polisky // Plasmid. - 1999. - Vol. 41, N 1. - P55-62 . - ISSN 0147-619X
Перевод заглавия: Аллель-специфичная супрессия мутантов плазмиды ColE1 по высокому числу копий мутацией rpoB у Escherichia coli
Аннотация: Выделены спонтанные устойчивые к рифампицину мутанты Escherichia coli, проявляющие супрессию фенотипа копий у мутантов плазмиды ColE1 in vivo. У супрессорных штаммов YY572 (rpoB572) и YY513 (rpoB13) мутации в гене rpoB вызывают замены I572V или Q513K в 'бета'-субъединице РНК-полимеразы. Однако 2 другие известные мутации rif{r} (rpoB8 и rpoB101), затрагивающие остаток 513, не вызывают супрессию фенотипа числа копий мутантов плазмиды ColE1, так что супрессия является аллель-специфичной. Обсуждается роль РНК-полимеразы в контроле числа копий плазмиды ColE1. США, Dep. Biol., Indiana Univ., Bloomington, IN 47405

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА COLE1
ЧИСЛО КОПИЙ
РЕГУЛЯЦИЯ
ФЕРМЕНТЫ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
СТРУКТУРА
СУБЪЕДИНИЦА*БЕТА-
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Polisky, Barry

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.210

Genetic and biochemical characterization of MbeA, the relaxase involved in plasmid ColE1 conjugative mobilization [Text] / Athanasia Varsaki [et al.] // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 48, N 2. - P481-493 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Генетическая и биохимическая характеристики Mbe A, релаксазы, участвующей в конъюгативной мобилизации плазмиды ColEI
Аннотация: Mbe A является белком с мол. массой 60 кД, кодируемым плазмидой ColEI. Он играет ключевую роль в конъюгативной мобилизации. Mbe A* - слегка укороченный вариант MbeA был очищен для анализа in vitro. Mbe A* катализировал разрыв ДНК и реакции переноса цепей, в которых использовались олигонуклеотиды, содержащие ColEI nic-сайт. Прокартированный ColEI nic-сайт имел следующий вид 5'-(1469)CTGG/CTTA(1462)-3', MbeA является релаксазой для ColEI-конъюгативной мобилизации, несмотря на факт, что MbeA не имеет звена из трех гистидиновых остатков, включающего инвариантные знаки конъюгативных релаксаз. Сравнение аминокислотных последовательностей позволяет предположить, что Mbe A является родственным традиционному семейству белковых релаксаз. Например, остаток Y19 в Mbe A мог соответствовать инвариантному тирозину в звене I, тогда как H97, E104 и N106 могут соответствовать гистидиновой триаде в звене III. Эта гипотеза была протестирована с помощью сайт-направленного мутагенеза. Аминокислотные остатки Y19, H97, E104 и N106 в Mbe A были заменены аланином. Mbe A мутант N106A характеризовался уменьшенной способностью разрывать олигонуклеотиды и уменьшенными активностями переноса цепей, тогда как мутации в других трех остатках приводили в результате к образованию белков без заметной активности, позволяя предположить, что они непосредственно участвуют в катализе разрыва ДНК и реакциях переноса цепей. Двойное замещение E104 и N106 с помощью гистидиновых остатков приводило к восстановлению канонической гистидиновой триады и восстановлению релаксазных активностей до 1% дикого типа. Т. обр., MbeA является вариантом общей релаксазной темы, включающей звено с HEN-знаками, которое прибавлено к каноническому звену с тремя гистидиновыми остатками для ранее описанных релаксаз. Греция, Sector of Organic Chemistry and Biochemistry, Dep. of Chemistry, Univ. of Ioannina, 451 10 Ioannina. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
РЕЛАКСАЗА MBEA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
СТРУКТУРА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Varsaki, Athanasia; Lucas, Maria; Afendra, Amalia S.; Drainas, Constantin; de, la Cruz Fernando

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.08-04Б2.206

Directed evolution and identification of control regions of ColE1 plasmid replication origins using only nucleotide deletions [Text] / Dewey Kim [et al.] // J. Mol. Biol. - 2005. - Vol. 351, N 4. - P763-775 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Направленная эволюция и идентификация контрольных районов ориджинов репликации плазмиды ColE1 с использованием только нуклеотидных делеций
Аннотация: Гены могут мутировать, изменяя содержание ДНК (изменения оснований) или длину ДНК (инсерции или делеции). Чаще всего в направленной эволюции in vitro используют изменения оснований для получения библиотек ДНК. Протестировали, можно ли идентифицировать мутационный процесс, продуцируемый только делециями нуклеотидов. Короткие нуклеотидные участки были удалены в плазмиде, кодирующей lacZ, а затем провели скрининг на бета-галактозидазную активность. Обнаружили несколько мутаций в ориджине репликации, изменяющие качественно и количественно поведение плазмиды in vivo. Некоторые мутации позволяли существовать ColE1 в Escherichia coli и применять шпилечные структуры II и III праймера РНК ColE1 как детерминанты плазмидной совместимости. Таким образом, выявили неожиданные полезные мутации из библиотеки, содержащей только делеции. США, INtegriGen, Inc., 42 Digital Dr. Bldg, 6, Novato, CA 94949. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
НАПРАВЛЕННАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
УЧАСТКИ ORI
КОНТРОЛЬНЫЕ РАЙОНЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ДЕЛЕЦИИ
МУТАЦИИ
МУТАЦИИ УЧАСТКА ORI
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Kim, Dewey; Rhee, Yoon; Rhodes, Denise; Sharma, Vikram; Sorenson, Olav; Greener, Alan; Smider, Vaughn

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.460

Suit, Joan L.
Expression of the Kil gene of the ColF1 plasmid in Escherichia coli Kil{r} mutants causes release of periplasmic enzymes and of colicin without cell death [Text] / Joan L. Suit, S. E. Luria // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 10. - P4963-4966 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Экспрессия гена Kil плазмиды ColE1 в мутантах Kil{r} Escherichia coli вызывает освобождение периплазматических ферментов и колицина без гибели клеток
Аннотация: Экспрессия гена kil плазмиды ColE1 у устойчивых к вызываемой kil гибели Кл Escherichia coli мутантов Kil{r} классов I-1 и II-1 вызывает освобождение периплазматических ферментов ('бета'-лактамазы и РНКазы) и колицина (I) в отсутствие гибели Кл. У этих мутантов имеется фосфолипаза А, но она не активируется при индукции гена kil и не вызывает разрушение клеточных фосфолипидов. У мутанта III-1 синтез I супрессирован. Высказано предположение, что у мутантов Kil{r} разобщены различные эффекты экспрессии гена kil. Библ. 12. США, Dep. J. Biol., Mossachusetts Inst. of Technology, Cambridge, MA92139.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАНТЫ KIL{R}
ОТСУТСТВИЕ ГИБЕЛИ
ПЛАЗМИДА COLE1
ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕНЫ KIL
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ПЕРИПЛАЗМАТИЧЕСКИЕ БЕЛКИ
РНКАЗА
ЛАКТАМАЗА БЕТА-
ВЫДЕЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Luria, S.E.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.468

The arginine repressor is essential for plasmid-stabilizing site-specific recombination at the ColE1 cer locus [Text] / C. J. Stirling [et al.] // EMBO Journal. - 1988. - Vol. 7, N 13. - P4389-4395 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Аргининовый репрессор необходим для стабилизирующей плазмиду сайт-специфичной рекомбинации в локусе cer ColE1
Аннотация: Известно, что наследуемая стабильность в клетках Escherichia coli многокопийной плазмиды ColE1 и родственных ей плазмид связана с поддержанием их ДНК в мономерной форме. Образующиеся в результате recA-зависимой рекомбинации мультимеры обычно разрешаются в мономеры с помощью сайт-специфичной системы рекомбинации, действующей в случае ColE1 на сайт cer. Вместе с тем, конкретные продукты, кодируемые плазмидой и использующие этот сайт в качестве мишени, не идентифицированы. Ранее выявлены 2 гена на хромосоме E. coli, несцепленные между собой и кодирующие продукты, вовлеченные в опосредованную сайтом cer сайт-специфическую рекомбинацию. Проведено выделение, картирование и секвенирование одного из этих генов, xerA. Выявлено, что он идентичен гену argR, кодирующему репрессор генов биосинтеза аргинина. Белок ArgR присоединяется к сайту cer в присутствие аргинина как in vivo, так и in vitro. Предполагается, что такое связывание необходимо для образования комплекса ДНК-белок высокого порядка, вовлеченного в рекомбинационный синапс. Обнаружено также, что ген argR B. subtilis комплементирует мутант argR E. coli по cer-зависимой рекомбинации, несмотря на то, что белки ArgR этих бактерий имеют лишь 27% гомологии. Ил. 5. Табл. 2. Библ. 40. Великобритания, Univ. of Glasgow, Church Street, Glasgow.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
СТАБИЛЬНОСТЬ ПЛАЗМИД
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
УЧАСТОК CER
ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РЕПРЕССОРЫ
РЕПРЕССОР ARGR
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
ГЕНЫ XERA
КАРТИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Stirling, C.J.; Szatmari, G.; Stewart, G.; Smith, M.C.M.; Sherratt, D.J.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.428

Stirling, C. J.
Multicopy plasmid stability in Escherichia coli requires host-encoded functions that lead to plasmid site-specific recombination [Text] / C. J. Stirling, G. Stewart, D. J. Sherratt // Mol. and Gen. Genet. - 1988. - Vol. 214, N 1. - С . 80-84 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Стабильность многокопийной плазмиды у Escherichia coli требует кодируемых хозяином функций, ведущих к плазмидной сайт-специфичной рекомбинации
Аннотация: Наследуемая стабильность многокопийной плазмиды ColE1 и родственных ей природных плазмид зависит от присутствия в них сайта, обозначаемого в случае ColE1 как cer, являющегося субстратом сайт-специфичной рекомбинации, поддерживающей плазмиду в форме мономера. Гомологичная рекомбинация ведет к мультимеризации плазмидной ДНК и ее потере клетками. В данной работе проверялась гипотеза по к-рой cer-специфичная рекомбиназа кодируется локусом E. coli, обозначенным xer (от chromosomal ColE1 recombination function's). Разработана процедура получения мутантов по этому локусу. Показано наличие, по крайней мере, 2 комплементационных групп локуса xer, несцепленных между собой. Один из генов xer клонирован в космиде, включившей также гены argI и purB E. coli, расположенные на 96-97 мин карты. Ил. 5. Табл. 1. Библ. 22. Великобритания, Univ. of Glasgow, Glasgow.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДА - БАКТЕРИИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
СТАБИЛЬНОСТЬ ПЛАЗМИД
ПЛАЗМИДА COLE1
РЕГУЛЯЦИЯ
БАКТЕРИАЛЬНАЯ САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЗА

Доп.точки доступа:
Stewart, G.; Sherratt, D.J.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.223

Summers, D. K.
Derivatives of CoIE1 cer show altered topological specificity in site-specific recombination [Text] / D. K. Summers // EMBO Journal. - 1989. - Vol. 8, N 1. - P309-315 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Дериваты CoIE1 cer обнаруживают измененную топологическую специфичность в сайт-специфической рекомбинации
Аннотация: Плазмида ColE1 содержит последовательность cer из 250 п. н., необходимую в цис-положении для разрешения плазмидных димеров в мономеры. В системе in vivo осуществлена рекомбинация между сайтом cer и локусом parB, обеспечивающем разрешение димеров плазмиды CloDF13. Выявлено, что между этими сайтами имеется 56% гомологии, причем наибольшее сходство имеется в сайтах кроссинговера. Плазмида рАР451, содержащая сайты cer и parB в виде прямых повторов, использована для трансформации шт. E. coli DS 941, дефектного по хромосомному гену xerA, продукт к-рого также необходим для разрешения димеров ColE1. При этом в трансформантах обнаруживалась плазмида, соотв. мономерной сверхскрученной форме рАР451. Напротив, в шт. xer+, трансформированном рАР451, обнаруживался дополнительный пик, соотв. продукту рекомбинации между cer и parB. В 20% трансформантов (гибриды I типа) плазмида находилась только в мономерной форме. У 80% трансформантов, отнесенных к гибридам II типа, преобладали мультимеры. Выявлено, что в гибридах обоих типов утрачен уникальный сайт EcoRI лежащий между cer и parB в рАР451, но сохранились сайты MluI и HindIII, что указывает на внутримолекулярную рекомбинацию между сайтами cer и parB. Гибриды I типа несут практически интактные сайт cer. В этом случае внутримолекулярная рекомбинация требует также продуктов генов xerA, B и С. Напротив, гибриды II типа, отличающиеся от типа I только по 2 п. н., функционируют независимо от топологической связи между взаимодействующими сайтами, что способствует как внутри-, так и межмолекулярной рекомбинации. Рекомбинация между cer и parB в гибридах II типа не зависит от продуктов генов xerA и xerB, а также требует наличия последовательности 50 п. н. Ил. 10. Библ. 24. Великобритания, University of Cambridge, Cambridge CB2 3EH.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
ПРОИЗВОДНЫЕ
РАЗРЕШЕНИЕ
РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕЖМОЛЕКУЛЯРНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
УЧАСТОК CER
УЧАСТОК PARB

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.241

Zhang, Shiping.
Regulation of gene expression in plasmid ColE1: delayed expression of the kil gene [Text] / Shiping Zhang, Lianfang Yan, Geoffrey Zubay // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 12. - P5460-5467 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Регуляция генной экспрессии у плазмиды ColE1: задержанная экспрессия гена kil
Аннотация: Плазмида ColE1 несет кластер функционально-родственных генов cea, kil и imm. Гены cea и kil образуют индуцируемый оперон, транскрибирующийся от промотора, сцепленного с cea. Ген imm локализован между генами cea и kil, но транскрибируется в противоположном направлении. С помощью слияний с геном lacZ по измерению уровня синтеза 'бета'-галактозидазы выявлено, что комплементарное взаимодействие между мРНК imm и анти-imm последовательностями в середине транскрипта cea-kil вызывает выраженную задержку экспрессии гена kil в случае индукции оперона cea-kil. В отсутствии транскрипции гена imm за задержанную экспрессию гена kil ответственен сегмент, расположенный в перекрывающемся районе между генами cea и imm. Ил. 9. Библ. 14. США, Columbia University, New York, NY 10027.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.17
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
ОПЕРОНЫ
ГЕН CEA
ГЕН KIL
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ЗАДЕРЖКА
МРНК ГЕНА IMM
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
АНТИ IMM ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Yan, Lianfang; Zubay, Geoffrey

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.397

Transfer and maintenance of small, mobilizable plasmids with ColE1 replication originals in Legionella pneumophila [Text] / N.Cary Engleberg [et al.] // Plasmid. - 1988. - Vol. 20, N 1. - P83-91
Перевод заглавия: Перенос и поддержание мелкой, мобилизующейся плазмиды с участком начала репликации ColE1 у Legionella pneumophila
Аннотация: Сконструирована плазмида pTLP1 7,9 т. п. н., несущая локус oriV плазмиды ColE1, маркер устойчивости к канамицину (Км) и фрагмент ДНК Legionella pheumophila, служащий сайтом гомологичной рекомбинации плазмиды с хромосомой, поскольку ожидалось, что pTLP1 не способна автономно поддерживаться в этих бактериях. Показано, что pTLP1 мобилизуется из E. coli в шт. L. pneumophila с помощью плазмиды-помощника pRK212.1 с частотой 106}-105}. Для обеспечения мобилизации в плазмиду pTLP1 включен локус oriT плазмиды RK2. С помощью блотгибридизации проведен анализ трансконъюгантов L. pneumophila, показавший, что плазмида pTLP1 может автономно реплицироваться в этом хозяина. Последующие скрещивания с участием плазмид, являющихся делеционными или замещенными по нек-рым последовательностям дериватами pTLP1, подтвердили, что для репликации в шт. L. pneumophila достаточно наличия только локуса oriV. Вместе с тем, плазмида pTLP1 стабильно поддерживается в этих бактериях при их пассировании на среде с Km, но утрачивается в неселективных условиях. Предполагается, что нестабильность плазмиды обусловлена быстрым накоплением бесплазмидных сегрегантов вследствие мультимеризации плазмид или их низкой копийности. Предполагается, что плазмида pTLP1 может использоваться как челночный вектор для переноса генов в L. pneumophila с целью их мутагенеза и анализа генов вирулентности. Ил. 4. Табл. 2. Библ. 25. США, Univ. of Michigan, Ann Arbor, MI 48109.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: LEGIONELLA PNEUMOPHILA (BACT.)
ПЛАЗМИДА PILP1
КОНСТРУИРОВАНИЕ
МОБИЛИЗАЦИЯ ПЛАЗМИД
ПОДДЕРЖАНИЕ ПЛАЗМИД
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ ПЛАЗМИД
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIV
ПЛАЗМИДА COLE1

Доп.точки доступа:
Engleberg, N.Cary; Cianciotto, Nicholas; Smith, Jean; Eisenstein, Barry I.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.398

Schroeter, A.
Amplification of different ColE1 plasmids in an Escherichia coli relA strain [Text] / A. Schroeter, S. Riethdorf, M. Hecker // J. Basic Microbiol. - 1988. - Vol. 28, N 8. - P553-555
Перевод заглавия: Амплификация различных CoLE1 плазмид в штамме Escherichia coli relA
Аннотация: Ранее этими же авторами было показано, что голодающие по аминокислотам клетки мутанта relA E. coli, неспособные синтезировать гуанозинтетрафосфат (ppGpp), накапливают большое кол-во ДНК плазмиды pBR322. Отсюда предполагалось, что ppGpp, возможно, участвует в регуляции репликации плазмидной ДНК в условиях голодания по минокислотам. С целью выявления верхнего предела амплификации плазмид в клетках reIA в условиях голодания исследованы различающиеся по размеру и копийности дериваты плазмиды ColE1, включая многокопийный мутант pBR322 pERII-BPL4hc, образующий свыше 1000 копий на клетку. Обнаружено, что во всех случаях происходит 4-6-кратное увеличение копийности плазмид в лог-фазе роста независимо от размера плазмид, числа участков начала репликации на плазмиде или ее иходной копийности. Число копий плазмид в клетках, подвергнутых аминокислотному голоданию, варьировало от 200 для димера pBR322 до свыше 2000 для мутанта pEPIII - BPL4hc. Плазмиды типа ropс увеличенным числом копий в логфазе роста обладали такой же способностью к амплификации в relA-мутанте при аминокислотном голодании, что плазмиды Rop+. Табл. 1. Библ. 11. ГДР, Ernst-Moritz-Arndt-Universitat Greifswald.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ RELA
АМИНОКИСЛОТНОЕ ГОЛОДАНИЕ
ПЛАЗМИДА COLE1
ДНК ПЛАЗМИДНАЯ
АМПЛИФИКАЦИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ГУАНОЗИНТЕТРАФОСФАТ

Доп.точки доступа:
Riethdorf, S.; Hecker, M.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.446

Masukata, Hisao.
involvement of the template strand DNA for RNA II transcription in initiation of plasmid ColE1 replication [Text] / Hisao Masukata, Jun-ichi Tomizawa // J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N 13Д. - P133 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Участие цепи ДНК, являющейся матрицей для синтеза РНК II в инициации репликации плазмиды ColE1
Аннотация: Изучали механизмы репликации ДНК плазмиды ColE1. Известно, что в процессе инициации репликации участвует так называемая РНК-II, которая взаимодействует с участком инициации репликации плазмиды и служит РНК-праймером при инициации репликации. Эта РНК считывается с участка ДНК ColE1, лежащего выше участка инициации репликации. В данной работе с помощью направленного мутагенеза in vitro изучали характер взаимодействия между РНК-II и участком инициации репликации ColE1. В результате анализа значительного числа мутантных вариантов плазмиды, авторы приходят к выводу о том, что участок ДНК, лежащий непосредственно перед сайтом инициации, гибридизуется с участком РНК-II, в ее 5'-концевой части. Результаты мутационного анализа подтверждаются данными, полученными в опытах с использованием конкурирующих олигонуклеотидов. Обсуждаются возможные механизмы участия РНК-II в процессе инициации репликации плазмиды ColE1. Япония, Dep. of Molecular Biology, Sch. of Science, Nagoya Univ., Nagoya 464-01.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
ДНК ПЛАЗМИДЫ
РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК ИНИЦИАЦИИ РЕПЛИКАЦИИ
РОЛЬ
РНК
РНК-II
ПРАЙМЕРЫ
СИНТЕЗ

Доп.точки доступа:
Tomizawa, Jun-ichi

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.546

Tomizawa, Jun-ichi.
Control of ColE1 plasmid replication [Text] / Jun-ichi Tomizawa, Yutaka Eguchi // J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13Д. - P70 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Контроль репликации плазмиды ColE1

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
РЕПЛИКАЦИЯ
ИНГИБИРОВАНИЕ
МЕХАНИЗМ
РНК II
ГИБРИДИЗАЦИЯ IN VIVO
РНК I
СТАБИЛИЗАЦИЯ
БЕЛОК ROM

Доп.точки доступа:
Eguchi, Yutaka

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.560

Eguchi, Yutaka.
Interaction of ColE1 rom protein with RNA I and RNA II [Text] / Yutaka Eguchi, Jun-ichi Tomizawa // J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13Д. - P122 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Взаимодействие Rom-белка плазмиды ColE1 с РНК-1 и РНК-2
Аннотация: Изучали роль белка Rom, кодируемого плазмидой ColE1, в репликации этой плазмиды. Известно, что праймером при репликации ДНК ColE1 является так называемая РНК-I, комплементарная определенному сайту в участке инициации репликации ColEI. Кроме того, в ходе репликации плазмиды ColE1 накапливается РНК-2, комплементарная РНК-1. Показано, что связывание РНК-1 с РНК-2 модулируется Rom-белком. Обнаружено также, что белок Rom связывается с комплексом РНК-1+РНК-2 и защищает эти РНК в составе комплекса от действия РНКаз. Судя по имеющимся данным, Rom-белок связывается с РНК-1 и РНК-2 только после того как они образуют комплекс между собой. США, Lab. of Molecular Biology, NIDDKD, NIH, Bethesda, MD 20892.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА COLE1
РЕПЛИКАЦИЯ
РНК ПЛАЗМИДНАЯ
ПРАЙМЕР РНК-1
РНК-РНК ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РНК-2
МОДУЛИРОВАНИЕ
БЕЛОК ROM

Доп.точки доступа:
Tomizawa, Jun-ichi

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.309

xerB, an Escherichia coli gene required for plasmid ColE1 site-specific recombination, is identical to pepA, encoding eminopeptidese A, a protein with substantial similarity to bovine lens leucine aminopeptidase [Text] / Colin J. Stirling [et al.] // EMBO Journal. - 1989. - Vol. 8, N 5. - P1623-1627 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: xerB, ген Escherichia coli, требующийся для сайт-специфической рекомбинации плазмиды ColE1, идентичен pepA, детерминирующему аминопептидазу А - белок, сходный по строению с лейцинаминопептидазой хрусталиков быка
Аннотация: Стабильность плазмиды ColE1 зависит от системы сайтспецифической рекомбинации, разрешающей плазмидные мультимеры до мономеров. Эта система требует наличия цис-действующего района cer ColЕ1, а также 2-х трансдействующих факторов - продуктов генов xerA и xerB E. coli. Проведено клонирование и секвенирование минимальной последовательности, комплементирующей XerBфенотип. Эта минимальная последовательность состоит из 1692 п. н. образующих фрагмент Hind III - AccI гибридной плазмиды pCS130. Полная нуклеотиданя последовательность гена xerB включает 503 кодона, способных детерминировать белок с М[г] 55,3 кДа. Уточнено, что локус xerB расположен на 96,5 мин карты E. coli. Подтверждено отмеченное ранее выраженное сходство между С-концевыми участками белка XerB и лейцинаминопептидазой хрусталика быка. Выявлено 31% идентичных и 22% родственных АК последовательностей. В целом С-концевые участки обоих белков идентичны на 52%. Обнаружено, что xerB идентичен генам pepA E. coli и S. typhimurium, кодирующим аминопептидазу А и локализующимся в том же районе хромосомы, что и xerB. Показано, что продукт гена xerB обладает аминопептидазной активностью. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 35. Великобритания, Biol. Kings Buildings, Univ. of Edinburgh, Edinburgh EH99 3JP.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI K12 (BACT)
ШТАММ АВ 1157
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА COLE1
СТАБИЛЬНОСТЬ
ТРАНС-ФАКТОРЫ
ГЕНЫ
ГЕНТРАНС-ФАКТОРА XERB
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬ
БЕЛКИ
БЕЛОК XER B
ЛЕЙЦИНАМИНОПЕПТИДАЗА ХРУСТАЛИКА БЫКА
АМИНОПЕПТИДАЗ А
ГОМОЛОГИЯ

Доп.точки доступа:
Stirling, Colin J.; Colloms, Sean D.; Collins, John F.; Szatmari, George; Sherratt, Dadid J.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.12-04Б2.384

Casaregola, Serge. [Text] : in vitro replication and mutagenesis of ColEl plasmid DNA in extracts from repair deficient Escherichia coli mutants / Serge Casaregola, Mohammed Khidhir, Barry Holland // Biochim. et biophys. acta dene struct. and express. - 1988. - Vol. 1008, N 1. - P45-51 . - ISSN 0167-4781
Перевод заглавия: Репликация in vitro и мутагенез плазмидной ДНК ColEI в экстрактах репарационно-дефектных мутантов Escherichia coli
Аннотация: ДНК плазмиды ColEI, облученная УФ-светом в дозе 300 Дж/м{2}, дающей 15-20 димеров тимина на молекулу, подвергали обработке экстрактами Кл шт. E. coli дикого типа и различных репарационно-дефектных мутантов. В экстрактах Кл дикого типа наблюдается репликация как нативной, так и облученной ДНК, но в экстрактах UVrA recB Кл облученная ДНК не реплицируется. В случае, если такие Кл предварительно облучали УФ-светом, наблюдалась небольшая стимуляция репликации. Мутагенез реплицирующейся ДНК плазмиды pBR325 исследовали после обработки ее экстрактами Кл, экспрессирующих SOS-ответ конститутивно. Разработаны условия, в к-рых достигается 10-кратное повышение частоты реверсий мутаций по гену tet по сравнению со шт. дикого типа. Кол-во реверсий не зависит от скорости репликации ДНК рВR325, что указывает на вовлеченность в нее систем склонной к ошибкам репарации. Т. к. это увеличение не зависит от гена muc, сделан вывод, что наблюдаемый мутагенез независим от генов umuCD, контролируемых геном LexA. Предложенная система м. б. использована для исследования механизмов и факторов мутагенеза и репликации. Табл. 2. Ил. 3. Библ. 35. Великобритания. Univ. of Leicester, Leicester.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАНТЫ ПО РЕПАРАЦИИ UVRARECB
ПЛАЗМИДА COLE1
РЕПЛИКАЦИЯ
МУТАГЕНЕЗ
РЕПАРАЦИЯ СКЛОННАЯ К ОШИБКАМ

Доп.точки доступа:
Khidhir, Mohammed; Holland, Barry

1-20 21-35

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска