СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА<.>)

Общее количество найденных документов : 20
Показаны документы с 1 по 20

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.181

Sen, Keya.
Isolation and characterizaton ot the Haemophilus influenzae tolQ, tolR, tolA and tolB genes [Text] / Keya Sen, Daniel J. Sikkema, Timothy F. Murphy // Gene. - 1996. - Vol. 178, N 1-2. - P75-81 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Выделение и характеристика генов tolQ, tolR, tolA и tolB Haemophilus influenzae
Аннотация: Из ДНК Haemophilus influenzae клонированы и секвенированы гены tolQ, tolR, tolA и tolB. Белки TolQ, TolR, TolA и TolB на 67, 63, 41 и 62% идентичны белкам TolQ, TolR, TolA и TolB Escherichia coli, соотв. Эти 4 белка участвуют в транспорте колицинов и бактериофагов через клеточную оболочку. Стоп-кодон трансляции белка TolB (последний ген кластера) расположен на 23 основания выше стартового кодона гена липопротеина P6. Показано, что начало транскрипта P6 находится внутри гена tolB. При анализе нуклеотидной последовательности области tolQRABP6 выявлено, что точка терминации транскрипции расположена сразу за геном P6. По-видимому, кластер генов tolQRABP6 представляет собой оперон. США, Div. of Infect. Dis. of Dep. of Med., St. Univ. of New York at Buffalo, Buffalo, NY 14215. Библ. 15

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН TOLQ
TOLR
TOLA
TOLB
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
КЛАСТЕР ГЕНОВ TOLQRABP6
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
HAEMOPHILUS INFLUENZAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Sikkema, Daniel J.; Murphy, Timothy F.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.116

The cbaAB genes for bo[3]-type cytochrome c oxidase in Bacillus stearothermophilus [Text] / Keiichi Nikaido [et al.] // Biochim. et biophys. acta. Gene Struct. and Express. - 1998. - Vol. 1397, N 3. - P262-267 . - ISSN 0167-4781
Перевод заглавия: Гены cbaAB цитохром-с-оксидазы типа bo[3] у Bacillus stearothermophilus
Аннотация: Клонированы и секвенированы гены cbaA и cbaB цитохром-с-оксидазы (I) из Bacillus stearothermophilus. Они образуют оперон и кодируют субъединицы I-I и I-II длиной соотв. 549 и 342 остатков. I-II на 50% гомологична карбоксипетидазе из Thermus aguaticus, а I-I - на 40,6% I из T. thermophilus. I из Bac. Stearothermophilus является цитохромом типа bo[3] и относится к классу SoxB. Япония, Dep. Biochem. Engineering and Sci., Kyushu Inst. Technol., Fukuoka 820-8502. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ЦИТОХРОМ-С-ОКСИДАЗЫ CBAAB
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ЦИТОХРОМ ТИПА BO[3]
BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)
ПРОТОННЫЙ НАСОС

Доп.точки доступа:
Nikaido, Keiichi; Noguchi, Shunsuke; Sakamoto, Junshi; Sone, Nobuhito

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.246

Ouyang, Shu.
Transcriptional analysis of type 1 capsule genes in Staphylococcus aureus [Text] / Shu Ouyang, Chia Y. Lee // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 3. - P473-482 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Транскрипционный анализ генов капсулы типа 1 у Staphylococcus aureus
Аннотация: Для изучения транскрипции генов капсулы серотипа 1 Staphylococcus aureus (13 генов cap1 на хромосомном фрагменте размером 14,6 т. п. н.) использовали генетическую комплементацию с применением плазмид с различными делециями фрагмента размером 14,6 т. п. н. Обнаружено 6 транскрипционных единиц: одна размером 14 тыс. нуклеотидов и несколько размером от 0,3 до 6 тыс. нуклеотидов. Анализируя синтезируемые транскрипты, пришли к выводу, что все 13 генов транскрибируются как одна единица. Транскрипты малого размера, скорее всего, являются продуктом процессинга транскрипта размером 14 т. н. Сделан вывод, что гены cap1 организованы в 1 оперон с 5 слабыми внутренними промоторами и одним основным промотором выше локуса cap1. США, Dep. of Microbiol., Mol. Genet. and Immunol., Univ. of Kansas Med. Centre, 3901 Rainbow Boulevard, Kansas City, Kansas 66160. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ КАПСУЛЫ ТИПА I
ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Lee, Chia Y.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.182

Vibrio cholerae iron transport: Haem transport genes are linked to one of two sets of tonB, exbB, exbD genes [Text] / Deborah A. Occhino [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 6. - P1493-1507 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Транспорт железа у Vibrio cholerae: гены транспорта гема сцеплены с одним из двух наборов генов tonB, exbB и exbD
Аннотация: У Vibrio cholerae имеется 2 набора генов, кодирующих белки TonB, ExbB и ExbD, к-рые участвуют в транспорте железа. Определена нуклеотидная последовательность генов, клонированных в плазмиде pHUT10, восстанавливающей у мутантов tonB V. cholerae способность использовать гемин, вибриобактин и феррихром в кач-ве источников железа. Оказалось, что плазмида pHUT10 содержит набор генов tonB1, exbB1 и exbD1, к к-рому примыкают гены транспорта железа hutBCD. Похоже, что все 6 генов экспрессируются с единственного промотора, регулируемого белком Fur. Анализ мутантов V. cholerae exbB1 и exbD1 позволил выявить второй набор генов tonB2, exbB2 и exbD2, не сцепленный с первым. Впервые у грамотрицательных бактерий показано наличие 2 наборов генов tonB, exbB и exbD, причем один из этих наборов составляет единый оперон с генами транспорта гема. США, (Payne S. M.) Dep. of Microbiol. and Inst. for Cell. and Mol. Biol., Univ. of Texas, Austin, TX 78712. Библ. 72

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
ПАТОГЕНЕЗ
ГЕНЫ
ГЕН TONB
ГЕН EXBB
ГЕН EXBD
ГЕНЫ HUTBCD
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ЖЕЛЕЗО
ГЕМ
ТРАНСПОРТ

Доп.точки доступа:
Occhino, Deborah A.; Wyckoff, Elizabeth E.; Henderson, Douglas P.; Wrona, Thomas J.; Payne, Shelley M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.03-04Б2.286

Schumann, Wolfgang.
The GroE chaperonin machine is the major modulator of the CIRCE heat shock regulon of Bacillus subtilis [Text] / Wolfgang Schumann, Georg Homuth, Axel Mogk // J. Biosci. - 1998. - Vol. 23, N 4. - P415-422 . - ISSN 0250-5991
Перевод заглавия: Шаперониновая машина GroE является главным модулятором регулона CIRCE теплового шока Bacillus subtilis
Аннотация: Обзор. У Bacillus subtilis гены теплового шока класса I (ГТШ-1) образуют 2 оперона: гептацистронный (dnaK) и бицистронный (groE). Белок HrcA (I), кодируемый первым геном оперона dnaK, связывается в обоих оперонах с оператором (элементом CIRCE) и выступает в роли репрессора. Активность I модулируется шаперонином GroE (II). Высказано предположение, что I после синтеза de novo или диссоциации от оператора присутствует в неактивной форме и должен быть активирован II. Индукцию ГТШ-I вызывает появление в цитоплазме денатурированных белков, к-рые оттитровывают II, что приводит к появлению неактивного I и дерепрессии ГТШ-I. После удаления неприродных белков из цитоплазмы освободившийся II вновь взаимодействует с I и способствует его сворачиванию в активную конформацию, что вызывает выключение ГТШ-I. Германия, Inst. Genet., Univ, Bayrenth, D-95440 Bayrenth. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ТЕПЛОВОГО ШОКА
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ОПЕРАТОР CIRCE
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК HRCA
АКТИВНОСТЬ
РЕГУЛЯЦИЯ
ШАПЕРОНИН GROE
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 25

Доп.точки доступа:
Homuth, Georg; Mogk, Axel

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 00.04-04Б4.136

Schumann, Wolfgang.
The GroE chaperonin machine is the major modulator of the CIRCE heat shock regulon of Bacillus subtilis [Text] / Wolfgang Schumann, Georg Homuth, Axel Mogk // J. Biosci. - 1998. - Vol. 23, N 4. - P415-422 . - ISSN 0250-5991
Перевод заглавия: Шаперониновая машина GroE является главным модулятором регулона CIRCE теплового шока Bacillus subtilis
Аннотация: Обзор. У Bacillus subtilis гены теплового шока класса I (ГТШ-1) образуют 2 оперона: гептацистронный (dnaK) и бицистронный (groE). Белок HrcA (I), кодируемый первым геном оперона dnaK, связывается в обоих оперонах с оператором (элементом CIRCE) и выступает в роли репрессора. Активность I модулируется шаперонином GroE (II). Высказано предположение, что I после синтеза de novo или диссоциации от оператора присутствует в неактивной форме и должен быть активирован II. Индукцию ГТШ-I вызывает появление в цитоплазме денатурированных белков, к-рые оттитровывают II, что приводит к появлению неактивного I и дерепрессии ГТШ-I. После удаления неприродных белков из цитоплазмы освободившийся II вновь взаимодействует с I и способствует его сворачиванию в активную конформацию, что вызывает выключение ГТШ-I. Германия, Inst. Genet., Univ, Bayrenth, D-95440 Bayrenth. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ТЕПЛОВОГО ШОКА
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ОПЕРАТОР CIRCE
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
БЕЛОК HRCA
АКТИВНОСТЬ
РЕГУЛЯЦИЯ
ШАПЕРОНИН GROE
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 25

Доп.точки доступа:
Homuth, Georg; Mogk, Axel

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.12-04Б2.225

Munchbach, Martin.
Multiple small heat shock proteins in rhizobia [Text] / Martin Munchbach, Andreas Nocker, Franz Narberhaus // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 1. - P83-90 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Множественные малые белки теплового шока у ризобий
Аннотация: У медленнорастущих клубеньковых бактерий сои (Bradyrhizobium japonicum) выявлено 7 генов, кодирующих малые белки теплового шока (sHsps). Они организованы в 5 оперонов и координированно регулируются общим цис-регуляторным элементом ROSE. Последовательности белков, полученные на основании секвенирования генов, позволяют разделить их на две группы: гомологичные белку lbpA E. coli и сходные с белками других прокариот и эукариот. С использованием двумерного гель-электрофореза у B. japonicum выявлено 12 белков sHsps. Анализ аминокислотных последовательностей позволил выявить 2 новых типа sHsps-белков. Множественные формы этих белков выявлены также у Rhizobium etli, R. meliloti, R. leguminosarum (bv. viceae, trifolii), R. tropici, Bradyrhizobium sp. (Parasponia, Lupinus) и у различных растений, тогда как у большинства бактерий данные белки представлены лишь 1-2 копиями. Швейцария, Protein Chemistry Lab., Eidgenossische Technische Hochschule, CH-8092 Zurich. Библ. 52

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ МАЛЫХ БЕЛКОВ ТЕПЛОВОГО ШОКА
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
РЕГУЛЯЦИЯ
ЦИС-РЕГУЛЯТОРНЫЙ ЭЛЕМЕНТ ROSE
БЕЛОК
МАЛЫЕ БЕЛКИ ТЕПЛОВОГО ШОКА ДЕЛЕНИЕ НА ГРУППЫ
ОБНАРУЖЕНИЕ
RHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)
RHIZOBIUM LEGUMINOSARUM (BACT.)
RHIZOBIUM TROPICI (BACT.)
BRADYRHIZOBIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nocker, Andreas; Narberhaus, Franz

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.192

Bosse, Janine T.
Novel genes affecting urease activity in Actinobacillus pleuropneumoniae [Text] / Janine T. Bosse, Hali D. Gilmour, Janet I. MacInnes // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 4. - P1242-1247 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Новые гены, влияющие на уреазную активность в Actinobacillus pleuropneumonia
Аннотация: При характеристике ряда уреазонегативных транспозонных мутаций у Actinobacillus pleuropneumoniae обнаружили, что многие из мутантов имели инсерции от 2 до 4 т. п. н. выше кластера генов уреазы. Область в 5 т. п. н. вверх по течению ДНК секвенировали. Обнаружили, что эта область содержала шесть открытых рамок считывания (ORFs), транскрибируемых в той же ориентации, что и гены уреазы. ORF apuR на расстоянии 202 п. н. выше этих 6 ORFs транскрибировалась в противоположном направлении. Предсказанный продукт этой индивидуальной ORF имеет гомологию со многими членами семейства LysR транскрипционных регуляторов. Пять из этих ORFs (cbi KLMQO), по-видимому образуют оперон, который кодирует предполагаемую никелевую и кобальтовую периплазматическую пермеазную систему. Гены cbi M и cbi Q кодируют белки, чья последовательность имеет сходство с известными мембранными белками транспорта кобальта, ген chi O кодирует кобальтовый транспортный АТФ-связывающий белковый гомолог. Шестая ORF, utp, по-видимому, кодирует интегральный мембранный белок, который имеет значительное сходство последовательности с транспортными белками мочевины млекопитающих. Канада, Dep. of Pathobiol., Univ. of Guelph, Guelph, Ontario, Canada NJG 2W1. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ CBI KLMQO
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ГЕНЫ CBIM
ГЕНЫ CBIQ
КОДИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
СХОДСТВО
МЕМБРАННЫЙ БЕЛОК ТРАНСПОРТА КОБАЛЬТА
КОБАЛЬТОВЫЙ ТРАНСПОРТНЫЙ АТФ-СВЯЗЫВАЮЩИЙ БЕЛОК
ТРАНСПОРТНЫЙ БЕЛОК МОЧЕВИНЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ
ACTINOBACILLUS PLEUROPNEUMONIAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Gilmour, Hali D.; MacInnes, Janet I.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.145

Sequence of the two operons encoding the four core subunits of the cytochrome b[6]f complex from the thermophilic cyanobacterium Synechococcus elongatus [Text] / Dirk Schneider [et al.] // Biochim. et biophys. acta. Gene Struct. and Express. - 2000. - Vol. 1491, N 1-3. - P364-368 . - ISSN 0167-4781
Перевод заглавия: Секвенирование двух оперонов, кодирующих четыре центральных субъединицы комплекса цитохромов b[6]f у термофильной цианобактерии Synechococcus elongatus
Аннотация: У термофильной цианобактерии Synechococcus elongatus клонированы и секвенированы гены, кодирующие цитохром f (petA), цитохром b[6] (petB), Fe-S-белок Rieske (petC) и IV субъединицу комплекса цитохромов b[6]f (petD). Как и у других цианобактерий, эти гены организованы в 2 коротких оперона petC/petA и petB/petD. Кроме того, в непосредственной близости от этих оперонов обнаружено 5 открытых рамок считывания, гомологичных известным генам цианобактерии Synechocystis PCC6803. Германия, [Rogner M.], Lehrstuhl fur Biochem. der Pflanzen, Fakultat fur Biol., Ruhr-Univ. Bochum, D-44780 Bochum. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ЦИТОХРОМА F PETA
ГЕНЫ ЦИТОХРОМА B[6] PETB
ГЕНЫ FE-S-БЕЛКА RIESKE PETC
ГЕНЫ IV СУБЪЕДИНИЦЫ ЦИТОХРОМОВ B[6]F PETD
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
SYNECHOCOCCUS CLONGATUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Schneider, Dirk; Altenfeld, Ursula; Thomas, Heike; Scharader, Silke; Muhlenhoff, Ulrich; Rogner, Matthias

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.163

Transcriptional and mutational analyses of the Streptomyces lividans recX gene and its interference with RecA activity [Text] / Silke Vierling [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 14. - P4005-4011 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Транскрипционный и мутационный анализ гена recX Streptomyces coelicolor и его интерференция с активностью RecA
Аннотация: Изучена роль белка RecX (I) с мол. м. 20 922, кодируемого геном recX Streptomyces coelicolor, к-рый расположен на расстоянии 220 п. н. с 3'-стороны от гена recA. Анализ транскрипции методом обратной транскрипции - ПЦР показал, что гены recA и recX образуют оперон. В неиндуцирующих условиях наблюдается базальная транскрипция только гена recA, а после индукции повреждениями ДНК образуется и транскрипт recA-recX, кол-во к-рого меньше кол-ва мРНК recA. Мутант, у к-рого ген recX инактивирован замещением генов, образует более мелкие колонии, но проявляет нормальные рекомбинационную активность, генетическую нестабильность и устойчивость к УФ-свету. Экспрессия лишней копии гена recA S. lividans под контролем индуцируемого тиострептоном промотора tipA летальна для мутанта recX. Это показало, что I может преодолевать токсич. эффекты гиперэкспрессии RecA (II). Т. к. инактивация гена recX не влияет на транскрипцию recA, I может негативно регулировать активность II, взаимодействуя с II или его филаментами. Германия, Mikrobiol./Biotechnol., Univ. Tubingen, D-72076 Tubingen. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН RECA
ГЕН RECX
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ
ТРАНСКРИПТЫ
ОБРАЗОВАНИЕ
ИНДУКЦИЯ
ПОВРЕЖДЕНИЯ ДНК
STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)

Доп.точки доступа:
Vierling, Silke; Weber, Tilmann; Wohlleben, Wolfgang; Muth, Gunther

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.09-04Б2.169

Characterization of the 4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase gene and operon structure of the protocatechuate 4,5-cleavage pathway genes in Sphingomonas paucimobilis SYK-6 [Text] / Hirofumi Hara [et al.] // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 1. - P41-50 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика гена 4-карбокси-4-гидрокси-2-оксоадипатальдолазы и оперонная структура генов пути 4,5-расщепления протокатехата у Sphingomonas paucimobilis SYK-6
Аннотация: Путь 4,5-расщепления протокатехата (ПКА) у Sphingomonas paucimobilis SYK-6 является важным метаболическим путем деградации низкомолекулярных производных лигнина. Во фрагменте хромосомы S. paucimobilis, несущем гены ферментов этого пути ligAB (ПКА-4,5-диоксигеназы), ligI (2-пирон-4,6-дикарбоксилатгидролазы), ligJ (4-оксаломезаконатгидратазы) и часть гена ligC (4-карбокси-2-гидроксимуконат-6-семиальдегиддегидрогеназы), обнаружен ген ligK, кодирующий 4-карбокси-4-гидрокси-2-оксоадипатальдолазу. Этот фермент катализирует последний этап пути 4,5-расщепления ПКА. Охарактеризованы его структура и функции. Инактивация гена ligK у S. paucimobilis SYK-6 приводит к неспособности микроорганизма расти на ваниллате и сирингате, что указывает на участие альдолазы LigK в катаболизме этих соединений. С помощью анализа продуктов обратной транскрипции-ПЦР показана оперонная структура генов пути 4,5-расщепления ПКА. Выявлены 4 транскрипционные единицы - ligK-orfl-ligI-lsdA, ligJAB и моноцистронные опероны ligR и ligC. Япония, (Masai E.) Dep. of Bioengineering, Nagaoka Univ. of Technol., Kamitomioka, Nagaoka, Niigata 940-2188. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ПРОТОКАТЕХАТ
4,5-РАСЩЕПЛЕНИЕ ПУТЬ
ГЕНЫ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ВАНИЛЛАТ
СИРИНГАТ
РАСЩЕПЛЕНИЕ
4-КАРБОКСИ-4-ГИДРОКСИ-2-ОКСОАДИПАТАЛЬДОЛАЗА
ГЕНЫ
ГЕНЫ LIGK АЛЬДОЛАЗА
ОБНАРУЖЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
SPHINGOMONAS PAUCIMOBILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Hara, Hirofumi; Masai, Eiji; Miyauchi, Keisuke; Katayama, Yoshihiro; Fukuda, Masao

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.183

An experimental validation of orphan genes of Buchnera, a symbiont of aphids [Text] / Sayaka Shimomura [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 2002. - Vol. 292, N 1. - P263-267 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Экспериментальная оценка генов - "сирот" Buchnera, симбионта тлей
Аннотация: Хотя Buchnera sp. APS, внутриклеточный симбионт тлей, паразитирующих на горохе, имеет много общего с Escherichia coli, его геном значительно модифицирован по причине продолжительного внутриклеточного существования. Компьютерный анализ прогнозировал наличие трех генов - "сирот" yba2, yba3 и yba4, рамки считывания которых не имеют гомологов в базе данных. В данной работе провели оценку всех 3 генов с помощью RT-ПЦР и Нозерн-гибридизации. Показали, что гены yba3 и yba4 формируют оперон, что свидетельствует о согласованности их функций. Анализ последовательностей вокруг сайта старта транскрипции привел к заключению о том, что эти гены находятся под контролем сигма 70. Сделано заключение о том, что Buchnera эволюционно сохраняется длительное время. Япония, Dep. of Biological Sciences, Graduate School of Science, Univ. Of Tokyo, 7-3-1, Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ "СИРОТ" YBA2
ГЕНЫ YBA3
ГЕНЫ YBA4
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
КОНТРОЛЬ
СИГМА 70
BUCHNERA (BACT.)
СИМБИОНТ ТЛЕЙ

Доп.точки доступа:
Shimomura, Sayaka; Shigenobu, Shuji; Morioka, Mizue; Ishikawa, Hajime

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 05.07-04Б4.37Д

Рыбак, К. В.
Поиск новых генов Escherichia coli, участвующих в экспорте аминокислот [Текст] : автореф. Дис. на соиск. уч. степ. канд. биол. наук / К. В. Рыбак ; Гос. НИИ генет. и селекции пром. микроорганизмов, Москва. - Москва, 2005. - 21 с. : ил.
Перевод заглавия: Поиск генов Escherichia coli, участвующих в экспорте аминокислот
Аннотация: В данной работе отражены материалы кандидатской диссертации. На основании сравнительного анализа генома Escherichia coli с геномами других организмов были отобраны 30 неохарактеризованных гипотетических генов, кодирующих белки гомологичные известным транспортерам. Анализ на возможную оперонную организацию показал, что 8 из них могут входить в гипотетические опероны. Исследовали влияние повышенной экспрессии отобранных генов на уровень устойчивости клеток E. coli к 50 соединениям различной химической природы. Установили, что амплификация 14 исследуемых генов приводит к изменению устойчивости модельного штамма E. coli TG1 к ряду аминокислот или их аналогов. Изучили влияние амплификации 14 исследуемых генов на скорость поглощения 18 природных аминокислот клетками модельного штамма E. coli TG1. Обнаружили, что повышенная экспрессия 5 из них сказывается на скорости поглощения некоторых аминокислот клетками этого штамма. Были осуществлены ферментации штаммов-продуцентов 10 природных аминокислот при амплификации 14 исследуемых генов. Показали, что 9 генов изменяют уровень продукции аминокислот некоторыми штаммами. Провели компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей перед исследуемыми генами (upstream-областей) на предмет обнаружения предполагаемых мест связывания как известных регуляторных белков E. coli, так и неизвестных регуляторов. Обнаружили, что в upstream-областях 16 изучаемых генов присутствуют потенциальные сайты связывания 10 различных регуляторов E. coli, а в регуляторной области двух генов- возможные места связывания неохарактеризованных на данный момент регуляторных белков. Россия, Москва, 117545, 1-ый Дорожный проезд, д. 1, ФГУП Гос. н.-и. ин-т генетики и селекции промышленных микроорганизмов

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ БЕЛКОВ ГОМОЛОГИЧНЫХ ТРАНСПОРТЕРОВ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ПОВЫШЕННАЯ
ВЛИЯНИЕ НА
УСТОЙЧИВОСТЬ
СОЕДИНЕНИЯ РАЗНОЙ ХИМИЧЕСКОЙ ПРИРОДЫ
АМИНОКИСЛОТЫ
АМПЛИФИКАЦИЯ
ВЛИЯНИЕ НА
СКОРОСТЬ ПОГЛОЩЕНИЯ АМИНОКИСЛОТ
ESCHERICHIA COLI
ДИССЕРТАЦИЯ
КАНДИДАТСКАЯ
РОССИЯ

Доп.точки доступа:
Гос. НИИ генет. и селекции пром. микроорганизмов, Москва
Свободных экз. нет

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.02-04Б2.148Д

Рыбак, К. В.
Поиск новых генов Escherichia coli, участвующих в экспорте аминокислот [Текст] : автореф. Дис. на соиск. уч. степ. канд. биол. наук / К. В. Рыбак ; Гос. НИИ генет. и селекции пром. микроорганизмов, Москва. - Москва, 2005. - 21 с. : ил.
Перевод заглавия: Поиск генов Escherichia coli, участвующих в экспорте аминокислот
Аннотация: В данной работе отражены материалы кандидатской диссертации. На основании сравнительного анализа генома Escherichia coli с геномами других организмов были отобраны 30 неохарактеризованных гипотетических генов, кодирующих белки гомологичные известным транспортерам. Анализ на возможную оперонную организацию показал, что 8 из них могут входить в гипотетические опероны. Исследовали влияние повышенной экспрессии отобранных генов на уровень устойчивости клеток E. coli к 50 соединениям различной химической природы. Установили, что амплификация 14 исследуемых генов приводит к изменению устойчивости модельного штамма E. coli TG1 к ряду аминокислот или их аналогов. Изучили влияние амплификации 14 исследуемых генов на скорость поглощения 18 природных аминокислот клетками модельного штамма E. coli TG1. Обнаружили, что повышенная экспрессия 5 из них сказывается на скорости поглощения некоторых аминокислот клетками этого штамма. Были осуществлены ферментации штаммов-продуцентов 10 природных аминокислот при амплификации 14 исследуемых генов. Показали, что 9 генов изменяют уровень продукции аминокислот некоторыми штаммами. Провели компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей перед исследуемыми генами (upstream-областей) на предмет обнаружения предполагаемых мест связывания как известных регуляторных белков E. coli, так и неизвестных регуляторов. Обнаружили, что в upstream-областях 16 изучаемых генов присутствуют потенциальные сайты связывания 10 различных регуляторов E. coli, а в регуляторной области двух генов- возможные места связывания неохарактеризованных на данный момент регуляторных белков. Россия, Москва, 117545, 1-ый Дорожный проезд, д. 1, ФГУП Гос. н.-и. ин-т генетики и селекции промышленных микроорганизмов

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ БЕЛКОВ ГОМОЛОГИЧНЫХ ТРАНСПОРТЕРОВ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ПОВЫШЕННАЯ
ВЛИЯНИЕ НА
УСТОЙЧИВОСТЬ
СОЕДИНЕНИЯ РАЗНОЙ ХИМИЧЕСКОЙ ПРИРОДЫ
АМИНОКИСЛОТЫ
АМПЛИФИКАЦИЯ
ВЛИЯНИЕ НА
СКОРОСТЬ ПОГЛОЩЕНИЯ АМИНОКИСЛОТ
ESCHERICHIA COLI
ДИССЕРТАЦИЯ
КАНДИДАТСКАЯ
РОССИЯ

Доп.точки доступа:
Гос. НИИ генет. и селекции пром. микроорганизмов, Москва
Свободных экз. нет

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.06-04Б2.171

Chen, Zhongyi.
The sbcDC locus mediates repression of type 5 capsule production as part of the SOS response in Staphylococcus aureus [Text] / Zhongyi Chen, Thanh T. Luong, Chia Y. Lee // J. Bacteriol. - 2007. - Vol. 189, N 20. - P7343-7350 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Локус sbcDC опосредует репрессию продукции капсул типа 5 как части SOS-ответа в Staphylococcus aureus
Аннотация: Показали, что гены sbcD и sbcC участвуют в репрессии продукции капсул типа 5 Staphylococcus aureus. Делеции в генах sbcDC вели к повышению капсульной промоторной активности, увеличению числа транскриптов капсульных генов и продукции капсул. Скорость выживания делеционного мутанта sbcDC уменьшалась при УФ-облучении, показывая, что эти гены участвуют в репарации ДНК в S. aureus. Показали, что два гена организованы как оперон и экспрессируются в ранней экспоненциальной фазе роста. Ципрофлоксацин и митомицин С индуцировали транскрипцию sbcDC, но репрессировали капсульную промоторную активность, что привело к выводу о том, что гены sbcDC и капсульные гены являются частью SOS-регулона. При помощи репортерной сшивки и Нозерн блоттинга установили, что sbcDC регуляция осуществляется через снижение активности генов arl и mgr. Совокупность полученных результатов позволила сделать заключение о том, что sbcDC при SOS-ответе репрессирует продукцию капсул 5 типа через путь arl-mgr. Это первое свидетельство, что гомолог SbcDC участвует в регуляции транскрипции. США, Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of Arkansas for Med. Sciences, Little Rock, Arkansas 72205. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ SBCDC
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ВЛИЯНИЕ НА
ТРАНСКРИПТЫ
ГЕНЫ КАПСУЛ
СНИЖЕНИЕ
SOS-ОТВЕТ
ВЛИЯНИЕ НА
ГЕНА RL
ГЕН MGR
КАПСУЛЫ
ПРОДУКЦИЯ
РЕПРЕССИЯ
STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Luong, Thanh T.; Lee, Chia Y.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.167

Pyruvate:quinone oxidoreductase in Corynebacterium glutamicum: Molecular analysis of the pqo gene, significance of the enzyme, and phylogenetic aspects [Text] / Mark E. Schreiner [et al.] // J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188, N 4. - P1341-1350 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Пируват:хиноноксидоредуктаза в Corynebacterium glutamicum: молекулярный анализ гена pqo, значение фермента и филогенетические аспекты
Аннотация: Недавно показали, что Corynebacterium glutamicum обладает пируват:хиноноксидоредуктазой (PQO). В данной работе анализировали экспрессию гена pqo C. glutamicum, значение PQO для роста и продукции аминокислот, а также провели филогенетический анализ. Показали, что транскрипция pqo инициируется 45 п.н. выше сайта старта трансляции и организуется в оперон вместе с генами, кодирующими метал-активируемый пиридоксаль-фермент и предполагаемый белок-активатор. Инактивация гена вела к отсутствию активности PQO, однако не влияла ни на рост, ни на продукцию аминокислот. Исследовали филогению соответствующих белков, анализируя базу данных. Выявили широкое распределение PQO среди прокариот в соответствии с гипотезой об общем предке трех энзимов: PQO, пируватоксидазы (POX), синтазы ацетоуксусной кислоты. Полученные результаты привели к заключению, что пируватоксидазы POX Lactobacillus произошла от PQO. Германия, Dep. of Microbiology and Biotechnology, Univ. of Ulm. 89069 Ulm. Библ. 75

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ПИРУВАТ:ХИНОНОКСИДОРЕДУКТАЗА PQO
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
УЧАСТКИ ТРАНСКРИПЦИИ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ИНАКТИВАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
АМИНОКИСЛОТЫ
ПРОДУКЦИЯ
РОСТ
ПИРУВАТ:ХИНОНОКСИДОРЕДУКТАЗА
ФИЛОГЕНИЯ
CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Schreiner, Mark E.; Riedel, Christian; Holatko, Jiri; Patek, Miroslav; Eikmanns, Bernhard J.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.04-04Б2.463

Structure and regulation of the Escherichia coli ruv operon involved in DNA repair and recombination [Text] / Hideo Shinagawa [et al.] // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 9. - P4322-4329
Перевод заглавия: Структура и регуляция оперона ruv Escherichia coli, вовлеченного в репарацию и рекомбинацию ДНК
Аннотация: Проведено клонирование и секвенирование гена ruv, находящегося под регуляцией SOS-системы и вовлеченного в процессы репарации и рекомбинации ДНК у E. coli. Выявлено, что локус ruv содержит 2 открытых рамки считывания расположенные тандемно и способные кодировать полипептиды с М[r]-22 и -37 кД. Соответствующие белки идентифицированы в системе макси-клеток, несущих гибридные плазмиды с клонированным локусом ruv. Оба гена расположены в одинаковой ориентации, регулируются SOS-системой и, вероятно, образуют оперон. Ген, расположенный дистально, комплементирует мутации ruv. Выше кодирующих рамок выявлены 2 сайта инициации транскрипции, причем транскрипция с них обоих подавляется репрессором LexA. В регуляторном районе оперона обнаружена последовательность, гомологичная SOS-боксу и связывающаяся с белком LexA. Рассчитанная на основе данных секвенирования ДНК аминокислотная последовательность белка Ruv обнаруживает выраженную гомологию с АТФ-связывающимися белками. Ил. 7. Табл. 1. Библ. 34. Япония, Osaka Univ., 3 - 1 Yamadaoka, Suita, Osaka 565.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.13.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ Н136
МУТАНТ RUV-9
ГЕНЫ
ЛОКУС RUV
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ТРАНСКРИПЦИОННАЯ СТРУКТУРА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
СИСТЕМА SOS
ФУНКЦИИ
РЕПАРАЦИЯ
РЕКОМБИНАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Shinagawa, Hideo; Makino, Kozo; Amemura, Mitsuko; Kimura, Sigenobu; Iwasaki, Hiroshi; Nakata, Atsuo

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.07-04Б2.238

Jenkins, Johu R.
Molekular cloning, expression, and analysis of the genes of the homoprotecatechuate catabolic pathway of Escherichia coli C [Text] / Johu R. Jenkins, Ronald. A. Cooper // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 11. - P5317-5324 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Молекулярное клонирование, экспрессия и анализ катаболитного обмена гомопротокатехата Escherichia coli C
Аннотация: Escherichia coli утилизирует ароматические соединения с помощью катаболитных путей аналогичных катаболитным путям почвенных бактерий. В связи с этим E. coli является хорощим модельным объектом для изучения генетической регуляции и структуры метаболических путей подобного типа. Исследовали организацию генов hpc, которые кодируют ферменты деградации гомопротокатехата (3,4-дигидроксифенилацетата, ГПК). Клонировали гены hpc и установили, что они организованы в два оперона hpc B, C, D, E, F и hpc G, H. В регуляции экспрессии обоих оперонов принимает участие продукт гена hpcR, который расположен, как полагают, рядом с геном hpcH. Транскрипция оперонов происходит в противоположные стороны. Предлагают модель структуры hpc-оперонов и механизма их регуляции. На основании данных по гибридизации фрагмента ДНК E. coli, кодирующего гены hpc, с ДНК Pseudomonas putida делают вывод, что имеется очень малый процент гомологии между генами, осуществляющими метаболизм ГПК у обоих бактерий. Библ. 32. Великобритания, Dep. of Biochemistry, Univ. of Leicester, Univ. Road, Leicester LE1 7RH.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.17
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
АРОМАТИЧЕСКИЕ СОЕДИНЕНИЯ
ГОМОПРОТОКАТЕХАТ
ДЕГРАДАЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ ГОМОПРОТОКАТЕХАТА HPC
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА
ТРАНСКРИПЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Cooper, Ronald.A.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.09-04Б2.258

McHenry, Charles S.
Functions and regulation of the DNA polymerase III holoenzyme, an asymmetric dimeric DNA polymerase [Text] / Charles S. McHenry, Henry Tomasiewicz, Ann Flower // J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13d. - P66 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Функции и регуляция холофермента ДНК-полимеразы III-асимметричной, димерной ДНК-полимеразы
Аннотация: Получены доказательства гипотезы о том, что холофермент ДНК-полимеразы III является асимметричным димером с различными полимеразами ведущей и отстающей цепи. Установлена асимметрия в функции двух популяций холофермента, в их способности использовать аналог АТФ (АТФ'гамма'S) для формирования инициирующего комплекса. Димерная полимераза стабилизируется 'тау'-субъединицей. Между двумя половинами полимеразы существует аллостерическая взаимосвязь. Внутри одного холофермента сосуществуют 'гамма'и 'тау'-субъединицы, к-рые имеют общие последовательности. Последний факт может являться структурной основой ассимметрии холофермента. Обсуждается применимость гипотезы асимметричного димера для решения проблем действия полимераз в репликативной вилке. Исследуется генетическая регуляция компонентов холофермента. Представлены доказательства, что гены dnaE и dnaZ - компоненты оперона, образующего комплекс с др. компонентами, необходимыми для синтеза макромолекул и клеточного деления. США, Dep. of Biochemistry, Biophysics and Genetics, Univ. of Colorado Health Siences Center, Denver CO 80262.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: БАКТЕРИИ
ДНК-ПОЛИМЕРАЗА III
СТРУКТУРА
ХОЛОФЕРМЕНТ
ФУНКЦИИ
РЕПЛИКАЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН DNAE
ГЕН DNAZ
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА

Доп.точки доступа:
Tomasiewicz, Henry; Flower, Ann

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.409

Regulation of methanol dehydrogenase synthesis in Paracoccus denitrificans [Text] / N. Harms [et al.] // Antonie van Leeuwenhoek. - 1989. - Vol. 56, N 1. - P47-50 . - ISSN 0003-6072
Перевод заглавия: Регуляция синтеза метанолдегидрогеназы у Paracoccus denitrificans
Аннотация: Выделен фрагмент ДНК Paracoccus denitrificans, содержащий дистальную часть структурного гена метанолдегидрогеназы (МД). В результате секвенирования данного фрагмента показано, что за геном МД расположена открытая рамка считывания (ORF-2), кодирующая белок с мол. м. 29 кД. N-терминальная часть этого белка (24 аминокислоты), по-видимому, является сигнальным пептидом. За ORF-2 идентифицированы стартовый кодон и последовательность Шайна-Дальгарно, которые могут быть регуляторными элементами третьей открытой рамки считывания. Между геном МД и ORF-2 обнаружены длинные инвертированные повторы, которые могут выполнять функцию регуляторных сигналов. Для клонирования и характеристики промоторов оперона МД P. denitrificans использовали плазмиду рМР190. В результате исследования экспрессии гибридных плазмид рМР190, содержащих различные фрагменты ДНК P. denitrificans показано, что истинным промотором оперона МД является промотор структурного гена МД. Область ДНК между геном МД и ORF-2, содержащая длинные инвертированные повторы, не выполняет функции терминатора транскрипции в условиях индукции МД и не содержит промотор. Т. обр., ген МД и ORF-2 входят в состав одного оперона. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 8. Нидерланды, Dep. of Microbiology, Biological Laboratory, Free University, P. O. Box 7161, 1007 MC Amsterdam.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: PARACOCCUS DENITRIFICANS (BACT.)
МЕТАНОЛГИДРОГЕНАЗА
СИНТЕЗ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ
СТРУКТУРНЫЕ ГЕНЫ
ФРАГМЕНТЫ
ГЕН МЕТАНОЛДЕГИДРОГЕНАЗЫ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
ОТКРЫТАЯ РАМКА СЧИТЫВАНИЯ ORF2
ОПЕРОННАЯ СТРУКТУРА

Доп.точки доступа:
Harms, N.; van, Spanning R.J.M.; Oltmann, L.F.; Stouthamer, A.H.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска