Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=БЕЛОК REP<.>)
Общее количество найденных документов : 30
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-30 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.04-04Б1.041

   

    Interaction of the adeno-associated virus rep protein with a sequence within the A palindrome of the viral terminal repeat [Text] / Douglas M. McCarty [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 8. - P4998-5006
Перевод заглавия: Взаимодействие белка Rep аденоассоциированного вируса с участком внутри палиндрома A вирусного концевого повтора
Аннотация: Ген Rep аденоассоциированного вируса (ААВ) кодирует 4 перекрывающиеся пептида. 2 из них (Rep68 и Rep78) необходимы для репликации ДНК ААВ, а также положительной и отрицательной регуляции промоторов ААВ. Изучали формирование комплексов чистого белка Rep 68 с полными концевыми повторами (КП) ДНК ААВ, а также с их стволом А. Можно было выявить 6 участков связывания с Rep68. Константа диссоциации комплекса с А была в 125 раз выше, чем с целыми КП. Изучили взаимодействие Rep68 с мутантами стебля А и КП. Мутация 5 нукл. вблизи концевого участка (участок trs) оказывала слабое действие на формирование комплекса. Считают, что существуют, по крайней мере, 3 элемента узнавания в КП для эндонуклеазы trs: участок связывания ствола А, вторичная структура палиндромом В и С, участок trs. Показано, что формируются различные комплексы ДНК с Rep, и многие могут содержать более одной молекулы ДНК. США, Dept of Microbiol. School of Med., Univ. Stony Brook, Stony Brook, New York 11794. Библ. 24.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУС
БЕЛКИ

БЕЛОК REP

ГЕНОМ

СВЯЗЫВАНИЕ


Доп.точки доступа:
McCarty, Douglas M.; Ryan, John H.; Zolotukhin, Sergei; Zhou, Xiaohuai; Muzyczka, Nicholas


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.11-04Б1.103

   

    Cell lines inducibly expressing the adeno-associated virus (AAV) rep gene: Requirements for productive replication of rep-negative AAV mutants [Text] / Christina Holscher [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 11. - P7169-7177 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Линии клеток, индуцибельно экспрессирующие ген rep аденоассоциированного вируса (ААВ): потребности для продуктивной репликации rep-негативных мутантов ААВ
Аннотация: Получены 2 линии клеток, экспрессирующих белок Rep78 (I) ААВ под контролем отвечающего на глюкокортикостероиды промотора вируса рака молочной железы мышей. Экспрессия I не вызывает цитотоксических эффектов. Обе линии поддерживают репликацию ДНК дефектных по гену rep мутантов ААВ и инициируют образование частиц ААВ, к-рые имеют правильные размеры и стехиометрию 3 капсидных белков, но неинфекционны. Это связано с дефектом по накоплению однонитевой ДНК ААВ. Преходящая конститутивная экспрессия индивидуальных Rep-белков ААВ (Rep78, Rep68, Rep52 или Rep40) комплементирует этот дефект и вызывает образование инфекционного потомства ААВ rep{-} с эффективностью, зависящей от использованной Rep-экспрессирующей конструкции. Эти данные показывают, что состояние экспрессии Rep важно для инфекционности потомства ААВ. Германия, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, D-82192 Martinsried. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ПАРВОВИРУСЫ
АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЕ ВИРУСЫ

ПРОДУКТИВНАЯ РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМЫ

БЕЛОК REP

ЭКСПРЕССИЯ


Доп.точки доступа:
Holscher, Christina; Horer, Markus; Kleinschmidt, Jurgen A.; Zentgraf, Hanswalter; Burkle, Alexander; Heilbronn, Regine


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.11-04Б1.104

   

    Sequence requirements for stable binding and function of Rep68 on the adeno-associated virus type 2 inverted terminal repeats [Text] / John A. Chiorini [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 11. - P7448-7457 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Требования к последовательности для стабильного связывания и функции [белка] Rep68 на инвертированных концевых повторах аденоассоциированного вируса типа 2
Аннотация: Белок Rep68 (I) дикого типа и рекомбинантный составной белок МВР-Rep68'ДЕЛЬТА' (IA), синтезированный в Escherichia coli, связываются с укороченной формой 'ДЕЛЬТА'57ITR (II) инвертированного концевого повтора ITR аденоассоциированного вируса типа 2 (ААВ-2) с таким же сродством, как и со шпилечным ITR дикого типа (III). Константа диссоциации комплексов IA с II и III равна 8*10{-10} М. Укорачивание II до 'ДЕЛЬТА'28ITR (IV), сохраняющего повторяющийся мотив ГЦТЦ, но не сайт терминального расщепления tsr, уменьшает связывание IA в 10 раз. Удлинение IV неспецифической последовательностью восстанавливает нормальное связывание IA. Т. обр. связывание I с высоким сродством требует присутствия целого мотива ГЦТЦ и стабилизации фланговыми последовательностями. Расщепление II рескрикционной эндонуклеазой DdeI, укорачивающее фланговую область, ингибирует связывание I и IA. С использованием олигонуклеотидных зондов показано, что связывание I и IA с II или III неразличимо. Однако, расщепление и последующее ковалентное связывание IA с нешпилечным II в 100 раз менее эффективны, чем в случае шпилечного III. Следовательно, хотя шпилечная часть ITR не играет роли в узнавании и стабилизации связывания I, ее присутствие влияет на способность I расщеплять tsr. США, Molecular Hematology Branch, Nat. Heart, Lung, and Blood Inst., NIH, Bethesda, MD 20892-1654. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ПАРВОВИРУСЫ
АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЕ ВИРУСЫ

БЕЛОК REP

СВЯЗЫВАНИЕ

МЕХАНИЗМЫ

ИНВЕРТИРОВАННЫЕ КОНЦЕВЫЕ ПОВТОРЫ


Доп.точки доступа:
Chiorini, John A.; Wiener, Stephen M.; Owens, Roland A.; Kyostio, Sirkka R.M.; Kotin, Robert M.; Safer, Brian


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.02-04Б1.76

   

    Adeno-associated virus (AAV) Rep proteins mediate complex formation between AAV DNA and its integration site in human DNA [Text] / Matthew D. Weitzman [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1994. - Vol. 91, N 13. - P5808-5812 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Белки Rep аденоассоциированного вируса (ААВ) участвуют в образовании комплекса между ААВ-ДНК и сайтом ее интеграции в ДНК человека
Аннотация: Аденоассоциированный вирус (ААВ) отличается от многих др. эукариотических вирусов способностью к предпочтительной интеграции в специфические сайты геномной ДНК человека. Выяснение мех-змов этой сайт-специфической интеграции имеет значение для разработки систем сайт-адресованной генной терапии болезней человека. Методом электрофореза ДНК-белковых комплексов показано, что белки Rep-78 и Rep-68 специфически связываются с локусом интеграции ААВ на хромосоме 19 человека. Сайт связывания Rep-белков содержит повторяющийся мотив GCTC, сходный с инвертированными концевыми повторами ААВ-ДНК, к-рые также связываются с Rep-белками. Специфичность связывания этих белков с сайтами-мишенями в ААВ-ДНК и в ДНК-человека определяется NH[2]-концевой областью Rep-белка, к-рый опосредует также и образование комплекса ААВ-ДНК с ДНК человека. Обсуждается роль Rep-белков ААВ в сайт-адресованной интеграции ААВ-ДНК в геном человека. США, Inst. Gene Therapy, Wistar Inst., Rm. 204, 36th and Spruce Streets, Philadelphia, PA 19104-4268
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БЕЛОК REP
АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУС

РОЛЬ

ДНК

ИНТЕГРАЦИЯ

ГЕНОМ

ЧЕЛОВЕК


Доп.точки доступа:
Weitzman, Matthew D.; Kyostio, Sirkka R.M.; Kotin, Robert M.; Owens, Roland A.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.08-04Б1.163

   

    Rep protein of tomato yellow leaf curl geminivirus has an ATPase activity required for viral DNA replication [Text] / Cecile Desbiez [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1995. - Vol. 92, N 12. - P5640-5644 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Белок Rep геминивируса желтого скручивания листьев томатов имеет АТФ-азную активность, требующуюся для репликации вирусной ДНК
Аннотация: Белки Rep (I) геминивирусов являются единственными вирусными белками, необходимыми для репликации вирусной ДНК, и содержат R-петлю - консенсусный мотив связывания нуклеозидтрифосфатов. Очищенный I вируса желтого скручивания листьев томатов (ВЖСЛТ), экспрессированный в Escherichia coli, обладает АТФ-азной активностью in vitro. Аминокислотные замены в R-петле I вызывают значительное уменьшение или исчезновение этой активности. In vivo мутанты ВЖСЛТ, имеющие эти замены в I, не реплицируются в клетках растений. Эти данные показали, что связывание I АТФ требуется для ф-ции I в репликации ДНК геминивирусов. Франция, Inst. de Sci. Vgeetales, CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ГЕМИНИВИРУСЫ
ВИРУС ЖЕЛТОГО СКРУЧИВАНИЯ ЛИСТЬЕВ ТОМАТОВ

ДНК

РЕПЛИКАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК REP

АТФ-АЗНАЯ АКТИВНОСТЬ

ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ


Доп.точки доступа:
Desbiez, Cecile; David, Chantal; Mettouchi, Amel; Laufs, Jurgen; Gronenborn, Bruno


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.09-04Б1.213

   

    DNA replication specificity of TYLCV geminivirus is mediated by the amino-terminal 116 amino acids of the Rep protein [Text] / Isabelle Jupin [et al.] // FEBS Lett. - 1995. - Vol. 362, N 2. - P116-120 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Специфичность репликации ДНК геминивируса желтого скручивания листьев томата опосредована N-концевыми 116 аминокислотными остатками белка Rep
Аннотация: Изучена специфичность узнавания области начала репликации (ОНР) ДНК у 2 разных изолятов вируса желтого скручивания листьев томата, выделенных на Сардинии и в Израиле. У обоих белков ОНР узнается только репликативными белками того же изолята. Специфичность узнавания определяется первыми 116 остатками белка Rep и левой частью межгенной области LR в ОНР. Франция, Inst. de Sci. Vegetales, CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ЖЕЛТОГО СКРУЧИВАНИЯ ЛИСТЬЕВ ТОМАТА
ДНК

УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ

БЕЛОК

БЕЛОК REP

N-КОНЦЕВАЯ ОБЛАСТЬ

СПЕЦИФИЧЕСКОЕ УЗНАВАНИЕ

РЕПЛИКАЦИЯ

ГЕМИНИВИРУСЫ


Доп.точки доступа:
Jupin, Isabelle; Hericourt, Francois; Benz, Bianca; Gronenborn, Bruno


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.128

   

    Determination of the origin cleavage and joining domain of geminivirus Rep proteins [Text] / Francoisez Heyraud-Nitschke [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1995. - Vol. 23, N 6. - P910-916 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Определение домена расщепления и воссоединения области начала репликации у белков Rep геминивирусов
Аннотация: Репликация однонитевой ДНК геминивирусов строго зависит от инициаторных белков Rep (I) с мол. м. 41000, кодируемых генами C1 или AC1. На примере вируса карликовости пшеницы (ВКП) и вируса желтого скручивания листьев томата (ВЖСЛТ) показано, что расщепление и воссоединение онДНК области начала репликации (ОНР) in vitro могут вызывать не только полноразмерные I, но и продукт трансляции открытой рамки считывания C1-N ВКП с мол. м. 30000 и искусственно укороченный I ВЖСЛТ с мол. м. 24000. Эти данные показали, что способность узнавать и процессировать ОНР определяется N-концевым доменом I. Германия, fur Zuchtungs forschung, D - 50829 Koln. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС КАРЛИКОВОСТИ ПШЕНИЦЫ
ВИРУС ЖЕЛТОГО СКРУЧИВАНИЯ ЛИСТЬЕВ ТОМАТА

ДНК

ОДНОНИТЕВАЯ

РЕПЛИКАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН C1

ГЕН AC1

БЕЛОК REP

ДОМЕН РАСЩЕПЛЕНИЯ И ВОССОЕДИНЕНИЯ

ГЕМИНИВИРУСЫ


Доп.точки доступа:
Heyraud-Nitschke, Francoisez; Schumacher, Silke; Laufs, Jurgen; Schaefer, Sabine; Schell, Jeff; Gronenborn, Bruno


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.134

    Xie, Qi.

    Identification and analysis of a retinoblastoma binding motif in the replication protein of a plant DNA virus: Requirement for efficient viral DNA replication [Text] / Qi Xie, Paula Suarez-Lopez, Crisanto Gutierrez // EMBO Journal. - 1995. - Vol. 14, N 16. - P4073-4082 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Идентификация и анализ мотива связывания [белка] ретинобластомы в репликативном белке ДНК-содержащего вируса растений: потребность для эффективной репликации вирусной ДНК
Аннотация: В репликативном белке Rep (I) геминивируса карликовости пшеницы (ГВКП) идентифицирован мотив LXCXE, к-рый используется гликопротеинами вирусов животных (SV40) для связывания с белком ретинобластомы Rb. С использованием дрожжевой двугибридной системы показано, что I образует стабильные комплексы с белком p130{Rbr2} (II) - членом семейства Rb. Одиночные аминокислотные замены в мотиве LXCXE устраняют способность I связываться с II. Мотив LXCXE сохраняется и в I др. геминивирусов подгруппы ГВКП. Присутствие этого мотива необходимо для репликации ДНК ГВКП в культуре клеток пшеницы. Эти данные позволили предположить, что: 1) одна из ф-ций I состоит в согласовании циклов репликации клеточной и вирусной ДНК; 2) у растений существуют Rb-подобные белки, играющие регуляторную роль в клеточном цикле. Испания, Centro de Biol. Molecular "Severo Ohhoa", Univ. Autonoma, Cantoblanco 28040 Madrid. Библ. 83
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ГЕМИНИВИРУСЫ
ВИРУС КАРЛИКОВОСТИ ПШЕНИЦЫ

РЕПЛИКАЦИЯ

ВИРУСЫ ДНК-СОДЕРЖАЩИЕ

БЕЛОК

БЕЛОК REP

РЕПЛИКАТИВНЫЙ

МОТИВ СВЯЗЫВАНИЯ БЕЛКА РЕТИНОБЛАСТОМЫ

ДНК

ВИРУСНАЯ

КЛЕТОЧНАЯ

РЕПЛИКАЦИЯ СОГЛАСОВАННАЯ

КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ


Доп.точки доступа:
Suarez-Lopez, Paula; Gutierrez, Crisanto


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.04-04Б1.110

   

    Identification of the nicking tyrosine of geminivirus Rep protein [Text] / Jurgen Laufs [et al.] // FEBS Lett. - 1995. - Vol. 377, N 2. - P258-262 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Идентификация вызывающего разрыв [ДНК] тирозина в белке Rep геминивируса
Аннотация: Белки-инициаторы репликации Rep (I) геминивирусов катализируют расщепление ДНК и перенос нити в вирусной области начала репликации, ковалентно прикрепляясь на промежуточной стадии к 5'-концу разрезанной ДНК. Выделен ковалентный пептид-нуклеотидный комплекс I вируса желтого скручивания листьев томата. Показано, что остаток тир[103] в консервативном мотиве I инициирует расщепление ДНК и физически связывает I с ДНК области начала репликации. Франция, Inst. de Sci. Vegetales, CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ГЕМИНИВИРУСЫ
ВИРУС ЖЕЛТОГО СКРУЧИВАНИЯ ЛИСТЬЕВ ТОМАТА

БЕЛОК REP

ТИРОЗИНОВЫЕ ОСТАТКИ

ДНК-РАСЩЕПЛЕНИЕ

ДНК-СВЯЗЫВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Laufs, Jurgen; Schumacher, Silke; Geisler, Norbert; Jupin, Isabelle; Gronenborn, Bruno


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.04-04Б1.157

   

    Geminivirus replication: Genetic and biochemical characterization of Rep protein function, a review [Text] : [Pap.] 3rd Meet. "Convergence DNA Replic., Recombinant., and Repair", Villejuif, June 6-9, 1995. Pt 1 / J. Laufs [et al.] // Biochimie. - 1995. - Vol. 77, N 10. - P765-773 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Репликация геминивирусов: генетическая и биохимическая характеристика функции белка Rep (обзор)
Аннотация: Обзор. Однонитевая геномная ДНК геминивирусов (ГВ) растений реплицируется по механизму вращающегося круга. Единственным белком ГВ, существенным для репликации, является белок-инициатор репликации Rep (I), кодируемый генами AC1 или C1. N-концевой домен 1 участвует в связывании со специфической областью ДНК ГВ, опосредующей инициацию репликации. I способен расщеплять и воссоединять ДНК и обладает АТФазной активностью. Рассмотрена модель синтеза вирусной нити ДНК ГВ. Обсуждается положение 1 в суперсемействе белков-инициаторов репликации бактерий и млекопитающих. Франция, Inst. de Sci. Vegetales, CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 85
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ГЕМИНИВИРУСЫ
РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛОК REP

ХАРАКТЕРИСТИКА

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 85


Доп.точки доступа:
Laufs, J.; Jupin, I.; David, C.; Schumacher, S.; Heyraud-Nitschke, F.; Gronenborn, B.


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.235

   

    Characterization of copy number mutants of plasmid pSC101 [Text] / Abdul Wadood [et al.] // J. Gen. and Appl. Microbiol. - 1997. - Vol. 43, N 6. - P309-316 . - ISSN 0022-1260
Перевод заглавия: Характеристика мутантов по числу копий плазмиды pSC101
Аннотация: У Escherichia coli плазмида pSC101 существует в кол-ве примерно 5 копий на клетку. Известны мутантные плазмиды pSC101, кол-во к-рых в клетке возрастает в 4-8 раз. У 3 подобных мутантных плазмид обнаружены простые замены в 43, 83 и 115 кодонах гена rep. Известно, что избыточные кол-ва белка Rep ингибируют репликацию плазмиды pSC101. У всех 3 мутантов ингибирующая активность белка Rep оказалась резко снижена. При этом, кол-во белка Rep с мутацией в клетке выше, чем у дикого типа. Если в одной плазмиде совмещали нормальный и мутантный гены rep, то кол-во копий такой плазмиды снижалось. Получ. рез-ты подтверждают роль белка Rep как в регуляции собственного синтеза, так и в контроле числа копий плазмиды. Япония, [Yamaguchi K.] Inst. for Gene Res., Kanazawa Univ., Kanazawa 920. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДЫ

ПЛАЗМИДА PSC101

ЧИСЛО КОПИЙ

КОНТРОЛЬ

ГЕНЫ

ГЕН REP

МУТАЦИИ

БЕЛОК

БЕЛОК REP

ИНГИБИТОР РЕПЛИКАЦИИ

АВТОРЕПРЕССОР


Доп.точки доступа:
Wadood, Abdul; Dohmoto, Mitsuko; Sugiura, Shigeki; Yamaguchi, Kazuo


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.06-04Б1.99

    Chiorini, John A.

    Adeno-associated virus (AAV) type 5 Rep protein cleaves a unique terminal resolution site compared with other AAV serotypes [Text] / John A. Chiorini, Sandra Afione, Robert M. Kotin // J. Virol. - 1999. - Vol. 73, N 5. - P4293-4298 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Белок Rep аденоассоциированного вируса типа 5 расщепляет уникальный сайт терминального разрешения по сравнению с другими серотипами аденоассоциированного вируса
Аннотация: Неспособность белков Rep аденоассоциированного вируса типа 5 (ААВ-5) поддерживать размножение ААВ других серотипов обусловлено блокированием репликации, а не сборки вирионов. Белки Rep AAB-5 и ААВ-2 имеют одинаковое сродство к инвертированным концевым повторам ITR AAB-2 и AAB-5. Однако эти белки проявляют разную эндонуклеазную специфичность в расщеплении сайта TRS терминального разрешения. Белок Rep78 AAB-2 расщепляет ITR AAB-2, а белок Rep ААВ-5 - только ITR ABB-5. Картирование сайтов TRS в ITR ААВ-5 обнаружило особый сайт расщепления (АГТГ'- ВНИЗ'ТГТЦ), отсутствующий в ITR других ААВ. Сравнение ITR ААВ-2 с ААВ-5 и локусом интеграции ААВ в хромосому 19 идентифицировало консервативные нуклеотиды с 3'-стороны от сайта расщепления и очень слабую гомологию с 5'-стороны. США, Mol. Hematol. Branch, NHLBI, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЕ ВИРУСЫ
БЕЛОК REP

ИНВЕРТИРОВАННЫЕ КОНЦЕВЫЕ ПОВТОРЫ

РАСЩЕПЛЕНИЕ

СЕРОТИПСПЕЦИФИЧНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Afione, Sandra; Kotin, Robert M.


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.10-04Б2.242

   

    A rolling-circle plasmid from Psychrobacter sp. TA144: Evidence for a novel rep subfamily [Text] / M.Luisa Tutino [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 2000. - Vol. 274, N 2. - P488-495 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Плазмида Psychrobacter sp. TA144, [реплицирующаяся по механизму] катящегося кольца: доказательство [существования] нового субсемейства Rep
Аннотация: Клонировали и секвенировали 2 небольшие плазмиды, pTAUp и pTADw, антарктической грамотрицательной бактерии Psychrobacter sp. штамм TA144. Плазмида pTAUp содержит ген, кодирующий белок Rep (Psyrep), что указывает на репликацию этой плазмиды по механизму катящегося кольца. Идентификация онДНК pTAUp подтвердила правильность этого предположения. На 3'-конце гена Psyrep с помощью комплементации in vivo найден предполагаемый плюс-участок начала репликации pTAUp. Структурное сходство на уровне организации гена, аминокислотной последовательности и последовательности сайта никирования указывает на принадлежность выделенного фермента к новому субсемейству ферментов репликации. Италия, Dip. Chimica Organica Biol., Univ. Naples Federico II, 1680134 Naples. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
PTA4P

PTADW

КЛОНИРОВАНИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

БЕЛОК

БЕЛОК REP

НОВОЕ ПОДСЕМЕЙСТВО

PSYCHROBACTER SP. TA144 (BACT.)


Доп.точки доступа:
Tutino, M.Luisa; Duilio, Angela; Moretti, Maria Angela; Sannia, Giovanni; Marino, Gennaro


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.07-04Б1.40

   

    Conditional site-specific integration into human chromosome 19 by using a ligand-dependent chimeric adeno-associated virus/rep protein [Text] / Daniela Rinaudo [et al.] // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, N 1. - P281-294 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Условная сайт-специфическая интеграция в хромосому 19 человека с использованием зависящего от лиганда белка Rep аденоассцоиированного вируса
Аннотация: Сконструирована зависящая от лиганда форма белка Rep(I) аденоассоциированного вируса (ААВ). Для этого I с делецией на С-конце соединили с укороченной формой домена связывания гомонов человеч. рецептора прогестерона(II), к-рая не связывает II и связывает только RU486(III) - синтетич. антагонист II. Активность химерного I, названного Rep1-486/P(IA), сильно зависит от III. В частности, IA запускает сайт-специфич. интеграцию в сайт AAVS1 хромосомы 19 человека кассеты, фланкированной инвертированными повторами ITR AAB. Интеграция в присутствии IA зависит от III, идет с такой же эффективностью, как и в присутствии I дикого типа, но не порождает нежелательных перестроек в сайте AAVS1. Италия, Dep. Genet., Inst. Richerce Biol. Mol., IRBM - Pietro Angoletti, 00040 Pomezia (Roma). Библ. 69
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.05.39
Рубрики: ВИРУСНЫЕ ВЕКТОРЫ
АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЕ ВИРУСЫ

БЕЛОК REP

САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ ИНТЕГРАЦИЯ

ЧЕЛОВЕЧЕСКАЯ ХРОМОСОМА 19


Доп.точки доступа:
Rinaudo, Daniela; Lamartina, Stefania; Roscilli, Giuseppe; Ciliberto, Gennaro; Toniatti, Carlo


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.02-04Б1.70

    Cathomen, Toni.

    A chimeric protein containing the N terminus of the adeno-associated virus Rep protein recognizes its target site in an in vivo assay [Text] / Toni Cathomen, Delphine Collete, Matthew D. Weitzman // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, N 5. - P2372-2382 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Химерный белок, содержащий N-конец белка Rep аденоассоциированного вируса, узнает его мишенный сайт в тесте in vivo
Аннотация: Разработана одногибридная система для обнаружения ДНК-белковых взаимодействий in vivo. Изучена способность к олигомеризации, связыванию с ДНК и активации экспрессии репортерского гена химерных белков, состоящих из N-конца белков Rep (I) аденоассоциированного вируса, чужеродных мотивов олигомеризации и домена активации транскрипции. Экспрессия репортерских генов, направляемая мотивами связывания I (RRS), клонированными перед промотором, изучена в клетках млекопитающих из трансфицированных плазмид и в клетках Saccharomyces cerevisiae из репортерской кассеты, встроенной в геном дрожжей. Показано, что химерные белки, содержащие 244 N-концевых остатка I, нацеливаются на RRS in vitro и in vivo, если они включаются в искусственные мультимеры. США, Lab. Genet., Salk Inst. for Biol. Studies, San Diego, CA 92186. Библ. 44
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЕ ВИРУСЫ
БЕЛОК REP

ДНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

ВЫЯВЛЕНИЕ

ОДНОГИБРИДНЫЕ СИСТЕМЫ

ХИМЕРНЫЕ БЕЛКИ


Доп.точки доступа:
Collete, Delphine; Weitzman, Matthew D.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.07-04Б1.321

   

    Roles of adeno-associated virus Rep protein and human chromosome 19 in site-specific recombination [Text] / Samuel M. Young [et al.] // J. Virol. - 2000. - Vol. 74, N 9. - P3953-3966 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Роли белка Rep аденоассоциированного вируса и человеческой хромосомы 19 в сайт-специфической рекомбинации
Аннотация: Аденоассоциированный вирус (ААВ) типа 2 нацеленно интегрируется в человеч. хромосому 19 (Х-19) q13.3qter при участии вирусных белков Rep68/78 (I), к-рые узнают элемент RBE связывания с ДНК. Для изучения роли I в нацеленной интеграции разработан зависящий от I метод связывания ДНК на фильтрах при участии высокоочищенного составного белка Rep68. Взаимодействие I-RBE изучено также методом электронной микроскопии. Показано, что при использовании голой ДНК сродство I к Х-19 не отличается от сродства к другим RBE в геноме человека. I эффективно ассоциируется с минимальными сайтами ГАГYГАГЦ, число к-рых в геноме человека равно 'ПРИБЛ='2*10{5}. Электронная микроскопия обнаружила образование только одного комплекса I-ДНК на мишени ДНК Х-19. Комплексы такого же размера образуются на всех субстратах, содержащих RBE, но не на ДНК, не содержащей RBE. Комплексы I-ДНК представляют собой мультипротеиновую структуру, занимающую 'ПРИБЛ='60 п.н. Иммунопреципитация из латентно инфицированных ААВ клеток показала, что они экспрессируют 1000-4000 копий I на клетку. Этого кол-ва I достаточно для взаимодействия со всеми потенциальными сайтами RBE. Экспрессия I в отсутствие цис-субстрата ААВ вызывает зависящие от I амплификацию и перестройку мишенной последовательности в Х-19. Высказано предположение, что это локус является горячей точкой рекомбинации, зависящей от I. Сконструирована линия мышей, несущая одну вставку ДНК длиной 2,7 т.п.н. из человеч. Х-19 со специфич. локусом интеграции ААВ. С использованием клеток из этих мышей показано, что этой последовательности достаточно для сайт-специфич. рекомбинации после заражения трансдуцирующим вектором, экспрессирующим I. Таким образом, хозяйские факторы, требующиеся для нацеливания, консервативны у человека и мыши, а встроенный фрагмент Х-19 создает цис-последовательности и структуру хроматина, необходимые для сайт-специфич. рекомбинации. Полученные данные позволили предположить, что специфичность нацеленной рекомбинации в Х-19 определяется не дифференциальным сродством I к RBE, а последовательностями в Х-19, к-рые содержат область начала репликации, опосредованной I, и облегчают нацеливание ААВ через взаимодействия I-I и I с хозяйскими ферментами. США, Gene Therapy Ctr., Univ. North Carolina, Chapel Hill, NC 27599. Библ. 63
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.19
Рубрики: АДРЕНОАССОЦИИРОВАННЫЕ ВИРУСЫ
БЕЛОК REP

ЧЕЛОВЕЧЕСКАЯ ХРОМОСОМА 19

САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

НАЦЕЛЕННАЯ ИНТЕГРАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Young, Samuel M.; McCarty, Douglas M.; Degtyareva, Natalya; Samulski, Richard Jude


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.05-04Б2.162

    Лагодич, А. В.

    Распространение плазмид тета-типа размером более 90 kb среди природных штаммов Bacillus subtilis [Текст] / А. В. Лагодич, М. А. Титок // Актуальные проблемы генетики. - М., 2003. - Т.2. - С. 88-89 . - ISBN 5-94327-165-1
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PBS72

ОРИДЖИН ВЕГЕТАТИВНОЙ РЕПЛИКАЦИИ

БЕЛОК REP

РЕПЛИКАЦИЯ

ПОДДЕРЖАНИЕ

РЕПЛИКОН

РАЗМЕРЫ

РАСПРОСТРАНЕНИЕ

КОНЪЮГАЦИОННЫЙ ПЕРЕНОС

BACILLUS SUBTILUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Титок, М.А.


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 04.06-04Б1.59

   

    ssDNA-dependent colocalization of adeno-associated virus Rep and herpes simplex virus ICP8 in nuclear replication domains [Text] / Regine Heilbronn [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2003. - Vol. 31, N 21. - P6206-6213 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Зависимая от одноцепочечной ДНК колокализация [белка] Rep аденоассоциированного вируса и [белка] ICP8 вируса простого герпеса в ядерных доменах репликации
Аннотация: Внутриядерное распределение белков репликационного комплекса считается важным фактором контроля репликации ДНК. Белок вируса простого герпеса (HSV), связывающийся с онДНК, ICP8 (белок 8 инфицированных клеток) накапливается в ядерных доменах репликации. ICP8 выполняет также функции белка-помощника в репликации аденоассоциированного вируса (AAV). С помощью метода количественной трехмерной колокализации показали, что при одновременном заражении клеток AAV и HSV белок репликации AAV Rep и ICP8 располагаются в доменах репликации HSV. При экспрессии Rep с использованием рекомбинантного HSV в отсутствие ДНК AAV характер распределения белков Rep и ICP8 в ядре не одинаков. Колокализация Rep и ICP8 восстанавливается при введении онAAV-векторов. In vitro ICP8 непосредственно связывается с Rep78. Это взаимодействие сильно стимулируется он-, но не днДНК AAV. Сделан вывод, что благодаря сильной онДНК-связывающей активности ICP8 использует онДНК AAV для образования тройного комплекса с rep78 и онДНК AAV. Такой механизм приводит к направлению ДНК AAV в ядерные компартменты репликации HSV. Германия, Inst. Infektionsmedizin, Abt. Virol., Charite Campus Benjamin Franklin, Freje Univ. Berlin. Библ. 55
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС ПРОСТОГО ГЕРПЕСА
БЕЛОК ICP8

АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУС

БЕЛОК REP

КОЛОКАЛИЗАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ОНДНК-СВЯЗЫВАЮЩАЯ АКТИВНОСТЬ

РЕПЛИКАЦИЯ

ДНК

РЕПЛИКАЦИОННЫЙ КОМПЛЕКС

ВНУТРИЯДЕРНОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ


Доп.точки доступа:
Heilbronn, Regine; Engstler, Markus; Weger, Stefan; Krahn, Antje; Schetter, Christian; Boshart, Michael


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.09-04Б1.97

   

    Прокариотическая экспрессия и иммунолокализация гена белка репликации вируса скручивания побегов табака [Text] / Xiao-Feng Cui [et al.] // Weishengwu xuebao = Acta microbiol. sin. - 2004. - Vol. 44, N 6. - С. 745-748 . - ISSN 0001-6209
Аннотация: Из изолята Y35 из табачных растений, инфицированных вирусом курчавости побегов (TbCSV), был выделен ген белка репликации Rep и клонирован в вектор экспрессии pGEX-4T-1 для получения рекомбинантной плазмиды pGEX Y35 Rep. Рекомбинантная плазмида была введена в E. coli, где была экспрессирована. Слитый белок Rep очищался аффинной хроматографией и его поликлональные антитела продуцировались в кроликах. Изучение распределения Rep-белка в табачных листьях показало, что он находится гл. обр. во фракциях содержащих ядра. Локализация Rep-белка в ядрах инфицированных клеток табака подтверждалось также реакцией антител с иммунозолочением. КНР, Inst. of Biotechnol., Zhejiang Univ., Hanzhou 210029. Библ. 13
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
ВИРУС СКРУЧИВАНИЯ ПОБЕГОВ ТАБАКА

БЕЛОК REP

ПРОКАРИОТИЧЕСКАЯ ЭКСПРЕССИЯ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Cui, Xiao-Feng; Li, Yun-Qin; Li, Gui-Xin; Zhou, Xue-Ping


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 08.03-04Б1.54

   

    The rep protein of adeno-associated virus type 2 interacts with single-stranded DNA-binding proteins that enhance viral replication [Text] / Travis H. Stracker [et al.] // J. Virol. - 2004. - Vol. 78, N 1. - P441-453 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Белок Rep аденоассоциированного вируса типа 2 взаимодействует с белком, связывающим одноцепочечную ДНК, что усиливает репликацию вируса
Аннотация: Аденоассоциированный вирус типа 2 (AAV) - парвовирус человека, репликация которого зависит от клеточных белков, а также белков, поставляемых вирусами-помощниками. Минимальный набор белков вируса простого герпеса типа 1 (HSV-1), поддерживающий репликацию AAV в клеточных культурах, включает в себя комплекс геликазы-праймазы из белков UL5, UL8 и UL52, а также продукт гена UL29-ICP8. Показали, что белки репликации AAV и HSV-1 колокализуются в дискретных участках ядра. В опытах по трансфекции мутантных генов обнаружили, что ферментативные активности геликазы-праймазы не существенны для репликации AAV. Белок ICP8 сам усиливает репликацию AAV in vitro. Выявили также локализацию клеточного репликационного белка A (RPA) в участках локализации AAV. Белки Rep68 и Rep78 AAV взаимодействуют с белками, связывающими одноцепочечную ДНК аденовирусов (ad-DBP), HSV-1 (ICP8) и клетки (RPA). Эти белки усиливают связывание белков Rep с участком начала репликации AAV и образование в нем одноцепочечных разрывов. США, Lab. Genet., Salk Inst. Biol. Studies, P. O. Box 85800, San Diego, CA 92186-5800. Библ. 72
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: ВИРУС АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ
ТИПА 2

РЕПЛИКАЦИЯ

БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

БЕЛОК REP

СВЯЗЫВАЮЩИЙ ОДНОЦЕПОЧЕЧНУЮ ДНК БЕЛОК


Доп.точки доступа:
Stracker, Travis H.; Cassell, Geoffrey D.; Ward, Peter; Loo, Yueh-Ming; van, Breukelen Bas; Carrington-Lawrence, Stacy D.; Hamatake, Robert K.; van, der Vliet Peter C.; Weller, Sandra K.; Melendy, Thomas


 1-20    21-30 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)