Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=DNAA<.>)
Общее количество найденных документов : 150
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.274

   

    A nucleotide switch in the Escherichia coli DnaA protein initiates chromosomal replication. Evidence from a mutant DnaA protein defective in regulatory ATP hydrolysis in vitro and in vivo [Text] / Satoshi Nishida [et al.] // J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277, N 17. - P14986-14995 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Переключение нуклеотидов в белке DnaA Escherichia coli инициирует хромосомную репликацию. Доказательство, что мутантный белок DnaA дефективен по регуляции гидролиза АТФ in vitro и in vivo
Аннотация: Белок DnaA Escherichia coli открывает двойную ДНК в участке начала репликации, что ведет к серии инициаций реакции in vitro. ДНК-полимераза III стимулирует гидролиз связи DnA-АТФ в присутствии белка IdaB/Hda, что приводит к выходу АДФ-DnaA, который инактивируется для инициации in vitro. Предположили, что эта негативная обратная регуляция играет важную роль в цикле репликации. Показали, что мутантный белок DnaA R334A - инертен для гидролиза связи с АТФ, хотя его сродство к АТФ и АДФ не меняется. АТФ-связывающий белок DnaA R334A, но не АДФ-форма, инициирует минихромосомную репликацию in vitro почти на уровне дикого типа. In vivo, DnaA R334A преобладает в АТФ-связанной форме, в отличие от белков DnaA E204Q, и способствует ориентации хромосомной репликации. Полученные данные подтверждают роль в связывании нуклеотидов регуляции активности DnaA во время репликации и позволяют сделать вывод о том, что остаток Arg-334 тесно взаимодействует со связанными нуклеотидами. Япония, Dep. of Mol. Microbiol., Kyushi Univ., Graduate School of Pharmaceutical Sci., Higashi-ku, Fukuoka 812-8582. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

ИНИЦИАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ НУКЛЕОТИДОВ

МЕХАНИЗМ

АМИНОКИСЛОТЫ

АРПЕНИН ARG-334

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Nishida, Satoshi; Fujimitsu, Kazuyuki; Sekimizu, Kazuhids; Ohmura, Tadshiro; Ueda, Tadashi; Katayama, Tsutomu


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.11-04Б2.268

   

    A transcriptional response to replication status mediated by the conserved bacterial replication protein DnaA [Text] / Alexi I. Goranov [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2005. - Vol. 102, N 36. - P12932-12937 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Транскрипционный ответ на состояние репликации опосредован консервативным репликативным белком DnaA
Аннотация: Организмы отвечают на изменения в репликации ДНК. Охарактеризовали общий транскрипционный ответ на ингибирование репликации ДНК в Bacillus subtilis. Определяли изменения, не зависящие от SOS-ответа. Обнаружили, что на перекрывающиеся наборы генов влияют пертурбации в репликационной элонгации и инициации, а транскрипционный ответ служил для ингибирования клеточного деления и сохранения жизнеспособности клеток. Около 20 оперонов (50 генов) имели потенциальные DnaA-связывающие сайты и прямо регулировались DnaA, консервативным белком инициации репликации и транскрипционным фактором. Гомологи многих из этих генов имелись в других бактериях, свидетельствуя о консервативности DnaA-опосредованного ответа. США, Dep. of Biol., Massachusetts Inst. of Technology, Cambridge, MA 02139. Библ. 66
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНГИБИРОВАНИЕ

ВЛИЯНИЕ

РЕПЛИКАЦИЯ ДНК

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ФУНКЦИЯ

BACILLUS SUBTILIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Goranov, Alexi I.; Katz, Luba; Breier, Adam M.; Burge, Christopher B.; Grossman, Alan D.


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.206

   

    Allele specificity of the Escherichia coli dnaA gene function in the replication of plasmids derived from phage 'лямбда' [Text] / Grzegorz Wegrzyn [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1996. - Vol. 252, N 5. - P580-586 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Аллель-специфичность функции гена dnaA Escherichia coli в репликации плазмид, происходящих от фага 'лямбда'
Аннотация: Описана вариация влияния 7 аллелей гена dnaA, вызывающих температурочувствительность инициации хромосомы, на репликацию происходящих от фага 'лямбда' плазмид при 30'ГРАДУС'. Аллель-специфичность мутаций dnaA не проявляется в отношении репликации 2 изученных плазмид 'лямбда''пи'. С другой стороны, неспособность плазмиды 'лямбда'P{+} реплицироваться при 30'ГРАДУС' в мутантах dnaA508, dnaA46, dnaA204 и dnaB (groPA15) и в клетках, температурочувствительных по генам шаперонов (dnaK756, dnaJ259 и grpE280), супрессируется одной мутацией 'пи'. Это позволяет предположить, что: 1) за супрессию ответственно общее свойство белка 'пи' - более слабое взаимодействие с геликазой DnaB (I); 2) регулируемая DnaA активация транскрипции ori'лямбда' действует на стадии, в к-рой кооперируются продукты всех указанных генов; т. е. во время сборки препраймосомы и опосредованного шаперонами освобождения I от ингибирования белком 'лямбда'P. Польша, Dep. of Molecular Biol., Univ. of Gdansk, Gdansk, PL-80822. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПРОИЗВОДНЫЕ

ФАГ ЛЯМБДА

РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Wegrzyn, Grzegorz; Wegrzyn, Alicja; Pankiewicz, Areta; Taylor, Karol


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.02-04Б1.197

   

    Allele specificity of the Escherichia coli dnaA gene function in the replication of plasmids derived from phage 'лямбда' [Text] / Grzegorz Wegrzyn [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1996. - Vol. 252, N 5. - P580-586 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Аллель-специфичность функции гена dnaA Escherichia coli в репликации плазмид, происходящих от фага 'лямбда'
Аннотация: Описана вариация влияния 7 аллелей гена dnaA, вызывающих температурочувствительность инициации хромосомы, на репликацию происходящих от фага 'лямбда' плазмид при 30'ГРАДУС'. Аллель-специфичность мутаций dnaA не проявляется в отношении репликации 2 изученных плазмид 'лямбда''пи'. С другой стороны, неспособность плазмиды 'лямбда'P{+} реплицироваться при 30'ГРАДУС' в мутантах dnaA508, dnaA46, dnaA204 и dnaB (groPA15) и в клетках, температурочувствительных по генам шаперонов (dnaK756, dnaJ259 и grpE280), супрессируется одной мутацией 'пи'. Это позволяет предположить, что: 1) за супрессию ответственно общее свойство белка 'пи' - более слабое взаимодействие с геликазой DnaB (I); 2) регулируемая DnaA активация транскрипции ori'лямбда' действует на стадии, в к-рой кооперируются продукты всех указанных генов; т. е. во время сборки препраймосомы и опосредованного шаперонами освобождения I от ингибирования белком 'лямбда'P. Польша, Dep. of Molecular Biol., Univ. of Gdansk, Gdansk, PL-80822. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПРОИЗВОДНЫЕ

ФАГ ЛЯМБДА

РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Wegrzyn, Grzegorz; Wegrzyn, Alicja; Pankiewicz, Areta; Taylor, Karol


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.301

   

    Analysis of the DNA-binding domain of Escherichia coli DnaA protein [Text] / Franca Blaesing [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 36, N 3. - P557-569 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Анализ домена связывания с ДНК белка DnaA Escherichia coli
Аннотация: За связывание с ДНК белка DnaA Escherichia coli отвечает домен 4 на С-конце DnaA (остатки 374-467). С использованием трансляционного слияния mioC::lacZ, интегрированного в хромосому индикаторного штамма, показано, что изолированный домен 4 является функциональным репрессором in vivo. Методами сайт-направленного и случайного ПЦР-мутагенеза сконструированы мутации домена 4, влияющие на экспрессию mioC::lacZ. Мутации, влияющие на связывание с ДНК, обнаружены по всему домену 4. Они сгруппированы в области основной петли, в спирали В и в высококонсервативной области на N-конце спирали C. Методом поверхностного плазмонного резонанса обнаружено несколько классов мутантов с разной способностью связываться с ДНК. Наиболее сильный дефект по связыванию вызывают замены остатков R399, R407, Q408, H434, T435, T436 и A440. Мутации в области длиной 12 остатков рядом с концом спирали C изменяют специфичность связывания. Дефекты классических температурочувствительных мутантов dnaA204, dnaA205 и dnaA211 являются результатом нестабильности белков DnaA при повышенной температуре. Мутации dnaA71 и dnaA721, являющиеся супрессорами dnaX, картированы в области около спирали C. Они вызывают неспецифическое связывание с ДНК. Германия, Max-Planck-Inst. Mol. Genet., D-14195 Berlin-Dahlem. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК DNAA

ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ С ДНК

АНАЛИЗ

ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Blaesing, Franca; Weigel, Christoph; Welzeck, Michaela; Messer, Walter


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.09-04Б2.235

   

    Anomalous DnaA protein binding to the regulatory region of the Escherichia coli aldA gene [Text] / Toru Ozaki [et al.] // Microbiology. - 2001. - Vol. 147, N 1. - P153-159 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Аномальное связывание белка DnaA с регуляторной областью гена aldA Escherichia coli
Аннотация: В регуляторной области гена aldA Escherichia coli идентифицирован сайт связывания белка DnaA (I). Образование in vitro специфич. комплекса I - ДНК aldA продемонстрировано методами связывания на фильтрах и сдвига ЭФ-подвижности. При выращивании клеток в минимальной среде с глюкозой экспрессия слияния генов aldA-lacZ подавляется избытком I и усиливается при понижении уровня свободной I. Эти данные позволили предположить, что I негативно регулирует экспрессию гена aldA. Несмотря на сильное связывание I, в промоторной области гена aldA нет консенсусного DnaA-блока. Футпринтинг обнаружил аномальное связывание I с АТ-богатой последовательностью, расположенной рядом со стартовым сайтом транскрипции. Япония, Div. Biol. Sci., Grad. Sch. Sci., Nagoya Univ., Nagoya 464-8602. Библ. 19
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН ALDA

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНАЯ ОБЛАСТЬ AT-БОГАТАЯ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

СВЯЗЫВАНИЕ АНОМАЛЬНОЕ

БЕЛОК DNAA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Ozaki, Toru; Kumaki, Yuichi; Kitagawa, Risa; Ogawa, Tohru


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.02-04Б2.165

    Aranovich, Alexander.

    The reactivation of DnaA (L366K) requires less acidic phospholipids supporting their role in the initiation of shromosome replication in Escherichia coli [Text] / Alexander Aranovich, Abraham H. Parola, Itzhak Fishov // FEBS Lett. - 2007. - Vol. 581, N 23. - P4439-4442 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Реактивация DnaA(L366K) нуждается в меньшей концентрации кислых фосфолипидов, что подтверждает их роль в инициации репликации хромосомы Escherichia coli
Аннотация: DnaA(L366K) совместно с белком дикого типа wtDnaA восстанавливает рост клеток Escherichia coli, прекратившийся из-за недостатка внутриклеточных кислых фосфолипидов. In vivo и in vitro показано, что сам по себе DnaA(L366K) не способен индуцировать инициацию репликации, это происходит только в присутствии wtDnaA. До настоящего времени различное поведение wt и мутантного DnaA оставалось непонятным. Показано, что мутантный белок DnaA(L366K) может быть активирован при значительно более низких концентрациях кислых фосфолипидов, чем белок дикого типа, и это может объяснять наблюдаемое восстановление роста in vivo. Израиль, Dep. Life Sci., Ben-Gurion Univ. Negev, P.O. Box 653, Beer-Sheva 84105. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

БЕЛКИ РЕПЛИКАЦИИ

ИНИЦИИРУЮЩИЙ БЕЛОК DNAA

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ФОСФОЛИПИДЫ

КИСЛЫЕ ФОСФОЛИПИДЫ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ

БЕЛОК-МЕМБРАНЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ


Доп.точки доступа:
Parola, Abraham H.; Fishov, Itzhak


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.218

   

    Arrest of cell division and nucleoid partition by genetic alterations in the sliding clamp of the replicase and in DnaA [Text] / H. Kawakami [et al.] // Mol. Gen. and Genom. - 2001. - Vol. 266, N 2. - P167-179 . - ISSN 1617-4615
Перевод заглавия: Задержка клеточного деления и распределение [по дочерним клеткам] нуклеоида под действием генетических изменений в [скользящем зажиме] репликазы и в DnaA
Аннотация: У Escherichia coli для регуляции цикла репликации хромосомы необходимо взаимодействие между инициатором репликации DnaA и белком "скользящего зажима" - 'бета'-субъединицей (DnaN) ДНК-полимеразы III. Показали, что при умеренной (4-8-кратной) сверхэкспрессии DnaA в температурочувствительном мутанте dnaN59 при 34-35'ГРАДУС'C подавляется образование колоний и клеточное деление, хотя репликация хромосомы и зависимая от 'бета'-субъединицы регуляция активности DnaA не подавляются существенным образом. С помощью иммуноблотинга показали, что содержание димеров 'бета'-субъединицы в клетках мутанта dnaN59 при 34'ГРАДУС'C остается высоким (примерно 5000 на клетку) в условиях сверхэкспрессии DnaA. Клетки, сверхэкспрессирующие DnaA, становятся нитевидными, причем это изменение не связано с запуском SOS-ответа. Подавляется также разделение нуклеоида и образование кольца FtsZ. Сделан вывод, что у мутанта dnaN59 излишнее накопление DnaA может нарушать координированное действие белков, регулирующих клеточный цикл, и подавлять эти процессы. Япония, Dep. Molec. Microbiol., Graduate Sch. Pharm. Sci., Kyushu Univ., 3-1-4 Maidashi, Higashi-ku, Fukuoka 812-8582. Библ. 70
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК DNAN

'БЕТА'-СУБЪЕДИНИЦА ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ III

БЕЛОК DNAA

МУТАЦИИ

КЛЕТОЧНОЕ ДЕЛЕНИЕ

ЗАДЕРЖКА

СЕГРЕГАЦИЯ НУКЛЕОИДА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Kawakami, H.; Iwura, T.; Takata, M.; Sekimizu, K.; Hiraga, S.; Katayama, T.


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.211

   

    Bacterial replication initiator DnaA. Rules for DnaA binding and roles of DNaA in origin unwinding and helicase loading [Text] / Walter Messer [et al.] // Biochimie. - 2001. - Vol. 83, N 1. - P5-12 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Бактериальный инициатор репликации DnaA. Правила для связывания DnaA и роли DnaA в расплетании области начала репликации и погрузке геликазы
Аннотация: Обзор. Рассмотрены процессы, ведущие к структурным модификациям, требующимся для инициации репликации хромосомы Escherichia coli, конверсии первичного комплекса с белком DnaA (I) в открытый комплекс репликации, погрузки геликазы DnaB (II) и сборки 2 репликативных вилок. Выведены правила ассоциации I с его сайтами связывания в ДНК. Описаны св-ва комплекса I-АТФ. Обсуждаются новые данные о кооперативных взаимодействиях и димеризации I у E. coli, Streptomyces и Thermus thermophilus и о стехиометрии комплексов I-oriC у E. coli. Германия, Max-Planck-Inst. Mol. Genet., 14195 Berlin. Библ. 49
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORI

СВЯЗЫВАНИЕ

ИНИЦИАТОР РЕПЛИКАЦИИ DNA A

ПОГРУЗКА

ГЕЛИКАЗЫ DNAB

РЕПЛИКАТИВНЫЕ ВИЛКИ

СБОРКА

АТФ

КОМПЛЕКС

БЕЛОК DNAA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 49


Доп.точки доступа:
Messer, Walter; Blaesing, Franca; Jakimowicz, Dagmara; Krause, Margret; Majka, Jerzy; Nardmann, Judith; Schaper, Sigrid; Seitz, Harald; Speck, Christian; Weigel, Christoph


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.198

    Bahloul, Abdelkader.

    Roles of Escherichia coli histone-like protein HU in DNA replication: HU-beta suppresses the thermosensitivity of dnaA46ts [Text] / Abdelkader Bahloul, Fatima Boubrik, Josette Rouviere-Yaniv // Biochimie. - 2001. - Vol. 83, N 2. - P219-229 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Роль гистоноподобного белка HU Escherichia coli в репликации ДНК: HU-бета супрессирует термочувствительность dnaA46ts
Аннотация: Продолжено изучение роли гистоноподобного белка HU (I), состоящего из субъединиц 'альфа' и 'бета' (IA и IB), в регуляции инициации репликации ДНК у Escherichia coli. Двойной мутант hupAB проявляет асинхронную инициацию, у мутанта hupA также понижена синхронность, а мутант hupB не отличается от дикого типа. Присутствие плазмиды, гиперэкспрессирующей IB, в т-рочувствительном по инициации мутанте dnaA46ts hupAB, не имеющем I, комплементирует т-рочувствительность инициации. Гиперпродукция IB придает мутанту dnaA46ts такую же картину асинхронности, как и dnaAcos-внутригенный супрессор dnaA46ts. У мутанта dnaA46ts значительно изменено относительное кол-во IA и IB, т. к. этот мутант почти не накапливает IB. Т. обр., супрессия IB т-рочувствительности dnaA46ts hupAB вызвана неожиданным отсутствием IB у мутанта dnaA46ts. Вероятно, субъединичный состав I чувствителен к различным состояниям белка DnaA и может играть роль в регуляции процесса инициации репликации ДНК, влияя на последующие события в клеточном цикле. Франция, Lab. Physiol. Bacterienne, Inst. Biol. Physico-Chim., 75005 Paris. Библ. 69
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

БЕЛОК

ГИСТОНОПОДОБНЫЙ БЕЛОК HU

СИНТЕЗ

ФУНКЦИЯ

СУБЪЕДИНИЧНЫЙ СОСТАВ

ВЛИЯНИЕ

БЕЛОК DNAA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Boubrik, Fatima; Rouviere-Yaniv, Josette


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.215

    Blanc-Potard, Anne-Beatrice.

    Histidine operon deattenuation in dnaA mutants of Salmonella typhimurium correlates with a decrease in the gene dosage ratio between tRNA{His} and histidine biosynthetic loci [Text] / Anne-Beatrice Blanc-Potard, Nara Figueroa-Bossi, Lionello Bossi // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 9. - P2938-2941 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Деаттенюация гистидинового оперона в мутантах dnaA Salmonella typhimurium коррелирует с уменьшением отношения дозы гена между тРНК{гис} локусами биосинтеза гистидина
Аннотация: Экспрессия гистидинового оперона у мутантов dnaA(Ts) Salmonella typhimurium усиливается при 37'ГРАДУС'. Этот эффект требует целого аттенюатора his и устраняется при увеличении числа копий гена hisR, кодирующего тРНК{гис}. Представлены данные, позволяющие предположить, что дефект по деаттенюации his в мутантах dnaA(Ts) вызван исчезновением градиента дозы генов между локусом hisR, близким к oriC, и опероном his, далеким от oriC. Франция, Ctr. Genet. Mol., CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГИСТИДИНОВЫЙ ОПЕРОН HIS

ДЕАТТЕНЮАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

МУТАНТЫ

МУТАНТ ПО СИНТЕЗУ ГИСТИДИНА DNAA(TS)

ХАРАКТЕРИСТИКА

SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Figueroa-Bossi, Nara; Bossi, Lionello


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.08-04Б2.218

    Blinkova, Alexandra.

    Suppression of temperature-sensitive chromosome replicarion of an Escherichia coli dnaX(Ts) mutant by reduction of initiation efficiency [Text] / Alexandra Blinkova, Mary Jo Hermandson, James R. Walker // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 12. - P3583-3595 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Супрессия температурно-чувствительной хромосомной репликации мутанта Escherichia coli dnaX(Ts) уменьшением эффективности инициации
Аннотация: Чувствительность к температуре мутанта Escherichia coli dnaX(Ts) супрессируется мутациями инициаторного гена dnaA, обозначенными dnaA(Cs,Sx). Для объяснения механизма супрессии предложены две модели - одна, связанная с нарушением инициации, и стабилизационная модель, основанная на идее, что DnaA взаимодействует с факторами полимеризации во время репликации. В данной работе представлены доказательства в поддержку модели нарушения эффективности инициации. Во-первых, мутация dnaA(Cs,Sx) уменьшает частоту инициации и хромосомное содержание, измеренной с помощью проточной цитометрии, и соотношение начала и терминации, измеренное с помощью ПЦР, как в штамме дикого типа, так штаммах dnaX(Ts). Так как dnaX(Ts) не имеет нарушений инициации, то эти эффекты - следствие супрессорных мутаций. Во-вторых, эти эффекты характерны для всех трех известных супрессорных мутаций. В-третьих, супрессия происходит на среде с глицеролом при 38'ГРАДУС'С, что не соответствует второй модели. В-четвертых, мутация dnaX(Ts) может супрессироваться введением oriC мутаций, уменьшающих эффективность инициации числа хромосом на клетку, а степень супрессии пропорциональна уровню нарушений инициации. В-пятых, введение аллели dnaA(Cos), вызывающей сверхинициацию, в dnaX(Ts) мутант усиливает его чувствительность к температуре. США, Section of Mol. and Microbiol. and Inst. for Cellular and Mol. Biol., Univ. of Texas, Austin, Texas 78712. Библ. 66
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛОК ИНИЦИАЦИИ РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИЯ

МУТАНТЫ

МУТАНТ ПО ГЕНУ РЕПЛИКАЦИИ DNAX

ХАРАКТЕРИСТИКА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hermandson, Mary Jo; Walker, James R.


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.148

    Bogan, Joseph A.

    DNA sequestration and transcription in the oriC region of Escherichia coli [Text] / Joseph A. Bogan, Charles E. Helmstetter // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 5. - P889-896 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Секвестрация ДНК и транскрипция в области oriC Escherichia coli
Аннотация: У Escherichia coli транскрипция генов gidA и dnaA выключается вскоре после инициации репликации, а гена mioC еще до инициации. Изучена транскрипция этих генов у мутантов seqA и dam Escherichia coli PC2 dnaC2(ts), синхронизированных по инициации репликации. В клетках seqA{-} или dam{-} гены gidA и dnaA продолжают транскрибироваться после инициации, но ингибирование транскрипции mioC перед инициацией не изменилось. После инициации транскрипты mioC, проходящие через oriC, исчезают более медленно в клетках seqA{+} dam{+}, чем в клетках seqA{-} или dam{-}, но до освобождения oriC от секвестрации. Вероятно, инициация транскрипции на промоторе может полностью предотвращаться секвестрацией, но установившиеся транскрипц. вилки могут проходить через секвестрированную ДНК. Высказано предположение, что способность к инициации у мутантов seqA повышена из-за увеличение длительности экспрессии gidA и dnaA во время цикла деления и дефектной секвестрации на oriC. США, Dep. of Biol. Sci., Florida Inst. of Technol., Melbourne, FL 32901. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН GIDA

ГЕН DNAA

ТРАНСКРИПЦИЯ

ОБЛАСТЬ ORI

СЕКВЕСТРАЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ PC2

DNAC2(TS)


Доп.точки доступа:
Helmstetter, Charles E.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.10-04Б2.187

    Bogan, Joseph A.

    DNA sequestration and transcription in the oriC region of Escherichia coli [Text] / Joseph A. Bogan, Charles E. Helmstetter // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 5. - P889-896 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Секвестрация ДНК и транскрипция в области oriC Escherichia coli
Аннотация: У Escherichia coli транскрипция генов gidA и dnaA выключается вскоре после инициации репликации, а гена mioC еще до инициации. Изучена транскрипция этих генов у мутантов seqA и dam Escherichia coli PC2 dnaC2(ts), синхронизированных по инициации репликации. В клетках seqA{-} или dam{-} гены gidA и dnaA продолжают транскрибироваться после инициации, но ингибирование транскрипции mioC перед инициацией не изменилось. После инициации транскрипты mioC, проходящие через oriC, исчезают более медленно в клетках seqA{+} dam{+}, чем в клетках seqA{-} или dam{-}, но до освобождения oriC от секвестрации. Вероятно, инициация транскрипции на промоторе может полностью предотвращаться секвестрацией, но установившиеся транскрипц. вилки могут проходить через секвестрированную ДНК. Высказано предположение, что способность к инициации у мутантов seqA повышена из-за увеличение длительности экспрессии gidA и dnaA во время цикла деления и дефектной секвестрации на oriC. США, Dep. of Biol. Sci., Florida Inst. of Technol., Melbourne, FL 32901. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН GIDA

ГЕН DNAA

ТРАНСКРИПЦИЯ

ОБЛАСТЬ ORI

СЕКВЕСТРАЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ PC2

DNAC2(TS)


Доп.точки доступа:
Helmstetter, Charles E.


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 06.10-04Б4.107

    Bordenstein, Seth.

    Discovery of a novel Wolbachia supergroup in isoptera [Text] / Seth Bordenstein, Rebeca B. Rosengaus // Curr. Microbiol. - 2005. - Vol. 51, N 6. - P393-398 . - ISSN 0343-8651
Перевод заглавия: Открытие новой супергруппы Wolbachia в Isoptera
Аннотация: Из термитов видов Zootermopsis angusticollis и Z. nevadensis выделены представители рода Wolbachia, которые образуют новую супергруппу H. Это заключение основывается на анализе последовательности новых генов, локализованных во фрагменте 3,5 т. п. н., а также генов 16S рРНК, dnaA, gtlA, groEL и ftsZ. Показаны четкие различия между супергруппой H и ранее описанной супергруппой F, инфицирующих другие виды термитов. Отмечается эффективность и полезность использования мультилокусного анализа для разделения супергрупп внутри Molbachia. США, Marine Boil. Lab., The Josephine Bay Paul Centr Comparative Mol. Biol. & Evolution, Woods Holl, MA 02543
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.19.99
Рубрики: ТАКСОНОМИЯ
ГЕНОМИКА

ГЕНЫ

ГЕНЫ

РРНК 16S

DNAA

GTLA

GROEL

FTSZ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

WOLBACHIA (BACT.)

СУПЕРГРУППА Н


Доп.точки доступа:
Rosengaus, Rebeca B.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.12-04Б2.400

    Boye, E.

    Bacterial growth control studied by flow cytometry [Text] / E. Boye, A. Lobner-Olesen // Res. Microbiol. - 1991. - Vol. 142, N 2-3. - P131-135 . - ISSN 0923-2508
Перевод заглавия: Изучение размножения бактерий при помощи проточной цитофотометрии
Аннотация: Изучалась репликация ДНК в клетках Escherichia coli методом проточной цитофотометрии. Известно что цитофотометрия позволяет определять, содержание ДНК в отдельных клетках. При этом кол-во ДНК может быть установлено быстро и с высокой точностью. Обнаружено, что у нек-рых шт. Escherichia coli, мутантных по репликации, число участков начала репликации отлично от 2{n}, а инициация начала репликации у них происходит не одновременно во всех участках ORI. Обсуждается возможность применения метода проточной цитофотометрии в научных исследованиях и производстве. Библ. 13. Дания, Dep. of Biophysics, Inst. of Cancer Res., Montebello, 0310 Oslo 3.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ АВ1157

РЕПЛИКАЦИЯ

ХРОМОСОМА

МЕХАНИЗМ

МУТАНТЫ

МУТАНТЫ ПО РЕПЛИКАЦИИ DNAA46

ПОЛУЧЕНИЕ

ХАРАКТЕРИСТИКА

МЕТОДЫ

ПРОТОЧНАЯ ЦИТОФОТОМЕТРИЯ

ПРИМЕНЕНИЕ


Доп.точки доступа:
Lobner-Olesen, A.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.12-04Б2.152

    Boye, Erik.

    Defective initiation in an Escherichia coli dnaA(Cs, Sx) mutant [Text] / Erik Boye, Alexandra Blinkova, James R. Walker // Biochimie. - 2001. - Vol. 83, N 1. - P25-32 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Дефектная инициация в Escherichia coli dnaA (Cs, Cx) мутантах
Аннотация: Мутации в Escherichia coli в гене инициации для ДНК репликации dnaA, которые супрессируют дефект полимеризации и ростовое ингибирование, вызываемые температурочувствительными мутациями в гене полимеризации dnaX, называются Cs, Sx. Показали, что имеются мутации, которые также вызывают дефекты в инициации (включая ингибирование в инициации) как при низких (ниже 20'ГРАДУС'C) так и высоких температурах, а также вызывают дефекты асинхронной инициации, как при пермиссивной (34'ГРАДУС'C) так и супрессивной температуре (39'ГРАДУС'C). Эти данные позволяют предположить определенное отношение между частично дефектной инициацией и супрессией дефекта полимеризации при 39'ГРАДУС'C. Норвегия, Dep. of Cell Biol., Inst. for Cancer Res., Montenbello 0310 Oslo, Norway. Библ. 61
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: МУТАНТЫ
МУТАНТЫ ПО ГЕНУ DNAA РЕПЛИКАЦИИ ДНК

ХАРАКТЕРИСТИКА

РЕПЛИКАЦИЯ

ИНИЦИАЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Blinkova, Alexandra; Walker, James R.


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.258

    Bramhill, David.

    A model for initiation at origins of DNA replication [Text] / David Bramhill, Arthur Kornberg // Cell. - 1988. - Vol. 25, N 7. - P915-918 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Модель инициации в участках начала репликации
Аннотация: Предложена модель инициации репликации хромосомы Escherichia coli в локусе oriC, постулирующая, что белок DnaA имеет 3 главных функции: он прочно связывается с 9-членными повторами (dnaA-боксами) с образованием инициационного комплекса; он эффективно расплавляет 3 АТ-богатых 13-членных повтора с образованием открытых комплексов и, наконец, он направляет DNaB-DnaC-комплекс в этот расплавленный район с образованием презатравочного комплекса. Последний развинчивает ДНК-матрицу, обеспечивая возможность осуществления двунаправленной репликации. Рассмотрены возможные инициационные события не только в локусе oriC хромосомы Е. соli, но и в других участках начала репликации, включая хромосому B. subtilis, плазмиды pSC101, F, P1, R1, R6К, Р4, RК2, СolЕ1, а также лямбдоидные фаги. Предполагается, что у эукариот роль АТ-богатых последовательностей в открывании дуплекса в точке ori сходна с тем, что имеет место для ДНК вируса SV40. В последнем случае локус ori прочно связывается с Т-антигеном, являющимся белком-инициатором, кодируемым самим вирусом, и служащим одновременно хеликазой, а также раскручивающим дуплекс ДНК в ori. Рассмотрена также роль регуляторных факторов, таких как АТР, белок DnaC, транскрипционная активация ori и прикрепление белка DnaA к мембране. Сделан вывод, что многие прокариотические ori напоминают локус oriC E. coli наличием необходимых АТ-богатых последовательностей, локализованных в виде тандемных повторов. Роль этих повторов, вероятно, состоит в первоначальном открывании ДНК-дуплекса белком-инициатором. Регуляторное действие белков типа DnaA E. coli состоит в активации транскрипции ori, связывании нуклеотидов, прикреплении к мембране и формировании репликативной вилки. Ил. 2. США, Stanford Univ. School of Medicine Stanford, CA 94305.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИИ

МОДЕЛЬ

УЧАСТКИ НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

БЕЛОК DNAA

ФУНКЦИИ


Доп.точки доступа:
Kornberg, Arthur


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.10-04Б2.432

    Bramhill, David.

    DNA polymerase activities and A dnaA gene in Rhizobium meliloti [Text] / David Bramhill, Silaron Long // J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13D. - P118 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: ДНК-полимеразные активности и ген dnaA у Rhizobium meliloti
Аннотация: Грамотрицательный бактерии Rhizobium meliloti необычны тем, что содержат 3 репликона хромосомного типа. Поэтому она может служить модельной системой для изучения координированной регуляции инициации репликации хромосомы с локусов ori. Выявлено, что в экстрактах этих бактерий присутствует 2 различные ДНК-полимеразные активности. Процессирующаяся полимераза, способная эффективно реплицировать затравочную ДНК вируса М13, преципитируется низкой конц-ией сульфата аммония (0,2 г/мл). Этот фермент напоминает холофермент ДНК-полимеразы III E. coli по способности стимулироваться белком SSB и чувствительности к разведению и полимеразной активности. Сульфат аммония в конц-ии выше 0,26 г/мл преципитирует другую полимеразу, к-рая наиболее активна в отношении дуплексных ДНК-субстратов, содержащих множество "ник-разрывов" и брешей. Эта последняя активность не стимулируется SSB и не чувствительна к разведению. Клонирован также ген R. meliloti подобный гену dnaA E. coli. Выявлено, что последовательности генов dnaA E. coli, P. putida и B. subtilis содержат консервативные районы. Участок консервативного района длиной 38 п. н. использован в качестве ДНК-зонда для исследования предпочтительного использования кодонов у R. meliloti. Обнаружено, что этот зонд избирательно гибридизуется с последовательностью, присутствующей в ДНК R. meliloti, но не E. coli. 38-членный олигонуклеотид позволил выявить 3 независимых клона гена dnaA R. meliloti, несущих перекрывающиеся фрагменты ДНК. Эти фрагменты были субклонированы с целью их секвенирования и анализа кодируемых белков. США, Stanford Univ., Stanford, CA 94305.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: RHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)
РЕПЛИКАЦИЯ

ИНИЦИАЦИЯ РЕПЛИКАЦИЯ

УЧАСТОК ORI

КООРДИНИРОВАННАЯ РЕГУЛЯЦИЯ

ДНК-ПОЛИМЕРАЗА

ХОЛОФЕРМЕНТ

ФЕРМЕНТАТИВНАЯ АКТИВНОСТЬ

ГЕНЫ

ГЕН DNAA

КЛОНИРОВАНИЕ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Long, Silaron


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.202

    Brasch, Michael A.

    Integrative suppression of dnaA46 by broad host-range plasmid R1162 [Text] / Michael A. Brasch, Richard J. Meyer // Mol. and Gen. Genet. - 1988. - Vol. 215, N 1. - P139-145 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Интегративная супрессия dnaA46 плазмидой широкого спектра R1162
Аннотация: Обнаружено, что интеграция плазмиды R1162 широкого спектра хозяев, идентичной IncQ-плазмидам RSF1010 и R300В, в хромосому E. coli мутанта dnaA46 приводит к супрессии мутантного фенотипа. Однако для этого требуются 2 условия: 1) наряду с интегрированной копией плазмиды в цитоплазме мутанта должны присутствовать дополнительно автономные копии; 2) дефектный участок начала репликации плазмиды, также должен присутствовать в хромосоме. Предполагается, что этот неактивный участок начала репликации устанавливает скорость инициации репликации хромосомы на уровне, совместимом с выживаемостью клеток. Возможно, что это происходит за счет образования дополнительных сайтов связывания с белком, кодируемым R1162, ограничивающим скорость плазмидной репликации. Ил. 2. Табл. 5. Библ. 34. США, Univ. of Texas at Austin, Austin, TX 78712-1095.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ПЛАЗМИДА R1162
ШИРОКИЙ КРУГ ХОЗЯЕВ

ИНТЕГРАЦИЯ

ХРОМОСОМА

МУТАНТЫ

ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

МУТАНТ DNAA46

ИНТЕГРАТИВНАЯ СУПРЕССИЯ

ПЛАЗМИДЫ-БАКТЕРИИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ


Доп.точки доступа:
Meyer, Richard J.


 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)