Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ<.>)
Общее количество найденных документов : 54
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-54 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 95.09-04Б4.152

    Rohde, John R.

    Thermoregulation in Yersinia enterocolitica is coincident with changes in DNA supercoiling [Text] / John R. Rohde, James M. Fox, Scott A. Minnich // Mol. Microbiol. - 1994. - Vol. 12, N 2. - P187-199 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Терморегуляция у Yersinia enterocolitica совпадает с изменениями в суперспирализации ДНК
Аннотация: Yersinia enterocolitica - факультативный внутриклеточный паразит, переход ее от сапрофитной жизни в почве к обитанию в ретикулоэндотелиальной системе млекопитающих сопровождается кардинальной перестройкой метаболизма. На модели биосинтеза жгутиков изучена терморегуляция Y. enterocolitica. При 25'ГРАДУС'C добавление субингибирующих конц-ий новобиоцина приводило к неподвижности клеток, что хар-но для 37'ГРАДУС'C. В этих условиях также индуцируются гены вирулентности. Показано также, что термоиндуцированные изменения фенотипа совпадают с изменениями суперспирализации ДНК. Существуют предположительно ДНК-гиразные (новобиоцин-резистентные) мутанты, имеющие фенотип 37'ГРАДУС'C при культивировании при 25'ГРАДУС'C. Похоже, что топология ДНК влияет на терморегуляцию Y. enterocolitica. США [Minnich S. A.], Dep. of Bacteriol. and Biochem., Univ. of Idaho, Moscow, Idaho 83843. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.25
Рубрики: YERSINIA ENTEROCOLITICA (BACT.)
ДНК

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

ГЕНЫ

ТЕРМОРЕГУЛЯЦИЯ

ФАКТОРЫ


Доп.точки доступа:
Fox, James M.; Minnich, Scott A.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 95.10-04Б4.103

    Tobe, Toru.

    Deregulation of temperature-dependent transcription of the invasion regulatory gene, virB, in Shigella by rho mutation [Text] / Toru Tobe, Masanosuke Yoshikawa, Chihiro Sasakawa // Mol. Microbiol. - 1994. - Vol. 12, N 2. - P267-276 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Разрегулирование температурозависимой транскрипции регуляторного гена инвазии virB с помощью 'ро'-мутации у Shigella
Аннотация: У Shigella flexneri ген virB, транскрипционный регулятор генов инвазии, кодируемый большой плазмидой, является регулируемым температурой. Его транскрипция находится под контролем белков VirF и H-NS, а также зависит от суперспирализации ДНК. С помощью транспозонного мутагенеза получен мутант S. flexneri, имеющий инвазионный фенотип как при 37'ГРАДУС'С, так и при 30'ГРАДУС'С. Такая мутация локализована в гене 'ро'-фактора, она приводит к добавлению лишних 11 аминокислот к C-концу белка 'ро'. Действие этой мутации опосредовано промотором гена virB. Кроме того, у такого 'ро'-мутанта наблюдается меньшее влияние температуры на состояние суперспирализации ДНК. Рост мутанта на среде с новобиоцином демонстрировал снижение транскрипции гена virB при обеих температурах. Похоже, что 'ро'-фактор влияет на температурозависимые топологические изменения ДНК и таким образом участвует в терморегуляции транскрипции гена virB. Япония (Sasakawa C.), Dep. of Bacteriol. Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Minato-ku, Tokyo 108. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.99
Рубрики: SHIGELLA FLEXNERI (BACT.)
ГЕНЫ

ГЕН VIR B

ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ РЕГУЛЯТОР ГЕНОВ ИНВАЗИИ

ГЕН 'РО'-ФАКТОРА

ИНСЕРЦИОННАЯ МУТАЦИЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ ДНК

ТЕРМОРЕГУЛЯЦИЯ


Доп.точки доступа:
Yoshikawa, Masanosuke; Sasakawa, Chihiro

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.07-04Б4.59

    Dorman, Charles J.

    Flexible response: DNA supercoiling, transcription and bacterial adaptation to environmental stress [Text] / Charles J. Dorman // Trends Microbiol. - 1996. - Vol. 4, N 6. - P214-216 . - ISSN 0966-842X
Перевод заглавия: Гибкий ответ: суперспирализация ДНК, транскрипция и бактериальная адаптация к стрессам окружающей среды
Аннотация: Обзор. Обсуждается роль суперспирализации ДНК в индукции экспрессии оперона proU у Escherichia coli и Salmonella typhimurium при осмотич. стрессе. Ирландия, Dept. of Microbiol., Univ. of Dublin, Trinity College, Dublin 2. Библ. 15
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.02
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
ОСМОТИЧЕСКИЙ СТРЕСС

ДНК

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

ВЛИЯНИЕ НА

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 15


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.08-04Б1.170

   

    Contributions of supercoiling to Tn3 resolvase and phage Mu gin site-specific recombination [Text] / Kirsten R. Benjamin [et al.] // J. Mol. Biol. - 1996. - Vol. 256, N 1. - P50-65 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Вклад суперспирализации в сайт-специфическую рекомбинацию под действием резольвазы Tn3 и инвертазы Gin фага Mu
Аннотация: Чтобы оценить роль суперспирализации (СС) в рекомбинации под действием резольваз Tn3 (I) и 'гамма''дельта' (II) и инвертазы Gin (III) фага Mu, использованы субстраты, к-рые имеют нек-рые, но не все топологические признаки стандартных субстратов. Реакция I состоит из синаптических и постсинаптических этапов (СЭ и ПСЭ). Показано, что вклад СС в СЭ и ПСЭ различен, т. к. катенирования субстрата в отсутствие СС или при низком уровне СС достаточно для СЭ, но не для ПСЭ. С использованием структурного и функционального топологического анализа подтверждено, что синаптические комплексы I с катенанами, имеющими однонитевой разрыв, являются промежуточными продуктами рекомбинации. II имеет менее строгую потребность в СС и вызывает рекомбинацию катенанов с однонитевыми разрывами лишь вдвое менее эффективно, чем рекомбинацию стандартных субстратов. Рекомбинация катенанов под действием III происходит, даже если рекомбинационный энхансер находится на кольце с разрывом, но оба сайта кроссинговера расположены на сверхскрученном кольце. Т. обр., СС требуется в кроссоверных сайтах III, но не в энхансере. Полученные данные показали, что: 1) только конформационные эффекты СС требуются для СЭ в случае резольваз и функции энхансера III; 2) торсионный эффект (раскручивание двойной спирали ДНК) необходим для ПСЭ в случае I и в сайтах рекомбинации III. США, Dep. of Molecular and Cell Biol., Univ. of California, Berkeley, CA 94720-3204. Библ. 74
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.02
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU

ИНВЕРТАЗЫ

САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Benjamin, Kirsten R.; Abola, A.Pia; Kanaar, Roland; Cozzarelli, Nicholas R.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.325

    Lopez-Garcia, Purificacion.

    DNA topology in hyperthermophilic archaea: Reference states and their variation with growth phase, growth temperature, and temperature stresses [Text] / Purificacion Lopez-Garcia, Patrick Forterre // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 6. - P1267-1279 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Топология ДНК у гипертермофильного архея: реперные состояния и их вариация с фазой роста, температурой роста и температурным стрессом
Аннотация: Для изучения динамики топологии ДНК у археев проанализировано топологическое состояние нескольких плазмид, обнаруженных у Thermococcales и Sulfolobales. Все эти плазмиды in vitro находятся в релаксированном состоянии или имеют сильную позитивную суперспирализацию (ПСС), т. е. отличаются от имеющих негативную суперспирализацию (НСС) плазмид из мезофильных бактерий и археев. У этих 2 порядков археев порядок зацепления Lk плазмидных ДНК уменьшается, когда т-ра становится ниже оптим. для роста, т. е. плазмиды с ПСС релаксируют, а релаксированные плазмиды приобретают НСС. При т-ре выше оптим. Lk увеличивается у Sulfolobales и уменьшается у Thermococcus sp. GE31. У обоих порядков археев топологическая вариация плазмидных ДНК, выделенных из клеток в разных фазах роста, видоспецифично, но направление вариации в условиях т-рного стресса одинаково: тепловой шок коррелирует с увеличением ПСС, а холодовой шок вызывает НСС. Кинетика этих процессов изучена у Sulfolobales. Повышение т-ры (с 80 до 85'ГРАДУС') и ее понижение (с 80 до 65'ГРАДУС') вызывают преходящую сильную вариацию Lk, а затем суперспирализация ДНК постепенно достигает уровня, типичного для стационарного роста при конечной т-ре. Эти данные показали, что топология ДНК у гипертермочувствительных археев может изменяться в зависимости от физиологических состояний и модификаций окружающей среды. Франция, Inst. de Genetique et Microbiol., Univ. Paris-Sud, 91405 Orsay. Библ. 44
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ДНК
ТОПОЛОГИЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

ДИНАМИКА

СТАДИЯ РОСТА

ТЕМПЕРАТУРА РОСТА

ТЕМПЕРАТУРНЫЙ СТРЕСС

THERMOCOCCALES (BACT.)

SULFOLOBALES (BACT.)


Доп.точки доступа:
Forterre, Patrick

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.03-04Б2.277

    Tobe, Toru.

    Thermoregulation of virB transcription in Shigella flexneri by sensing of changes in local DNA superhelicity [Text] / Toru Tobe, Masanosuke Yoshikawa, Chihiro Sasakawa // J. Bacteriol. - 1995. - Vol. 177, N 4. - P1094-1097 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Терморегуляция транскрипции [гена] virB Shigella flexneri благодаря узнаванию изменений в локальной суперспирализации ДНК
Аннотация: Транскрипция гена virB, транскрипционного регулятора генов инвазивности, расположенного на большой плазмиде Shigella flexneri, строго регулируется температурой роста. Она активируется белком VirF, детерминированным этой же плазмидой, зависимо от состояния суперспирализованности ДНК. С помощью встраивания перед геном virB зависимого от РНК-полимеразы фага T7 промотора 'фи'10 в противоположной ориентации, создан домен, при активации транскрипции с этого промотора создающий сайт локальной негативной суперспирализации. Оказалось, что индукция промотора 'фи'10 даже при 30'ГРАДУС'C активировала транскрипцию гена virB, и уровни транскрипции с обоих генов коррелировали. Получ. рез-ты доказывают, что репрессия транскрипции гена virB при 30'ГРАДУС'C связана со снижением при этой температуре степени негативной суперспирализации в районе промотора. Япония, Dep. of Bacteriol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Minato-ku, Tokyo 108. Библ. 16
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: SHIGELLA FLEXNERI (BACT.)
ГЕНЫ

ГЕН VIRB

РЕГУЛЯТОР ГЕНОВ ИНВАЗИВНОСТИ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ТЕМПЕРАТУРОЗАВИСИМАЯ РЕГУЛЯЦИЯ

МЕХАНИЗМЫ

ДНК

ОТРИЦАТЕЛЬНАЯ СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

АКТИВАЦИЯ ПРОМОТОРОВ


Доп.точки доступа:
Yoshikawa, Masanosuke; Sasakawa, Chihiro

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.03-04Б2.289

   

    Genetic and topological analyses of the bop promoter of Halobacterium halobium: Stimulation by DNA supercoiling and non-B-DNA structure [Text] / Chin-Fen Yang [et al.] // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 3. - P840-845 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Генетический и топологический анализ промотора bop Halobacterium halobium: стимуляция суперспирализацией ДНК и не-В-структурой ДНК
Аннотация: Транскрипция гена bop бактериоопсина у Halobacterium halobium NRC-1 индуцируется в 20 раз в микроаэробных условиях и ингибируется новобиоцином (I) в концентрациях, субингибиторных для роста, но вызывающих частичную релаксацию суперспирализации (СС) плазмидной ДНК. Это показало, что СС ДНК необходима для транскрипции bop. Промоторная область bop, клонированная на плазмидном векторе H. halobium, более активна в гиперпродуцирующем bop штамме S9, чем в штамме NRC-1 дикого типа. Транскрипция с промотора bop на плазмиде ингибируется I так же, как и из хромосомы. При введении клонированного промотора в штамм S9 со вставками в регуляторных генах brp или bat транскрипция не наблюдается, так что продукты этих генов вызывают транс-активацию промотора bop. Делец, анализ промотора bop показал, что для транскрипции достаточно расположенного с 5'-стороны от стартового сайта транскрипции участка длиной 53 п. н., но не 28 п. н. С центром в положении -23 в промоторе bop имеется участок длиной 11 п. н., состоящий из чередующихся остатков пуринов и пиримидинов. Чувствительность этого участка к нуклеазе S1 и OsO[4] показала, что он имеет конформацию левозакрученной Z-ДНК. Вероятно, эта необычная не-В-структура ДНК участвует в стимулированной СС транскрипции гена bop. США, Dep. of Microbiol., Univ. of Massachusetts, Amherst, MA 01003. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН БАКТЕРИООПСИНА BOP

РЕГУЛЯЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ ДНК

ПРОМОТОРЫ

ПРОМОТОР BOP

АКТИВАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

HALOBACTERIUM HALOBIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Yang, Chin-Fen; Kim, Jong-Myoung; Molinari, Elizabeth; DasSarma, Shiladitya

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.06-04Б1.114

    Митин, Ю. А.

    Роль нарушений суперспиральной конформации ДНК лимфоцитов при ВИЧ-инфекции [Текст] : [Прогр.итез.] 5 Междунар. конф. "СПИД, рак и родств. пробл.", С-Петербург, 25-30 мая, 1997 / Ю. А. Митин, Н. Х. Дулатова, Е. И. Змушко // Рус. ж. "ВИЧ/СПИД и родств. пробл.". - 1997. - Т. 1, N 1. - С. 192
Аннотация: Проведено экспериментальное исследование степени суперспирализации ядерной ДНК у 32 инфицированных ВИЧ лиц, к-рую определяли эластовискозометрически, при титровании лизатов бромистым этидием. Обнаружено, что у ВИЧ-инфицированных наблюдаются изменения конформационного состояния суперспиральной ДНК. Смещение точки максимума относительной вязкости в сторону больших конц-ий интеркалятора свидетельствует о большей плотности суперспирализации ядерной ДНК иммунокомпетентных клеток ВИЧ-инфицированных лиц, по сравнению с контрольной группой. Такие изменения характерны для состояния сниженной активности генома, возникают при старении культур клеток, после облучения, в клетках людей преклонного возраста, затрагивая доменно-кластерный уровень организации хроматина
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: СПИД
БОЛЬНЫЕ

ЛИМФОЦИТЫ

ДНК ЯДЕРНАЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Дулатова, Н.Х.; Змушко, Е.И.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.155

    Mojica, Francisco J. M.

    In vivo supercoiling of plasmid and chromosomal DNA in an Escherichia coli hns mutant [Text] / Francisco J. M. Mojica, Christopher F. Higgins // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 11. - P3528-3533 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Суперспирализация in vivo плазмидной и хромосомной ДНК в мутанте hns Escherichia coli
Аннотация: Для измерения уровня локальной неограниченной суперспирализации ДНК in vivo использован триметилпсорален. Показано, что суперспирализация плазмидной и хромосомной ДНК изменена в мутанте hns независимо от транскрипции и изменений активности ДНК-топоизомеразы I. Это согласуется с участием гистоноподобного белка H-NS в организации хромосомы и экспрессии генов. Великобритания, Dep. Clinical Biochem., Inst. Molec. Med., Univ. Oxford, Oxford, OX3 9DS. Библ. 45
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ДНК
ПЛАЗМИДНАЯ

ХРОМОСОМНАЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

МУТАНТЫ

МУТАНТ HNS

БЕЛОК H-NS

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Higgins, Christopher F.

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.330

    Wang, Ziyuan.

    Long-range effects in a supercoiled DNA domain generated by transcription in vitro [Text] / Ziyuan Wang, Peter Droge // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 271, N 4. - P499-510 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Дальнодействующие эффекты в суперспирализованном домене ДНК, порожденные транскрипцией in vitro
Аннотация: Для изучения механизма динамич. суперспирализации (СС) ДНК использована система in vitro, в к-рой сайт-специфич. рекомбинация резольвазой 'гамма''дельта' (I) топологически сопряжена с индуцированной транскрипцией негативной СС (НСС). Кинетич. опыты показали, что рекомбинация сопряжена с процессом СС, вызванным транскрипцией. Высокая скорость, с к-рой 2 связанных с I сайта рекомбинации спариваются в синаптич. комплекс, использована в кинетич. опытах с субстратами ДНК, содержащими 3 таких сайта. Обнаружено существование временного градиента НСС. Он является следствием вращения двойной спирали ДНК позади транслоцирующейся РНК-полимеразы и возникает в области длиной до 2 т. п. н. с 5'-стороны от сайта инициации транскрипции. На топологич. сопряжение транскрипции и трансляции не влияет связывание изгибающего ДНК белка IHF с несколькими сайтами в области att фага 'лямбда'. ФРГ, Inst. of Genetics, Univ. of Cologne, D-50931 Koln. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
РЕЗОЛЬВАЗА ГАММА ДЕЛЬТА

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ДНК

НЕГАТИВНАЯ СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Droge, Peter

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.318

    Dove, Simon L.

    The site-specific recombination system regulating expression of the Type 1 fimbrial subunit gene of Escherichia coli is sensitive to changes in DNA supercoiling [Text] / Simon L. Dove, Charles J. Dorman // Mol. Microbiol. - 1994. - Vol. 14, N 5. - P975-988 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Система сайт-специфической рекомбинации, регулирующая экспрессию гена субъединицы фимбрий типа 1 Escherichia coli, чувствительна к изменению суперспирализации ДНК
Аннотация: Изучено влияние изменений уровня суперспирализации (СС) ДНК при фазовой вариации экспрессии гена fimA Escherichia coli. Транскрипция с промотора fimA не зависит от изменений СС, вызванных введением мутации topA::Tn10 в гене ДНК-топоизомеразы I (I) или ингибированием ДНК-гиразы (II) новобиоцином. Однако инактивация topA уменьшает скорость инверсии промоторного фрагмента fimA в направлениях ON '-' OFF и OFF '-' ON. Этот эффект коррелирует с отсутствием функциональной I, а не с глобальным уровнем СС ДНК. Ингибирование II способствует инверсии OFF '-' ON и слабо влияет на инверсию ON '-' OFF. Изменение экспрессии гена fimB рекомбиназы, катализирующей инверсию промоторного фрагмента fimA, не коррелирует с влиянием на фазовую вариацию fimA: транскрипция fimB ингибируется при утрате I и усиливается при ингибировании II, что коррелирует с глобальным уровнем СС ДНК in vivo. Предложена модель, объясняющая влияние утраты функции I. Великобритания, Molecular Genetics Lab., Dep. of Biochem., Univ. of Dundee, Dundee DD1 4HN. Библ. 55
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ФИМБРИИ
ФИМБРИИ ТИПА 1

СИНТЕЗ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕН СУБЪЕДИНИЦЫ ФИМБРИИ ТИПА 1 FIMA

РЕГУЛЯЦИЯ

СИСТЕМА САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКОЙ РЕКОМБИНАЦИИ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ ДНК

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Dorman, Charles J.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.166

   

    Triple-helix specific ligands stabilize H-DNA conformation [Text] / Guy Duval-Valentin [et al.] // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 247, N 5. - P847-858 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Специфические лиганды тройной спирали стабилизируют конформацию Н-ДНК
Аннотация: В условиях суперспирального напряжения олигопурин-олигопиримидиновые зеркальные повторы (ОЗП) принимают конформацию Н-ДНК, в к-рой существуют трехнитевые и однонитевые структуры. Внутримолекулярная тройная спираль сильно стабилизируется производным бензо[e]пиридоиндола (I). Элонгация ДНК in vitro под действием ДНК-полимераз фаза Т7, Escherichia coli и Taq необратимо ингибируется структурой Н-ДНК в присутствии I. О ОЗП, встроенный между геном 'бета'-лактамазы E. coli и его промотором bla, сильно ингибируют транскрипцию этого гена in vivo. В отсутствие суперспирализации переход в конформацию Н-ДНК не происходит, но I стабилизируют структуру Н-ДНК, вызванную суперспирализацией. Франция, Lab. de Biophys., Museum Nat. d'Histoire Naturelle, 75005 Paris. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ДНК
КОНФОРМАЦИЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

H-ДНК

ОБРАЗОВАНИЕ

СТАБИЛИЗАЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

СПЕЦИФИЧНЫЕ ЛИГАНДЫ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Duval-Valentin, Guy; de, Bizemont Therese; Takasugi, Masashi; Mergny, Jean-Louis; Bisagni, Emile; Helene, Claude

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.80

   

    Anaerobic/aerobic transitions in Escherichia coli: Effects on catabolism, HADH/NAD ratio, ATP/ADP ratio and DNA supercoiling [Text] / Graef Mark R. de [et al.] // Beijerinck Centenn. "Microb. Physiol. and Gene Regul.: Emerg. Princ. and Appl.", The Hague, 10-14 Dec., 1995. - Delft, 1995. - P171-172 . - ISBN 90-407-1213-1
Перевод заглавия: Перенос Escherichia coli в аэробные/анаэробные условия: влияние на катаболизм, соотношение НАДН/НАД, АТФ/АДФ и суперспирализацию ДНК
Аннотация: Исследовали регуляцию метаболизма E. coli при переносе из аэробных условий в анаэробные и обратно. При прекращении доступа O[2] клетки начинают сбраживать глюкозу, из этого следует, вероятно, что гены, кодирующие эту систему, уже были транскрибированы. Суперскрученность ДНК резко менялась. Отмечена корреляция между соотношением АТФ/АДФ и суперскрученностью ДНК. Это позволяет предположить, что изменение суперскрученности может быть еще одним из механизмов ответа микроорганизмов на стресс. Нидерланды, Dept Microbiol., EC Slater Inst., Biocentrum. Univ. of Amsterdam, 1018 WS Amsterdam. Библ. 3
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.19.09
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
АЭРОБИОЗ

АНАЭРОБИОЗ

КАТАБОЛИЗМ

ВЛИЯНИЕ

СТРЕСС

ДНК

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
de, Graef Mark R.; Snoep, Jacky L.; de, Mattos M.Joost Teixeira; Westerhoff, Hans V.; Neijssel, Oense M.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.08-04Б3.38

   

    Anaerobic/aerobic transitions in Escherichia coli: Effects on catabolism, HADH/NAD ratio, ATP/ADP ratio and DNA supercoiling [Text] / Graef Mark R. de [et al.] // Beijerinck Centenn. "Microb. Physiol. and Gene Regul.: Emerg. Princ. and Appl.", The Hague, 10-14 Dec., 1995. - Delft, 1995. - P171-172 . - ISBN 90-407-1213-1
Перевод заглавия: Перенос Escherichia coli в аэробные/анаэробные условия: влияние на катаболизм, соотношение НАДН/НАД, АТФ/АДФ и суперспирализацию ДНК
Аннотация: Исследовали регуляцию метаболизма E. coli при переносе из аэробных условий в анаэробные и обратно. При прекращении доступа O[2] клетки начинают сбраживать глюкозу, из этого следует, вероятно, что гены, кодирующие эту систему, уже были транскрибированы. Суперскрученность ДНК резко менялась. Отмечена корреляция между соотношением АТФ/АДФ и суперскрученностью ДНК. Это позволяет предположить, что изменение суперскрученности может быть еще одним из механизмов ответа микроорганизмов на стресс. Нидерланды, Dept Microbiol., EC Slater Inst., Biocentrum. Univ. of Amsterdam, 1018 WS Amsterdam. Библ. 3
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
АЭРОБИОЗ

АНАЭРОБИОЗ

КАТАБОЛИЗМ

ВЛИЯНИЕ

СТРЕСС

ДНК

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
de, Graef Mark R.; Snoep, Jacky L.; de, Mattos M.Joost Teixeira; Westerhoff, Hans V.; Neijssel, Oense M.

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 99.12-04Я6.308

    Weglarz, Ludmila.

    Changes in DNA supercoiling in fibroblasts cultured in the presence of hydralazine [Text] / Ludmila Weglarz, Aneta Koceva-Chyla // Biochimie. - 1998. - Vol. 80, N 7. - P627-630 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Изменения суперспирализации ДНК в фибробластах, культивируемых в присутствии гидралазина
Аннотация: Методами экстракции ядерного матрикса и седиментации в градиенте плотности сахарозы, содержащей бромид этидия, исследовали влияние гидралазина (Гл) на суперспиральность ДНК нуклеоида фибробластов 3T3 мыши. Показано, что нуклеоиды клеток, обработанных Гл, отличаются от нуклеоидов контрольных клеток по зависимости седиментации ДНК от конц-ии бромида этидия. Это свидетельствует о том, что Гл снижает степень суперспиральности ДНК. Нуклеоиды клеток, обработанных Гл, резистентны к переходу от релаксированного состояния к позитивной суперспирализации, к-рый вызывается высокими конц-иями бромида этидия. Польша, Dep. Thermobiol., Univ. Lodz, 90-237 Lodz. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.23.09
Рубрики: ДНК
СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

ГИДРАЛАЗИН

ВЛИЯНИЕ

ФИБРОБЛАСТЫ

МЫШИ


Доп.точки доступа:
Koceva-Chyla, Aneta

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.174

   

    The supercoiling sensitivity of a bacterial tRNA promoter parallels its responsiveness to stringent control [Text] / Nara Figueroa-Bossi [et al.] // EMBO Journal. - 1998. - Vol. 17, N 8. - P2359 -2367 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Чувствительность промотора бактериальной тРНК к суперспирализации коррелирует с его способностью отвечать на строгий контроль
Аннотация: У Salmonella typhimurium экспрессия оперона тРНК hisR уменьшается при ингибировании ДНК-гиразы. Зависимость активности промотора hisR от негативной суперспирализации (НСС) ДНК изучена in vivo и in vitro. Анализ мутантов показал, что детерминанты этой чувствительности расположены между блоком -10 и стартом транскрипции. Эта область богата парами Г*Ц. При замене пары Г*Ц в положении -7 на Т*А ответ на НСС уменьшается. Замена последовательности ЦЦЦЦЦГ между -5 и +1 на ГТТАА устраняет ответ на НСС in vivo и in vitro. Устранение зависимости от НСС коррелирует с увеличением чувствительности промотора к плавлению in vivo и с меньшей потребностью в инициирующих нуклеотидах для образования стабильных инициирующих комплексов in vitro. Изучение в голодающих по лейцину клетках показало, что такие изменения последовательности уменьшают или устраняют ответ промотора hisR на строгий контроль. Полученные данные позволили предположить, что чувствительность промотора hisR к НСС и строгому контролю обусловлена одним и тем же физич. св-вом - устойчивостью промотора к плавлению и что механизм строгого контроля мешает способности РНК-полимеразы вызывать плавление ДНК. Франция, Ctr. Genet. Mol., CNRS, 91198 Gif-sur-Yvette. Библ. 49
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР HISR

ЗАВИСИМОСТЬ АКТИВНОСТИ

НЕГАТИВНАЯ СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ

КОРРЕЛЯЦИЯ

УСТОЙЧИВОСТЬ К ПЛАВЛЕНИЮ

SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Figueroa-Bossi, Nara; Guerin, Martine; Rahmouni, Rachid; Leng, Marc; Bossi, Lionello

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.180

    Fang, Ming.

    A promoter relay mechanism for sequential gene activation [Text] / Ming Fang, Hai-Young Wu // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 3. - P626-633 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Механизм промоторного реле для последовательной активации генов
Аннотация: Описан новый механизм промоторного реле для последовательной активации генов, к-рые экспрессируются зависящим от положения образом. Промотор pilvIH у Salmonella typhimurium активирует криптич. промотор pleuO и pleu-500. Для активации pleu-500 необходима действующая в цис-положении активность pleuO и транс-действующий белок LeuO. Промотор pleuO можно заменить функционально на индуцибельный промотор ptac в активации pleu-500. Это позволило предположить, что механизм промоторного реле основан на суперспирализации ДНК, вызываемой транскрипцией. США, Dep. Pharmacol., Sch. Med., Wayne State Univ., Detroit, MI 48201. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
PLEUO

PLEU-500

АКТИВАЦИЯ

ПРОМОТОР PILVIH

ПРОМОТОРНОЕ РЕЛЕ

МЕХАНИЗМ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ ДНК

ТРАНСКРИПЦИЯ

SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Wu, Hai-Young

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.290

   

    Cell-free trascription at 95{0}: Thermostability of trascription components and DNA topology requirements of Pyrococcus transcription [Text] / Carina Hethke [et al.] // Genetics. - 1999. - Vol. 152, N 4. - P1325-1333 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Бесклеточная транскрипция при 95'ГРАДУС': термостабильность транскрипционных компонентов и требования транскрипции у Pyrococcus к топологии ДНК
Аннотация: С использованием бесклеточной системы транскрипции из Pyrococcus furiosus изучена термостабильность компонентов транскрипции. При инкубации при 100'ГРАДУС' фактор транскрипции aTBP не инактивируется в течение 1 час, а периоды полураспада для РНК-полимеразы, фактора транскрипции TFB и продукта транскрипции длиной 328 н. равны соотв. 23, 3 и 10 мин. Транскрипт РНК наиболее стабилен при pH 6 в присутствии 0,4 М глутамата K (I) и в присутствии Mg{2+}. Физиологич. конц-ии I стабилизируют белковые компоненты при 100'ГРАДУС', так что I является важным фактором, вносящим вклад в термостабильность осмолит бетаин (II) стабилизирует РНК и белки при конц-ии 1 М. При 95'ГРАДУС' активность синтеза РНК максимальна при 95'ГРАДУС' в присутствии 1 М II и 0,4 М I. Положительно суперспирализованная ДНК может транскрибироваться in vitro при 70 и 90'ГРАДУС'. Однако при любой т-ре предполагаемой матрицей является отрицательно суперспирализованная ДНК. Анализ транскриптов топоизомеров плазмиды с промотором глутаматдегидрогеназы и реакций транскрипции в присутствии обратной гиразы показал, что положительная суперспирализация ДНК ингибирует транскрипцию с этого промотора. Германия, Inst. Allgemeine Mikrobiol., Univ. Kiel, D-24118 Kiel. Библ. 35
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
БЕСКЛЕТОЧНАЯ СИСТЕМА

ТЕМПЕРАТУРА 95'ГРАДУС'

ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ КОМПОНЕНТЫ

ТЕРМОСТАБИЛЬНОСТЬ

ТОПОЛОГИЯ

ДНК

ПОЛОЖИТЕЛЬНАЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

ВЛИЯНИЕ НА

ТРАНСКРИПЦИЯ

ИНГИБИРОВАНИЕ

PYROCOCCUS FURIOSUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hethke, Carina; Bergerat, Agnes; Hausner, Winfried; Forterre, Patrick; Thomm, Michael

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.05-04Б2.179

    Chen, Dongrong.

    Transcription-induced hypersupercoiling of plasmid DNA [Text] / Dongrong Chen, David M. J. Lilley // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 285, N 2. - P443-448 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Индуцированная транскрипцией гиперсуперспирализация плазмидной ДНК
Аннотация: Сконструирован набор плазмид с функциональным геном tet устойчивости к тетрациклину, в к-рые встроены сильные промоторы, транскрибирующие очень короткие сегменты ДНК с образованием нетранслируемых транскриптов длиной 45, 60 или 75 н. Показано, что транскрипция с этих промоторов значительно увеличивает кол-во гиперсуперспирализованной ДНК. Высказано предположение, что повторяющееся открывание двойной спирали ДНК при инициации транскрипции вносит значительный вклад в индукцию высокого уровня суперспирализации. Великобритания, Dep. Biochem., Univ. Dundee, Dundee DD1 4HN. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ УСТОЙЧИВОСТИ К ТЕТРАЦИКЛИНУ TET

СИЛЬНЫЕ ПРОМОТОРЫ

ВСТРОЙКА

ТРАНСКРИПЦИЯ

ВЛИЯНИЕ НА

ДНК ПЛАЗМИДНАЯ

СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Lilley, David M.J.

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.06-04Б2.293

    Masse, Eric.

    R-loop-dependent hypernegative supercoiling in Escherichia coli topA mutants preferentially occurs at low temperatures and correllates with growth inhibition [Text] / Eric Masse, Marc Drolet // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 294, N 2. - P321-332 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Зависящая от R-петель гипернегативная суперспирализация в мутантах topA Escherichia coli преимущественно происходит при низкой температуре и коррелирует с ингибированием роста
Аннотация: Ранее было показано, что ингибиторные R-петли образуются во время транскрипции в нулевых по ДНК-топоизомеразе I (I) мутантах, когда вновь синтезируемая РНК отжигается с матричной нитью ДНК позади РНК-полимеразы. Установлено, что в отсутствие I для роста клеток существенна активность РНКазы Н (II). Это наблюдается, даже если рост мутанта topA компенсируется вторичными мутациями, понижающими глобальную суперспирализацию до нормального уровня. Зависящая от R-петель гипернегативная суперспирализация увеличивается с понижением т-ры и коррелирует с ингибированием роста нулевых мутантов topA. Гиперэкспрессия II при понижении т-ры до 21'ГРАДУС' становится вредной для роста клеток. Вероятно, различные мРНК секвестрируются в R-петлях и их разрушение под действием II нарушает синтез белка. Высказано предположение, что понижение скорости транскрипции при низкой т-ре способствует образованию R-петель. Предложена модель, объясняющая чувствительность нулевых мутантов topA к различным изменениям условий окружающей среды, часто сопровождается временным ингибированием трансляции. Канада, Dep. Microbiol. et Immunol., Univ. Montreal, Montreal, Quebec H3C 3J7. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ
ГИПЕРНЕГАТИВНАЯ

ЗАВИСЯЩАЯ ОТ R-ПЕТЕЛЬ

УВЕЛИЧЕНИЕ НИЗКАЯ ТЕМПЕРАТУРА

КОРРЕЛЯЦИЯ

ИНГИБИРОВАНИЕ РОСТА

МУТАНТЫ TOPA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Drolet, Marc

 1-20    21-40   41-54 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)