Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=DNAA<.>)
Общее количество найденных документов : 150
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 96.01-04Б4.302

    Sakakibara, Yoshimasa.

    Suppression of thermosensitive initiation of DNA replication in a dnaR mutant of Escherichia coli by a rifampin resistance mutation in the rpoB gene [Text] / Yoshimasa Sakakibara // J. Bacteriol. - 1995. - Vol. 177, N 3. - P733-737 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Супрессия термочувствительной инициации репликации ДНК у мутанта dnaR Escherichia coli в результате мутации устойчивости к рифампицину в гене rpoB
Аннотация: Автор исследовал спонтанные мутанты Escherichia coli, устойчивые к рифампицину (Rif{r}) в результате мутации гена rpoB, кодирующего 'бета'-субъединицу РНК-полимеразы. Эта мутация вызывала супрессию мутации dnaR в гене prs, кодирующем фосфорибозилпирофосфатсинтетазу. Показали, что мутация в dnaR связана с термочувствительностью инициации репликации ДНК. Супрессия дефекта dnaR зависит от функции dnaA, а proB - зависимая супрессия dnaA - дефекта связана с функцией dnaR. Супрессия дефекта dnaR определенными мутациями dnaA предполагает функциональное взаимодействие между продуктами dnaR и dnaA. Обсуждается возможность активации транскрипции oriC продуктами dnaR и dnaA. Япония, Dep. of Biochemistry and Cellular Biology, Nat. Inst. of Health, 1-23-1, Toyama, Shinjuku, Tokyo 162. Табл. 3. Ил. 4. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.25.07
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМЫ

АКТИВАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAR

ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)



2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.06-04Б4.90

    Walker, James R.

    Extragenic suppressors of a temperature-sensitive dnaX polymerization mutant of E. coli are located in the initiator gene dnaA but behave as a cis-acting site [Text] : [Pap.] Keystone Symp. Mol. and Cell. Biol.: "Bacterial Chromosomes, Santa Fe, N.M., Jan. 6-12, 1995 / James R. Walker, Edwin Gines-Candelaria, Alexandra Blinkova // J. Cell. Biochem. - 1995. - Suppl. 19a. - P120 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Внегенные супрессоры температурочувствительного по репликации мутанта dnaX E. coli расположены в инициаторном гене dnaA, но ведут себя как цис-действующий сайт
Аннотация: Внегенные супрессоры температурочувствительного дефекта по репликации ДНК у мутанта dnaX2016(Ts), одновременно вызывающие холодочувствительность, картированы в гене dnaA. На фоне dnaX{+} они сохраняют холодочувствительность и вызывают дефект по инициации репликации при 20'ГРАДУС'. Секвенирование показало, что одна мутация вызывает замену Ala[313] '-' Asp в белке DnaA, вторая замену Arg[432] '-' Leu и третья - замену Thr[435] '-' Lys. Нормальный фенотип доминирует над холодочувствительностью, независимо от того, где находится супрессор: в хромосоме или на плазмиде. Однако супрессия доминантна, если супрессорный аллель находится в хромосоме, и рецессивна, если он расположен на плазмиде. Если супрессор расположен на плазмиде, а в хромосоме содержится нулевой аллель dnaA, супрессия не наблюдается. Т. обр. супрессорный аллель должен быть интегрирован в хромосомный локус dnaA. США, Dep. Microbiol., Univ. Texas, Austin, TX 78712
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: МУТАНТЫ
МУТАНТ DNAX2016(TS)

ДЕФЕКТНЫЙ ПО РЕПЛИКАЦИИ

ВНЕГЕННЫЕ СУПРЕССОРЫ

ГЕНЫ

ГЕН DNAA

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Gines-Candelaria, Edwin; Blinkova, Alexandra


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.249

    Smith, R. W.P.

    Autoregulation of the Escherichia coli replication initiator protein, DnaA, is indirect [Text] / R. W.P. Smith, Sean McAteer, Millicent Masters // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 6. - P1303-1315 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Авторегуляция белка-инициатора репликации DnaA Escherichia coli является непрямой
Аннотация: Экспрессия гена dnaA авторегулируется: его транскрипция усиливается, когда белок DnaA (I) инактивирован и инициация репликации предотвращена, и ослабляется, если I присутствует в клетке в избытке. Однако инактивация I не обязательно ведет к усиленной продукции I, т. к. у ts-мутантов dnaA(Ts), интегративно супрессированных плазмидой R1, индуцированная т-рой дерепрессия не наблюдается. Рассмотрено и отвергнуто несколько объяснений подобного поведения. Высказано предположение, что завершение критической стадии в инициации может предотвратить дерепрессию dnaA: хотя I требуется для завершения этой стадии на oriC, мутантной I может быть достаточно для oriR1. Авторегуляция dnaA была приписана связыванию I с консенсусным сайтом в промоторной области гена dnaA. С использованием репортерских систем установлено, что этот сайт связывания I не нужен для авторегуляции. Найдено также, что замена хромосомного гена dnaA геном с мутированным сайтом связывания I не вызывает заметных фенотипических изменений: клетки с таким мутантным геном не уступают клеткам dnaA{+}. Великобритания, Inst. Cell and Molec. Biol., Univ. Edinburgh, Edinburgh, EH9 3JR. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК DNAA

ИНИЦИАТОР РЕПЛИКАЦИИ

НЕПРЯМАЯ АВТОРЕГУЛЯЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
McAteer, Sean; Masters, Millicent


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.267

   

    DnaA protein stimulates polA gene expression in Escherichia coli [Text] / Ariel Quinones [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 6. - P1193-1202 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Белок DnaA стимулирует экспрессию гена polA у Escherichia coli
Аннотация: В расширенной промоторной области гена polA ДНК-полимеразы I E. coli имеются 2 предполагаемых сайта связывания белка-инициатора репликации DnaA (I). Изучено влияние изменения уровня I на экспрессию polA. Найдено, что гиперпродукция I усиливает экспрессию polA в стационарной фазе роста. Эта стимуляция не зависит от гена rpoS, кодирующего 'сигма'{S}-фактор для генов, индуцируемых в стационарной фазе, но модулируется ppGpp. С использованием нуклеазы S1 показано, что индукция polA связана со стимуляцией транскрипции. Футпрининг обнаружил связывание I только с блоком DnaA, ближайшим к промотору. Предполагают, что I играет дополнительную роль активатора транскрипции, по крайней мере, в нек-рых условиях. Германия, Inst. fur Genetik, Martin-Luther-Univ., D-06181 Halle. Библ. 55
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН POLA

ТРАНСКРИПЦИЯ

СТИМУЛЯЦИЯ

БЕЛОК DNAA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Quinones, Ariel; Wandt, Gudrun; Kleinstauber, Sabine; Messer, Walter


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.02-04Б1.197

   

    Allele specificity of the Escherichia coli dnaA gene function in the replication of plasmids derived from phage 'лямбда' [Text] / Grzegorz Wegrzyn [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1996. - Vol. 252, N 5. - P580-586 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Аллель-специфичность функции гена dnaA Escherichia coli в репликации плазмид, происходящих от фага 'лямбда'
Аннотация: Описана вариация влияния 7 аллелей гена dnaA, вызывающих температурочувствительность инициации хромосомы, на репликацию происходящих от фага 'лямбда' плазмид при 30'ГРАДУС'. Аллель-специфичность мутаций dnaA не проявляется в отношении репликации 2 изученных плазмид 'лямбда''пи'. С другой стороны, неспособность плазмиды 'лямбда'P{+} реплицироваться при 30'ГРАДУС' в мутантах dnaA508, dnaA46, dnaA204 и dnaB (groPA15) и в клетках, температурочувствительных по генам шаперонов (dnaK756, dnaJ259 и grpE280), супрессируется одной мутацией 'пи'. Это позволяет предположить, что: 1) за супрессию ответственно общее свойство белка 'пи' - более слабое взаимодействие с геликазой DnaB (I); 2) регулируемая DnaA активация транскрипции ori'лямбда' действует на стадии, в к-рой кооперируются продукты всех указанных генов; т. е. во время сборки препраймосомы и опосредованного шаперонами освобождения I от ингибирования белком 'лямбда'P. Польша, Dep. of Molecular Biol., Univ. of Gdansk, Gdansk, PL-80822. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПРОИЗВОДНЫЕ

ФАГ ЛЯМБДА

РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Wegrzyn, Grzegorz; Wegrzyn, Alicja; Pankiewicz, Areta; Taylor, Karol


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.148

    Bogan, Joseph A.

    DNA sequestration and transcription in the oriC region of Escherichia coli [Text] / Joseph A. Bogan, Charles E. Helmstetter // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 5. - P889-896 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Секвестрация ДНК и транскрипция в области oriC Escherichia coli
Аннотация: У Escherichia coli транскрипция генов gidA и dnaA выключается вскоре после инициации репликации, а гена mioC еще до инициации. Изучена транскрипция этих генов у мутантов seqA и dam Escherichia coli PC2 dnaC2(ts), синхронизированных по инициации репликации. В клетках seqA{-} или dam{-} гены gidA и dnaA продолжают транскрибироваться после инициации, но ингибирование транскрипции mioC перед инициацией не изменилось. После инициации транскрипты mioC, проходящие через oriC, исчезают более медленно в клетках seqA{+} dam{+}, чем в клетках seqA{-} или dam{-}, но до освобождения oriC от секвестрации. Вероятно, инициация транскрипции на промоторе может полностью предотвращаться секвестрацией, но установившиеся транскрипц. вилки могут проходить через секвестрированную ДНК. Высказано предположение, что способность к инициации у мутантов seqA повышена из-за увеличение длительности экспрессии gidA и dnaA во время цикла деления и дефектной секвестрации на oriC. США, Dep. of Biol. Sci., Florida Inst. of Technol., Melbourne, FL 32901. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН GIDA

ГЕН DNAA

ТРАНСКРИПЦИЯ

ОБЛАСТЬ ORI

СЕКВЕСТРАЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ PC2

DNAC2(TS)


Доп.точки доступа:
Helmstetter, Charles E.


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.07-04Б2.353

   

    Coordinating DNA replication initiation with cell growth: Differential roles for DnaA and SeqA proteins [Text] / Erik Boye [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1996. - Vol. 93, N 22. - P12206-12211 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Координация репликации ДНК с ростом клеток: дифференциальная роль белков DnaA и SeqA
Аннотация: Разработан новый подход к анализу контроля репликации ДНК у Escherichia coli. Клетки выращивали при низкой скорости роста, когда и клеточный цикл похож на эукариотический. Методом проточной цитометрии таких культур определена зависимость времени инициации репликации от массы клетки. Показано, что инициация строго сопряжена с физиологией клетки: распределение масс индивидуальных клеток дикого типа в момент инициации является очень узким (коэф. вариации менее 9%). У мутанта seqA масса клетки в момент деления понижена на 10-20% по сравнению с диким типом. Это прямо доказывает, что белок SeqA является негативным регулятором инициации репликации. Напротив, у мутантов dnaA(Ts) масса клетки в момент инициации повышена и вариабельность массы в момент инициации гораздо больше, чем у дикого типа. В отличие от клеток дикого типа и мутантов dnaA(Ts), у мутанта seqA часто наблюдаются 2 события инициации за цикл клеточного деления и все области начала репликации в одной клетке не инициируются синхронно. Норвегия, Dep. of Biophys., Inst. for Cancer Research, 0310 Oslo. Библ. 35
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК

DNAA

SEGA

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Boye, Erik; Stokke, Trond; Kleckner, Nancy; Skarstad, Kirsten


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.08-04Б2.273

    Messer, Walter.

    DnaA initiator - also a transcription factor [Text] / Walter Messer, Christoph Weigel // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 24, N 1. - P1-6 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Инициатор DnaA является также транскрипционным фактором
Аннотация: Белок DnaA является основным белком в инициации репликации ДНК у бактерий. Он связывается с асимметричным консенсусом из 9 п. н. В oriC Escherichia coli DnaA-бокс повторяется 5 раз. Взаимодействие DnaA с этими последовательностями приводит к локальному расплетанию ДНК, обеспечивая подсоединение геликаз и последующее формирование репликационной вилки. Однако, помимо своей основной функции - инициации репликации, DnaA является так же фактором транскрипции. Он репрессирует транскрипцию нескольких генов. DnaA-боксы располагаются перед промоторами или в пределах промоторов таких генов. Это, например, ген mioC, локализующийся рядом с oriC и от транскрипции к-рого зависит количество мини-хромосом. DnaA подавляет так же собственную транскрипцию. Нек-рые гены активируются DnaA. В этом случае, два DnaA-бокса присутствуют перед транскрипционным стартом между -20 и -70 нуклеотидами. Механизм активации неизвестен, но предполагается, что DnaA взаимодействует с РНК-полимеразой. Для нек-рых генов комплекс DnaA-ДНК может терминировать транскрипцию. В целом, список генов, регулируемых DnaA, включает гены, связанные с репликацией и с поддержанием внутренней среды. Германия, Max-Planck-Inst. Mol. Gen., Ihnestr. 73, D-14195 Berlin (Dahlem). Библ. 68
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БЕЛОК
DNAA

ФУНКЦИИ

ФАКТОР РЕПЛИКАЦИИ

ФАКТОР ТРАНСКРИПЦИИ

МЕХАНИЗМЫ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Weigel, Christoph


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.10-04Б2.187

    Bogan, Joseph A.

    DNA sequestration and transcription in the oriC region of Escherichia coli [Text] / Joseph A. Bogan, Charles E. Helmstetter // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 26, N 5. - P889-896 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Секвестрация ДНК и транскрипция в области oriC Escherichia coli
Аннотация: У Escherichia coli транскрипция генов gidA и dnaA выключается вскоре после инициации репликации, а гена mioC еще до инициации. Изучена транскрипция этих генов у мутантов seqA и dam Escherichia coli PC2 dnaC2(ts), синхронизированных по инициации репликации. В клетках seqA{-} или dam{-} гены gidA и dnaA продолжают транскрибироваться после инициации, но ингибирование транскрипции mioC перед инициацией не изменилось. После инициации транскрипты mioC, проходящие через oriC, исчезают более медленно в клетках seqA{+} dam{+}, чем в клетках seqA{-} или dam{-}, но до освобождения oriC от секвестрации. Вероятно, инициация транскрипции на промоторе может полностью предотвращаться секвестрацией, но установившиеся транскрипц. вилки могут проходить через секвестрированную ДНК. Высказано предположение, что способность к инициации у мутантов seqA повышена из-за увеличение длительности экспрессии gidA и dnaA во время цикла деления и дефектной секвестрации на oriC. США, Dep. of Biol. Sci., Florida Inst. of Technol., Melbourne, FL 32901. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН GIDA

ГЕН DNAA

ТРАНСКРИПЦИЯ

ОБЛАСТЬ ORI

СЕКВЕСТРАЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ PC2

DNAC2(TS)


Доп.точки доступа:
Helmstetter, Charles E.


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.189

   

    Negative control of DNA replication by hydrolysis of ATP bound DnaA protein, the initiator of chromosomal DNA replication in Escherichia coli [Text] / Tohru Mizushima [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 12. - P3724-3730 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Негативный контроль репликации ДНК гидролизом АТФ, связанного с белком DnaA - инициатором репликации хромосомной ДНК у Escherichia coli
Аннотация: АТФ, связанный с белком DnaA (I) Escherichia coli, медленно гидролизуется, но физиологич. роль гидролиза была неясна. Методом сайт-направленного мутагенеза сконструирован мутант I с заменой глу[204]'-'глн (IA), у к-рого АТФ-азная активность понижена в 3 раза. Мутация не повлияла на сродство к АТФ или АДФ. Мутантный ген dnaA летален в клетках дикого типа, но не в клетках, рост к-рых не зависит от функции oriC. Введение IA в клетки дикого типа вызывает гиперинициацию репликации ДНК. Высказано предположение, что характеристич. АТФ-азная активность I негативно регулирует репликацию хромосомной ДНК. Япония, Faculty of Pharmaceutical Sci., Kynshu Univ., Fukuoka 812-82. Библ. 32
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК

DNAA

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ГИДРОЛИЗ АТФ

МЕХАНИЗМ

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Mizushima, Tohru; Nishida, Satoshi; Kurokawa, Kenji; Katayama, Tsutomu; Miki, Takeyoshi; Sekimizu, Kazuhisa


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.191

   

    DnaA protein binding to individual DnaA boxes in the Escherichia coli replication origin, oriC [Text] / Christoph Weigel [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 21. - P6574-6583 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Связывание белка DnaA с индивидуальными боксами DnaA в ориджине репликации oriC Escherichia coli
Аннотация: В экспериментах in vitro изучено формирование нуклеопротеиновых комплексов между белком-инициатором репликации Dna (I) Escherichia coli и отдельными боксами DnaA в участке начала репликации oriC. I связывался с равной эффективностью с линейными и суперскрученными субстратами oriC, однако выявлено предпочтительное связывание I в пределах боксов RI, M, R2 и R3. В частности, более высокая конц-ия I была необходима для связывания DnaAc M. Показатели низкого сродства у этого сайта позволяют считать его еще одним кандидатом на роль регулятора бокса DnaA. Германия, Max-Planck-Institut fur molekulare Genetik, Ihnestrasse 73, D-14195 Berlin-Dahlem. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: БЕЛОК
DNAA БЕЛОК

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

БОКС DNAA

УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ ORIC

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Weigel, Christoph; Schmidt, Andrea; Ruckert, Beate; Lurz, Rudi; Messer, Walter


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.204

   

    Purification and characterization of the Streptomyces lividans initiator protein DnaA [Text] / Jerzy Majka [et al.] // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 7. - P2426-2432 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Очистка и характеристика белка-инициатора DnaA Streptomyces lividans
Аннотация: Белок DnaA (I) Streptomyces lividans имеет мол. м. 73 кД (на 15 кД больше, чем у I E. coli из-за вставки области из 120 преимущественно кислых остатков в домене II) и состоит из 4 доменов. I синтезирован в виде составного белка, меченного полигистидином. Очищенный I (pI 5,7) обладает слабой АТФазной активностью. I защищает в области oriC S. lividans 17 блоков DnaA (TTGTCCACA). Очищенные мутанты I с делецией C-концевого мотива спираль-поворот-спираль НТН или с заменами L577G в спирали А либо R595A в спирали B не взаимодействуют с блоками DnaA. Мутанты I с заменами R587A или R589A в петле мотива НТН также плохо взаимодействуют с блоками DnaA. Т. обр. C-концевой домен IV в I абсолютно необходим для связывания с блоком DnaA. Делеция домена II не влияет на связывание с ДНК. Польша, Inst. Immunol. Exp. Therapy, Polish Acad. Sci., 53-114 Wroclaw. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: ДНК
РЕПЛИКАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК-ИНИЦИАТОР DNAA

ОЧИСТКА

СВОЙСТВА

STREPTOMYCES LIVIDANS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Majka, Jerzy; Messer, Walter; Schrempf, Hildgund; Zakrzewska-Czerwinska, Jolanta


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.206

    Roth, Angelika.

    High-affinity binding sites for the initiator protein DnaA on the chromosome of Escherichia coli [Text] / Angelika Roth, Walter Messer // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 28, N 2. - P395-401 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Высокоаффинные сайты связывания для белка-инициатора DnaA в хромосоме Escherichia coli
Аннотация: Белок-инициатор DnaA (I) Escherichia coli связывается в хромосоме с очень высоким сродством не только с областью начала репликации oriC, но и еще с 5 другими областями. Методом связывания с ДНК в твердой фазе, в к-ром C-концевой домен связывания I с ДНК взаимодействует через биотин с магнитными бусинками, из продуктов расщепления хромосомы выловлены только эти 6 фрагментов ДНК. Все эти фрагменты, за исключением oriC, содержат только 1-2 блока DnaA - консенсусных сайта связывания I. Распределение этих сайтов в хромосоме является случайным. Германия, Max. Planck-Inst. fur molekulare Genetik, D-14195 Berlin-Dahlem. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК-ИНИЦИАТОР DNAA

ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

САЙТЫ СВЯЗЫВАНИЯ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Messer, Walter


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.266

   

    Conformational transition of DnaA protein by ATP: Structural analysis of DnaA protein, the initiator of Escherichia coli chromosome replication [Text] / Toshio Kubota [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1997. - Vol. 232, N 1. - P130-135 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Конформационный переход белка DnaA под действием АТФ: структурный анализ белка DnaA - инициатора репликации хромосомы Escherichia coli
Аннотация: Разработан новый эффективный метод очистки белка DnaA (I), повышающий в 6 раз выход I по сравнению с описанными ранее методами и позволяющий выделить более 22 мг I из 100 г клеток. Полученный препарат I имеет нормальное сродство к АДФ и активен в репликации in vitro плазмиды oriC. Процесс тепловой денатурации I, блокируемый АТФ, изучен методами характеристич. флуоресценции и кругового дихроизма. Показано, что I имеет высокое содержание 'альфа'-спиралей и что связывание АТФ вызывает изменение конформации I с уменьшением содержания 'альфа'-спиралей. Япония, Dep. of Microbiol., Kyushu Univ., Faculty of Pharmaceutical Sci., Fakuoka 812. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
ХРОМОСОМА

ИНИЦИАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

DNAA

КОНФОРМАЦИОННЫЙ ПЕРЕХОД

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Kubota, Toshio; Katayama, Tsutomu; Ito, Yuji; Mizushima, Tohru; Sekimizu, Kazuhisa


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.04-04Б2.160

    Sutton, Mark D.

    Novel alleles of the Escherichia coli dnaA gene [Text] / Mark D. Sutton, Jon M. Kaguni // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 271, N 5. - P693-703 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Новые аллели гена dnaA Escherichia coli
Аннотация: Белок DnaA Escherichia coli необходим для инициации репликации и участвует в связывании АТФ, расплетании цепей ДНК и специфич. связывании с ДНК в т. н. DnaA-боксах. Для идентификации функциональных доменов в белке DnaA разработана генетич. система, позволяющая отбирать мутации в гене dnaA. В фаг 'лямбда' введен сайт начала репликации плазмиды pSC101. Этот сайт, строго зависимый от белка DnaA, контролировал литич. цикл развития фага. Репликация с собственного сайта начала репликации фага 'лямбда' подавлялась репрессором cI. В реципиентный штамм, лизогенный по фагу 'лямбда' и полностью лишенный гена dnaA, вводили предварительно обработанную гидроксиламином плазмиду с геном dnaA. Полученные трансформанты инфицировали вышеописанным фагом 'лямбда' и отбирали выраставшие клоны. Из этих клонов выделяли плазмиду и секвенировали ген dnaA. Получена большая коллекция миссенс-, нонсенс- и делеционных мутаций. Из 50 миссенс-мутаций 28 представляли собой единичные замены. Они распределены по 3 районам, что указывает на 3 функциональных домена в белке DnaA. Мутации, попадающие в C-конец белка DnaA, приводили к его неспособности связываться с ДНК. США, [Kaguni J. M.], Dep. of Biochem. Michigan State Univ. East Lansing, MI 48824-1319. Библ. 76
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК DNAA

ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ДОМЕНЫ

МУТАЦИИ

ОТБОР

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ОТБОРА

КОНСТРУИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Kaguni, Jon M.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.200

    Miyata, Makoto.

    Asymmetrical progression of replication forks just after initiation on Mycoplasma capricolum chromosome revealed by two-dimensional gel electrophoresis [Text] / Makoto Miyata, Takashi Fukumura // Gene. - 1997. - Vol. 193, N 1. - P39-47 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Асимметричная прогрессия репликативных вилок после инициации на хромосоме Mycoplasma capricolum, обнаруживаемая двухмерным гель-электрофорезом
Аннотация: Сайт инициации репликации хромосомы Mycoplasma capricolum расположен вблизи гена dnaA. Посредством двухмерного гель-электрофореза идентифицировали сайт инициации репликации M. capricolum и наблюдали за процессом движения репликативных вилок. Самые короткие зарождающиеся нити обнаружили в области размером 875 п. н., состоящей из 3'-конца гена dnaA и ниже расположенной некодирующей последовательности. В последующем движении репликативных вилок от места инициации репликации осуществлялось асимметрично в обоих направлениях. Япония, Dep. of Biol., Fac. of Sci., Osaka City Univ., Sumiyoshi-ku, Osaka 558. Библ. 35
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: РЕПЛИКАЦИЯ
УЧАСТОК НАЧАЛА РЕПЛИКАЦИИ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

3'-КОНЕЦ ГЕНА DNAA

РЕПЛИКАТИВНЫЕ ВИЛКИ

АССИМЕТРИЧНОЕ ДВИЖЕНИЕ

MYCOPLASMA CAPRICOLUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Fukumura, Takashi


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.206

   

    Allele specificity of the Escherichia coli dnaA gene function in the replication of plasmids derived from phage 'лямбда' [Text] / Grzegorz Wegrzyn [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1996. - Vol. 252, N 5. - P580-586 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Аллель-специфичность функции гена dnaA Escherichia coli в репликации плазмид, происходящих от фага 'лямбда'
Аннотация: Описана вариация влияния 7 аллелей гена dnaA, вызывающих температурочувствительность инициации хромосомы, на репликацию происходящих от фага 'лямбда' плазмид при 30'ГРАДУС'. Аллель-специфичность мутаций dnaA не проявляется в отношении репликации 2 изученных плазмид 'лямбда''пи'. С другой стороны, неспособность плазмиды 'лямбда'P{+} реплицироваться при 30'ГРАДУС' в мутантах dnaA508, dnaA46, dnaA204 и dnaB (groPA15) и в клетках, температурочувствительных по генам шаперонов (dnaK756, dnaJ259 и grpE280), супрессируется одной мутацией 'пи'. Это позволяет предположить, что: 1) за супрессию ответственно общее свойство белка 'пи' - более слабое взаимодействие с геликазой DnaB (I); 2) регулируемая DnaA активация транскрипции ori'лямбда' действует на стадии, в к-рой кооперируются продукты всех указанных генов; т. е. во время сборки препраймосомы и опосредованного шаперонами освобождения I от ингибирования белком 'лямбда'P. Польша, Dep. of Molecular Biol., Univ. of Gdansk, Gdansk, PL-80822. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПРОИЗВОДНЫЕ

ФАГ ЛЯМБДА

РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕН РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Wegrzyn, Grzegorz; Wegrzyn, Alicja; Pankiewicz, Areta; Taylor, Karol


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.352

   

    DnaA-stimulated transcriptional activation of ori'лямбда': Escherichia coli RNA polymerase 'бета' subunit as a transcriptional activator contact site [Text] / Agnieszka Szalewska-Palasz [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 8. - P4241-4246 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Стимулируемая DnaA транскрипционная активация ori'лямбда': 'бета'-субъединица РНК-полимеразы Escherichia coli как контактный сайт для транскрипционного активатора
Аннотация: Стимуляция активности промотора p[R] белком DnaA (I) Escherichia coli необходима для репликации плазмид с областью начала репликации ori'лямбда' фага 'лямбда'. Найдено, что I активирует промотор p[R] in vitro. Определенные мутации в гене rpoB 'бета'-субъединицы (II) РНК-полимеразы E. coli способны супрессировать негативное влияние некоторых мутаций dnaA на репликацию плазмид с ori'лямбда'. Эта супрессия аллель-специфична. После изменения с помощью мутагенеза in vitro потенциального сайта связывания I, расположенного на расстоянии нескольких п.н. с 3'-стороны от промотора p[R], промотор перестает активироваться I in vivo и in vitro. Эти данные позволяют предположить, что I может контактировать с II во время активации промотора p[R]. Предложена новая классификация прокариотич. активаторов транскрипции. Польша, Dep. Mol. Biol., Univ. Gdansk, 80-822 Gdansk. Библ. 37
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
P[R]

АКТИВНОСТЬ

СТИМУЛЯЦИЯ

БЕЛОК DNAA

ПЛАЗМИДЫ

ORI'ЛЯМБДА'

РЕПЛИКАЦИЯ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

'БЕТА'-СУБЪЕДИНИЦА

КОНТАКТНЫЙ САЙТ

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

DNAA

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Szalewska-Palasz, Agnieszka; Wegrzyn, Alicia; Blaszczak, Adam; Taylor, Karol; Wegrzyn, Grzegorz


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.185

    Sutton, Mark D.

    The Escherichia coli dnaA gene: Four functional domains [Text] / Mark D. Sutton, Jon M. Kaguni // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 274, N 4. - P546-561 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Ген dnaA Escherichia coli: четыре функциональных домена
Аннотация: Выделены 28 новых миссенс-мутантов белка DnaA (I) Escherichia coli, неспособных поддерживать репликацию производного плазмиды pSC101, содержащегося в векторе фага 'лямбда'. Изучены эти мутанты, 7 новых миссенс-мутантов I и один мутант с сохраняющей рамку считывания делецией. Полученные данные показали, что I содержит 4 функциональных домена. Один из них (домен связывания АТФ) содержит остатки Р-петли или мотива А Уолкера. Второй домен, расположенный около C-конца I, участвует в связывании с ДНК. Функции 3-его домена на N-конце I неизвестны, но он может участвовать в димеризации I. Два аллеля, кодирующие разные укороченные формы I, поддерживают репликацию из области начала репликации pSC101, но не oriC. Они определяют 4-ый домен, к-рый является существенным для репликации бактериальной хромосомы из области oriC. США, Dep. Biochem., Michigan State Univ., East Lancing, MT 48824-1319. Библ. 88
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PSC101

РЕПЛИКАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕН БЕЛКА РЕПЛИКАЦИИ DNAA

ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ДОМЕНЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК РЕПЛИКАЦИИ DNAA

СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Kaguni, Jon M.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.114

   

    Organization around the dnaA gene of Streptococcus pneumoniae [Text] / Anne-Marie Gasc [et al.] // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 2. - P433-439 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Организация области вокруг гена dnaA из Streptococcus pneumoniae
Аннотация: Авт. клонировали и секвенировали область вокруг гена dnaA Streptococcus pneumoniae, патогена с большим количеством смертельных исходов. Идентифицированы ген тРНК, 7 открытых рамок считывания и три кластера DnaA-боксов. Порядок генов и межгенных областей следующий: тРНК{Arg}-orf1-кластер 3 боксов DnaA-htrA-spoOJ-кластер 2 боксов DnaA-dnaA-кластер 1 боксов DnaA-dnaN-orfX-orfY. Пять открытых рамок считывания гомологичны известным бактериальным генам. Ген тРНК{Arg} и orf1, обозначенная так же orfL, описаны ранее в пневмококках, где они предшествуют регуляторному локусу компетентности comCDE. В Escherichia coli ген htrA кодирует сериновую протеазу. В Bacillus subtilis ген spoOJ участвует в споруляции и разделении. Ген dnaA кодирует белок инициации репликации, к-рый очень консервативен в нескольких бактериях. Ген dnaN кодирует бета-субъединицу РНК-полимеразы III в E. coli. Функция orfX неизвестна. N-концевая часть возможного белкового продукта, кодируемого orfY, имеет высокую гомологию с ГТФ-связывающим белком. Кластеры DnaA-боксов, располагающиеся до и после гена dnaA, свидетельствуют о том, что хромосомный ориджин находится в этой области. Ориджин репикации S. pneumoniae локализован на физической карте этой бактерии. Франция, Lab. Microb. Genet. Mol. CNRS, Univ. Paul Sabatier, 118r. Narbonne, 31062 Toulorse Cedex. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ОБЛАСТЬ ВОКРУГ ГЕНА DNAA

ГЕН ТРНК

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

КЛАСТЕРЫ DNAA-БОКСОВ

КЛОНИРОВАНИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ОРГАНИЗАЦИЯ

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Gasc, Anne-Marie; Giammarinaro, Philippe; Richter, Stefan; Sicard, Michel


 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)