СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ФАГ MU<.>)

Общее количество найденных документов : 80
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.07-04Б1.49

Rice, Phoebe.
Formation of active complexes by MuA protein with short linear DNAs [Text] : [Pap.] Keystone Symp. Mol. and Cell Biol. "Transp. and Site-Spec. Recomb.: Mech. and Biol., Park City, Utah, Jan. 21-28, 1994 / Phoebe Rice, Harri Savilahti, Kiyoshi Mizuuchi // J. Cell. Biochem. - 1994. - Suppl. 18b. - P35 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Формирование активных комплексов белка MuA с короткими линейными ДНК
Аннотация: Белок MuA, катализирующий транспозицию фага Mu благодаря образованию разрывов на концах генома Mu, существует в активной форме в виде связанного с ДНК тетрамера. Для оценки необходимых условий образования ДНК-белкового комплекса (кроме известных - сверхспиральности матрицы, двухвалентных катионов, нек-рых хозяйских белков) использовали олигонуклеотиды с сайтами R1 и R2 связывания MuA. Устойчивый к конкурентной ДНК комплекс образуется и в отсутствии DMSO, однако в случае ДНК с разрывом он компетентен к переносу нити, а с разветвленной ДНК (как для т. наз. комплекса с переносом нити) комплекс катализирует удаление сегмента адресной нити ДНК. В последнем комплексе нить высвобождается в виде внутримолек. петли, а не соединения 2 половин непрерывной адресной нити. С синтезированными кристаллами фрагмента белка проводят кристаллографич. анализ структуры комплекса. США, NIDDK / NIH, Bethesda, MD 20892.

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
БЕЛОК
БЕЛОК MUA
ДНК
КОРОТКАЯ ЛИНЕЙНАЯ
КОМПЛЕКСЫ АКТИВНЫЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
MU GENOME
R1/R2 MU-BINDING SITES
STRAND TRANSFER REACTION

Доп.точки доступа:
Savilahti, Harri; Mizuuchi, Kiyoshi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.202

A novel illegitimate recombination event: Precise excision and reintegration with the Mu gem mutant prophage [Text] / P. Ghelardini [et al.] // Mol. Microbiol. - 1994. - Vol. 13, N 4. - P709-718 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Новое событие незаконной рекомбинации: точное вырезание и реинтеграция мутанта gem профага Mu
Аннотация: Мутанты malT, lac и thyA Escherichia coli, индуцированные вставкой мутантного профага Mu gem2ts в эти локусы, ревертируют с частотой 'ПРИБЛ='10{-6} к Mal{+}, Lac{+} или Thy{+} в рез-те точного вырезания профага. Это вырезание наблюдается в пермиссивных для развития фага условиях в полностью иммунных (c{+}) лизогенах и не зависит от клеточного белка RecA и фаговой транспоназы. Вырезание Mu gem2ts всегда сопровождается реинтеграцией профага в другие области хромосомы. В случае ревертантов Mal{+} профаг всегда реинтегрируется на 94-ой мин хромосомы E. coli. Т. обр. мутация gem2ts придает профагу Mu способность к точному вырезанию, отсутствующую у фага дикого типа. Италия, Centro di Studio per gli Acidi Nucleici del CNR, Rome. Библ. 44

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
МУТАНТЫ
РЕВЕРТИРОВАНИЕ
ПРОФАГ
ВЫРЕЗАНИЕ

Доп.точки доступа:
Ghelardini, P.; Liebart, J.C.; Di, Zenzo G.; Micheli, G.; D'Ari, R.; Paolozzi, L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.204

Regulation of bacteriophage Mu transposition [Text] / Ariane Toussaint [et al.] // Genetica. - 1994. - Vol. 93, N 1-3. - P27-39 . - ISSN 0016-6707
Перевод заглавия: Регуляция транспозиции бактериофага Mu
Аннотация: Обзор. Рассмотрены след. вопросы: 1) литич. цикл и лизогенное состояние фага Mu; 2) вырезание профага Mu и индукция его стрессом; 3) функции хозяина, влияющие на регуляцию фага Mu; 4) глобальная модель репрессии фага Mu. Бельгия, Lab. de Genetique, Univ. Libre de Bruxelles, B1640 Rhode St. Genese. Библ. 78

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСПОЗИЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 78

Доп.точки доступа:
Toussaint, Ariane; Gama, Marie-Jose; Laachouch, Jamal; Maenhaut-Michel, Genevieve; Mhammedi-Alaoui, Amina

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.04-04Б1.253

Functionally distinct RNA polymerase binding sites in the phage Mu mom promoter region [Text] / Virginia Balke [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1992. - Vol. 20, N 11. - P2777-2784 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Функционально различные сайты связывания РНК-полимеразы в промоторной области mom фага Mu
Аннотация: Транскрипция оперона com/mom фага Mu трансактивируется продуктом фагового гена с (I). Методом футпринт-анализа изучено влияние I на связывание РНК-полимеразы (II) E. coli с различными составными плазмидами com-lacZ. Картированы сайты, чувствительные к ДНК-азе I (III) или к KMnO[4] (IV) - расплетенные области в открытых комплексах II. В отсутствие I in vivo II связывается с промотором дикого типа в сайте Р2 между положениями -74 и -24, перекрывающимся с сильным сайтом связывания I (от -35 до -54). II, связанная с Р2, судя по присутствию гиперчувствительных к IV сайтов, находится в открытом комплексе. В присутствии I in vivo II связывается с сайтом Р1, расположенным с 3'-стороны от Р2 и частично перекрывающимся с Р2, и также образует открытый комплекс. Изучены 2 независящих от I мутантных промотора с нормальным положением стартового сайта транскрипции. У мутанта tin 7 с заменой T[-14]'-'Г II в отсутствие I связывается преимущественно с Р1, занимающим область от -56 до +21. В случае мутанта tin 6, у к-рого делеция удалила Р2, часть Р1 и сайт связывания I между -35 и -54, II связывается с Р1 независимо от I. Эти данные позволяют сделать следующие выводы: 1) Р1 является функциональным сайтом связывания II для инициации транскрипции in vivo; 2) I активирует транскрипцию, способствуя связыванию II с Р1 и блокируя связывание с Р2. США, Dep. of Biol., Univ. of Rochester, NY 14627. Библ. 39

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
МЕХАНИЗМЫ

Доп.точки доступа:
Balke, Virginia; Nagaraja, Valakunja; Gindlesperger, Tracy; Hattman, Stanley

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.09-04Б1.421

Binding of Mu repressor and JHF to the early operator region of bacteriophage Mu in vitro [Text] : [Abstr.] Keystone Symp. "Nucl. Acid-Protein Interact.", Tamarron, Colo, Febr. 13-20, 1994 / Robert J. Alazard [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1994. - Suppl. 18c. - P140 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Связывание репрессора Mu и IHF с ранним операторным районом бактериофага Mu
Аннотация: Показали, что хозяйский фактор интеграции (IHF) Escherichia coli стимулирует транскрипцию от Pe и Pc, двух дивергентных промоторов фага Mu, для сверхспиральной плазмидной ДНК in vivo и in vitro. Кроме того, IHF стабилизирует взаимодействие между репрессором (r) этого фага и сильными операторными сайтами O1 и O2. Установили последовательность связывания r с операторными сайтами O1 и O2. Обнаружили, что r представлен, в основном, в растворе в виде димеров и способствует длительным взаимодействиям, ведущим к образованию петлеобразных структур

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
СИНТЕЗ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РЕПРЕССОР
ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР ИНТЕГРАЦИИ
РАННИЙ ОПЕРАТОВ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Alazard, Robert J.; Rousseau, Philippe; Betermier, Mireille; Chandler, Michael

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.01-04Б1.239

Savilahti, Harri.
The phage Mu transpososome core: DNA requirements for assembly and function [Text] / Harri Savilahti, Phoebe A. Rice, Kiyoshi Mizuuchi // EMBO Journal. - 1995. - Vol. 14, N 19. - P4893-4903 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Сердцевина транспозосомы фага Mu: требования к ДНК для сборки и функции
Аннотация: Расщепление донорной ДНК и перенос нити при транспозиционной рекомбинации фага Mu происходят в транспозосомах (ТC) - ДНК-белковых комплексах высшего порядка, в сердцевине к-рых находится тетрамер транспоназы (I), связанный с 2 концами генома Mu. Хотя для сборки ТС обычно требуется несколько факторов, при определенных условиях достаточно I и короткого фрагмента ДНК. Изучены требования, предъявляемые к ДНК при сборке ТС, стабильность и активность образующихся комплексов. 2-валентные катионы, обычно необходимые для сборки ТС, можно исключить, если в субстрате предварительно образовались разрывы нитей, если фланговая ДНК очень коротка или если 2 фланкирующие нити комплементарны. Присутствие 1 нуклеотида за концом генома Mu в неразрезанной нити играет критич. роль в стабильности ТС. Для расщепления донорной ДНК дополнительно требуются по меньшей мере 2 нуклеотида в расщепляемой нити. В ТС фланкирующая двойная спираль ДНК дестабилизирована, что указывает на искажение структуры ДНК около активного центра I. Хотя для расщепления донорной ДНК необходим Mg{2+}, перенос нити может происходить и в присутствии Ca{2+}. Это позволяет предположить, что конформации активного центра I на 2 стадиях транспозиции неодинаковы. США, Lab. of Molecular Biol., Nat. Inst. of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 52

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСПОЗИЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ДНК-БЕЛКОВОЕ УЗНАВАНИЕ
ТРАНСПОЗОСОМА
ОБРАЗОВАНИЕ
СТРУКТУРА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Rice, Phoebe A.; Mizuuchi, Kiyoshi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.01-04Б1.243

Mizuuchi, Michiyo.
Assembly of phage Mu transponosomes: Cooperatives transitions assisted by protein and DNA scaffolds [Text] / Michiyo Mizuuchi, Tania A. Baker, Kiyoshi Mizuuchi // Cell. - 1995. - Vol. 83, N 3. - P375-385 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Сборка транспоносом фага Mu: кооперативные переходы, которым помогают строительные леса белка и ДНК
Аннотация: Транспозиция фага Mu происходит в ДНК-белковых комплексах - транспоносомах (ТС), к-рые содержат 2 геномных конца ДНК Mu, синаптированных тетрамером транспоназы MuA (I). Сборка ТС может идти по разным путям. Первый, ранее описанный путь зависит от энхансероподобного элемента - внутренней активирующей последовательности IAS, а второй - от комплекса белка MuB (II) с мишенной ДНК. На обоих путях сборки ТС необходимо взаимодействие всех 4 мономеров I в тетрамере с помогающим сборке элементов - IAS или II. Однако после сборки не все мономеры I в ТС требуются для взаимодействия с II и захвата связанной с II ДНК. Высказано предположение, что у фага Mu in vivo несколько уровней контроля используются для обеспечения эффективных раундов репликации ДНК и минимизации образования нежелательных продуктов транспозиции. США, Lab. of Molecular Biol., Nat. Inst. of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 48

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСПОЗИЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ТРАНСПОНОСОМЫ
СБОРКА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Baker, Tania A.; Mizuuchi, Kiyoshi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.01-04Б1.246

Kim, Keetae.
Mutational analysis of the att DNA-binding domain of phage Mu transposase [Text] / Keetae Kim, Rasika M. Harshey // Nucl. Acids Res. - 1995. - Vol. 23, N 19. - P3937-3943 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Мутационный анализ домена связывания att-ДНК в транспозазе фага Mu
Аннотация: Транспозаза (Тп), или белок A, фага Mu является ДНК-связывающим белком со специфическим сродством к двум семействам att-сайтов на концах Mu-ДНК и к внутренним энхансерным сайтам. В узнавании этих типов сайтов связывания участвуют отдельные субдомены N-концевого домена 1 в Тп. Методом делеционного и мутационного картирования идентифицирован участок из 135 аминок-т внутри домена 1'бета', к-рый необходим для связывания Тп с att-сайтами в Mu-ДНК. Этот сегмент Тп имеет структуру типа спираль-виток-спираль, типичную для многих ДНК-связывающих белков. Мутации в этой области либо полностью блокируют (К157Q), либо ослабляют (F131S и R146N) связывание Тп с att-ДНК и нарушают также транспозицию in vitro. Обсуждается роль субдоменов Тп в его att-связывающей активности и в дискриминации между множественными att-сайтами. США, Dep. Microbiol., Univ. Texas Austin, Austin, TX 78712. Библ. 37

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БЕЛОК A
ФАГ MU
ДОМЕН СВЯЗЫВАНИЯ
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Harshey, Rasika M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.08-04Б1.170

Contributions of supercoiling to Tn3 resolvase and phage Mu gin site-specific recombination [Text] / Kirsten R. Benjamin [et al.] // J. Mol. Biol. - 1996. - Vol. 256, N 1. - P50-65 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Вклад суперспирализации в сайт-специфическую рекомбинацию под действием резольвазы Tn3 и инвертазы Gin фага Mu
Аннотация: Чтобы оценить роль суперспирализации (СС) в рекомбинации под действием резольваз Tn3 (I) и 'гамма''дельта' (II) и инвертазы Gin (III) фага Mu, использованы субстраты, к-рые имеют нек-рые, но не все топологические признаки стандартных субстратов. Реакция I состоит из синаптических и постсинаптических этапов (СЭ и ПСЭ). Показано, что вклад СС в СЭ и ПСЭ различен, т. к. катенирования субстрата в отсутствие СС или при низком уровне СС достаточно для СЭ, но не для ПСЭ. С использованием структурного и функционального топологического анализа подтверждено, что синаптические комплексы I с катенанами, имеющими однонитевой разрыв, являются промежуточными продуктами рекомбинации. II имеет менее строгую потребность в СС и вызывает рекомбинацию катенанов с однонитевыми разрывами лишь вдвое менее эффективно, чем рекомбинацию стандартных субстратов. Рекомбинация катенанов под действием III происходит, даже если рекомбинационный энхансер находится на кольце с разрывом, но оба сайта кроссинговера расположены на сверхскрученном кольце. Т. обр., СС требуется в кроссоверных сайтах III, но не в энхансере. Полученные данные показали, что: 1) только конформационные эффекты СС требуются для СЭ в случае резольваз и функции энхансера III; 2) торсионный эффект (раскручивание двойной спирали ДНК) необходим для ПСЭ в случае I и в сайтах рекомбинации III. США, Dep. of Molecular and Cell Biol., Univ. of California, Berkeley, CA 94720-3204. Библ. 74

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.02
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ИНВЕРТАЗЫ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
СУПЕРСПИРАЛИЗАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Benjamin, Kirsten R.; Abola, A.Pia; Kanaar, Roland; Cozzarelli, Nicholas R.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.08-04Б1.172

C-terminal deletions can suppress temperature-sensitive mutations and change dominance in the phage Mu repressor [Text] / Jodi L. Vogel [et al.] // Genetics. - 1996. - Vol. 142, N 3. - P661-672 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: C-концевые делеции могут супрессировать температурочувствительные мутации и изменять доминантность у репрессора фага Mu
Аннотация: Мутации в N-концевом домене длиной ГО остатков белка-репрессора (I) фага Mu вызывают температурочувствительность способности I связываться с ДНК. Амбер-мутации могут условно корректировать этот дефект у 3 мутантных форм I с заменами D43G, R47Q и M28I (мутации cts25, cts62 и cts67 соотв.) и в соответствующем хозяине вызывать термостабильный фенотип Sts (от "выживаемость при температурных сдвигах"). Супрессорные мутанты sts термочувствительны в хозяевах supE или supF и термоустойчивы в хозяевах sup{o}. Мутанты с фенотипом Sts имеют мутации в одном из 3 кодонов: Q179, Q287 или Q190. Фенотип Sts связан с размером I: в хозяевах sup{o} I типа Sts короче соотв. на 7, 10 или 18 остатков по сравнению с I в хозяевах supE или supF. Укороченная форма I sts62-2, лишенная 18 остатков (Q179-V196) связывается с операторной ДНК фага Mu при 42'ГРАДУС' in vitro более стабильно, чем полноразмерный I cts62. C-конец I влияет не только на температурочувствительность: он контролирует чувствительность к протеолизу протеазой Clp in vivo, влияя на мультимерную структуру I. США, Dep. of Biochem., Univ. of Alabama, Birmingham, AL 35294. Библ. 49

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
БЕЛКИ-РЕПРЕССОРЫ
МУТАЦИИ
СУПРЕССИИ
C-КОНЦЕВЫЕ ДЕЛЕЦИИ

Доп.точки доступа:
Vogel, Jodi L.; Geuskens, Vincent; Desmet, Lucie; Higgins, N.Patrick; Toussaint, Ariane

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.01-04Б2.299

Different structures of selected and unselected araB-lacZ fusions [Text] / Genevieve Maenhaut-Michel [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 6. - P1133-1145 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Различные структуры селектированных и неселектированных слияний araB-lacZ
Аннотация: Опосредованное фагом Mu образование слияний кодирующих последовательностей araB-lacZ было первым примером адаптивной мутации у Escherichia coli. Секвенированы 84 независимых слияния araB-lacZ. Все они несут перестроенные линкерные последовательности MuR между доменами araB и lacZ. Это показывает, что они возникли из комплекса переноса нитей (КПН) - стандартного промежуточного продукта перестройки ДНК Mu. Однако 5 нестандартных слияний araB-lacZ, выделенных в условиях непрямой селекции, имеют новые структуры, содержащие инвертированные линкеры MuR в конфигурации "спина к спине". Т. к. разные процедуры выделения мутантов дают стандартные и нестандартные слияния, можно предположить, что клеточная физиология влияет на поздние стадии биохимического процесса, ведущего к слияниям araB-lacZ. Каждое такое слияние содержит 2 новых стыка ДНК. Стыки MuR-lacZ образуются в горячих точках в соответствии с правилами выбора мишени для транспозиции фага Mu. В образовании стыков araB-MuR и MuR-MuR участвуют обмены в коротких областях гомологии последовательностей. Более сильная гомология между MuR и araB указывает на потенциальную изомеризацию КПН в разрешаемую 4-стороннюю структуру, аналогичную холидеевскому стыку. Т. обр. образование слияний araB-lacZ является скорее многостадийным клеточным биологическим процессом, чем унитарной биохимической р-цией. Бельгия, Lab. Prokaryotic Genetics, Dep. Molec. Biol., Univ. Libre de Bruxelles, 1640 Rhode-St-Genese. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.17.03
Рубрики: МУТАЦИИ
АДАПТИВНЫЕ
СИСТЕМА АДАПТИВНЫХ СИТУАЦИЙ
СЛИЯНИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ARAB-LACZ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU

Доп.точки доступа:
Maenhaut-Michel, Genevieve; Blake, Catherine E.; Leach, David R.F.; Shapiro, James A.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.02-04Б1.66

The zinc coordination site of the bacteriophage Mu translational activator protein, Com [Text] / Robert T. Witkowski [et al.] // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 247, N 4. - P753-764 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Сайт координации цинка в белке-активаторе трансляции Com бактериофага Mu
Аннотация: Белок Com (I) фага Mu, активирующий трансляцию мРНК com, содержит 6 остатков Cys и 5 остатков His, потенциально способных образовывать несколько альтернативных мотивов цинкового пальца. Методом олигонуклеотилного сайт-направленного мутагенеза сконструированы замены каждого из этих остатков в отдельности (Cys'-'Ser и His'-'Asn или Gla) и изучена способность мутантов I функционировать in vivo. Показано, что замена любого из 4 N-концевых остатков Cys в положениях 6, 9, 26 и 29 приводит к утрате активности I. Для сворачивания I в функциональную третичную структуру необходим Com. Методом {1}H-ЯМР показано, что в присутствии ЭДТА I находится в конформации статистического клубка. Специфичность связывания ионов металлов и термостабильность I также изучены методом {1}H-ЯМР. Показано, что стехиометрия комплексов Zn{2+}-I равна 1:1 и что Zn{2+} находится в тетратиолатном лигандном окружении. Сравнение спектров ЯМР мутантов I с заменами C6S и C39S показало, что в координации Zn{2+} участвует Cys[6], но не Cys[39]. Предполагают, что координационный центр Zn{2+} в I состоит из остатков Cys в положениях 6, 9, 26 и 29. США, Dep. Chem., Univ. Rochester, Rochester, NY 14627. Библ. 47

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
БЕЛОК
БЕЛОК-АКТИВАТОР ТРАНСЛЯЦИИ COM
САЙТ КООРДИНАЦИИ ЦИНКА

Доп.точки доступа:
Witkowski, Robert T.; Hattman, Stanley; Newman, Laurel; Clark, Kimber; Tierney, David L.; Penner-Hahn, James; McLendon, George

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.139

Function of the C-terminal domain of the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase in basal expression and integration host factor-mediated activation of the early promoter of bacteriophage Mu [Text] / Ulsen Peter van [et al.] // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 2. - P530-537 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Функция C-концевого домена 'альфа'-субъединицы РНК-полимеразы Escherichia coli в базальной экспрессии и в опосредованной хозяйским фактором интеграции активации раннего промотора бактериофага Mu
Аннотация: В прямой активации раннего промотора P[e] фага Mu хозяйским фактором интеграции IHF (I) участвует C-концевой домен 'альфа'CTD 'альфа'-субъединицы РНК-полимеразы (II). Показано, что для экспрессии P[e] в присутствии I требуются те же остатки 'альфа'CTD, что и для взаимодействия с элементом UP промотора P1 оперона rrnB. 2 мутанта II с заменами 'альфа'R265A (IIA) и 'альфа'G296A (IIB), у к-рых наиболее сильно затронута транскрипция P[e] in vivo, изучены in vitro. IIA полностью дефектен по активации, опосредованной I, и имеет сильно пониженный уровень базальной экспрессии с P[e]. В случае IIB транскрипция с P[e] слегка понижена в отсутствие I, но способность активироваться I сохранилась. Эти данные показали, что взаимодействие с 'альфа'CTD участвует не только в опосредованной I активации транскрипции с P[e], но и в базальной транскрипции. Для базальной транскрипции с P[e] важна область от -39 до -51, к-рая, вероятно, связывает 'альфа'CTD. Нидерланды, Lab. of Molecular Genetics, Leiden Inst., of Chem., Garlaeus Labs., Leiden Univ., 2300 RA Leiden. Библ. 50

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
РАННИЕ
P[E]
ЭКСПРЕССИЯ
АКТИВАЦИЯ
IHF
БАЗАЛЬНАЯ ТРАНСКРИПЦИЯ
ДОМЕН 'АЛЬФА'CTD
C-КОНЦЕВОЙ 'АЛЬФА'-СУБЪЕДИНИЦА
РНК-ПОЛИМЕРАЗА
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU

Доп.точки доступа:
van, Ulsen Peter; Hillebrand, Marcel; Kainz, Mark; Collard, Romain; Zulianello, Laurence; van, de Putte Pieter; Gourse, Richard L.; Goosen, Nora

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.185

Wetly, David J.
Communication of ClpXP hypersensitivity to bacteriophage Mu repressor isoforms [Text] / David J. Wetly, Jessica M. Jones, Hiroshi Nakai // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 272, N 1. - P31-41 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Придание гиперчувствительности к протеазе ClpXP изоформам репрессора бактериофага Mu
Аннотация: Репрессор Rep (I) дикого типа у фага Mu стабилен in vivo, а измененный репрессор Vir (II) у вирулентных транс-доминантных мутантов быстро разрушается протеазой ClpXP (III) Escherichia coli. Для деградации под действием III V[макс] одинакова у I и II, но K[M] для I в 20 раз больше, чем для II (3,6 и 0,15 мкМ соотв.). I, в отличие от II, очень устойчив к деградации в присутствии ДНК. II увеличивает скорость деградации I, уменьшая K[M], и придает I чувствительность к III в присутствии ДНК. При 8-кратном избытке I по сравнению с II наблюдается ускоренная полная деградация I. Если конц-ия II превышает 0,1 мкМ, I разрушается с такой же K[M], как и II. Эти свойства I важны для передачи физиологич. сигналов, индуцирующих транспозицию Mu в ответ на условия роста или стресс, т. к. гиперчувствительность к III распространяется среди молекул I. США, Dep. of Biochem. and Molecular Biol., Georgetown Univ. Med. Center, Washington, DC 20007. Библ. 39

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: БЕЛОК
РЕПРЕССОР REP
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ПРОТЕАЗА CLPXP
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
СИНТЕЗ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Jones, Jessica M.; Nakai, Hiroshi

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.386

Levchenko, Igor.
ClpX and MuB interact with overlapping regions of Mu transposase: Implications for control of the transposition pathway [Text] / Igor Levchenko, Michael Yamauchi, Tania A. Baker // Genes and Dev. - 1997. - Vol. 11, N 12. - P1561-1572 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: ClpX и MuB взаимодействуют с перекрывающимися областями транспоназы фага Mu: следствия для контроля пути транспозиции
Аннотация: В транспозиции фага Mu по завершении рекомбинации шаперон ClpX (I) инициирует разборку комплекса транспоназы MuA (II) с ДНК и дает возможность начаться репликации фаговой ДНК. Изучено узнавание I комплексов II-ДНК. Найдено, что пептид длиной 10 остатков из C-концевого домена II требуется для узнавания I. Этот положительно заряженный пептид превращает гетерологичный белок ArcA в субстрат для I. Показано, что область II, взаимодействующая с активирующим транспозицию белком MuB (III), перекрывается с областью, узнаваемой I. Вследствие этого III ингибирует разборку нескольких комплексов II-ДНК, являющихся интермедиатами рекомбинации. Такая способность III блокировать доступ к II позволяет предложить механизм ограничения опосредованного I перемоделирования комплексов II-ДНК надлежащей стадией во время репликативной транспозиции. Перекрывание последовательностей, участвующих во взаимодействиях субъединиц, с последовательностями, нацеливающими белок на перестройку или разрушение, может являться полезной конструкцией для белков, к-рые функционируют в путях, регулирующих перемоделирования или разрушения. США, Howard Hughes Med. Inst., Cambridge, MA 02139. Библ. 63

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСПОЗИЦИЯ
МЕХАНИЗМ
БЕЛОК
CLPX
MUB
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Yamauchi, Michael; Baker, Tania A.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.02-04Б1.44

The integration host factor-DNA complex upstream of the early promoter of bacteriophage Mu is functionally symmetric [Text] / Ulsen Peter van [et al.] // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 9. - P3073-3075 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Комплекс хозяйский фактор интеграции - ДНК с 5'-стороны от раннего промотора бактериофага Mu функционально симметричен
Аннотация: Инверсия сайта ihf в области промотора ранних генов фага Mu не влияет на ф-ции хозяйского фактора интеграции IHF (I). Связывание I с этим инвертированным сайтом противодействует репрессии белком H-NS, непосредственно активирует транскрипцию и поддерживает литический рост фага Mu. Т. обр. гетеродимер I и его асимметричный сайт связывания образуют функционально симметричный комплекс. Нидерланды, Lab. Molec. Genet., Leiden Inst. Chem., Leiden Univ., 2300 RA Leiden. Библ. 28

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
КОМПЛЕКС ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР ИНТЕГРАЦИИ - ДНК
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ СИММЕТРИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РАННИЙ ПРОМОТОР

Доп.точки доступа:
van, Ulsen Peter; Hillebrand, Marcel; Zulianello, Laurence; van, de Putte Pieter; Goosen, Nora

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.300

Wetly, David J.
Communication of ClpXP hypersensitivity to bacteriophage Mu repressor isoforms [Text] / David J. Wetly, Jessica M. Jones, Hiroshi Nakai // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 272, N 1. - P31-41 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Придание гиперчувствительности к протеазе ClpXP изоформам репрессора бактериофага Mu
Аннотация: Репрессор Rep (I) дикого типа у фага Mu стабилен in vivo, а измененный репрессор Vir (II) у вирулентных транс-доминантных мутантов быстро разрушается протеазой ClpXP (III) Escherichia coli. Для деградации под действием III V[макс] одинакова у I и II, но K[M] для I в 20 раз больше, чем для II (3,6 и 0,15 мкМ соотв.). I, в отличие от II, очень устойчив к деградации в присутствии ДНК. II увеличивает скорость деградации I, уменьшая K[M], и придает I чувствительность к III в присутствии ДНК. При 8-кратном избытке I по сравнению с II наблюдается ускоренная полная деградация I. Если конц-ия II превышает 0,1 мкМ, I разрушается с такой же K[M], как и II. Эти свойства I важны для передачи физиологич. сигналов, индуцирующих транспозицию Mu в ответ на условия роста или стресс, т. к. гиперчувствительность к III распространяется среди молекул I. США, Dep. of Biochem. and Molecular Biol., Georgetown Univ. Med. Center, Washington, DC 20007. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БЕЛОК
РЕПРЕССОР REP
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ПРОТЕАЗА CLPXP
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
СИНТЕЗ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Jones, Jessica M.; Nakai, Hiroshi

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.294

Aldaz, Hector.
The interwoven architecture of the Mu transposase couples DNA synapsis to catalysis [Text] / Hector Aldaz, Eugene Schuster, Tania A. Baker // Cell. - 1996. - Vol. 85, N 2. - P257-269 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Переплетенная архитектура транспоназы фага Mu сопрягает синапсис ДНК с катализом
Аннотация: В транспозиции ДНК фага Mu участвует пара сайтов рекомбинации на концах фагового генома. Разработан метод, позволяющий определить, где индивидуальные субъединицы тетрамерной транспоназы MuA (I) связываются с ДНК и где они катализируют воссоединение ДНК. Показано, что субъединицы I катализируют рекомбинацию не в сайте, смежном с тем, с к-рым они связаны, а на противоположном конце фагового генома. В катализ одной стадии реакции вносят вклад субъединицы I, связанные с 2 разными сайтами. Такое переплетенное расположение субъединиц позволяет объяснить точность, с к-рой происходит рекомбинация с использованием пары сигналов в ДНК. Эти данные иллюстрируют, как архитектура ДНК-белкового комплекса может определять продукты реакции. США, Dept of Biol., Massachusetts Inst. of Technol., Cambridge, MA 02139. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСПОЗИЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
ТРАНСПОНАЗА
СТРУКТУРА
АКТИВНОСТЬ
ESHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Schuster, Eugene; Baker, Tania A.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.295

Savilahti, Harri.
Mu Transpositional recombination: Donor DNA cleavage and strand transfer in trans by the Mu tranposase [Text] / Harri Savilahti, Kiyoshi Mizuuchi // Cell. - 1996. - Vol. 85, N 2. - P271-280 . - ISSN 0092-8674
Перевод заглавия: Транспозиционная рекомбинация фага Mu: расщепление донорной ДНК и перенос нити в транс-положении транспоназой Mu
Аннотация: Главными химич. стадиями в транспозиц. рекомбинации фага Mu являются расщепление донорной ДНК и перенос нитей. Эти реакции протекают в транспозосоме (ТС) Mu, к-рая содержит I концевых сегмента ДНК фага Mu, связанные с тетрамером транспоназы MuA (I). Чтобы установить, какой из мономеров I катализирует каждую из этих реакций, реконструированы ТС, содержащие субъединицы I дикого типа и мутантов I по активному центру. С использованием предварительной загрузки вариантов I на концевые фрагменты ДНК Mu разной длины до сборки ТС можно проследить катализ под действием I, связанной с каждым из концевых сегментов ДНК Mu и идентифицировать конец донорной ДНК, на к-ром произошла реакция. Показано, что и расщепление донорной ДНК, и перенос нити катализируются в транс-положении мономерами I, связанными с противоположным концом генома Mu. Это позволяет объяснить, почему сборка ТС является предпосылкой для химич. стадий транспозиции. США, Lab. of Molecular Biol., NIDDKD, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 60

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ MU
ТРАНСПОЗИЦИОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ДОНОРНАЯ ДНК
РАСЩЕПЛЕНИЕ
ФЕРМЕНТЫ
ТРАНСПОНАЗА
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Mizuuchi, Kiyoshi

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.304

Stimulation of DNA inversion by FIS: Evidence for enhancer-independent contacts with the Gin-gix complex [Text] / Annette Deufel [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 19. - P3832-3839 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Стимуляция инверсии ДНК белком FIS: доказательство не зависящих от энхансера контактов с комплексом Gin-gix
Аннотация: Мутанты белка FIS (I) с нарушенным связыванием с ДНК способны позитивно или негативно влиять на реакцию инверсии, катализируемую инвертазой Gin (II) фага Mu in vitro и in vivo. Мутант I с заменами K25E/V66A/M67T значительно усиливает расщепление сайтов рекомбинации не зависящим от I вариантом II, причем это усиление не зависит и от рекомбинац. энхансера. Эти данные позволяют предположить, что I играет двойную роль в регуляции инверсии: он стимулирует как сборку синаптич. комплекса, так и расщепление нитей ДНК. Германия, Inst. fur Genetik und Mikrobiol. der Univ. Munchen, 80638 Munchen. Библ. 63

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ИНВЕРСИЯ
ДНК
РЕГУЛЯЦИЯ
БЕЛОК FIS
ESCHERICHIA
БЕЛОК GIN
ФАГ MU

Доп.точки доступа:
Deufel, Annette; Hermann, Thomas; Kahmann, Regine; Muskhelishvili, Georgi

1-20 21-40 41-60 61-80

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска