Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ<.>)
Общее количество найденных документов : 17
Показаны документы с 1 по 17
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.364

    Mirabella, Allyson.

    Yeast telomeric sequences function as chromosomal anchorage points in vivo [Text] / Allyson Mirabella, Marc R. Gartenberg // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 3. - P523-533 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Последовательности теломер у дрожжей функционируют как точки заякоривания хромосом in vivo
Аннотация: Сайт-специфичная рекомбинация в Saccharomyces cerevisiae использована для генерации нерепликативных колец ДНК, содержащих теломерные последовательности дрожжей. В мутантах по ДНК-топоизомеразе, экспрессирующих топоизомеразу I Escherichia coli, кольца ДНК имеют топологию, согласующуюся со способностью теломерной ДНК блокировать или задерживать осевое вращение ДНК. Фрагменты ДНК, содержащие участки концевого повтора C[1-3]A/TG[1-3]; необходимы и достаточны для создания препятствия для вращения ДНК. Заякоревание ДНК уменьшается при добавлении конкурирующих теломерных последовательностей. По-видимому, белок Rap1p является составной частью якоря ДНК, но делеция жизненно неважного C-концевого домена не влияет на топологию колец теломерной ДНК. Разрушение генов SIR2, SIR3 и SIR4 также не влияет на топологию колец. Считается, что теломерная ДНК поддерживает формирование SIR-независимой сборки макромолекулярного комплекса белок-ДНК, к-рый задерживает движение ДНК из-за ее связи с нер-римой ядерной структурой. США, Dep. Pharmac., UMDNI-Robert Wood Johnson Med. Sch., Piscatawag, NI 08854. Библ. 73
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.02
Рубрики: ДНК
ТЕЛОМЕРЫ

ХРОМОСОМЫ

КОМПЛЕКСЫ ДНК-БЕЛОК

ЯКОРНАЯ ФУНКЦИЯ

ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА

ГЕНЫ

ГЕН RAP1

ГЕН SIR

ТРАНСКРИПЦИОННОЕ СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

РЕКОМБИНАЗА R

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Gartenberg, Marc R.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.284

   

    Increase in negative supercoiling of plasmid DNA in Escherichia coli exposed to cold shock [Text] / Tohru Mizushima [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 2. - P381-386 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Увеличение негативного суперскручивания плазмидной ДНК у Escherichia coli, подвергнутой холодовому шоку
Аннотация: Негативное суперскручивание плазмидной ДНК в клетках (Кл) Escherichia coli может временно уменьшиться при тепловом шоке. Изучали действие холодового шока на негативное суперскручивание ДНК. ЭФ-анализ в присутствии хлороквина выявил, что негативное суперскручивание плазмидной ДНК в Кл повышалось, когда Кл подвергали холодовому шоку. Это повышение было временным, а в случае предварительной обработки Кл налидиксовой к-той, ингибитором ДНК-гиразы, этого повышения не наблюдали. В мутанте, дефектном по экспрессии белка HU, повышение негативного суперскручивания было менее выражено, чем в Кл дикого типа. Полагают, что ДНК-гираза и белок HU участвуют в суперскручивании ДНК. Япония, Fac. Pharmaceutic. Sci., Kyushu Univ., Fukuoka 812-82. Библ. 26
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ДНК
ПЛАЗМИДНАЯ

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ХОЛОДОВОЙ ШОК

ВЛИЯНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Mizushima, Tohru; Kataoka, Kazuhiro; Ogata, Yasuyuki; Inoue, Ryu-ichi; Sekimizu, Kazuhisa


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.165

    Masse, Eric.

    Escherichia coli DNA topoisomerase I inhibits R-loop formation by relaxing transcription-induced negative supercoiling [Text] / Eric Masse, Marc Drolet // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 23. - P16659-16664 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: ДНК-топоизомераза I Escherichia coli подавляет формирование R-петли релаксацией негативного суперскручивания [ДНК], индуцированного транскрипцией
Аннотация: Недавно было показано, что сверхпродукция РНКазы Н может частично компенсировать дефект роста клеток Escherichia coli, вызванный отсутствием ДНК-топоизомеразы I. Предложена модель, согласно которой R-петли (гибриды РНК-ДНК, в которых матричная нить связана с РНК, а нематричная нить остается свободной) образуются в ходе транскрипции мутантов topA E. coli. Авт. получены результаты, подтверждающие это предположение и показывающие, что формирование R-петли связано с суперскручиванием ДНК, индуцированным транскрипцией. Показано, что стабильные R-петли образуются при транскрипции in vitro РНК-полимеразой E. coli только в присутствии ДНК-гиразы. Кроме того, интенсивное образование R-петель in vivo наблюдается в условиях, при которых мутанты topA не способны расти. Более того, сопряжение транскрипции и трансляции в клетках бактерий является эффективным способом предотвращения образования R-петель. Канада, Dep. Microbiol. Immunol., Univ. Montreal, C.P. 6128, Succursale Centre-Ville, Montreal, Que., H3C 3J7. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ДНК
R-ПЕТЛИ

ФОРМИРОВАНИЕ

НЕГАТИВНОЕ СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА I

ИНГИБИРУЮЩЕЕ ДЕЙСТВИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Drolet, Marc


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.166

    Masse, Eric.

    Relaxation of transcription-induced negative supercoiling is an essential function of Escherichia coli DNA topoisomerase [Text] / Eric Masse, Marc Drolet // J. Biol. Chem. - 1999. - Vol. 274, N 23. - P16654-16658 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Релаксация негативного суперскрученного [состояния ДНК], индуцированного транскрипцией, является важной функцией ДНК-топоизомеразы I Escherichia coli
Аннотация: Предполагается, что важной функцией ДНК-топоизомеразы I Escherichia coli, является предотвращение возникновения в хромосомной ДНК высокого уровня глобального негативного суперскручивания. Однако в работах in vivo показано, что ДНК-топоизомераза I очень эффектно удаляет локальные негативные супервитки, образующиеся в ходе элонгации транскрипции. Чтобы установить, контролирует ли ДНК-топоизомераза глобальную или локальную суперспирализацию ДНК, получены нуль-мутантные по гену topA штаммы E. coli. Показано, что основной функцией ДНК-топоизомеразы I является релаксация локальных негативных суперспиральных структур, которые образуются при элонгации ДНК в ходе транскрипции. Канада, Dep. Microbiol. Immunol., Univ. Montreal, C.P. 6128, Succursale Centre-Ville, Montreal, Que, H3C 3J7. Библ. 17
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ДНК
НЕГАТИВНОЕ СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ИНДУЦИРОВАННОЕ ТРАНСКРИПЦИЕЙ

РЕЛАКСАЦИЯ

ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА I

УЧАСТИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Drolet, Marc


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.12-04Б2.157

    Bebbington, Keren J.

    A role for DNA supercoiling in the regulation of the cytochrome bd oxidase of Escherichia coli [Text] / Keren J. Bebbington, Huw D. Willams // Microbiology. - 2001. - Vol. 147, N 3. - P591-598 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Роль суперспирализации ДНК в регуляции [экспрессии гена] цитохром-bd-оксидазы Escherichia coli
Аннотация: Оперон cydAB Escherichia coli кодирует цитохром-bd-терминальную оксидазу аэробной дыхательной цепи. Экспрессия оперона cydAB контролируется двухкомпонентной системой ArcA/ArcB и чувствительным к кислороду регулятором транскрипции Fnr. В то же время экспрессия cydAB индуцируется при переходе к стационарной фазе роста или к анаэробным условиям в мутантных штаммах с делециями генов arcA и fnr. Возможным механизмом регуляции экспрессии оперона cydAB в мутантных штаммах являются изменения суперспирализации ДНК при переходе к анаэробным условиям. Показали, что экспрессия cydAB чувствительна к ингибиторам ДНК-гиразы, фермента, катализирующего образование отрицательных супервитков ДНК. Налидиксовая кислота и новобиоцин подавляют экспрессию слитого гена cydA-lacZ. В мутантах по гену gyrA уровень экспрессии cydAB снижен, и экспрессия не зависит от содержания кислорода. Т. обр., суперспирализация ДНК приводит к индукции экспрессии cydAB и увеличению содержания цитохрома bd в клетках E. coli в анаэробных условиях. Великобритания, Dep. Biol., Imperial Coll. Sci., Technol., Med., London SW7 2AZ. Библ. 44
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЦИТОХРОМ-BD-ОКСИДАЗА
ОПЕРОНЫ

CYDAB

ЭКСПРЕССИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

ДНК

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Willams, Huw D.


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.147

    Travers, Andrew.

    DNA supercoiling and transcription in Escherichia coli: The FIS connection [Text] / Andrew Travers, Robert Schneider, Georgi Muskhelishvili // Biochimie. - 2001. - Vol. 83, N 2. - P213-217 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Суперскручивание ДНК и транскрипция у Escherichia coli: свойства FIS
Аннотация: Обзор. Ассоциированный с нуклеоидом белок FIS изменяет топологию ДНК зависимым от стадии роста образом и препятствует образованию избытка негативных суперспиралей. Предполагается, что существуют по меньшей мере 2 механизма действия FIS: физическое подавление суперспирализации посредством связывания FIS с ДНК; снижение экспрессии и эффективности работы ДНК-гиразы. Для высокого уровня экспрессии гена fis необходима высокая плотность негативных суперспиралей. На ДНК-субстратах, содержащих фазированные высокоаффинные сайты связывания, FIS образует сильно изогнутые структуры ДНК, или микропетли, которые необходимы для оптимальной работы промотора. Предполагается, что эти микропетли частично компенсируют индуцированное FIS снижение плотности суперспиралей. Великобритания, MRC Lab. Molec. Biol., Hills Road, Cambridge CB2 2QH. Библ. 53
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ДНК
СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ТРАНСКРИПЦИЯ

БЕЛОК

АССОЦИИРОВАННЫЙ С НУКЛЕОИДОМ БЕЛОК FIS

СВОЙСТВА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 53


Доп.точки доступа:
Schneider, Robert; Muskhelishvili, Georgi


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.04-04Б2.253

   

    DNA supercoiling contributes to disconnect 'сигма'{s} accumulation from 'сигма'{s}-dependent transcription in Escherichia coli [Text] / Patricia Bordes [et al.] // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 48, N 2. - P561-571 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Суперскручивание ДНК вносит вклад в нарушение связи 'дельта'{S}-аккумуляции и 'дельта'{S}-зависимой транскрипции в Escherichia coli
Аннотация: Субъединица 'дельта'{S} РНК-полимеразы - ключевой регулятор транскрипции Escherichia coli в стрессовых условиях. 'дельта'{S} накапливается в клетках в условиях осмотического стресса или входа в стационарную фазу. Показали, что 'дельта'{S} накаливается задолго до начала 'дельта'{S}-зависимой индукции промотора osmEp. Данные, полученные in vivo и in vitro свидетельствуют, что высокий уровень отрицательной спирализации ДНК ингибирует транскрипцию через E 'дельта'{S}. При изменении плотности суперспирали, зависящей от условий роста, можно модулировать транскрипцию подмножества 'дельта'{S}-мишеней и, следовательно, вклад во временное нарушение связи между аккумуляцией 'дельта'{S} и 'дельта'{S}-транскрипцией. Предположили, что в условиях стресса, ведущих к накоплению 'дельта'{S} без снижения скорости роста, уровень суперскрученности ДНК действует как проверяющий регулятор, к-рый задерживает сдвиг транскрипционного механизма к общему стрессу, замедляя индукцию подмножества 'дельта'{S}-регулона до того времени, пока неблагоприятные условия вызовут переход в стационарную фазу. Франция, Lab. de Microbiol. et Genetique Moleculaire, UMR 5100 CNRS-Univ. Toulouse III, 118, Route de Narbonne, 31062, Toulouse Cedex. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ДНК
СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ОТРИЦАТЕЛЬНАЯ СПИРАЛИЗАЦИЯ

ВЛИЯНИЕ НА

ТРАНСКРИПЦИЯ

СУБЪЕДИНИЦЫ E'ДЕЛЬТА'{S}

ИНГИБИРОВАНИЕ

АККУМУЛЯЦИЯ 'ДЕЛЬТА'{S}

НАРУШЕНИЕ СВЯЗИ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Bordes, Patricia; Conter, Annie; Morales, Violette; Bouvier, Jean; Kolb, Annie; Gutierrez, Claude


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.01-04Б4.152

   

    Roles of DNA supercoiling and the Fis protein in modulating expression of virulence genes during intracellular growth of Salmonella enterica serovar Typhimurium [Text] / Tadhg O. Croinin [et al.] // Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 62, N 3. - P869-882 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Роль суперскручивания ДНК и белка Fis в модуляции экспрессии генов вирулентности Salmonella enterica серовар Typhimurium в процессе внутриклеточного роста [этого микроорганизма]
Аннотация: Для адаптации бактериальных патогенов к внутриклеточному окружению необходима регуляция уровней экспрессии широкого набора генов вирулентности и генов домашнего хозяйства. Исследовали может ли суперскручивание ДНК модулировать экспрессию генов, которые являются важными для внутриклеточного роста патогена Salmonella enterica серовар Typhimurium. Результаты данной работы показали, что ДНК переходила в релаксированную форму, когда клетки Salmonella росли в мышиных макрофагах, но не в эпителиальных клетках, что указывало, что суперскручивание ДНК играло роль в дискриминации между двумя типами внутриклеточного окружения. Обнаружили, что регуляторный ген ssrA внутри островка патогенности SPI-2, который необходим для выживания в макрофагах, активируется за счет ДНК релаксации. Для этого увеличения экспрессии необходим Fis-белок, связанный с нуклеидом. Изменения уровня Fis-белка модулировали как уровень суперскручивания ДНК, так и транскрипцию ssr A. Обсуждают модель адаптации бактерий к внутриклеточному окружению, в которой Fis-белок и суперскручивание ДНК вместе участвуют в регуляции экспрессии генов вирулентности. Ирландия, Dep. of Microbiology, Moyne Institute of Preventive Medicine, Trinity College Dublin. Библ. 113
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.21.07.99
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ ДНК

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН АКТИВАТОРА ТРАНСКРИПЦИИ SSRA

ФУНКЦИЯ

SALMONELLA ENTERICA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Croinin, Tadhg O.; Carroll, Ronan K.; Kelly, Arlene; Dorman, Charles J.


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.05-04Б2.85

   

    Roles of DNA supercoiling and the Fis protein in modulating expression of virulence genes during intracellular growth of Salmonella enterica serovar Typhimurium [Text] / Tadhg O. Croinin [et al.] // Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 62, N 3. - P869-882 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Роль суперскручивания ДНК и белка Fis в модуляции экспрессии генов вирулентности Salmonella enterica серовар Typhimurium в процессе внутриклеточного роста [этого микроорганизма]
Аннотация: Для адаптации бактериальных патогенов к внутриклеточному окружению необходима регуляция уровней экспрессии широкого набора генов вирулентности и генов домашнего хозяйства. Исследовали может ли суперскручивание ДНК модулировать экспрессию генов, которые являются важными для внутриклеточного роста патогена Salmonella enterica серовар Typhimurium. Результаты данной работы показали, что ДНК переходила в релаксированную форму, когда клетки Salmonella росли в мышиных макрофагах, но не в эпителиальных клетках, что указывало, что суперскручивание ДНК играло роль в дискриминации между двумя типами внутриклеточного окружения. Обнаружили, что регуляторный ген ssrA внутри островка патогенности SPI-2, который необходим для выживания в макрофагах, активируется за счет ДНК релаксации. Для этого увеличения экспрессии необходим Fis-белок, связанный с нуклеидом. Изменения уровня Fis-белка модулировали как уровень суперскручивания ДНК, так и транскрипцию ssr A. Обсуждают модель адаптации бактерий к внутриклеточному окружению, в которой Fis-белок и суперскручивание ДНК вместе участвуют в регуляции экспрессии генов вирулентности. Ирландия, Dep. of Microbiology, Moyne Institute of Preventive Medicine, Trinity College Dublin. Библ. 113
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ ДНК

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН АКТИВАТОРА ТРАНСКРИПЦИИ SSRA

ФУНКЦИЯ

SALMONELLA ENTERICA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Croinin, Tadhg O.; Carroll, Ronan K.; Kelly, Arlene; Dorman, Charles J.


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.04-04Б2.212

    Cheng, Eric.

    Differential effects of DNA supercoiling on Chlamydia early promotes correlate with expression patterns in midcycle [Text] / Eric Cheng, Ming Tan // J. Bacteriol. - 2012. - Vol. 194, N 12. - P3109-3115 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Различные эффекты суперскручивания ДНК на ранние промоторы Chlamydia коррелируют с образцами экспрессии в середине цикла
Аннотация: Исследовали промоторы 10 ранних генов Chlamydia trachonatis и обнаружили, что они могут быть разделены на две группы на основе их отклика на суперскручивание ДНК in vitro. Тип ответа коррелировал с образцами экспрессии in vivo для каждого раннего гена. Выяснили, что вторая группа генов представляет собой новый класс хламидиальных генов развития со свойствами генов как ранней, так и средней фазы цикла. Выдвинули гипотезу, что экспрессия этих зависимых от суперскручивания ранних генов активируется при повышении уровня суперскручивания в середине цикла через ответ промоторов на суперспирализацию, также как и генов средней фазы цикла. То есть суперспирализация ДНК - основной механизм регуляции генов в Chlamydia в среднюю стадию цикла и не только генами средней фазы. США, of Microbiology and Molecular Genetics, College of med., Univ. of California, Irvine, Irvine, California
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ
IN VITRO

ДНК

РАЗЛИЧНЫЕ ЭФФЕКТЫ

КОРРЕЛЯЦИЯ

ПРОМОТОРЫ РАННИЕ

ОТВЕТ

ГЕНЫ РАННИЕ

СЕРЕДИНА ЦИКЛА

СHLAMYDIA TRACHOMATIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Tan, Ming


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 13.06-04Б4.87

    Zhi, Xiaoduo.

    Dependence of transcription-coupled DNA supercoiling on promoter strength in Escherichia coli topoisomerase I deficient strains [Text] / Xiaoduo Zhi, Fenfei Leng // Gene. - 2013. - Vol. 514, N 2. - P82-90 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Зависимость сопряженного с транскрипцией суперскручивания ДНК от длины промотора в штаммах Escherichia coli, дефектных по топоизомеразе
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ДНК

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ТОПОИЗОМЕРАЗЫ

ГЕНЫ

МУТАЦИИ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ TOPA


Доп.точки доступа:
Leng, Fenfei


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.07-04Б2.169

    Zhi, Xiaoduo.

    Dependence of transcription-coupled DNA supercoiling on promoter strength in Escherichia coli topoisomerase I deficient strains [Text] / Xiaoduo Zhi, Fenfei Leng // Gene. - 2013. - Vol. 514, N 2. - P82-90 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Зависимость сопряженного с транскрипцией суперскручивания ДНК от длины промотора в штаммах Escherichia coli, дефектных по топоизомеразе
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.02
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ДНК

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

ТОПОИЗОМЕРАЗЫ

ГЕНЫ

МУТАЦИИ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ TOPA


Доп.точки доступа:
Leng, Fenfei


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.10-04Б2.184

   

    The nucleoid-associated proteins H-NS and FIS modulate the DNA supercoiling response of the pel genes, the major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii [Text] / Z. -A. Ouafa [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2012. - Vol. 40, N 10. - P4306-4319 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Ассоциированные с нуклеоидом белки H-NS и FIS модулируют суперскручивание ДНК генов pel - главных факторов вирулентности патогенной бактерии растений Dickeya dadantii
Аннотация: Экспрессия генов pel, кодирующего пектатлиазу, модулируется белками H-NS и FIS, ассоциированными с нуклеотидом и влияющими на топологию ДНК. Релаксация ДНК в растущих клетках Dickeya dadantii снижает экспрессию генов pel. Делеция гена fis усиливает, а делеция гена hus ослабляет негативное влияние релаксации ДНК. Сделан вывод, что FIS действует как репрессор, нейтрализующий негативное действие релаксации ДНК, тогда как H-NS служит для тонкой настройки генов вирулентности, обеспечивающей их экспрессию в субоптимальных условиях. Франция, Univ. Lyon, F-69622 Lyon. Библ. 71
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН PEL

ФАКТОРЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ

ДНК

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

DICKEYA DADANTII (BACT.)

ФИТОПАТОГЕН


Доп.точки доступа:
Ouafa, Z.-A.; Reverchon, S.; Lautier, T.; Muskhelishvilli, G.; Nasser, W.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.12-04Б2.388

    Bates, Andrew D.

    DNA gyrase can supercoil DNA circles as small as 174 base pairs [Text] / Andrew D. Bates, Anthony Maxwell // EMBO. Journal. - 1989. - Vol. 8, N 6. - P1861-1866 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: ДНК-гираза может суперспирализовать кольцевые ДНК длиной всего в 174 пары нуклеотидов
Аннотация: В ходе изучения механизмов действия ДНК-гиразы (ДГ) Escherichia coli определяли минимальную длину кольцевых молекул ДНК, которые могут суперспирализоваться под действием этого фермента. В работе использовали набор релаксированных кольцевых ДНК длиной от 116 до 427 п. н. Обнаружено, что минимальный размер молекул ДНК, в которые ДГ может вносить отрицательные супервитки, составляет 174 п. н. Достигаемая при этом плотность суперспирализации (-0,11), была такой же, как максимальная величина плотности суперспирализации, индуцируемой ДГ в ДНК плазмиды pBR322. Обсуждается вопрос о том, определяется ли нижний предел действия ДГ термодинамическими параметрами, или он зависит от стерических факторов. Кроме того, обнаружено, что ДГ E. coli может вызывать релаксацию отрицательных супервитков даже в кольцевых ДНК длиной всего в 116 п. н. Библ. 30. Великобритания, Deparment of Biochemistry, University of Liecester. University Road. Leicester, LEI 7RH, UK.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДНК-ГИРАЗА

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

КОЛЬЦЕВЫЕ ДНК

МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ


Доп.точки доступа:
Maxwell, Anthony


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.05-04Б2.19

   

    Tetracycline promoter mutations decrease non-B DNA structural transitions, negative linking differences and deletions in recombinant plasmids in Escherichia coli [Text] / Adam Jaworski [et al.] // J. Mol. Biol. - 1989. - Vol. 207, N 3. - P513-526 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Мутации в тетрациклиновом промоторе снижают структурные переходы не-В-ДНК, различия в негативном скручивании и делеции в рекомбинантных плазмидах у Escherichia coli
Аннотация: Исследована возможность клонирования в 3 сайтах плазмиды pBR322 протяженных (50 п. н.) участков ДНК не Bформы, включая левозакрученную Z-ДНК, крестообразную и триплексную ДНК. Выявлено, что вставки этих форм ДНК стабильны, не делетируются в случае, когда они клонированы в EcoRI-сайте, расположенном в нетранслируемом районе pBR322. Напротив, вставки Z-ДНК или триплексов в сайт BamHI, расположенный в гене tet, активно делетировались in vivo. Однако, в случае, если промотор гена tet повреждался заполнением сайтов Hind III либо ClaI, вставки необычной ДНК в сайт BamHI не делетировались. Одновременно снижался уровень негативных супервитков в плазмидной ДНК. Точно также, вставки, к-рые с высокйо вероятностью могли приобрести Z-конфигурацию, постепенно делетировались из сайта RuII pBR322, расположенного вблизи ori репликации и района, контролирующего число копий, но значительно реже делетировались в случае, если промотор tet был поврежден мутацией. Поскольку более короткие вставки, с меньшей вероятностью формирующие структуры типа не-В-ДНК, либо случайные последовательности не проявляли себя подобной нестабильностью, сделан вывод, что феномен делетирования определяется способностью клонированных последовательностей образовывать Z-форму или триплекс in vivo. Библ. 45.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ПЛАЗМИДЫ

ПЛАЗМИДА PBR322

ПРОМОТОР ГЕНА TET

ДНК

НЕ-В-ДНК

ВСТАВКИ

ДЕЛЕЦИИ

РЕГУЛЯЦИЯ

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

НЕГАТИВНОЕ СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Jaworski, Adam; Blaho, John A.; Larson, Jacquelynn E.; Shimizu, Mitsuhiro; Wells, Robert D.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.12-04Б2.243

   

    The Escherichia coli minB mutation resembles gyrB in defective nucleoid segregation and decreased negative supercoiling of plasmids [Text] / Egbert Mulder [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1990. - Vol. 221, N 1. - P87-93 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Мутация minB Escherichia coli подобна gyrB в дефектной сегрегации нуклеоидов и уменьшает негативное суперскручивание плазмид
Аннотация: Показали, что в мутантных клетках Escherichia coli minB и в клетках со сверхсинтезом продуктов этого гена происходит дефектная сегрегация нуклеоидов. По-видимому, это связано с уменьшением негативного суперскручивания плазмид. Предположил, что в мутантных клетках gurB (tr) задержка сегрегации нуклеоидов приводит к образованию мини - клеток и безъядерных клеток. Ил. 6. Табл. 2. Библ. 35.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАЦИИ

МУТАЦИИ MIN

ФЕНОТИП

НУКЛЕОИДЫ

ДЕФЕКТНАЯ СЕГРЕГАЦИЯ

ДНК ПЛАЗМИДНАЯ

НЕГАТИВНОЕ СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ

УМЕНЬШЕНИЕ


Доп.точки доступа:
Mulder, Egbert; El'Bouhali, Mohamed; Pas, Evelien; Woldringh, Conrad L.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 93.09-04Б1.134

    Banerjee, Subhasis.

    Differential effect of DNA supercoiling on transcription of adenovirus genes in vitro [Text] / Subhasis Banerjee, David J. Spector // J. Gen. Virol. - 1992. - Vol. 73, N 10. - P2631- 2638 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Дифференциальное влияние суперскручивания ДНК на транскрипцию генов аденовируса in vitro
Аннотация: Изучали влияние топологии матрицы ДНК на транскрипцию регулируемых по времени генов E1а, Е1b и рIX аденовируса 5 in vitro. Для этого сравнивали количество РНК, синтезируемой при участии промоторов генов Е1а, Е1b и pIX на депротеинизированных линейных и скрученных ДНК-матрицах. В качестве матриц использовали рекомбинантную ДНК плазмиды pXC1, содержащей 16% генома аденовируса 5. Показали, что РНК синтезируется в 2-4 раза больше при участии промотора гена Е1а и в 3-7 раз больше при участии промотора гена Е1b на суперскрученной ДНК-матрице по сравнению с линейной. В противоположность этому синтез РНК при участии промотора pIX гена не зависел от топологии ДНК. Считают, что структура промотора pIX гена отличается от структуры промоторов генов Е1а и Е1b. Библ. 45. Англия, Dep. of Pathol., The Royal Veterinary College, Univ. of London, London NW1 ОТV.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
ГЕНЫ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ДНК

СУПЕРСКРУЧИВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Spector, David J.


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)