Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=САЙТЫ УЗНАВАНИЯ<.>)
Общее количество найденных документов : 23
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-23 
1.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 97.03-04Н1.186

    Pattaramalai, Sugit.

    A novel recognition site on laminin for the 'альфа'3'бета'1 integrin [Text] / Sugit Pattaramalai, Keith M. Skubitz, Amy P. N. Skubitz // Exp. Cell Res. - 1996. - Vol. 222, N 2. - P281-290 . - ISSN 0014-4827
Перевод заглавия: Новый сайт узнавания для интегрина 'альфа'3'бета'1 на ламинине
Аннотация: Синтетический пептид GD-2 из C-концевого длинного плеча цепи A ламинина стимулирует адгезию клеток (Кл) SCC9 плосклеточного рака языка человека и др. клеток. Моноклональное антитело к клеткам SCC9, связывающееся с поверхностью этих Кл, угнетает адгезию Кл SCC9 на ламинине и на GD-2, но не на фибронектине или коллагене IV типа. Это антитело вызывает иммунопреципитацию комплекса из компонентов 135 и 116 кД. Из экстракта Кл антитело удаляет интегрин 'альфа'3'бета'1. Иммуноцитохимическая окраска с помощью этого антитела тканей языка и рака языка человека выявила антиген на поверхности эпителиоцитов, расположенных на базальной мембране и в лежащих выше 2-3 клеточных слоях; антитело окрашивает также кровеносные сосуды плоскоклеточных структур. Картина идентична окраске антителами к субъединице 'альфа'3 интегрина. США [A. P. N. S.], Dep. Lab. Med. a. Pathol., Med. Sch., Univ. Minn., Minneapolis, MN 55455-0315. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.03.25.07.11
Рубрики: ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС
ЛАМИНИН

РЕЦЕПТОРЫ

ИНТЕГРИНЫ АЛЬФА 3 БЕТА 1

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

КЛЕТКИ SCC9

РАК ПЛОСКОКЛЕТОЧНЫЙ


Доп.точки доступа:
Skubitz, Keith M.; Skubitz, Amy P.N.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 97.05-04Я6.251

    Pattaramalai, Sugit.

    A novel recognition site on laminin for the 'альфа'3'бета'1 integrin [Text] / Sugit Pattaramalai, Keith M. Skubitz, Amy P. N. Skubitz // Exp. Cell Res. - 1996. - Vol. 222, N 2. - P281-290 . - ISSN 0014-4827
Перевод заглавия: Новый сайт узнавания для интегрина 'альфа'3'бета'1 на ламинине
Аннотация: Синтетический пептид GD-2 из C-концевого длинного плеча цепи A ламинина стимулирует адгезию клеток (Кл) SCC9 плосклеточного рака языка человека и др. клеток. Моноклональное антитело к клеткам SCC9, связывающееся с поверхностью этих Кл, угнетает адгезию Кл SCC9 на ламинине и на GD-2, но не на фибронектине или коллагене IV типа. Это антитело вызывает иммунопреципитацию комплекса из компонентов 135 и 116 кД. Из экстракта Кл антитело удаляет интегрин 'альфа'3'бета'1. Иммуноцитохимическая окраска с помощью этого антитела тканей языка и рака языка человека выявила антиген на поверхности эпителиоцитов, расположенных на базальной мембране и в лежащих выше 2-3 клеточных слоях; антитело окрашивает также кровеносные сосуды плоскоклеточных структур. Картина идентична окраске антителами к субъединице 'альфа'3 интегрина. США [A. P. N. S.], Dep. Lab. Med. a. Pathol., Med. Sch., Univ. Minn., Minneapolis, MN 55455-0315. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.21.07
Рубрики: ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ МАТРИКС
ЛАМИНИН

РЕЦЕПТОРЫ

ИНТЕГРИНЫ АЛЬФА 3 БЕТА 1

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

КЛЕТКИ SCC9

РАК ПЛОСКОКЛЕТОЧНЫЙ


Доп.точки доступа:
Skubitz, Keith M.; Skubitz, Amy P.N.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.07-04Б1.224

    Крюков, В. М.

    Эндонуклеаза SegE фага Т4 [Текст]. II. Определение и характеристика сайта узнавания / В. М. Крюков, М. Г. Шляпников, Ф. А. Кадыров // Молекул. биол. - 1996. - Т. 30, N 6. - С. 1307-1315 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Сайт-специфическая эндонуклеаза SegE фага Т4 гидролизует двухцепочечную ДНК с образованием 3'-выступающих концов, состоящих из двух нуклеотидов. Минимальная последовательность ДНК, необходимая для гидролиза, асимметрична и расположена в положении от -1 до +17 (+19) по отношению к центру сайта гидролиза. Сайт узнавания SegE высоковырожден, и не позволяет однозначно предсказать наличие сайта гидролиза по первичной структуре ДНК. Россия, Ин-т биохимии и физиологии микроорганизмов РАН, Пущино, Моск. обл. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ Т4

ЭНДОНУКЛЕАЗЫ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ОПРЕДЕЛЕНИЕ

ХАРАКТЕРИСТИКИ


Доп.точки доступа:
Шляпников, М.Г.; Кадыров, Ф.А.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.139

    Gelfand, Mikhail S.

    Avoidance of palindromic words in bacterial and archaeal genomes: A close connection with restriction enzymes [Text] / Mikhail S. Gelfand, Eugene V. Koonin // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 12. - P2430-2439 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Избегание палиндромных слов в геномах бактерий и археев: тесная связь с рестрикционными ферментами
Аннотация: Обнаружено статистически достоверное избегание коротких палиндромных последовательностей (ПП) длиной 4, 5 и 6 п. н. в полностью секвенированных геномах бактерий Haemophilus influenzae и Synechococcus sp. и архея Methanococcus jannaschii. В маленьком геноме Mycobacterium genitalium избегание ПП является лишь умеренным, а в геномах хлоропластов и митохондрий отсутствует. Среди наиболее избегаемых ПП находятся сайты действия ферментов систем рестрикции-модификации (СРМ), имеющихся у данного вида. Это указывает на прямую связь между избеганием коротких олигонуклеотидных слов и СРМ с соответствующей специфичностью. ПП, соответствующие СРМ из других видов, также избегаются, но менее значительно. Это позволяет предположить, что в процессе эволюции бактериальные ДНК подвергались действию широкого спектра СРМ, вероятно, из-за горизонтального переноса мобильных генетич. элементов (плазмид и профагов). ПП накапливаются в ДНК, как только она изолируется от СРМ в геномах клеточных органелл. Показано, что наиболее избегаемые ПП длиной 4 и 6 п. н. в геноме M. jannaschii могут быть сайтами действия для 2 новых СРМ. США, Nat. Center for Biotechnol. Information, Nat. Library of Med., NIH, Bethesda, MD 20894. Библ. 32
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
СТРУКТУРА

КОРОТКИЕ ПАЛИНДРОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ИЗБЕГАНИЕ

СИСТЕМА РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ВОЗНИКНОВЕНИЕ

ВСТРЕЧАЕМОСТЬ

HAEMOPHILUS INFLUENZAE


Доп.точки доступа:
Koonin, Eugene V.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.164

    Sagawa, Hiroaki.

    Sse83871, a useful eight base cutter for mammalian genome analysis (influence of methylation on the activity of Sse83871) [Text] / Hiroaki Sagawa, Atsushi Ohshima, Ikunoshin Kato // Nucl. Acids Res. - 1995. - Vol. 23, N 13. - P2367-2370 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Sse 8387 I, полезный резчик [участка] из восьми пар для анализа генома млекопитающих (влияние метилирования на активность Sse 8387 I)
Аннотация: Рестриктазы Not I, Sfi I и Fse I чувствительны к метилированию 5'-{m}CG-3', что ограничивает их использование при анализе геномов млекопитающих, где подобное метилирование встречается часто. Из Streptomyces sp. шт 8387 выделили рестриктазу Sse 8387 I, узнающую 5'-CCTGCA/GG-3' и расщепляющую эту последовательность в положении, указанном косой. Рестриктаза теряет активность при метилировании A или C в любом положении сайта узнавания. В участке Sse 8387 I- узнавания отсутствует динуклеотид CpG, а присутствие 5'-{m}CG-3' непосредственно перед или после участка узнавания не влияет на эффективность расщепления. Обсуждают возможность использования Sse 8387 I вместе с Pst I, имеющей 6-членный участок узнавания, идентичный ср. гексамеру Sse 8387 I-сайта. Япония, Biotechnol. Res. Labs., Takara Shuzo Co. Ltd, Shiga 520-21. Библ. 11
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: ГЕНОМ ЭУКАРИОТИЧЕСКИЙ
ГЕНОМ МЛЕКОПИТАЮЩИХ

КАРТИРОВАНИЕ ФИЗИЧЕСКОЕ

МЕТИЛИРОВАНИЕ

ЭНДОДЕЗОКСИРИБОНУКЛЕАЗА SSE 8387 I

ВЫДЕЛЕНИЕ

СВОЙСТВА

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

STREPTOMYCES SP. ШТ. 8387


Доп.точки доступа:
Ohshima, Atsushi; Kato, Ikunoshin

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.168

   

    M. Bss H II, a multispecific cytosine-C5-DNA-methyltransferase with unusual target recognizing properties [Text] / Judith Schumann [et al.] // J. Mol. Biol. - 1996. - Vol. 257, N 5. - P949-959 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: M. Bss H II, мультиспецифичная С5-цитозиновая ДНК-метилтрансфераза с необычными свойствами узнавания
Аннотация: В Bacillus stearothermophilus H3 была найдена новая мультиспецифичная C5-цитозиновая ДНК-метилтрансфераза. Ген M. BssH II был клонирован и секвенирован. Предсказанная аминокислотная последовательность показала план построения C5-метилазы. При помощи бисульфитного секвенирования ДНК определены следующие мишени метилирования: ACGCGT/CCGCGG (Mlu I/Sac II), PuGCGCPy (Hae II), PuCCGGPy (Cfr 10I) b GCGCGC (Bss H II). Расположение детерминант специфичности С5-метилазы было получено из анализа производных M. Bss H II, несущих делеции внутри вариабельной области "V", и химерных С5-метилаз, сконструированных из M. Bss H II и относительно моноспецифичного фермента M.'фи'3TII. Четыре разновидности M. Bss H II (Mlu I, Sac II, Cfr 10I и Bss H II) можно связать с аминокислотными сегментами в пределах вариабельной области "V". Детерминанту активности Hae II следует отнести к последовательностям, определяющим ферментный кор. Это первый пример С5-метилтрансферазы, в к-рой метилирующий потенциал опосредован структурами вне вариабельной области. Анализ химерного фермента из M. Bss HII и M.'фи'3TII показал уменьшение метилирующей способности, как в отношении узнаваемой последовательности, так и направленности метилирования в пределах этой последовательности. Германия, Mix-Planck-Inst. mol. Genet. Ihnestrasse 73, D-14195. Библ. 30
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ
МЕТИЛТРАНСФЕРАЗА BSSH II

ЦИТОЗИНОВАЯ

МУЛЬТИСПЕЦИФИЧНОСТЬ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Schumann, Judith; Walter, Jorn; Willert, Jurgen; Wild, Carola; Koch, Daniel; Trautner, Thomas A.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.147

    Bilcock, Denzil T.

    DNA restriction dependent on two recognition sites: Activities of the SfiI restriction-modification system in Escherichia coli [Text] / Denzil T. Bilcock, Stephen E. Halford // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 4. - P1243-1254 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Рестрикция ДНК, зависимая от двух сайтов распознавания: активность системы рестрикции-модификации SfiI в Escherichia coli
Аннотация: Эндонуклеаза SfiI отличается от рестриктаз II типа тем, что она является тетрамером, и для эффективной рестрикции ей необходимо связаться с ДНК в двух сайтах, и разрезание происходит также по обоим сайтам. Похоже, что эндонуклеаза SfiI используется скорее для перестроек ДНК, чем для рестрикции. В Escherichia coli получена экспрессия системы рестрикции-модификации SfiI, и в такой штамм введена плазмида, содержащая сайты рестрикции для SfiI. Если в плазмиде был 1 SfiI-сайт, то такая плазмида не рестрицировалась. Если же сайтов было 2 или больше, то рестрикция проходила успешно. Плазмида с метилированными SfiI-сайтами также не рестрицировалась. В плазмиде, выделенной из трансформантов, не было обнаружено перестроек. Похоже, что в E.coli система SfiI является системой рестрикции-модификации, но не рекомбинации. Великобритания, (Halford S. E.) Dep. of Biochem., School of Med. Sci., Univ. of Bristol, Univ. Walk, Bristol BS8 1TD. Библ. 51
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДНК

РЕСТРИКЦИЯ

МОДИФИКАЦИЯ

РЕКОМБИНАЦИЯ

РЕСТРИКТАЗА SFII

МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ


Доп.точки доступа:
Halford, Stephen E.

8.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 00.03-04Н1.7

   

    Multiple functional domains of AML1: PU.1 and C/EBP'альфа' synergize with different regions of AML1 [Text] / Martha S. Petrovick [et al.] // Mol. and Cell. Biol. - 1998. - Vol. 18, N 7. - P3915-3925 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Многочисленные функциональные домены AML1:PU.1 и C/EBP'альфа' синергически [взаимодействуют] с различными областями AML1
Аннотация: Функциональные взаимодействия активаторов транскрипции проанализировали на модели гена рецептора колониестимулирующего фактора макрофагов (M-CSF) человека, чувствительного к действию факторов PU.1, AML1 и C/EBP'альфа'. На зондах -71/-37 промотора рецептора, содержащих соотв. сайты узнавания, образуются тройные комплексы AML1-C/EBP'альфа'-ДНК и AML1-PU.1-ДНК. При этом runt-домен рекомбинантного AML1 связывается с ДНК кооперативно в присутствии bZip-домена C/EBP'альфа', а тройной комплекс с PU.1 формируется некооперативно. В системе in vitro PU.1 и AML1B способны ассоциировать друг с другом посредством своих ДНК-связывающих доменов, а в трансфектантах HeLa подобное взаимодействие приводит к синергической активации промотора рецептора M-CSF, к-рое зависит от активаторных доменов факторов. Аналогичный синергизм действия AML1 и C/EBP'альфа' также определяется активаторными доменами партнеров, но иным, нежели в случае взаимодействия AML1-PU.1, субдоменом AML1. Мутация в потенциальном сайте фосфорилирования AML1 не влияет на способность фактора к синергической активации. Обсуждают функциональную вариабельность AML1, в т. числе и на различных промоторах. США, Harvard Inst. Med., Boston, MA 02115. Библ. 80
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.03.02
Рубрики: РЕЦЕПТОРЫ
РЕЦЕПТОР КОЛОНИЕСТИМУЛИРУЮЩЕГО ФАКТОРА МАКРОФАГОВ

ГЕНЫ

M-CSF

ПРОМОТОРЫ

АКТИВАЦИЯ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

АКТИВАТОРЫ

PU.1, AML1 И C/EBP'АЛЬФА'

ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ДОМЕНЫ

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ СИНЕРГИЧЕСКОЕ


Доп.точки доступа:
Petrovick, Martha S.; Hiebert, Scott W.; Friedman, Alan D.; Hetherington, Christopher J.; Tenen, Daniel G.; Zhang, Dong-Er

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.293

    Knudsen, Thomas B.

    Probing the receptor recognition site of the FimH adhesin by fimbriae-displayed FimH-FocH hybrids [Text] / Thomas B. Knudsen, Per Klemm // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 7. - P1919-1929 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Зондирование сайта узнавания рецептора адгезина FimH проявляемыми гибридными фимбриями FcmH-FoCH
Аннотация: Фимбрии типа 1 (Ф-1) Escherichia coli опосредуют чувствительное к D-маннозе (I) связывание с поверхностью клеток хозяина при участии минорного компонента FimH (II). Для изучения домена связывания II сконструированы гибриды II и гомологичного белка FoCH (III) Ф-F1C, к-рые не связываются с D-маннозидами и не вызывают агглютинацию эритроцитов и дрожжей (АЭД). Слияния II-III, содержащие 72% N-конца II и комплементарную часть III, вызывают такую же АЭД, как и II. Слияния II-III, содержащие 56-66% N-конца II, связываются с клетками дрожжей и бусинками, покрытыми конъюгатом I - бычий сывороточный альбумин или одним I, но не вызывают АЭД. Слияния, содержащие не более 50% N-концевой области из II, почти не связываются с рецептором. Эти данные указали на присутствие в II сердцевинного домена, связывающегося с рецептором I. Сродство этого домена модулируется др. секторами II, придающими способность связываться с расширенными мишенями, содержащими I. Дания, Dep. Microbiol., Tech. Univ. Denmark, DK-2800 Lyngby. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АДГЕЗИНЫ
АДГЕЗИН FIMH

РЕЦЕПТОРЫ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ЗОНДИРОВАНИЕ

ГИБРИДНЫЕ ФИМБРИИ

FIMH-FOCH

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Klemm, Per

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 00.07-04М3.100

   

    Ligand recognition sites on P[2X] receptors studied by quantitative autoradiography of [{3}H]'альфа','бета'-methylene-ATP binding in rat brain [Text] / Rebecca A. Worthington [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1998. - Vol. 249, N 1. - P166-171 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Сайты узнавания лигандов на рецепторах P[2x], исследуемые количественной радиоавтографией связывания {3}H-'альфа','бета'-метилен-АТФ в мозгу крыс
Аннотация: Изучали влияние различных аналогов АТФ и родственных АТФ соединений на связывание {3}H-'альфа','бета'-метилен-АТФ (10 мкМ) с рецепторами P[2x] на тонких криостатных срезах мозга крыс. Показали, что сильным ингибирующим действием на связывание обладают два близких лиганду аналога, 3-О-(тринитрофенил)-АТФ и 'бета','гамма'-имидо-АТФ. Ингибирующая эффективность 'бета','гамма'-метилен-АТФ оказалась значительно ниже, а другие нуклеозидтрифосфаты, включая окисленный перйодатом АТФ и 1,N{6}-этено-АТФ, очень слабо влияют на связывание {3}H-'альфа','бета'-метилен-АТФ с рецепторами P[2x]. Т. обр. рецепторы P[2x] в мозгу крыс обладают очень строгими структурными требованиями к лигандам. Австралия, Dep. Anat. and Histol., Univ. Sydney, NSW 2006. Библ. 35
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.39.15.25.02
Рубрики: РЕЦЕПТОРЫ P[2X]
САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

СТРУКТУРНЫЕ ТРЕБОВАНИЯ

МОЗГ

КРЫСЫ


Доп.точки доступа:
Worthington, Rebecca A.; Hansen, Mitchell A.; Bennett, Maxwell R.; Barden, Julian A.; Balcar, Vladimir J.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI34) 00.12-04Т4.169

   

    Участки узнавания моноклональных антител А4 и А24 в молекуле 'альфа'-латротоксина [Текст] / В. Д. Лазарева [и др.] // Биоорган. химия. - 2000. - Т. 26, N 4. - С. 299-305 . - ISSN 0132-3423
Аннотация: Участки молекулы 'альфа'-латротоксина ('альфа'-LTX), связывающие функционально активные моноклональные антитела (МА) A4 и A24, локализованы с использованием трех подходов: гидролиз молекулы токсина и определение N-концевой аминокислотной последовательности иммунореактивных пептидов; изучение взаимодействия МА с несколькими рекомбинантными фрагментами 'альфа'-LTX; твердофазный ИФА синтетических перекрывающихся пептидов (6-8 аминокислотных остатков), соответствующих структуре иммунореактивного фрагмента 'альфа'-LTX. Показано, что эпитоп МA A4 находится в области F234-M294 молекулы белка, а МА A24 взаимодействуют с фрагментом 347FDKDIT352. Россия, Ин-т биоорг. химии РАН, Москва. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.47.21.29.13.13.23
Рубрики: 'АЛЬФА'-ЛАТРОТОКСИН
МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА A4 И A24

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

ЯД

КАРАКУРТЫ


Доп.точки доступа:
Лазарева, В.Д.; Бочарова, Н.Е.; Волынский, К.Е.; Волкова, Т.М.; Гришин, Е.В.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.89К

    Ширяев, С. А.

    Выделение и характеристика сайт-специфических эндонуклеаз из штаммов бактерий родов Bacillous и Staphylococcus [Текст] / С. А. Ширяев. - М. : МГУ, 2001. - 20 с. : ил.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: ЭНДОНУКЛЕАЗЫ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКИЕ

SSPD5 I

ОБНАРУЖЕНИЕ

SSD5 II

BSPF4 I

BSPLAF

BSPLA II

BSP LAIIIS

BSPMK I

BSUK29 I

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

САЙТЫ РЕСТРИКЦИИ ДНК

ОСНОВНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ

BACILLUS (BACT.)

STAPHYLOCOCCUS (BACT.)

Свободных экз. нет

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 05.02-04Б1.34

   

    Новые сайт-специфические эндонуклеазы F-TflI, F-TflII и F-TflIV, кодируемые бактериофагом T5 [Текст] / Н. В. Акуленко [и др.] // Молекул. биол. - 2004. - Т. 38, N 4. - С. 632-641 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Обнаружены новые сайт-специфические эндонуклеазы F-TflI, F-TflII и F-TflIV, относящиеся к семейству H-N-H. Они кодируются открытыми рамками считывания, расположенными в области генов тРНК бактериофага Т5. Показано, что эндонуклеаза F-TflIV вносит двухцепочечный разрыв в псевдопалиндромную последовательность ДНК длиной в 17 п. н., образуя 3'-выступающие концы из одного нуклеотида. В отличие от F-TflIV, эндонуклеазы F-TflI и F-TalII вносят одноцепочечные разрывы в несимметричные сильновырожденные последовательности ДНК, причем каждая из них - только в одну цепь (матричную или кодирующую). Анализ аминокислотных последовательностей исследуемых эндонуклеаз показал, что они обладают высокой гомологией в области H-N-H-мотива и С-концевой последовательности, формирующих предполагаемый каталитический домен, N-конец эндонуклеазы F-TflIV гомологичен последовательности, образующей HTH-домен LuxR-семейства транскрипционных регуляторов, который отвечает за связывание и узнавание ДНК. В N-концевой последовательности эндонуклеаз F-TflI и F-TflII выявлен составной мотив NUMOD4, обнаруживаемый также в предполагаемых узнающих доменах определенной группы H-N-H-эндонуклеаз. Высказано предположение о двухдоменной структуре эндонуклеаз F-TflI, F-TflII и F-TflIV - с N-концевым узнающим и C-концевым каталитическим доменами, а также об их эволюционном происхождении путем рекомбинации каталитического и узнающих доменов. Россия, Ин-т белка РАН, Пущино. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: H-N-H-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ
САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

УЗНАЮЩИЙ ДОМЕН

БЕСКЛЕТОЧНАЯ СИСТЕМА ТРАНСЛЯЦИИ

ГЕННАЯ КОНВЕРСИЯ

БАКТЕРИОФАГ T5


Доп.точки доступа:
Акуленко, Н.В.; Ивашина, Т.В.; Шалойко, Л.А.; Шляпников, М.Г.; Ксензенко, В.Н.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 89.10-04Б1.233

   

    Studies on DNA methylation and restriction processes by use of bacterial virus Т7 [Text] / D. H. Kruger [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1989. - Suppl. N13D. - P200 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Изучение процессов метилирования и рестрикции ДНК с использованием бактериального вируса Т7
Аннотация: Продукт гена ocr+ фага Т7 блокирует действие метилаз (I) и рестрикционных эндонуклеаз (II) типа I (Eco B, Eco K). Появление сайтов узнавания для I-II клас са II (EcoRII и I Eco Dam и EcoDcm) в геноме Т7 затруднено, а для действия II EcoRII необходимо присутствие в ДНК по меньшей мере 2-х сайтов узнавания. При наличии одного сайта он расщепляется II EcoRII лишь в присутствии др. чувствительной ДНК или олигонуклеотидов. Устойчивость ДНК Т7 к I-II типа III (Eco Р15) объясняется несимметричностью сайтов, в к-рых лишь одна нить может метилироваться. ГДР, Inst. of Med. Virology, Humboldt Univ., 1040 Berlin. Библ. 6.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ Т7

ДНК

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ФЕРМЕНТЫ

РЕСТРИКТАЗЫ

МЕТИЛАЗЫ

БЛОКИРОВКА ДЕЙСТВИЯ

БЕЛОК OCR+


Доп.точки доступа:
Kruger, D.H.; Bickle, T.A.; Reuter, M.; Pein, C.D.; Schroeder, C.

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.02-04Б2.450

    Rowland, S. -J.

    Characterization of the staphylococcal 'бета'-lactamase transposon Tn552 [Text] / S. -J. Rowland, K. G.H. Dyke // EMBO Journal. - 1989. - Vol. 8, N 9. - P2761-2773 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Характеристика 'бета'-лактамазного транспозона Tn552 стафилококков
Аннотация: Представлены результаты рестрикционного анализа и секвенирования одного из бета-лактамазных транспозонов Tn552 Staphylococcus aureus. Показано, что Tn552 генерирует по месту транспозиции образование прямых повторов из 6 пар оснований и подобно фагу Mu отличается концевыми нуклеотидами 5' TG...GA3'. На примере плазмиды p19789 показано действие системы транспозиции Tn552, при которой горячими точками для транспозиции являются сайты resR на плазмиде и resL на самом транспозоне. Представлены и обсуждаются схемы структурной организации сайтов рекомбинации для ферментов, регулирующих процесс транспозиции Tn552 и его аналогов Tn3, Tn21 и Tn917, проводится филогенетический анализ ферментов, участвующих в этих процессах (инвертазы и резольвазы). Ил. 12. Библ. 58. Великобритания, Microbiol. Unit, Dep. of Biochem. Univ. of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3QU.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.15.07
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
ШТАММ PS80

ТРАНСПОЗОНЫ

TN552

ТРАНСПОЗИЦИЯ

МЕХАНИЗМ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ФЕРМЕНТЫ

ФЕРМЕНТЫ ТРАНСПОЗИЦИИ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ


Доп.точки доступа:
Dyke, K.G.H.

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.05-04Б1.344

   

    Avoidance of DNA methylation. A virus-encoded methylase inhibitor and evidence for counterselection of methylase-recognition sites in viral genomes [Text] / D. H. Kruger [et al.] // Cell Biophys. - 1989. - Vol. 15, N 1-2. - P87-95 . - ISSN 0163-4992
Перевод заглавия: Избегание метилирования ДНК. Кодируемый вирусом ингибитор метилаз и доказательство контрселекции сайтов узнавания метилазами в вирусных геномах
Аннотация: Обзор. Продукт гена оcr фага Т7 специфически ингибирует ДНК-метилазы типа (M.EcoK и M.EcoB), а фаг Т3 кодирует S-аденозилметионингидролазу, разрушающую донор метильных групп и ответственную за полное отсутствие метилирования ДНК Т3. В геноме фага Т7 сайты dcm и dam, встречаются соответственно в 56 и 141 раз реже, чем следует ожидать из нуклеотидного состава ДНК. Сайты метилирования 5'-ЦГ представлены также в ограниченном кол-ве в геномах ДНК-содержащих вирусов животных. Осбуждаются также защита последовательностей узнавания в ДНК, в которых только одна нить может метилироваться (как в случае ECoP15 типа III) и первичная устойчивость сайтов узнавания к рестрикционной эндонуклеазе EcoRII типа II. ГДР, Inst. of Med. Virol., Humboldt Univ. School of Med. (Charite), Berlin 1040. Библ. 38.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07 + 341.25.29.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ Т7

И ДНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ

ГЕНОМ ВИРУСНЫЙ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

МЕТИЛАЗЫ

ОБЗОРЫ

И БИБЛ. 38


Доп.точки доступа:
Kruger, D.H.; Schroeder, C.; Santibanez-Koref, M.; Reuter, M.

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.05-04Б1.164

    Hardy, Stephen.

    E2F from adenovirus-infected cells binds cooperatively to DNA containing two properly oriented and spaced recognition sites [Text] / Stephen Hardy, Thomas Shenk // Mol. and Cell. Biol. - 1989. - Vol. 9, N 10. - P4495-4506 . - ISSN 0270-7306
Перевод заглавия: Фактор Е2F из клеток, зараженных аденовирусом, кооперативно связывается с ДНК, содержащей два правильно ориентированных и разделенных правильным расстоянием сайта узнавания
Аннотация: Изучали механизмы функционирования фактора Е2F в ходе аденовирусной (АВ) инфекции. Этот фактор обнаруживается и в незараженных Кл, но в АВ-зараженных Кл он активирует транскрипцию ранних областей Е1 и Е2 в геноме АВ. Перед геном Е2 АВ идентифицирован сайт связывания Е2F, представляющий собой две последовательности, расположенные в виде обратного повтора и разделенные участком длиной в 25 п. н. В данной работе показано, что в незараженных Кл содержится несколько форм Е2F, отличающихся по характеру связывания с узнаваемым участком ДНК перед геном Е2 АВ. Однако только в АВ-зараженных Кл обнаруживалась форма Е2F, к-рая кооперативно связывалась с двумя инвертированными сайтами, расположенными на расстоянии 25 п. н. Изменение расстояния между этими сайтами или их взаимной ориентации приводило к утрате этой специфической формой Е2F способности к прочному кооперативному связыванию. Делается вывод, что АВ-инфекция приводит к модификации одной из имеющихся в Кл формы Е2F, придающей этой форме способность кооперативно взаимодействовать с двумя инвертированными сайтами ДНК, разделенными расстоянием в 25 п. н. США, Howard Hughes Med. Inst., Dept. of Biology, Princeton Univ., Princeton, New Jersey 08540. Библ. 23.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: АДЕНОВИРУСЫ
ДНК

КЛЕТОЧНЫЙ ФАКТОР Е2F

СВЯЗЫВАНИЕ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

ВИРУСКЛЕТКА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ


Доп.точки доступа:
Shenk, Thomas

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.01-04Б2.358

   

    Dam methyltransferase sites located within the loop region of the oligopurine-oligopyrimidine sequences capable of forming H-DNA are undermethylated in vivo [Text] / Pawel Parniewski [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1990. - Vol. 18, N 3. - P605-611 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Сайты метилирования метилтрансферазой Dam, располагающиеся в петле олигопуриновой-олигопиримидиновой последовательности способной формировать H-ДНК, недометилируются in vivo
Аннотация: Изучали возможность образования in vivo так называемой Н-структуры ДНК. В данной работе для этой цели использовали процесс метилирования ДНК in vivo Dam-метилазой по последовательностям, расположенным рядом с пурпир-последовательностями, потенциально способными образовывать Н-ДНК. Показано, что in vivo последовательности ГАТЦ, расположенные рядом с пур-пир трактами, метилируются менее эффективно, чем аналогичные последовательности в др. участках ДНК. В то же время, следует подчеркнуть, что in vitro последовательности ГАТЦ, расположенные рядом с Н-ДНК, подвергались эффективному метилированию. Библ. 42. Польша, Centre of Mol. and Macromolecular Studies, Dep. of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sci., 90-362 Lodz, Sienkiewicza 112.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДНК

СТРУКТУРА Н-ДНК

ОБРАЗОВАНИЕ IN VIVO

МЕТИЛИРОВАНИЕ

МЕТИЛТРАНСФЕРАЗА DAM

Н-ДНК

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

СПЕЦИФИЧНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Parniewski, Pawel; Kwinkowski, Marek; Wilk, Andrzej; Klysik, Jan

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.03-04Б2.459

   

    Isolation of characterization of two sequence-specific endonucleases from the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6308 [Text] / Eva Foerg [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 1990. - Vol. 69, N 1-2. - P105-108 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Выделение и характеристика двух специфичных к определенной нуклеотидной последовательности эндонуклеаз из цианобактерии Synechocystis sp. PCC 6308
Аннотация: Из цианобактерии Synechocytis sp. PCC 6308 впервые выделены две рестриктазы, обозначенные synI и SynII. Приведены их характеристики. SynI, изошизомер известной рестриктазы AvaII, узнает последовательность 5'-ГГ(АТ) ЦЦ-3', а SynII, изомер XmnI, узнает нуклеотидную последовательность 5'-ГАА NNNNTTC-3'. США, Dep. of Biol. Sci., Wellesley College, Wellesley, MA.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: SYNECHOCYSTIS (BACT.)
ШТАММ PCC 6308

РЕСТРИКТАЗЫ

РЕСТРИКТАЗА SYNI

РЕСТРИКТАЗА SYNII

ВЫДЕЛЕНИЕ

ЖИДКОСТНАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ


Доп.точки доступа:
Foerg, Eva; Saporito, Laura; Huang, Sheila; Yang, Joy; Allen, Mary M.

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.07-04Б2.318

    De, Backer Olivier.

    Identification of the recognition sequence for the M*StyLTI methyltransferase of Salmonella typhimurium LT7: an asymmetric site typical of type-III enzymes [Text] / Backer Olivier De, Charles Colson // Gene. - 1991. - Vol. 97, N 1. - P103-107 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Идентификация последовательности узнавания для метилтрансферазы М*StyLJ7 Salmonella typhimurium LT7: асимметричный сайт, типичный для ферментов типа III
Аннотация: ДНК-метилтрансфераза М*StyLTI (I) системы рестрикции-модификации Salmonella typhimurium LT7, частично очищена из штамма Escherichia coli, экспрессирующего клонированный ген I, и использована для метилирования ДНК с известными последовательностями в присутствии S-аденозил-[мотил-{3}H]-метионина. Анализ модифицированных I ДНК показал, что I метилирует отмеченный остаток А в асимметрич., невырожденном пентануклеотиде 5'-ГТЦТЦ-5'. Асимметрия сайта действия I позволяет отнести 1 к модифицирующим ДНК-метилтрансферазам класса III. Библ. 21. (C. Colson]. Бельгия, Unite de Genetique, Universite Cathologue de Louvain, B-1348 Louvain- La-Neuve.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)
ШТАММ LT7

ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗЫ

ДНК-МЕТИЛТРАНСФЕРАЗА МXSTYLT1

ТИП III

СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ДНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

САЙТЫ УЗНАВАНИЯ

АССИММЕТРИЧНЫЙ ПЕНТАНУКЛЕОТИД


Доп.точки доступа:
Colson, Charles

 1-20    21-23 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)