СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ<.>)

Общее количество найденных документов : 36
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-36

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.02-04Б1.071

Thomson, Brian J.
Structure and heterogeneity of the 'альфа' sequences of human herpesvirus 6 strain variants U1102 and Z29 and identification of human telomeric repeat sequences at the genomic termini [Text] / Brian J. Thomson, Steven Dewhurst, Diane Gray // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 5. - P3007-3014
Перевод заглавия: Структура и гетерогенность последовательностей 'альфа' штаммовых вариантов U 1102 и Z 29 герпесвируса человека 6 и идентификация человеческих теломерных повторных последовательностей на геномном конце
Аннотация: Известно, что геномная единица герпесвируса 6 (ГВ-6) человека состоит из единичного уникального компонента U, связанного с повторами DR и DR, образующими конкатомер "хвост-голова" в течение продуктивной инфекции. В конце генома герпесвируса находятся ЦИС-элементы (или 'альфа'-последовательности), которые опосредуют расщепление и упаковку образующихся вирионов. Исследовали варианты ГВ-6 - U1102 и Z29, проводя секвенирование геномных концов соединений U-DR и DRDR. Показано, что человеческие теломерные повторные последовательности образуют часть последовательностей 'альфа' ГВ-6, а аранжировка последовательностей 'альфа' в геноме вируса представлена как 'альфа'DR'альфа'-U-'альфа'-DR'альфа'. Великобритания, Dep. of Med., Addenbrooke's Hosp., Cambridge CB2 2QQ. Библ. 61.

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ГЕРПЕСВИРУСЫ
ГЕРПЕСВИРУС ЧЕЛОВЕКА ТИПА 6
ШТАММОВЫЕ ВАРИАНТЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СТРУКТУРА
ГЕТЕРОГЕННОСТЬ

Доп.точки доступа:
Dewhurst, Steven; Gray, Diane

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.12-04Б1.384

Determination and comparative analysis of the small RNA genomic sequences of California encephalitis, Jamestown Canyon, Jerry Slough, Melao, Keystone and Trivittatus viruses (Bunyaviridae, genus Bunyavirus, California serogroup) [Text] / Michael D. Bowen [et al.] // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 3. - P559-572 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Обнаружение и сравнительный анализ геномных последовательностей малых РНК вирусов калифорнийского энцефалита, каньона Джеймстоун, болот Джерри, Мелао, Кейстоун, Тривиттатус (Bunyaviridae, род Bunyavirus, серогруппа Калифорния)
Аннотация: Определена нуклеотидная последовательность малых (S) геномных РНК шести представителей буньявирусов серогруппы Калифорния. РНК содержали перекрывающиеся открытые рамки считывания белка нуклеокапсида N и неструктурного белка NSs. Все открытые рамки считывания белка нуклеокапсида N имели длину в 708 нуклеотидов и кодировали полипептид из 235 аминокислотных остатков. Рамки считывания неструктурного белка кодировали полипептиды из 92 или 97 аминокислотных остатков. Высокий консерватизм показан для комплементарных концевых и богатых пурином последовательностей 3'-концевой некодирующей области малых РНК. США, Univ. of California at Berkeley, Berkeley, CA 94720. Библ. 69

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.31
Рубрики: БУНЬЯВИРУСЫ
СЕРОГРУППА КАЛИФОРНИЯ
РНК МАЛЫЕ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Bowen, Michael D.; Jackson, Andrew O.; Bruns, Thomas D.; Hacker, David L.; Hardy, James L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.06-04Б1.72

Genomic sequences increase adenoviral vector-mediated factor IX expression 1.900 fold and enable sustained expression in vivo [Text] : abstr. Keystone Symp. Gene Ther. and Mol. Med., Steamboat Springs, Colo, March 26-Apr.1, 1995 / Michael Kaleko [et al.] // J. Cell. Biochem. - 1995. - Suppl. 21a. - P366 . - ISSN 0730-2312
Перевод заглавия: Геномные последовательности увеличивают опосредованную аденовирусным вектором экспрессию фактора IX в 1900 раз и обеспечивают длительную экспрессию in vivo
Аннотация: Сконструированный аденовирусный вектор (АВВ) Av1H9B, несущий кДНК фактора свертывания IX (I), отсутствующего при гемофилии В, вызывает экспрессию I в терапевтическом количестве лишь при высоких, гепатотоксичных дозах. Сконструированы 3 новых АВВ: Av1H9D, Av1H9E и Av1H9F -, содержащие, кроме кДНК I, геномные последовательности гена I. Все эти АВВ содержат 5'-лидерную область I. Av1H9D имеет также 3'-нетранслируемую область, AvH9E несет укороченный в центре первый интрон, а AvH9F содержит 3'-нетранслируемую область и интрон. После трансдукции АВВ клеток HepG2 уровень I в культуральной среде составлял 1-3 мкг/мл в случае АВВ B, D и E и 12 мкг/мл в случае АВВ F, что связано с увеличением накопления мРНК I. При введении 5 иммунокомпетентным взрослым мышам этих ААВ в дозе 10{9} б. о. е., вызывающей слабый гепатотоксический эффект, уровень I в плазме для АВВ B, D, E и F составлял соотв. 80, 335, 2024 и 151000 нг/мл. В случае АВВ B уровень I возвращался к исходному через 10 нед, а в случае АВВ D и E терапевтический уровень I сохранялся в течение 6-8 мес. США, Genetic Therapy, Inc., Gaitherburg, MD 20878

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.39
Рубрики: ГЕМОФИЛИЯ B
ГЕНОТЕРАПИЯ
АДЕНОВИРУСЫ
ВЕКТОРЫ
КОНСТРУИРОВАНИЕ
ФАКТОР IX
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ДЛИТЕЛЬНАЯ ЭКСПРЕССИЯ

Доп.точки доступа:
Kaleko, Michael; Kayda, Dawn; Sakhuja, Kiran; Mehaffey, Michele; McClelland, Alan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.07-04Б1.15

The intracellular polymerase chain reaction for small CMV genomic sequences within heavily infected cellular sections [Text] / R. A. Ray [et al.] // J. Pathol. - 1995. - Vol. 177, N 2. - P171-180 . - ISSN 0022-3417
Перевод заглавия: Внутриклеточная полимеразная цепная реакция для мелких геномных последовательностей CMV внутри тяжелоинфицированных клеточных срезов
Аннотация: Непрямая внутриклеточная полимеразная цепная реакция (in situ ПЦР) связывает потенциальную чувствительность ПЦР с высокой специфичностью и морфологической сохранностью гибридизации in situ (ISH). Описан метод амплификации мелких, специфических цитомегаловирусных геномных последовательностей внутри больших тканевых парафиновых срезов, фиксированных формалином. Устойчивый к нагреванию клей окружает срез, при этом создается большой объем изотонического раствора без покрытия минеральным маслом. Это оптимизирует морфологическую сохранность, дает возможность делать большие срезы и проводить денатурации и циклы ПЦР (до 40) in situ. Проводилась ISH с использованием неизотопной пробы ДНК специфической для CMV с предварительной амплификацией in situ ПЦР или без нее на стеклах с фибробластами и тканями легких и в суспензии. Образцы на стеклах анализировались как в темном поле, так и в отраженном свете сравнением интенсивности сигнала и числом позитивных клеточных определений с внутриклеточной амплификацией и без нее. Клеточные суспензии анализировались в темном поле и гельэлектрофорезом клеточных лизатов. В предложенной высококопируемой модели достигнута удачная внутриклеточная амплификация. Великобритания, Univ. Dep. of Med., Royal Free Hosp. Sch. of Med., Rowland Hill Street London NW3 2PF. Библ. 33

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: ЦИТОМЕГАЛОВИРУСЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ТКАНЕВЫЕ СРЕЗЫ
МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ГИБРИДИЗАЦИЯ IN SITU
СОВМЕЩЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Ray, R.A.; Smith, M.; Sim, R.; Nystrom, M.; Pounder, R.E.; Wakefield, A.J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.12-04Б1.14

Natarajan, Dipa.
Isolation of genomic sequences flanking a retroviral insertion site using a novel PCR-based method [Text] / Dipa Natarajan, Catherine A. Boulter // Gene. - 1995. - Vol. 161, N 2. - P195-198 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Выделение геномных последовательностей, фланкирующих сайт вставки ретровируса, с использованием нового основанного на ПЦР метода
Аннотация: Разработан новый, основанный на ПЦР метод выделения геномных последовательностей, фланкирующих сайты ретровирусных вставок. Метод основан на направленном клонировании рестрикционных фрагментов геномной ДНК в множественный сайт клонирования плазмид типа pUC, выделении рекомбинантных плазмид из фонда трансформированных колоний Escherichia coli и ПЦР-амплификации с праймерами, специфичными для вектора pUC и длинных концевых повторов ретровирусов. Этот простой метод может быть приспособлен для быстрого выделения любых геномных последовательностей, меченных вставкой чужеродной ДНК. Великобритания, Dep. Genetics, Univ. Cambridge, Cambridge CB2 3EH. Библ. 17

ГРНТИ	34.25.05

ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: ДНК
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
РЕТРОВИРУСЫ
ВСТАВКИ
ФЛАНКИРУЮЩИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
МЕТОДЫ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
МЫШИ
ИНСЕРЦИОННЫЙ МУТАГЕНЕЗ

Доп.точки доступа:
Boulter, Catherine A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.02-04Б1.302

Retrovirus-like particles released from the human breast cancer cell line T47-D display type B- and C-related endogenous retroviral sequences [Text] / Wolfgang Seifarth [et al.] // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 10. - P6408-6416 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Ретровирусные частицы, образующиеся в линии клеток T47-D рака молочной железы человека обнаруживают наличие последовательностей, связанных с эндогенными ретровирусами типа В и C
Аннотация: Из очищенных ретровирусоподобных частиц линии клеток T47-D рака молочной железы человека амплифицированы с помощью праймеров консервативной области гена pol ретровирусов три различных типа ретровирусных последовательностей (MLN, FRD и FTD). Скрининг геномной библиотеки человека позволил отнести последовательности MLN к последовательностям эндогенного происхождения, родственным семейству многокопийных эндогенных человеческих ретровирусных элементов, а последовательности FRD и FTD к низкокопийным элементам гаплоидного генома человека. Германия, Univ. of Heidelberg, D-68305 Mannheim. Библ. 59

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.17.23.02
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ
ВИРУСОПОДОБНЫЕ ЧАСТИЦЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКИ
РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЧЕЛОВЕКА

Доп.точки доступа:
Seifarth, Wolfgang; Skladny, Heyko; Krieg-Schneider, Frank; Reichert, Anja; Hehlmann, Rudiger; Leib-Mosch, Christine

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 97.02-04Н1.383

Retrovirus-like particles released from the human breast cancer cell line T47-D display type B- and C-related endogenous retroviral sequences [Text] / Wolfgang Seifarth [et al.] // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 10. - P6408-6416 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Ретровирусные частицы, образующиеся в линии клеток T47-D рака молочной железы человека обнаруживают наличие последовательностей, связанных с эндогенными ретровирусами типа В и C
Аннотация: Из очищенных ретровирусоподобных частиц линии клеток T47-D рака молочной железы человека амплифицированы с помощью праймеров консервативной области гена pol ретровирусов три различных типа ретровирусных последовательностей (MLN, FRD и FTD). Скрининг геномной библиотеки человека позволил отнести последовательности MLN к последовательностям эндогенного происхождения, родственным семейству многокопийных эндогенных человеческих ретровирусных элементов, а последовательности FRD и FTD к низкокопийным элементам гаплоидного генома человека. Германия, Univ. of Heidelberg, D-68305 Mannheim. Библ. 59

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.21.11.07.09
Рубрики: РЕТРОВИРУСЫ
ВИРУСОПОДОБНЫЕ ЧАСТИЦЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКИ
РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЧЕЛОВЕКА

Доп.точки доступа:
Seifarth, Wolfgang; Skladny, Heyko; Krieg-Schneider, Frank; Reichert, Anja; Hehlmann, Rudiger; Leib-Mosch, Christine

РЖ ВИНИТИ 76 (BI11) 98.06-04Б1.389

Detection of hepatitis C virus genomic sequences in the cerebrospinal fluid of HIV-infected patients [Text] / Giulia Morsica [et al.] // J. Med. Virol. - 1997. - Vol. 53, N 3. - P252-254 . - ISSN 0146-6615
Перевод заглавия: Выявление геномных последовательностей вируса гепатита С в спинномозговой жидкости ВИЧ-инфицированных больных
Аннотация: У 21 HCV/ВИЧ-инфицированного больного определяли одновременно в сыворотке и спинномозговой жидкости (СМЖ) РНК HCV. РНК была обнаружена в сыворотке 19 из 21 (90,4%) больных и в СМЖ у 5 из 19 с наличием РНК в сыворотке. Генотипы вируса в сыворотке и СМЖ были идентичными, зависимости наличия РНК в СМЖ от генотипа вируса выявлено не было. Наличие вирусной РНК в СМЖ не влияло заметным образом на уровень виремии. Возможно, ЦНС функционирует как резервуар HCV. Италия, Infect. Dis. Dep., San Raffaele Scientific Inst., Via Stamira d'Ancona 20, 20127 Milano

ГРНТИ	76.03.41

ВИНИТИ 761.03.41.02
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫЯВЛЕНИЕ
СМЖ
ВИЧ-ИНФИЦИРОВАННЫЕ ЛИЦА

Доп.точки доступа:
Morsica, Giulia; Bernardi, Maria Teresa; Novati, Roberto; Foppa, Caterina Uberti; Castagna, Antonella; Lazzarin, Adriano

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.12-04Б1.327

In vivo tropism of hepatitis C virus genomic sequences in hematopoietic cells: Influence of viral load, viral genotype, and cell phenotype [Text] / Herve Lerat [et al.] // Blood. - 1998. - Vol. 91, N 10. - P3841-3849 . - ISSN 0006-4971
Перевод заглавия: Тропизм in vivo геномных последовательностей вируса гепатита С (ВГС) в клетках гемопоэза: влияние вирусной нагрузки, вирусного генотипа и клеточного фенотипа
Аннотация: Проанализировано влияние ряда вирусных и клеточных факторов на частоту обнаружения генов ВГС в гемопоэтических клетках 38 хронических б-ных. 19 из них были инфицированы изолятами генотипа 1 (1а и 1b), 13 - изолятами других генотипов (2а/с, 3а и 4) и 6 коинфицированы изолятами генотипов 1 и 6. Содержание вируса в сыворотке, варьировавшее от 2*10{5} до 161*10{5} эквивалентов генома на мл, не влияло на частоту обнаружения с помощью полимеразной цепной р-ции как "плюс"-, так и "минус"-нити РНК в мононуклеарах периферической крови (МНПК): та и другая обнаруживались у всех трех групп пациентов с частотой 15-100% и 8-83,3%, соотв. У коинфицированных лиц частота обнаружения во всех случаях превышала 80%. У б-ных, инфицированных изолятами генотипа 1, частота обнаружения как "плюс"-, так и "минус"-нити РНК была выше по сравнению с другими генотипами (Р0,001 и Р0,04, соотв.). Обе нити обнаруживались во фракциях полиморфоядерных лейкоцитов, моноцитов/макрофагов и В-лимфоцитов и никогда не присутствовали в Т-лимфоцитах. Делается заключение, что геномные последовательности ВГС можно обнаружить в МНПК хронически инфицированных лиц независимо от вирусной нагрузки, при этом местом их обитания являются специфические субпопуляции клеток. Франция, INSERM U271, Lyon. Библ. 49

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.21
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
ТРОПИЗМ
ВИРУСНАЯ НАГРУЗКА
ГЕНОТИПЫ
ГЕМОПОЭТИЧЕСКИЕ КЛЕТКИ
БОЛЬНЫЕ

Доп.точки доступа:
Lerat, Herve; Rumin, Sylvie; Habersetzer, Francois; Berby, Francoise; Trabaud, Mary-Anne; Trepo, Christian; Inchauspe, Genevieve

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 00.08-04А3.91

Ежов, А. А.
NEGATRON: нейросетевой пакет программ для анализа скрытых повторов в геномных последовательностях ДНК [Текст] / А. А. Ежов, А. Г. Токаев, В. Р. Чечеткин // Науч. сес. МИФИ-99: Всерос. науч.-техн. конф. "Нейроинформат-99", Москва, 20-22 янв., 1999. - М., 1999. - Ч.3. - С. 182-188 . - ISBN 5-7262-0268-6
Аннотация: Описан нейросетевой пакет программ, предназначенный для поиска скрытых повторов в геномных последовательностях ДНК. Приведен пример использования пакета для решения задачи предсказания структуры белка PTCH, изменения, в которой связаны с возникновением базальноклеточного рака кожи. Россия, Троицкий Ин-т инновационных и термоядерных исследований. Ил. 2. Библ. 10

ГРНТИ	34.53.19

ВИНИТИ 341.53.19.09
Рубрики: НЕЙРОННЫЕ СЕТИ
ПРОГРАММЫ
НЕЙРОСЕТЕВОЙ ПАКЕТ NEGATRON
ДНК
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СКРЫТЫЕ ПОВТОРЫ
ЗАБОЛЕВАНИЯ
РАК КОЖИ

Доп.точки доступа:
Токаев, А.Г.; Чечеткин, В.Р.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.35

Koike, Hideaki.
Enzymes idenfitied using genomic DNA sequences suggest some atypical characteristics of de novo biosynthesis of purines in archaebacteria [Text] / Hideaki Koike, Tsuyoshi Kawashima, Masashi Suzuki // Proc. Jap. Acad. B. - 1999. - Vol. 75, N 9. - P263-268 . - ISSN 0386-2208
Перевод заглавия: Ферменты, идентифицированные с использованием геномных последовательностей ДНК, свидетельствуют о некоторых нетипичных характеристиках путей биосинтеза пуринов de novo у архебактерий
Аннотация: С использованием полных геномных последовательностей ДНК семи архебактерий идентифицированы гены, кодирующие ферменты, к-рые, как предполагают, участвуют в биосинтезе de novo нуклеотидов. У Aeropyrum pernix не обнаружено ферментов, опосредующих путь, ведущий к синтезу инозинмонофосфата, и начинающийся от 5-фосфорибозил-1-пирофосфата и глутамина. Ни у одной из семи архебактерий не найдено генов, кодирующих ферменты, синтезирующие ГДФ из ГМФ. Предполагается, что эти существенные этапы катализируют еще не идентифицированные ферменты. Идентифицированные ферменты архебактерий в основном ближе к ферментам E. coli, чем к дрожжевым, в частности, по количеству пептидов, составляющих целый фермент. Япония, (M. Suzuki) AIST-NIBHT CREST Ctr. Of Structural Biol., 1-1 Higashi, Tsukuba 305-0046. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: АРХЕБАКТЕРИИ
AEROPYRUM PERNIX (BACT.)
НУКЛЕОТИДЫ
ПУРИНЫ
БИОСИНТЕЗ
ПУТИ
ФЕРМЕНТЫ
НЕТИПИЧНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
ДНК
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Kawashima, Tsuyoshi; Suzuki, Masashi

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 01.03-04Б3.118

Koike, Hideaki.
Enzymes idenfitied using genomic DNA sequences suggest some atypical characteristics of de novo biosynthesis of purines in archaebacteria [Text] / Hideaki Koike, Tsuyoshi Kawashima, Masashi Suzuki // Proc. Jap. Acad. B. - 1999. - Vol. 75, N 9. - P263-268 . - ISSN 0386-2208
Перевод заглавия: Ферменты, идентифицированные с использованием геномных последовательностей ДНК, свидетельствуют о некоторых нетипичных характеристиках путей биосинтеза пуринов de novo у архебактерий
Аннотация: С использованием полных геномных последовательностей ДНК семи архебактерий идентифицированы гены, кодирующие ферменты, к-рые, как предполагают, участвуют в биосинтезе de novo нуклеотидов. У Aeropyrum pernix не обнаружено ферментов, опосредующих путь, ведущий к синтезу инозинмонофосфата, и начинающийся от 5-фосфорибозил-1-пирофосфата и глутамина. Ни у одной из семи архебактерий не найдено генов, кодирующих ферменты, синтезирующие ГДФ из ГМФ. Предполагается, что эти существенные этапы катализируют еще не идентифицированные ферменты. Идентифицированные ферменты архебактерий в основном ближе к ферментам E. coli, чем к дрожжевым, в частности, по количеству пептидов, составляющих целый фермент. Япония, (M. Suzuki) AIST-NIBHT CREST Ctr. Of Structural Biol., 1-1 Higashi, Tsukuba 305-0046. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.25
Рубрики: АРХЕБАКТЕРИИ
AEROPYRUM PERNIX (BACT.)
НУКЛЕОТИДЫ
ПУРИНЫ
БИОСИНТЕЗ
ПУТИ
ФЕРМЕНТЫ
НЕТИПИЧНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
ДНК
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Kawashima, Tsuyoshi; Suzuki, Masashi

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.06-04Б1.151

Genomic sequences of bacteriophages HK97 and HK022: Pervasive genetic mosaicism in the lambdoid bacteriophages [Text] / Robert J. Juhala [et al.] // J. Mol. Biol. - 2000. - Vol. 299, N 1. - P27-51 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Геномные последовательности бактериофагов HK97 и HK022: широко распространенный генетический мозаицизм у лямбдоидных бактериофагов
Аннотация: Определены полные последовательности геномных днДНК фагов HK97 (39 732 п. н.) и HK022 (40 751 п. н.) Escherichia coli - членов лямбдоидной группы фагов. Сравнение этих последовательностей друг с другом и с фагами 'лямбда' E. coli и P22 Salmonella typhimurium подтвердило, что эти фаги являются генетич. мозаиками, у к-рых мозаичные сегменты разделены резкими переходами в последовательности. Это доказало, что главным компонентом эволюции лямбдоидных фагов является горизонтальный перенос генетич. материала. Предложена модель эволюции, в к-рой генетич. разнообразие порождается сочетанием незаконной и гомологич. рекомбинации и мутационного сдвига, а селекция по ф-циям порождает популяцию, в к-рой большинство выживающих мозаичных границ расположено на границах генов и иногда на границах белковых доменов в генах. Сравнительный анализ позволил приписать ф-ции генам и др. генетич. элементам. Приведены примеры генов общей рекомбинации фагов HK97, HK022 и P22 и предполагаемого белка-адаптора головки и хвостового отростка фагов HK97 и HK022. Сравнительный анализ позволил идентифицировать новый класс элементов - "мороны", к-рые состоят из кодирующей белок области, фланкированной промоторами типа 'сигма'{70} и не зависящим от факторов терминатором транскрипции. Все мороны расположены между 2 генами, к-рые являются смежными у других фагов. Мороны, вероятно, являются автономными генетич. модулями, к-рые экспрессируются из внутриклеточных профагов. Сравнение последовательностей моронов позволило предположить, что они сравнительно недавно вошли в фаговые геномы по механизму горизонтального переноса. США, Dep. Biol. Studies, Univ. Pittsburgh, Pittsburgh, PA 15260. Библ. 66

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ЛЯМБДОИДНЫЙ ФАГ HK97
ЛЯМБДОИДНЫЙ ФАГ HK022
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МАЗАИЦИЗМ
ЭВОЛЮЦИЯ
ФАГ ЛЯМБДА
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС ГЕНОВ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Juhala, Robert J.; Ford, Michael E.; Duda, Robert L.; Youlton, Anthony; Hatfull, Graham F.; Hendrix, Roger W.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.09-04Б2.51

Multienzyme complexes in the archaea: Predictions from genome sequences [Text] / M. J. Danson [et al.] // Halophiles 2001: International Conference on Halphilic Microorganisms, Sevilla, 23-27 Sept., 2001. - Sevilla, 2001. - PL18
Перевод заглавия: Мультиферментные комплексы у архей: предсказания на основании геномных последовательностей
Аннотация: Центральной р-цией, связывающей катаболизм сахаров с метаболизмом липидов, является окислительное декарбоксилирование пирувата с образованием ацетил-коА. У эукариот и большинства аэробных бактерий эта р-ция катализируется пируват-дегидрогеназным комплексом (ПДК), содержащим множественные копии 3 ферментов и представляющим одну из наиболее крупных мультиферментных систем клетки (Мол. масса 6*10{6}). Аналогичные комплексы дегидрогеназ 2-оксикислот катализируют превращение 2-оксоглутарата в сукцинил-коА (в ЦТК) и окислительное декарбоксилирование 2-оксикислот, образуемых при катаболизме аминокислот. Центральную роль в каждом комплексе играет ковалентно связанный кофактор, липоевая к-та. У архей активности комплексов дегидрогеназы 2-оксикислот никогда не удавалось обнаружить, у них аналогичные р-ции катализируют более простые оксидоредуктазы 2-оксокислот. Однако у Haloferax volcanii обнаружен оперон генов, имеющих высокую степень родства с компонентами ПДК грамположительных бактерий, имеются четкие указания на присутствие в клетках галобактерий компонентов ПДК и липоевой к-ты. Сходные опероны обнаружены в геноме Halobacterium NRC1, их наличие предполагают у Aeropyrum pernix, Thermoplasma acidophilum, Sulfolobus solfataricus, но они не обнаружены у Archaeoglobus fulgidus и Pyrococcus horikoshii. Обсуждается значение исследования ПДК для понимания эволюции центрального метаболизма в 3 доменах живого, а также изучения механизмов ассоциации ферментов в крупные комплексы в экстремальных условиях (при высокой солености и т-ре до 105'ГРАДУС'C). Великобритания, Dep. of Biol. and Biochem., Univ. of Bath, Bath BA2 7AY. Библ. 2

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: МУЛЬТИФЕРМЕНТНЫЕ КОМПЛЕКСЫ
ПИРУВАТДЕГИДРОГЕНАЗНЫЙ КОМПЛЕКС
ЛИПОЕВАЯ КИСЛОТА
УЧАСТИЕ В ЦЕНТРАЛЬНОМ МЕТАБОЛИЗМЕ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АНАЛИЗ
АРХЕБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Danson, M.J.; Morgan, D.J.; Hough, D.W.; Dyall-Smith, M.L.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 02.09-04Б3.84

Multienzyme complexes in the archaea: Predictions from genome sequences [Text] / M. J. Danson [et al.] // Halophiles 2001: International Conference on Halphilic Microorganisms, Sevilla, 23-27 Sept., 2001. - Sevilla, 2001. - PL18
Перевод заглавия: Мультиферментные комплексы у архей: предсказания на основании геномных последовательностей
Аннотация: Центральной р-цией, связывающей катаболизм сахаров с метаболизмом липидов, является окислительное декарбоксилирование пирувата с образованием ацетил-коА. У эукариот и большинства аэробных бактерий эта р-ция катализируется пируват-дегидрогеназным комплексом (ПДК), содержащим множественные копии 3 ферментов и представляющим одну из наиболее крупных мультиферментных систем клетки (Мол. масса 6*10{6}). Аналогичные комплексы дегидрогеназ 2-оксикислот катализируют превращение 2-оксоглутарата в сукцинил-коА (в ЦТК) и окислительное декарбоксилирование 2-оксикислот, образуемых при катаболизме аминокислот. Центральную роль в каждом комплексе играет ковалентно связанный кофактор, липоевая к-та. У архей активности комплексов дегидрогеназы 2-оксикислот никогда не удавалось обнаружить, у них аналогичные р-ции катализируют более простые оксидоредуктазы 2-оксокислот. Однако у Haloferax volcanii обнаружен оперон генов, имеющих высокую степень родства с компонентами ПДК грамположительных бактерий, имеются четкие указания на присутствие в клетках галобактерий компонентов ПДК и липоевой к-ты. Сходные опероны обнаружены в геноме Halobacterium NRC1, их наличие предполагают у Aeropyrum pernix, Thermoplasma acidophilum, Sulfolobus solfataricus, но они не обнаружены у Archaeoglobus fulgidus и Pyrococcus horikoshii. Обсуждается значение исследования ПДК для понимания эволюции центрального метаболизма в 3 доменах живого, а также изучения механизмов ассоциации ферментов в крупные комплексы в экстремальных условиях (при высокой солености и т-ре до 105'ГРАДУС'C). Великобритания, Dep. of Biol. and Biochem., Univ. of Bath, Bath BA2 7AY. Библ. 2

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.07
Рубрики: МУЛЬТИФЕРМЕНТНЫЕ КОМПЛЕКСЫ
ПИРУВАТДЕГИДРОГЕНАЗНЫЙ КОМПЛЕКС
ЛИПОЕВАЯ КИСЛОТА
УЧАСТИЕ В ЦЕНТРАЛЬНОМ МЕТАБОЛИЗМЕ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АНАЛИЗ
АРХЕБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Danson, M.J.; Morgan, D.J.; Hough, D.W.; Dyall-Smith, M.L.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.07-04Б1.383

Genetic analysis of full-length genomes and subgenomic sequences of TT virus-like mini virus human isolates [Text] / Philippe Biagini [et al.] // J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82, N 2. - P379-383 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Генетический анализ полноразмерных геномов и субгеномных последовательностей изолятов минивируса, похожего на вирус ТТ
Аннотация: Изучены филогенетич. взаимоотношения целых геномных последовательностей 10 японских и одного французского изолятов похожего на вирус ТТ (ВТТ) минивируса (МВТТ). Анализ вариабельности нуклеотидных последовательностей и обнаружение сигнатурных картин для перекрывающихся генов позволил предположить, что у МВТТ функциональны открытые рамки считывания 1 и 2, но не 3. Во всем геноме МВТТ идентифицировано несколько нуклеотидных или аминокислотных последовательностей, консервативных среди цирковирусов, включая ВТТ и вирус анемии цыплят. Филогенетич. анализ установили 3 главные группы МВТТ и обнаружил предполагаемые точки рекомбинации в некодирующей области. Геномы МВТТ обнаружены в плазме 38 из 50 французских доноров крови, а также в моноядерных клетках периферич. крови, в фекалиях и слюне. Филогенетич. анализ 37 штаммов МВТТ из Франции, Японии и Бразилии показал, что их генетич. группировка не связана с географич. происхождением. Франция, Lab. Virol. Mol., Etablissement Francais du Sang "Aples-Mediterranee", 13005 Marseille. Библ. 7

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.21
Рубрики: ВИРУС ТТ
МИНИВИРУСЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВЗАИМОСВЯЗИ

Доп.точки доступа:
Biagini, Philippe; Gallian, Pierre; Attoui, Houssam; Touinssi, Mhammed; Cantaloube, Jean-Francois; de, Micco Philippe; de, Lamballerie Xavier

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.07-04Б1.441

Detection of human and animal rotavirus sequences in drinking water [Text] / B. Gratacap-Cavallier [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66, N 6. - P2690-2692 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Выявление последовательностей нуклеотидов ротавирусов человека и животных в питьевой воде
Аннотация: Провели анализ методом ревертазы/полимеразной цепной реакции (Р/ПЦР) питьевой воды в домах 56 детей заболевших ротавирусным гастроэнтеритом. В 4-х пробах обнаружили присутствие генома ротавируса (РВ). Эти штаммы отличались от человеческих РВ, выделенных из фекалий больных детей. Это было доказано с помощью секвенирования фрагментов амплифицированного гена VP7. Три из них происходили от млекопитающих: свиньи или быка. Один принадлежал к РВ человека. Франция, Lab. de Virol., Centre Hospitalier Universitaire, 38043 Grenoble Cedex 09. Библ. 18

ГРНТИ	34.25.39

ВИНИТИ 341.25.39.11
Рубрики: РОТАВИРУСЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ПИТЬЕВАЯ ВОДА

Доп.точки доступа:
Gratacap-Cavallier, B.; Genoulaz, O.; Brengel-Pesce, K.; Soule, H.; Innocenti-Francillard, P.; Bost, M.; Gofti, L.; Zmirou, D.; Seigneurin, J.M.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 04.04-04А1.78

House, Christopher H.
Genomic tree of eukaryotes [Text] : докл.[13 International Conference on the Origin of Life, Oaxaca, June 30-July 5,2002] / Christopher H. House, Sorel T. Fitz-Gibbon // Orig. Life and Evol. Bios. - 2002. - Vol. 32, N 5-6. - P493-494 . - ISSN 0169-6149
Перевод заглавия: Геномное древо эукариот
Аннотация: Несмотря на многолетние исследования, филогенетические взаимоотношения непротистовых эукариот остаются неясными. В частности, объединение животных и грибов при исключении из этой группы растений очень слабо выявляется при анализе единичных генов, а положение нематод относительно других фил животных весьма дискуссионно. Хотя нематоды, имеющие псевдоцелом, традиционно помещаются в базальное положение относительно животных с настоящим целомом (Coelomata), тем не менее недавний анализ 18S pРНК отвел нематодам место в кладе Ecdysozoa, включающей линяющих животных, имеющих кутикулу, в т.ч., Arthropoda. Такая альтернативная филогения (гипотеза Ecdysozoa) обладает большой привлекательностью, особенно в биологии развития, влияя на многие интерпретации ранней эволюции животных. Однако во многом гипотеза Ecdysozoa остается дискуссионной. Филогенетический анализ белковых последовательностей ее не подтверждает, следовательно, сменяющиеся кутикулы артропод и нематод - это не гомологичные образования. В предлагаемой работе реконструировано филогенетическое древо на основе данных о полной геномной последовательности 5 эукариот и 3 Crenarchaeta для внешней группы. Полученное древо показало объединение всех животных организмов при исключении растений и подтвердило традиционную гипотезу Coelomata, помещающую Caenorhabditis elegans (Nematoda) в базальное положение относительно Drosophila melanogaster (Arthropoda) и Homo sapiens (Chordata). США, Penn State Astr. Res. Center and Dep. Geosci., Pennsylvania St. Univ., PA 16802; e-mail: chouse@geosc.psu.edu

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДРЕВА
ЭУКАРИОТЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Fitz-Gibbon, Sorel T.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.11-04А3.705

Огурцов, А. Ю.
Протокол автоматического выравнивания геномных последовательностей при помощи программы OWEN [Текст] / А. Ю. Огурцов // Биофизика. - 2005. - Т. 50, N 3. - С. 475-479 . - ISSN 0006-3029
Аннотация: Описан протокол автоматического иерархического выравнивания длинных последовательностей ДНК при помощи программы OWEN. Протокол основан на командном режиме программы OWEN и позволяет выравнивать большое количество пар последовательностей с умеренным сходством в автоматическом режиме. При помощи этого протокола выравнены 8263 ортологичных полных межгенных интервала геномов человека и мыши. Россия, Ин-т теоретич. и эксперим. биофизики РАН, Москва. Библ. 9

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ДНК
ГЕНЫ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АВТОМАТИЧЕСКОЕ ВЫРАВНИВАНИЕ
ПРОГРАММА OWEN

20.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 06.04-04В5.48

Identification of specific genomic sequences of Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens by suppressive subtractive hybridization [Text] : докл.[11 Annual Meeting of Italian Society for Plant Pathology (SIPaV), Milan, Sept. 29-Oct. 1, 2004] / V. Michelotti [et al.] // J. Plant Pathol. - 2004. - Vol. 86, N 4. - P326 . - ISSN 1125-4653
Перевод заглавия: Идентификация специфических геномных последовательностей Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens с помощью субтрактивной гибридизации
Аннотация: Метод субтрактивной гибридизации (SSH) был использован для выявления специфических нуклеотидных последовательностей C. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), связанных с патогенностью и кругом растений-хозяев бактерии и их различий с C. flaccumfaciens pv. betae (Cfb). Геномная ДНК Cff была использована как тестер ДНК, а геномная ДНК из Cfb как драйвер ДНК. Специфическая пара праймеров для нуклеотидных последовательностей каждого из клонов были использованы для PCR для амплификации генома Cff и Cfb. Получен только один амплифицированный фрагмент ожидаемой длины и последовательности при использовании этой пары праймеров и Cff ДНК как шаблона. Эти ампликоны затем были использованы в качестве зондов для последовательностей генов, связанных с 3 SSH клонами

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.17.02
Рубрики: ФИТОПАТОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ
CURTOBACTERIUM FLACCUMFACIENS (BACT.)
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
МЕТОД СУБТРАКТИВНОЙ ГИБРИДИЗАЦИИ

Доп.точки доступа:
Michelotti, V.; Tegli, S.; Bernardi, R.; Scala, A.

1-20 21-36

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска