Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ПЛАЗМИДА F<.>)
Общее количество найденных документов : 38
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-38 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.12-04Б2.396

    Clugston, C. K.

    A bacterial position effect: When the F factor in E. coli K12 is integrated in cis to a chromosomal gene that is flanked by IS1 repeats the elements are activated so that amplification and other regulatory changes that affect the gene can occur [Text] / C. K. Clugston, A. P. Jessop // Mutat. Res. Fund. and Mol. Mech. Mutagen. - 1991. - Vol. 248, N 1. - P1-15 . - ISSN 0027-5107
Перевод заглавия: Бактериальный эффект положения: когда Fфактор у E. coli К12 интегрирован в цис-положении относительно хромосомного гена, фланкированного повторами IS1, элементы активируются, так что могут происходить амплификация и другие регуляторные изменения, влияющие на ген
Аннотация: У Escherichia coli К12 ген argF расположен в пределах Tn 2901 - геномной единицы длиной 12 т. п. н., фланкированной элементами IS1 в прямом повторе. Когда штаммы, у к-рых F-фактор интегрирован в цис-положении относительно Tn 2901, подвергаются соответствующей селекции, с высокой частотой наблюдаются регуляторные изменения, приводящие к гиперпродукции кодируемой argF орнитинтранскарбамилазы. Если происходит амплификация argF, F-фактор нужен только для начального обмена между элементами IS1, а гомологич. рекомбинация между тандемными повторами Tn 2901 не зависит от F-статуса Кл. Амплификация Tn 2901 является частым событием у нек-рых штаммов Hf[2]. В др. штаммах преобладают регуляторные события, не связанные с амплификацией. Область переноса F-фактора не участвует в эффекте положения. Библ. 34. (A. Jessop). Великобритания, CRC Dept. of Med. Oncology, Beatson Inst. for Cancer Research, Glasgow G61 1BD.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ К-12

ПЛАЗМИДА F

ИНТЕГРАЦИЯ

ХРОМОСОМА

ЦИС-ПОЛОЖЕНИЕ

КОРРЕЛЯЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН ARG F ОРНИТИНТРАНСКАРБАМИЛАЗЫ

АМПЛИФИКАЦИЯ ГЕНОВ

ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ

IS1

ГЕНОМ ПЕРЕСТРОЙКИ

ЭФФЕКТ ПОЛОЖЕНИЯ


Доп.точки доступа:
Jessop, A.P.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.04-04Б2.472

    Golub, Efim.

    A gene encoding an SOS inhibitor is present in different conjugative plasmids [Text] / Efim Golub, Adriana Bailone, Raymond Devoret // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 9. - P4392-4394
Перевод заглавия: Ген, кодирующий SOS-ингибитор, присутствует в различных конъюгативных плазмидах
Аннотация: Исследовано наличие гена psiB (от plasmid SOS inhibi tion), обнаруженного ранее в плазмиде R6-5 и обеспечивающего подавление индукции SOS-функций в 20 конъюгативных плазмидах различных групп несовместимости. Ген psiB обнаружен в плазмидах F (IncFI), R100 (FII), R124 (FIV), pGL611А (FVI], R387(К), R483(I), pIP231(V), pIP171a (9) и R16(В-О). У всех этих плазмид ранее выявлен аналог хромосомного гена ssb, кодирующего белок, связывающийся с однонитевой ДНК. Обнаружено, что в случае плазмиды F белок SSB увеличивает эффект ингибирования SOS-функции продуктом гена psiB. Кроме того, ген psiB F подавляет SOS-функции, когда он присутствует на многокопийной лазмиде. Сделан вывод, что ген psiB плазмиды F отличается от соответствующего гена плазмиды R6-5 по регуляторным последовательностям. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 32. США, Yale Univ. Sch. of Medicine, New Haven, CN 06510.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: КОНЪЮГАТИВНЫЕ ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА F

ПЛАЗМИДА R100

ПЛАЗМИДЫ-КЛЕТКИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ОТВЕТ SOS

ИНГИБИРОВАНИЕ

ПЛАЗМИДНЫЕ БЕЛКИ

ПРОДУКТ ГЕНА PSIB

ГЕН PSIB

ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ГЕН SSB

ИДЕНТИФИКАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Bailone, Adriana; Devoret, Raymond

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.06-04Б2.348

    Esser, V. K.von.

    Bakterielle Konjugation - Grundlagen Anwendung fur die Biotechlnologie [Text] / V. K.von. Esser, R. Ridder // Jahrb. Biotechnol., 1988-1989. - Munchen, Wien, 1988. - Bd 2. - S121-138
Перевод заглавия: Бактериальная коьюгация - основы и применение в биотехнологии
Аннотация: Краткий обзор. Рассмотрен конъюгационный процесс (КП) как способ рекомбинации генетического материала. На примере Escherichia coli описаны молекулярные основы КП, механизм передачи плазмид F и хромосомной ДНК. Описаны естественные конъюгационные системы у других грамотрицательных бактерий, преимущественно Pseudomonas. Отмечается, что в качестве мобилизирующего агента часто выступают плазмиды R. Также описаны конъюгационные системы грамположительных бактерий для Bacillus, Streptococcus, Streptomyces и Clostridium. Отмечается роль КП в процессе эволюции бактерий. Демонстрируется возможность использования КП для картирования хромосом. Схематически описано конструирование бактериальных векторов. Перечислены возможности использования КП в биотехнологии. Ил. 6. Библ. 57.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.03
Рубрики: BACILLUS (BACT.)
STEPTOCOCCUS (BACT.)

STREPTOMYCES (BACT.)

CLOSTRIDIUM

КОНЬЪЮГАЦИЯ

ПЛАЗМИДА F

ПЛАЗМИДА

ДНК ХРОМОСОМНАЯ

ПЕРЕНОС

РЕКОМБИНАЦИЯ МИДА0Н ДНК ХРОМОСОМНАЯ%%Н ПЕРЕНОС%%Н РЕКОМБИНАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Ridder, R.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.200

    Santini, Joanne M.

    Both the fipA gene of pKM101 and the pifC gene of F inhibit conjugal transfer of RP1 by an effect on traG [Text] / Joanne M. Santini, Vilma A. Stanisich // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 16. - P4093-4101 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Ген fipA pKM101 и ген pilC плазмиды F ингибируют перенос RP1, влияя на traG
Аннотация: Из области SmaI-AatII (14,8-15,6 т. п. н.) плазмиды pKM101 группы IncN выделен ген fipA длиной 624 п. н., ингибирующий перенос плазмиды RP1 группы IncP. Этот ген, сохраняющийся у др. плазмид IncN, транскрибируется против часовой стрелки как часть оперона переноса, включающего traHI. Белок FipA с мол. м. 24 кД является цитоплазматическим и при экспрессии с многокопийной плазмиды замедляет рост клеток Escherichia coli WP2. Сравнен механизм действия гена fipA и неродственного гена pifC F-плазмиды группы IncF1. Оба гена ингибируют перенос плазмид IncP'альфа' и IncP'бета', но в разной степени. Они ингибируют также мобилизацию RSF1010, требующую генов фимбрий RP1 и traG, но не CloDF13, кодирующей гомолог traG. С использованием искусственной системы, в к-рой клонированный ген traG усиливает мобилизацию RSF1010 через N-фимбрии, доказано, что специфич. мишенью для ингибирования является traG. Такое усиление не наблюдается в присутствии fipA или pifC. Показано, что экспрессия оперона pif F-плазмиды усиливается в клетках, несущих F'lac и traG, но только тогда, когда кодирующая последовательность traG является целой. Это позволило предположить, что ингибирование конъюгации RP1 вызвало взаимодействие белков PifC и TraG. Ингибирование traG под действием fipA является постранскрипционным. Австралия, Dep. Microbiol., La Irobe Univ., Bundoora 3083. Библ. 78
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА RP1
КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС

ВЛИЯНИЕ

ПЛАЗМИДА PKM101

ПЛАЗМИДА F

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН ИНГИБИТОРА ПЕРЕНОСА FIPA

ГЕН ИНГИБИТОРА ПЕРЕНОСА PILC

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Stanisich, Vilma A.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.11-04Б2.222

   

    Comparison of proteins involved in pilus syntesis and mating pair stabilization from the related plasmids F and R100-1: Insights into the mechanism of conjugation [Text] / Karen G. Anthony [et al.] // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 17. - P5149-5159 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Сравнение белков, участвующих в синтезе фимбрий и стабилизации конъюгирующих пар, из родственных плазмид F и R100-1
Аннотация: Завершено секвенирование области переноса плазмиды R100-1 (от trbA от traS). Полная последовательность R100-1 сравнена с последовательностью близкородственной плазмиды F. Различия между 2 областями переноса включают вставки и делеции, а также дупликации генов и мозаицизм внутри генов, все гены Mpf, существенные для образования конъюгирующих пар, консервативны в обеих плазмидах. Изучена комплементация клеток F{+} с определенными мутациями в каждом из генов Mpf гомологичными генами плазмиды R100-1. Показано, что специфичность в узнавании реципиентных клеток и исключении при вхождении опосредована соотв. белками TraN и TraG, а не фимбриями. Канада, Dep. Biol. Chem., Univ. Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2E7. Библ. 87
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА R100-1
ПЛАЗМИДА F

КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС

МЕХАНИЗМ

ПЛАЗМИДНЫЕ БЕЛКИ

БЕЛОК КОНЪЮГАТИВНОГО ПЕРЕНОСА TRAN

БЕЛОК КОНЪЮГАТИВНОГО ПЕРЕНОСА TRAG

СИНТЕЗ

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Anthony, Karen G.; Klimke, William A.; Manchak, Jan; Frost, Laura S.

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.252

    Holcik, Martin.

    Conditionally lethal genes associated with bacterial plasmids [Text] / Martin Holcik, V. N. Iyer // Microbiology. - 1997. - Vol. 143, N 11. - P3403-3416 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Условно-летальные гены, ассоциированные с бактериальными плазмидами
Аннотация: Обзор. Постсегрегационная гибель бесплазмидных клеток бактерий вызывается плазмидными системами, к-рые состоят из 2 компонентов: стабильного киллерного белка-токсина (I) и нестабильного фактора, предотвращающего экспрессию I или его функционирование и играющего роль антидота. Антитоксинами могут служить белки или антисмысловые РНК. Рассмотрены системы ccd F-плазмиды, hok/sok плазмиды R1, kil/kor плазмид групп несовместимости P и N и kik плазмид Klebsiella oxytoca, а также летальные гены плазмид Streptomyces. Канада, Dep. of Biol., Carleton Univ., Ottawa, Ontario K1S 5B6. Библ. 92
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ГЕНЫ
ПЛАЗМИДА F

HOK-SOK

ПЛАЗМИДА R1

KIL-KOR

ПЛАЗМИДЫ ГРУПП НЕСОВМЕСТИМОСТИ P

N

KIK

KLEBSIELLA OXYTOCA

УСЛОВНО-ЛЕТАЛЬНЫЕ ГЕНЫ

ХАРАКТЕРИСТИКА

БЕСПЛАЗМИДНЫЕ КЛЕТКИ

ПОСТСЕГРЕГАЦИОННАЯ ГИБЕЛЬ


Доп.точки доступа:
Iyer, V.N.

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.02-04Б2.427

    Tam, Jeffrey E.

    Control of the ccd operon in plasmid F [Text] / Jeffrey E. Tam, Bruce C. Kline // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 5. - P2353-2360 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Контроль ccd оперона у F-плазмиды
Аннотация: Исследовалась регуляция экспрессии генов ccdA и ccdB F-фактора E. coli. Гены ccdA и ccdB участвуют в поддержании плазмиды. Белок CcdB является цитотоксином, который активируется при потере F-плазмиды, таким образом убивая Fклетки. В F+-клетках CcdA защищает от летального эффекта CcdB. Исследование показало, что экспрессия ccdA и ccdB негативно авторегулируется на уровне транскрипции. Для репрессии необходим как минимум ccdB: ccdA сам по себе не является авторепрессором, а ccdB отдельно не исследовался из-за его летальности. Получены результаты, которые показывают, что существуют по крайней мере два ДНК-связывающих сайта для Ccd-белков. Метод отпечатка показал защищенный участок размером 113 п.н., в который входят предполагаемый промотор-оператор и начало ccdA-гена. Ил. 6. Табл. 2. Библ. 26. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Mayo Clinic/Foundation, Rochester, Minnesota 55905.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДА F

ПОДДЕРЖАНИЕ ПЛАЗМИД

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕН ЦИТОТОКАИНА CCDB

ГЕН CCDA

АВТОРЕГУЛЯЦИЯ


Доп.точки доступа:
Kline, Bruce C.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.12-04Б2.334

   

    Deletion analysis of the F plasmid oriT locus [Text] / Y. -H.Florence Fu [et al.] // J. Bacteriol. - 1991. - Vol. 173, N 3. - P1012-1020 . - ISSN 0021-9293
Перевод заглавия: Делеционный анализ локуса ori Т плазмиды F
Аннотация: F-плазмиды Escherichia coli и подобные им плазмиды содержат цис-действующий локус ori T, в к-рый вводится спиралеспецифичный однонитевой разрыв, необходимый для конъюгационного переноса никированной нити в реципиентную бактерию в направлении 5{1}-{3}{1}. Исследовали структуру локуса ori T. Получили делеции справа, слева от ori T и в центре его. Клонировали мутантные локусы ori T в составе немобилизуемой плазмиды puC8 и изучили их способность инициировать перенос или никирование, когда функции оперона tra присутствуют in trans. Показали, что удаление последовательности ДНК справа от ori T не влияет на его способность к никированию, но резко снижает эффективность переноса. Делеция слева не влияет на функцию переноса. Делеции в центральном А-Т-богатом районе приводят к вариациям в эффективности переноса. Делают вывод, что локус ori T содержит домены, участвующие в переносе, никировании и организации общей структуры данного района. Для эффективности переноса F-плазмиды необходимо сохранить нативными все эти домены. Библ. 30. США, Mol. Biol., Dep. of Biol. Sci, SHS 172, Univ. of Southern California, Los Angeles, CA 90089-1340.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.03 + 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ RD5042

ПЛАЗМИДА F

КОНЪЮГАЦИЯ

ЛОКУС ORIT

СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ

ДЕЛЕЦИИ

НИКИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Fu, Y.-H.Florence; Tsai, Mei-Mei; Luo, Yanan; Deonier, Richard C.

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.164

   

    Direct selection cloning vectors adapted to the genetic analysis of Gram-negative bacteria and their plasmids [Text] / Philippe Gabant [et al.] // Gene. - 1998. - Vol. 207, N 1. - P87-92 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Клонирующие векторы прямой селекции, приспособленные для генетического анализа грамотрицательных бактерий и их плазмид
Аннотация: Описаны 6 новых плазмидных векторов, использующих для позитивной селекции токсичность белка CcdB (I) F-плазмиды Escherichia coli: 1) pKIL1921 и pKIL194 с низким и средним числом копий соотв.; 2) pKIL194T и pZErO-2T с узким кругом хозяев и средним и высоким числом копий соотв.; 3) мобилизируемые векторы pBHRK18 и pBHRK19 с широким кругом хозяев. Изучение передачи гена ccdB в 10 разных видов грамотрицательных бактерий показало, что I летален только в Enterobacteriaceae (E. coli, Salmonella typhimurium, Erwinia chrysanthemi, E. herbicola и Klebsiella pneumoniae). Бельгия, Lab. Genet. Procaryotes, Dep. Biol. Mol., Univ. Libre Bruxelles, B-1640 Rhode-Saint-Genese. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ВЕКТОРЫ
ПРЯМОЙ СЕЛЕКЦИИ

ПЛАЗМИДА F

БЕЛОК CCDB

ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ


Доп.точки доступа:
Gabant, Philippe; Szpirer, Cedric Y.; Couturier, Martine; Faelen, Michel

10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.202

   

    Disruption of the F plasmid partition complex in vivo by partition protein SopA [Text] / M. Lemonnier [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 38, N 3. - P493-503 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Разрушение комплекса распределения F-плазмиды in vivo белком распределения SopA
Аннотация: Гиперпродукция белка распределения SopA (I) вызывает утрату плазмиды мини-F растущими клетками Escherichia coli. Избыток I уменьшает коэф. зацепления (Lk) ДНК мини-F, разрушая комплекс распределения, в к-ром белок SopD (II) в норме индуцирует локальную положительную суперспирализацию, связываясь с центромерой sopC. Вызванное I уменьшение Lk не связано с изменениями активности промотора sop или уровня II и происходит в отсутствие изменений валовой суперспиральной плотности. Мутанты I с заменой K120Q в сайте связывания нуклеотидов АТФазной ф-ции или с делецией домена взаимодействия с II, не вызывают изменений Lk. Это позволило предположить, что избыток I разрушает комплекс распределения, взаимодействуя с II и удаляя положительные супервитки зависящим от АТФ образом. Дестабилизация плазмиды мини-F зависит только от sopC и II. Мутант K120Q сохранил остаточную способность дестабилизировать мини-F. Рассмотрена модель регуляторной роли I в олигомеризации димеров II, связанных с центромерой. Франция, Lab. Microbiol. et Genet. Mol., 31062 Toulouse. Библ. 45
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА F

СЕГРЕГАЦИЯ

БЕЛОК

БЕЛОК РАСПРЕДЕЛЕНИЯ ПЛАЗМИДЫ F SOPA

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

КОМПЛЕКС РАСПРЕДЕЛЕНИЯ

РАЗРУШЕНИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Lemonnier, M.; Bouet, J.-Y.; Libante, V.; Lane, D.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.273

   

    Escherichia coli ColV plasmid pRK100: Genetic organization, stability and conjugal transfer [Text] / Jerneja Ambrozic [et al.] // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 2. - P343-352 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: ColV плазмида pRK100 из Escherichia coli: генетическая организация, стабильность и конъюгативный перенос
Аннотация: Уропатогенные штаммы Escherichia coli экспрессируют хромосомные и плазмидные, связанные с вирулентностью факторы, такие как: специфические адгезины, токсины и железо-транспортные системы. Исследовали ColV плазмиду (pRK100) из уропатогенного штамма и ее хозяина KS533. Хозяин кодирует капсулу K1, фимбрии P и S, но не образует не гемолизин, не цитотоксичный некротический фактор CNF1. На основании гибридизации и секвенирования получена рестрикционная карта pRK100. Плазмида несет ColV, консервативную репликативную область RepFIB, систему транспорта аэробактина, репликон RepFIC, а так же Colla и транспозон Tn5431. Локализация репликонов RepFIC такая же как в плазмиде F. Плазмиды ColV и F имеют одинаковую область, составляющую более половины от размера F. Несмотря на то, что их области репликации и переноса гомологичны, плазмиды ColV присутствуют только в штаммах E. coli. Конъюгативный перенос pRK100 проверяли в четыре вида, из к-рых он прошел с низкой эффективностью только в Klebsiella pneumoniae, демонстрируя эффективность природного барьера перед переносом. Показана стабильность плазмиды в присутствии несовместимой плазмиды за счет интеграции в хромосому. Словения, Dep. Biol., Biotech. Fac., Univ. Ljublijana, Vecna pot 111, 1000 Ljubljana. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
COLV

PRK100

РЕСТРИКЦИОННАЯ КАРТА

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ

ГОМОЛОГИЯ

ПЛАЗМИДА F

СТАБИЛЬНОСТЬ

КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ШТАММ KS533

УРОПАТОГЕННЫЕ БАКТЕРИИ


Доп.точки доступа:
Ambrozic, Jerneja; Ostroversnik, alenka; Starcic, Marjanca; Kuhar, Irena; Grabnar, Miklavz; Zgur-Bertok, Darja

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.130

   

    Evidence for involvement of Escherichia coli genes pmbA, csrA and a previously unrecognized gene tldD, in the control of DNA gyrase by letD (ccdB) of sex factor F [Text] / Nobuhiro Murayama [et al.] // J. Mol. Biol. - 1996. - Vol. 256, N 3. - P483-502 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Доказательство участия генов pmbA, csrA и ранее неизвестного гена tldD Escherichia coli в контроле ДНК-гиразы геном letD(ccdB) полового фактора F
Аннотация: Гены letA(ccdA) и letD(ccdB) F-плазмиды участвуют в ее стабильном сохранении в клетках E. coli. Белок LetD (I) ингибирует распределение хромосомной ДНК и клеточное деление, подавляя активность ДНК-гиразы (II), а белок LetA противодействует I. Для идентификации клеточных факторов, участвующих в этих процессах, изучены мутанты E. coli, спасающиеся от экспрессии гена letD. Кроме ранее описанных генов groE, обнаружено участие 3 др. генов: tldD, tldE и zfiA. Подобно мутациям groES, мутации tldD и tldE делают клетки толерантными к экспрессии I. Мутация в гене zfiA превращает мутанты tldD, tldE и groES в чувствительные к I. Высказано предположение, что продукты этих генов являются факторами, модулирующими активность II в присутствии I: белок ZfiA ингибирует взаимодействие между I и субъединицей А II, а белки TldD, TldE и GroES супрессируют ингибиторную активность белка ZfiA. Гены tldD, tldE и zfiA картированы соотв. на 70,4-ой, 96,0-ой и 58,2-ой мин хромосомы E. coli. Секвенирование показало, что они кодируют белки с мол. м. 51, 48 и 6,8 кД соотв. Ген tldD является новым, ген tldE совпадает с геном pmbA (продукция микроцина В17), а ген zfiA - с геном csrA регулятора запасания углерода. Япония, Fac. Pharmaceutical Sci., Kyushu Univ., Fukuoka 812. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ДНК-ГИРАЗА
РЕГУЛЯЦИЯ НЕГАТИВНАЯ

БЕЛОК

БЕЛОК LETD

ПЛАЗМИДА F

ГЕНЫ

ГЕН PMBA

ГЕН CSRA

ГЕН TLDD

УЧАСТИЕ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

ESCHERICHIA COLI

КЛЕТОЧНЫЙ ЦИКЛ


Доп.точки доступа:
Murayama, Nobuhiro; Shimizu, Hiroki; Takiguchi, Souichi; Baba, Yoshifumi; Amino, Hisako; Horiuchi, Tadao; Sekimizu, Kazuhisa; Miki, Takeyoshi

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.06-04Б2.205

    Harris, Robin L.

    Evidence that F-plasmid proteins TraV, TraK and TraB assemble into an envelope-spanning structure in Escherichia coli [Text] / Robin L. Harris, Veronica Hombs, Philip M. Silverman // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 42, N 3. - P757-766 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Доказательство того, что белки TraV, TraK и TraB F-плазмиды собираются в пересекающую оболочку структуру у Escherichia coli
Аннотация: Изучена роль в сборке F-фимбрий липопротеина внешней мембраны TraV (I), периплазматич. белка TraK (II) и белка внутренней мембраны TraB (III), кодируемых F-плазмидой. С использованием дрожжевой 2-гибридной системы установлено, что I взаимодействует с II, II - c I и III, а III - исключительно с II. Высказано предположение, что I, II и III образуют в клетках Escherichia coli комплекс, пересекающий клеточную оболочку от внешней мембраны (I) через периплазму (II) до внутренней мембраны (III). Получены следующие дополнительные доказательства этой гипотезы: 1) в 2-гибридной системе I и III связываются с разными сегментами II; 2) I-III фракционируются с внешней мембраной в клетках tra{+}; 3) в мутантных клетках traV или traK II фракционируется с внутренней мембраной; 4) у мутанта traV I появляется в жидкости при осмотич. шоке; 5) у мутанта traK I не накапливается в обнаружимом кол-ве, а уровень III значительно понижен; 6) в клетках traB2[Am]накапливаются I и II и обнаруживается амбер-фрагмент III, сохранивший домен связывания I. Высказано предположение, что I является мембранным якорем для пересекающего оболочку комплекса белков Tra, требующегося для сборки F-фимбрий и, возможно, для других событий конъюгационного переноса. США, Program in Mol. and Cell Biol., Oklahoma Med. Res. Foundation, Oklahoma City, OK 73104. Библ. 43
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА F
КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС

ФИМБРИИ

F-ФИМБРИИ

СБОРКА

ПЛАЗМИДНЫЕ БЕЛКИ

БЕЛКИ TRA VKB

БЕЛОК - БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hombs, Veronica; Silverman, Philip M.

14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.03-04Б2.224

    Matson, Steven W.

    F plasmid conjugative DNA transfer. The TraI helicase activity is essential for DNA strand transfer [Text] / Steven W. Matson, Juliana K. Sampson, Devon R. N. Byrd // J. Biol. Chem. - 2001. - Vol. 276, N 4. - P2372-2379 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Конъюгативный перенос ДНК F-плазмиды. Активность геликазы TraI существенна для переноса нити ДНК
Аннотация: Белок TraI (I), требующийся для переноса ДНК F-плазмиды при конъюгации, состоит из C-концевого домена ДНК-геликазы (II) и N-концевого домена ДНК-трансэстеразы (III), катализирующей образование однонитевого разрыва в области oriT для инициации переноса ДНК. Сконструированы мутации traI и генетич. и биохимич. методами изучено их влияние на перенос ДНК. Мутант с делецией-вставкой в traI дефектен по переносу. Мутант с C-концевой делецией домена II также дефектен по переносу, хотя у него сохранилась область traI, кодирующая домен III. Показано, что N-концевого домена I достаточно для зависящей от oriT трансэстеразной активности. Таким образом, функциональной III недостаточно для поддержания переноса ДНК. Точечный мутант с заменой K998M, не имеющий активности II, проявляет зависящую от oriT активность III in vitro и in vivo, но не комплементирует мутант 'ДЕЛЬТА'traI по конъюгационному переносу ДНК. Таким образом, активности II и III у I существенны для переноса нити ДНК при конъюгации. США, Dep. Biol., Univ. North Carolina, Chapel Hill, NC 27599. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА F
КОНЪЮГАТИВНЫЙ ПЕРЕНОС

МЕХАНИЗМ

ФЕРМЕНТЫ

ГЕЛИКАЗА TRAI

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Sampson, Juliana K.; Byrd, Devon R.N.

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.09-04Б2.242

   

    General mutagenesis of F plasmid TraI reveals its role in conjugative regulation [Text] / Rembrandt J. F. Haft [et al.] // J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188, N 17. - P6346-6353 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Общий мутагенез F-плазмидного TraI выявил его роль в конъюгативной регуляции
Аннотация: Описали мутагенез F-плазмидного гена релаксазы traI с помощью использования 31-кодонных инсерций. Фенотипический анализ библиотеки мутантов позволил установить, что некоторые мутантные белки функционируют в конъюгации, и выявить районы TraI, толерантные к данным инсерциям. Показали, что сверхэкспрессия TraI играет доминантно-негативную регуляторную роль в конъюгации, репрессируя 100-кратно плазмидный перенос. Мутантные белки TraI с инсерциями в районе приблизительно в 400 остатков между последовательностями релаксазы и хеликазы не вызывают конъюгативной репрессии. Эти варианты имеют нормальную активность релаксазы in vivo и некоторые конъюгативные функции, когда экспрессируются в нормальных условиях. Постулировали, что TraI негативно регулирует конъюгацию путем взаимодействия и секвестирования некоторых компонентов аппарата конъюгации. Домен, ответственный за репрессию конъюгации, находится в центральном районе TraI между каталитическими доменами. США, Dep. of Microbiol., Univ. of Washington, Seattle, Washington 98195. Библ. 21
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.07
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА F

ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН РЕЛАКСАЗЫ TRAI

СТРУКТУРА

ФУНКЦИИ

ФЕРМЕНТЫ

РЕЛАКСАЗА TRAI

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Haft, Rembrandt J.F.; Palacios, Gilberto; Nguyen, Tran; Mally, Manuela; Gachelet, Eliora G.; Zechner, Ellen L.; Traxler, Beth

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.201

    Klimke, William A.

    Genetic analysis of the role of the transfer gene, traN, of the F and R100-1 plasmids in mating pair stabilization during conjugation [Text] / William A. Klimke, Laura S. Frost // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 16. - P4036-4043 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Генетический анализ роли гена переноса traN плазмид F и R100-1 в стабилизации конъюгационных пар во время конъюгации
Аннотация: В ген traN плазмиды pOX38, являющейся вариантом F-фактора, встроена кассета устойчивости к хлорамфениколу. У полученной плазмиды pOX38N1::CAT значительно понизилась способность к переносу ДНК. Плазмиды F и R101-1 traN одинаково хорошо комплементируют перенос pOX38N1::CAT в реципиенты дикого типа. F traN, но не R101-1 traN, поддерживает гораздо более низкий уровень переноса, если реципиент содержит мутацию ompA или дефектен по липополисахариду (I), что указало на рецепторную специфичность. Секвенирован ген traN R100-1. Его продукт на 82,3% гомологичен белку TraN (II) F-плазмиды. Различия этих II сосредоточены в центральное области (остатки 152-333 у F и 162-348 у R100-1). Делец. анализ traN плазмиды F показал, что эта часть II отвечает за рецепторную специфичность II. II не отвечает за поверхностное исключение, зависящее от TraT. Эти данные показали, что II, а не F-фимбрии, взаимодействует с I и белком OmpA во время конъюгации и стабилизирует пары, т. е. осуществляет первый этап в эффективной мобилизации ДНК. Канада, Dep. Biol. Sci., Univ. Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2E9. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: КОНЪЮГАЦИЯ
СТАБИЛИЗАЦИЯ КОНЪЮГАЦИОННЫХ ПАР

ПЕРЕНОС ДНК

МЕХАНИЗМ

ПЛАЗМИДА POX38

ПЕРЕНОС

ПЛАЗМИДА F

ПЛАЗМИДА R100-1

КОМПЛЕМЕНТАЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕН КОНЪЮГАЦИОННОГО ПЕРЕНОСА TRAN

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Frost, Laura S.

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.202

   

    Interaction between the F plasmid TraA (F-pilin) and TraQ proteins [Text] / Robin L. Harris [et al.] // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 34, N 4. - P780-791 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Взаимодействие между белками TraA (F-пилином) и TraQ F-плазмиды
Аннотация: Дрожжевая 2-гибридная система (2-ГС) использована для идентификации продуктов генов F-фактора Escherichia coli, способных взаимодействовать с F-пилином TraA (I) - субъединицей F-фимбрий. Показано, что только белок TraQ (II) может взаимодействовать с I. Это взаимодействие специфично, т. к. II не взаимодействует с продуктом гена traA плазмиды pED208 Salmonella typhi. Изучена способность 2 сегментов traQ, выделенных в 2-ГС по признаку взаимодействия с I, комплементировать нулевой аллель traQ. Сегмент, кодирующий II без первых 11 аминок-тных остатков из 94, восстанавливает донорную активность при конъюгации, чувствительность к мужским фагам и накопление I в мембране. II, у к-рого отсутствует 21 N-концевой остаток, менее эффективен. Оба варианта II накапливаются в клетках E. coli как мембранные белки. В 2-ГС более длинный сегмент traQ взаимодействует с только с сегментами traE. Показано, что для взаимодействия с II достаточно гидрофобного С-концевого домена IV в I. Полученные данные позволили предположить, что взаимодействие II с I отражает специфическую шапероновую ф-цию II. Попытки выделить комплекс I-II из клеток E. coli оказались неудачными. Высказано предположение, что ассоциация I с II является временной. США, Program in Mol. and Cell Biol., Oklahoma Med. Res. Foundation, Oklahoma City, OK 73104. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ТРАНСФОРМАЦИЯ
ПЛАЗМИДА F

ПЕРЕНОС

БЕЛОК

БЕЛОК TRAA

БЕЛОК TRAQ

БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

МЕХАНИЗМ

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Harris, Robin L.; Sholl, K.Aprill; Conrad, Michael N.; Dresser, Michael E.; Selverman, Philip M.

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.05-04Б2.481

    Tsai, Mei-Mei.

    Intrinsic bends and integration host factor binding at F plastid oriT [Text] / Mei-Mei Tsai, Florence Y. -H. Fu, Richard C. Deonier // J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 8. - P4603-4609 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Внутренние изгибы и связывание хозяйского фактора интеграции в oriT плазмиды F
Аннотация: Сконструирована Сконструирована серия плазмид, несущих фрагмент oriT плазмиды F. В последовательности длиной 527 п. н. обнаружен внутренний изгиб ДНК с центром в сайте 240. Картированы 2 сайта связывания хозяйского фактора интеграции (integration host factor IHF): 1 сайт в области 165-195 п. н. и др. с меньшим сродством в области 287-319 п. н. Внутренний изгиб и сайты связывания IHF м. б. важными структурными элементами для функциониро-вания ori T. Ил. 5. Табл. 2. Библ. 26. (R. C. Deonier). США, Молецулар Виол., Деп. оф Виол. Сци., СШС 172, Univ. of Southern California, Los Angeles, CA 90089-1340.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.07.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
КОНЪЮГАЦИЯ

КОНЪЮГАТИВНЫЕ ПЛАЗМИДЫ

ПЛАЗМИДА F

УЧАСТОК ORI T

СТРУКТУРА

ВНУТРЕННИЕ ИЗГИБЫ

ДНК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

ХОЗЯЙСКИЙ ФАКТОР ИНТЕГРАЦИИ


Доп.точки доступа:
Fu, Florence Y.-H.; Deonier, Richard C.

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.02-04Б2.425

   

    Involvement of DnaK protein in mini-F plasmid replication: Temperature-sensitive seg mutations are located in the dnaK gene [Text] / Bunichi Ezaki [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1989. - Vol. 218, N 2. - P183-189 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Участие белка DnaK в репликации миниF-плазмид: температуро-чувствительные мутации seg локализуются в гене dnaK
Аннотация: Изучали роль продукта гена dnaK в репликации мини Fплазмид в клетках Escherichia coli. Известны мутации генома клеток E. coli - seg-1 и seg-2, которые ингибируют репликацию мини F-плазмид. В данной работе выделен сегмент хромосомной ДНК E. coli, комплементирующий эти мутации, и показано, что этот сегмент соответствует известному гену теплового шока - гену dnaK. При секвенировании соответствующих участков ДНК seg-1 и seg-2 мутантов в обоих случаях обнаружено по 1 нуклеотидной замене, соответствующей также аминокислотной замене в продукте этого гена. На основании этих данных делается вывод, что ген seg идентичен известному гену dnaK E. coli. Обсуждается возможная функция продукта этого гена и его возможная роль в репликации плазмид и в реакции теплового шока клеток E. coli. Библ. 51. Япония, Dep. of Molecular Genetics, Inst. for Medical Genetics, Kumamoto Univ. Medical School, Kumamoto 862.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.15.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПЛАЗМИДЫБАКТЕРИИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ПЛАЗМИДА F

ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ

ГЕНЫ SEG

МУТАЦИИ

КОМПЛЕМЕНТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ

ХРОМОСОМНЫЕ ГЕНЫ БЕЛКОВ ТЕПЛОВОГО ШОКА DNAK


Доп.точки доступа:
Ezaki, Bunichi; Ogura, Teru; Mori, Hirotada; Niki, hironori; Hiraga, Sota

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.07-04Б2.230

    Hu, Wen-Yuan.

    IS903 insertion specificity: A distinct preference for the F transfer operon [Text] / Wen-Yuan Hu, Keith M. Derbyshire // J. Biomol. Struct. and Dyn. - 1997. - Vol. 14, N 6. - P839-839 . - ISSN 0739-1102
Перевод заглавия: Инсерционная специфичность IS903: явно выраженное предпочтение оперона переноса F-плазмиды
Аннотация: Изучены независимые вставки IS-элемента IS903 в плазмиду рОХ38 (55 т. п. н.), являющуюся производным F-плазмиды. Показано, что сайты вставки сгруппированы в нескольких коротких областях (1,2-3,8 т. п. н.) области переноса tra и в лидерной области рядом с oriT. Не удалось идентифицировать консенсусную последовательность мишенного сайта (9. п. н.), но в фланговых областях длиной 10 п. н. обнаружено предпочитание некоторых нуклеотидов, симметрично расположенных относительно сайта инсерции. Региональная специфичность транспозиции IS903 отсутствует в неродственной конъюгативной плазмиде pUB307 - делец. варианте плазмиды RP1 группы IncP. Распределение вставок в pUB307 изменяется после введения в нее фрагмента traY-L (1,1 т. п. н.) tra-области F: 90% вставок картированы в этом фрагменте. Делеция блоков -35 и -10 промотора PtraY в этом фрагменте уменьшает число вставок IS903 на 40%. Т. обр. транскрипция с PtraY является дополнительным фактором, усиливающим использованием сегмента traY-L в качестве мишени для транспозиции. США, Dep. of Biomed. Sci., School of Public Health, Albany, NY 12206
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.07
Рубрики: ИНСЕРЦИОННЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ
IS903

ИНСЕРЦИЯ

МИШЕНЬ

ПЛАЗМИДА F

ОБЛАСТЬ TRA

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Derbyshire, Keith M.

 1-20    21-38 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)