СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ<.>)

Общее количество найденных документов : 443
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 93.10-04А1.090

De, Jong Wilfried W.
'альфа'-Crystallin sequences and amniote relationships - a cladistic approach [Text] : [Pap.] Symp. "Macromol. Identif. and Classif. Organisms", Antwerp., Dec. 7, 1991 / Jong Wilfried W. De, Gert-Jan Caspers // Belg. J. Bot. - 1992. - Vol. 125, N 2. - P121 . - ISSN 0037-9557
Перевод заглавия: Последовательности 'альфа'-кристаллина и взаимоотношения амниот - кладистический подход
Аннотация: На основании аминокислотных последовательностей 'альфа'Акристаллина млекопитающих, птиц, крокодила и ящерицы построена кладограмма. В качестве внешних групп использовали лягушку и акулу. Монофилия амниот подтверждается по меньшей мере 7 уникальными синапоморфными замещениями. О монофилии диапсид свидетельствуют 5 уникальных замещений. Птицы и крокодил имеют 2 общих замещения. 'альфа'А-кристаллины плацентарных и сумчатых млекопитающих не свидетельствуют о монофилетизме. Нидерланды, Univ. of Nijmegen.

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.11
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
БЕЛКИ
АЛЬФА-КРИСТАЛЛИН
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФИЛОГЕНЕЗ
ПОЗВОНОЧНЫЕ
ЭВОЛЮЦИОННЫЕ ДЕРЕВЬЯ
КЛАДИСТИЧЕСКИЙ ПОДХОД

Доп.точки доступа:
Caspers, Gert-Jan

РЖ ВИНИТИ 34 (BI26) 96.10-04М4.83

Rojas, A.
'бета'-Glucosidase families revealed by computer analysis of protein sequences [Text] / A. Rojas, Ll. Arola, A. Romeu // Biochem. and Mol. Biol. Int. - 1995. - Vol. 35, N 6. - P1223-1231 . - ISSN 1039-9712
Перевод заглавия: Семейства 'бета'-глюкозидаз, выявленные компьютерным анализом белковых последовательностей
Аннотация: Осуществлен компьютерный анализ организации 'бета'-глюкозидазных подсемейств. 22 'бета'-глюкозидазы, принадлежащие как целлюлолитическим, так и нецеллюлолитическим организмам, были идентифицированы. Показано существование 2 четких подсемейств A и B. Подсемейство A делится на A1 и A2. A1 включает растительные глюкозидазы, а A2 прокариотические ферменты. Подсемейство B включает 3 новых подсемейства B1, B2 и B3. Ферменты B2 из дрожжей и грибов. Остатки Asp, Glu, His, которые предположительно участвуют в гидролизе, консервативны. Также обнаружены аминокислотные мотивы, консервативные в подсемействах A и B. Испания, Univ. Rovira, Dep. Biochem., E-43005 Tarragona. Библ. 25

ГРНТИ	34.39.41

ВИНИТИ 341.39.41.07.21
Рубрики: ГЛЮКОЗИДАЗЫ БЕТА
СЕМЕЙСТВА
БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Arola, Ll.; Romeu, A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.08-04А3.904

3DCoffee@igs: A web server for combining sequences and structures into a multiple sequence alignment [Text] / Olivier Poirot [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, прил. Web Serv. issue. - P37-40 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: 3DCoffee@igs - сетевой сервер соединения последовательностей и структур в множественное сопоставление последовательностей
Аннотация: Представлен сетевой сервер 3DCoffee@igs, позволяющий вычислять высокачественные множественные сопоставления последовательностей (МСП). 3DCoffee позволяет для повышения точности МСП использовать сочетания последовательностей и структур белков. Структуры можно брать из PDB либо вводить в сервер. После введения структур и последовательностей структуры попарно сопоставляются программой SAP, а последовательности - программой Fugue. Затем полученный набор парных сопоставлений объединяется в МСП алгоритмом T-Coffee. Сервер доступен по адресу: http://igs-server.cnrs-mrs.fr/Tcoffee. Запросы по адресу: cedric.notredame@europe.com. Библ. 19

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПРОСТРАНСТВЕННЫЕ СТРУКТУРЫ
МНОЖЕСТВЕННОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
СЕТЕВОЙ СЕРВЕР 3DCOFFEE@IGS
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Poirot, Olivier; Suhre, Karsten; Abergel, Chantal; O'Toole, Eamonn; Notredame, Cedric

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.06-04А3.601

Bennett, Steven P.
3MOTIF: Visualizing conserved protein sequence motifs in the protein structure database [Text] / Steven P. Bennett, Craig G. Nevill-Manning, Douglas L. Brutlag // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 4. - P541-542 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: 3MOTIF - визуализация консервативных мотивов в белковых последовательностях базы данных белковых структур
Аннотация: 3MOTIF (http://motif.stanford.edu/3motif) - это сетевая программа визуализации в трехмерных структурах банка белковых данных PDB карты консервативных мотивов в последовательностях. В изображениях структур разным цветом отмечаются такие важные свойства мотивов, как степень консервативности и площадь доступной растворителю поверхности каждого остатка. США, Dep. Biochem., B400 Beckman Ctr., Stanford Univ., Stanford, CA 94305-5307. Библ. 7

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
БАНК PDB
ТРЕХМЕРНЫЕ СТРУКТУРЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
КОНСЕРВАТИВНЫЕ МОТИВЫ
ВИЗУАЛИЗАЦИЯ
СЕТЕВАЯ ПРОГРАММА 3MOTIF
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Nevill-Manning, Craig G.; Brutlag, Douglas L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 91.08-04Б4.245

Jacobs, E.
A B cell-, T cell-linked epitope located on the adhesin of Mycoplasma pneumoniae [Text] / E. Jacobs, R. Bock, L. Dalehite // Infec. and Immun. - 1990. - Vol. 58, N 8. - P2464-2469 . - ISSN 0019-9567
Перевод заглавия: B- и T-клеточные эпитопы, локализованные на адгезине Mycoplasma pneumoniae
Аннотация: Для локализации В- и Т-клеточных эпитопов в белке Р[1], к-рый является адгезином и главным антигеном (АГ) Mycoplasma pneumoniae, был синтезирован набор пептидов с аминокислотными последовательностями, перекрывающими иммунную область his 821-gly 871 Р[1]. Наибольшей способностью вызывать бласттрансформацию Тлимфоцитов из бронхов инфицированных морских свинок обладал пептид Ser845-G-S-R-S-F-L-P-. IgG из сыворотки зараженных животных наиболее активно взаимодействовал с пептидом Tyr842-N-T-S, независимо от аминокислоты 845. Т. обр., В-клеточный эпитоп центральной области белка Р[1] Mycoplasma pneumoniae расположен вслед за N-концом Т-клеточного эпитопа через Ser 845. Планируется уточнить функцию обнаруженного Т-клеточного эпитопа в свете проблемы конструирования ситетич. клеточной вакцины. Библ. 25. ФРГ, Univ. of Fleiburg, D-7800 Fleiburg.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.07
Рубрики: MYCOPLASMA PNEUMONIAE (BACT.)
АДГЕЗИНЫ
АНТИГЕНЫ
ЭПИТОПЫ
СТРУКТУРА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ИММУНИТЕТ
В-КЛЕТОЧНЫЙ ОТВЕТ
ВАКЦИНЫ

Доп.точки доступа:
Bock, R.; Dalehite, L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 93.05-04Б1.362

A burgonya y virus magyar (H) izolatumanak klonozasa es elsodleges szerkezetenek meghatarozasa [Text] / Vera Thole [et al.] // 38 Novenyved. tud. napok., Budapest, febr. 25-26, 1992. - Budapest, 1992. - С. 108
Перевод заглавия: Клоновый отбор венгерского (Н) варианта Y-вируса картофеля и первоначальное определение его структуры

ГРНТИ	34.25.29

ВИНИТИ 341.25.29.11
Рубрики: ВИРУС КАРТОФЕЛЯ Y
ВАРИАНТЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Thole, Vera; Dalmay, Tamas; Burgyan, Jozsef; Balazs, Ervin

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 89.09-04И9.181

Jenkins, Mark C.
A cDNA encoding a merozoite surface protein of the protozoan Eimeria acervulina contains tandem-repeated sequences [Text] / Mark C. Jenkins // Nucl. Acids Res. - 1988. - Vol. 16, N 20. - P9863 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: кДНК, кодирующая поверхностный белок мерозоитов простейшего Eimeria acervulina, содержит тандемноповторные последовательности
Аннотация: Тандемно повторяющиеся последовательности аминокислот известны у некоторых иммуногенных белков малярийного плазмодия и по крайней мере у 1 поверхностного гликопротеина Trypanosoma cruzi и Leishmaria major. Иммуноскринингом клонотеки E. acervulina с аСв против мембранных белков выделен клон кДНК, кодирующей иммуногенную область поверхностного белка мерозоитов с мол. м. 250 кД. Изученная аминокислотная последовательность содержит у 5'-окончания 14 тандемных повторов SPPSTPV. США, Animal Parasitol. Group, LPSI, ARS, USDA, Beltsville, MD 20705. Библ. 5.

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.15.15.09.15.17
Рубрики: EIMERIA ACERVULINA (PROT.)
МЕРОЗОИТЫ
ПОВЕРХНОСТНЫЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.03-04Б2.64

Hawkins, Christopher F.
A common structural motif in thiamin pyrophosphate-binding enzymes [Text] / Christopher F. Hawkins, Adolfo Borges, Richard N. Perham // FEBS Lett. - 1989. - Vol. 255, N 1. - P77-82 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: Общий структурный лейтмотив в тиаминпирофосфатсвязывающих ферментах
Аннотация: Сравнивали аминокислотные последовательности шестнадцати разных ферментов (из бактерий, дрожжей и млекопитающих), к-рые используют тиаминпирофосфат (ТПФ) в кач-ве кофактора. В этих ферментах обнаружен структурный элемент из 'ЭКВИВ'30 аминокислотных остатков, начинающийся с высококонсервативной последовательности -GDG- и оканчивающийся также высококонсервативной последовательностью -NN-. Остатки между ними намного менее консервативны, но имеют несколько общих особенностей. Так, на расстоянии 10 остатков от С-концевой стороны -GDG- обычно расположен отрицательно заряженный остаток (Е или D), через 5 и 11 остатков от к-рого расположены аланин и пролин соответственно. Последовательности -NN- предшествует кластер из 6 или 7 высокогидрофобных остатков. Этот структурный лейтмотив, как предполагается, может формировать вторичную структуру типа 'бета''альфа''бета' и служить сайтом присоединения ТПФ. Такой же структурный элемент обнаружен в выведенной аминокислотной цепи неидентифицированного белка из Rhodobacter capsulata. Ил. 3. Табл. 1. Библ. 40. Великобритания, [R. N. Perham], Dep. of Biochem., Univ. of Cambridge, Tennis Court Road, Cambridge CB2 1QW.

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.21
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ТИАМИНПИРОФОСФАТСВЯЗЫВАЮЩИЕ ФЕРМЕНТЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СРАВНЕНИЕ
КОФЕРМЕНТЫ
ТИАМИНПИРОФОСФАТ
МИКРООРГАНИЗМЫ
БАКТЕРИИ
ДРОЖЖИ
МЛЕКОПИТАЮЩИЕ
ПИРУВАТДЕКАРБОКСИЛАЗА
ПИРУВАТДЕГИДРОГЕНАЗА

Доп.точки доступа:
Borges, Adolfo; Perham, Richard N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI17) 98.03-04И1.101

Shishikura, Fumio.
A comparative study on earthworm hemoglobins: An amino acid sequence comparison of monomer globin chains of two species, Pontodrilus matsushimensis and Pheretima communissima that belong to the family Megascolecidae [Text] / Fumio Shishikura, Masako Nakamura // Zool. Sci. - 1996. - Vol. 13, N 6. - P849-856 . - ISSN 0289-0003
Перевод заглавия: Сравнительное исследование гемоглобинов дождевых червей: сравнение аминокислотных последовательностей в мономерных цепях глобина у двух видов - Pontodrilus matsushimensis и Pheretima communissima, принадлежащих к семейству Megascolecidae
Аннотация: Очищены субъединицы внеклеточных гемоглобинов из 2 видов мегасколецид. У Pontodrilus matsushimensis мол. масса субъединицы 16366 Да, в ней 141 аминокислотный остаток. У Pheretima communissima мол. масса субъединицы 16000 Да, она состоит из 140 остатков. Проведено сравнение с гемоглобинами 3 других видов дождевых червей, трубочника и полихеты. Дивергенция между 3 видами р. Pheretima произошла 50-100 млн. лет назад, а между рр. Pheretima и Pontodrilus - 209 млн. лет назад. Япония, Dep. of Biol., Nihon Univ. School of Medicine, Ohyaguchi-kami machi, Itabashi-ku, Tokyo. Ил. 6. Табл. 1. Библ. 41

ГРНТИ	34.33.15

ВИНИТИ 341.33.15.25.11.29
Рубрики: ОЛИГОХЕТЫ
MEGASCOLECIDAE (OLIGOCH.)
ГЕМОГЛОБИНЫ
МОНОМЕРНЫЕ ЦЕПИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Nakamura, Masako

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.06-04Б2.293

A family of six flagellin genes contributes to the Caulobacter crescentus flagellar filament [Text] / Bert Ely [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 17. - P5001-5004 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Семейство из шести генов флагеллинов вносит вклад в жгутиковый филамент Caulobacter crescentus
Аннотация: У Caulobacter crescentus жгутиковый филамент собирается из 6 флагеллинов (I), кодируемых разными генами. По аминокислотным последовательностям I FljJ (IA) и FljL (IB) отличаются от 4 остальных I. Т. к. IA и IB первыми собираются в жгутиковый филамент, они могут являться специализированными I, облегчающим инициацию сборки. США, Dep. Biol. Sci., Univ. South Carolina, Columbia, SC 29208. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.29
Рубрики: ЖГУТИКОВЫЙ ФИЛАМЕНТ
СБОРКА
6 ФЛАГЕЛЛИНОВ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
FIJJ
FIJL
CAULOBACTER CRESCENTUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Ely, Bert; Ely, Tracey W.; Crymes, William B.; Minnich, Scott A.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.04-04А3.410

Loytynoja, Ari.
A hidden Markov model for progressive multiple alignment [Text] / Ari Loytynoja, Michel C. Milinkovitch // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 12. - P1505-1513 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Скрытая марковская модель последовательного множественного сопоставления последовательностей
Аннотация: Представлен новый алгоритм множественного сопоставления последовательностей, который сочетает метод скрытых марковских моделей, алгоритм последовательного сопоставления и вероятностную модель эволюции, описывающую характер процессов замещения. Метод использует итеративные попарные сопоставления в соответствии с эволюционным древом, определяя каждый предшественник последовательности из парного сопоставления последующих узлов и последовательно конструируя множественное сопоставление. Метод позволяет рассчитывать минимальную апостериорную вероятность для каждой колонки сопоставления. Как показано, эта величина коррелирует с правильностью результата сопоставления и потому позволяет отфильтровывать недостоверно сопоставленные колонки. Программа доступна по адресу: http://www.ilb.ac.be/sciences/ueg/. Бельгия, Unit Evolutionary Genet., Free Univ. Brussels, CP 300, Inst. Mol. Biol. & Med., 6041 Gosselies. Библ. 23

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОЕ МНОЖЕСТВЕННОЕ СОПОСТАВЛЕНИЕ
СКРЫТАЯ МАРКОВСКАЯ МОДЕЛЬ
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Milinkovitch, Michel C.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 03.05-04А3.681

Buzko, Oleksandr.
A kinase sequence database: Sequence alignments and family assignment [Text] / Oleksandr Buzko, Kevan M. Shokat // Bioinformatics. - 2002. - Vol. 18, N 9. - P1274-1275 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: База данных последовательностей киназ. Сопоставление последовательностей и отнесение к семействам
Аннотация: База данных последовательностей киназ KSD (http://kinase.ucsf.edu/ksd) содержит информацию о 290 семействах протеинкиназ, сформированных с помощью кластерного анализа профилей невырожденных последовательностей 5041 протеинкиназ из 100 видов из GenBank. Классификация семейств основана на степени гомологичности киназных каталитических доменов (длиной 250- 300 остатков). Сопоставления представлены в формате Excel. Кроме того KSD содержит эволюционные древа для каждого семейства и детальную информацию о каждой последовательности. Имеются также программы генерирования эволюционных древ, отнесения последовательностей и статистического анализа. США, Dep. Cell. & Mol. Pharmac., Univ. California San Francisco, San Francisco, CA 94143-9450. Библ. 5

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: КИНАЗА
ПРОТЕИНКИНАЗЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СОПОСТАВЛЕНИЕ
КЛАССИФИКАЦИЯ СЕМЕЙСТВ
БАЗЫ ДАННЫХ
БАЗА ДАННЫХ KSD
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Shokat, Kevan M.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 90.11-04Б4.236

A major immunogenic 36,000-molecular-weight antigen from Mycobacterium leprae contains an immunoreactive region of proline-rich repeats [Text] / Jelle E. R. Thole [et al.] // Infec. and Immun. - 1990. - Vol. 58, N 1. - P80-87 . - ISSN 0019-9567
Перевод заглавия: Иммунодоминантный антиген с молекулярной массой 36 килодальтон из Mycobacterium leprae содержит иммунореактивный участок, состоящий из богатых пролином повторяющихся последовательностей
Аннотация: Из библиотеки рекомбинантной ДНК M. leprae в бактериофагах 'лямбда'gt11 и космидах выделены клоны, содержащие полностью ген (pra), кодирующий иммунодоминантный белок с мол. м. 36 кД M. leprae, несущий Т- и В-клеточные антигенные детерминанты. Показано, что последовательность ДНК гена pra кодирует полипептид, состоящий из 249 аминокислот и имеющий мол. м. 26,299 кД. Установлено, что на NH[2]-конце полипептида расположен богатый пролином участок (42%), состоящий из повторов аналогичных или идентичных последовательности PGGSYPPPPP. Продемонстрировано, что мАТ F47-9, F67-1, F67-5 и F126-5 взаимодействуют именно с этим участком полипептида PRA. Анализ иммунореактивности полипептида и нуклеотидной последовательности ДНК pra позволяет предположить, что выделенный ранее (R. A. Young и соавт., "Nature", 316: 450-452, 1985) с помощью мАТ F47-9 рекомбинант Y3180 ('лямбда'gt11) кодирует не имеющий отношения к PRA белок слияния, содержащий аналогичный эпитоп, распознаваемый мАТ F47-9. Библ. 41. Нидерланды, N. H. Swellengrebel Lab. of Trop. Hygiene, Royal Tropical Inst. Mcibergdreef 39. 1105 AZ Amsterdam.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.07
Рубрики: MYCOBACTERIUM LEPRAE (BACT.)
АНТИГЕНЫ
СТРУКТУРА
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АТИТЕЛА
ДНК
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

Доп.точки доступа:
Thole, Jelle E.R.; Stabel, Linda F.E.M.; Суыкервуык, Марйон Е.Г.; де, Щит Маделеине Ы.Л.; Клатсер, Паул Р.; Колк, Аренд Ш.Й.; Шартскеерл, Руды А.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 89.12-04А1.110

Martin, P. G.
A molecular evolutionary clock for angiospering [Text] / P. G. Martin, I. M. Dowd // Taxon. - 1988. - Vol. 37, N 2. - P364-377 . - ISSN 0040-0262
Перевод заглавия: Молекулярные эволюционные часы для покрытосеменных
Аннотация: Для определения скорости молекулярной эволюции проводили сравнение N-терминальных аминокислотных последовательностей малой субъединицы фермента "рубиско" некоторых таксонов Proteaceae, Winteraceae, Nothofagus и Solanum, имеющих разрыв ареалов, связанный с разделением Гондваны и последующим континентальным дрейфом. Сравнивали таксоны Австралии (А) и Юж. Америки, А и Новой Зеландии, А и Африки. В результате получены ур-ния линейной регрессии ("молекулярные часы"), связывающие макромолекулярные изменения (замещения аминокислотных остатков) со временем. Концепция "молекулярных эволюционных часов" была разработана на гомологичных белках животных, гл. обр. млекопитающих, для к-рых хорошо датируется время дивергенции. По растениям аналогичных данных по последовательностям мало, и авторы могли использовать только свои результаты по 40 терминальным аминокислотным остаткам рубиско. Время дивергенции определяли ориентировочно по палеогеографическим реконструкциям. Составлены филогенетические деревья для Nothofagus (внешняя группа - Quercus), Winteraceae (внешняя группа - agnoliaceae), Proteaceae (выбор внешней группы оказался сложным, в качестве таковой рассматриваются Promonocotyledones) и др. На этой основе построены деревья согласия миним. длины, т. е. использован один из методов максимальной парсимонии. Хотя по различным таксонам наблюдается большая дисперсия данных, скорость эволюции по наиболее вероятной линии регрессии составляет одну нуклеотидную замену в течение 7 миллионо лет. Результаты рассматриваются как предварительные. Австралия, South Australia 5001, Adelaide, Univ. of Adelaide, Dept. of Bot. Ил. 4. Табл. 4. Библ. 39.

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.11 + 341.03.21
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ТЕМПЫ ЭВОЛЮЦИИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФЕРМЕНТ "РУБИСКО"
ПОКРЫТОСЕМЕННЫЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДРЕВА
ПАРСИМОНИЯ

Доп.точки доступа:
Dowd, I.M.

15.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 89.01-04Н1.173

A myeloid-related sequence that localizes to human chromosome 8q21.1-22 [Text] / Wendy M. Mars [et al.] // Blood. - 1988. - Vol. 71, N 6. - P1713-1719
Перевод заглавия: Связанная с миелоидными клетками последовательность, располагающаяся у человеческой хромосомной области 8q21.1-22
Аннотация: Ранее показано существование такой последовательности (Пс) и комплементарной ДНК в лейкоцитах б-ных хронич. миелоидным лейкозом (Mars W. M. и соавторы, Blood, 1985, 65, 1218). Нуклеотидный анализ показал, что Пс кодирует уникальный белок из 93 аминокислот, включающий 18 основных аминокислотных последовательностей. Гибридизация пробы комплементарной ДНК Пс с ДНК Кл соматич. гибридов человека выявила 1000%-ное соответствие с Хр 8 человека и подтвердила расположение Пс на этой Хр. Гибридизация in situ метафазных Хр позволила уточнить местонахождение Пс в положении 8q21.1-22, поскольку 58% гранул, проявляемых на Хр 8, сконцентрированы в этой обл. Зона скопления гранул окружает точку поломки при транслокации с вовлечением полосы 8q22. Такая транслокация наблюдается у 18% б-ных острыми нелимфоидными лейкозами. Проводили гибридизацию с использованием ДНК соматич. гибридов человека, содержащих либо делецию 8q-, либо добавочное плечо 21q+, от 2 б-ных острыми нелимфоидными лейкозами. Сигнал появлялся только в случае делеции 8q-. США, Univ. of Texas M. D. Anderson Hosp. and Tumor Inst. at Houston. Библ. 37.

ГРНТИ	76.29.49

ВИНИТИ 761.29.49.19.13.21
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
ОБЛАСТЬ 8Q21.1-22
ДНК
БЕЛКИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ЛЕЙКОЗ ХРОНИЧЕСКИЙ МИЕЛОИДНЫЙ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Mars, Wendy M.; van, Tuinen Peter; Drabkin, Harry A.; White, James W.; Saunders, Grady F.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 94.03-04А3.498

Friemann, Andreas.
A new approach for displaying identities and differences among aligned amino acid sequences [Text] / Andreas Friemann, Stefan Schmitz // Comput. Appl. Biosci. - 1992. - Vol. 8, N 3. - P261-265 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Новый подход к отображению идентичностей и различий выравненных последовательностей аминокислот
Аннотация: Предложен алгоритм подсчета степени сходства выравненных последовательностей аминокислот. Для каждой позиции определяется идентичный участок др. последовательности, и затем определяется среднее значение по окрестностям по всей последовательности. 2-й алгоритм определяет аналогичным образом отличия последовательностей. Оба удобны для реализации на микро-ЭВМ. Приведены примеры их использования на нитратредуктазах высших растений, показывающие быстродействие и высокую точность анализа. Германия, Botanisches Inst. der Univ. Bonn, D-5300 Bonn I. Ил. 2. Библ. 20.

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.29
Рубрики: ОБРАБОТКА ДАННЫХ
АЛГОРИТМЫ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОТОБРАЖЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Schmitz, Stefan

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 91.01-04Б4.251

A new fimbrial type (PCF09) on enterotoxigenic Escherichia coli 09:HLT+ isolated from a case of infant diarrhea in Central Australia [Text] / Michael W. Heuzenroeder [et al.] // FEMS Microbiol Lett. - 1990. - Vol. 66, N 1-3. - P55-60 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Характеристика нового фактора колонизации (PCF 09), продуцируемого энтеротоксигенными штаммами Escherichia coli 09:HLT+, выделенными от детей с диареей в Центральной Австралии
Аннотация: Исследовали некоторые молекулярные х-ки нового предполагаемого фактора колонизации, обозначенного PCF 09 и продуцируемого энтеротоксигенными Escherichia coli 09:Н выделенными при вспышке диареи у детей в Центральной Австралии, а также его генетический контроль. Основной белок PCF 09, полученный в чистом виде, имел мол. м. 27 кД и отличался по NH[2]-концевой последовательности от др. фимбриальных АГ (CS 5, PAP A, K99, К88АВ), хотя у них был выявлен общий аминокислотный состав. Установлен температурозависимый характер экспрессии PCF 09 и показано путем эл. микроскопии бактериальных клеток, маркированных частицами золота, что этот АГ обнаруживается на поверхности бактерий в виде фибрилл. Гены, детерминирующие синтез АГ PCF 09, были клонированы из хромосомной ДНК исходного шт. E. coli на фрагменте величиной 6,7 т. п. о. и построена физическая карта рекомбинантной плазмиды. Локализация гена, кодирующего синтез основной субъединицы PCF 09, на клонированном фрагменте ДНК определена с помощью синтетического олигонуклеотидного зонда. Библ. 26. Австралия, Dept. Microbiol. Immunol., Univ. Adelaide.

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.21.07.99
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ФАКТОРЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
КОЛОНИЗАЦИЯ
ФИМБРИИ
СТРУКТУРА
ПИЛИН
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ЗОНДЫ
ДНК ГИБРИДИЗАЦИЯ
ЭЛЕКТРОННАЯ МИКРОСКОПИЯ

Доп.точки доступа:
Heuzenroeder, Michael W.; Elliot, Trevor R.; Thomas, Connor J.; Halter, Roman; Manning, Paul A.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.12-04А3.988

Dopazo, Joaquin.
A new index to find regions showing an unexpected variability or conservation in sequence alignments [Text] / Joaquin Dopazo // Comput. Appl. Biosci. - 1997. - Vol. 13, N 3. - P313-317 . - ISSN 0266-7061
Перевод заглавия: Новый индекс для обнаружения областей с неожиданной вариабельностью или консерватизмом при выравнивании последовательностей
Аннотация: Разработаны показатели для идентификации областей неожиданной вариабельности или консерватизма при выравнивании аминок-тных последовательностей белков. Индекс основан на определении наблюдаемого и ожидаемого уровней вариабельности с использованием табличных данных о вероятности аминок-тных замен. Испания, Dep. Bioinformatica, TDI, c/Severo Ochoa S/N, Edificio B3, Nave 103, 28100 Alcobendas, Madrid. Библ. 15

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВЫРАВНИВАНИЕ
ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ И КОНСЕРВАТИЗМ
ВЫЯВЛЕНИЕ
ИНДЕКС
РАЗРАБОТКА
МЕТОДЫ

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.02-04А3.907

Yang, Ziheng.
A new method of inference of ancestral nucleotide and amino acid sequences [Text] / Ziheng Yang, Sudhir Kumar, Masatoshi Nei // Genetics. - 1995. - Vol. 141, N 4. - P1641-1650 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Новый метод логического вывода предковых нуклеотидных и аминокислотных последовательностей
Аннотация: Предложена статистическая модель, позволяющая на основе эмпирических баз данных выстраивать предковые нуклеотидные (генные) или аминокислотные (полипептидные) последовательности. Предлагаемая модель основана на расчислении вероятностей точковых (нуклеотидных - смысловых или несмысловых) замен и вероятностей дивергенции вариантов эволюционирующих последовательностей. Апробация разработанного метода проведена на материале параметров лизоцимов-c у 6 млекопитающих с использованием методов максимального правдоподобия и парсимонии;в целом отмечено хорошее совпадение с реальным филогенезом этих таксономических групп. Определены максимальные вероятности точности метода всех аминокислот в отдельных узлах выстраиваемой филогенетической схемы - 0,73-0,91; точность метода парсимонии 0,51-0,84. Для 4 последовательностей метод максимального правдоподобия дает результат 91,3':-'98,7%. США, Dep. Integr. Biol., Univ. California, Berkeley, CA 94720-3140; e-mail - ziheng

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: НУКЛЕОТИДНЫЕ ПРЕДКОВЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ВОССТАНОВЛЕНИЕ
МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ

Доп.точки доступа:
Kumar, Sudhir; Nei, Masatoshi

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 05.08-04А3.532

A special-purpose computer for exploring similar protein sequences by the dynamic programming method [Text] / Takashige Sugie [et al.] // Comput. Phys. Commun. - 2004. - Vol. 157, N 1. - P1-8 . - ISSN 0010-4655
Перевод заглавия: Компьютер специального назначения для исследования сходных белковых последовательностей методом динамического программирования
Аннотация: Создан специализированный компьютер BIOLER-1 для исследования сходных аминокислотных последовательностей белков методом динамического программирования. Он может устанавливать сходство между последовательностями двух белков длиной до 1024 остатков. Описана конструкция BIOLER-1, подсоединяемого к персональному компьютеру. Его производительность составляет 3564 миллиона команд в 1 с, что втрое быстрее, чем у персонального компьютера с Pentium 4 с частотой 1,8 ГГц. Япония, Dep. Electronics & Mech. Eng., Chiba Univ., 1-33 Yayoi, Inage, Chiba 263-8522. Библ. 18

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
УСТАНОВЛЕНИЕ СХОДСТВА
СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫЙ КОМПЬЮТЕР BIOLER-1
МЕТОД ДИНАМИЧЕСКОГО ПРОГРАММИРОВАНИЯ

Доп.точки доступа:
Sugie, Takashige; Horita, Keiji; Hosono, Satoru; Ito, Tomoyoshi; Ebisuzaki, Toshikazu

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска