Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=КВАЗИВИДЫ<.>)
Общее количество найденных документов : 125
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.02-04Б1.370

   

    Dynamic behavior of hepatitis C virus quasispecies in patients undergoing orthotopic liver transplantation [Text] / Maria Martell [et al.] // J. Virol. - 1994. - Vol. 68, N 5. - P3425-3436
Перевод заглавия: Динамическое поведение квазивидов вируса гепатита С (ВГС) у больных при ортотопической трансплантации печени
Аннотация: В образцах, взятых до и после трансплантации печени от 2 б-ных ВГС-циррозом, путем секвенирования клонированных ПЦР-продуктов исследовали распределение вирусных последовательностей 5'-некодирующей обл. и фрагмента из обл. Е2/NS2 генома ВГС. В обоих случаях показано усложнение состава квазивидов вируса после трансплантации, хотя консенсусные нуклеотидные и аминок-тные последовательности оставались неизменными. Предполагается существенное влияние на генетический состав квазивидов как позит., так и негат. отбора, равно как и элемента случайности при взятии образца. Рецидив ВГС-инфекции может иметь место в условиях равновесия. Испания, Liver Unit, Dep. of Med., Hosp. General Univ. Vall d'Hebron, Barcelona. Илл. 4. Табл. 1. Библ. 22.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.39.17
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
КВАЗИВИДЫ

СОСТАВ

ТРАНСПЛАНТАЦИЯ ПЕЧЕНИ

БОЛЬНЫЕ


Доп.точки доступа:
Martell, Maria; Esteban, Juan I.; Quer, Josep; Vargas, Victor; Esteban, Rafael; Guardia, Jaume; Gomez, Jordi

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.03-04Б1.17

   

    Characterization of simple and complex hepatitis C virus quasispecies by heteroduplex gel shift analysis: Correlation with nucleotide sequencing [Text] / Jeffery J. Wilson [et al.] // J. Gen. Virol. - 1995. - Vol. 76, N 7. - P1763-1771 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Характеристика простых и сложных квазивидов вируса гепатита С (ВГС) путем анализа сдвига гетеродуплексов в геле: корреляция с секвенированием нуклеотидов
Аннотация: Известно, что инфицированных лиц ВГС существует как квазивид (КВ), характеризующийся множеством замен нуклеотидов в гипервариабельной области 1 (HVR1) второго гена оболочки. Для характеристики КВ обычно используют ОТ-ПЦР-амплификацию с клонированием и секвенированием большого числа клонов. Использовали более простой, быстрый и дешевый метод, известный как анализ сдвига гетеродуплексов в геле (GSA), к-рый применялся для анализа КВ ВИЧ. С помощью GSA последовательностей HVR1, амплифицированных непосредственно из сыворотки, и/или анализа нуклеотидных последовательностей охарактеризованы простые (дающие однородный профиль сдвига с одной доминирующей полосой) и сложные (с несколькими полосами) КВ, полученные от 4 б-ных с активной инфекцией ВГС. В общей сложности было проанализировано 119 индивидуальных клонов. Показано приблизительное соответствие профилей GSA популяции клонов и строгая корреляция GSA клонов HVR1 с секвенированием нуклеотидов. США, Viral Hepatits Lab., Dep. of Lab. Med., Univ. of Washington Med. Cent., Seattle, WA 98195. Ил. 3. Библ. 19
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНАЯ ОБЛАСТЬ

КВАЗИВИДЫ

СЕКВЕНИРОВАНИЕ

СДВИГ ГЕТЕРОДУПЛЕКСОВ В ГЕЛЕ

КОРРЕЛЯЦИИ


Доп.точки доступа:
Wilson, Jeffery J.; Polyak, Stephen J.; Day, Timothy D.; Gretch, David R.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.408

    Tao, Binli.

    Molecular and biological analyses of quasispecies during evolution of a virulent simian immunodeficiency virus, SIVsmmPBj14 [Text] / Binli Tao, Patricia N. Fultz // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 4. - P2031-2037 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Молекулярный и биологический анализ квазивидов в процессе эволюции вирулентного вируса иммунодефицита обезьян SIVsmmPBj14
Аннотация: Прототипный вариант вируса иммунодефицита обезьян SIVsmm9, выделенный от шерстистых мангабеев, пассировали на макаках PBj. Один из вариантов вируса, выделенный из тканей животного, погибшего через 14 мес после инокуляции при типичных проявлениях СПИД'оподобного синдрома, обнаружил исключительную вирулентность, максимальную среди известных лентивирусов приматов. Этот вариант индуцировал острое заболевание и гибель макак через 6-10 суток после внутривенного введения. Отличительные св-ва варианта включали способность реплицироваться в неактивированной популяции мононуклеарных клеток периферической крови макак, способность активировать и индуцировать пролиферацию клеток CD4+ и CD8+ и цитопатическую активность в отношении лимфоцитов CD4+ мангабеев. США, Univ. of Alabama at Birmingham, Birmingham, Alabama 35294
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУС ИММУНОДЕФИЦИТА ОБЕЗЬЯН
КВАЗИВИДЫ

ПРИМАТЫ

БИОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ


Доп.точки доступа:
Fultz, Patricia N.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.12-04Б1.330

   

    Defective accessory genes in a human immunodeficiency virus type 1-infected long-term survivor lacking recoverable virus [Text] / Nelson L. Michael [et al.] // J. Virol. - 1995. - Vol. 69, N 7. - P4228-4236 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Дефектные вспомогательные гены у выжившего в течение длительного времени пациента, инфицированного вирусом иммунодефицита человека типа 1 и не имеющего выделяемого вируса
Аннотация: Продолжено изучение асимптоматической пациентки, зараженной ВИЧ-1 13 лет назад при переливании крови и имеющей очень низкую вирусную нагрузку, но серопозитивной по антигенам ВИЧ-1. Изучены провирусные квазивиды ВИЧ-1, выделенные от этой пациентки на протяжении 5 лет. Последовательность LTR свидетельствует о нормальной базальной и опосредованной Tat промоторной активности. Частота дефектных генов nef очень низка (8,3%), последовательность не претерпевала эволюции и преобладающие формы nef были активны. Анализ ампликона, содержащего гены vif, vpr, vpn, tat1 и rev1, обнаружил инактивирующие мутации в 64% клонов. Эти данные позволяют предположить, что пациентка, первоначально инфицированная вирулентным ВИЧ-1, в настоящее время несет сильно аттенуированные квазивиды ВИЧ-1 в рез-те эффективного хозяйского иммунитета. США, Dev. of Retrovirol., Walter Reed Army Inst. of Res., Rockville, MD 20850. Библ. 69
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
КВАЗИВИДЫ

ФОРМИРОВАНИЕ

ИНФИЦИРОВАННЫЕ ЛИЦА

ХОЗЯЙСКИЙ ИММУНИТЕТ


Доп.точки доступа:
Michael, Nelson L.; Chang, George; D'Arcy, Lisa A.; Ehrenberg, Philip K.; Mariani, Roberto; Busch, Michael P.; Birx, Deborah L.; Schwartz, David H.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.06-04Б1.145

   

    Evolution of fitness in experimental populations of vesicular stomatitis virus [Text] / Santiago F. Elena [et al.] // Genetics. - 1996. - Vol. 142, N 3. - P673-679 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Эволюция приспособленности в экспериментальной популяции вируса везикулярного стоматита
Аннотация: При культивировании РНК-вирусов часто наблюдаются мутации, гомо- и гетерологичные рекомбинации. Поэтому даже клоновые популяции представляют собой смесь вариантов (квазивидов) и обладают выраженным генным полиморфизмом. Динамика эволюции вирусной популяции определяется ее приспособленностью, т. е. способностью квазивидов вируса проходить полный цикл репродукции с образованием инфекционных частиц. Вирус везикулярного стоматита клон MARM культивировали в клетках ВНК21 или HeLa с пассажами из флакона в флакон, из бляшки в бляшку или по перемежающейся схеме. Некоторые пассажи проводили в присутствии моноклональных антител к исходному штамму для подавления возможных ревертантов дикого типа. При пассажах из бляшки в бляшку приспособленность вирусов снижалась по сравнению с приспособленностью дикого вируса, а при пассажал во флаконах она повышалась. У клонов с высокой приспособленностью наблюдалась более выраженная ее редукция, чем у клонов с низкой приспособленностью при включении пассажей из бляшки в бляшку. С другой стороны увеличение приспособленности было тем выраженней, чем она была ниже у исходного клона. Кол-венный генетический анализ конечных популяций показал, что генетическая вариация признака положительно коррелирует с величиной изменений в данном признаке. Полученные данные обсуждаются в плане отношения благоприятных мутаций к генному дрейфу вируса. Испания, [A.Moya], Dep. de Genetica i Servei de Bioinform., Fac. de Biol., Univ. de Valencia, Dr. Moliner, 50, E-46100 Burjassot, Valencia
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.11
Рубрики: ВИРУС ВЕЗИКУЛЯРНОГО СТОМАТИТА
КВАЗИВИДЫ

ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВАРИАЦИИ

ЭВОЛЮЦИЯ

ПРИСПОСОБЛЕННОСТЬ


Доп.точки доступа:
Elena, Santiago F.; Gonzalez-Candelas, Fernando; Novella, Isabel S.; Duarte, Elizabeth A.; Clarke, David K.; Domingo, Esteban; Holland, John J.; Moya, Andres

6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.07-04Б1.291

   

    Detection of different quasispecies of hepatitis C virus core region in cancerous and noncancerous lesions [Text] / Chiyo Horie [et al.] // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1996. - Vol. 218, N 3. - P674-681 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Обнаружение разных квазивидов сердцевинной области вируса гепатита С в раковых и нераковых повреждениях
Аннотация: Изучены квазивиды (КВ) сердцевинной области генома вируса гепатита С (ВГС) в раковых и нераковых повреждениях (РП и НРП) у 7 больных с гепатоклеточной карциномой. Использованы методы ПЦР-амплификации и полиморфизма конформации однонитевой ДНК. Показано, что в РП содержится иной набор КВ ВГС и большее число КВ, чем в НРП. Предсказанные аминокислотные последовательности показали, что в положении 45 сердцевинного белка преобладает остаток сер в НРП и остаток гли в РП. Т. обр., ВГС в гепатоклеточных карциномах состоит из большого числа специфических КВ, вероятно, в связи с их способностью к мощной пролиферации. Другой набор КВ с аминокислотной заменой, вероятно, участвует в гепатоканцерогенезе. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.21
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ГЕНОМ

СЕРДЦЕВИННАЯ ОБЛАСТЬ

КВАЗИВИДЫ

РАКОВЫЕ ПОРАЖЕНИЯ

НЕРАКОВЫЕ ПОРАЖЕНИЯ

БОЛЬНЫЕ


Доп.точки доступа:
Horie, Chiyo; Iwahana, Hiroyuki; Horie, Takahiro; Shimizu, Ichiro; Yoshimoto, Katsuhiko; Yogita, Shiro; Tashiro, Seiki; Ito, Susumu; Itakura, Mitsuo

7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.09-04Б1.101

   

    Competitive selection in vivo by a cell for one variant over another: Implications for RNA virus quasispecies in vivo [Text] / Janel Docketer [et al.] // J. Virol. - 1996. - Vol. 70, N 3. - P1799-1803 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Конкурентная селекция in vivo клеткой одного варианта по сравнению с другим: следствия для квазивидов РНК-содержащих вирусов
Аннотация: Ранее было показано, что остаток фен[260] в гликопротеине (I) вируса лимфоцитарного хориоменингита (ВЛХ) дикого типа коррелирует с тропизмом к нейронам, а остаток лей[260] у клона 13 ВЛХ - с тропизмом к клеткам иммунной системы. Изучена способность вариантов ВЛХ с остатками фен[260] или лей[260] реплицироваться in vivo в селезенке, печени и головном мозге и конкурировать друг с другом за нейрон-специфическую селекцию при разных отношениях количеств вирионов. Оба варианта одинаково хорошо реплицируются в нейронах, но при совместной инокуляции нейроны отбирают популяцию вирусов, содержащих остаток фен[260], а в печени и почках преимущественно размножается вариант с остатков лей[260]. Анализ заражения реассортантами ВЛХ показал, что гены, расположенные на коротких сегментах РНК: гены I и нуклеопротеина (II), но не гены полимеразы L и белка Z, ассоциированы с нейротропизмом. Т. к. последовательности II у штамма Armstrong дикого типа и клона 13 одинаковы, можно предположить, что специфические цитоплазматические факторы в нейронах играют главную роль в селекции вируса с остатком фен[260] в I. США, Dep. of Neuropharmacol., Scripps Research Inst., La Jolla, CA 92037. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ВИРУС ЛИМФОЦИТАРНОГО ХОРИОМЕНИНГИТА
ВАРИАНТЫ

КОНКУРЕНТНАЯ СЕЛЕКЦИЯ

КВАЗИВИДЫ

ЦИТОПЛАЗМАТИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ

НЕЙРОНЫ


Доп.точки доступа:
Docketer, Janel; Evans, Claire F.; Tishon, Antoinette; Oldstone, Michael B.A.

8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.10-04Б1.408

    Yeh, Chau-Ting.

    Distinct composition of viral quasispecies between ascites and serum samples from patients with late stage chronic hepatitis C [Text] / Chau-Ting Yeh, Chia-Ming Chu, Yun-Fan Liaw // Biochem. and Biophys. Res. Commun. - 1996. - Vol. 227, N 2. - P524-529 . - ISSN 0006-291X
Перевод заглавия: Различный состав вирусных квазивидов в пробах асцитов и сыворотки у больных на поздней стадии хронического гепатита C
Аннотация: Методами полиморфизма конформации оДНК и ПЦР-клонирования и секвенирования сравнен аминокислотный состав гипервариабельных и вариабельных областей вируса гепатита C (ВГС) в пробах асцитов и сыворотки у 2 пациентов на поздней стадии хронического гепатита C. У первого пациента главный асцитный клон ВГС совпадает с минорным сывороточным клоном, а главный сывороточный клон отсутствует в асцитах. Кроме того, в асцитных моноядерных клетках найдена антигеномная РНК ВГС. У второго пациента главный асцитный клон ВГС дефектен и генетически отличается от сывороточных клонов. Эти данные показали, что брюшная полость является довольно изолированным отделением для эволюции квазивидов ВГС особого состава. Тайвань, Liver Res. Unit, Chang Gung Mem. Hosp. and Med. Coll., Taipei. Библ. 29
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.21
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА C
КВАЗИВИДЫ

АМИНОКИСЛОТНЫЙ СОСТАВ

СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ


Доп.точки доступа:
Chu, Chia-Ming; Liaw, Yun-Fan

9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.12-04Б1.184

    Nichol, Stuart.

    Life on the edge of catastrophe [Text] / Stuart Nichol // Nature. - 1996. - Vol. 384, N 6606. - P218-219 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Жизнь на грани катастрофы
Аннотация: Автор делится впечатлением от докладов, сделанных на международном совещании по квазивидам РНК-содержащих вирусов, состоявшемся в Мадриде 7-9 октября 1996 г. В силу неточности работы используемой для репликации генома вирусной РНК-полимеразы (10{-3}-10{-4} замен на основание), отсутствия механизмов коррекции, а также высокой частоты рекомбинации РНК-содержащие вирусы существуют в виде множества генетических вариантов (квазивидов). Наглядным примером являются вирусы иммунодефицита человека, гриппа А, ящура и полиомиелита. Проблема изменчивости генома рассматривается в свете эволюции вирусов, разработки вакцин и применения противовирусных химиопрепаратов. США, Div. of Viral and Rickettsial Dis., Centers for Dis. Control and Prevention, 1600 Clifton Road, Atlanta, GA 30333
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.02
Рубрики: РНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ
ИЗМЕНЧИВОСТЬ

КВАЗИВИДЫ

ВАКЦИНЫ

ХИМИОПРЕПАРАТЫ


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.02-04Б1.62

   

    Genetic analysis of the hepatitis C virus (HCV) genome from HCV-infected human T cells [Text] / K. Sugiyama [et al.] // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78, N 2. - P329-336 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Генетический анализ генома вируса гепатита С (ВГС) из ВГС-инфицированных Т-клеток человека
Аннотация: Ранее авторами была получена клеточная культуральная система для репликации ВГС с использованием инфицированных HTLV-I клеток линии МТ-2 и показано, что квазивидовая в исходном инокулюме гипервариабельная область генома становится однородной в клетках МТ-2 через 10 дней после инокуляции ВГС. Сообщается о получении на 12 день после инокуляции с помощью двойной полимеразной р-ции с обратной транскрипцией с использованием РНК из ВГС-инфицированных клеток МТ-2С, обеспечивающих более эффективную репликацию вируса, клонов кДНК, полностью охватывающих геном вируса. Был также выделен 41 клон кДНК почти с полным охватом генома из библиотеки кДНК, полученной из исходного инокулюма. Сравнение последовательностей клонов ВГС из обоих источников показало, что после инокуляции популяции ВГС стали однородными более чем по половине сравниваемых областей генома, из чего следует, что лишь ограниченная популяция ВГС из инокулюма способна адаптироваться к размножению в клетках МТ-2С. Из ВГС-инфицированных клеток МТ-2С были выделены также клоны кДНК, содержащие 3' Х-концевую последовательность, идентифицированную недавно как bona fide. Подтверждено, что 3' Х-концевая последовательность является высококонсервативной, что свидетельствует об ее участии в репликации ВГС. На основе последовательностей кДНК-клонов ВГС, полученных из ВГС-инфицированных клеток МТ-2С, определена полная нуклеотидная последовательность содержащего 3' Х-конец генома ВГС как кандидата в инфекционный молекулярный клон вируса. Япония, Virol. Div., National Cancer Center Res. Inst., 5-1-1 Tsukiji, Chuo-ku, Tokyo 104. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ГЕНОМ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

КЛОНЫ

ГИПЕРВАРИАБЕЛЬНАЯ ОБЛАСТЬ

КВАЗИВИДЫ

КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК


Доп.точки доступа:
Sugiyama, K.; Kato, N.; Mizutani, T.; Ikeda, M.; Tanaka, T.; Shimotohno, K.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.05-04Б1.25

   

    Non-isotopic detection of hepatitis C virus quasispecies by single strand conformation polymorphism [Text] / Jung-Hun Lee [et al.] // J. Med. Virol. - 1997. - Vol. 53, N 3. - P245-251 . - ISSN 0146-6615
Перевод заглавия: Неизотопное обнаружение квазивидов вируса гепатита С на основании одноцепочечного конформационного полиморфизма
Аннотация: У больных хроническим гепатитом С обнаружена гетерогенная популяция вируса, содержащая так называемые квазивиды. Квазивиды различаются по гипервариабельным областям гена Е2. В работе оптимизирован общий для всех генотипов набор праймеров, позволяющий амплифицировать гипервариабельную область. Также предложен метод анализа одноцепочечного конформационного полиморфизма для быстрого обнаружения преобладающих в сыворотках квазивидов. Метод основан на полимеразной цепной реакции и электрофорезе. С помощью предложенного метода показано, что лечение 'альфа'-интерфероном может изменять распределение квазивидов у б-ных хроническим гепатитом. Германия, Med. Klinik II, Klinikum der J. W. Goete-Univ., D-60590 Frankfurt a.M. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.05.07
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
КВАЗИВИДЫ

НЕИЗОТОПНОЕ ВЫЯВЛЕНИЕ

КОНФОРМАЦИОННЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ


Доп.точки доступа:
Lee, Jung-Hun; Stripf, Tobias; Roth, W.Kurt; Zeuzem, Stefan

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.05-04Б1.268

   

    Virus 'quasispecies': Making a mountain out of a molehill? [Text] / Donald B. Smith [et al.] // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78, N 7. - P1511-1519 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Вирусные "квазивиды" - не делается ли гора из кротовины?
Аннотация: Обзор. Термин "квазивиды" обычно используют для описания гетерогенной структуры вирусной популяции. Вирусная популяция у инфицированных индивидуумов может быть гетерогенной, однако автор указывает на несовершенство терминологии, возникающие артефакты при полимеразной цепной р-ции, обсуждает альтернативные методы изучения вирусной гетерогенности. Великобритания, Dep. of Med. Microbiol., Univ. of Edinburgh, Med. Sch., Teviot Place, Edinburgh EH8 9AG
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.02
Рубрики: ВИРУСНЫЕ ИНФЕКЦИИ
ПОПУЛЯЦИЯ

ГЕТЕРОГЕННОСТЬ

КВАЗИВИДЫ

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 51


Доп.точки доступа:
Smith, Donald B.; McAllister, Jane; Casino, Carmela; Simmonds, Peter

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.194

    Boerlijst, Maarten.

    Viral quasi-species and recombination [Text] / Maarten Boerlijst ; Math. Forschungsinst., Oberwolfach // Tagungsber. - 1996. - N 40. - P4
Перевод заглавия: Вирусные квазивиды и рекомбинация
Аннотация: Вирусная популяция представляет собой совокупность различающихся, но близкородственных, геномов, т. н. квазивидов. Математический анализ вирусных квазивидов фокусируется на точечных мутациях, как основном источнике вариабельности. Однако, ретровирусы (равно как и многие др. вирусы) способны к рекомбинации их геномов. В работе проанализирована математическая модель движущей силы вирусных квазивидов, включающая как точечные мутации, так и рекомбинацию. Показано, что при низких уровнях мутаций рекомбинация может редуцировать разнообразие и усиливать общее соответствие. Однако при высоких уровнях мутаций рекомбинация может способствовать возникновению пороговых ошибок, вызывая т. обр. потерю всей генетической информации
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.02
Рубрики: ВИРУСЫ
КВАЗИВИДЫ

ОБРАЗОВАНИЕ

МУТАЦИИ

РЕКОМБИНАЦИЯ

МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ


14.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI11) 98.10-04Б1.730

   

    Quasispecies nature of hepatitis C virus (HCV) in patients with chronic hepatitis C with mixed HCV subtypes [Text] / Hidenori Toyoda [et al.] // J. Med. Virol. - 1998. - Vol. 54, N 2. - P80-85 . - ISSN 0146-6615
Перевод заглавия: Квазивидовая природа вируса гепатита С (ВГС) у больных хроническим гепатитом С со смешанными субтипами ВГС
Аннотация: Для определения субтипов (СТ) ВГС использована ПЦР с праймерами для сердцевинной области. Число СТ оценивали методом ПЦР-амплификации гипервариабельной области 1. Показано, что у 35 б-ных, инфицированных смесью СТ ВГС, число квазивидов ВГС больше, чем у 83 больных, инфицированных каким-либо одним СТ ВГС. Япония, Second Dep. of Internal Med., Nagoya Univ., School of Med., Nagoya 466. Библ. 30
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.03.41.02
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
КВАЗИВИДЫ

ПОДТИПЫ

ВИРУСНЫЕ ГЕПАТИТЫ

ХРОНИЧЕСКИЙ ГЕПАТИТ С

БОЛЬНЫЕ


Доп.точки доступа:
Toyoda, Hidenori; Fukuda, Yoshihide; Nakano, Isao; Katano, Yoshiaki; Takayama, Tetsuo; Kumada, Takashi; Nakano, Satoshi; Takamatsu, Junki; Saito, Hidehiko; Hayakawa, Tetsuo

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.12-04Б1.248

   

    Analysis of mother-to-infant transmission of hepatitis C virus: Quasispecies nature and buoyant densities of maternal virus populations [Text] / Toyoichiro Kudo [et al.] // J. Med. Virol. - 1997. - Vol. 51, N 3. - P225-230 . - ISSN 0146-6615
Перевод заглавия: Анализ передачи вируса гепатита С от матери ребенку - квазивидовая природа и плавучая плотность вирусной популяции у матерей
Аннотация: Трансмиссию вируса гепатита С изучали на примере двух матерей и их детей. Сыворотки матерей подвергали ультрацентрифугированию. Были секвенированы гипервариабельная область 1 (HVR1) (N-терминальная область предполагаемого белка оболочки Е2) и карбоксильный конец белка оболочки Е1. Аминокислотные последовательности у обоих детей были более близки друг другу, чем у их матерей. Последовательности Е1 у каждой матери и ее ребенка были практически идентичными, последовательности HRV1 были близки, но не идентичны. Нуклеотидные остатки HVR1 у одного из детей в течение 3 мес не изменились. У 6 женщин с неинфицированными детьми все плотные фракции сыворотки содержали значительное кол-во вирусной РНК, в то время как у 6 матерей инфицированных детей только 2 фракции сыворотки содержали вирусную РНК. Поскольку известно, что тяжелые фракции содержат вирусные частицы, можно предположить, что материнские анти-HCV могут ингибировать передачу вируса ребенку. Япония, Dep. of Pediatrics, Nagoya Univ. Sch. of Med., 65, Tsuruma-Cho, Showa-Ku, Nagoya 466
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.39.17
Рубрики: ВИРУС ГЕПАТИТА С
ВЕРТИКАЛЬНАЯ ПЕРЕДАЧА

КВАЗИВИДЫ


Доп.точки доступа:
Kudo, Toyoichiro; Yanase, Youichiro; Ohshiro, Makoto; Yamamoto, Mitsuaki; Morita, Makoto; Shibata, Motohiro; Morishima, Tsuneo

16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.02-04Б1.372

    Plikat, Uwe.

    Genetic drift can dominate short-term human immunodeficiency virus type 1 nef quasispecies evolution in vivo [Text] / Uwe Plikat, Kay Nieselt-Struwe, Andreas Meyerhnas // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 6. - P4233-4240 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Генетический дрейф может доминировать в краткосрочной эволюции квазивидов nef вируса иммунодефицита человека типа 1
Аннотация: Изучена эволюция квазивидов nef ВИЧ-1 у пациента, клонально инфицированного загрязненным препаратом фактора IX свертываемости крови. Через 11, 25 и 41 месяцев после заражения из моноцитов периферической крови клонировали провирусную ДНК, амплифицированную методом ПЦР, и секвенировали область nef. Изучены филогенетические взаимоотношения среди 41 информативной последовательности и использованы для расчета матрицы замен. Показано, что число стоп-кодонов в открытой рамке считывания nef и число синонимических и несинонимических замен достоверно не отличаются от ожидаемых в предположении случайных замен. Макс. дивергенция последовательности увеличивается линейно со скоростью 4,4 нуклеотидных и 3,2 аминокислотных замен в год. Эти данные показали, что стохастичные процессы сильно влияют на краткосрочную эволюцию квазивидов nef ВИЧ-1. Германия, Inst. fur Med. Mikrobiol. und Hygiene, Univ. Freiburg, 79104 Freiburg. Библ. 89
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
ГЕН NEF

КВАЗИВИДЫ

ЭВОЛЮЦИЯ

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ДРЕЙФ


Доп.точки доступа:
Nieselt-Struwe, Kay; Meyerhnas, Andreas

17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.04-04Б1.291

    Boerlijst, Maarten.

    Viral quasi-species and recombination [Text] / Maarten Boerlijst, Sebastian Bonhoeffer, Martin A. Nowak // Proc. Roy. Soc. London. B. - 1996. - Vol. 263, N 1376. - P1577-1584 . - ISSN 0962-8452
Перевод заглавия: Вирусные квазивиды и рекомбинация
Аннотация: Вирусные популяции представляют собой сложные объединения различных, но родственных геномов (так называемые квазивиды). Математические описания вирусных квазивидов сконцентрированы на точечных мутациях, как принципиальном источнике изменчивости. Однако, у ретровирусов (и у многих других вирусов) возможна рекомбинация их геномов. Изучена математическая модель динамики квазивидов, включающая и точечные мутации, и рекомбинацию. Показано, что при низкой частоте мутаций рекомбинация может снижать разнообразие квазивидов и повышать общую приспособленность. При высокой частоте мутаций рекомбинация может вызывать потерю всей генетической информации. Наконец, рекомбинация приводит к устойчивости квазивидов: если частота полезного мутанта ниже определенного порога, он не будет подвергаться действию отбора. Великобритания, Dep. of Zool., Univ. of Oxford, Oxford OX1 3PS. Библ. 53
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.02
Рубрики: ВИРУСЫ
КВАЗИВИДЫ

РЕКОМБИНАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Bonhoeffer, Sebastian; Nowak, Martin A.

18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.04-04Б1.367

    Leroux, Caroline.

    Novel and dynamic evolution of equine infectious anemia virus genomic quasispecies associated with sequential diseas cycle in an experimentally infected pony [Text] / Caroline Leroux, Charles J. Issel, Ronald C. Montelaro // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 12. - P9627-9639 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Новая и динамичная эволюция геномных квазивидов вируса инфекционной анемии лошадей, связанная с последовательными циклами болезни у экспериментально инфицированных пони
Аннотация: Изучена генетическая эволюция трех функционально различных областей генома вируса инфекционной анемии лошадей (env, rev и длинный терминальный повтор) во время периодических случаев лихорадки у пони, экспериментально инфицированного референс-вирусом. Все квазивиды референс-вируса присутствовали во время первого случая лихорадки, но были полностью заменены во время второго случая. С каждым последующим случаем болезни связаны новые преобладающие квазивиды. Во время третьего случая лихорадки произошла крупная делеция (до 45 аминокислот) в основном домене нейтрализации gp90. Эта делеция не влияет на репликацию вируса in vitro и его приспособленность in vivo. Аминокислотные мутации распределяются не случайно, но локализованы в 8 вариабельных областях. Т. обр., представлено первое подробное описание эволюции геномных квазивидов вируса инфекционной анемии лошадей при персистентной инфекции. США, Dep. of Mol. Gen. and Biochem., Univ. of Pittsburgh Sch. of Med., Pittsburgh, PA 15261. Библ. 51
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ЛЕНТИВИРУСЫ
ВИРУС ИНФЕКЦИОННОЙ АНЕМИИ ЛОШАДЕЙ

ГЕНОМНЫЕ КВАЗИВИДЫ

ЭВОЛЮЦИЯ


Доп.точки доступа:
Issel, Charles J.; Montelaro, Ronald C.

19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.04-04Б1.368

   

    Tracking members of the simian immunodeficiency virus deltaB670 quasispecies population in vivo at single-cell resolution [Text] / Todd A. Reinhart [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 1. - P113-120 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Слежение за членами квазивидовой популяции вируса иммунодефицита обезьян deltaB670 in vivo с разрешением на уровне отдельных клеток
Аннотация: Для изучения поведения индивидуальных членов квазивидовых популяций ретровирусов разработан метод гибридизации in situ с геномспецифическими зондами. Использованы зонды, позволяющие обнаружить варианты вируса иммунодефицита обезьян (ВИО) deltaB670 с различными последовательностями в области V1 гена env гликопротеина оболочки. Исследованы репликация и клеточный тропизм 4 вариантов ВИО в тканях зараженных макак-резусов. Найдено, что генотипич. варианты V1 реплицируются пространственно определенным образом и в разной степени в каждом из изученных анатомических участков. Два варианта ВИО, к-рые реплицируются наиболее экстенсивно у животных, больных СПИДом, обнаружены в тканях как в макрофагах, так и в Т-клетках. Этот подход м. б. применен для изучения роли отдельных вирусов квазивида в лентивирусном патогенезе. США, Dep. Microbiol., Univ. Minnesota Med. Sch., Minneapolis, MN 55455. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.29.17.23.17
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ОБЕЗЬЯН
КВАЗИВИДЫ

ПОПУЛЯЦИИ

РЕПЛИКАЦИЯ

ТРОПИЗМ


Доп.точки доступа:
Reinhart, Todd A.; Rogan, Michael J.; Amedee, Angela Martin; Murphey-Corb, Michael; Rausch, Dianne M.; Eiden, Lee E.; Haase, Ashley T.

20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 99.05-04К1.292

   

    Tracking members of the simian immunodeficiency virus deltaB670 quasispecies population in vivo at single-cell resolution [Text] / Todd A. Reinhart [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 1. - P113-120 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Слежение за членами квазивидовой популяции вируса иммунодефицита обезьян deltaB670 in vivo с разрешением на уровне отдельных клеток
Аннотация: Для изучения поведения индивидуальных членов квазивидовых популяций ретровирусов разработан метод гибридизации in situ с геномспецифическими зондами. Использованы зонды, позволяющие обнаружить варианты вируса иммунодефицита обезьян (ВИО) deltaB670 с различными последовательностями в области V1 гена env гликопротеина оболочки. Исследованы репликация и клеточный тропизм 4 вариантов ВИО в тканях зараженных макак-резусов. Найдено, что генотипич. варианты V1 реплицируются пространственно определенным образом и в разной степени в каждом из изученных анатомических участков. Два варианта ВИО, к-рые реплицируются наиболее экстенсивно у животных, больных СПИДом, обнаружены в тканях как в макрофагах, так и в Т-клетках. Этот подход м. б. применен для изучения роли отдельных вирусов квазивида в лентивирусном патогенезе. США, Dep. Microbiol., Univ. Minnesota Med. Sch., Minneapolis, MN 55455. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.43.41.13.05.09
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ОБЕЗЬЯН
КВАЗИВИДЫ

ПОПУЛЯЦИИ

РЕПЛИКАЦИЯ

ТРОПИЗМ


Доп.точки доступа:
Reinhart, Todd A.; Rogan, Michael J.; Amedee, Angela Martin; Murphey-Corb, Michael; Rausch, Dianne M.; Eiden, Lee E.; Haase, Ashley T.

 1-20    21-40   41-60   61-80   81-100   101-120      
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)