Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Sekiguchi, JoAnn$<.>)
Общее количество найденных документов : 12
Показаны документы с 1 по 12
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.103

    Sekiguchi, JoAnn.

    Requirements for noncovalent binding of vaccinia topoisomerase I to duplex DNA [Text] / JoAnn Sekiguchi, Stewart Shuman // Nucl. Acids Res. - 1994. - Vol. 22, N 24. - P5360-5365 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Требования для ковалентного связывания топоизомеразы I вируса осповакцины с двунитевой ДНК
Аннотация: ДНК-топоизомераза (I) вируса осповакцины связывается с дн/ДНК и образует ковалентный аддукт в сайтах, содержащих в разрезаемой нити консервативный мотив 5'-(C/T)CCTT'- ВНИЗ'. Анализ связывания мутантной I-Phe[274] (1A), связывающейся с ДНК нековалентно и неспособной расщеплять ДНК, позволил сопоставить ковалентное и нековалентное связывание I с ДНК. Расщепление ДНК под действием I дикого типа наиболее эффективно с "самоубийственными" субстратами, содержащими менее 10 п. н. дистальнее расщепляемой связи. В то же время для оптимального связывания IA необходимы по меньшей мере 10 п. н. с 3'-стороны от сайта расщепления. Т. обр. область ДНК, фланкирующая пентамерный мотив, служит для стабилизации нековалентного связывания I. IA связывается с ДНК, не имеющей консенсусного пентамера, со сродством, в 7-10 раз меньшим, чем с ДНК, содержащей сайт CCCTT. США, Molecular Biol., Sloan-Kettering Inst., New York, NY 10021. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ДНК
ДВУНИТЕВАЯ

ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА I

ВИРУС ОСНОВАКЦИНЫ

КОВАЛЕНТНОЕ СВЯЗЫВАНИЕ

УСЛОВИЯ


Доп.точки доступа:
Shuman, Stewart


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 97.08-04Т2.443

   

    Mechanism of inhibition of vaccinia DNA topoisomerase by novobiocin and coumermycin [Text] / JoAnn Sekiguchi [et al.] // J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 4. - P2313-2322 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Механизм подавления активности ДНК-топоизомеразы коровьей оспы новобиоцином и кумермицином
Аннотация: Кумермицин (I) и новобиоцин (II) связываются с ДНК-топоизомеразой (III) и препятствуют ее взаимодействию с ДНК. При этом K[i] составляют 10-25 мкМ и 350 мкМ для I и II соотв. I связывается с ДНК в одном участке молекулы (K[d]=27'+-'5 мкМ), тогда как II взаимодействует с III сильно и слабо в двух различных точках с K[1d]=20'+-'5 мкМ и K[2d]=513'+-'125 мкМ соотв. I конкурирует с ДНК за связь с III. I и II изменяют чувствительность нативной III или III в комплексе с двухспиральной ДНК к действию химотрипсина или трипсина. США, Molecular Biology Program, Sloan-Kettering Inst., New Jork, NJ 10021. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.45.21.95.47.99
Рубрики: НОВОБИОЦИН
КУМЕРМИЦИН

ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА

ВИРУС КОРОВЬЕЙ ОСПЫ

ИНГИБИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Sekiguchi, JoAnn; Stivers, James T.; Mildvan, Albert S.; Shuman, Stewart


3.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI28) 97.09-04Н3.93

   

    Mechanism of inhibition of vaccinia DNA topoisomerase by novobiocin and coumermycin [Text] / JoAnn Sekiguchi [et al.] // J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 4. - P2313-2322 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Механизм подавления активности ДНК-топоизомеразы коровьей оспы новобиоцином и кумермицином
Аннотация: Кумермицин (I) и новобиоцин (II) связываются с ДНК-топоизомеразой (III) и препятствуют ее взаимодействию с ДНК. При этом K[i] составляют 10-25 мкМ и 350 мкМ для I и II соотв. I связывается с ДНК в одном участке молекулы (K[d]=27'+-'5 мкМ), тогда как II взаимодействует с III сильно и слабо в двух различных точках с K[1d]=20'+-'5 мкМ и K[2d]=513'+-'125 мкМ соотв. I конкурирует с ДНК за связь с III. I и II изменяют чувствительность нативной III или III в комплексе с двухспиральной ДНК к действию химотрипсина или трипсина. США, Molecular Biology Program, Sloan-Kettering Inst., New Jork, NJ 10021. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.55.07.09.09
Рубрики: НОВОБИОЦИН
КУМЕРМИЦИН

ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА

ВИРУС КОРОВЬЕЙ ОСПЫ

ИНГИБИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Sekiguchi, JoAnn; Stivers, James T.; Mildvan, Albert S.; Shuman, Stewart


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.02-04Б1.106

    Sekiguchi, JoAnn.

    Domain structure of vaccinia DNA ligase [Text] / JoAnn Sekiguchi, Stewart Shuman // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 4. - P727-734 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Структура доменов ДНК-лигазы вируса осповакцины
Аннотация: ДНК-лигаза вируса осповакцины состоит из 552 аминокислотных остатков. Она содержит 3 структурных домена: 1) N-концевой фрагмент из 175 аминокислотных остатков, чувствительный к химотрипсину и трипсину; 2) устойчивый к протеазам центральный домен, включающий активный центр переноса нуклеотидов (Lys-231) и 3) устойчивый к протеазам C-концевой фрагмент. Два устойчивых к протеазам домена разделены расщепляемым протеазами мостиком (от 296 до 307 позиции). Аденилилтрансферазная и ДНК-лигазная активности сохраняются при удалении 200 N-концевых аминокислотных остатков. Однако, укороченная форма фермента характеризуется пониженной скоростью катализа при объединении цепей и сниженной аффинностью к ДНК. Каталитическое "ядро" лигазы вируса осповакцины из 350 остатков аналогично по размеру и по чувствительности к протеазам полноразмерной ДНК-лигазе фага Т7. США, Mol. Biol. Program, Sloan - Kettering Inst., New York, NY 10021. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
ДНК-ЛИГАЗА

СТРУКТУРА ДОМЕНОВ


Доп.точки доступа:
Shuman, Stewart


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.07-04Б1.128

    Sekiguchi, JoAnn.

    Novobiocin inhibits vaccinia virus replication by blocking virus assembly [Text] / JoAnn Sekiguchi, Stewart Shuman // Virology. - 1997. - Vol. 235, N 1. - P129-137 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Новобиоцин подавляет репликацию вируса вакцины блокированием сборки вируса
Аннотация: В присутствии новобиоцина (I) все классы вирусных белков синтезировались в культуре клеток BSC40. Вначале слегка уменьшалась репликация ДНК, но затем сравнивалась с контрольной инфекцией. Протеолитический процессинг главных структурных полипептидов подавлялся I, что предполагает задержку сборки вируса. Электронная микроскопия показала, что I блокировал вирусный морфогенез в ранней стадии. I добавляется к классу антипоксвирусных агентов, таких как рифампин, и N-1-изоникотиноил-N-2-3-метил-4-хлоробензоилгидразин, задерживающих морфогенез. США, Program in Molecular Biol., Sloan-Kettering Inst., New York, NY 10021. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.19.17
Рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
РЕПЛИКАЦИЯ

ПОДАВЛЕНИЕ

НОВОБИОЦИН


Доп.точки доступа:
Shuman, Stewart


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.08-04Б1.98

    Sekiguchi, JoAnn.

    Mutational analysis of vaccinia virus topoisomerase identifies residues involved in DNA binding [Text] / JoAnn Sekiguchi, Stewart Shuman // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 18. - P3649-3656 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Мутационный анализ топоизомеразы вируса осповакцины идентифицирует остатки, участвующие в связывании ДНК
Аннотация: Сконструированы замены на аланин в 14 положениях из 24 в сегменте ДНК-топоизомеразы (I) вируса осповакцины между положениями 63 и 86 (DSK G RR Q YFY GKMHV QNRN AKRDR). Измерение скоростей релаксации ДНК в оптимальных для I дикого типа условиях обнаружило значительный эффект мутаций в 6 положениях (R67, Y70, Y72, R80, R84 и R85). Мутантные I имеют нормальные скорости однооборотной трансэстерификации ДНК. Влияние замен на связывание с ДНК подтвердилось ингибированием образования ковалентного аддукта в присутствии соли и Mg{2+}. Мутантные I имеют пониженное сродство к части сайтов расщепления в ДНК плазмиды pUC19. Замены остатков Y70 и Y72 на фен, гис, глн или арг показали, что ароматическая группа важна для связывания I с ДНК. США, Mol. Biol. Progr., Sloan-Kettering Inst., New York, NY 10021. Библ. 30
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗЫ

МУТАЦИИ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

СВЯЗЫВАНИЕ ДНК


Доп.точки доступа:
Shuman, Stewart


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 99.07-04Б1.87

    Sekiguchi, JoAnn.

    Nick sensing by vaccinia virus DNA ligase requires a 5' phosphate at the nick and occupancy of the adenylate binding site on the enzyme [Text] / JoAnn Sekiguchi, Stewart Shuman // J. Virol. - 1997. - Vol. 71, N 12. - P9679-9684 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Узнавание однонитевого разрыва ДНК-лигазой вируса осповакцины требует 5'-фосфата в однонитевом разрыве и занятости сайта связывания аденилата на ферменте
Аннотация: При связывании с субстратом ДНК-лигаза (I) вируса осповакцины различает ДНК, содержащую в однонитевом разрыве (ОР) 5'-фосфат, от ДНК, содержащей в ОР 5'-гидроксил. Мутант I с заменой К231 в активном центре (IA), неспособен образовывать ковалентный интермедиат I - аденилат (II) и активировать ДНК с ОР через образование интермедиата ДНК-II. Тем не менее IA катализирует образование фосфодиэфирной связи на преаденилированном ОР. Т. обр., остаток лиз активного центра I не требуется для стадии замыкания в реакции лигирования. IA прочно связывается с ДНК-II в ОР, но имеет низкое сродство к стандартному ОР. I дикого типа, находящаяся преимущественно в форме I-II, прочно связывается с ОР в ДНК. Это позволяет предположить, что занятость кармана связывания АМФ в I существенна для стабильного связывания с ДНК. Секвестрирование внеспирального нуклеотида связанной с ДНК I напоминает механизм "выскакивания" основания, используемый в узнавании мишенных сайтов др. ферментами модификации и репарации ДНК. США, Mol. Biol. Program, Sloan-Kettering Inst., New York, NY 10021. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
ДНК-ЛИГАЗА

ОДНОНИТЕВЫЕ РАЗРЫВЫ

УЗНАВАНИЕ

МИШЕННЫЕ САЙТЫ

ЛИГИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Shuman, Stewart


8.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 01.01-04Н1.14

   

    Interplay of p53 and DNA-repair protein XRCC4 in tumorigenesis, genomic stability and development [Text] / Yijie Gao [et al.] // Nature. - 2000. - Vol. 404, N 6780. - P897-900 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Взаимодействие р53 и белка ДНК-репарации XRCC4 в онкогенезе, геномной стабильности и развитии
Аннотация: Белок XRCC4 участвует в репарации двунитевых разрывов ДНК (воссоединении негомологичных концов) и V(D)J-рекомбинации. Мыши, дефектные по XRCC4, погибали в позднем эмбриональном периоде из-за интенсивного апоптоза постмитотических нейронов. Напротив, р53-дефектность в гомо- или гетерозиготном варианте не влияла на выживаемость, но р53{-/-}-мутанты в 5-месячном возрасте имели повышенную восприимчивость к раку. Двойные мутанты XRCC4{-/-} p53{-/-} оказались полностью жизнеспособными, в отличие от пониженной выживаемости у мутантов XRCC4{-/-} p53{+/-}, но дефектность рекомбинации и развития лимфоцитов у них не восстанавливалась. Взрослые двойные мутанты имели пониженный вес и существенно меньшую, чем дикий тип или р53{-/-}-контроль, продолжительность жизни. После 6-недельного возраста у них, как правило, развивалась пре-В-клеточная лимфома из-за повышенной частоты нереципрокной транслокации между хромосомами 12 и 15 и сцепления амплифицированного онкогена c-myc с IgH-локусом. Обсуждают роль XRCC4 в поддержании стабильности генома и возможность сохранения функциональных нейронов у двойных мутантов. США, H. Hughes Med. Inst., Children's Hosp., Harvard Med. Sch., Boston, MA 02115. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.29.49.03.11.02
Рубрики: ДНК
ДВУНИТЕВЫЕ РАЗРЫВЫ

РЕПАРАЦИЯ

ОНКОГЕНЕЗ

И РАЗВИТИЕ

ГЕНОМ ЭУКАРИОТИЧЕСКИЙ

СТАБИЛЬНОСТЬ

ГЕНЫ-СУПРЕССОРЫ

БЕЛОК Р53

БЕЛОК

XRCC4

ВЛИЯНИЕ

МЫШИ


Доп.точки доступа:
Gao, Yijie; Ferguson, David O.; Xie, Wei; Manis, John P.; Sekiguchi, JoAnn; Frank, Karen M.; Chaudhuri, Jayanata; Horner, James; DePinho, Ronald A.; Alt, Frederick W.


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 02.01-04М1.65

   

    Defective embryonic neurogenesis in Ku-deficient but not DNA-dependent protein kinase catalytic subunit-deficient mice [Text] / Yansong Gu [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2000. - Vol. 97, N 6. - P2668-2673 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Нарушение эмбрионального нейрогенеза у мышей, дефектных по Ku, но не у мышей, дефектных по каталитической субъединице ДНК-зависимой протеинкиназы
Аннотация: В негомологичном соединении концов ДНК млекопитающих принимают участие белки Ku70, Ku80, каталитическая субъединица ДНК-зависимой протеинкиназы (PK), XRCC4 и ДНК-лигазы IV (Lig4). Показано, что инактивация Ku70 и Ku80, но не PK, приводит к резкому увеличению гибели развивающихся эмбриональных нейронов у мышей. Ku-дефектный фенотип сам по себе является менее тяжелым, чем в ассоциации с XRCC4 и Lig4. Отсутствие гибели нейронов в эмбрионах мышей, дефектных по PK, и умеренный тип повреждений в Ku-дефектных эмбрионах по сравнению с XRCC4- или Lig4-дефектными эмбрионами указывает на важную роль этих факторов негомологичного соединения концов ДНК в развитии нервной системы млекопитающих. США, Howard Hughes Medical Inst., The Children's Hosp. and Center for Blood Res., and Dep. of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.21.17.09.07.17
Рубрики: РАЗВИТИЕ
ЭМБРИОГЕНЕЗ

НЕРВНАЯ СИСТЕМА

ГЕНЫ

KU70

KU80

XRCC4

РK

УЧАСТИЕ

МЫШИ


Доп.точки доступа:
Gu, Yansong; Sekiguchi, JoAnn; Gao, Yijie; Dikkes, Pieter; Frank, Karen; Ferguson, David; Hasty, Paul; Chun, Jerold; Alt, Frederick W.


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.08-04Б1.84

    Sekiguchi, JoAnn.

    Resolution of a Holliday junction by vaccinia topoisomerase requires a spacer DNA seqment 3' of the CCCTT'- ВНИЗ' cleavage sites [Text] / JoAnn Sekiguchi, Chonghui Cheng, Stewart Shuman // Nucl. Acids Res. - 2000. - Vol. 28, N 14. - P2658-2663 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Разрешение холидеевского стыка [ДНК]-топоизомеразой вируса осповакцины требует спейсерного сегмента ДНК с 3'-стороны от сайтов расщепления ЦЦЦТТ'- ВНИЗ'
Аннотация: ДНК-топоизомераза (I) вируса осповакцины (ВОВ) катализирует разрешение холидеевских стыков (ХС) in vitro по механизму согласованной трансэтерификации двух сайтов расщепления (СР) ЦЦЦТТ'- ВНИЗ', расположенных на противоположных нитях в частично лабильном четырехстороннем стыке. Эффективное расщепление происходит в ХС, имеющем сегмент подвижности ветви (5'-ГЦЦЦТТАТЦГ), который распространяется на 4 п. н. в 3'-сторону от СР. Разрешение уменьшается, если подвижность ветви ограничена сегментом длиной 8 п. н., распространяющемся на 2 п. н. в 3'-сторону от СР, и устраняется, если подвижность ветви ограничена последовательностью ГЦЦЦТТ длиной 6 п. н. с 5'-стороны от СР. Это позволило предположить, что спейсерная область с 3'-стороны от ЦЦЦТТ нужна для одновременного расщепления в 2 противолежащих сайтах ХС. Миграция ветви не требуется для реакции в ХС, т. к. I расщепляет один сайт ЦЦЦТТ в неподвижном четырехстороннем стыке, в котором СР расположен в точке перекреста. Способность I разрешать ХС может использоваться в образовании шпилечных теломер ВОВ. США, Mol. Biol. Program, Sloan-Kettering Inst. New York, NY 10021. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.17.09.17
Рубрики: ВИРУС ОСПОВАКЦИНЫ
ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА

РЕКОМБИНАЦИЯ

ХОЛИДЕЕВСКИЕ СТЫКИ

РАЗРЕШЕНИЕ

СПЕЙСЕРНЫЙ СЕГМЕНТ

НЕОБХОДИМОСТЬ


Доп.точки доступа:
Cheng, Chonghui; Shuman, Stewart


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 04.11-04Я6.208

   

    Increased ionizing radiation sensiivity and genomic instability in the absence of histone H2AX [Text] / Craig H. Bassing [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2002. - Vol. 99, N 12. - P8173-8178 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Повышенная чувствительность к ионизирующему облучению и геномная нестабильность в отсутствии гистона H2AX
Аннотация: Гомологичной рекомбинацией в эмбриональных стволовых (ES) клетках мыши получили H2AX-недостаточный (H2AX{'ДЕЛЬТА'/'ДЕЛЬТА'}) клон. Нуль-аллельные мутанты были жизнеспособны, но проявляли повышенную чувствительность к 'гамма'-облучению во всем интервале доз 50-400 рад, к-рая, однако, была меньше, чем у мутанта XRCC4{-/-}. У мутантов H2AX{'ДЕЛЬТА'/'ДЕЛЬТА'} уровень хромосомных аномалий (слияние, транслокации, разорванные центромеры) составил 17-29% по сравнению с 3-8% в контроле, а в 'гамма'-облученных H2AX-недостаточных ES-клетках превышение над контролем составило 'ЭКВИВ'8-кратную величину. Кроме того, у мутантов выявили измененный характер 'гамма'-индуцированного образования BRCA1 и RAD51 фокусов. В то же время утрата H2AX не изменила нормальный уровень и точность воссоединения концов в V(D)J внехромосомной рекомбинации плазмидного субстрата и не повлияла на созревание периферических T- и B-лимфоцитов. Обсуждают возможные функции H2AX в репарации ДНК. США, H. Hughes Med. Inst., Harvard Med. Sch., Boston, MA 02115. Библ. 41
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.23.07.11
Рубрики: ГИСТОНЫ
H2AX

ГЕНЫ

ИНАКТИВАЦИЯ

ПОСЛЕДСТВИЯ

МЫШИ

ЭМБРИОНАЛЬНЫЕ СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ


Доп.точки доступа:
Bassing, Craig H.; Chua, Katrin F.; Sekiguchi, JoAnn; Suh, Heikyung; Whitlow, Scott R.; Fleming, James C.; Monroe, Brianna C.; Ciccone, David N.; Yan, Catherine; Vlasakova, Katerina; Livingston, David M.; Ferguson, David O.; Scully, Ralph; Aly, Frederick W.


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 90.08-04М1.248

    Kmiec, Eric B.

    Studies on the ATP requirements of in vitro chromatin assembly [Text] / Eric B. Kmiec, JoAnn M. Sekiguchi, Allyson D. Cole // Biochem. and Cell Biol. - 1989. - Vol. 67, N 8. - P443-454 . - ISSN 0829-8211
Перевод заглавия: Исследования потребностей в АТФ [для процесса] сборки хроматина in vitro
Аннотация: Исследовали зависимость процесса сборки структур хроматина на кольцевой ДНК в экстракте S-150 из ооцитов Xenopus от АТФ. Авт. различают 2 стадии сборки, отличающиеся по величине нужной конц-ии АТФ. Первая - сборка нуклеосом, для к-рой необходима и достаточна конц-ия АТФ, имеющаяся в экстракте. Вторая - установление регулярного межнуклеосомного расстояния, нуждается в добавлении АТФ до 1 мМ. Плотность сверхспирализации ДНК на обеих стадиях одинакова. США, Dep. of Biochem. and Biophysics, Univ. of California, Davis, Davis, CA 95616. Библ. 31.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.19.09.13 + 341.19.19.09.07
Рубрики: ХРОМАТИН
НУКЛЕОСОМЫ

СБОРКА

ЭНЕРГИЯ

АТФ

ООЦИТЫ

XENOPUS

ДНК ТОПОИЗОМЕРАЗА


Доп.точки доступа:
Sekiguchi, JoAnn M.; Cole, Allyson D.


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)