СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=PPGPP<.>)

Общее количество найденных документов : 40
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 96.11-04Б2.83

Scoarughi, Gian Luca.
Lack of production of (p)ppGpp in Halobacterium volcanii under conditions that are effective in the eubacteria [Text] / Gian Luca Scoarughi, Carmen Cimmino, Pierluigi Donini // J. Bacteriol. - 1995. - Vol. 177, N 1. - P82-85 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: У Halobacterium volcanii не образуется (p)ppGpp в условиях, которые стимулируют его образование у эубактерий
Аннотация: В условиях температурного сдвига (при оптимальной температуре роста штамма 45'ГРАДУС'C использовали сдвиг к 31'ГРАДУС'C и 48'ГРАДУС'C), обработки цианидом, общего голодания и (как показано авт. ранее) при голодании по аминокислотам у Halobacterium volcanii DSM 3757 не образуется (p)ppGpp. В ходе экспоненциального роста в клетках обнаруживаются фосфорилированные соединения, похожие, но не идентичные по электрофоретической подвижности, на (p)ppGpp, в ходе стационарной фазы роста и при вышеуказанных воздействиях концентрация этих соединений значительно возрастает. Соединения идентифицированы как короткоцепочечные полифосфаты, идентичные таковым, найденным у Saccharomyces cerevisiae в сходных условиях. Италия, Dip. di Biol. Cellulare e dello Sviluppo, Univ. "La Sapienza", Rome

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.09.07 + 341.27.19.09
Рубрики: HALOBACTERIUM VOLCANII (BACT.)
ШТАММ DSM 3757
ТЕМПЕРАТУРНЫЙ СДВИГ
ОБРАБОТКА ЦИАНИДОМ
ОБЩЕЕ ГОЛОДАНИЕ
ГУАНОЗИНТЕТРАФОСФАТ
(P)PPGPP
ОТСУТСТВИЕ
ПОЛИФОСФАТЫ

Доп.точки доступа:
Cimmino, Carmen; Donini, Pierluigi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.202

Da, Costa Xavier J.
Mutations that render the promoter of the histidine operon of Salmonella typhimurium insensitive to nutrient-rich medium repression and amino acid downshift [Text] / Costa Xavier J. Da, Stanley W. Artz // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 16. - P5211-5217 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Мутации, делающие промотор гистидинового оперона Salmonella typhimurium нечувствительным к репрессии богатой питательной средой и аминокислотному сдвигу вниз
Аннотация: Сконструированы мутации в блоке -10 и в дискриминаторной последовательности (ДП) между блоком -10 и стартовой точкой транскрипции оперона his S. typhimurium и введены в транскрипционные слияния his-lacz. Изучено влияние этих мутаций на экспрессию 'бета'-галактозидазы в богатой питательной среде и в минимальных средах в условиях, вызывающих предсказуемые изменения внутриклеточного уровня ppGpp (I), а также в условиях аминокислотного сдвига вниз, вызванного добавлением серингидроксамата, когда уровень I повышается. Полученные данные подтвердили in vivo рез-ты опытов в сопряженной системе транскрипции-трансляции in vitro, и показали, что: 1) I регулирует взаимодействие РНК-полимеразы с промотором his; 2) для стимуляции I транскрипции нужны белок -10 и ДП промотора his. США, Sec. Microbiol., Univ. California, Davis, CA 95616. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН HIS
ТРАНСКРИПЦИЯ
ПРОМОТОРЫ
МУТАЦИИ
PPGPP
ИЗМЕНЕНИЯ ВНУТРИКЛЕТОЧНОГО УРОВНЯ
ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ
БОГАТЫЕ
МИНИМАЛЬНЫЕ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Artz, Stanley W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.04-04Б2.210

The role of the Corynebacterium glutamicum rel gene in (p)ppGpp metabolism [Text] / Lutz Wehmeier [et al.] // Microbiology. - 1998. - Vol. 144, N 7. - P1853-1862 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Роль гена rel Corynebacterium glutamicum в метаболизме (p)ppGpp
Аннотация: Методом ПЦР с вырожденными консенсусными праймерами выделен ген rel Corynebacterium glutamicum АТСС 13032. Ген имеет длину 2283 п. н. и кодирует белок длиной 760 остатков (м. м. 84400), высокогомологичный родственным белкам RelA и SpoT Escherichia coli, участвующим в биосинтезе и деградации (p)ppGpp. Ген rel C. glutamicum расположен с 3'-стороны от гена apt аденинфосфорибозилтрансферазы и открытой рами считывания, похожей на гены dciAE, кодирующие часть системы транспорта дипептидов у E. coli. Сконструирован мутант C. glutamicum с делецией в гене rel. Он не накапливает (p)ppGpp в ответ на аминокислотное голодание. При гиперэкспрессии в E. coli ген rel C. glutamicum устраняет ростовые дефекты, вызванные гиперэкспрессией гена relA. Высказано предположение, что ген rel кодирует бифункциональный фермент с активностями (p)ppGpp-синтетазы и деградации (p)ppGpp. Германия, Lehrstuhl Genet., Fak. Biol., Univ. Biclefeld, D-33501 Bielefeld. Библ. 52

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН REL
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ В ГЕНОМЕ
ФУНКЦИИ
(P)PPGPP
МЕТАБОЛИЗМ
РЕГУЛЯЦИЯ
CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wehmeier, Lutz; Schafer, Andreas; Burkovski, Andreas; Kramer, Reinhard; Mechold, Undine; Malke, Horst; Puhler, Alfred; Kalinowski, Jorn

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.342

Acid- and multistress-resistant mutants of Lactococcus lactis: Identification of intracellular stress signals [Text] / Fabien Rallu [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 3. - P517-528 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Кислото- и мультистресс-устойчивые мутанты Lactococcus lactis: идентификация внутриклеточных стрессовых сигналов
Аннотация: Для изучения механизмов адаптации к кислым средам у лактококков в Lactococcus lactis MG1363 получен ряд инсерционных мутаций, приводящих к кислотоустойчивости. 21 независимая мутация локализована в 18 локусах. Часть этих локусов детерминирует транспортные системы или основной метаболизм. Получ. мутации разделены на 4 фенотипич. класса, 2 из к-рых проявляли резистентность ко многим стрессам. Показано, что у L. lactis сигналом, определяющим уровень индукции ответа на стресс, является внутриклеточ. кол-во фосфатов и (p)ppGpp. Получ. рез-ты указывают на связь между физиологич. состоянием клетки и степенью ее устойчивости к стрессам, а также на роль строгого контроля в регуляции ответа на кислотный стресс. Франция [Maguin E.], Genet. Microb., URLGA, INRA, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex. Библ. 82

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: LACTOCOCCUS LACTIS (BACT.)
ШТАММ MG1363
ГЕНЫ
ИНСЕРЦИОННЫЕ МУТАЦИИ
КИСЛОТОУСТОЙЧИВЫЕ МУТАЦИИ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
КИСЛОТНЫЙ СТРЕСС
ВНУТРИКЛЕТОЧНЫЙ СИГНАЛ
СТРОГИЙ КОНТРОЛЬ
(P)PPGPP

Доп.точки доступа:
Rallu, Fabien; Gruss, Alexandra; Ehrlich, S.Dusko; Maguin, Emmanuelle

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.266

Activities of constitutive promoters in Escherichia coli [Text] / S. -T. Liang [et al.] // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 292, N 1. - P19-37 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Активности конститутивных промоторов в Escherichia coli
Аннотация: Сконструировали коллекцию изогенных штаммов Escherichia coli. Каждый штамм содержал нуклеотидную последовательность (НП), представляющую смесь промотора и гена lacZ. Исследовали следующие промоторы: P[spc] spc рибосомного оперона, P[L] фага 'лямбда', P[bla] 'бета'-лактамазного гена, P[РНКI] и P[РНКII] из РНКI репликационного контрольного гена и РНК II праймера из плазмиды pBR 322, P1 и P2 из рРНК оперона rrn. Указанные промоторы являются конститутивными. Для исследования промоторов применили метод определения дозы гена, гибридизацию мРНК и подсчет 'бета'-галактозидазной активности. Значения активностей промоторов для различных мРНК(т) имели тенденцию к снижению в процессе роста бактериальных клеток в LB среде, по сравнению с результатами, полученными в среде с глюкозой и аминокислотами. Предполагают, что нек-рые изученные промоторы имеют низкие значения K[m], к-рые показывают, что они насыщаются РНК-полимеразой при высоких скоростях роста бактериальных клеток и их активности становятся независимыми от концентрации свободной РНК-полимеразы. Предполагают, что активности промотора rrn зависят как от изменения концентрации РНК-полимеразы, так и от концентрации ppGpp. Вероятно, мРНК промоторы P[spc], P[L], P[bla] и P[РНКI], также как рРНК промотор P2rrnB не находится под сильным влиянием концентрации ppGpp во время экспоненциальной фазы роста. США, Program in Molecular and Cell Biology, Univ. of Texas at Dallas, Richardson TX, 75083-0688. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
P[SPC]
P[L]
P[BLA]
P[РНКI]
КОНСТИТУТИВНЫЕ
АКТИВНОСТЬ
ЗАВИСИМОСТЬ
КОНЦЕНТРАЦИЯ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Liang, S.-T.; Bipathnath, M.; Xu, Y.-C.; Chen, S.-L.; Dennis, P.; Ehrenberg, M.; Bremer, H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.146

Fusidic acid-resistant EF-G perturbs the accumulation of ppGpp [Text] / Mirjana Macvanin [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 37, N 1. - P98-107 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: У мутантов EF-G, устойчивых к фузидиевой кислоте, нарушена аккумуляция ppGpp
Аннотация: В норме наблюдается позитивная корреляция между скоростью роста клеток и их размножением. Роль координатора в этом процессе выполняет глобальный транскрипционный регулятор - молекула ppGpp, и ее базальный уровень обычно находится в обратном соотношении с размером клетки при делении. Обнаружен мутант Salmonella typhimurium, устойчивый к фузидиевой кислоте (ФК), в к-ром снижение скорости роста коррелирует с увеличением среднего размера клетки. Этот феномен вызван изменением уровня ppGpp в клетках EF-G, к-рые приобрели устойчивость к ФК, нарушив, таким образом, нормальное соотношение между скоростью роста клеток и их размером. Швеция, Dep. of Cell and Molecular Biol., Box 596, The Biomed. Center, Uppsala Univ., S-751 24 Uppsala. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: МУТАНТЫ
EF-G
УСТОЙЧИВОСТЬ К ФУЗИДИЕВОЙ КИСЛОТЕ
СКОРОСТЬ РОСТА
СНИЖЕНИЕ
КОРРЕЛЯЦИЯ
СРЕДНИЙ РАЗМЕР КЛЕТОК
УВЕЛИЧЕНИЕ
УРОВЕНЬ PPGPP
ИЗМЕНЕНИЕ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Macvanin, Mirjana; Johanson, Urban; Ehrenberg, Mans; Hughes, Diarmaid

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.223

In vivo and in vitro effects of (p)ppGpp on the 'сигма'{54} promoter Pu of the TOL plasmid of Pseudomonas putida [Text] / Manuel Carmona [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 17. - P4711-4718 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: In vivo и in vitro влияние (p)ppGpp на 'сигма'{54}-[зависимый] промотор Pu плазмиды TOL Pseudomonas putida
Аннотация: Анализировали связь in vivo и in vitro между физиологическим контролем 'сигма'{54}-зависимого промотора Pu плазмиды TOL pWW0 Pseudomonas putida и жестким ответом, опосредованным (p)ppGpp. Ключевые регуляторные элементы этой системы были получены в клетках Escherichia coli, а их активность проверена в слияниях c lacZ в отсутствие (p)ppGpp или при сверхэкспрессии relA. В штаммах relA/spoT не обнаружено реакции Pu на 3-метилбензиловый спирт, опосредованной соотв. активатором XylR, или негативной регуляции промотора быстрым ростом, уровень которой можно рассматривать как физиологический контроль промотора. Сверхэкспрессия гена relA (предположительно повышает внутриклеточный уровень (p)ppGpp) не приводит к заметному повышению активности Pu. Такая активация может быть результатом непрямых эффектов, поэтому авт. анализировали влияние (p)ppGpp в системе транскрипции in vitro. Обнаружили, что активность Pu возрастает в определенном диапазоне концентраций 'сигма'{54}, но не более, чем в 2 раза. Испания, Ctr Nacional Biotecnol. CSIC, 28049 Madrid. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА TOL
'СИГМА'{54}-ЗАВИСИМЫЙ ПРОМОТОР PU
РЕГУЛЯЦИЯ
(P)PPGPP
ВЛИЯНИЕ
PSEUDOMONAS PUTIDA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Carmona, Manuel; Rodriguez, Maria J.; Martinez-Costa, Oscar; De, Lorenzo Victor

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.159

Choy, Hyon E.
The study of guanosine 5'-diphosphate 3'-diphosphate-mediated transcription regulation in vitro using a coupled transcription-translation system [Text] / Hyon E. Choy // J. Biol. Chem. - 2000. - Vol. 275, N 10. - P6783-6789 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Изучение опосредованной гуанозин-5'-дифосфат-3'-дифосфатом регуляции транскрипции in vitro с использованием системы сопряженной транскрипции-трансляции
Аннотация: С использованием ДНК-зависимой системы транскрипции (Тр)-трансляции S-30 анализировали влияние "алармона" гуанозин-5'-дифосфат-3'-дифосфата (ppGpp) на регуляцию in vitro гистидинового оперона Salmonella typhimurium и оперона тРНК{Leu} Escherichia coli. Тр промотора hisG позитивно регулируется ppGpp, тогда как промотор leuV регулируется негативно. Для понимания глобальных регуляторных механизмов контроля Тр ppGpp на этих промоторах, как на моделях, изучали взаимосвязи между ppGpp-зависимой активацией и репрессией. Предположили, что ppGpp-зависимая активация является следствием репрессии стабильной Тр генов в условиях недостатка РНК-полимеразы. Чтобы проверить эту модель одновременно определяли ppGpp-зависимую регуляцию активируемого промотора hisGp и репрессируемого промотора leuVp на смешанных матрицах in vitro. Не обнаружили корреляции между активацией и репрессией транскрипции и лимитированным содержанием РНК-полимеразы в условиях in vitro. Сделан вывод, что ppGpp-зависимая активация не зависит от репрессии. Кроме того, ppGpp-зависимая активация и репрессия зависят от титруемых факторов, каждый из которых действует независимо. Ю. Корея, Dep. Biochem., Dankook Univ. Med. Coll., Chungnam, Chonan, Anseo, San 29. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ОПЕРОН HIS
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)
ОПЕРОН ТРНК{LEU}
ESCHERICHIA COLI
PPGPP
СИСТЕМА СОПРЯЖЕННОЙ ТРАНСКРИПЦИИ-ТРАНСЛЯЦИИ IN VITRO S-30

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.11-04Б2.205

Mechanism of regulation of transcription initiation by ppGpp [Text]. I. Effects of ppGpp on transcription initiation in vivo and in vitro / Melanie M. Barker [et al.] // J. Mol. Biol. - 2001. - Vol. 305, N 4. - P673-688 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Механизм регуляции инициации транскрипции ppGpp. I. Влияние ppGpp на инициацию транскрипции in vivo и in vitro
Аннотация: Изучали роль ppGpp в позитивной и негативной регуляции инициации транскрипции на экспоненциальной фазе роста Escherichia coli. С этой целью анализировали транскрипцию in vivo и in vitro с зависящего от скорости роста промотора (ПР) генов рРНК, rrnB P1 и с обратно пропорционально зависящих от скорости роста ПР генов биосинтеза аминокислот (ГБА)/транспортных белков PargI, PhisG, PlysC, PpheA, PthrABC и PlivJ. В штаммах 'ДЕЛЬТА'relA'ДЕЛЬТА'spoT, не способных синтезировать ppGpp, активность ПР rrnB P1 была выше, чем в штаммах дикого типа. ppGpp подавляет транскрипцию с ПР rrnB P1 in vitro. Активность ПР ГБА в штаммах 'ДЕЛЬТА'relA'ДЕЛЬТА'spoT была значительно ниже, чем в штаммах дикого типа, но ppGpp не влиял на эти ПР in vitro. Кинетический анализ in vitro показал, что на ПР ГБА открытые комплексы (ОК) формируются намного медленнее, и они "живут" дольше, чем ОК rrnB P1. ppGpp снижает время полужизни ОК на всех ПР. Т. обр., показано, что ppGpp прямо ингибирует транскрипцию, но только на ПР типа rrnB P1, которые формируют короткоживущие ОК. Стимуляция ПР ГБА происходит не прямо. Предложены модели позитивного контроля ПР ГБА ppGpp, которые могут объяснить необходимость ppGPP для прототрофности штаммов по аминокислотам. США, Dep. Bacteriol., Univ. Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706. Библ. 27

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP
УЧАСТИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Barker, Melanie M.; Gaal, Tamas; Josaitis, Cathleen A.; Gourse, Richard L.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.83

Wendrich, Thomas M.
Characterization of the relAlspoT gene from Bacillus stearothermophilus [Text] / Thomas M. Wendrich, Carsten L. Beckering, Mohamed A. Marahiel // FEMS Microbiol. Lett. - 2000. - Vol. 190, N 2. - P195-201 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Характеристика гена relA/spoT из Bacillus stearothermophilus
Аннотация: С помощью вырожденных праймеров амплифицирован фрагмент ДНК Bacillus stearothermophilus, гомологичный генам relA/spoT. "Прогулка по хромосоме" позволила секвенировать полноразмерный ген и его фланкирующие области. Предсказанная аминокислотная последовательность продукта гена relA/spoT B. stearothermophilus на 78% идентична таковой для одноименного пептида Bacillus subtilis и локусы обоих генов имеют одинаковую организацию. Ген rel B. stearothermophilus восстанавливает нормальный рост мутанта B. subtilis с делецией в relA. С помощью иммунохимического анализа был обнаружен рекомбинантный белок Rel[Bst] и продукт катализируемой им реакции - гуанозин-3-дифосфат-5-(три)дифосфат ((p)ppGpp) в условиях аминокислотного стресса и недостатка источников углерода. Полученные in vivo данные, генетическая организация и первичная структура других гомологов RelA/SpoT свидетельствуют о том, что идентифицированный ген кодирует (p)ppGpp-синтазу у B. stearothermophilus, кроме того полагают, что этот фермент выполняет функции (p)ppGpp-гидролазы. Германия, Dep. Chem., PhilippsUniv., D-35032 Marburg

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН RELA/SPOT
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
(P)PPGPP - СИНТАЗА
БИФУНКЦИОНАЛЬНОСТЬ
BACILLUS SPEAROTHERMOPHILUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Beckering, Carsten L.; Marahiel, Mohamed A.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.251

Hirsch, Matthew.
Role of ppGpp in rpoS stationary-phase regulation in Escherichia coli [Text] / Matthew Hirsch, Thomas Elliott // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 18. - P5077-5087 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Роль ppGpp в регуляции у Escherichia coli в стационарной фазе rpoS [фактора]
Аннотация: Бактериальный сигма фактор RpoS строго индуцируется при ряде стрессовых условий и в течение стационарной фазы роста. В данной работе использовали rpoS-lac гибриды в Escherichia coli, чтобы исследовать контроль действующий на уровне синтеза RpoS, который особенно хорошо доказывается, когда клетки достигают стационарной фазы в богатой среде. Ранее было показано, что маленькая молекула ppGpp необходима для нормальных уровней RpoS в стационарной фазе. Несмотря на привлекательность модели, в которой уровень ppGpp контролирует индукцию RpoS в стационарной фазе роста, тщательное измерение экспрессии rpoS-lac в мутанте, не имеющем ppGpp, показало наличие сходных эффектов как в экспоненциальной, так и в стационарной фазе роста. Главный эффект ppGpp был направлен на базальную экспрессию. Кроме того умеренный регуляторный дефект был связан с мутантом, не имеющим ppGpp и характеризующимся задержкой времени, при котором полная экспрессия осуществляется в течение 2-3 ч. Делеционный анализ показал, что дефект в базальной экспрессии был распределен по нескольким элементам последовательности, тогда как регуляторный дефект был картирован в области, расположенной выше rpoS рибосомсвязывающего сайта (RBS), который содержит активирующий антисенсорный элемент. Протестировали ряд других генов, которые считали регуляторами rpoS, включая dksA, dsrA, barA, ppkx и hfg. За исключением мутанта dksA, который имел умеренный дефект в среде Luria-Bertani, ни один из этих мутантов не был дефектным в отношении индукции rpoS в стационарной фазе. Даже короткий сегмент rpoS, начинающийся на 24 нуклеотида выше AUG инициирующего кодона был достаточен, чтобы поддержать существенную регуляцию в стационарной фазе, которая была главным образом посттранскрипционная. Эффект RBS проксимальной последовательности был независим для всех известных трансактивирующих факторов, включая ppGpp. США, Dep. of Microbiology, Immunology and Cell Biology, West Virginia Univ. Health Sciences Center, Morgantown, West Virginia 26506. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: РОСТ
СТАЦИОНАРНАЯ ФАЗА
ГЕНЫ
ГЕН ФАКТОРА RPOS
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Elliott, Thomas

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.07-04Б2.202

Potrykus, Katarzyna.
Multiple mechanisms of transcription inhibition by ppGpp at the 'лямбда'p[R] promoter [Text] / Katarzyna Potrykus, Grzegorz Wegrzyn, V.James Hernandez // J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277, N 46. - P43785-43794 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Механизмы транскрипционного ингибирования ppGpp промотора 'лямбда'p[R]
Аннотация: Условия стресса в бактериальной клетке вызывают клеточный ответ, названный строгим ответом. Первым этапом этого контроля является продукция больших количеств регуляторного нуклеотида - гуанозин-3',5'-(бис) пирофосфата (ppGpp). Недавно выдвинули гипотезу, что ppGpp действует через уменьшение стабильности открытых комплексов промоторов, производящих короткоживущие открытые комплексы, в том числе и pРНК-промоторы. В данной работе, однако, установили, что промотор бактериофага 'лямбда'p[R], который образует короткоживущие открытые комплексы, ингибируется ppGpp in vitro и in vivo. Провели систематическое исследование ингибирования инициации транскрипции 'лямбда'p[R] и обнаружили, что ppGpp не уменьшает стабильность открытых комплексов 'лямбда'p[R], оказывает только незначительное воздействие. Основной эффект ppGpp-опосредованного ингибирования заключается в уменьшении скорости выхода промотора. Результаты привели к заключению, что ингибирование инициации транскрипции не ограничено промоторами, производящими короткоживущие открытые комплексы. Начальным каталитическим шагом, ингибируемым ppGpp в 'лямбда'p[R], является образование первой фосфодиэфирной связи. Польша, Dep. of Molecular Biology, Univ. of Gdansk, Kladki 24, 80-822 Gdansk. Библ. 26Ы

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
СТРЕСС
СТРОГИЙ ОТВЕТ
МЕХАНИЗМ
БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛАМБДА
СИНТЕЗ
ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР ЛАМБДА P[R]
ИНГИБИРОВАНИЕ
PPGPP
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wegrzyn, Grzegorz; Hernandez, V.James

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.52

Korch, Shaleen B.
Characterization of the hipA7 allele of Escherichia coli and evidence that high persistence is governed by (p)ppGpp synthesis [Text] / Shaleen B. Korch, Thomas A. Henderson, Thomas M. Hill // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 50, N 4. - P1199-1213 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Характеристика аллели hipA7 Escherichia coli и подтверждение того, что высокая устойчивость клеток определяется (p)ppGpp синтезом
Аннотация: Охарактеризовали аллель hipA7, определяющую высокую устойчивость клеток Escherichia coli и установили, что HipA7 не токсичен, содержит две мутации (G22S и D291A), необходимые для проявления фенотипа мутантов hip. Высокая устойчивость клеток наблюдалась при экспрессии hipA7 в отсутствии hipB. Обнаружили высокую корреляцию между частотой устойчивых клеток в штаммах hipA7 и клеточной плотностью. Результаты, полученные с помощью нокаут-мутантов relA и экспрессией relA' с плазмид привели к заключению о том, что hipA7 увеличивает уровень (p)ppGpp синтеза, позволяя значительному количеству клеток в популяции приобрести устойчивость к антибиотикам. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Univ. of North Dakota School of Med. and Health Sci., Grand Forks, ND 58202-9037. Библ. 48

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: АЛЛЕЛИ
АЛЛЕЛЬ HIPA7
МУТАЦИИ HIP
ФЕНОТИП
УСТОЙЧИВОСТЬ
КЛЕТКИ
АНТИБИОТИКИ
КОРРЕЛЯЦИЯ
(P)PPGPP
СИНТЕЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Henderson, Thomas A.; Hill, Thomas M.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.04-04Б2.285

Zhang, Shuyu.
RelA is a component of the nutritional stress activation pathway of the Bacillus subtilis transcription factor 'сигма'{B} [Text] / Shuyu Zhang, W. G. Haldenwang // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 19. - P5714-5721 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: RelA-компонент активируемого недостатком питания пути транскрипционного фактора 'сигма'{B}-Bacillus subtilis
Аннотация: В Bacillus subtilis стрессовый регулон индуцируется активацией транскрипционного фактора 'сигма'{B}. Представили доказательства с помощью инсерционного мутагенеза, что RelA, (p)ppGpp синтетаза, и ключевой фермент ответа на стресс, вызванный изменениями питания, играет важную роль в активации фактора 'сигма'{B}. Роль RelA в активации отличается от его участия в стрессовом ответе. Аминокислотные аналоги, индуцирующие ответ и RelA-зависимый синтез (p)ppGpp не запускают активность 'сигма'{B}. Ни миссенс мутации в relA, ни нуль мутации в гене rplK, ингибирующие ответ и RelA-зависимый синтез (p)ppGpp, не блокируют активацию 'сигма'{B} при недостатке глюкозы. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Univ. of Texas Health Sci. Center, San Antonio, Texas 78229-3900. Библ. 46

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
ГОЛОДАНИЕ
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
(P)PPGPP СИНТАЗА
ФУНКЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ФАКТОР СИГМА B
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Haldenwang, W.G.

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.197

Masuda, Shinji.
Null mutation of HvrA compensates for loss of an essential relA/spoT-like gene in Rhodobacter capsulatus [Text] / Shinji Masuda, Carl E. Bauer // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 1. - P235-239 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Нуль мутация HvrA компенсирует утрату важного relA/spoT-подобного гена в Rhodobacter capsulatus
Аннотация: Показали, что relA/spoT-подобный ген находится в хромосоме Rhodobacter capsulatus и его утрата приводит к летальности. Получили мутации в данном гене на основе нуль мутации в белке нуклеоида HvrA. Полученные результаты привели к заключению, что имеется прямая связь между HrvA-регулируемыми промоторами и ppGpp-связанным строгим ответом. Япония, Lab. for Photobiology, RIKEN Photodynamycs Res. Center, Sendai 980-0845. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГОЛОДАНИЕ
АМИНОКИСЛОТЫ
АДАПТАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН PPGPP-СИНТАЗЫ HVRA
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ФУНКЦИЯ
RHODOBACTER CAPSULATUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bauer, Carl E.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.08-04Б2.341

Wei, W.
Mutagenesis and complementation of relA from Sinorhizobium meliloti 042BM as a salt tolerance involvement gene [Text] / W. Wei, J. Jiang, S. S. Yang // Ann. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 3. - P317-324 . - ISSN 1590-4261
Перевод заглавия: Мутагенез и комплементация relA из Sinorhizobium melioti 042BM как гена солевой толерантности
Аннотация: Sinorhizobium melioti 042BM может расти при 0,6М концентрации NaCl. Сконструировали Tn5-инсерционную библиотеку S. melioti и провели скрининг солеустойчивых мутантов. У мутанта W9 ингибирование роста наступало при 0,2М NaCl. Мутацию отнесли к солечувствительным, а не осмочувствительным. Секвенирование локуса показало, что Tn5-1063a локализован в гене relA, кодирующем (p)ppGpp-синтетазу. Тест на комплементацию в Escherichia coli relA-мутанта позволил установить, что ген обладает (p)ppGpp-синтетазной активностью. Обнаружили нарушение симбиоза в мутанте relA S. melioti 042BM. Китай, Dep. of Microbiol., College of Biol. Sci., China Agricultural Univ., Beijing 100094, PR. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
СОЛЕВОЙ СТРЕСС
МЕХАНИЗМ
ФЕРМЕНТЫ
(P)PPGPP-СИНТЕТАЗА
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
SINORHIZOBIUM MELIOTI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jiang, J.; Yang, S.S.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.02-04Б4.69

Iron limitation induces SpoT-dependent accumulation of ppGpp in Escherichia coli [Text] / Daniel Vinella [et al.] // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 56, N 4. - P958-970 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Недостаток железа индуцирует SpoT-зависимое накопление ppGpp в Escherichia coli
Аннотация: В Escherichia coli бета-лактаммециллинам специфично ингибирует пенициллинсвязывающий белок 2 (PBP2), пептидогликан транспептидазу, важную для поддержания формы клетки. Ранее показали, что инактивация PBP2 ведет к блокированию клеточного деления, а повышение концентрации ppGpp приводит к устойчивости к мециллинаму и позволяет клеткам делиться в отсутствии PBP. В данной работе охарактеризовали инсерционную мутацию, несущую устойчивость к мециллинаму в штамме дикого типа и штамме 'ДЕЛЬТА'relA, но не в штаммах 'ДЕЛЬТА'relA'ДЕЛЬТА'spoT с отсутствием ppGpp. Мутант имел инсерцию в гене fes, кодирующем энтерохелинэстеразу. Этот энзим гидролизует комплекс энтерохелин-Fe{3+}, что приводит к доступности железа для клеток. Показали, что инактивация гена fes вызывает ограничение железа на чашках с богатой средой и увеличение пула ppGpp. Недостаток железа в жидкой среде продуцирует SpoT-зависимое увеличение ppGpp, что свидетельствует о роли железа в балансе двух активностей SpoT - синтезе и гидролизе (p)ppGpp. Представили доказательства, что ppGpp осуществляет прямой и опосредованный положительный контроль над поглощением железа, что подтверждает его регуляторную роль в гомеостазе: недостаток железа ведет к увеличению пула ppGpp, что увеличивает экспрессию генов поглощения железа. Франция, Inst. Jaques Monod (C. N. R. S., Univ. Paris 6, Univ. Paris 7). 2 place Jiussieu, 75251 Paris Cedex 05. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
МЕЦИЛЛИНАМ
МЕХАНИЗМ
ТРАНСПОРТ ИОНОВ
ИОНЫ ЖЕЛЕЗА
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН ТРАНСПОРТА ЖЕЛЕЗА SPOT
ТРАНСКРИПЦИЯ
СИНТЕЗ PPGPP
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Vinella, Daniel; Albrecht, Christian; Cashel, Michael; D'Ari, Richard

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.08-04Б2.226

ppGpp with DksA controls gene expression in the locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes [Text] / Noriko Nakanishi [et al.] // Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 61, N 1. - P194-205 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: ppGpp с DksA контролируют экспрессию генов в локусе прикрепления энтероцитов (LEE) острова патогенности энтерогеморрагических Escherichia coli через активацию двух регуляторных генов вирулентности
Аннотация: Недостаток питательных веществ или остановка роста индуцируют ответную реакцию Escherichia coli через увеличение ppGpp. Установили, что способность к прикреплению энтерогеморрагических Escherichia coli (EHEC) и генная экспрессия локуса прикрепления энтероцитов (LEE) усиливаются при недостатке питания или входе в стационарную фазу роста, то есть при каждом событии, приводящем к увеличению ppGpp. Активация зависит от relA и spoT, кодирующих энзимы синтеза и деградации ppGpp, или dksA, кодирующего аксессорный белок РНК-полимеразы. При индукции экспрессии RelA, транскрипция гена LEE активируется в течение 20 минут, даже без голодания. Экспрессия транскрипционных регуляторов LEE - Ler и Pch, активируется ppGpp и важна для генной экспрессии LEE. Промоторы ler и pch непосредственно активируются ppGpp в системе транскрипции in vitro. Полученные данные привели к заключению, что регуляция генов вирулентности в EHEC объединена с системой ответа E. coli через регуляторные гены вирулентности. Япония, Division of Applied Microbiology, Graduate School of Med., Osaka Univ., Osaka 565-0871

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛКИ СИНТЕЗА PPGPP RELA, SPOT
БЕЛОК СТРОГОГО ОТВЕТА DKSA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nakanishi, Noriko; Abe, Hiroyuki; Ogura, Yoshitoshi; Hayashi, Tetsuy; Tashiro, Kosuke; Kuhara, Satoru; Sugimoto, Nakaba; Tobe, Toru

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.182

ppGpp with DksA controls gene expression in the locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes [Text] / Noriko Nakanishi [et al.] // Mol. Microbiol. - 2006. - Vol. 61, N 1. - P194-205 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: ppGpp с DksA контролируют экспрессию генов в локусе прикрепления энтероцитов (LEE) острова патогенности энтерогеморрагических Escherichia coli через активацию двух регуляторных генов вирулентности
Аннотация: Недостаток питательных веществ или остановка роста индуцируют ответную реакцию Escherichia coli через увеличение ppGpp. Установили, что способность к прикреплению энтерогеморрагических Escherichia coli (EHEC) и генная экспрессия локуса прикрепления энтероцитов (LEE) усиливаются при недостатке питания или входе в стационарную фазу роста, то есть при каждом событии, приводящем к увеличению ppGpp. Активация зависит от relA и spoT, кодирующих энзимы синтеза и деградации ppGpp, или dksA, кодирующего аксессорный белок РНК-полимеразы. При индукции экспрессии RelA, транскрипция гена LEE активируется в течение 20 минут, даже без голодания. Экспрессия транскрипционных регуляторов LEE - Ler и Pch, активируется ppGpp и важна для генной экспрессии LEE. Промоторы ler и pch непосредственно активируются ppGpp в системе транскрипции in vitro. Полученные данные привели к заключению, что регуляция генов вирулентности в EHEC объединена с системой ответа E. coli через регуляторные гены вирулентности. Япония, Division of Applied Microbiology, Graduate School of Med., Osaka Univ., Osaka 565-0871

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ
ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
БЕЛКИ СИНТЕЗА PPGPP RELA, SPOT
БЕЛОК СТРОГОГО ОТВЕТА DKSA
СИНТЕЗ
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nakanishi, Noriko; Abe, Hiroyuki; Ogura, Yoshitoshi; Hayashi, Tetsuy; Tashiro, Kosuke; Kuhara, Satoru; Sugimoto, Nakaba; Tobe, Toru

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.07-04Б2.205

EshA accentuates ppGpp accumulation and is conditionally required for antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2) [Text] / Natsumi Saito [et al.] // J. Bacteriol. - 2006. - Vol. 188, N 13. - P4952-4961 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: EshA способствует накоплению ppGpp и условно необходим для продукции антибиотиков
Аннотация: Разрушение гена eshA, кодирующего 52-кДа белок, продуцируемый в позднюю фазу роста Streptomyces coelicolor A3(2), ведет к прекращению продукции актинородина. Разрушение eshB, близкого гомолога eshA, не оказывает подобного эффекта на выход антибиотика. В мутанте eshA накопление ppGpp было намного ниже, чем в штамме дикого типа. Экспрессия укороченного гена повышала уровень ppGpp до уровня штамма дикого типа. Продукция антибиотика также восстанавливалась в мутанте eshA введением мутации в rpoB (кодирующего бета-субъединицу РНК полимеразы), что позволяло обойти потребность в ppGpp, в соответствии с ролью EshA в модуляции уровней ppGpp. EshA содержит нуклеотид-связывающий домен, необходимый для его роли в запуске продукции актинородина. Полученные результаты позволяют по-новому оценить молекулярные события во время физиологической дифференциации стрептококков. Япония, National Food Research Inst., Tsukuba, Ibaraki. Библ. 62

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: АНТИБИОТИКИ
СТРЕПТОМИЦИН
АКТИНОРОДИН
БИОСИНТЕЗ
ГЕНЫ
ГЕН СИНТЕЗА АКТИНОРОДИНА ESHA
ФУНКЦИЯ
PPGPP
НАКОПЛЕНИЕ
STREPTOMYCES COELICOLOR (BACT.)

Доп.точки доступа:
Saito, Natsumi; Xu, Jun; Hosaka, Takeshi; Okamoto, Susumu; Aoki, Hiroyuki; Bibb, Mervyn J.; Ochi, Kozo

1-20 21-40

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска