СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ<.>)

Общее количество найденных документов : 23
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-23

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.10-04Б1.216

The interaction of glycoprotein C of herpes simplex virus types 1 and 2 with the alternative complement pathway [Text] / Shan-Ling Hung [et al.] // Virology. - 1994. - Vol. 203, N 2. - P299-312 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Взаимодействие гликопротеина C вируса герпеса типа 1 и 2 с альтернативным путем [активации] комплемента
Аннотация: Гликопротеин C вируса герпеса типа 1 (gC-1) не ингибирует образование C3 конвертазы при альтернативном пути активации комплемента. Эта конвертаза стабилизируется сывороточным пропердином. Очищенный gC-1, но не гликопротеин C вируса герпеса типа 2, ингибирует связывание пропердина с C3b, что дестабилизирует конвертазу. Мутант без аминокислот 367-449 способен в высоких конц-иях до нек-рой степени ингибировать связывание пропердина, хотя он связывается с C3b более слабо, чем gC дикого типа. В противоположность этому, белок без аминокислот 33-123 неспособен ингибировать связывание пропердина с C3b. Т. обр., gC-1 содержит два структурных домена, один из к-рых содержит аминокислоты 124-366 и связывается с C3b, тогда как другой содержит аминокислоты 33-133 и мешает пропердину связываться с C3b. США, Dept. of Pathobiol., Sch. of Vet. Med., Univ. of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104. Библ. 67

ГРНТИ	34.25.23

ВИНИТИ 341.25.23.02
Рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
ГЛИКОПРОТИН C
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
КОМПЛЕМЕНТ
СВЯЗЫВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Hung, Shan-Ling; Peng, Charline; Kostavasili, Ioanna; Fridman, Harvey M.; Lambris, John D.; Eisenberg, Roselyn J.; Cohen, Gary H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 95.10-04К1.786

The interaction of glycoprotein C of herpes simplex virus types 1 and 2 with the alternative complement pathway [Text] / Shan-Ling Hung [et al.] // Virology. - 1994. - Vol. 203, N 2. - P299-312 . - ISSN 0042-6822
Перевод заглавия: Взаимодействие гликопротеина C вируса герпеса типа 1 и 2 с альтернативным путем [активации] комплемента
Аннотация: Гликопротеин C вируса герпеса типа 1 (gC-1) не ингибирует образование C3 конвертазы при альтернативном пути активации комплемента. Эта конвертаза стабилизируется сывороточным пропердином. Очищенный gC-1, но не гликопротеин C вируса герпеса типа 2, ингибирует связывание пропердина с C3b, что дестабилизирует конвертазу. Мутант без аминокислот 367-449 способен в высоких конц-иях до нек-рой степени ингибировать связывание пропердина, хотя он связывается с C3b более слабо, чем gC дикого типа. В противоположность этому, белок без аминокислот 33-123 неспособен ингибировать связывание пропердина с C3b. Т. обр., gC-1 содержит два структурных домена, один из к-рых содержит аминокислоты 124-366 и связывается с C3b, тогда как другой содержит аминокислоты 33-133 и мешает пропердину связываться с C3b. США, Dept. of Pathobiol., Sch. of Vet. Med., Univ. of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104. Библ. 67

ГРНТИ	34.43.59

ВИНИТИ 341.43.59.13
Рубрики: ВИРУС ГЕРПЕСА ПРОСТОГО
ГЛИКОПРОТИН C
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
КОМПЛЕМЕНТ
СВЯЗЫВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Hung, Shan-Ling; Peng, Charline; Kostavasili, Ioanna; Fridman, Harvey M.; Lambris, John D.; Eisenberg, Roselyn J.; Cohen, Gary H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 96.08-04Т1.188

Guan, Xiao-Ming.
Determination of structural domains for G protein coupling and ligand binding in 'бета'[3]-adrenergic receptor [Text] / Xiao-Ming Guan, Angela Amend, Catherine D. Strader // Mol. Pharmacol. - 1995. - Vol. 48, N 3. - P492-498 . - ISSN 0026-895X
Перевод заглавия: Определение структурных доменов 'бета'[3]-адренорецептора, [участвующих] в сопряжении с G-белком и связывании лиганда
Аннотация: Опыты поставлены на культуре клеток Raji, в к-рых были экспрессированы химерные 'бета'[2]/'бета'[3]-адренорецепторы. Изопротеренол (10{-6} М) ингибировал связывание [{125}I]йодцианопиндолола с рецептором дикого типа и с мутантным рецептором D(277-289) на 30 и 70% соотв. Различий во влиянии пропранолола на связывание радиолиганда с рецептором дикого типа и с мутантным рецептором не обнаружено. Значения IC[50] сродства BRL 37344 с 'бета'[2]- и 'бета'[3]-рецепторами дикого типа, а также с химерными рецепторами ('бета'[2]/'бета'[3]) C1, C8, C11 и С14 составляли 3400, 380, 1100, 53000, 97 и 3300 нМ соотв. Продукция цАМФ, стимулированная изопротеренолом (10{-5} М), в L-клетках, в к-рых были экспрессированы 'бета'[3]-рецептор дикого типа, а также мутантные рецепторы D(227-284) и D(277-289), возрастала в 3,5; 1,3 и 1,8 раза соотв. Показано отсутствие сопряжения мутантных рецепторов с G-белком. Обсуждена роль нек-рых доменов 3-й внутриклеточной петли структуры рецептора во взаимодействии с лигандами. США, Merck Res. Labs, Rohway, NJ 07065. Библ. 27

ГРНТИ	34.45.21

ВИНИТИ 341.45.21.23.15.02
Рубрики: АДРЕНОРЕЦЕПТОРЫ* 'БЕТА'3-
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
СОПРЯЖЕНИЕ С G-БЕЛКОМ
СВЯЗЫВАНИЕ ЛИГАНДОВ
КЛЕТКИ RAJI

Доп.точки доступа:
Amend, Angela; Strader, Catherine D.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 97.01-04Я6.80

Burns, Roy G.
Identification of two new members of the tubulin family [Text] / Roy G. Burns // Cell Motil. and Cytoskeleton. - 1995. - Vol. 31, N 4. - P255-258 . - ISSN 0886-1544
Перевод заглавия: Идентификация двух новых членов семейства тубулина
Аннотация: Анализ последовательностей 'дельта'- и 'эпсилон'-тубулинов показывает, что они оба состоят из двух структурных доменов, из которых N-концевой домен может связываться 'альфа'/'бета' гетеродимерами, в то время как C-концевой домен вероятно связывается нетубулиновым белком. Оба тубулина возможно связывают ГТФ, но у них отсутствует ГТФазная активность, в то же время их синтез не саморегулируется и требует наличия шаперонина TCP1. Хотя их свойства напоминают свойства 'гамма'-тубулина, низкая идентичность последовательностей показывает, что 'гамма'-, 'дельта'- и 'эпсилон'-белки должны быть классифицированы как различные члены семейства тубулина. Великобритания, Biophys. Section, Blackett Lab., Imperial Coll. Sci., Technol., Med., London. Библ. 10

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.07.03.01
Рубрики: ТУБУЛИН
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.08-04Б1.98

Structural domains involved in human cytomegalovirus glycoprotein B-mediated cell - cell fusion [Text] / S. Bold [et al.] // J. Gen. Virol. - 1996. - Vol. 77, N 9. - P2297-2302 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Структурные домены, вовлеченные в передающееся гликопротеином B цитомегаловируса человека слияние клетки с клеткой
Аннотация: Разработали новый метод слияния клеток, используя кокультивирование фибробластов крайней плоти человека со стабильно трансфицированными клетками астроцитомы человека U373, к-рые экспрессировали природный или мутантный гликопротеин B цитомегаловируса человека (гB ЦМВ, грUL55). При делециях в гB гидрофобного домена 1 (гд 1, аминокислоты 714-747) или делециях специфических сегментов в цитоплазматическом хвосте (аминокислоты 811-825 или 871-906) обнаружили значительное уменьшение слияния гетерологичных клеток. Специфичные для гB моноклональные антитела (МА), как и МА против клеточного аннексина II, предотвращали слияние трансфицированных клеток, экспрессирующих природный гB. Метили фибробласты флуоресцирующим внутриклеточным флуорохромом кальцеином AM и определяли флуоресценцию образованного синцития через 6 ч после кокультивирования с трансфицированными клетками. Установили, что способность гB ЦМВ вызывать слияние клеток определяется его внеклеточным доменом гд1 и конформацией цитоплазматического хвоста. Германия, Inst. fur Virol. der Philipps-Univ., Robert-Koch-Str. 17, D-35037 Marburg. Библ. 20

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ЦИТОМЕГАЛОВИРУСЫ
ГЛИКОПРОТЕИН В
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
СИМПЛАСТООБРАЗОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Bold, S.; Ohlin, M.; Garten, W.; Radsak, K.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI39) 97.11-04К1.83

The two biological activities of human immunodeficiency virus type 1 Vpu protein involve two separable structural domains [Text] / Ulrich Schubert [et al.] // J. Virol. - 1996. - Vol. 70, N 2. - P809-819 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: В двух биологических активностях белка Vpu вируса иммунодефицита человека участвуют два раздельных структурных домена
Аннотация: Белок Vpu (I) ВИЧ-1 вызывает деградацию CD4 (II) в эндоплазматическом ретикулуме и усиливает освобождение вируса с поверхности клетки. Мутант I Vpu[35], лишенный большей части цитоплазматического домена, сохранил частичную активность в освобождении ВИЧ-1, но не вызывает деградацию II. Это показало, что N-конец I с трансмембранным якорным доменом (ТМЯД) важен для регуляции освобождения вируса, но не для разрушения II. Сконструирован мутант I Vpu[RD] (IA) с измененной последовательностью ТМЯД, сохранившей аминокислотный состав и 'альфа'-спиральную структуру. IA нормально интегрируется в мембрану и не отличается от I дикого типа по уровню экспрессии, стабильности белка и субклеточной локализации, а также по способности связываться с II и вызывать его деградацию. Однако IA не усиливает освобождение вируса из инфицированных и трансфицированных клеток. ВИЧ-1, кодирующий IA, по репликации в Т-клетках не отличается от дефектного по I мутанта ВИЧ-1. Мутация сайтов фосфорилирования в IA делает его неспособным выполнять обе функции I. Эти данные показали, что 2 биологические активности I зависят от разных молекулярных механизмов и определяются разными структурными доменами I. США, Lab. of Mol. Microbiol., Nat. Inst. of Allergy and Infections Diseases, Bethesda, MD 20892-0460. Библ. 44

ГРНТИ	34.43.27

ВИНИТИ 341.43.27.15
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
БЕЛОК VPU
БИОЛОГИЧЕСКИЕ АКТИВНОСТИ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ

Доп.точки доступа:
Schubert, Ulrich; Bour, Stephan; Ferrer-Montiel, Antonio V.; Montal, Mauricio; Maldarelli, Frank; Strebel, Klaus

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 97.12-04Б1.65

The two biological activities of human immunodeficiency virus type 1 Vpu protein involve two separable structural domains [Text] / Ulrich Schubert [et al.] // J. Virol. - 1996. - Vol. 70, N 2. - P809-819 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: В двух биологических активностях белка Vpu вируса иммунодефицита человека участвуют два раздельных структурных домена
Аннотация: Белок Vpu (I) ВИЧ-1 вызывает деградацию CD4 (II) в эндоплазматическом ретикулуме и усиливает освобождение вируса с поверхности клетки. Мутант I Vpu[35], лишенный большей части цитоплазматического домена, сохранил частичную активность в освобождении ВИЧ-1, но не вызывает деградацию II. Это показало, что N-конец I с трансмембранным якорным доменом (ТМЯД) важен для регуляции освобождения вируса, но не для разрушения II. Сконструирован мутант I Vpu[RD] (IA) с измененной последовательностью ТМЯД, сохранившей аминокислотный состав и 'альфа'-спиральную структуру. IA нормально интегрируется в мембрану и не отличается от I дикого типа по уровню экспрессии, стабильности белка и субклеточной локализации, а также по способности связываться с II и вызывать его деградацию. Однако IA не усиливает освобождение вируса из инфицированных и трансфицированных клеток. ВИЧ-1, кодирующий IA, по репликации в Т-клетках не отличается от дефектного по I мутанта ВИЧ-1. Мутация сайтов фосфорилирования в IA делает его неспособным выполнять обе функции I. Эти данные показали, что 2 биологические активности I зависят от разных молекулярных механизмов и определяются разными структурными доменами I. США, Lab. of Mol. Microbiol., Nat. Inst. of Allergy and Infections Diseases, Bethesda, MD 20892-0460. Библ. 44

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА
БЕЛОК VPU
БИОЛОГИЧЕСКИЕ АКТИВНОСТИ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ

Доп.точки доступа:
Schubert, Ulrich; Bour, Stephan; Ferrer-Montiel, Antonio V.; Montal, Mauricio; Maldarelli, Frank; Strebel, Klaus

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.04-04Б1.102

Chimeric coxsackie B3 virus genomes that express hybrid coxsackievirus-poliovirus 2B proteins: Functional dissection of structural domains involved in RNA replication [Text] / Kuppeveld Frank J. M. van [et al.] // J. Gen. Virol. - 1997. - Vol. 78, N 8. - P1833-1840 . - ISSN 0022-1317
Перевод заглавия: Химерные геномы вируса Коксаки В3, экспрессирующие гибридные белки 2В вирус Коксаки - вирус полиомиелита: функциональный анализ структурных доменов, участвующих в репликации РНК
Аннотация: Белки 2В (I) вируса Коксаки (ВК) и вируса полиомиелита (IА и IВ соотв.) структурно похожи, имеют близкие биохимические функции и содержат в С-концевых 2/3 молекулы два гидрофобных домена, один из к-рых может образовывать катионную амфипатическую 'альфа'-спираль. Сконструированы геномы ВК-В3, экспрессирующие целый IВ или гибридные I, в к-рых специфические сегменты IА заменены соответствующими сегментами IВ. Синтез и процессинг химерных полипротеинов in vitro протекает нормально. Геномы ВК-В3, продуцирующие IВ или I, состоящий из N-концевой трети IА и остальной части IВ, не реплицируются. Химерный геном, экспрессирующий гибридный I, состоящий из N-концевой трети IВ и остальной части IА, дают жизнеспособные вирусы. Эти данные позволяют предположить, что специфичные в отношении последовательности взаимодействия с другим вирусным белком требуются для репликации РНК и что эти участки контакта расположены в С-концевых 2/3 молекулы I. Гибридные геномы, в к-рых заменены гидрофобные домены I, реплицироваться не могут. Обсуждается вклад этих доменов в структуру и функцию I. Нидерланды, Dep. of Med. Microbiol., Univ. of Nijmegen, 6500 HB Nijmegen. Библ. 41

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ЭНТЕРОВИРУСЫ
КОКСАКИВИРУСЫ
ПОЛИОВИРУСЫ
БЕЛКИ ГИБРИДНЫЕ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
van, Kuppeveld Frank J.M.; van, den Hurk Patrick J.J.C.; van, der Vliet Walter; Galama, Jochem M.D.; Melchers, Willem J.G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 98.04-04Т1.235

Pessia, Mauro.
Structural domains of the muscarine-gated K{+} channel involved in G-protein sensitivity and channel assembly [Text] : [Pap.] 28th Nat. Congr. Ital. Pharmacol. Soc., Bari, Apr. 30-May 3, 1997: Abstr. Book / Mauro Pessia, Stephen J. Tucker, John P. Adelman // Pharmacol. Res. - 1997. - Vol. 35, Suppl. - P7 . - ISSN 1043-6618
Перевод заглавия: Структурные домены K{+}-каналов м-холинорецепторов, обуславливающие чувствительность к G-белкам и сборку канала
Аннотация: На ооцитах Xenopus, экспрессирующие тандемно связанные субъединицы K{+}-каналов, K[IR] 3.1 и K[IR] 3.4, показано, что белок G-'бета'[1]'гамма'[2] увеличивал амплитуду тока канала K[IR] 3.4-3.4-3.1-3.1 и K[IR] 3.4-3.1-3.4-3.1 в 2,5 и 6 раз соотв. Считают, что N- и C-концевые домены тетрамера обусловливают чувствительность K{+}-каналов м-холинорецепторов к G-белкам. Италия, Istituto "Mario Negri" Sud. S. Maria Imbaro (CH). Библ. 2

ГРНТИ	34.45.21

ВИНИТИ 341.45.21.23.09.07
Рубрики: М-ХОЛИНОРЕЦЕПТОРЫ
КАЛИЕВЫЕ КАНАЛЫ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
СБОРКА КАНАЛА
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К G-БЕЛКАМ
ООЦИТЫ XENOPUS

Доп.точки доступа:
Tucker, Stephen J.; Adelman, John P.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI24) 99.04-04М3.149

Domaines essential for localization of myosin binding protein H (MYBP-H, H-protein) to the A-band of myofibril [Text] : annu. Meet. Prof. Res. Sci. "Exp. Biol.", New Orleans, La, Apr. 6-9, 1997 / D. A. Fischman [et al.] // FASEB Journal. - 1997. - Vol. 11, N 3. - P16 . - ISSN 0892-6638
Перевод заглавия: Домен, необходимый для локализации миозин-связывающего белка Н (MYBP-H, H-белок) в А-полосе миофибрилл

ГРНТИ	34.39.15

ВИНИТИ 341.39.15.37.17.13
Рубрики: МИОЗИН
Н-БЕЛОК
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ХИМЕРНЫЕ ФОРМЫ
МИОФИБРИЛЛЫ
КУРЫ

Доп.точки доступа:
Fischman, D.A.; Cohen, J.A.; Pardo, S.; Basu, A.; Siewert, C.; Reinach, F.C.; Gilbert, R.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.297

Kwon, Douglas.
Structural domains of IS10 transposase and reconstitution of transposition activity from proteolytic fragments lacking an interdomain linker [Text] / Douglas Kwon, Ronald M. Chalmers, Nancy Kleckner // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1995. - Vol. 92, N 18. - P8234-8238 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Структурные домены транспозазы IS 10 и реконструкция транспозиционной активности из протеолитических фрагментов, лишенных междоменного линкера
Аннотация: Транспозаза элемента IS 10 (I) имеет мол. м. 48 кД и состоит из 2 главных доменов: N-концевого (N-КД) с мол. м. 28 кД (остатки 1-246) и C-концевого домена (C-КД) с мол. м. 17 кД (остатки 256 - 402), соединенных чувствительной к протеолизу линкерной областью (ЛО) с мол. м. 1 кД (остатки 247-255). N-КД имеет слабый чувствительный к протеазам сайт на расстоянии 53 остатка от N-конца, к-рый разбивает N-КД на субдомены N-КД-'альфа' и N-КД-'бета'. Фрагменты N-КД и N-КД-'бета' способны связываться с ДНК. Ни один из фрагментов I порознь не может катализировать первую стадию транспозиции - сборку синаптического комплекса, содержащего пару концов транспозона. Полная активность I в транспозиции реконструируется при смешивании фрагментов N-КД и C-КД, независимо от присутствия ЛО. Эти данные показали, что структурная целостность I во время переходов на разных стадиях р-ции транспозиции поддерживается независимо от ЛО прямыми контактами между N-КД и С-КД. Мутации, затрагивающие ЛО, могут влиять на перенос нити или специфичность инсерции. Нет ни одной области I, к-рая была бы не нужна для образования синаптического комплекса, но требовалась для расщепления комплекса. США, Dep. Molec. and Cell Biol., Harvard Univ., Cambridge, MA 02138. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: ТРАНСПОЗОНЫ
ЭЛЕМЕНТ IS10
ТРАНСПОЗАЗА
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ТРАНСПОЗИЦИЯ
ОГРАНИЧЕННЫЙ ПРОТЕОЛИЗ
ДНК
СВЯЗЫВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Chalmers, Ronald M.; Kleckner, Nancy

12.

РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 00.11-04В5.77

Interactions between the structural domains of the RNA replication proteins of plant-infecting RNA viruses [Text] / Erin K. O'Reilly [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 9. - P7160-7169 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Взаимодействия между структурными доменами белков репликации РНК заражающих растения РНК-содержащих вирусов
Аннотация: Белок 1a (I) вируса мозаики костра (ВМК) состоит из N-концевого кэпирующего домена (КД) и C-концевого геликазного домена (ГД). С использованием ранее изученных мутантов в РК ВМК установлена идеальная корреляция между фенотипами этих мутантов и способностью мутантных I взаимодействовать друг с другом и с I дикого типа в дрожжевой 2-гибридной системе. Вестерн-блот показал, что многие невзаимодействующие мутантные I имеют такую же стабильность, как и I дикого типа. Делеционный анализ показал, что N-концевые 515 остатков I необходимы и достаточны для взаимодействия I-I. Это межмолекулярное взаимодействие между КД I обнаружено и у вируса огуречной мозаики (ВОМ) с геномом из 3 частей РНК. Границы различных активностей I определены в контексте предсказанных вторичных структур нескольких похожих на I белков альфавирусного семейства. Предложена рабочая модель сборки РНК-репликазы ВМК. США, Dep. Biol., Indiana Univ., Blaomington, IN 47405. Библ. 33

ГРНТИ	68.37.31

ВИНИТИ 681.37.31.15.02
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
РНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ
РЕПЛИКАЦИОННЫЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
O'Reilly, Erin K.; Wang, Zhaohui; French, Roy; Kao, C.Cheng

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.11-04Б1.60

Interactions between the structural domains of the RNA replication proteins of plant-infecting RNA viruses [Text] / Erin K. O'Reilly [et al.] // J. Virol. - 1998. - Vol. 72, N 9. - P7160-7169 . - ISSN 0022-538X
Перевод заглавия: Взаимодействия между структурными доменами белков репликации РНК заражающих растения РНК-содержащих вирусов
Аннотация: Белок 1a (I) вируса мозаики костра (ВМК) состоит из N-концевого кэпирующего домена (КД) и C-концевого геликазного домена (ГД). С использованием ранее изученных мутантов в РК ВМК установлена идеальная корреляция между фенотипами этих мутантов и способностью мутантных I взаимодействовать друг с другом и с I дикого типа в дрожжевой 2-гибридной системе. Вестерн-блот показал, что многие невзаимодействующие мутантные I имеют такую же стабильность, как и I дикого типа. Делеционный анализ показал, что N-концевые 515 остатков I необходимы и достаточны для взаимодействия I-I. Это межмолекулярное взаимодействие между КД I обнаружено и у вируса огуречной мозаики (ВОМ) с геномом из 3 частей РНК. Границы различных активностей I определены в контексте предсказанных вторичных структур нескольких похожих на I белков альфавирусного семейства. Предложена рабочая модель сборки РНК-репликазы ВМК. США, Dep. Biol., Indiana Univ., Blaomington, IN 47405. Библ. 33

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: ВИРУСЫ РАСТЕНИЙ
РНК-СОДЕРЖАЩИЕ ВИРУСЫ
РЕПЛИКАЦИОННЫЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
O'Reilly, Erin K.; Wang, Zhaohui; French, Roy; Kao, C.Cheng

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.173

Comparison of conserved structural and regulatory domains within divergent 16S rRNA-23S rRNA spacer sequences of cyanobacteria [Text] / Isabelle Iteman [et al.] // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 6. - P1275-1286 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Сравнение консервативных структурных и регуляторных доменов в дивергентных спейсерных последовательностях рРНК 16S-рРНК 23S цианобактерий
Аннотация: При ПЦР-амплификации внутреннего транскрибируемого спейсера ITS между генами рРНК 16S и 23S у цианобактерии Nostoc PCC 7120 образуются 3 продукта, 2 из к-рых представляют истинные области ITS разных размеров, а третий является их гетеродуплексом. Более длинный спейсер ITS-L имеет длину 512 н. и содержит гены тРНК{иле} и тРНК{ала}, разделенные большой шпилечной структурой V2, к-рая состоит из коротких тандемных повторов. Короткий спейсер ITS-S почти идентичен длинному, но не содержит обоих генов тРНК и 5'-половины петли V2. Спейсеры Nostoc PCC 7120 сравнили с последовательностями ITS цианобактерий, цианелл Cyanophora paradoxa и Escherichia coli. Области ITS цианобактерий имеют длину 283-545 н. и могут содержать гены тРНК{иле} и тРНК{вал} либо только тРНК{иле} или не содержат обоих генов. Однако корреляция между размером ITS и способностью кодировать тРНК отсутствует. Сравнение предсказанных вторичных структур транскриптов оперонов rrn нескольких цианобактерий и E. coli позволило идентифицировать высококонсервативные мотивы для сворачивания и созревания и область, похожую на бактериальные антитерминаторы boxA и boxB. Консервативные и вариабельные области ITS цианобактерий могут быть использованы в кач-ве праймеров для ПЦР и олигонуклеотидных зондов для обнаружения и идентификации цианобактерий. Франция, Dep. Biochem. et Genet. Mol., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РРНК RRN
СПЕЙСОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ITS
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ДОМЕНЫ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА
NOSTOC (BACT.)
ЦИАНОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Iteman, Isabelle; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 02.07-04В2.59

Comparison of conserved structural and regulatory domains within divergent 16S rRNA-23S rRNA spacer sequences of cyanobacteria [Text] / Isabelle Iteman [et al.] // Microbiology. - 2000. - Vol. 146, N 6. - P1275-1286 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Сравнение консервативных структурных и регуляторных доменов в дивергентных спейсерных последовательностях рРНК 16S-рРНК 23S цианобактерий
Аннотация: При ПЦР-амплификации внутреннего транскрибируемого спейсера ITS между генами рРНК 16S и 23S у цианобактерии Nostoc PCC 7120 образуются 3 продукта, 2 из к-рых представляют истинные области ITS разных размеров, а третий является их гетеродуплексом. Более длинный спейсер ITS-L имеет длину 512 н. и содержит гены тРНК{иле} и тРНК{ала}, разделенные большой шпилечной структурой V2, к-рая состоит из коротких тандемных повторов. Короткий спейсер ITS-S почти идентичен длинному, но не содержит обоих генов тРНК и 5'-половины петли V2. Спейсеры Nostoc PCC 7120 сравнили с последовательностями ITS цианобактерий, цианелл Cyanophora paradoxa и Escherichia coli. Области ITS цианобактерий имеют длину 283-545 н. и могут содержать гены тРНК{иле} и тРНК{вал} либо только тРНК{иле} или не содержат обоих генов. Однако корреляция между размером ITS и способностью кодировать тРНК отсутствует. Сравнение предсказанных вторичных структур транскриптов оперонов rrn нескольких цианобактерий и E. coli позволило идентифицировать высококонсервативные мотивы для сворачивания и созревания и область, похожую на бактериальные антитерминаторы boxA и boxB. Консервативные и вариабельные области ITS цианобактерий могут быть использованы в кач-ве праймеров для ПЦР и олигонуклеотидных зондов для обнаружения и идентификации цианобактерий. Франция, Dep. Biochem. et Genet. Mol., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 51

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.15.19
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ РРНК RRN
СПЕЙСОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ITS
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ДОМЕНЫ
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА
NOSTOC (BACT.)
ЦИАНОБАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Iteman, Isabelle; Rippka, Rosmarie; Tandeau, de Marsac Nicole; Herdman, Michael

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.10-04Б2.229

Dissection of the functional and structural domains of phosphroelay histidine kinase A of Bacillus subtilis [Text] / Ling Wang [et al.] // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 9. - P2795-2802 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Анализ функциональных и структурных доменов гистидиновой киназы A фосфореле Bacillus subtilis
Аннотация: Главной входной гистидиновой протеинкиназой фосфореле Bacillus subtilis, инициирующего споруляцию, является киназа A (I), к-рая активна в форме гомодимера. Мономер I состоит из N-концевой узнающей сигнал области длиной 400 остатков с 3 доменами PAS (A, B и C) и C-концевой области автокиназы (II) длиной 200 остатков. Протеолиз и 2-гибридный анализ показали, что в димеризации N-концевой области I участвует область PAS-B/PAS-C. Ближайший к N-концу домен PAS-A не димеризуется, но очень важен для ферментативной активности. Аминокислотные замены в PAS-A и PAS-C влияют на активность in vivo. Это показало, что оба домена PAS требуются для узнавания сигнала. C-концевая II в отсутствие N-области I является димером. Димеризация требуется для образования фосфотрансферазного домена - пучка из 4 спиралей. Укороченная II неактивна в автофосфорилировании с АТФ, но фосфорилирование гистидина в фосфотрансферазном домене обратными реакциями из Spo0F'ЭКВИВ'P происходит нормально. Однако фосфорилированная II не переносит свою фосфатную группу на АДФ. Эти данные показали, что N-концевая область I существенна для узнавания сигнала и для поддержания правильной конформации автокиназной области. США, Dep. Mol. and Experim. Med., Scripps Res. Inst., La Jolla, CA 92037. Библ. 25

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
ГИСТИДИНОВАЯ КИНАЗА A
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ДОМЕНЫ
ХАРАКТЕРИСТИКА
АКТИВНЫЙ ЦЕНТР
ОРГАНИЗАЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wang, Ling; Fabret, Celine; Kanamaru, Kyoko; Stephenson, Keith; Dartois, Veronique; Perego, Marta; Hoch, James A.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 04.04-04А3.434

DDBASE2.0:Updated domain database with improved identification of structural domains [Text] / A. Vianyagam [et al.] // Bioinformatics. - 2003. - Vol. 19, N 14. - P1760-1764 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: DDBASE2.0 - база данных о доменах с усовершенствованной идентификацией структурных доменов
Аннотация: Хотя существует много алгоритмов идентификации структурных доменов (СД) в трехмерной структуре белка, точное их определение и применение к большому числу белков часто требует вмешательства исследователя. Проведено усовершенствование метода формального определения понятия СД, начиная с концепции кластеризации элементов вторичной структуры, но с намерением уменьшить число прерывающихся отрезков в определяемых СД. Проведено сравнение полученного модифицированного и автоматизированного метода с другими методами определения СД. Результаты применения нового метода для определения числа СД на 88% совпали с определениями кристаллографов и результатами, собранными в базах данных SCOP, CATH, DALI, 3Dee и PDP. По определению границ доменов результаты на 98% перекрываются с данными других методов. Создана новая база данных по результатам определения новым методом 5409 СД в 4592 белках (http://www.ncbs.res.in/'ЭКВИВ'faculty/mini/ddbase/ddbase.html). Индия, Nat. Ctr. Biol. Sci., Tata Inst. Fundamental Res., UAS-GKVK Campus, Bangalore, Kamataka 560065. Библ. 22

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БЕЛОК
ТРЕХМЕРНАЯ СТРУКТУРА
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
УСОВЕРШЕНСТВОВАННАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ
БАЗА ДАННЫХ DDBASE2.0
АДРЕС В ИНТЕРНЕТЕ

Доп.точки доступа:
Vianyagam, A.; Shi, J.; Pugalenthi, G.; Meenakshi, B.; Blundell, T.L.; Sowdhamini, R.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.159

Serres, Margrethe H.
GenProtEC: An updated and improved analysis of functions of Escherichia coli K-12 proteins [Text] / Margrethe H. Serres, Sulip Goswami, Monica Riley // Nucl. Acids Res. - 2004. - Vol. 32, прил. Dat. Iss. - P300-302 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: GenProtEC: модернизированный и улучшенный анализ функций белков Escherichia coli
Аннотация: В базе данных GenProtEC (http://genprotec.mbl.edu/) представлена новая информация о функциях 87% белков Escherichia coli K-12. Новый подход обеспечил сведения о структурных доменах и их функциях в белках E. coli. Модернизировали некоторые ранее используемые методы, такие как процесс идентификации и разделения многомодульных белков. В результате определили группы паралогичных белков. Включили экспериментальную информацию из текущей литературы о ранее неизвестных генах. Уделили особое внимание белкам, выполняющим в клетке несколько функций, что позволило расширить информацию, получаемую из каталога MultiFun. США, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02540. Библ. 11

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.07
Рубрики: БЕЛОК
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ФУНКЦИИ
ПАРАЛОГИЧНЫЕ БЕЛКИ
ПРОТЕОМИНА
БАЗЫ ДАННЫХ
GENPROTEC
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Goswami, Sulip; Riley, Monica

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.11-04Б2.292

The roles of different regions of the CycH protein in c-type cytochrome biogenesis in Sinorhizobium meliloti [Text] / G. Cinege [et al.] // Mol. Gen. and Genom. - 2004. - Vol. 271, N 2. - P171-179 . - ISSN 1617-4615
Перевод заглавия: Роль разных участков белка CycH в биогенезе цитохромов типа c у Sinorhizobium meliloti
Аннотация: Цитохром-c-гемлиазы Sinorhizobium meliloti, кодируемые опероном cycHJKL, катализируют образование ковалентной связи между простетической группой гема и апоцитохромами C. Белок CycH, N-концевая часть которого предположительно ассоциирована с мембраной, а C-концевая часть расположена в периплазме, как полагают, отвечает за связывание апоцитохрома и его представление аппарату, присоединяющемуся гем. Предположили, что эти 2 модуля CycH играют разную роль в его функционировании. N-концевые 96 аминокислот представляют активный субдомен белка, способный комплементировать фенотип накопления протопорфирина IX (ppIX) у мутантного по cycH штамма AT342. Т. обр., N-концевой субдомен участвует в заключительных стадиях биосинтеза гема C. В C-концевой области CycH идентифицированы 3 тетратрикопептидных (TPR) домена, которые, как известно, определяют белок-белковые взаимодействия. Каждый из 3 TPR-доменов абсолютно необходим для функционирования белка. Плазмиды с генами cycH с удаленными областями, кодирующими TPR-домены, не способны комплементировать отсутствие нитратредуктазной (Rnr-) и азотфиксирующей (Fix-) активностей мутантов cycH. N-концевая часть CycH размером 309 аминокислотных остатков, включающая все 3 TPR-домена, способна обеспечивать сборку цитохромов c-типа, необходимую для проявления фенотипа Rnr{+}, но только полноразмерный белок обеспечивает способность к фиксации азота

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.29
Рубрики: ЦИТОХРОМ С
БИОГЕНЕЗ
ЦИТОХРОМ-С-ГЕМЛИАЗЫ
ОПЕРОН CYCHJKI
БЕЛОК
CYCH
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Cinege, G.; Kereszt, A.; Kertesz, S.; Balogh, G.; Dusha, I.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 06.09-04А3.571

Pugalenthi, Ganesan.
GenDiS: Genomic Distribution of protein structural domain Superfamilies [Text] / Ganesan Pugalenthi, Anirban Bhaduri, Ramanathan Sowdhamini // Nucl. Acids Res. - 2005. - Vol. 33, Database issue. - PD252-D255 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: GenDiS: геномное распределение суперсемейств структурных доменов белков

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
GENDIS
БЕЛОК
СТРУКТУРНЫЕ ДОМЕНЫ
РАСПРЕДЕЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Bhaduri, Anirban; Sowdhamini, Ramanathan

1-20 21-23

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска