Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ<.>)
Общее количество найденных документов : 26
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-26 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.12-04Б1.213

   

    A hotspot of spontaneous and UV-induced illegitimate recombination during formation of 'лямбда' bio transducing phage [Text] / Hirotaka Yamaguchi [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1995. - Vol. 248, N 6. - P637-643 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Горячая точка спонтанной и УФ-индуцированной незаконной рекомбинации во время образования трансдуцирующих фагов 'лямбда' bio
Аннотация: Для изучения механизма спонтанной и УФ-индуцированной незаконной рекомбинации у Escherichia coli исследовано образование специализированных трансдуцирующих фагов (СТФ). Т. к. большинство СТФ 'лямбда' bio дефектно по генам red и gam и образует негативные колонии на лизогене по фагу Р2, для селекции СТФ 'лямбда' bio использован этот фенотип Spi{-}. Секвенированы рекомбинац. стыки СТФ 'лямбда' bio и определены последовательности родительских сайтов рекомбинации. Они широко распределены по ДНК локуса bio и фага 'лямбда', за исключением одной горячей точки рекомбинации (ГТР), к-рая отвечает за 57% УФ-индуцированных и 77% спонтанно индуцированных СТФ 'лямбда' bio. Сайты ГТР в ДНК E. coli и 'лямбда' имеют общую область гомологии длиной 9 п. н. (ТТЦЦАТГЦГ). Кроме того в самих ГТР и рядом с ними имеются прямые повторы 8 п. н. (АТГYГYТЦ). Мутация recA не влияет на частоту рекомбинации в ГТР, так что рекомбинация не является вариантом RecA-зависимой гомологич. рекомбинации. Обсуждается модель, согласно к-рой короткий участок гомологии и прямые повторы играют важную роль в незаконной рекомбинации в ГТР. Япония, Dep. of Molecular Biol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Tokyo 108. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛЯМБДА BIO

ТРАНСДУКЦИЯ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Yamaguchi, Hirotaka; Yamashita, Teruhito; Shimizu, Hatsushi; Ikeda, Hideo


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.03-04Б1.160

    Marais, Armelle.

    Spiroplasma citri virus SpV1-derived cloning vector: Deletion formation by illegitimate and homologous recombination in a spiroplasmal host strain which probably lacks a functional recA gene [Text] / Armelle Marais, Joseph M. Bove, Joel Renaudin // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 3. - P862-870 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Происходящий из вируса SpV1 Spiroplasma citri клонирующий вектор: образование делеций в результате незаконной и гомологической рекомбинации в штамме-хозяине спироплазмы, вероятно, лишенном функционального гена recA
Аннотация: Ранее было описано применение репликативной формы (РФ) ДНК фага SpV1 Spiroplasma citri в качестве вектора для экспрессии в S. citri эпитопа адгезина Р1 из Mycoplasma pneumoniae. Найдено, что рекомбинантная РФ ДНК нестабильна и часто утрачивает вставку. Анализ фаговых клонов с делециями показал, что в образовании делеций участвует как незаконная, так и гомологич. рекомбинация. В одном из таких клонов делеция образовалась в результате двойного кроссоверного обмена между кольцевой свободной РФ ДНК и последовательностями ДНК фага SpV1 в хромосоме S. citri. Гомологич. рекомбинация обычно зависит от белка RecA. Однако изучение гена recA в использованном штамме R8A2 S. citri показало, что более 2/3 открытой рамки считывания recA делетировано в С-концевой части, так что этот штамм должен быть дефектен по RecA. Франция, Lab. de Biol. Cellulaire et Moleculaire, INRA, Univ. de Bordeaux II, 33883 Villenave d'Ornan. Библ. 71
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: ВЕКТОРЫ
ВИРУС SPV1

ДЕЛЕЦИИ

ОБРАЗОВАНИЕ

ВЛИЯНИЕ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

SPIROPLASMA CITRI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Bove, Joseph M.; Renaudin, Joel


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.08-04Б2.226

    Marais, Armelle.

    Spiroplasma citri virus SpV1-derived cloning vector: Deletion formation by illegitimate and homologous recombination in a spiroplasmal host strain which probably lacks a functional recA gene [Text] / Armelle Marais, Joseph M. Bove, Joel Renaudin // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 3. - P862-870 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Происходящий из вируса SpV1 Spiroplasma citri клонирующий вектор: образование делеций в результате незаконной и гомологической рекомбинации в штамме-хозяине спироплазмы, вероятно, лишенном функционального гена recA
Аннотация: Ранее было описано применение репликативной формы (РФ) ДНК фага SpV1 Spiroplasma citri в качестве вектора для экспрессии в S. citri эпитопа адгезина Р1 из Mycoplasma pneumoniae. Найдено, что рекомбинантная РФ ДНК нестабильна и часто утрачивает вставку. Анализ фаговых клонов с делециями показал, что в образовании делеций участвует как незаконная, так и гомологич. рекомбинация. В одном из таких клонов делеция образовалась в результате двойного кроссоверного обмена между кольцевой свободной РФ ДНК и последовательностями ДНК фага SpV1 в хромосоме S. citri. Гомологич. рекомбинация обычно зависит от белка RecA. Однако изучение гена recA в использованном штамме R8A2 S. citri показало, что более 2/3 открытой рамки считывания recA делетировано в С-концевой части, так что этот штамм должен быть дефектен по RecA. Франция, Lab. de Biol. Cellulaire et Moleculaire, INRA, Univ. de Bordeaux II, 33883 Villenave d'Ornan. Библ. 71
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ВЕКТОРЫ
ВИРУС SPV1

ДЕЛЕЦИИ

ОБРАЗОВАНИЕ

ВЛИЯНИЕ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

SPIROPLASMA CITRI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Bove, Joseph M.; Renaudin, Joel


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.09-04Б2.133

   

    Short-homology-independent illegitimate recombination in Escherichia coli: Distinct mechanism from short-homology-dependent illegitimate recombination [Text] / Hatsushi Shimizu [et al.] // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 266, N 2. - P297-305 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Не зависящая от короткой гомологии незаконная рекомбинация у Escherichia coli: механизм, отличающийся от зависящей от короткой гомологии незаконной рекомбинации
Аннотация: Выделен температурочувствительный мутант gyr Ahr1 по субъединице А ДНК-гиразы (I) Escherichia coli, у к-рого повышена частота спонтанной незаконной рекомбинации (НР) и наблюдается спонтанная индукция профага 'лямбда'. Высказано предположение, что мутация вызывает образование в хромосоме разрывов, стимулирующих НР. Анализ рекомбинац. стыков у трансдуцирующих фагов 'лямбда'bio, спонтанно образовавшихся в мутанте gyr Ahr1, показал, что сайты НР в гене bio и в ДНК 'лямбда' имеют среднюю длину участка гомологии всего 1,3 п. н. В клетках дикого типа стыки фагов 'лямбда'bio имеют среднюю длину области гомологии 8,4 п. н. Т. обр. НР в мутанте gyr Ahr1 отличается от НР в клетках дикого типа. После УФ-облучения мутанта gyr Ahr1 в стыках также обнаружена очень короткая гомология. Предложена модель НР, не зависящей от короткой гомологии и опосредованной обменом субъединицами между I. Япония, Dep. of Molecular Biol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo, Tokyo 108. Библ. 28
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ФЕРМЕНТЫ

ДНК-ГИРАЗА

СУБЪЕДИНИЦА A

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Shimizu, Hatsushi; Yamaguchi, Hirotaka; Ashizawa, Yuki; Kohno, Yuko; Asami, Mihoko; Kato, Jun-ichi; Ikeda, Hideo


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.211

   

    Photooxidative stress stimulates illegitimate recombination and mutability in carotenoid-less mutants of Rubrivivax gelatinosus [Text] / Soufian Ouchane [et al.] // EMBO Journal. - 1997. - Vol. 16, N 15. - P4777-4787 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Фотоокислительный стресс стимулирует незаконную рекомбинацию и мутабельность у не имеющих каротиноидов мутантов Rubrivivax gelatinosus
Аннотация: Сконструированы мутанты Rubrivivax gelatinosus с разрушением гена crtB, не образующие каротиноиды (I). Изучено влияние фотоокислительного стресса (ФОС) на клетки дикого типа, мутанты crtB и мутанты crtC и crtD, синтезирующие промежуточные продукты биосинтеза I. Только у мутантов crtB ФОС вызывает появление с высокой частотой 4 классов мутантов: 1) с частичным восстановлением синтеза I; 2) дефектных по фотосинтезу; 3) с пониженным уровнем антенн LH1; 4) с ингибированием синтеза фотосинтетич. аппарата только в условиях оэробиоза. Молекулярный анализ показал, что ФОС индуцирует мутации и незаконную рекомбинацию, приводящую к образованию функциональных или нефункциональных химерных генов. Франция, Centre de Genetique Moleculaire du CNRS, 91198 Gif sur Yvette. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

АКТИВАЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

ФОТООКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС

ГЕНЫ

ГЕН СИНТЕЗА КАРАТИНОИДОВ CRTB

ФУНКЦИЯ

RUBRIVIVAX GELATINOSUS


Доп.точки доступа:
Ouchane, Soufian; Picaud, Martine; Vernotte, Claudie; Astier, Chantal


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.214

   

    An unusual illegitimate recombination occurs in the linear-plasmid-encoded outer-surface protein A gene of Borrelia afzelii [Text] / Jianhui Wang [et al.] // Microbiology. - 1997. - Vol. 143, N 12. - P3819-3825 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Необычная незаконная рекомбинация происходит в кодируемом линейной плазмидой гене белка А внешней поверхности Borrelia afzelii
Аннотация: Из пациента с хронич. болезнью Лайма выделен мутант Borrelia afzelii, у к-рого произошла необычная незаконная рекомбинация в плазмидном гене ompA белка А внешней поверхности, вызвавшая делецию сегмента длиной 96 п. н. Природа перестройки позволяет предположить, что она произошла по механизму проскальзывания нити, стимулированной палиндромом (18 п. н.) и короткими прямыми повторами (5 п. н.) на обоих концах делетированной ДНК. Делетированная последовательность может образовывать сложную шпилечную структуру. Высказано предположение, что эта структура может играть важную роль в задержке репликации и проскальзывании вновь синтезированной нити ДНК через репликативную вилку. Япония, Dept. of Microbiol., School of Pharmacentical Sci., Univ. of Shizuoka, Shizuoka 422. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: ПЛАЗМИДНЫЕ ГЕНЫ
ГЕН БЕЛКА ОБОЛОЧКИ OMPA

СТРУКТУРА

МУТАЦИИ

МУТАЦИЯ В ГЕНЕ БЕЛКА ОБОЛОЧКИ OMPA

ВОЗНИКНОВЕНИЕ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ХАРАКТЕРИСТИКА

BORRELIA AFZELII (BACT.)


Доп.точки доступа:
Wang, Jianhui; Masuzawa, Toshiyuki; Li, Miqing; Yanagihara, Yasutake


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.346

    Ukita, Toshiyuki.

    Role of the recJ gene product in UV-induced illegitimate recombination at the hotspot [Text] / Toshiyuki Ukita, Hideo Ikeda // J. Bacteriol. - 1996. - Vol. 178, N 8. - P2362-2367 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Роль продукта гена recJ в УФ-индуцированной незаконной рекомбинации в горячей точке
Аннотация: Незаконная рекомбинация (НР) между профагом и смежной бактериальной ДНК в горячей точке является первым шагом в образовании специализированных трансдуцирующих фагов (СТФ). Такая НР значительно стимулируется УФ-облучением клеток. Показано, что мутация recJ у Escherichia coli понижает частоту образования УФ-индуцированных СТФ 'лямбда'bio в 3-10 раз. Кроме того, горячая точка НР, ответственная за 60% СТФ 'лямбда'bio в клетках дикого типа, отсутствует в мутанте recJ. Введение в мутант recJ плазмиды, гиперпродуцирующей белок RecJ (I), восстанавливает НР в горячей точке. Эти данные показали, что I преимущественно стимулирует НР в горячей точке. Горячая точка НР и негорячие сайты имеют короткие участки гомологии, но только горячая точка содержит общие прямые повторы. Для объяснения участия I в НР в горячей точке предложена модель, учитывающая (5{|"}'-'3{|"})-экзонуклеазную активность I. Япония, Dep. of Molecular Biol., Inst. of Med. Sci., Univ. of Tokyo 108. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.07
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛОК НЕЗАКОННОЙ РЕКОМБИНАЦИИ RECJ

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Ikeda, Hideo


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.214

    Глазер, В. М.

    Генетическая рекомбинация без гомологии: процессы, ведущие к перестройкам в геноме [Текст] / В. М. Глазер // Сорос. образ. ж. - 1998. - N 7. - С. 22-29
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.07
Рубрики: ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ
САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ТРАНСПОЗИЦИИ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ГЕНОМНЫЕ ПЕРЕСТРОЙКИ

МЕХАНИЗМЫ

ПРОКАРИОТЫ

ФАГИ

ЭУКАРИОТЫ

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 4



9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 00.12-04Б1.148

    Mosig, Gisela.

    Several new bacteriophage T4 genes, mapped by sequencing deletion endpoints between genes 56 (dCTPase) and dda (a DNA-dependent ATPase-helicase) modulate transcription [Text] / Gisela Mosig, Nancy E. Colowick, Bradley C. Pietz // Gene. - 1998. - Vol. 223, N 1-2. - P143-155 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Несколько новых генов бактериофага Т4, картированных секвенированием концевых точек делеций между генами 56 (дСТФаза) и dda (ДНК-зависимая АТФаза-геликаза), модулируют транскрипцию
Аннотация: Изучена ДНК 13 независимых жизнеспособных мутантов фага Т4 с большими делециями, к-рые образовались в результате незаконной рекомбинации между короткими (4-15 п. н.) эктопич. повторами. Последовательность 5'-ГГГЦ встретилась в 3 повторах и еще рядом с 4 повторами. 5 ранее известных генов (69, soc, mrh, modA и dda) картированы относительно концевых точек делеций. Между ними обнаружены еще 9 дополнительных открытых рамок считывания (ОРС). Одна из ОРС похожа на ген mrh (модуляция rpoH), в вторая на ген modA (АДФ-рибозилтрансфераза, модулирующая 'альфа'-субъединицу РНК-полимеразы). Показано, что клеточный 'сигма'-фактор теплового шока 'сигма'{32} фосфорилирован и что эта модификация модулируется белком Mrh. ОРС dda.9 с 3'-стороны от гена mrh, имеющая частичную гомологию с C-концевым мотивом 'сигма'{32}, названа srh. ОРС dda.2, расположенная между modA и dda и гомологичная 'сигма'{70}, названа srd. Высказано предположение, что белки Srh и Srd действуют как приманки для 'сигма'{32} и 'сигма'{70} соотв. Экспрессия нескольких ОРС токсична для Escherichia coli. Из гена 69 и из modA могут быть сконструированы только мутантные клоны. Клоны, несущие ОРС dda.2 (srd), растут очень медленно и образуют филаменты. Клоны, содержащие mrh и srh, проявляет менее сильную филаментацию. США, Dep. Mol. Biol., Vanderbilt Univ., Nashville, TN 37235. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: ДЕЛЕЦИИ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ГЕНЫ

69

SOC

MRH

MODA

DDA

КАРТИРОВАНИЕ

ВЛИЯНИЕ НА

ТРАНСКРИПЦИЯ

БАКТЕРИОФАГИ

ФАГ Т4


Доп.точки доступа:
Colowick, Nancy E.; Pietz, Bradley C.


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.314

   

    Photooxidative stress stimulates illegitimate recombination and mutability in carotenoid-less mutants of Rubrivivax gelatinosus [Text] / S. Ouchane [et al.] // 9th Int. Symp. Phototroph. Prokaryotes, Vienna, Sept. 6-12, 1997. - [Vienna], 1997. - P151
Перевод заглавия: Фотоокислительный стресс стимулирует незаконную рекомбинацию и мутабильность у лишенных каротеноидов мутантов Rubrivivax gelatinosus
Аннотация: В условиях фотоокислительного стресса мутант crtB Rubrivivax gelatinosus, лишенный каротеноидов, с высокой частотой (10{-3}) дает 4 класса спонтанных мутантов: 1) с частичным восстановлением биосинтеза каротеноидов; 2) с понижением количества комплексов LHI; 3) с дефектом по фотосинтезу; 4) с ингибированием синтеза фотосинтетического аппарата только в условиях анаэробиоза. Молекулярный анализ показал, что в отсутствие защитного действия каротеноидов фотоокислительные повреждения индуцируют мутации и незаконную рекомбинацию, порождающую функциональные или нефункциональные гены. Франция, CGM, CNRS, 91191 Gif-sur-Yvette. Библ. 3
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: ФОТООКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС
ВЛИЯНИЕ НА

МУТАЦИИ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ИДУКЦИЯ

МУТАНТЫ ПО КАРОТЕНОИДАМ

RUBRIVIVAX GELATINOSUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Ouchane, S.; Picaud, M.; Vernotte, C.; Astier, C.


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.346

    Cormack, Brendan P.

    Efficient homologous and illegitimate recombination in the opportunistic yeast pathogen Candida glabrata [Text] / Brendan P. Cormack, Stanley Falkow // Genetics. - 1999. - Vol. 151, N 3. - P979-987 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Эффективная гомологическая и незаконная рекомбинация у оппортунистического дрожжевого патогена Candida glabrata
Аннотация: Сконструированы ауксотрофные мутанты клинического изолята Candida glabrata с дефектами хромосомных генов ura3 или his3. Линеаризированные плазмиды с геном URA3 Saccharomyces cerevisiae эффективно трансформируют мутант ura3 к прототрофности. Если эти плазмиды содержат короткие концевые области гомологии с хромосомой C. glabrata, наблюдается гомологическая рекомбинация. В отсутствие гомологии с хромосомой плазмиды интегрируются по механизму незаконной рекомбинации в случайные сайты генома. Секвенирование показало, что у большинства незаконных рекомбинантов отсутствует микрогомология в сайтах интеграции. Около 0,25% вставок приводит к ауксотрофности по аминокислотам. Секвенирование позволило предположить, что незаконная рекомбинация является неслучайной на уровне одного гена и что интегрирующаяся плазмида предпочитает встраиваться в некодирующие области генома. Сравнение числа событий гомологической и незаконной рекомбинации показало, что C. glabrata имеет эффективные системы как гомологической, так и незаконной рекомбинации. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5402. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.25.03
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ

ВСТРАИВАЕМЫЕ ГЕНЫ

ГОМОЛОГИЯ

ФУНКЦИЯ

CANDIDA GLABRATA (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Falkow, Stanley


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.12-04В2.399

    Cormack, Brendan P.

    Efficient homologous and illegitimate recombination in the opportunistic yeast pathogen Candida glabrata [Text] / Brendan P. Cormack, Stanley Falkow // Genetics. - 1999. - Vol. 151, N 3. - P979-987 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Эффективная гомологическая и незаконная рекомбинация у оппортунистического дрожжевого патогена Candida glabrata
Аннотация: Сконструированы ауксотрофные мутанты клинического изолята Candida glabrata с дефектами хромосомных генов ura3 или his3. Линеаризированные плазмиды с геном URA3 Saccharomyces cerevisiae эффективно трансформируют мутант ura3 к прототрофности. Если эти плазмиды содержат короткие концевые области гомологии с хромосомой C. glabrata, наблюдается гомологическая рекомбинация. В отсутствие гомологии с хромосомой плазмиды интегрируются по механизму незаконной рекомбинации в случайные сайты генома. Секвенирование показало, что у большинства незаконных рекомбинантов отсутствует микрогомология в сайтах интеграции. Около 0,25% вставок приводит к ауксотрофности по аминокислотам. Секвенирование позволило предположить, что незаконная рекомбинация является неслучайной на уровне одного гена и что интегрирующаяся плазмида предпочитает встраиваться в некодирующие области генома. Сравнение числа событий гомологической и незаконной рекомбинации показало, что C. glabrata имеет эффективные системы как гомологической, так и незаконной рекомбинации. США, Dep. Microbiol. and Immunol., Stanford Univ. Sch. Med., Stanford, CA 94305-5402. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

САЙТЫ РЕКОМБИНАЦИИ

ВСТРАИВАЕМЫЕ ГЕНЫ

ГОМОЛОГИЯ

ФУНКЦИЯ

CANDIDA GLABRATA (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Falkow, Stanley


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.06-04Б1.151

   

    Genomic sequences of bacteriophages HK97 and HK022: Pervasive genetic mosaicism in the lambdoid bacteriophages [Text] / Robert J. Juhala [et al.] // J. Mol. Biol. - 2000. - Vol. 299, N 1. - P27-51 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Геномные последовательности бактериофагов HK97 и HK022: широко распространенный генетический мозаицизм у лямбдоидных бактериофагов
Аннотация: Определены полные последовательности геномных днДНК фагов HK97 (39 732 п. н.) и HK022 (40 751 п. н.) Escherichia coli - членов лямбдоидной группы фагов. Сравнение этих последовательностей друг с другом и с фагами 'лямбда' E. coli и P22 Salmonella typhimurium подтвердило, что эти фаги являются генетич. мозаиками, у к-рых мозаичные сегменты разделены резкими переходами в последовательности. Это доказало, что главным компонентом эволюции лямбдоидных фагов является горизонтальный перенос генетич. материала. Предложена модель эволюции, в к-рой генетич. разнообразие порождается сочетанием незаконной и гомологич. рекомбинации и мутационного сдвига, а селекция по ф-циям порождает популяцию, в к-рой большинство выживающих мозаичных границ расположено на границах генов и иногда на границах белковых доменов в генах. Сравнительный анализ позволил приписать ф-ции генам и др. генетич. элементам. Приведены примеры генов общей рекомбинации фагов HK97, HK022 и P22 и предполагаемого белка-адаптора головки и хвостового отростка фагов HK97 и HK022. Сравнительный анализ позволил идентифицировать новый класс элементов - "мороны", к-рые состоят из кодирующей белок области, фланкированной промоторами типа 'сигма'{70} и не зависящим от факторов терминатором транскрипции. Все мороны расположены между 2 генами, к-рые являются смежными у других фагов. Мороны, вероятно, являются автономными генетич. модулями, к-рые экспрессируются из внутриклеточных профагов. Сравнение последовательностей моронов позволило предположить, что они сравнительно недавно вошли в фаговые геномы по механизму горизонтального переноса. США, Dep. Biol. Studies, Univ. Pittsburgh, Pittsburgh, PA 15260. Библ. 66
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ЛЯМБДОИДНЫЙ ФАГ HK97

ЛЯМБДОИДНЫЙ ФАГ HK022

ГЕНОМНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МАЗАИЦИЗМ

ЭВОЛЮЦИЯ

ФАГ ЛЯМБДА

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС ГЕНОВ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Juhala, Robert J.; Ford, Michael E.; Duda, Robert L.; Youlton, Anthony; Hatfull, Graham F.; Hendrix, Roger W.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.167

   

    Evidence for horizontal tranfer of SsuDAT1I restriction-modification genes to the Streptococcus suis genome [Text] / Tsutomu Sekizaki [et al.] // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 2. - P500-511 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Доказательство горизонтального переноса генов рестрикции-модификации SsuDAT1I в геном Streptococcus suis
Аннотация: Штаммы Streptococcus suis серотипов 1 и 2, выделенные от свиней, различаются наличием системы рестрикции-модификации (РМС), изошизомера РМС DpnII S. pneumoniae, узнающей сайт 5{'}-GATC-3{'}. Секвенирование генов, кодирующих РМС S. suis DATI, названную SsuDAT1I, показало, что в эту систему входят гены 2 метилтрансфераз, ssuMA и ssuMB, как и в РМС DpnII. Аминокислотные последовательности (ПС) M.SsuMA и M.SsuMB на 70 и 90% идентичны ПС M.DpnII и M.DpnA соотв. Однако РМС SsuDAT1I содержит гены 2 рестриктаз - изошизомеров, ssuRA и ssuRB. Аминокислотные ПС R.SsuRA и R.SsuRB на 49 и 72% идентичны ПС R. Dpn1I и R.LlaDCHI Lactococcus lactis subsp. cremoris DCH-4 соотв. Гены SsuDAT1I перекрываются и окружены генами биосинтеза пуринов: purF-purM-purN-purH-ssuMA-ssuMB-ssuRA-ssuRB-purD-purE. GC-состав в области генов SsuDAT1I (34,1%) ниже, чем в области генов pur (48,9%), что указывает на горизонтальный перенос генов системы SsuDAT1I. Во фланкирующих ПС не найдены длинные концевые повторы или транспозоны. Сравнение ПС генов ssuDAT показало, что только ПС от 53 п. н. выше гена ssuMA до 5 п. н. ниже ssuRB встроилась между генами purH и purD, причем сайт инсерции не является сайтом узнавания SsuDAT1I. Предполагается, что система SsuDAT1I могла интегрироваться в хромосому S. suis посредством незаконной рекомбинации. Япония, Lab. Molec. Bacteriol., Nat. Inst. Animal Hlth, 3-1-1 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856. Библ. 60
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
СИСТЕМА SSUDAT1I

ГЕНЫ

ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС

STREPTOCOCCUS SUIS (BACT.)

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ


Доп.точки доступа:
Sekizaki, Tsutomu; Otani, Yoshiko; Osaki, Makoto; Takamatsu, Daisuke; Shimoji, Yoshihiro


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.233

   

    UvrA and UvrB suppress illegitimate recombination: Synergistic action with RecQ helicase [Text] / Katsuhiro Hanada [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2000. - Vol. 97, N 11. - P5989-5994 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Белки UvrA и UvrB подавляют незаконную рекомбинацию: синергичное действие с геликазой RecQ
Аннотация: Показано, что УФ-индуцированная незаконная рекомбинация (НР) у Escherichia coli усиливается мутациями в генах нуклеотидной эксцизионной репарации uvrA и uvrB и в меньшей степени uvrC, но не мутацией uvrD. Двойная мутация uvrA и uvrB, но двойная мутация uvrB uvrC, повышает частоту НР даже в отсутствие УФ-облучения. Это позволило предположить, что НР подавляется белками UvrA (I) и UvrB (II). НР синергично усиливается двойной мутацией recQ uvrA. Гиперпродукция I устраняет фенотип НР у мутантов recQ и uvrB, но не влияет на УФ-чувствительность мутанта uvrB. Эти данные позволили предположить, что комплекс I-II подавляет НР по пути, в к-ром участвует геликаза RecQ. Один I может устранять НР по этому пути. Обсуждаются возможные ф-ции белков, участвующих в этих путях НР. Япония, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, Tokyo 108-8639. Библ. 25
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.07
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛКИ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ UVRAB

ФУНКЦИЯ

ФЕРМЕНТЫ

ГЕЛИКАЗА RECQ

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hanada, Katsuhiro; Iwasaki, Mihoko; Ihashi, Sonoe; Ikeda, Hideo


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI08) 07.06-04Я6.107

   

    Ингибирование ДНК-топоизомеразы II в живых клетках стимулирует процесс незаконной рекомбинации [Текст] / О. Н. Уманская [и др.] // Докл. РАН. - 2005. - Т. 405, N 3. - С. 419-421 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: Разработана и апробирована тест-система, позволяющая отследить рекомбинационные события, а также определить их частоту. С помощью такой системы изучалось влияние ингибитора ДНК-топоизомеразы II тенипозида на незаконную рекомбинацию. При индукции незаконной рекомбинации топоизомеразой II в минимальной in vitro системе рекомбинационных событий обнаружено не было. В живых клетках ингибирование топоизомеразы II тенипозидом значительно увеличивало частоту незаконной рекомбинации. Эти данные интерпретированы как свидетельство того, что основная часть всех перестроек под действием ингибиторов топоизомеразы II в живых клетках происходит по "индукционному" механизму, согласно которому топоизомераза II только вносит двухцепочечные разрывы в ДНК, в то время как их репарация происходит под действием других клеточных систем. Россия, Ин-т биол. гена РАН, Москва. Библ. 8
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.19.19.11.03.09
Рубрики: ДНК-ТОПОИЗОМЕРАЗА II
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ЖИВЫЕ КЛЕТКИ

ТЕСТ-СИСТЕМА


Доп.точки доступа:
Уманская, О.Н.; Юдинкова, Е.С.; Разин, С.В.; Быстрицкий, А.А.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI36) 11.04-04А4.11

   

    Some unsolved problems and unresolved issues in radiation cytogenetics. A review and new data on roles of homologous recombination and non-homologous end joining [Text] / Hatsumi Nagasawa [et al.] // Mutat. Res. Genet. Toxicol. and Environ. Mutagen. - 2010. - Vol. 701, N 1. - P12-22 . - ISSN 1383-5718
Перевод заглавия: Некоторые нерешенные проблемы и неразрешенные вопросы радиационной цитогенетики: обзор новых данных о гомологичной рекомбинаии и соединении негомологичных концов [ДНК]
Аннотация: В историческом аспекте рассмотрены следующие вопросы: 1) повреждения и процессы, влияющие на появление хроматидных и(или) хромосомных аберраций после облучения; 2) процесс воссоединения двунитевых разрывов ДНК и воссоединение разрывов либо образование обменов; 3) роль процесса гомологичной рекомбинационной репарации в защите клеток от индукции аберраций хроматидного типа при облучении в поздней S/G2 фазе; 4) роль структуры интерфазного хроматина в организации ядра и индукции аберраций; 5) реакция клеток на индукцию аберраций в зависимости от типа ткани, к которой они принадлежат; 6) подходы к определению "скрытых" аберраций
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.49.19.15.49
Рубрики: АБЕРРАЦИИ ХРОМОСОМ
МЕХАНИЗМ ОБРАЗОВАНИЯ

ДНК

РЕПАРАЦИЯ

ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ОБЗОРЫ


Доп.точки доступа:
Nagasawa, Hatsumi; Brogan, John R.; Peng, Yuanlin; Little, John B.; Bedford, Joel S.


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.02-04Б2.310

    Yi, Tau-Mu.

    Illegitimate recombination in an Escherichia coli plasmid: modulation by DNA damage and a new bacterial gene [Text] / Tau-Mu Yi, Duncan Tearns, Bruce Demple // J. Bacteriol. - 1988. - Vol. 170, N 7. - P2898-2903
Перевод заглавия: Незаконная рекомбинация в плазмиде Escherichia coli. Модуляция посредством изменения ДНК и новый бактериальный ген
Аннотация: Исследовали перестройки в ДНК E. coli, используя плазмиду с "молчащим" геном tet. Отбирали Tet{r}-мутанты. Наиболее частым изменением, приводящим к восстановлению Tet{r}-фенотипа, была делеция в 1,3 т. н. п. между 2 сайтами с частичной гомологией (14 из 19 н. п. идентичны). Такие делеции возникали с одинаковой частотой в штамме recA+ и мутанте recA13. При действии ультрафиолета частота появления Tet{r}-мутантов возрастала в 50 раз. Делеция в области xth - pnc (1,3 т. н. п.) в хромосоме значительно увеличивала частоту появлениTet{r}-Кл. Это увеличение исчезало при введении в Кл эписомы, содержащей xth - pnc, но не изменялось при клонировании гена xth. Эти результаты позволяют судить о значении разных изменений ДНК для "незаконной" рекомбинации и идентифицировать участок хромосомы E. coli, содержащий гены, продукты которых супрессируют незаконные делеции. Ил. 3. Табл. 3. Библ. 35. США, Dep. of Biochemistry and Molecular Biology, Harvard Univ., Cambridge, MA 02138.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ДНК ПОВРЕЖДЕНИЯ

ОБЛАСТЬ XTH - PNC

ВЛИЯНИЕ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ПЛАЗМИДНЫЙ МОЛЧАЩИЙ ГЕН TET

БЕСПРОМОТОРНЫЙ ГЕН


Доп.точки доступа:
Tearns, Duncan; Demple, Bruce


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.05-04Б2.449

    Bien, M.

    Repair of the plasmid pBR322 damaged by 'гамма'-irradiation or by restriction endonucleases using different recombination-proficient E. coli strains [Text] / M. Bien, H. Steffen, D. Schulte-Frohlinde // Mutat. Res. DNA Repair Repts. - 1988. - Vol. 194, N 3. - P193-205 . - ISSN 0167-8817
Перевод заглавия: Репарация плазмиды pBR322, поврежденной 'гамма'облучением или рестрикционными эндонуклеазами, с использованием различных рекомбинационно-способных штаммов E. coli
Аннотация: ДНК плазмиды pBR322 обрабатывали рестриктазами BamHI, PvuII или 'гамма'-облучением для образования двунитевых разрывов со структурно различающимися концами и проводили сравнение данных об эффективности трансформирующей способности, частоте образования мутаций и клонального анализа в случае ферментативно и радиолитически поврежденных ДНК. Выявлено, что в рекомбинационно-дефектном (recBO} шт. E. coli K-12 SFX выход трансформантов при использовании препаратов ДНК, обработанных BamHI, PvuII либо 'гамма'-лучами составлял соотв. 4,3%, 0,14% и 0,1%. Выживаемость открытых кольцевых форм ДНК при облучении в дозе 30 Gy составляла 1,3%. Эффективность трансформации лишь слабо заисела от SOS-индукции и белка RecA. Частота мутаций по признаку чувствительности к тетрациклину (tet{s}) в расчете на выжившую плазмиду составляла 2,6%, 11,8% и 0,2% в случае обработки BamHI, PvuII или 'гамма'-лучами в дозе 30 Gy соответственно. Отмечено, что во всем исследованном диапазоне доз (от 1 до 30 Gy) облучение слабо индуцировало мутации. При этом лишь 15% мутантов tet{s}, образованных 'гамма'-облученными плазмидами содержало делеции, тогда как процент делеций в случае испытания на частоту мутагенеза ДНК, обработанной BamHI или PvuII составлял 30-50 и 90% соотв. Во всех случаях делеции имели протяженность 500-1700 п. н. При SOS-индукции частота мутагенеза 'гамма'-облученной плазмиды увеличивалась в 4 раза, а обработанной рестриктазами не изменялась. Предполагается, что репарация ферментативно линеаризованной ДНК осуществляется с помощью двух рекомбинационных путей, а репарация облученной ДНК связана с механизмом эксцизии повреждений. Библ. 46. ФРГ, Max-Planck-Institut fur Strahlenchemie, Stifstr. 34-36, D4300 Mulheim a. d. Ruhr.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.13.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММЫ СПОСОБНЫЕ К РЕКОМБИНАЦИИ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ДНК ПЛАЗМИДНАЯ

ДНК ЛИАНОРИЗОВАННАЯ

УФ-ОБЛУЧЕННАЯ ДНК

ДНК ПОВРЕЖДЕНИЯ

ДВУНИТЕВЫЕ РАЗРЫВЫ

ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ

РЕПАРАЦИЯ

МЕХАНИЗМЫ


Доп.точки доступа:
Steffen, H.; Schulte-Frohlinde, D.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.269

    Bashkirov, V. I.

    Illegitimate recombination and amplification in Bacillus subtilis [Text] / V. I. Bashkirov // Biol. Zbl. - 1988. - Vol. 107, N 6. - P682-684 . - ISSN 0006-3304
Перевод заглавия: Незаконная рекомбинация и амплификация у Bacillus subtilis
Аннотация: Исследована интеграция плазмиды pGG20, являющейся гибридом pE194 и pBR322, в хромосому Bacillus subtilis. Секвенирование ДНК в сайтах рекомбинации выявило присутствие гомологичной последовательности из 8 п. н. в pBR322 и участке хромосомы клона b2, в к-рых произошла встройка pGG20. В случае 2 других клонов, b1 и b5, в к-рых гибридная плазмида встроилась по сайтам, локализованным в pE194, не обнаружено гомологии между этими сайтами и хромосомой. Показано также, что pGG20 и pE194 могут не только интегрировать в хромосому, но и не родственную плазмиду pUB110 с помощью recE-независимого процесса, приводящего к образованию коинтегратов. Секвенирование ДНК в области стыка рекомбинирующих молекул выявило, что рекомбинация происходит в пределах коротких (9-15 п. н.) участков гомологии, присутствующих у взаимодействующих плазмид. Однако в случае коинтеграта, обозначенного t542, рекомбинация произошла между негомологичными сайтами. Предполагается, что в подобный процесс незаконной рекомбинации вовлечена пока неидентифицированная рекомбиназа B. subtilis. По отбору клонов с повышенной устойчивостью к хлорамфениколу исследована возможность амплификации последовательностей, интегрировавших хромосому через иную гибридную плазмиду, rep-ts, образованную путем рекомбинации между pE194 и pC194. Обнаружены 2 амплифицированные структуры. Одна из них амплифицирована в сайтах стыка одиночной копии плазмиды с хромосомой, а другая - в сайтах, локализованных внутри плазмиды и соответствующего участка хромосомы. Предполагается, что в амплификацию 2-ого типа вовлечены инвертированные повторы. Библ. 36. СССР, Ин-т общей генетики им. Н. И. Вавилова АН СССР, Москва В-333.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.07
Рубрики: ПЛАЗМИДА PGG20
ИНТЕГРАЦИЯ

НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

ХРОМОСОМА

BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

АМПЛИФИКАЦИЯ

ИНТЕГРИРОВАННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ



 1-20    21-26 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)