Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=PFGE<.>)
Общее количество найденных документов : 49
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-49 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.10-04Б4.181

   

    A cluster of culture positive gonococcal infections but with false negative cppB gene based PCR [Text] / G. Lum [et al.] // Sex. Transmitt. Infec. - 2005. - Vol. 81, N 5. - P400-402 . - ISSN 1368-4973
Перевод заглавия: Кластер гонококковых инфекций, тестированных позитивно культуральным методом и негативного - с помощью ПЦР на основе гена cppB
Аннотация: Гонококки, изолированные из образцов мочи, фенотипировали методом определения класса ауксотип/серовар (A/S), генотипировали методом PFGE и методом амплификации нуклеиновых кислот (NAA) на основе гена cppB и на основе других генов. Показали, что 14 из 143 изолятов относятся к классу A/S pro{-}/Brpyut, неразличимы с помощью PFGE и негативны по гену cppB, но не по другим генам - мишеням NAA. Предположили, что данный кластер представляет временную и географическую экспансию субтипа гонококков, не имеющих гена cppB. Тест на основе NAA с мишенным геном cppB рассматривается как дополнительный к культуральному при диагностике гонорреи. Австралия, Dep. of Microbiology, The Prince of Wales Hospital, Randwick, New south Wales. Библ. 16
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.25.08
Рубрики: ГОНОКОККИ
ИЗОЛИРОВАНИЕ

МОЧА

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

СЕРОВАР A/S

МЕТОДЫ

PFGE

МЕТОД АМПЛИФИКАЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

ГЕН CPPB

ГОНОРЕЯ

ДИАГНОСТИКА ПОЗИТИВНАЯ

КУЛЬТУРАЛЬНЫЙ МЕТОД


Доп.точки доступа:
Lum, G.; Freeman, K.; Nguyen, N.L.; Limnios, E.A.; Tabrizi, S.N.; Carter, I.; Chambers, I.W.; Whiley, D.M.; Sloots, T.P.; Garland, S.M.; Tapsall, J.W.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.11-04Б2.245

   

    A polyphasic approach to assessing genetic diveristy among Xanthomonas campestris pv. campestris strains using PFGE, AFLP, Rep-PCR and integron gene cassette PCR [Text] / Angel Valverde [et al.] // Phytoparasitica. - 2006. - Vol. 34, N 3. - P297 . - ISSN 0334-2123
Перевод заглавия: Полифазный подход для оценки генетического разнообразия среди штаммов Xanthomonas campestris pv. campestris при использовании PFGE, AFLP, rep-ПЦР и ПЦР на основе интегронной генной кассеты
Аннотация: Исследовали генетическое разнообразие двадцати двух различных штаммов Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) с помощью трех методов молекулярного типирования: PFGE, AFLP и rep-ПЦР. В соответствии с использованными методами исследованные штаммы разделили на 11, 12 и 13 различных типов паттернов. Паттерны ПЦР, полученные с интегрон-специфичными праймерами подтвердили относительно высокое разнообразие среди штаммов исследованного патовара относительно других патоваров X. campestris. Для оценки корреляции генетической структуры различных штаммов X. campestris и их фитопатогенностью требуется провести дальнейшие исследования. Израиль, Dep. of Entomology, Nematology Unit, ARO, The Volcani Center, Bet Dagan
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: XANTHOMONAS CAMPESTRIS (BACT.)
PV. CAMPESTRIS

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ

МЕТОДЫ

PFGE

AFLP

REP-ПЦР

ПЦР НА ОСНОВЕ ИНТЕГРОННОЙ ГЕННОЙ КАССЕТЫ


Доп.точки доступа:
Valverde, Angel; Hubert, T.; Stolov, A.; Dagar, A.; Kopelowitz, J.; Burdman, S.


3.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI04) 07.12-04В5.134

   

    A polyphasic approach to assessing genetic diveristy among Xanthomonas campestris pv. campestris strains using PFGE, AFLP, Rep-PCR and integron gene cassette PCR [Text] / Angel Valverde [et al.] // Phytoparasitica. - 2006. - Vol. 34, N 3. - P297 . - ISSN 0334-2123
Перевод заглавия: Полифазный подход для оценки генетического разнообразия среди штаммов Xanthomonas campestris pv. campestris при использовании PFGE, AFLP, rep-ПЦР и ПЦР на основе интегронной генной кассеты
Аннотация: Исследовали генетическое разнообразие двадцати двух различных штаммов Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) с помощью трех методов молекулярного типирования: PFGE, AFLP и rep-ПЦР. В соответствии с использованными методами исследованные штаммы разделили на 11, 12 и 13 различных типов паттернов. Паттерны ПЦР, полученные с интегрон-специфичными праймерами подтвердили относительно высокое разнообразие среди штаммов исследованного патовара относительно других патоваров X. campestris. Для оценки корреляции генетической структуры различных штаммов X. campestris и их фитопатогенностью требуется провести дальнейшие исследования. Израиль, Dep. of Entomology, Nematology Unit, ARO, The Volcani Center, Bet Dagan
ГРНТИ  
ВИНИТИ 681.37.31.17.02
Рубрики: XANTHOMONAS CAMPESTRIS (BACT.)
PV. CAMPESTRIS

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ

МЕТОДЫ

PFGE

AFLP

REP-ПЦР

ПЦР НА ОСНОВЕ ИНТЕГРОННОЙ ГЕННОЙ КАССЕТЫ


Доп.точки доступа:
Valverde, Angel; Hubert, T.; Stolov, A.; Dagar, A.; Kopelowitz, J.; Burdman, S.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.150

   

    A regional outbreak of S. Typhimurium in Denmark and identification of the source using MLVA typing [Text] / M. Torpdahl [et al.] // Eurosurveillance. - 2006. - Vol. 11, N 4-6. - P134-136 . - ISSN 1025-496X
Перевод заглавия: Региональная вспышка заболевания, вызванная S. typhimurium, в Дании и идентификация источника с использованием MLVA типирования
Аннотация: В Дании в рамках национальной системы контроля кишечных инфекций человека все изоляты Salmonella typhimurium в настоящее время субтипируются, используя фаготипирование, антибиограмное типирование и PFGE. Однако различающаяся способность PFGE не всегда достаточно высока для установления различий между определенными фаготипами и не всегда можно отделить имеющие и не имеющие отношения изоляты. Поэтому с 2004 г. для контрольного типирования S. typhimurium применяется MLVA. В мае-июне 2005 г. методом MLVA было идентифицировано 26 случаев инфекции, вызванной S. typhimurium. Изоляты были полностью чувствительными и имели один из наиболее часто встречающихся в Дании фаготипов (DT 12) и PFGE типов. Используя методы MLVA и PFGE проведено сравнение изолятов S. typhimurium DT 12 от рутинного контроля животных и пищевых продуктов для сравнения с изолятами от людей. Результаты типирования показали, что изоляты от свиного стада и соответствующей скотобойни, расположенной в районе, где произошла вспышка заболевания, имели те же MLVA и PFGE типы, что и изоляты от людей. В противоположность этому у всех других исследованных изолятов DT 12, имевших тот же профиль PFGE, были другие MLVA типы. Заключение о том, что свиное стадо являлось источником инфекции людей, было подтверждено информацией от пациентов. Сделан вывод, что MLVA может вносить существенный вклад в контроль и исследование вспышек заболеваний, вызванных S. typhimurium, так как без типирования методом MLVA эта вспышка могла быть не определена или ее происхождение могло остаться не отслеженным. Дания, Statens Serum Inst. Dep. of Bacteriology, Mycology & Parasitology, Copenhagen. Библ. 10
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.59 + 761.03.43.05.07
Рубрики: ИНФЕКЦИИ
КИШЕЧНЫЕ

ВСПЫШКИ

ЧЕЛОВЕК

КОНТРОЛЬ

ДАНИЯ

SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)

СУБТИПИРОВАНИЕ

ИЗОЛЯТЫ

ЖИВОТНЫЕ

ПИЩЕВЫЕ ПРОДУКТЫ

МЕТОДЫ

MLVA

PFGE


Доп.точки доступа:
Torpdahl, M.; Sorensen, G.; Ethelberg, S.; Sando, G.; Gammelgard, K.; Porsbo, L.J.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 98.10-04Б4.148

   

    Combined use of ribotyping, PFGE typing and IS341 typing in the discrimination of nosocomial strains of methicillin-resistant Staphylococcus aureus [Text] / Tatsumi Yoshida [et al.] // Microbiol. and Immunol. - 1997. - Vol. 41, N 9. - P687-695 . - ISSN 0385-5600
Перевод заглавия: Сочетанное использование риботипирования, PFGE-типирования и IS431-типирования для дискриминирования болезнетворных штаммов устойчивых к метициллину Staphylococcus aureus
Аннотация: 46 устойчивых к метициллину клинических изолятов Staphylococcus aureus, выделенных в больнице Малайского университета в 1987-89 гг., изучены методами риботипирования, PFGE-типирования с использованием гель-электрофореза в пульсирующем поле и IS431-типирования (полиморфизма длины рестрикц. фрагментов с зондом элемента IS431). Эти изоляты разбиты на 5 риботипов, 22 PFGE-типа и 15 IS431-типов. Сочетание всех 3 методов генотипирования позволило отнести 46 штаммов к 39 генотипам. Япония, Dep. of Bacteriol., Juntendo Univ., Tokyo 113. Библ. 47
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
КЛИНИЧЕСКИЕ ИЗОЛЯТЫ

РИБОТИПИРОВАНИЕ

PFGE-ТИПИРОВАНИЕ

IS431-ТИПИРОВАНИЕ

39 ГЕНОТИПОВ

ОБНАРУЖЕНИЕ


Доп.точки доступа:
Yoshida, Tatsumi; Kondo, Noriko; Hanifah, Yasmin Abu; Hiramatsu, Keiichi


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 15.08-04Б2.103

   

    Comparison of five molecular subtyping methods for differentiation of Salmonella Kentucky isolates in Tunisia [Text] / Yousra Turki [et al.] // World J. Microbiol. and Biotechnol. - 2014. - Vol. 30, N 1. - P87-98 . - ISSN 0959-3993
Перевод заглавия: Сравнение пяти молекулярных субтипирующих методов для дифференциации изолятов Salmonella Kentucky в Тунисе
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: SALMONELLA SV. KENTUCKY
ИЗОЛЯТЫ

ПЛАЗМИДНЫЙ ПРОФИЛЬ

МОЛЕКУЛЯРНОЕ СУБТИПИРОВАНИЕ

ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ

МЕТОДЫ

PFGE

ERIC-ПЦР

RAPD-ПЦР

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ТУНИС


Доп.точки доступа:
Turki, Yousra; Mehri, Ines; Fhoula, Imen; Hassen, Abdennaceur; Ouzari, Hadda


7.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 15.05-04Б4.27

   

    Comparison of five molecular subtyping methods for differentiation of Salmonella Kentucky isolates in Tunisia [Text] / Yousra Turki [et al.] // World J. Microbiol. and Biotechnol. - 2014. - Vol. 30, N 1. - P87-98 . - ISSN 0959-3993
Перевод заглавия: Сравнение пяти молекулярных субтипирующих методов для дифференциации изолятов Salmonella Kentucky в Тунисе
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: SALMONELLA SALMONELLA SV. KENTUCKY
ИЗОЛЯТЫ

ПЛАЗМИДНЫЙ ПРОФИЛЬ

МОЛЕКУЛЯРНОЕ СУБТИПИРОВАНИЕ

ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ

МЕТОДЫ

PFGE

ERIC-PCR

RAPD-PCR

РИБОТИПИРОВАНИЕ

ТУНИС


Доп.точки доступа:
Turki, Yousra; Mehri, Ines; Fhoula, Imen; Hassen, Abdennaceur; Ouzari, Hadda


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.02-04Б4.59

   

    Comparison of four methods for molecular subtyping of Legionella pneumophila as implemented during an epidemic cluster of legionellosis in Rome [Text] : тез. [20 Annual Meeting of the European Working Group for Legionella Infections, Rome, May 16-17, 2005] / Marisa Scaturro [et al.] // Congr. ISTISAN. - 2005. - N C2. - P28 . - ISSN 0393-5620
Перевод заглавия: Сравнение четырех методов молекулярного субтипирования Legionella pneumophila, сделанное во время эпидемической вспышки легионеллеза в Риме
Аннотация: Для выяснения эпидемиологической связи между клиническими изолятами Legionella pneumophila и таковыми из окружающей среды в районе эпидемической вспышки легионеллеза в Риме провели молекулярное типирование этих изолятов с помощью моноклональных антител, гель-электрофореза в пульсирующем поле (PFGE), полиморфизма длин амплифицированных фрагментов (AFLP) и на основе секвенирования (SBT). С помощью PFGE и AFLP обнаружили одинаковые геномные паттерны в указанных группах изолятов. С помощью SBT установили 100% идентичность между собой ампликонов из эпидемического района. Техника SBT, простая и высоковоспроизводимая, рассматривается как полезное дополнение к технике AFLP, принятой за золотой стандарт. Италия, Dip. di Malattie Infettive, Parassitarie ed Immunomediate, Ist. Superiore di Sanita, Rome
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: LEGIONELLA PNEOMOPHILA (BACT.)
ИЗОЛЯТЫ

ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА

КЛИНИЧЕСКИЕ ИЗОЛЯТЫ

ЭПИДЕМИЧЕСКИЕ СВЯЗИ

МЕТОДЫ

PFGE

AFLP

ТИПИРОВАНИЕ НА ОСНОВЕ СЕКВЕНИРОВАНИЯ SBT

ЛЕГИОНЕЛЛЕЗ

ЭПИДЕМИЯ

ИТАЛИЯ


Доп.точки доступа:
Scaturro, Marisa; Losardo, Maria; De, Ponte Germana; Ricci, Maria Luisa


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 15.03-04Б4.115

   

    Corynebacterium ulcerans isolates from humans and dogs: Fibrinogen, fibronectin and collagen-binding, antimicrobial and PFGE profiles [Text] / Liliane Simpson-Louredo [et al.] // Antonie van Leeuwenhoek. - 2014. - Vol. 105, N 2. - P343-352 . - ISSN 0003-6072
Перевод заглавия: Изоляты Corynebacterium ulcerans из людей и собак: фибриноген-, фибронектин- и коллаген-связывание, антимикробные- и PFGE-профили
Аннотация: Соrynebacterium ulcerans - опасный зоонозный агент дифтерии и других инфекций, а бессимптомными носителями этого патогена могут быть собаки. Изучен вирулентный потенциал изолятов, полученных от людей и собак в Рио-де-Жанейро. Проанализированы данные о связывании фибриногена, фибронектина и коллагена I типа, а также генетические взаимосвязи штаммов, выделенных от человека и собак. PFGE-профили были распределены на 5 групп, причем в 2-х группах со сходством до 85% находились изоляты из людей и собак, живущих в непосредственном соседстве. Независимо от типа PFGE-профиля все излоляты продемонстрировали афинность к фибриногену, фибронектину и коллагену. Гетерогенность PFGE-профилей свидетельствует об эндемичности C. ulcerans в районе Рио-де-Жанейро. Различия в экспрессии адгезинов к внеклеточному матриксу людей приводит к вариациям вирулентности и зоонозного потенциала штаммов C. ulcerans
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.25.07
Рубрики: ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ФИБРИНОГЕН

ФИБРИНОНЕКТИН

КОЛЛАГЕН

СВЯЗЫВАНИE

ТАКСОНОМИЯ

PFGE-ПРОФИЛЬ

CORYNEBACTERIUM ULCERANS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Simpson-Louredo, Liliane; Ramos, Juliana Nunes; Peixoto, Renata Stavracakis; Santos, Louisy Sanches; Antunes, Camila Azevedo; Ladeira, Elisa Martins; Santos, Cintia Silva; Vieira, Veronica Viana; Boas, Maria Helena Simoes Villas; Hirata, Raphael; Mattos-Guaraldi, Ana Luiza


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 15.03-04И8.175

   

    Corynebacterium ulcerans isolates from humans and dogs: Fibrinogen, fibronectin and collagen-binding, antimicrobial and PFGE profiles [Text] / Liliane Simpson-Louredo [et al.] // Antonie van Leeuwenhoek. - 2014. - Vol. 105, N 2. - P343-352 . - ISSN 0003-6072
Перевод заглавия: Изоляты Corynebacterium ulcerans из людей и собак: фибриноген-, фибронектин- и коллаген-связывание, антимикробные- и PFGE-профили
Аннотация: Соrynebacterium ulcerans - опасный зоонозный агент дифтерии и других инфекций, а бессимптомными носителями этого патогена могут быть собаки. Изучен вирулентный потенциал изолятов, полученных от людей и собак в Рио-де-Жанейро. Проанализированы данные о связывании фибриногена, фибронектина и коллагена I типа, а также генетические взаимосвязи штаммов, выделенных от человека и собак. PFGE-профили были распределены на 5 групп, причем в 2-х группах со сходством до 85% находились изоляты из людей и собак, живущих в непосредственном соседстве. Независимо от типа PFGE-профиля все излоляты продемонстрировали афинность к фибриногену, фибронектину и коллагену. Гетерогенность PFGE-профилей свидетельствует об эндемичности C. ulcerans в районе Рио-де-Жанейро. Различия в экспрессии адгезинов к внеклеточному матриксу людей приводит к вариациям вирулентности и зоонозного потенциала штаммов C. ulcerans
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.23.59.02.25
Рубрики: ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ФИБРИНОГЕН

ФИБРИНОНЕКТИН

КОЛЛАГЕН

СВЯЗЫВАНИE

ТАКСОНОМИЯ

PFGE-ПРОФИЛЬ

CORYNEBACTERIUM ULCERANS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Simpson-Louredo, Liliane; Ramos, Juliana Nunes; Peixoto, Renata Stavracakis; Santos, Louisy Sanches; Antunes, Camila Azevedo; Ladeira, Elisa Martins; Santos, Cintia Silva; Vieira, Veronica Viana; Boas, Maria Helena Simoes Villas; Hirata, Raphael; Mattos-Guaraldi, Ana Luiza


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 96.09-04Б4.150

    Defontaine, A.

    Contribution of various techniques of molecular analysis to strain identification of Candida glabrata [Text] / A. Defontaine, M. Coarer, J. P. Bouchara // Microb. Ecol. Health and Disease. - 1996. - Vol. 9, N 1. - P27-33 . - ISSN 0891-060X
Перевод заглавия: Возможности различных методов молекулярного анализа при идентификации штаммов Candida glabrata
Аннотация: An evaluation of genetic typing systems (PFGE, mtDNA-RFLP, RAPD) on 22 isolates of Candida glabrata (ex Torulopsis glabrata) was undertaken. This evaluation indicated that PFGE has the highest degree of discrimination. The other methods can be used as complementary techniques when ambiguous results occur with PFGE
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.09
Рубрики: CANDIDA GLABRATA (FUNGI)
ШТАММЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ

МЕТОДЫ

PFGE

MTDNA-RFLP

СРАВНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАТИВНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Coarer, M.; Bouchara, J.P.


12.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 08.01-04Б4.3

   

    Distribution of molecular subtypes within Salmonella enterica serotype Enteritidis phage type 4 and S.Typhimurium definitive phage type 104 in nine European countries, 2000-2004: Results of an international multi-centre study [Text] / A. J. Gatto [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2006. - Vol. 134, N 4. - P729-736 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Распределение молекулярных субтипов среди Salmonella enterica серотип enteritidis фаготип 4 и S. typhimurium дефинитивный фаготип 104 в девяти европейских странах в 2000-2004 гг.: результаты международного многоцентрового исследования
Аннотация: Исследовано распределение профилей PFGE среди Salmonella enterica серотип enteritidis фаготип (РТ) 4 и S. typhimurium дефинитивный фаготип (DT) 104 от случаев инфицирования человека в девяти европейских странах с 2000 по 2004 гг. Изоляты были субтипированы, используя стандартные методы; гель-имиджи были поданы каждой участвующей страной в координирующий центр, откуда они поступили в центральную базу данных. S. enteritidis РТ 4 (n=3637) был разделен на 38 различных профилей. Simpson's индекс разнообразия (D) профилей находился в диапазоне от 0,2 до 0,4. Профиль SENTXB.0001 представлял, по меньшей мере, 80% всех профилей в каждой стране. S. typhimurium DT 104 (n=1202) был разделен на 28 различных типов профилей. Simpson's D составлял, по меньшей мере, 0,6 во всех странах за исключением Австрии и Италии. В обеих этих странах свыше 74% профилей S. typhimurium DT 104 были STYMXB.0013. Профиль STYMXB.0061 был преобладающим в Дании, Испании, Финляндии, Англии и Уэльсе, где он представлял от 36% до 45% профилей. Профиль STYMXB.0001 представлял почти половину всех профилей в Шотландии и 23% в Англии и Уэльсе. Доказана польза PFGE для более глубокого определения различий среди S. enteritidis РТ 4 и S. typhimurium DT 104. Установление международных вспышек, вовлекающих общие серотипы и фаготипы, можно улучшить с помощью своевременного взятия профилей PFGE из центральной базы данных, доступной для всех участников. Великобритания, Health Protection Agency Centre for Infections, London. Библ. 17
ГРНТИ  
ВИНИТИ 761.03.43.01.17 + 341.27.59
Рубрики: ПРОФИЛИ
PFGE

SALMONELLA ENTERICA (BACT.)

СЕРОТИП ENTERITIDIS

ФАГОТИП 4

ДЕФИНИТИВНЫЙ ФАГОТИП 104

ЧЕЛОВЕК

ИНФИЦИРОВАНИЕ

9 ЕВРОПЕЙСКИХ СТРАН

ВСПЫШКИ

МЕЖДУНАРОДНЫЕ

УСТАНОВЛЕНИЕ

ПРОФИЛИ

ВЗЯТИЕ

ЦЕНТРАЛЬНАЯ БАЗА ДАННЫХ


Доп.точки доступа:
Gatto, A.J.; Peters, T.M.; Green, J.; Fisher, I.S.; Gill, O.N.; O'Brien, S.J.; Maguire, C.; Berghold, C.; Lederer, I.; Gerner, -Smidt P.; Torpdahl, M.; Siitonen, A.; Lukinmaa, S.


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.03-04Б4.62

   

    Epidemiological tracing of Salmonella enterica serotype Abortusovis from Spanish ovine flocks by PFGF fingerprinting [Text] / S. Valdezate [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2007. - Vol. 135, N 4. - P695-702 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Эпидемиологическое отслеживание Salmonella enterica серотип abortusovis в испанских стадах овец методом получения PFGE фингерпринтов
Аннотация: Используя XbaI-PFGE, исследовали Salmonella enterica серотип abortusovis, выделенные от овец в стадах из 11 провинций. Несмотря на то, что штаммы были географически и пространственно связанными, PFGE продемонстрировал эпидемиологически приемлемую различающую способность, идентифицировав 20 клонов (схожесть 52-96%). Клоны Sabv6, 1, 5 были определены в 7, 5 и 2 областях, соответственно, другие 17 клонов были обнаружены в отдельных местах. Клоны из близких географических регионов показали высокую схожесть (различие в одной полосе в профиле PFGE), что говорит об общем предке. Было зафиксировано одновременное выделение клонов (Sabv5-6, Sabv1-3, Sabv1-6) в одном и том же стаде. Исследование методом PFGE показало преобладание и широкую распространенность клона Sabv6, выделенного в 21 из 55 изолятов S. enterica серотип abortusovis, изученных в Испании. Испания, Spanish Reference Lab. for Salmonella and Shigella (LNRSSE), Servico de Bacteriologia, C. N. M. Inst. de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid. Библ. 24
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОТИП ABORTUSOVIS

ЭПИДЕМИОЛОГИЯ

КЛОНЫ

РАЗЛИЧИЕ

СХОЖЕСТЬ

РАЗНЫЕ ГЕОГРАФИЧЕСКИЕ РАЙОНЫ

ИСПАНИЯ

МЕТОДЫ

PFGE ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЕ

ОВЦЫ


Доп.точки доступа:
Valdezate, S.; Astorga, R.; Herrera-Leon, S.; Perea, A.; Usera, M.A.; Huerta, B.; Echeita, A.


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.12-04Б4.110

   

    Evaluation of genetic relatedness of Bacteroides fragilis strains isolated from different sources by AP-PCR and pulsed-field gel electrophoresis assays [Text] / D. C. Vallim [et al.] // Anaerobe. - 2002. - Vol. 8, N 4. - P192-199 . - ISSN 1075-9964
Перевод заглавия: Оценка генетического родства штаммов Bacteroides fragilis, выделенных из разных источников с помощью AP-ПЦР и PFGE
Аннотация: Генетическое родство 71 штамма Bacteroides fragilis, выделенных их разных источников (образцы инфекционной и неинфекционной кишечной и некишечной микрофлоры человека и животных, бактериально загрязненные образцы воды) оценили с помощью ПЦР с произвольными праймерами (АР-ПЦР) и PFGE. Кроме того, у исследованных штаммов провели ПЦР-определение генов энтеротоксина (bft) и 'бета'-лактамазы (cepA, cfiA). Данные, полученные с помощью АР-ПЦР, предполагают связь cfiA-позитивных штаммов с образцами некишечной инфекции, однако огромное разнообразие PFGE-типов не позволяет устанавливать связь генетических типов B. fragilis со специфическим источником. Возможно, PFGE-типирование будет полезным только при исследовании образцов, связанных с уникальным хозяином. Бразилия, Ist. de Microbiol. Prof. Paulo do Goes, UFRJ, Rio de Janeiro. Ил. 3. Табл. 2. Библ. 50
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.15
Рубрики: БОЛЕЗНИ
КИШЕЧНЫЕ ИНФЕКЦИИ

ВОЗБУДИТЕЛЬ

ДИАГНОСТИКА

МЕТОДЫ

AP-ПЦР

PFGE-МЕТОД

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

РАЗЛИЧНЫЕ ШТАММЫ

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РОДСТВО

BACTEROIDES FRAGILIS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Vallim, D.C.; Oliveira, I.C.M.; Antunes, E.N.F.; Ferreira, E.O.; Moraes, S.R.; Paula, G.R.; Silva-Carvalho, M.C.; Figueiredo, A.M.S.; Ferreira, M.C.S.; Domingues, R.M.C.P.


15.
РЖ ВИНИТИ 68 (BI13) 13.08-04Б3.167

   

    Genetic diversity among Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens populations in the American high plains [Text] / I. V. Agarkova [et al.] // Can. J. Microbiol. - 2012. - Vol. 58, N 6. - P788-801 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие популяций Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens на американских плоскогорьях
Аннотация: Изучали разнообразие в популяциях Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, возбудителя бактериального вилта у фасоли обыкновенной в Небраске, Колорадо и Вайоминге. 67 изученных штаммов были собраны в 1957-2009 гг. Их обследовали молекулярными методами: полиморфизма фрагментов, AFLP; повторяющихся межгенных палиндромов, rep-PCR; электрофорезом в импульсном поле, PFGE. Методы показали высокую разнородность, но не соответствовали кластерному анализу ее популяции. Кластерный анализ на основе 3 методов приводит к существованию кластера А, дающего желтые, оранжевые и розовые колонии. Кластер В содержал штаммы лишь с желтым пигментом. Штаммы с красным внеклеточным пигментом встречались и в А, и в В. Подчеркивается фенотипич. и генотипич. разнообразие С. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens. США, Plant Pathology Dep., Univ. of Nebraska-Lincoln, NE 68583-0900
ГРНТИ  
ВИНИТИ 681.03.07.21
Рубрики: CURTOBACTIRIUM FLACCUMFACIENS PV. FLACCUMFACIENS (BACT.)
ФИТОПАТОГЕН ФАСОЛИ

РАЗНООБРАЗИЕ

МОЛЕКУЛЯРЫНЕ МЕТОДЫ

AFLD

REP-PCR

PFGE


Доп.точки доступа:
Agarkova, I.V.; Lambrecht, P.A.; Vidaver, A.K.; Harveson, R.M.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.05-04Б2.108

   

    Genetic diversity among Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens populations in the American high plains [Text] / I. V. Agarkova [et al.] // Can. J. Microbiol. - 2012. - Vol. 58, N 6. - P788-801 . - ISSN 0008-4166
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие популяций Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens на американских плоскогорьях
Аннотация: Изучали разнообразие в популяциях Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, возбудителя бактериального вилта у фасоли обыкновенной в Небраске, Колорадо и Вайоминге. 67 изученных штаммов были собраны в 1957-2009 гг. Их обследовали молекулярными методами: полиморфизма фрагментов, AFLP; повторяющихся межгенных палиндромов, rep-PCR; электрофорезом в импульсном поле, PFGE. Методы показали высокую разнородность, но не соответствовали кластерному анализу ее популяции. Кластерный анализ на основе 3 методов приводит к существованию кластера А, дающего желтые, оранжевые и розовые колонии. Кластер В содержал штаммы лишь с желтым пигментом. Штаммы с красным внеклеточным пигментом встречались и в А, и в В. Подчеркивается фенотипич. и генотипич. разнообразие С. flaccumfaciens pv. flaccumfaciens. США, Plant Pathology Dep., Univ. of Nebraska-Lincoln, NE 68583-0900
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.23.11.04 + 341.27.21.09.31.02
Рубрики: CURTOBACTIRIUM FLACCUMFACIENS PV. FLACCUMFACIENS (BACT.)
ФИТОПАТОГЕН ФАСОЛИ

РАЗНООБРАЗИЕ

МОЛЕКУЛЯРЫНЕ МЕТОДЫ

AFLD

REP-PCR

PFGE


Доп.точки доступа:
Agarkova, I.V.; Lambrecht, P.A.; Vidaver, A.K.; Harveson, R.M.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.02-04Б4.231

   

    Genetic diversity of vaginal Lactobacillus sp. determined by pulsed-field gel electrophoresis in women 20 and 30 weeks pregnant and the effect of lantibiotic genes on preterm delivery [Text] : тез.[3 World Congess on Anaerobic Bacteria and Infections, Glasgow, 7-9 May, 2003] / J. E. Warner [et al.] // Anaerobe. - 2003. - Vol. 9, N 5. - P266 . - ISSN 1075-9964
Перевод заглавия: Оценка генетического разнообразия вагинальных Lactobacillus sp. у женщин 20 и 30 недель беременности с помощью гель-электрофореза в пульсирующем поле и эффект лантибиотических генов на преждевременные роды
Аннотация: С помощью PFGE разнообразие геномной ДНК 113 изолятов Lactobacillus sp. из вагинальных мазков, взятых на 20-ю и 30-ю недели беременности у 64 женщин. Около 300 таких же изолятов Lactobacillus разделили на 3 группы: две группы высокого риска преждевременных родов, сформированные по признакам предыдущих преждевременных родов (PPB) и вагинального кровотечения (VB), и группу низкого риска (отсутствие PPB и VB). Изоляты этих групп будут исследованы с помощью ПЦР-амплификации и ДНК гибридизации на присутствие лантибиотических генов для установления возможной связи между данными генами и преждевременными родами. США, Channing Lab., Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.25.15.19
Рубрики: LACTOBACILLUS (BACT.)
ГЕНОМНОЕ РАЗНООБРАЗИЕ

ГЕНЫ

ЛАНТИБИОТИЧЕСКИЕ ГЕНЫ

ВЛИЯНИЕ НА

БЕРЕМЕННОСТЬ

ВАГИНАЛЬНЫЕ МАЗКИ

РОДЫ

ПРЕЖДЕВРЕМЕННЫЕ РОДЫ

ВАГИНАЛЬНОЕ КРОВОТЕЧЕНИЕ

МЕТОДЫ

PFGE

ПЦР

ГИБРИДИЗАЦИЯ ДНК


Доп.точки доступа:
Warner, J.E.; Ross, R.A.; Delaney, M.L.; Dubois, A.M.; Onderdonk, A.B.


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.130

   

    Genomic relatedness within five common finnish Campylobacter jejuni pulsed-field gel electrophoresis genotypes studied by amplified fragment length polymorphism analysis, ribotyping, and serotyping [Text] / Marja-Liisa Hanninen [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2001. - Vol. 67, N 4. - P1581-1586 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Геномное родство Campylobacter jejuni финского происхождения, исследованное в 5 распространенных PFGE-генотипах с помощью анализа полиморфизма длин амплифицированных фрагментов, риботипирования и серотипирования
Аннотация: Провели сравнительное исследование 35 штаммов Campylobacter jejuni с помощью анализа PFGE-образцов, образцов полиморфизма длин амплифицированных фрагментов (AFLP), HaeIII-риботипов и теплостабильных (HS)-серотипов. Эти штаммы были выделены из людей и кур в 1997-98-ом г. в Финляндии и представляли собой 5 распространенных SmaI/SacII - PFGE - генотипических групп. Показали высокий дискриминирующий уровень PFGE, AFLP и HaeIII-риботипирования, позволивший распределить исследованные штаммы в одни и те же генотипические группы. Дискриминирующий уровень серотипирования был ниже, т. к. идентичные серотипы были обнаружены в разных генотипических группах. В целом, результаты проведенного исследования предполагают наличие генетически родственных групп C. jejuni, колонизирующих людей и кур. Финляндия, Dep. of Food and Environmental Hygiene, Fac. of Veterinary Med., Univ. of Helsinki, and Helsinki Univ. Central Hosp. Diagnostics, 00014 Univ. of Helsinki. Ил. 4. Табл. 1. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: CAMPYLOBACTER JEJUNI (BACT.)
ШТАММЫ

ВЫДЕЛЕНИЕ

ЛЮДИ

КУРЫ

ФИНЛЯНДИЯ

ГЕНОМНОЕ РОДСТВО

МЕТОДЫ

PFGE-ОБРАЗЦЫ

МЕТОД AFLP

HAEIII-РИБОТИПЫ


Доп.точки доступа:
Hanninen, Marja-Liisa; Perko-Makela, Paivikki; Rautelin, Hilpi; Duim, Birgitta; Wagenaar, Jaap A.


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 03.05-04И8.87

   

    Genotypic analysis of Staphylococcus aureus from milk of dairy cows with mastitis in Argentina [Text] / F. R. Buzzola [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2001. - Vol. 126, N 3. - P445-452 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Генотипический анализ Staphyloccocus aureus из молока больных маститом коров в Аргентине
Аннотация: Оценили генотипический состав и генеалогические связи Staphylococcus aureus, выделенных из молока больных маститом коров в Аргентине в 1987-97 годах. Для этого 112 изолятов из 21 района Аргентины исследовали методами SmaI PFGE-типирования, автоматизированного EcoRI-риботипирования и рестриктазного анализа плазмидных ДНК (REAP). Обнаружили 4 кластера PFGE-полос из 13 риботипов. Показали наличие определенной связи между PFGE-генотипами и риботипами. REAP-анализ был полезен для дискриминации штаммов с идентичными PFGE-генотипами и риботипами. В исследованном материале выявили 2 наиболее распространенных штамма S. aureus и проследили изменения в их распространении на протяжении 8 лет. Аргентина, Dep. de Microbiol., Fac. de Med., Univ. de Buenos Aires, Paraguay 2155 P-12, (1121) Buenos Aires. Ил. 5. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.23.59.02.25
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ

МОЛОКО

КОРОВЫ БОЛЬНЫЕ МАСТИТОМ

АРГЕНТИНА 1987 Г. - 1997 Г.

ГЕНОТИПИЧЕСКИЙ СОСТАВ

ГЕНЕАЛОГИЧЕСКИЕ СВЯЗИ

МЕТОДЫ SMAI PFGE-ТИПИРОВАНИЕ

АВТОМАТИЗИРОВАННЫЙ ECORI-РИБОТИПИРОВАНИЕ

ПЛАЗМИДНЫЕ ДНК

РЕСТРИКТАЗНЫЙ АНАЛИЗ


Доп.точки доступа:
Buzzola, F.R.; Quelle, L.; Gomez, M.I.; Catalano, M.; Steele-Moore, L.; Berg, D.; Gentilini, E.; Denamiel, G.; Sordelli, D.O.


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.178

   

    Genotypic instability of campylobacters from human and poultry sources [Text] / A. M. Ridley [et al.] // Res. Vet. Sci. - 2001. - Vol. 70, прил. A. - P4 . - ISSN 0034-5288
Перевод заглавия: Нестабильность генотипирования кампилобактерий у человека и домашней птицы
Аннотация: В эпидемиологических исследованиях кампилобактерий применяются различные методы генотипирования - как определение одного локуса, так и определение селектированных фрагментов целого генома. Но все методы отмечают нестабильность генотипирования кампилобактерии. В данной работе использовали два метода генотипирования при исследовании образцов от человека и домашней птицы - fla-типирование AFLP и PFGE. Результаты показали наличие вариаций, свидетельствующие о геномной нестабильности, достаточно редкой в образцах, взятых у человека. Тем не менее, полученные данные свидетельствуют о том, что штаммы кампилобактерий могут мутировать в стрессовых условиях. Великобритания, Veterinary Lab. Agency (Weybridge), New Haw, Addlestone, Surrey KT15 3NB
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: КАМПИЛОБАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ ЧЕЛОВЕК

ДОМАШНЯЯ ПТИЦА

ГЕНОМ

ТИПИРОВАНИЕ

FLA

НЕСТАБИЛЬНОСТЬ

МЕТОДЫ

AFLP PFGE


Доп.точки доступа:
Ridley, A.M.; Toszeghy, M.; Cawthraw, S.; Newell, D.G.


 1-20    21-40   41-49 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)