СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=АНТИТЕРМИНАЦИЯ<.>)

Общее количество найденных документов : 49
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-49

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.11-04Б2.330

An escherichia coli cis-acting antiterminator sequence: The dnaG nut site [Text] / N. Almond [et al.] // Mol. and Gen. Genet. - 1989. - Vol. 216, N 2-3. - P195-203 . - ISSN 0026-8925
Перевод заглавия: Цис-активная антитерминаторная последовательность у Escherichia coli: сайт dnaG nut
Аннотация: Оперон gpsU-dnaG-proD escherichia coli содержит внутренний терминатор транскрипции Т[1], локализованный ранее в межгенном районе между генами rpsU и duaG. Путем клонирования Т[1] в составе фрагмента 127 п. н. в специальном векторе для выявления терминаторов pDR720, позволяющим вставлять терминатор между оператор-промоторным участком гена trp и служащим для определения активости клонируемого терминатора геном galK, выявлено, что Т[1] является мощным терминатором транскрипции, сравнимым по силе с терминатором Т[2], находящимся на 3'-конце оперона. Вместе с тем, установлено, что транскрипция через Т[1], обеспечивающая экспрессию гена galK может осуществляться в результате наличия в кодирующем районе гена rpsU в 5'-положении к Т[1], последовательности, гомологичной сайту nut фага 'лямбда'. Включение этой последовательности в плазмиду pDR720 в 5'-положении к Т[1] обеспечивает транскрипцию стоящего позади гена. Показано, что эта последовательность, обозначенная duaG nut может также модифицировать терминаторную активность Т[2]. Предполагается, что duaG nut является цис-активным элементом антитерминаторной системы E. coli. Ил. 7. Табл. 2. Библ. 45. США, NYU Medical Center, 550 First Avenue, New York, NY 10016.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
DNAGNUT
ТЕРМИНАТОР Т1
КЛОНИРОВАНИЕ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ФУНКЦИИ

Доп.точки доступа:
Almond, N.; Yajnik, V.; Svec, P.; Godson, G.N.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 98.10-04Б1.159

An RNA enhancer in a phage transcriptional antitermination complex functions as a structural switch [Text] / Leila Su [et al.] // Genes and Dev. - 1997. - Vol. 11, N 17. - P2214-2226 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Энхансер РНК в фаговом комплексе антитерминации транскрипции функционирует как структурный переключатель
Аннотация: Изучена минимальная модель комплекса антитерминации белка N (I) фага 'лямбда'. Асимметричное связывание богатого аргинином пептида I с одной стороной шпильки boxA РНК nut организует вторую сторону шпильки, к-рая в свою очередь связывается с антитерминирующим комплексом белков хозяина. Индуцированная пептидом структура РНК имитирует шпильку GNRA - организационный элемент рРНК и рибозимов. Две стороны шпильки РНК, соединенные смещенной парой оснований Г*А, проявляет специфич. стекинг и выпетливание оснований. Кроме того, обнаруживается стекинг боковой группы остатка трп с неспаренным остатком А на поверхности связывания I. Такой расширенный стекинг сопряжен с индукцией специфич. внутренней архитектуры РНК и блокируется мутациями РНК, к-рые in vivo ассоциированны с утратой антитерминирующей активности. Мимикрия мотива сборки РНК комплексом РНК-белок дает ему возможность взаимодействовать с аппаратом антитерминации. США, Dep. of Biol. Chem. and Molecular Biol., Univ. of Chicago, Chicago, IL 60637-5419. Библ. 62

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛАМБДА
СИНТЕЗ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН БЕЛКА N
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ЭНХАНСЕР РНК
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Su, Leila; Radek, James R.; Labeots, Laura A.; Hallenga, Klaa; Hermanto, Patrick; Chen, Huifen; Nakagawa, Satoe; Zhao, Ming; Kates, Steve; Weiss, Michael A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.154

An RNA polymerase 'альфа' subunit mutant impairs N-dependent transcriptional antitermination in Escherichia coli [Text] / Michal Obuchowski [et al.] // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 23, N 2. - P211-222 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Мутантная альфа-субъединица РНК-полимеразы нарушает N-зависимую транскрипционную антитерминацию в Escherichia coli
Аннотация: Холофермент РНК-полимеразы Escherichia coli состоит из пяти субъединиц ('альфа'[2]'бета''бета'''сигма'), из к-рых четыре ('альфа'[2]'бета''бета'') составляют ядро. Известно, что альфа-субъединица, кодируемая геном rpoA, является инициатором в сборке холофермента, а так же на многих, позитивно регулируемых промоторах взаимодействует с активаторами транскрипции и связывается со специфическими последовательностями ДНК перед боксом -35. Авт. выделили мутацию rpoA341, к-рая характеризовалась снижением уровня транскриптов с литических промоторов p['альфа'] и p[R] фага лямбда. При этом, инициация транскрипции с обоих промоторов не нарушалась. Значительно снижались уровни длинных, антитерминированных транскриптов с этих промоторов. Оказалось, что суперэкспрессия антитерминаторного белка N восстанавливает нарушенную функцию. Таким образом, выявлена еще одна функция альфа-субъединицы РНК-полимеразы, а именно ее участие в антитерминации транскрипции. Польша, Lab. Mol. Genet., Dep. Mol. Biol., Univ. Gdansk, Kladki 24, 80-822 Gdansk. Библ. 55s

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
РНК-ПОЛИМЕРАЗА БАКТЕРИЙ
СТРУКТУРА
СУБЪЕДИНИЦА*АЛЬФА-
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Obuchowski, Michal; Wegrzyn, Alicja; Szalewska-Palasz, Agnieszka; Thomas, Mark S.; Wegrzyn, Grzegorz

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.01-04Б2.199

Analysis of HutP-dependent transcription antitermination in the Bacillus subtilis hut operon: Identification of HutP binding sites on hut antiterminator RNA and the involvement of the N-terminus of HutP in binding of HutP to the antiterminator RNA [Text] / Masanao Oda [et al.] // Mol. Microbiol. - 2004. - Vol. 51, N 4. - P1155-1168 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Анализ HutP-зависимой антитерминации транскрипции в опероне hut Bacillus dubtilis: идентификация сайтов связывания HytP на антитерминаторной РНК hyt и участие N-конца HutP в связывании HutP и антитерминаторной РНК
Аннотация: Исследовали HutP-зависимую антитерминацию транскрипции оперона hyt Bacillus subtilis. Показали in vitro, что TutP ингибирует терминацию транскрипции путем связывания антитерминатора на мРНК hyt в присутствии гистидина. Взаимодействие HutP с районом, содержащим три UAG последовательности, локализованные на вершине антитерминаторной структуры, играет важную роль в hut антитерминации in vivo. Установили, что вторичная структура необходима для связывания HutP с районом антитерминатора, содержащим три триплета UAG. In vivo антитерминаторная активность HytP снижалась при наличии мутаций в N-концевом районе HutP. Варианты HutP с мутациями H4A, R7A, I9A и Q26A имели пониженное сродство к антитерминаторной РНК in vitro. Пептид, состоящий из аминокислотных остатков 2-26 HutP связывался с антитерминаторной РНК, что свидетельствует о том, что N-конец HutP участвует в связывании HutP с антитерминаторной РНК. Япония, Inst. for Biological Resources and Functions, National Inst. of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Central 6, Higashi 1-1-1, Tsukyba City, Ibaraki 305-8566. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АНТИТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ОПЕРОН HYT
РНК МАТРИЧНАЯ
МРНК HUT
АНТИТЕРМИНАТОР
СВЯЗЫВАНИЕ
HUTP
IN VITRO
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Oda, Masanao; Kobayashi, Nobuhiro; Fujita, Masaya; Miyazaki, Yuusuke; Sadaie, Yoshito; Kurusu, Yasurou; Nishikawa, Satoshi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.02-04Б2.406

Antitermination of characterized transcriptional terminators by the Escherichia coli rrnG leader region [Text] / Bjarne Albrechtsen [et al.] // J. Mol. Biol. - 1990. - Vol. 213, N 1. - P123-134 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Антитерминация охарактеризованных терминаторов транскрипции лидерной областью rrn G Escherichia coli
Аннотация: Антитерминатор (АТ) оперона рРНК опосредует эффективную транскрипцию ДНК, содержащей ро-зависимые терминаторы. Под действием АТ rrn РНК-полимераза транскрибирует ДНК, содержащую 2 или 3 копии терминатора с такой же эффективностью, как ДНК с 1 терминатором. АТ оказывает меньшее действие на ро-независимые терминаторы; фрагмент rpo Ct и терминатор rrn B препятствуют антитерминации транскрипции. Сила данных терминаторов связана с дополнительными нижележащими терминаторами. Обсуждается механизм действия АТ rrn. Ил. 2. Табл. 5. Библ. 62. США, [C. L. Squires], Dep. of Biol. Sci, Columbia Univ., New York, NY 10027.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT)
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН РРНК RRN
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ТЕРМИНАТОРЫ
АНТИТЕРМИНАТОРЫ

Доп.точки доступа:
Albrechtsen, Bjarne; Squires, Catherine L.; Li, Suzanne; Squires, Craig

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 03.05-04Б1.84

Arenavirus nucleocapsid protein displays a transcriptional antitermination activity in vivo [Text] / M. A. Tortorici [et al.] // Virus Res. - 2001. - Vol. 73, N 1. - P41-55 . - ISSN 0168-1702
Перевод заглавия: Нуклеокапсидный белок аренавируса проявляет активность антитерминации транскрипции in vivo
Аннотация: В клетках, зараженных аренавирусами, в переходе от транскрипции к репликации участвует зависящая от шпилечной структуры терминация. Чтобы обойти этот сигнал, требуется синтез белка. Заражение вирусом Хунин (ВХ) клеток BHK-21, экспрессирующих нуклеокапсидный белок N (I) ВХ, в присутствии ингибиторов транскрипции показало, что I участвует в контроле антитерминации транскрипции. Аргентина, Dep. Ciencias Biol., Fac. Ciencias Exactas, Univ. Nat. La Plata, 1900 La Plata, Buenos Aires. Библ. 36

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: АРЕНАВИРУСЫ
НУКЛЕОКАПСИДНЫЙ БЕЛОК
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Tortorici, M.A.; Albarino, C.G.; Posik, D.M.; Ghiringhelli, P.D.; Lozano, M.E.; Rivera, Pomar R.; Romanowski, V.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.05-04Б2.264

Autogenous mudulation of the Bacillus subtilis ascB-levB-yveA levansucrase operon by the levB transcript [Text] / Jean-Pierre Daguer [et al.] // Microbiology. - 2004. - Vol. 150, N 11. - P3669-3679 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Автогенная модуляция оперона sacB-levB-yveA левансахаразы Bacillus subtilis транскриптом levB
Аннотация: Показано, что независимая экспрессия гена levB, находящегося в составе оперона левансахаразы sacB-levB-yveA Bacillus subtilis, значительно стимулирует экспрессию левансахаразы, в то время как молчание levB вызывает ее уменьшение. Данный автогенный эффект связан с транскриптом levB, несущим 11 нуклеотидную последовательность, идентичную таковой в лидерном районе оперона sacB-levB-yveA. Исследуется возможное взаимодействие транскрипта levB с компонентами антитерминации транскрипции, контролирующими экспрессию этого оперона. Франция, Inst. Jacques Monod, Laboratoire Genetique et Membranes, CNRS - Univ. Paris 6 et Paris 7, Tour 43, 2 place Jussieu, 75251 Paris Cedex 05. Ил. 8. Табл. 2. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН ЛЕВАНСАХАРАЗЫ SACB-LEVB-YVEA
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
АВТОГЕННАЯ МОДУЛЯЦИЯ
ТРАНСКРИПТ LEVB
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Daguer, Jean-Pierre; Geissmann, Thomas; Petit-Glatron, Marie-Francoise; Chambert, Regis

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 95.07-04Б1.80

Bacteriophage lambda N-dependent transcription antitermination. Competition for an RNA site may regulate antitermination [Text] / Thomas A. Patterson [et al.] // J. Mol. Biol. - 1994. - Vol. 236, N 1. - P217-228 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Зависимая от белка N антитерминация транскрипции бактериофага ламбда. Конкуренция за сайт РНК может регулировать антитерминацию
Аннотация: Экспрессия ранних генов фага 'лямбда' контролируется с помощью серии событий терминации и антитерминации. Антитерминация осуществляется с помощью фагового белка N (I), белков клетки-хозяина Nus (II) и cis-активирующих сайтов nut (III). III состоит из 2 компонентов: box A и boxB. Исследовали функцию каждого из компонентов III. Получили мутации по обоим компонентам III и показали, что они по разному влияют на антитерминацию транскрипции. Полагают, что II и ингибитор антитерминаторной активности (IV) конкурируют между собой за взаимодействие с III. Предлагают модель, согласно к-рой белок NusB и неидентифицированный в настоящее время IV взаимодействуют с nutA и регулируют I-зависимую антитерминацию транскрипции. США, Lab. of Chromosome Biol., ABL-Basic Res. Program NCI-Frederick Cancer Res. and Develop. Center P. O. Box B., Frederick, MD 21702. Библ. 53

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ЛАМБДА
РАННИЕ БЕЛКИ
СИНТЕЗ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ РАННИХ БЕЛКОВ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI
MUTANTS
DELETIONS

Доп.точки доступа:
Patterson, Thomas A.; Zhang, Zhaoshan; Baker, Teresa; Johnson, Linda L.; Friedman, David I.; Court, Donald L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.10-04Б2.266

Berg, Karen L.
Ribosomal RNA operon anti-termination Function of leader and spacer region box B-Box A sequences and their conservation in diverse micro-organisms [Text] / Karen L. Berg, Craig Squires, Catherine L. Squires // J. Mol. Biol. - 1989. - Vol. 209, N 3. - P345-358 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Антитерминация в опероне рибосомной РНК. Функция последовательностей элемент В - элемент А в лидерной и спейсерной областях и их сохранение у сильно отличающихся микроорганизмов
Аннотация: Изучали природу последовательностей ответственных за эффект антитерминации в рибосомном опероне rrnB Кл Escherichia coli. По аналогии с антитерминаторным последовательностями ламбдоидных фагов, в составе оперона rrnB идентифицированы 2 предполагаемых антитерминатора - в лидерной области в спейсерном участке между генами рРНК 16S и 23S. Эти антитерминаторы состояли из 2 элементов - А и В. С помощью направленного мутагенеза in vitro подтверждены, их антитерминаторные функции, но для проявления активности достаточно только элементов А, а элементы В не являются необходимыми. Определены также границы участка элемента А, необходимые для его активности. Показано, что инактивация антитерминатора при одновременном удалении терминатора приводит к усилению активности соотв-щего промотора. При анализе нуклеотидных последовательностей рибосомных оперонов из разных организмов такие антитерминаторы обнаружены в большинстве исследованных микроорганизмов, включая и архебактерии. Библ. 69. США, Dep. of Biological Sci. Columbia Univ. New York, NY 10027.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ А
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ В
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ФУНКЦИИ
РИБОСОМНЫЕ ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН РРНК 16S - 23S
ЛИДЕРНАЯ ОБЛАСТЬ
СПЕЙСЕРНАЯ ОБЛАСТЬ

Доп.точки доступа:
Squires, Craig; Squires, Catherine L.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.06-04Б2.282

Chai, Weihang.
RNA sequence requirements for NasR-mediated, nitrate-responsive transcription antitermination of the Klebsiella oxytoca M5al nasF operon leader [Text] / Weihang Chai, Valley Stewart // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 292, N 2. - P203-216 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Требования к последовательностям РНК для опосредованной NasR, отвечающей на нитрат антитерминации транскрипции в лидере оперона nasF Klebsiella oxytoca M5aI
Аннотация: У Klebsiella oxytoca M5aI белок NasR (I) вызывает антитерминацию транскрипции оперона nasFEDCBA ассимиляции нитрата (II), взаимодействуя с лидерной РНК nasF (III). Сравнение последовательностей ДНК обнаружило у 2 видов Klebsiella сохранение шпилечных структур (ШС) 1:2 и 3:4 в III. Специфическое связывание I с III стимулируется II и нитритом (IV). С использованием мутационного анализа, изучения антитерминации in vitro и in vivo и сдвига ЭФ-подвижности РНК определены области в III, существенные для антитерминации и взаимодействия I-РНК. Для индукции II и взаимодействия I-РНК требуются ШС 1:2 и специфическая последовательность гексануклеотидной петли в ней. Мутации в ШС 1:2, устраняющие индукцию II, мешают взаимодействию I-III. Замены нуклеотидов или вставки в III между ШС 1:2 и 3:4 вредны для индукции оперона nasF, но не для взаимодействия I-III. Высказано предположение, что I узнает в III ШС 1:2 и вызывает антитерминацию транскрипции в ответ на II или IV. США, Section Microbiol., Cornell Univ., Ithaca, NY 14853-8101. Библ. 36

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АНТИТЕРМИНАЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ОПЕРОН NASF АССИМИЛЯЦИИ НИТРАТА
БЕЛОК
БЕЛОК NASR
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ЛИДЕРНАЯ РНК NASF
ШПИЛЕЧНЫЕ СТРУКТУРЫ
СТИМУЛЯЦИЯ
НИТРИТ
KLEBSIELLA OXYTOCA (BACT.)
ШТАММ M5A1

Доп.точки доступа:
Stewart, Valley

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.03-04Б2.552

Chang, Zhen.
Novel UGA-suppressors in Escherichia coli K-12 [Text] / Zhen Chang, Hachiro Inokuchi, Haruo Ozeki // Идэнгаку дзасси = Jap. J. Genet. - 1990. - Vol. 65, N 2. - P71-81
Перевод заглавия: Новые супрессоры кодона УГА у Escherichia coli К-12
Аннотация: Выделено несколько новых супрессорных мутантов Escherichia coli. У данных мутантов обнаружено явление "пассивной супрессии" - за счет замедления процесса освобождения белков на кодоне УГА и проскакивания рибосом через этот терминирующий кодон. Супрессия такого типа осуществлялась за счет мутации по гену prfB, кодирующему фактор освобождения белков RF2. Еще несколько из выделенных супрессорных мутантов характеризовались способностью восстанавливать стрептомицинчувствительный фенотип у стрептомицинустойчивых бактерий. Предполагается, что и у этих мутантов супрессия достигается за счет каких-то изменений в рибосомном аппарате (включая и факторы освобождения). Библ. 23. Япония, Dep. of Biophysics, Fac. of Sci., Kyoto Univ., Sakuo-ku, Kyoto 606.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT)
ШТАММ K-12
СУПРЕССОРНЫЕ МУТАЦИИ
МУТАЦИИ ГЕНА PRFB ФАКТОРА РФ2
КОРРЕЛЯЦИЯ
ТРАНСЛЯЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
СТОПКОДОН УГА

Доп.точки доступа:
Inokuchi, Hachiro; Ozeki, Haruo

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.230

cis-Acting regulatory sequences for antitermination in the transcript of the Bacillus subtilis hut operon and histidine-dependent binding of HutP to the transcript containing the regulatory sequences [Text] / Masanao Oda [et al.] // Mol. Microbiol. - 2000. - Vol. 35, N 5. - P1244-1254 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Цис-действующие регуляторные последовательности для антитерминации транскрипта hut Bacillus subtilis и зависящее от гистидина связывание HutP с промотором, содержащим регуляторные последовательности
Аннотация: Определено положение цис-регуляторной области для зависящей от гистидина (I) антитерминации оперона hut Bacillus subtilis. В регуляторной области транскрипта hut обнаружена вторичная структура, частично перекрывающаяся с 3'-терминатором. Мутац. анализ показал, что эта структура требуется для зависящей от I антитерминации. Методом сдвига ЭФ-подвижности обнаружено связывание очищенного белка HutP (II) в присутствии I и Mg{2+} с РНК hut, имеющей предсказанную вторичную структуру, но не с РНК, неспособной к образованию такой структуры. II существует в форме гексамера. Для связывания II, равного 50% от максимального, требуется присутствие 3,1 мМ I. K[d] для связывания II с РНК в присутствии I равна 0,56 мкМ. Эти данные показали, что: 1) вторичная структура в регуляторной области мРНК hut функционирует как антитерминатор, блокирующий образование терминатора; 2) II усиливает экспрессию структурных генов hut, связываясь со вторичной структурой РНК в ответ на присутствие I. Япония, Nat. Inst. Biosci. and Human Technol., MITI, Tsukuba, Ibaraki 305-8568. Библ. 41

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН HUT
РЕГУЛЯЦИЯ
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АНТИТЕРМИНАТОРНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
СТРУКТУРА
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АНТИТЕРМИНАТОР HUTP
СПЕЦИФИЧНОСТЬ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Oda, Masanao; Kobayashi, Nobuhiro; Ito, Akiko; Kurusu, Yasurou; Taira, Kazunari

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.08-04Б2.189

Comparative analysis of the four rRNA operons in Finegoldia magna ATCC29328 [Text] / Kozo Todo [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2004. - Vol. 27, N 1. - P18-26 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Сравнительный анализ четырех оперонов рРНК в Finegoldia magna АТСС29328
Аннотация: В отличие от Clostridia, у Finegoldia magna АТСА29328 4 оперона рРНК рассредоточены по хромосоме. С помощью BAC-библиотеки определена нуклеотидная последовательность и структура всех 4 оперонов, включая их фланкирующие участки. В оперонах идентифицированы предполагаемые boxA-последовательности, возможно, участвующие для антитерминации транскрипции рРНК, соответствующие тандемные промоторы, АТ-богатые UP-элементы в предшествующих районах и Rho-независимые терминаторы в областях, следующих за оперонами. Для всех оперонов характерна мозаичная организация. Следом за оперонами rrC и rmD обнаружены множественные тРНК; 18 следом за rrnC и 11 за rrnD. Полагают, что они образуют единую транскрипционную единицу с генами рРНК. За оперонами rrnA и rrnB вместо тРНК обнаружены повторяющиеся единицы с Rho-независимыми терминаторами. Показано, что промоторные области наиболее сходны у оперонов rrnB и rrnC. Не обнаружено положительной корреляции между межцистронными последовательностями рРНК и расстояниями между оперонами. Япония, Dep. Microbiol., Wakayama Med. Univ., Wakayama. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ОПЕРОНЫ
ОПЕРОНЫ RRNA-D
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ОРГАНИЗАЦИЯ МОЗАИЧНАЯ
ПРОМОТОРЫ
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
FINEGOLDIA MAGNA (BACT.)

Доп.точки доступа:
Todo, Kozo; Goto, Takatsugu; Honda, Akio; Tamura, Mieko; Miyamoto, Kazuaki; Fujita, Shigeyuki; Akimoto, Shigeru

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 91.05-04Б1.343

Costantino, Nina.
Analysis of mutations in the ninR region of bacteriophage lambda that bypass a requirement for lambda N antitermination [Text] / Nina Costantino, M. Zuber, Donald Court // J. Bacteriol. - 1990. - Vol. 172, N 8. - P4610-4615 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Анализ мутаций в области minR бактериофага ламбда, обходящих потребность в антитерминации [белком] N [фага] 'лямбда'
Аннотация: Изучены 2 мутации в области minR фага 'лямбда', обходящие антитерминацию. Мутация byp клонирована и методом спасения маркеров картирована на сегменте длиной 417 п. н. в области ninR. Секвенирование и анализ с помощью улавливающих промоторы векторов показали, что мутация byp создает новый промотор, с к-рого транскрибируется ген Q. Мутация nin3 является делецией, удаляющей 2485 п. н. области minR, начиная с гена ren и кончая открытой рамкой считывания ninG. Она удаляет терминаторы t[2] и t[3] и делает фаг 'лямбда' N-независимым и способным расти в хозяевах, дефектных по факторам антитерминации Nus. США, Lab. of Chromosome Biol., Nat. Cancer Inst.-Frederick Cancer Research Facility, Frederick, MD21702-1201. Библ. 32.

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛАМБДА
МУТАЦИИ
МУТАЦИЯ BUP
ОБЛАСТЬ NINR
БЕЛОК N
АНТИТЕРМИНАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Zuber, M.; Court, Donald

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.12-04Б2.451

Drew, Robert.
Positive control of Pseudomonas aeruginosa amidase synthesis is mediated by a transcription anti-termination mechanism [Text] / Robert Drew, Nick Lowe // F. Gen. Microbiol. - 1989. - Vol. 135, N 4. - P817-823 . - ISSN 0022-1287
Перевод заглавия: Положительный контроль синтеза амидазы Pseudomonas aeruginosa осуществляется механизмом антитерминации транскрипции
Аннотация: Экспрессия амидазного гена (ami E) Pseudomonas aeruginosa регулируется продуктом регуляторного гена amiR, который расположен на расстоянии 2 т. п. н. за геном ami E и транскрибируется в одном с ним направлении. Изучили нуклеотидную последовательность района длиной в 150 п. н., расположенного перед геном ami E и его влияние на транскрипцию данного гена. Показали, что данный район содержит промотор, подобный промотору Escherichia coli, короткую открытую рамку считывания, E. coli-подобный ро-независимый участок терминации транскрипции, сайт связывания рибосом. Делеции внутри участка терминации транскрипции приводят к высокой конститутивной экспрессии гена ami Е, которая не зависит от продукта гена ami R. Полагают, что синрез амидазы регулируется с помощью позитивной регуляции механизмом антитерминации транскрипции. Библ. 25. Великобритания, Dep. of Biochem., Univ. College London, Gower Street, London WC1Е 6ВТ.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.03
Рубрики: PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACT.)
ШТАММ PAC1
ШТАММ PAC308
ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕН AMI E
ЛИДЕРНЫЙ РАЙОН
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
МУТАЦИИ
ДЕЛЕЦИИ

Доп.точки доступа:
Lowe, Nick

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.09-04Б2.142

Evidence that the KH RNA-binding domains influence the action of the E. coli NusA protein [Text] / Ying Zhou [et al.] // J. Mol. Biol. - 2002. - Vol. 318, N 5. - P1175-1188 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Доказательства, что КН РНК-связывающие домены влияют на активность белка NusA E. coli
Аннотация: Белок элонгации транскрипции NusA, связывающий РНК, содержит последовательности, соответствующие S1 и KH классам РНК-связывающих доменов. Помимо этой важной функции в E. coli, NusA является одним из факторов хозяина, необходимых для действия белка антитерминации транскрипции 'лямбда'. Тандем KH доменов идентифицировали как находящийся ниже S1 домена. Заменили первый Gly на Asp в GXXG мотиве, тетрапептидной диагностике KH доменов, в обоих NusA KH доменах. Замена в первом, G253D, дала большой эффект, тогда как во втором, G319D, оказала незначительное влияние на активность NusA. Изменения в обоих доменах накладывались на связывание NusA с РНК. Замена консервативного Arg в S1 домене, R199A, накладывалась на связывание РНК, но мало влияла на активность NusA. Однако nusA аллель при изменении как в G253D, так и в G319D, кодировал функционально неактивный белок NusA. Таким образом, получены прямые доказательства, что оба КН, также как S1 РНК-связывающие домены важны для активности NusA в поддержании выживаемости бактерий и антитерминации транскрипции, опосредованной 'лямбда' N белком. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Univ. of Michigan Med. School, 5641 Med. Sci. Building II Ann Arbor, MI 48109-0620. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК ЭЛОНГАЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ NUSA
КН-ДОМЕНЫ РНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ЗАМЕНА GLY НА ASP
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ВЫЖИВАЕМОСТЬ БАКТЕРИЙ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Zhou, Ying; Mah, Thien-Fah; Greenblatt, Jack; Friedman, David I.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 03.09-04Б4.40

Evidence that the KH RNA-binding domains influence the action of the E. coli NusA protein [Text] / Ying Zhou [et al.] // J. Mol. Biol. - 2002. - Vol. 318, N 5. - P1175-1188 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Доказательства, что КН РНК-связывающие домены влияют на активность белка NusA E. coli
Аннотация: Белок элонгации транскрипции NusA, связывающий РНК, содержит последовательности, соответствующие S1 и KH классам РНК-связывающих доменов. Помимо этой важной функции в E. coli, NusA является одним из факторов хозяина, необходимых для действия белка антитерминации транскрипции 'лямбда'. Тандем KH доменов идентифицировали как находящийся ниже S1 домена. Заменили первый Gly на Asp в GXXG мотиве, тетрапептидной диагностике KH доменов, в обоих NusA KH доменах. Замена в первом, G253D, дала большой эффект, тогда как во втором, G319D, оказала незначительное влияние на активность NusA. Изменения в обоих доменах накладывались на связывание NusA с РНК. Замена консервативного Arg в S1 домене, R199A, накладывалась на связывание РНК, но мало влияла на активность NusA. Однако nusA аллель при изменении как в G253D, так и в G319D, кодировал функционально неактивный белок NusA. Таким образом, получены прямые доказательства, что оба КН, также как S1 РНК-связывающие домены важны для активности NusA в поддержании выживаемости бактерий и антитерминации транскрипции, опосредованной 'лямбда' N белком. США, Dep. of Microbiol. and Immunol., Univ. of Michigan Med. School, 5641 Med. Sci. Building II Ann Arbor, MI 48109-0620. Библ. 65

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК ЭЛОНГАЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ NUSA
КН-ДОМЕНЫ РНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ЗАМЕНА GLY НА ASP
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ВЫЖИВАЕМОСТЬ БАКТЕРИЙ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Zhou, Ying; Mah, Thien-Fah; Greenblatt, Jack; Friedman, David I.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.10-04Б2.284

Fauzi, Hamid.
In vitro selection to identify determinants in tRNA for Bacillus subtilis tyrS T box antiterminator mRNA binding [Text] / Hamid Fauzi, Karen D. Jack, Jennifer V. Hines // Nucl. Acids Res. - 2005. - Vol. 33, N 8. - P2595-2602 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Селекция in vitro для идентификации детерминант в тРНК для связывания антитерминаторных РНК Т-бокса tyrS Bacillus subtilis
Аннотация: Т-бокс - система регуляции антитерминации транскрипции, обнаруженная в грамположительных бактериях, зависит от комплекса взаимодействий между незаряженной тРНК и 5'-нетранслируемым лидерным районом мРНК регулируемого гена. В одном из этих взаимодействий участвует пара оснований акцепторного конца родственной тРНК с 4-мя основаниями в 7nt-районе антитерминаторной РНК. Использовали селекцию in vitro рандомизированных тРНК, связывающихся с антитерминаторными модельными РНК tyrS Bacillus subtilis, для определения последовательностей для связывания известных комплементарных пар оснований. Выбрали модельные антитерминаторные РНК для захвата тРНК. Хотя не наблюдали корреляции по последовательностям между отобранными тРНК, имелась корреляция между определенными элементами третичной структуры и эффективностью связывания с различными антитерминаторными модельными РНК. Полученные результаты свидетельствуют, что на уровне третичной структуры антитерминаторная модель соответствует наблюдениям in vivo, а дополнительные характерные особенности узнавания могут играть роль в образовании комплекса. США, Dep. of Chemistry and Biochemistry, Ohio Univ., Athens, OH 45701. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РНК ТРАНСПОРТНАЯ
НЕЗАРЯЖЕННАЯ ТРНК
МРНК
I-БОКС TYRS
ТРНК-МРНК ВЗАИМОДЕЙСТВИЕМ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Jack, Karen D.; Hines, Jennifer V.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.03-04Б2.220

Franklin, Naomi C.
A plasmid to visualize and assay termination and antitermination of transcription in Escherichia coli [Text] / Naomi C. Franklin // Plasmid. - 1989. - Vol. 21, N 1. - P31-42
Перевод заглавия: Плазмида для наблюдения и изучения терминации и антитерминации транскрипции в Escherichia coli
Аннотация: Для совершенствования анализа процессов терминации и антитерминации транскрипции у прокариот в репликон плазмиды pBR322 был встроен сложный оперон, включающий природные и синтетические элементы ДНК. Активность указанного оперона контролировалась по количеству продукта 'бета'-галактозидазы на субстрате с хромогеном. Этот оперон инициируется с индуцибельного промотора, включает сложный (разделенный) терминатор транскрипции и поэтому требует, чтобы антитерминация транскрипции экспрессировалась после гена lacZ. Описанная плазмида может служить тестером для изучения мутаций, влияющих на различные аспекты регуляции транскрипции терминацией. Ил. 2. Табл. 1. Библ. 33. США, Biology Dep. and Howard Hughes Medical Inst., Univ. of Utah, Salt Lake City, Utah 84112.

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PBR322
КОНСТРУИРОВАНИЕ
ТРАНСКРИПЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
АНТИТЕРМИНАЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
МОДЕЛИ
ГЕН-МАРКЕР LACZ
ХРОМОГЕННЫЕ СУБСТРАТЫ

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 90.03-04Б1.273

Franklin, Naomi C.
Overexpression of N antitermination proteins of bacteriophages 'лямбда', 21, and P22: loss of N protein specificity [Text] / Naomi C. Franklin, Jed H. Doelling // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 5. - P2513-2522 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Гиперэкспрессия антитерминирующих белков N бактериофагов 'лямбда', 21 и Р22: утрата специфичности белков N
Аннотация: Белок N (I) фага 'лямбда' (I) вызывает антитерминацию, если матрица содержит с 5'-стороны от терминатора сайт nut, и только в присутствии клеточных белков Nus. Ламбдоидные фаги 21 и Р22 образуют аналоги I (I{2}{1} и I{2}{2}), к-рые зависят от своих сайтов nut и по-разному взаимодействуют с белками NusA (II) E. coli (II[c]) и Salmonella (II[a][l]). Сконструированы экспрессионные плазмиды - производные pBR322, несущие гены I, I{2}{1} и I{2}{2} под контролем промотора tac и гиперпродуцирующие эти I при индукции изопропил-'бета'-D-тиогалактозидом при 37'ГРАДУС' в Кл, содержащих II[c] или II[a][l]. Показано, что гиперпродукция этих I вызывает ослабление специфичности в отношении nut, что выражается в способности плазмид комплементировать мутанты N гетерологичных фагов. Однако, специфичность в отношении II определяется тем I, к-рый гиперпродуцируется комплементирующей плазмидой. Избыток I супрессирует трансляционную полярность в случае клонированного гена 'trpA триптофанового оперона, но не влияет на полярность в хромосомном гене trpE. Т. к. в цис-положении к 'trp A нет известных сайтов nut, высказано предположение, что преодоление криптического внутригенного терминатора связано с наличием в 'trpA последовательности nut, функционирующей в присутствии I любого типа и II [e]или II[a][l]. Найдено также, что избыток II, не зависящее от nut, мешает ауторегуляции синтеза II. Полученные данные показывают, что конц-ия белка очень важна для специфичности его взаимодействия с др. белком и с нуклеиновыми к-тами и что взаимодействие I и II требует участия nut для специфичности и функциональности. Библ. 59. США, Dept. of Biol., Univ. of Utah, Salt Lake City, UT 84112.

ГРНТИ	34.25.21

ВИНИТИ 341.25.21.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ ЛАМБДА
БЕЛКИ N
АНТИТЕРМИНАЦИЯ
ГИПЕРЭКСПРЕССИЯ
УТРАТА СПЕЦИФИЧНОСТИ

Доп.точки доступа:
Doelling, Jed H.

1-20 21-40 41-49

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска