СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Schuler, Dirk$<.>)

Общее количество найденных документов : 21
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-21

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 95.10-04Б2.20

Phylogenetic analysis of uncultured magnetotactic bacteria from the alpha-subclass of Proteobacteria [Text] / Stefan Spring [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 1995. - Vol. 17, N 4. - P501-508 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Филогенетический анализ некультивируемых обладающих магнитотаксисом бактерий, относящихся к альфа-подклассу Proteobacteria
Аннотация: Из осадков различных пресных водоемов в Германии выделены накопительные культуры бактерий, обладающих магнитотаксисом; по морфологии 9 из них являются кокками, а одна характеризуется палочковидными клетками. На основании рез-тов секвенирования 16S рДНК и использования флуоресциирующих олигонуклеотидных зондов обсуждается их таксономическое положение и филогенетические связи. Установлено, что бактерии принадлежат к альфа-подклассу класса Proteobacteria, образуя в нем самостоятельную ветвь. Констатировано значительное филогенетическое разнообразие обладающих магнитотаксисом кокков. Германия, Lehrstuhl fur Mikrobiol., Technishe Univ. Munchen, D-80290 Munchen. Библ. 29

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: PROTEOBACTERIA (BACT.)
МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
ТАКСОНОМИЯ
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Spring, Stefan; Amann, Rudolf; Ludwig, Wolfgang; Schleifer, Karl-Heinz; Schuler, Dirk; Poralla, Karl; Petersen, Nikolai

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 96.10-04Б2.4

Schuler, Dirk.
A simple light scattering method to assay magnetism in Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Dirk Schuler, Rainer Uhl, Edmund Bauerlein // FEMS Microbiol. Lett. - 1995. - Vol. 132, N 1-2. - P139-145 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Простой, основанный на светорассеянии метод для определения магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Разработан простой оптический метод для определения клеточного магнетизма в культуре магнитных бактерий р. Magnetospirillum. При помещении в магнитное поле клетки выстраиваются параллельно его линиям, что вызывает изменение светорассеяния. Соотношение величин светорассеяния при разных углах магнитного поля характеризует среднюю магнитную ориентацию клеток, к-рая, как оказалось, коррелирует со средним числом частиц в клетках магнитных бактерий. Предложенный метод позволяет легко и быстро прослеживать динамику образования магнетита в растущих культурах M. gryphiswaldense. Германия, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, Abt. Membranbiochemie, D-82 152 Martinsried. Библ. 17

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
МАГНЕТИТ
МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Uhl, Rainer; Bauerlein, Edmund

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.07-04Б2.21

Schuler, Dirk.
Iron-limited growth and kinetics of iron uptake in Magnetospirilum gryphiswaldense [Text] / Dirk Schuler, Edmund Baeuerlein // Arch. Microbiol. - 1996. - Vol. 166, N 5. - P301-307 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Лимитированный железом рост и кинетика поглощения железа у Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Рост и образование магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 максимальны при внеклеточной конц-ии железа (I) 15-20 мкМ. Включение I происходит медленно, процесс подобен диффузии. Хелаторы I, включая сидерофоры микроорганизмов, не могут ускорять транспорт I в клетки. Отработанная культуральная жидкость стимулирует поглощение ионов I истощенными по I клетками, а свежая среда и буфер - не стимулируют. В отработанной жидкости не удалось обнаружить сидерофороподобных веществ с использованием анализа с хром-азуролом S. Поглощение иона I описывается кинетикой Михаэлиса-Ментен с К[м] 3 мкМ и V[max] 0,86 нмоль мин{-1} мг сухой массы{-1}, следовательно, транспортная система имеет относительно низкое сродство, но высокую скорость. Включение I чувствительно к 2,4-динитрофенолу и карбонилцианид-м- хлорфенилгидразону (что указывает на энергозависимость системы). Германия, [E. Baeuerlein], M.-P.-I. fur Biochem., Abteilung Membranenbiochemie, D-82152 Martinsried. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.07.09.09
Рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ MSR-1
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ
ЖЕЛЕЗО
ПОГЛОЩЕНИЕ
КИНЕТИКА
ТРАНСПОРТНАЯ СИСТЕМА

Доп.точки доступа:
Baeuerlein, Edmund

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.07-04Б3.35

Schuler, Dirk.
Iron-limited growth and kinetics of iron uptake in Magnetospirilum gryphiswaldense [Text] / Dirk Schuler, Edmund Baeuerlein // Arch. Microbiol. - 1996. - Vol. 166, N 5. - P301-307 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Лимитированный железом рост и кинетика поглощения железа у Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Рост и образование магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 максимальны при внеклеточной конц-ии железа (I) 15-20 мкМ. Включение I происходит медленно, процесс подобен диффузии. Хелаторы I, включая сидерофоры микроорганизмов, не могут ускорять транспорт I в клетки. Отработанная культуральная жидкость стимулирует поглощение ионов I истощенными по I клетками, а свежая среда и буфер - не стимулируют. В отработанной жидкости не удалось обнаружить сидерофороподобных веществ с использованием анализа с хром-азуролом S. Поглощение иона I описывается кинетикой Михаэлиса-Ментен с К[м] 3 мкМ и V[max] 0,86 нмоль мин{-1} мг сухой массы{-1}, следовательно, транспортная система имеет относительно низкое сродство, но высокую скорость. Включение I чувствительно к 2,4-динитрофенолу и карбонилцианид-м- хлорфенилгидразону (что указывает на энергозависимость системы). Германия, [E. Baeuerlein], M.-P.-I. fur Biochem., Abteilung Membranenbiochemie, D-82152 Martinsried. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ MSR-1
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ
ЖЕЛЕЗО
ПОГЛОЩЕНИЕ
КИНЕТИКА
ТРАНСПОРТНАЯ СИСТЕМА

Доп.точки доступа:
Baeuerlein, Edmund

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 99.01-04Б3.54

Schuler, Dirk.
Dynamics of iron uptake and Fe[3]O[4] biomineralization during aerobic and microaerobic growth of Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Dirk Schuler, Edmund Baeuerlein // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 1. - P159-162 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Динамика поглощения железа и биоминерализации Fe[3]O[4] в процессе аэробного и микроаэробного роста Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: С помощью радиоактивного и оптического (основанного на светорассеянии клеток в магнитном поле) методов исследовали поглощение Fe{3+} и образование магнетита (Fe[3]O[4]) клетками Magnetospirillum gryphiswaldense. Обнаружено, что образование магнетита сопряжено с интенсивным поглощением Fe{3+} и происходит только в микроаэробных условиях, при конц-ии O[2] от 2 до 7 мкМ (при 30'ГРАДУС'C). Клетки запасали до 2% Fe в виде магнетита, локализованного во внутрицитоплазматических везикулах. Число кристаллов магнетита диаметром 42-45 нм на клетку достигало 60. Германия, Abteilung Membranbiochemie, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, D-82152 Martinsrieg. Библ. 20

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
АЭРОБНЫЙ РОСТ
ЖЕЛЕЗО (III)
ПОГЛОЩЕНИЕ
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Baeuerlein, Edmund

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.02-04Б2.16

Schuler, Dirk.
Dynamics of iron uptake and Fe[3]O[4] biomineralization during aerobic and microaerobic growth of Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Dirk Schuler, Edmund Baeuerlein // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 1. - P159-162 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Динамика поглощения железа и биоминерализации Fe[3]O[4] в процессе аэробного и микроаэробного роста Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: С помощью радиоактивного и оптического (основанного на светорассеянии клеток в магнитном поле) методов исследовали поглощение Fe{3+} и образование магнетита (Fe[3]O[4]) клетками Magnetospirillum gryphiswaldense. Обнаружено, что образование магнетита сопряжено с интенсивным поглощением Fe{3+} и происходит только в микроаэробных условиях, при конц-ии O[2] от 2 до 7 мкМ (при 30'ГРАДУС'C). Клетки запасали до 2% Fe в виде магнетита, локализованного во внутрицитоплазматических везикулах. Число кристаллов магнетита диаметром 42-45 нм на клетку достигало 60. Германия, Abteilung Membranbiochemie, Max-Planck-Inst. fur Biochemie, D-82152 Martinsrieg. Библ. 20

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.07.09
Рубрики: MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
АЭРОБНЫЙ РОСТ
ЖЕЛЕЗО (III)
ПОГЛОЩЕНИЕ
МАГНЕТИТ
ОБРАЗОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Baeuerlein, Edmund

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.10-04Б2.172

Schuler, Dirk.
Improved technique for the isolation of magnetotactic spirilla from a freshwater sediment and their phylogenetic characterization [Text] / Dirk Schuler, Stefan Spring, Dennis A. Bazylinski // Syst. and Appl. Microbiol. - 1999. - Vol. 22, N 3. - P466-471 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Улучшенный метод выделения магнетотактических спирилл из пресноводного осадка и их филогенетическая характеристика
Аннотация: Для выделения микроанаэрофильных магнетотактич. спирилл из пресноводных осадков использовали разделение от немагнетотактич. бактерий активной миграцией вдоль силовых линий магнитного поля в капиллярах и последующую инокуляцию в 2-слойную среду с противоположными градиентами конц-ий O[2] и сульфида. Выделено несколько штаммов, к-рые по морфологии, физиологии и почти полным последовательностям гена рРНК 16S отнесены к p. Magnetospirillum. 5 изолятов близкородственны описанным ранее видам (гомология более 99%), а 2 представляют третий филогенетич. кластер в этом роде. Германия, Max-Planck-Inst. Marine Mirobiol., D-28359 Bremen. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)
МАГНЕТОТАКТИЧЕСКИЕ СПИРИЛЛЫ
ПРЕСНОВОДНЫЕ ОСАДКИ
ВЫДЕЛЕНИЕ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕН РРНК 16S

Доп.точки доступа:
Spring, Stefan; Bazylinski, Dennis A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.02-04Б2.298

Characterization of a spontaneous nonmagnetic mutant of Magnetospirillum gryphiswaldense reveals a large deletion comprising a putative magnetosome island [Text] / Sabrina Schubbe [et al.] // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, N 19. - P5779-5790 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика спонтанного мутанта Magnetospirillum gryphiswaldense выявила большую делецию, содержащую предполагаемый магнитосомный остров
Аннотация: Спонтанную утрату магнитного фенотипа наблюдали в культурах стационарной фазы бактерии Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1. Выделили и охарактеризовали немагнитный мутант MSR-1B, у которого отсутствовали магнитные кристаллы и внутренние мембранные везикулы. Штамм характеризовался ухудшением роста при любых условиях и снижением аккумуляции железа. Идентифицировали большую хромосомную делецию в 80 т. п. н., которая включала кластеры mamAB и mamDC, а также опероны, кодирующие белки, связанные с магнитными свойствами. Из геномной библиотеки M. gryphiswaldense выделили клон, частично перекрывающий район делеции. Секвенирование этого фрагмента выявило тесную связь генов mam с генами, кодирующими другие белки магнетосомы. Этот район был также богат инсерционными элементами и генами неизвестных семейств, по-видимому, специфичных для магнитотактильных бактерий. Сделан вывод о наличии большого магнитосомного острова в M. gryphiswaldense и других родственных бактерий. Германия, Max-Planck-Inst. fur Marine Microbiol., 28359 Bremen. Библ. 53

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ОРГАНЕЛЛЫ
МАГНИТОСОМЫ
СИНТЕЗ
БЕЛОК
БЕЛКИ МАГНИТОСОМ MAMAB, MAMDC
ФУНКЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ СИНТЕЗА МАГНИТОСОМ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ХАРАКТЕРИСТИКА
MAGNETOSPRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Schubbe, Sabrina; Kube, Michael; Scheffel, Andre; Wawer, Cathrin; Heyen, Udo; Meyerdierks, Anke; Madkour, Mohamed H.; Mayer, Frank; Reinhard, Richard; Schuler, Dirk

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.11-04Б2.119

Flies, Christine B.
Combined approach for characterization of uncultivated magnetotactic bacteria from various aquatic environments [Text] / Christine B. Flies, Jorg Peplies, Dirk Schuler // Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 5. - P2723-2731 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Комбинированный подход для характеристики некультивируемых магнитных бактерий из различных водных местообитаний
Аннотация: Активная миграция магнитных бактерий (MB) вдоль линий магнитного поля обеспечивает уникальную возможность определения, очистки и накопления этих организмов из внешней среды. Некультивируемые МВ могут быть селективно отделены от частиц донных осадков и не МБ с помощью магнитного обогащения и капиллярного метода "race track" очистки. Использовали рестрикционный анализ амплифицированной рДНК и DGGE (электрофорез в денатурирующем градиенте геля) в сочетании с анализом последовательности 16S рРНК. Используя эти методы очистки, изучали распространение и разнообразие МВ в микрокосмах из различных морских и пресноводных местообитаний с помощью микроскопических, молекулярных и культуральных методов. В большинстве микрокосмов доминировали магнитные кокки. Большинство последовательностей 16S рРНК (к-рые были определены) объединялись с отдельным кластером внутри 'альфа'-Proteobacteria. Внутри этой линии родства уровни дивергенции последовательностей были 1-11%, показывая разнообразие на уровне рода среди магнитных кокков из различных микрокосмов, а также среди MB из различных стадий сукцессии одних и тех же микрокосмов. Состав сообщества в микрокосмах, подвержен серьезной сукцессии в течение инкубации, и в микрокосмах из одних и тех же местообитаний наблюдали значительную неоднородность. Новая магнитная палочковидная бактерия (MHB-1) была обнаружена в образце донных отложений из озера в сев. Германии с помощью флуоресцентной гибридизации in situ. MHB-1 отнесен к филуму Nitrospira, обнаружив 91% сходства последовательностей 16S рРНК с "Magnetobacterium bavaricum". Интенсивные попытки культивирования потерпели неудачу при выделении MHB-1, так же как и др. MB, присутствующих в изучаемых образцах. Однако, хотя магнитные спириллы не часто обнаруживались в накопительных культурах, 10 новых изолятов р. Magnetospirillum, к-рые обычными рутинными методами не выделялись ранее в виде чистых культур, были получены. Германия, Max Planck Inst. for Marine Microbiology, 28359 Bremen. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.23

ВИНИТИ 341.27.23.09
Рубрики: МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ВОДНЫХ МЕСТООБИТАНИЙ
ОЧИСТКА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Peplies, Jorg; Schuler, Dirk

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 05.11-04Б3.32

Flies, Christine B.
Combined approach for characterization of uncultivated magnetotactic bacteria from various aquatic environments [Text] / Christine B. Flies, Jorg Peplies, Dirk Schuler // Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 5. - P2723-2731 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Комбинированный подход для характеристики некультивируемых магнитных бактерий из различных водных местообитаний
Аннотация: Активная миграция магнитных бактерий (MB) вдоль линий магнитного поля обеспечивает уникальную возможность определения, очистки и накопления этих организмов из внешней среды. Некультивируемые МВ могут быть селективно отделены от частиц донных осадков и не МБ с помощью магнитного обогащения и капиллярного метода "race track" очистки. Использовали рестрикционный анализ амплифицированной рДНК и DGGE (электрофорез в денатурирующем градиенте геля) в сочетании с анализом последовательности 16S рРНК. Используя эти методы очистки, изучали распространение и разнообразие МВ в микрокосмах из различных морских и пресноводных местообитаний с помощью микроскопических, молекулярных и культуральных методов. В большинстве микрокосмов доминировали магнитные кокки. Большинство последовательностей 16S рРНК (к-рые были определены) объединялись с отдельным кластером внутри 'альфа'-Proteobacteria. Внутри этой линии родства уровни дивергенции последовательностей были 1-11%, показывая разнообразие на уровне рода среди магнитных кокков из различных микрокосмов, а также среди MB из различных стадий сукцессии одних и тех же микрокосмов. Состав сообщества в микрокосмах, подвержен серьезной сукцессии в течение инкубации, и в микрокосмах из одних и тех же местообитаний наблюдали значительную неоднородность. Новая магнитная палочковидная бактерия (MHB-1) была обнаружена в образце донных отложений из озера в сев. Германии с помощью флуоресцентной гибридизации in situ. MHB-1 отнесен к филуму Nitrospira, обнаружив 91% сходства последовательностей 16S рРНК с "Magnetobacterium bavaricum". Интенсивные попытки культивирования потерпели неудачу при выделении MHB-1, так же как и др. MB, присутствующих в изучаемых образцах. Однако, хотя магнитные спириллы не часто обнаруживались в накопительных культурах, 10 новых изолятов р. Magnetospirillum, к-рые обычными рутинными методами не выделялись ранее в виде чистых культур, были получены. Германия, Max Planck Inst. for Marine Microbiology, 28359 Bremen. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.02
Рубрики: МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ ИЗ ВОДНЫХ МЕСТООБИТАНИЙ
ОЧИСТКА
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
MAGNETOSPIRILLUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Peplies, Jorg; Schuler, Dirk

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.12-04Б2.253

Schultheiss, Daniel.
Development of a genetic system for Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Daniel Schultheiss, Dirk Schuler // Arch. Microbiol. - 2003. - Vol. 179, N 2. - P89-94 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Открытие генетической системы для Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Генетический анализ биоминерализации бактериальных магнетосом затруднен из-за отсутствия приемлемой методологии культивирования и генетических манипуляций для большинства бактерий, проявляющих магнитотаксис. Предлагается генетическая система для Magnetospirillum gryphiswaldense, включающая технику посева, которая обеспечивает скрининг "магнитных" и "немагнитных" колоний, а также протокол переноса чужеродной ДНК электропорацией и высоко-эффективной конъюгации. Показано, что различные векторы с широким спектром хозяев, относящиеся к группам IncQ, IncP и pBBR1, способны реплицироваться в клетках M. gryphiswaldense, также идентифицированы маркеры устойчивости к антибиотикам, которые могут быть экспрессированы в этих бактериях. Tn5 транспозоны, доставленные суицидными плазмидами, были обнаружены в виде инсерций в случайных хромосомных сайтах

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ТАКСИС
МАГНИТОТАКСИС
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
МЕТОДЫ
МАГНИТНЫЕ КОЛОНИИ
НЕМАГНИТНЫЕ КОЛОНИИ
СКРИНИНГ

Доп.точки доступа:
Schuler, Dirk

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.42

Schuler, Dirk.
Molecular analysis of a subcellular compartment: the magnetosome membrane in Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Dirk Schuler // Arch. Microbiol. - 2004. - Vol. 181, N 1. - P1-7 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Молекулярный анализ субклеточного компартмента: мембрана магнитосомы у Magnitospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Проводили биохимический и генетический анализ функций магнитосомоных мембранных белков (ММБ) в процессе биоминерализации магнетита, экспрессии кодирующих их генов и локализации в ходе роста бактерий. У Magnitospirillum gryphiswaldense мембрана магнитосом имеет определенный биохимический состав и содержит комплекс специфических ММБ. Одни классы ММБ включают белки, ответственные за направленный в магнитосомы транспорт и связывание железа, образование ядер кристаллизации и сборку магнитосомных мембранных мультибелковых комплексов. Другие ММБ включают белковые семейства с еще неизвестной функцией, вероятно, консервативной среди других магнитных бактерий. Гены mam и mms кодируют большинство ММБ, их кластеры образуют несколько оперонов, являющихся частью большого нестабильного района генома, представляющего предположительно магнитосомный остров

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.07.09 + 341.27.17.09.07.09.09
Рубрики: МАГНИТОСОМЫ
МАГНИТОСОМНЫЕ МЕМБРАННЫЕ БЕЛКИ
ФУНКЦИИ
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ МАГНЕТИТА
ТРАНСПОРТ ЖЕЛЕЗА
MAGNITOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.01-04Б2.9

Evaluation of gene expression analysis using RNA-targeted partial genome arrays [Text] / Chris Wurdemann [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2006. - Vol. 29, N 5. - P349-357 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Оценка анализа экспрессии генов с использованием адресованных к РНК частичных наборов геномных матриц
Аннотация: Методическая работа, посвященная постоянно нарастающему объему работ по прямому обнаружению РНК или аРНК (амплифицированной РНК), что позволяет обойти зависимость получения молекулярных препаратов от специфических ферментов. Авторы оценивали степень неспецифического связывания олигонуклеотидных микроматриц, созданных для профилирования экспрессии суммарной РНК. Для этой цели применяли модельную систему, включающую 70-звенные пробы, ориентированные на гены mam. Эти гены участвуют в образовании магнитосом у бактерии Magnetospirillum gryphiswaldense. Испытывали штамм дикого типа MSR-1 и его изогенный мутант MSR-1B с выпадением всех генов mam. Использовали подход с применением прямого химического мечения суммарной клеточной РНК. Наблюдали линейную корреляцию между кол-вом использованной РНК и средней всеобщей фоновой интенсивностью. Она обеспечивала простой и объективный путь нормализации данных. Рез-ты, полученные на мутанте MSR-1B, выявили большое число ошибочных положительных сигналов даже в оптимальных условиях гибридизации. Это указывало на высокую степень неспецифического связывания в опытах с наборами микроматриц в случае применения более длинных олиго- или полинуклеотидов и РНК в кач-ве молекулы мишени. Провели сравнительный анализ культуры MSR-1B и двух культур MSR-1 (дикого типа). Их выращивали в разных условиях и применяли метод трехцветной гибридизации. Дополнительные данные, полученные по MSR-1B-транскриптому, выявили отличающуюся экспрессию генов у двух культур MSR-1. Различить их иными способами было невозможно. Германия, Max Plank Inst. for Marine Microbiol., 28359 Bremen (E-mail: fog

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.07
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ MAM
УЧАСТИЕ В ОБРАЗОВАНИИ МАГНИТОСОМ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ ДИКОГО ТИПА
ИЗОГЕННЫЙ МУТАНТ
РНК
СУММАРНАЯ КЛЕТОЧНАЯ РНК
ХИМИЧЕСКОЕ МЕЧЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Wurdemann, Chris; Peplies, Jorg; Schubbe, Sabrina; Ellrott, Andreas; Schuler, Dirk; Glockner, Frank Oliver

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.04-04Б2.206

Transcriptional organization and regulation of mangetosome operons in Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Sabrina Schubbe [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2006. - Vol. 72, N 9. - P5757-5765 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Транскрипционная организация и регуляция оперона магнетосомы Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: В клетках магнетотоксической спириллы Magnetospirillum gryphiswaldense гены, участвующие в биоминерализации магнетита (Fe[3]O[4]), сосредоточены в островке магнетосомы. С помощью ПЦР с обратной транскрипцией показана котранскрипция генов внутри кластеров mamAB, mamDC и mms. Сайты инициации транскрипции оперонов mamAB, mamDC и mms маркированы на 22 п. н., 52 п. н. и 58 п. н. перед первым геном кластера, соответственно. Показано наличие -10 и -35 box в промоторах этих оперонов, они близки канонической последовательности узнавания сигма 70. При сравнении реакции магнитных бактерий и немагнитного мутантного штамма на железо или кислород установлено, что экспрессия генов mam и mms подавляется в мутантных клетках при недостатке железа и в меньшей степени при аэробном росте по сравнению с образующими магнетит клетками, выращиваемыми в условиях микроаэрации и при достаточном количестве железа. Германия, Max Planck Inst. Marine Microbiol., Dept. Mocrobiol., Celsiusstr. 1, 28359 Bremen. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ГЕНЫ
ГЕНЫ МАГНЕТОСОМЫ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЖЕЛЕЗО
КИСЛОРОД
МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
МАГНЕТИТ
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Schubbe, Sabrina; Wurdemann, Chris; Peplies, Jorg; Heyen, Udo; Wawer, Cathrin; Glockner, Frank Oliver; Schuler, Dirk

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.01-04Б2.2

Lang, Claus.
Expression of green fluorescent protein fused to magnetosome proteins in microaerophilic magnetotactic bacteria [Text] / Claus Lang, Dirk Schuler // Appl. and Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74, N 15. - P4944-4953 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Экспрессия белка с зеленой флуоресценцией, слитого с белками магнитосом, в микроаэрофильных магнитотаксических бактериях
Аннотация: Магнитосомы бактерий - органеллы, состоящие из кристаллов магнетита, окруженных фосфолипидным бислоем с серией белков, обладающих различными функциями. Они нашли широкое применение, обычно после присоединения функциональных молекул к мембране магнитосом. Изучалась возможность использования белка с зеленой флуоресценцией (GFP) как репортера локализации белков магнитосом. Слитые с GFP белки MamC, MamF и MamG были экспрессированы в Magnetospirillum gryphiswaldense. Хотя оптимальные условия синтеза магнетита и флуорофора были взаимоисключающие, удалось подобрать подходящие условия (с ограничением по кислороду) для одновременного роста, биоминерализации магнетита и образования GFP флуорофора. Все слитые белки были локализованы на мембране магнитосом, но наиболее выраженной экспрессией и флуоресценцией характеризовался MamC-GFP. Белок MamC может использоваться как "якорь" для дисплея гетерологичных белков на магнитосомах. Германия, Ludwig-Maximillians-Univ. Munchen, Dep. Biol. I, Bereich Mikrobiol., Maria-Ward-Str., Ia, 80638 Munich. Библ. 56

ГРНТИ	34.27.05

ВИНИТИ 341.27.05.15
Рубрики: МАГНИТОСОМЫ
ФУНКЦИОНАЛИЗАЦИЯ
АНАЛИЗ ЛОКАЛИЗАЦИИ БЕЛКОВ
GFP КАК РЕПОРТЕР
MAMC КАК "ЯКОРЬ"
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ГИБРИДНЫЕ БЕЛКИ
СЛИТЫЕ С GFP БЕЛКИ МАГНИТОСОМ
ЭКСПРЕССИЯ

Доп.точки доступа:
Schuler, Dirk

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.01-04Б2.168

Diversity analysis of magnetotactic bacteria in Lake Miyun, northern China, by restriction fragment length polymorphism [Text] / Wei Lin [et al.] // Syst. and Appl. Microbiol. - 2009. - Vol. 32, N 5. - P342-350 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Анализ разнообразия магнитотаксических бактерий из озера Miyun, северный Китай, с помощью анализа полиморфизма длины фрагментов рестрикции
Аннотация: In silico определена эффективность действия 12 наборов традиционно используемых рестриктаз для анализа полиморфизма длины фрагментов рестрикции магнитных бактерий, для этого из GenBank были взяты 23 последовательности генов рРНК 16S этих организмов. Показано, что наиболее эффективной для выявления операционных таксономических единиц последовательностей генов 16S рРНК магнитных бактерий является пара рестриктаз - MspI и RsaI. После обогащения микробного сообщества во взятых образцах придонного осадка озера Miyun магнитными бактериями, проводили амплификацию генов 16S рРНК, амплифицированные продукты клонировали с помощью вектора pMD19-T. Трансформированные клетки наносили на агаровые пластины и отбирали колонии со вставками гена 16S рРНК, которые затем амплифицировали с праймерами, специфичными к плазмиде pMD19-T. Продукты ПЦР обрабатывали смесью рестриктаз и разделяли в 4% агарозе электрофорезом. В исследуемых образцах было обнаружено 8 операционных таксономических единиц, 5 из них принадлежат Alphaproteobacteria, а остальные - к филуму Nitrospira. Операционные таксономические единицы C, D и I на 91,8-98,4% сходны с "Magnetobacterium bavariucum". КНР, Biogeomagnetism Group, Paleomagnetism & Geochronology Lab., St. Key Lab. Lithospheric Evolution, Inst. Geol. & Geophys., Chinese Acad. Sci., Beijing 100029. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: МАГНИТОТАКСИС
ГЕНЫ
ГЕНЫ 16S РРНК
РЕСТРИКЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ПОЛИМОРФИЗМ ДЛИНЫ ФРАГМЕНТОВ РЕСТРИКЦИИ
ТАКСОНОМИЯ
ОПЕРАЦИОННЫЕ ТАКСОНОМИЧЕСКИЕ ЕДИНИЦЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
MAGNITOBACTERIUM (BACT.)

Доп.точки доступа:
Lin, Wei; Li, Jinhua; Schuler, Dirk; Jogler, Christian; Pan, Yongxin

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.03-04Б2.78

Ullrich, Susanne.
Cre-lox-based method for generation of large deletions within the genomic magnetosome island of Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Susanne Ullrich, Dirk Schuler // Appl. and Environ. Microbiol. - 2010. - Vol. 76, N 8. - P2439-2444 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Метод на оснвое Cre-lox для получения больших делеций внутри геномного магнетосомного острова Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Разработали метод получения делеций на основе Cre-lox, позволяющий эксцизию больших геномных фрагментов в Magnetospirillum gryphiswaldense. Две конъюгативные суицидальные плазмиды, несущие сайты lox, фланкирующие ген-мишень, последовательно вставили в хромосому путем гомологичной рекомбинации. Эксцизию сегмента хромосомы маркеров устойчивости индуцировали экспрессией in trans Cre-рекомбиназы, Хелперную плазмиду Cre затем удалили из делетируемого штамма путем отбора с помощью антибиотиков. Использовали этот метод для получения делеций 16,3 т.п.н., 61 т.п.н. и 67,3 т.п.н. фрагментов из геномного магнетосомного острова M. gryphiswaldense (MAI), либо с помощью одного цикла, либо с последующим циклом делеций, перекрывающим район 'ЭКВИВ' 87 т.п.н., включающий опероны mamAB, mms6 и mamGFDC. Германия, Ludwig-Maximillians-Univ. Munchen, Dep. Biologie I., Bereich Mikrobiologie, Biozentrum der LMU, Groshadernestr. 4, Planegg-Martinsried

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ДЕЛЕЦИИ
ПОЛУЧЕНИЕ
ГЕНОМНЫЕ ФРАГМЕНТЫ
ЭКСЦИЗИЯ
МАГНЕТОСОМНЫЙ ОСТРОВ
ГЕНЫ
ФУНКЦИИ
АНАЛИЗ
МЕТОДЫ
ОСНОВА CRE-LOX
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Schuler, Dirk

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.06-04Б2.177

Deletion of a fur-like gene affects iron homeostasis and magnetosome formation in Magnetospirillum gryphiswaldense [Text] / Rene Uebe [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, N 16. - P4192-4204 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Делеция fur-подобного гена влияет на гомеостаз железа и образование магнетосом у Magnetospirillum gryphiswaldense
Аннотация: Начато исследование компонентов основного метаболизма железа и их вклада в биоминерализацию магнетита у Magnetospirillum gryphiswaldense. Проведено сравнение содержания внутриклеточных метаболитов железа и профилей экспрессии генов мутанта с делецией в гене, гомологичном гену основного регулятора потребления железа fur, и клеток дикого типа. Установлено, что Fur является глобальным регулятором ответа на ионы железа у этих бактерий, а также влияет на образование магнетосом. Германия, Ludwig-Maximillians-Univ. Munchen, Dept. Biol I, Beriech Mikrobiol., Biozentrum der LMU, Grosshaderterstr. 4. Библ. 79

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ЖЕЛЕЗО
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕН FUR
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ОТВЕТА
БЕЛОК FUR
МАГНЕТОСОМЫ
ОБРАЗОВАНИЕ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACH.)

Доп.точки доступа:
Uebe, Rene; Voigt, Brigit; Schweber, Thomas; Albrecht, Dirk; Katzmann, Emanuel; Lang, Claus; Bottger, Lars; Matzanke, Berthold; Schuler, Dirk

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 14.01-04Б2.181

The cation diffusion facilitator proteins MamB and MamM of Magnetospirillum gryphiswaldense have distinct and complex functions, and are involved in magnetite biomineralization and magnetosome membrane assembly [Text] / Rene Uebe [et al.] // Mol. Microbiol. - 2011. - Vol. 82, N 4. - P818-835 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Белки MamB и MamM, облегчающие диффузию катионов Magnetospirillum gryphiswaldense, имеют различные и сложные функции и участвуют в биоминерализации и сборке мембранной магнитосомы
Аннотация: Показали, что белки MamB и MamM, облегчающие диффузию катионов Magnetospirillum gryphiswaldense, участвуют в нескольких этапах образования магнитосомы. Оба белка важны для биоминерализации, но только делеция mamB ведет к потере магнитосомных мембранных везикул. Стабильность MamB зависит от присутствия MamM при образовании гетеродимерного комплекса. MamB взаимодействует с несколькими белками, включая домен PDZ1 MamE. Любая генетическая модификация MamB ведет к потере функции, а сайт-специфичный мутагенез внутри MamM ведет к усиленному образованию магнитных частиц. Полученные данные свидетельствуют, что MamB и MamM имеют сложные функции и участвуют в контроле ключевых этапов образования магнитосомы благодаря их взаимодействию. Германия, Ludwig Maximillian Univ. Munich, Dept. Biol. I., Grosshademer Str., 2, D-82152 Martinsried

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: МАГНИТОСОМЫ
МЕМБРАННЫЕ
СБОРКА
БИОМИНЕРАЛИЗАЦИЯ
БЕЛОК
MAMB
MAMM
ФУНКЦИЯ
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Uebe, Rene; Junge, Katja; Henn, Verena; Poxleitner, Gabriele; Katzmann, Emanuel; Plitzko, Jurgen M.; Zarivach, Raz; Kasama, Takeshi; Wanner, Gerhard; Posfai, Mihaly; Bottger, Lars; Matzanke, Berthold; Schuler, Dirk

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 92.04-04В2.034

The genus Magnetospirillum gen. nov. description of magnetospirillum gryphiswaldense sp. nov. and transfer of Aquaspirillum magnetotacticum to Magnetospirillum magnetotacticum comb. nov [Text] / Karl Heinz Schleifer [et al.] // Sys. and Appl. Microbiol. - 1991. - Vol. 14, N 4. - P379-286 . - ISSN 0723-2020
Перевод заглавия: Род Magnetospirillum gen. nov. Описание Magnetospirillum gryphiswaldense sp. nov. и перенос Aquaspirillum magnetotacticum b Magnetospirillum magnetotacticum comb. nov
Аннотация: Из евтрофной реки в Германии выделена новая бактерия (штамм MSR-1), обладающая магнитотаксисом. В рез-те сравнительного изучения морфологии, ультраструктуры, биохимич. признаков и секвенирования 16S рРНК (16 S рДНК) установлено, что MSR-1 близок к Aquaspirillum magnetotacticum, и оба вида существенно отличаются от др. представителей р. Aquaspirillum. Более того, они относятся к 'альфа'-подклассу Proteobacteria, а A. serpens (типовой вид р. Aquaspirillum) - к 'бета'-подклассу. Поэтому авт. предлагают выделить MSR-1 и A. magnetotacticum в новый род Magnetospirillum в качестве M. gryphiswaldense sp. nov. и M. magnetotacticum, соответственно, и дают его описание. Спириллы (0,2- 0,7*1-20 мкм), грамотрицательные, подвижные благодаря наличию биполярных жгутиков. В цитоплазме содержатся цепочки магнетосом. Микроаэрофилы. Хемоорганотрофы. Содержат или не содержат каталазу и оксидазу. Растут в рез-те использования органич. к-т, редко углеводов. Содержание ГЦ в ДНК 64-71%. Тип, вид M. gryphiswaldense с типовым штаммом MSR-1. Библ. 30. ФРГ, Lehrstuhl fur Mikrobiol., Technische Univ. Munchen, W 8000 Munchen 2.

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: НОВЫЕ РОДЫ
МАГНИТНЫЕ БАКТЕРИИ
MAGNETOSPIRILLUM MAGNETOTACTICUM (BACT.)
MAGNETOSPIRILLUM GRYPHISWALDENSE (BACT.)
ШТАММ MSR-1
ГЕНОСИСТЕМАТИКА
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Schleifer, Karl Heinz; Schuler, Dirk; Spring, Stefan; Weizenegger, M.; Amann, R.; Ludwig, Wolfgang; Kohler, Manfred

1-20 21-21

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска