СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>A=Danchin, Antoine$<.>)

Общее количество найденных документов : 57
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-57

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.05-04Б4.87

Conformational transitions within the calmodulin-binding site of Bordetella pertussis adenylate cyclase studied by time-resolved fluorescence of Trp242 and circular dichroism [Text] / Ahmed Bouhss [et al.] // Eur. J. Biochem. - 1996. - Vol. 237, N 3. - P619-628 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Конформационные переходы в кальмодулин-связывающем центре аденилатциклазы Bordetella pertussis, исследованные с помощью разрешенной по времени флуоресценции Trp242 и кругового дихроизма
Аннотация: С помощью кинетической флуоресцентной спектроскопии исследовали свойства пептидов аденилатциклазы Bordetella pertussis различной длины и с различным сродством к кальмодулину, но с той же последовательностью вокруг Trp242. Их динамические свойства сравнивали со свойствами каталитического домена аденилатциклазы, соотв-щего первым 400 аминокислотным остаткам белка, и его мутанта, в к-ром остаток Trp69 заменен на Phe. Гетерогенность затухания интенсивности флуоресценции Trp242, по-видимому, возникает благодаря равновесию между конформерами, что подтверждается данными по влиянию трифторэтанола как на содержание вторичной структуры, так и на распределение времен жизни флуоресценции; на последнее сильно влияет связывание кальмодулина, отбирая главную популяцию возбужденных состояний, т. е. один главный конформер. Trp242 в комплексе все еще обладает определенной степенью вращательной свободы. Уменьшение вращательной свободы более важно для более коротких пептидов, чем для более длинных. Аналогичный отбор одного главного конформера с тем же временем жизни флуоресценции наблюдается также для Trp242 в мутантном белке при связывании кальмодулина, а также для комплексов с пептидами. Сделан вывод, что центр взаимодействия аденилатциклазы с кальмодулином обладает такой же конформационной гибкостью, как и в изолированных пептидах. Полагают, что это свойство молекулы обеспечивает лучшую подгонку фермента к кальмодулину при их взаимодействии. Франция, Lab. I'Utilisation Rayonnement Electromagnetique, Univ. Paris Sud, F-91405 Orsay-Cedex. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: АДЕНИЛАТЦИКЛАЗА
КАЛЬМОДУЛИН-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ЦЕНТР
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ПЕРЕХОДЫ
ФЛУОРЕСЦЕНЦИЯ И КД
BORDETELLA PERTUSSIS

Доп.точки доступа:
Bouhss, Ahmed; Vincent, Michel; Munier, Helene; Gilles, Anne-Marie; Takahashi, Masayuchi; Barzu, Octavian; Danchin, Antoine; Gallay, Jacques

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.09-04Б2.133

Conformational transitions within the calmodulin-binding site of Bordetella pertussis adenylate cyclase studied by time-resolved fluorescence of Trp242 and circular dichroism [Text] / Ahmed Bouhss [et al.] // Eur. J. Biochem. - 1996. - Vol. 237, N 3. - P619-628 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Конформационные переходы в кальмодулин-связывающем центре аденилатциклазы Bordetella pertussis, исследованные с помощью разрешенной по времени флуоресценции Trp242 и кругового дихроизма
Аннотация: С помощью кинетической флуоресцентной спектроскопии исследовали свойства пептидов аденилатциклазы Bordetella pertussis различной длины и с различным сродством к кальмодулину, но с той же последовательностью вокруг Trp242. Их динамические свойства сравнивали со свойствами каталитического домена аденилатциклазы, соотв-щего первым 400 аминокислотным остаткам белка, и его мутанта, в к-ром остаток Trp69 заменен на Phe. Гетерогенность затухания интенсивности флуоресценции Trp242, по-видимому, возникает благодаря равновесию между конформерами, что подтверждается данными по влиянию трифторэтанола как на содержание вторичной структуры, так и на распределение времен жизни флуоресценции; на последнее сильно влияет связывание кальмодулина, отбирая главную популяцию возбужденных состояний, т. е. один главный конформер. Trp242 в комплексе все еще обладает определенной степенью вращательной свободы. Уменьшение вращательной свободы более важно для более коротких пептидов, чем для более длинных. Аналогичный отбор одного главного конформера с тем же временем жизни флуоресценции наблюдается также для Trp242 в мутантном белке при связывании кальмодулина, а также для комплексов с пептидами. Сделан вывод, что центр взаимодействия аденилатциклазы с кальмодулином обладает такой же конформационной гибкостью, как и в изолированных пептидах. Полагают, что это свойство молекулы обеспечивает лучшую подгонку фермента к кальмодулину при их взаимодействии. Франция, Lab. I'Utilisation Rayonnement Electromagnetique, Univ. Paris Sud, F-91405 Orsay-Cedex. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: АДЕНИЛАТЦИКЛАЗА
КАЛЬМОДУЛИН-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ЦЕНТР
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ПЕРЕХОДЫ
ФЛУОРЕСЦЕНЦИЯ И КД
BORDETELLA PERTUSSIS

Доп.точки доступа:
Bouhss, Ahmed; Vincent, Michel; Munier, Helene; Gilles, Anne-Marie; Takahashi, Masayuchi; Barzu, Octavian; Danchin, Antoine; Gallay, Jacques

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.10-04Б2.115

Crecy-Lagard, Valerie de.
Fructose phosphotransferase system of Xanthomonas campestris pv. campestris: Characterization of the fruB gene [Text] / Valerie de Crecy-Lagard, Marie Binet, Antoine Danchin // Microbiology. - 1995. - Vol. 141, N 9. - P2253-2260 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Система фруктозо-трансферазы Xanthomonas campestris pv. campestris: характеристика гена fruB
Аннотация: Авторы клонировали и секвенировали ген fruB Xanthomonas campestris pv. campestris, связанный со специфической фосфотрансферазной системой фруктозы. Показали, что fruB, также как и локализованный выше ген fruK, являются частью единой транскрипционной единицы. Полученные данные показывают сходство (46%) белка, кодируемого fruB, и соответствующего белка Rhodobacter capsulatus. Франция, Unite de Regulation de l'Expression genetique, Inst. Pasteur, 75724 Paris cedex 15. Ил. 5. Табл. 1. Библ. 52

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: САХАРА
ФРУКТОЗА
ТРАНСПОРТ
МЕХАНИЗМ
ГЕНЫ
ГЕН ТРАНСПОРТА ФРУКТОЗЫ FRUB
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
XANTHOMONAS CAMPESTRIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Binet, Marie; Danchin, Antoine

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.10-04Б2.176

CMP kinase from Escherichia coli is structurally related to other nucleoside monophosphate kinases [Text] / Nadia Bucurenci [et al.] // J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 5. - P2865-2862 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: ЦМФ киназа Escherichia coli структурно родственна другим нуклеозидмонофосфаткиназам
Аннотация: ЦМФ киназа E. coli имеет незначительное сходство последовательности аминокислот с другими нуклеозидмонофосфат (НМФ) киназами. Однако, наличие консервативных остатков, участвующих в связывании субстрата и в катализе, указывает на сохранение общей укладки, найденной у других НМФ киназ. Очищенная до гомогенного состояния ЦМФ кристаллизуется с образованием кристаллов гексагональной формы (a=b=82,3 A, c=60,7 A, группа P6[3]). При возбуждении при 295 нм ЦМФ киназа дает флюоресцентный спектр испускания с максимумом при 328 нм. ЦМФ киназа активна в присутствии АТФ, дАТФ или ГТФ в качестве доноров и ЦМФ, дЦМФ и арабинофуранозил-ЦМФ в качестве акцепторов. Связывание с ЦМФ усиливает сродство ЦМФ киназы к АТФ или АДФ. Франция, Unite Biochim. Regulations Cell., Inst. Pasteur, 28, rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.17

ВИНИТИ 341.27.17.09.15
Рубрики: ЦДФ-КИНАЗА
СТРУКТУРА
СХОДСТВО
НУКЛЕОЗИДМОНОФОСФАТКИНАЗА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Bucurenci, Nadia; Sakamoto, Hiroshi; Briozzo, Pierre; Palibroda, Nicolae; Serina, Lidia; Sarfati, Robert S.; Labesse, Gilles; Briand, Gilbert; Danchin, Antoine; Barzu, Octavian; Gilles, Anne-Marie

РЖ ВИНИТИ 34 (BI13) 97.12-04Б3.105

CMP kinase from Escherichia coli is structurally related to other nucleoside monophosphate kinases [Text] / Nadia Bucurenci [et al.] // J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 5. - P2865-2862 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: ЦМФ киназа Escherichia coli структурно родственна другим нуклеозидмонофосфаткиназам
Аннотация: ЦМФ киназа E. coli имеет незначительное сходство последовательности аминокислот с другими нуклеозидмонофосфат (НМФ) киназами. Однако, наличие консервативных остатков, участвующих в связывании субстрата и в катализе, указывает на сохранение общей укладки, найденной у других НМФ киназ. Очищенная до гомогенного состояния ЦМФ кристаллизуется с образованием кристаллов гексагональной формы (a=b=82,3 A, c=60,7 A, группа P6[3]). При возбуждении при 295 нм ЦМФ киназа дает флюоресцентный спектр испускания с максимумом при 328 нм. ЦМФ киназа активна в присутствии АТФ, дАТФ или ГТФ в качестве доноров и ЦМФ, дЦМФ и арабинофуранозил-ЦМФ в качестве акцепторов. Связывание с ЦМФ усиливает сродство ЦМФ киназы к АТФ или АДФ. Франция, Unite Biochim. Regulations Cell., Inst. Pasteur, 28, rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 44

ГРНТИ	34.27.39

ВИНИТИ 341.27.39.09.07
Рубрики: ЦДФ-КИНАЗА
СТРУКТУРА
СХОДСТВО
НУКЛЕОЗИДМОНОФОСФАТКИНАЗА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Bucurenci, Nadia; Sakamoto, Hiroshi; Briozzo, Pierre; Palibroda, Nicolae; Serina, Lidia; Sarfati, Robert S.; Labesse, Gilles; Briand, Gilbert; Danchin, Antoine; Barzu, Octavian; Gilles, Anne-Marie

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.04-04Б2.114

Escherichia coli UMP-kinase, a member of the aspartokinase family, is a hexamer regulated by guanine nucleotides and UTP [Text] / Lidia Serina [et al.] // Biochemistry. - 1995. - Vol. 34, N 15. - P5066-5074 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Член аспартокиназного семейства УМФ-киназа Escherichia coli является гексамером, регулируемым гуаниновыми нуклеотидами и УТФ
Аннотация: Клонирован и секвенирован ген pyrH УМФ-киназы (I) Escherichia coli. Он имеет длину 723 п. н. и идентичен гену smbA, участвующему в распределении хромосом. I не гомологична известным нуклеозидмонофосфаткиназам, но гомологична аспартокиназам, глутаматкиназам и карбаматкиназе Pseudomonas aeruginosa. I гиперэкспрессирована в E. coli и изучены структурные и кинетич. свойства ее гомогенного препарата. I состоит из 6 одинаковых субъединиц длиной 240 остатков (N-концевой мет отсутствует в зрелой I). При возбуждении светом 295 нм I имеет максимум спектра флуоресценции при 332 нм. Это показывает, что единственный остаток трп в I (трп[119]) находится в гидрофобном окружении. ГТФ служит аллостерич. активатором, а УТФ - аллостерич. ингибитором I. УДФ и УТФ, но не другие нуклеотиды (ГТФ, АТФ и УМФ), усиливают флуоресценцию I. Сигмоидная форма кривой доза - ответ свидетельствует о кооперативности связывания УДФ и УТФ. I с заменой D201N, ответственной за фенотип измененной морфологии клеток E. coli, имеет пониженную в 10 раз активность и измененные стабильность и регуляторные свойства. Это согласуется с предположением, что I лишь косвенно участвует в делении клеток. Франция, Unite de Biochim. des Regulation Cellulaire, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 57

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН УМФ-КИНАЗЫ PYR
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ГИПЕРЭКСПРЕССИЯ
УМФ-КИНАЗА
СТРУКТУРНЫЕ СВОЙСТВА
КИНЕТИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Serina, Lidia; Blondin, Catherine; Krin, Evelyne; Sismeiro, Odile; Danchin, Antoine; Sakamoto, Hiroshi; Giles, Anne-Marie; Barzu, Octavian

РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 99.02-04И2.103

On proteins of the microsporidian invasive apparatus: Complete sequence of a polar tube protein of Encephalitozoon cuniculi [Text] / Frederic Delbac [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 3. - P825-834 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Белки инвазионного аппарата микроспоридий: полная аминокислотная последовательность белка полярной трубки Encephalitozoon cuniculi
Аннотация: Из геномной клонотеки микроспоридия E. cuniculi выделена нуклеотидная последовательность гена, кодирующего один из белков семейства PTP - эти "белки полярных трубок" являются важными факторами вирулентности микроспоридий, к-рые обусловливают широко распространенные инвазии при СПИДе. Расшифрованная последовательность полипептида состоит из 395 аминокислот, 22 из к-рых приходятся на сигнальный участок: расчетная мол. масса зрелого пептида - 37230 Д, - что соответствует прямой оценке, полученной с помощью электрофореза в полиакриламидном геле (37 кД). Подтверждено присутствие в составе полипептида 4 26-аминокислотных повторяющихся участков. Отмечено, что сколько-нибудь существенное сходство с ранее исследованными белками различных организмов не обнаруживается. Осуществлена модельная экспрессия выделенного гена в клетках кишечной палочки: исследованы кинетические и биохимические св-ва рекомбинантного продукта. Обсуждаются перспективы использования полученных данных для разработки новых стратегий в терапии микроспоридиозов. Франция, Protistol. Mol. et Cell. Parasites Opportunistes, LBCP, URESA CNRS 6023, Univ. B. Pascal, F-63177 Aubiere Cedex. Библ. 53

ГРНТИ	34.33.23

ВИНИТИ 341.33.23.15.15.15.17
Рубрики: ENCEPHALITOZOON CUNICULI (PROT.)
ПОЛЯРНАЯ ТРУБКА
ПРОТЕИНЫ
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
ФАКТОРЫ ПАТОГЕННОСТИ

Доп.точки доступа:
Delbac, Frederic; Peyret, Pierre; Metenier, Guy; David, Danielle; Danchin, Antoine; Vivares, Christian P.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.160

Bacillus subtilis devoile ses genes [Text] / Antoine Danchin [et al.] // Biofutur. - 1998. - N 174. - P14-17 . - ISSN 0294-3506
Перевод заглавия: Bacillus subtilis раскрывает свои гены
Аннотация: Обзор. Завершено секвенирование генома Bacillus subtilis длиной 421481 п. н. Сравнение предсказанных последовательностей позволило приписать функции 58% белков. Из 4100 генов Bac. subtilis по меньшей мере 212 являются регуляторными. В геноме обнаружены 6 профагов или их остатков, содержащих от 15 до 160 генов. Многие гены Bac. subtilis являются многокопийными (число копий равно 2, 3, 4 и 5 соотв. для 284, 91, 168 и 100 генов). Франция, Unite Biochim. Microbienne, Inst. Pasteur, 750015 Paris

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНЫ
КОЛИЧЕСТВО КОПИЙНОСТЬ
БЕЛОК
ФУНКЦИИ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Danchin, Antoine; Glasser, Philippe; Kunst, Frank; Moszer, Ivan; Rapoport, Georges

РЖ ВИНИТИ 76 (BI38) 99.10-04А3.94

IMAGENE: An integrated computer envitronment for sequence annotation and analysis [Text] / Claudine Medique [et al.] // Bioinformatics. - 1999. - Vol. 15, N 1. - P2-15 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: IMAGENE: интегрированное компьютерная среда для представления и анализа последовательностей
Аннотация: Создана первая версия системы IMAGENE для максимально полного и всестороннего описания и анализа нуклеотидных и аминокислотных последовательностей. Рассмотрена общая архитектура этой системы, положенные в ее основу стратегические принципы и функциональные возможности. Система предназначена для работы на достаточно мощных рабочих станциях и распространяется бесплатно на лицензионной основе через сайт http://wwwabi.snv.jussieu.fr/imagene. Франция, Inst. Pasteur, REG, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 36

ГРНТИ	76.03.59

ВИНИТИ 761.03.59.09.29.09
Рубрики: НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ОПИСАНИЕ
АНАЛИЗ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ ПРОГРАММЫ
ПРОГРАММА IMAGENE

Доп.точки доступа:
Medique, Claudine; Rechenmenn, Francois; Danchin, Antoine; Viari, Alain

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.10-04Б2.167

Sekowska, Agnieszka.
Characterization of polyamine synthesis pathway in Bacillus subtilis 168 [Text] / Agnieszka Sekowska, Philippe Bertin, Antoine Danchin // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 29, N 3. - P851-858 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Характеристика пути синтеза полиаминов у Bacillus subtilis 168
Аннотация: Показано, что у Bacillus subtilis 168 имеется единственный путь биосинтеза полиаминов (I), к-рый начинается от аргинина и использует в кач-ве промежуточного продукта агматин. Идентифицирован ген аргининдекарбоксилазы speA (ранее cad). Описан оперон speE speB, направляющий синтез спермидинсинтазы и агматиназы (II). Он транскрибируется с образованием двух мРНК: главная соответствует одному гену speE, а минорная - обоим генам. Методом удлинения праймера картирован стартовый сайт транскрипции оперона. Анализ транскрипции оперона показал, что уровень синтеза II очень низок. Это обеспечивает строгий контроль синтеза путресцина и всех I. Полученные данные согласуются с уровнем I, измеренным в клетках. Франция, Regulation Expression Genetique, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 26

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: МЕТАБОЛИЗМ
ПОЛИАМИНЫ
СИНТЕЗ
ОПЕРОНЫ
ОПЕРОН SPE BE
КЛОНИРОВАНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ФЕРМЕНТЫ
АРГИНИНДЕКАРБОКСИЛАЗА SPEA
СПЕРМИДИН-СИНТАЗА SPEE
АГМАТИНАЗА SPEB
ФУНКЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bertin, Philippe; Danchin, Antoine

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.89

Danchin, Antoine.
Biochimie et Genetique moleculaire [Text] / Antoine Danchin // Lett. Inst. Pasteur. - 1998. - N 22. - P9-10 . - ISSN 1243-8863
Перевод заглавия: Биохимия и молекулярная генетика
Аннотация: Основными направлениями исследований в Отделе биохимии и молекулярной генетики Института Пастера (Париж) являются: 1) введение искусственных оснований в хромосомы; 2) механизмы устранения измененных белков, накапливающихся при старении; 3) "репарация" белков, поврежденных клеточным дыханием; 4) структурный анализ белков и их взаимодействий с субстратами; 5) изучение цианобактерий и поддержание коллекции 600 штаммов организмов из биосферы; 6) участие в секвенировании генома Bacillus subtilis; 7) изучение гена переносчика Fe у трансгенных мышей; 8) изучение на трансгенных мышах 3 белков человека, участвующих в обмене холестерина

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.01
Рубрики: БИОХИМИЯ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА
НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
ПАСТЕРА ИНСТИТУТ
ОТДЕЛ БИОХИМИИ И МОЛЕКУЛЯРНОЙ ГЕНЕТИКИ

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.11-04Б4.74

Effects of site-directed mutagenesis of protolytic residues in subunit I of Bacillus subtilis aa[3]-600 quinol oxidase. Role of lysine 304 in proton translocation [Text] / Gaetano Villani [et al.] // Biochemistry. - 1999. - Vol. 38, N 8. - P2287-2294 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Эффекты сайт-адресованного мутагенеза протолитических остатков в субъединице I хинолоксидазы aa[3]-600 Bacillus subtilis: роль лизина-304 в транслокации протонов
Аннотация: Исследовали функциональные последствия сайт-адресованного мутагенеза с заменами протолитических остатков на гидрофобные в субъединице I aa[3]-600-хинолоксидазы (ХО) B. subtilis. Идентифицированы 2 мутации (Y284F и K304L), нарушающие биоэнергетические функции этого микроорганизма. Мутация Y284F подавляет электрон-транспортную активность ХО и нарушает ее взаимодействие с CO и с H[2]H[2], т. е. вызывает деструкцию двухъядерного домена ХО. Мутация K304L не нарушает этих функций ХО, но блокирует активность ХО как протонного насоса. Сделан вывод, что остаток K304 консервативен для всех гем-медь-оксидаз и необходим для протон-транслоцирующей активности этих ферментов. Италия, Inst. Med. Biochem., Chem., Univ., Bari. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: ХИНОЛОКСИДАЗА AA[3]-600
СУБЪЕДИНИЦА I
РОЛЬ LYS-304
ПЕРЕНОС ПРОТОНОВ
МУТАЦИИ
ВЛИЯНИЕ
BACILLUS SUBTILIS

Доп.точки доступа:
Villani, Gaetano; Capitanio, Nazzareno; Bizzoca, antonella; Palese, Luigi L.; Carlino, Valeria; Tattoli, Maria; Glaser, Philippe; Danchin, Antoine; Papa, Sergio

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.12-04Б2.239

Baranova, Natalya N.
Mta, a global MerR-type regulator of the Bacillus subtilis multidrug-efflux transporters [Text] / Natalya N. Baranova, Antoine Danchin, Alexander A. Neyfakh // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 5. - P1549-1559 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Mta - глобальный регулятор типа MerR транспортеров множественной лекарственной устойчивости Bacillus subtilis
Аннотация: Выделены мутанты Bacillus subtilis, гиперэкспрессирующие транспортеры множественной лекарственной устойчивости Bmr (I) и Bml (II). Они имеют мутации в локусе mta (315'ГРАДУС' генетич. карты), клонирование и секвенирование к-рого показало, что он кодирует глобальный транскрипц. активатор Mta (III) - член семейства MerR регуляторных белков. Индивидуально экспрессированный N-концевой домен связывания I с ДНК взаимодействует с промоторами генов bmr и bml и индуцирует их транскрипцию. Этот домен стимулирует экспрессию самого гена mta и гена ydfK, кодирующего гипотетич. мембранный белок. Эти данные и гомология I с индуцируемым тиострептоном белком TipA Streptococcus lividans позволили предположить, что I является аутогенно контролируемым глобальным регулятором транскрипции, активность к-рого стимулируется неидентифицированным индуктором. Эта стимуляция имитируется удалением N-концевого домена III, связывающего индуктор. Т. к. I и II контролируются одним и тем же III, можно предположить, что некоторые функции I и II одинаковы или родственны. США, Ctr. for Pharm. Biotechnol., Univ. Illinois, Chicago, IL 60607. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ТРАНСПОРТЕРОМ МНОЖЕСТВЕННОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ
РЕГУЛЯЦИЯ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
ГЛОБАЛЬНЫЙ РЕГУЛЯТОР ТРАНСКРИПЦИИ MTA
ФУНКЦИЯ
BACILLUS SUBTILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Danchin, Antoine; Neyfakh, Alexander A.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.01-04Б2.207

Rocha, Eduardo P. C.
Universal replication biases in bacteria [Text] / Eduardo P. C. Rocha, Antoine Danchin, Alain Viari // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 32, N 1. - P11-16 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Универсальные репликационные предпочтения у бактерий
Аннотация: Анализ 15 полных бактериальных геномов обнаружил важные предочтения в организации генов. Сильная асимметрия состава нуклеотидов между генами в ведущей нити и генами в отстающей нити наблюдается на уровне нуклеотидов, кодонов и даже аминокислотных остатков в кодируемых генами белках. Для нек-рых видов этот перекос так велик, что простого знания аминокислотной последовательности белка достаточно для почти безошибочного предсказания, с какой из нитей ДНК транскрибируется данный ген. Эти предпочтения являются универсальными, а не видоспецифичными. Полученные данные могут иметь важные последствия для понимания таких фундаментальных биологических процессов, как точность репликации, использование кодонов в генах и даже использование аминокислот в белках. Франция, Atelier Bioinformatique, Univ. Paris VI, 75005 Paris. Библ. 29

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
АНАЛИЗ
ГЕНЫ
ОРГАНИЗАЦИЯ
СОСТАВ НУКЛЕОТИДОВ
СИЛЬНАЯ АССИМЕТРИЯ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ТОЧНОСТЬ РЕПЛИКАЦИИ
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Danchin, Antoine; Viari, Alain

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.05-04Б2.299

Perrotte-Piquemal, Marina.
Pyrophosphate increases the efficiency of enterobactin-dependent iron uptake in Escherichia coli [Text] / Marina Perrotte-Piquemal, Antoine Danchin, Francis Biville // Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 3. - P245-253 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Пирофосфат повышает эффективность зависящего от энтеробактина поглощения железа у Escherichia coli
Аннотация: Добавление пирофосфата (I), аммоний-Fe{3+}-цитрата или FeCl[3] в минимальную среду М63, содержащую 1,7 мкМ Fe, повышает выход биомассы Escherichia coli. Из этих добавок только I вреден для штаммов, неспособных синтезировать энтеробактин (II). Т. обр. положительный эффект I связан с влиянием на энтеробактиновую систему поглощения в среде с низким содержанием Fe. В минимальной среде I репрессирует экспрессию генов, регулируемых белком Fur (III). В среде, богатой Fe, в к-рой синтез II значительно понижен, добавление I усиливает экспрессию генов, регулируемых III. Этот регуляторный эффект I усиливается в отсутствие синтеза II. Добавление I защищает клетки от окислительного стресса, вызванного присутствием H[2]O[2] в средах, богатых Fe. Эти данные показали, что I, действуя как хелатирующий Fe агент, запускает систему поглощения Fe, зависящую от II, и способствует усиленному связыванию Fe с II. Франция, Unite Regulation Expression Genet., Dep. Biochim. et. Genet., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 50

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ЖЕЛЕЗО
СИСТЕМА ПОГЛОЩЕНИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЭНТЕРОБАКТИН
ПИРОФОСФАТ
ФУНКЦИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
БИОМАССА
ВЫХОД

Доп.точки доступа:
Danchin, Antoine; Biville, Francis

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.07-04Б2.304

The structural and functional organization of H-NS-like proteins is evolutionarily conserved in Gram-negative bacteria [Text] / Philippe Bertin [et al.] // Mol. Microbiol. - 1999. - Vol. 31, N 1. - P319-329 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Структурная и функциональная организация H-NS-подобных белков эволюционно консервативна у грамотрицательных бактерий
Аннотация: Ранее гомологи белка H-NS (I) Escherichia coli были найдены у кишечных бактерий, Erwinia chrysanthemi и Haemophilus influenzae. Кроме того, у Bordetella pertussis белок BpH3 (II) имеет небольшую гомологию с I, особенно в N-концевом домене. Белок-активатор HvrA (III) Rhodobacter capsulatus также имеет небольшую, но достоверную гомологию с I. С использованием предсказания вторичной структуры и моделирования домена связывания с ДНК, основанного на аминок-тных последовательностях I-III и белка StpA (похожего на I белка E. coli), а также изучения комплементации связанных с I фенотипов и конкурентного сдвига ЭФ-подвижности доказано, что эти белки принадлежат к одному классу связывающихся с ДНК белков. Анализ in silico позволил предположить, что к этому семейству относятся также III из R. sphaeroides, XrvA из Xanthomonas oryzae и VirH из Vibrio cholerae. Т. обр. белки, структурно и функционально родственные I, широко распространены у грам-отрицательных бактерий. Франция, Unite Regulation Expression Getet., Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 55

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: БЕЛОК
H-NS
ГОМОЛОГИЯ
БЕЛОК BPH3
BORDETELLA PERTUSSIS (BACT.)
БЕЛОК HVR A
RHODOBACTER CAPSULATUS (BACT.)
ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ
СТРУКТУРА ВТОРИЧНАЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ
ЭВОЛЮЦИОННАЯ КОНСЕРВАТИВНОСТЬ
ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Bertin, Philippe; Benhabiles, Nora; Krin, Evelyne; Laurent-Winter, Christine; Tendeng, Christian; Turlin, Evelyne; Thomas, Annick; Danchin, Antoine; Brasseur, Robert

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.08-04Б2.155

Aeromonas hydrophila adenylyl cyclase 2: A new class of adenylyl cyclases with thermophilic properties and sequence similarities to proteins from hyperthermophilic archaebacteria [Text] / Odile Sismeiro [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 13. - P3339-3344 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Аденилилциклаза-2 Aeromonas hydrophila: новый класс аденилилциклаз с термофильными свойствами и гомологией последовательности с белками из гипертермофильных археев
Аннотация: При комплементации мутанта cya Escherichia coli геномной библиотекой Aeromonas hydrophila выделены клоны с 2 разными генами аденилилциклаз (I). Ген cyaA кодирует I-1, гомологичную известным I, а ген cyaB - новую I-2, не имеющую гомологов в базах данных и не гомологичную 3 известным классам I. Очищенная I-2 имеет высокие оптимальные т-ру (65'ГРАДУС') и pH (9,5). Гены cyaA и cyaB инактивированы в хромосоме A. hydrophila. Показано, что в отличие от cyaA, ген cyaB не экспрессируется в обычных лабораторных условиях роста. Однако введение плазмиды с геном cyaB в мутанты cyaA и cyaA cyaB вызывает образование цАМФ. I-2 является первым членом нового класса I, не имеющим гомологов у др. организмов. Однако обнаружена гомология I-2 с продуктами генов 3 термофильных археев: Methanobacterium thermoautotrophicum, Archaeoglobus fulgidus и Methanococcus jannaschii. Франция, Dep. Biol. et Genet. Mol., Inst. Pasteur, 75015 Paris. Библ. 28

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН АДЕНАЛИЛЦИКЛАЗЫ-1 CYAA
ГЕН АДЕНИЛИЛЦИКЛАЗЫ-2 CYAB ВЫДЕЛЕНИЕ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
АДЕНИЛИЛЦИКЛАЗА-2
ГОМОЛОГИЯ
ПРОДУКТЫ ГЕНОВ
ГИПЕРТЕРМОФИЛЬНЫЕ АРХЕИ

Доп.точки доступа:
Sismeiro, Odile; Trotot, Pascale; Biville, Francis; Vivares, Christian; Danchin, Antoine

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.09-04Б2.253

Mutational analysis of UMP kinase from Escherichia coli [Text] / Nadia Bucurenci [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 3. - P473-477 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Мутационный анализ УМФ-киназы из Escherichia coli
Аннотация: Хотя УМФ-киназа Escherichia coli (I) не гомологична др. нуклеозидмонофосфаткиназам, 2 ее сегмента (остатки 35-78 и 145-194) идентичны соотв. фосфоглицераткиназе (на 28%) и аспартокиназе (на 30%). Исходя из этих гомологий, выбрано несколько остатков I в кач-ве мишеней для сайт-направленного мутагенеза. Биохимич., генетич. и спектроскопич. анализ модифицированных I идентифицировал остатки, существенные для катализа (асп[146]), связывания УМФ (асп[174]) и взаимодействия с аллостерич. эффекторами ГТФ и УТФ (арг[62] и асп[77]). Франция, Lab. Chim. Structurales Macromolecules, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 18

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: УМФ-КИНАЗА
САЙТ-НАПРАВЛЕННЫЙ МУТАГЕНЕЗ
ОСТАТКИ СУЩЕСТВЕННЫЕ ДЛЯ КАТАЛИЗА
СВЯЗЫВАНИЕ УМФ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С АЛЛОСТЕРИЧЕСКИМИ ЭФФЕКТОРАМИ
ГТФ
УТФ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bucurenci, Nadia; Serina, Lidia; Zaharia, Cristina; Landais, Stphanie; Danchin, Antoine; Barzu, Barzu

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 00.11-04А3.900

Danchin, Antoine.
A brief history of genome research and bioinformatics in France [Text] / Antoine Danchin // Bioinformatics. - 2000. - Vol. 16, N 1. - P65-75 . - ISSN 1367-4803
Перевод заглавия: Биоинформатика и краткая история изучения генома во Франции
Аннотация: Медленное развитие геномики in silico во Франции обусловлено различными политическими причинами. В кратком обзоре рассмотрена деятельность 2 организаций, координирующих развитие геномики и биоинформатики во Франции: Groupement de Recherche sur les Genomes (GREG) и Groupement de Recherche 1029 (GDR 1029), входящих в Национальную академию наук (CNRS). Франция, Inst. Pasteur, 75724 Paris Cedex 15. Библ. 27

ГРНТИ	34.05.25

ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: БИОИНФОРМАТИКА
ГЕНОМИКА
ФРАНЦИЯ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 57

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.04-04Б2.269

Immunochemical analysis of UMP kinase from Escherichia coli [Text] / Stephanie Landais [et al.] // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 3. - P833-840 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Иммунохимический анализ УМФ-киназы из Escherichia coli
Аннотация: Изучено взаимодействие поликлональных и моноклональных антител (ПКА и МКА) с целой УМФ-киназой (I) и ее фрагментами, полученными методом делец. мутагенеза. Обнаружена иммунодоминантность C-концевой четверти I. ПКА ингибируют активность I с частичным или полным устранением аллостерич. эффектов УТФ и ГТФ соотв., что указало на частичное перекрывание сайтов связывания УТФ и ГТФ в I. МКА 44-2 (II) узнает линейный эпитоп остатков 171-180 в I. Замена D174N в I устраняет взаимодействие с II. С использованием ПКА показано, что: 1) при 2-мерном ЭФ I образует пятно с pI 7,24 и мол. м. 26 кД; 2) I расположена в клетках E. coli рядом с мембранами. Такая локализация I объясняется св-вами агрегации I in vitro и указывает на возможную роль I в клеточном делении. Франция, Lab. Chim. Structurales Macromolecules, Inst. Pasteur, 75724 Paris. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.27.07
Рубрики: ФЕРМЕНТЫ
УМФ-КИНАЗА
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ИММУНОХИМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
ПОЛИКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА
МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Landais, Stephanie; Gounon, Pierre; Laurent-Winter, Christine; Mazie, Jean-Claude; Danchin, Antoine; Barzu, Octavian; Sakamoto, Hiroshi

1-20 21-40 41-57

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска