СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=PFGE<.>)

Общее количество найденных документов : 49
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-49

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 96.09-04Б4.150

Defontaine, A.
Contribution of various techniques of molecular analysis to strain identification of Candida glabrata [Text] / A. Defontaine, M. Coarer, J. P. Bouchara // Microb. Ecol. Health and Disease. - 1996. - Vol. 9, N 1. - P27-33 . - ISSN 0891-060X
Перевод заглавия: Возможности различных методов молекулярного анализа при идентификации штаммов Candida glabrata
Аннотация: An evaluation of genetic typing systems (PFGE, mtDNA-RFLP, RAPD) on 22 isolates of Candida glabrata (ex Torulopsis glabrata) was undertaken. This evaluation indicated that PFGE has the highest degree of discrimination. The other methods can be used as complementary techniques when ambiguous results occur with PFGE

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.09
Рубрики: CANDIDA GLABRATA (FUNGI)
ШТАММЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ
МЕТОДЫ
PFGE
MTDNA-RFLP
СРАВНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Coarer, M.; Bouchara, J.P.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 98.10-04Б4.148

Combined use of ribotyping, PFGE typing and IS341 typing in the discrimination of nosocomial strains of methicillin-resistant Staphylococcus aureus [Text] / Tatsumi Yoshida [et al.] // Microbiol. and Immunol. - 1997. - Vol. 41, N 9. - P687-695 . - ISSN 0385-5600
Перевод заглавия: Сочетанное использование риботипирования, PFGE-типирования и IS431-типирования для дискриминирования болезнетворных штаммов устойчивых к метициллину Staphylococcus aureus
Аннотация: 46 устойчивых к метициллину клинических изолятов Staphylococcus aureus, выделенных в больнице Малайского университета в 1987-89 гг., изучены методами риботипирования, PFGE-типирования с использованием гель-электрофореза в пульсирующем поле и IS431-типирования (полиморфизма длины рестрикц. фрагментов с зондом элемента IS431). Эти изоляты разбиты на 5 риботипов, 22 PFGE-типа и 15 IS431-типов. Сочетание всех 3 методов генотипирования позволило отнести 46 штаммов к 39 генотипам. Япония, Dep. of Bacteriol., Juntendo Univ., Tokyo 113. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
КЛИНИЧЕСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
РИБОТИПИРОВАНИЕ
PFGE-ТИПИРОВАНИЕ
IS431-ТИПИРОВАНИЕ
39 ГЕНОТИПОВ
ОБНАРУЖЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Yoshida, Tatsumi; Kondo, Noriko; Hanifah, Yasmin Abu; Hiramatsu, Keiichi

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 98.12-04Б4.71

Iteman, I.
Comparison of three molecular methods for typing and subtyping pathogenic Yersinia enterocolitica strains [Text] / I. Iteman, A. Guiyoule, E. Carniel // J. Med. Microbiol. - 1996. - Vol. 45, N 1. - P48-56 . - ISSN 0022-2615
Перевод заглавия: Сравнение трех молекулярных методов для типирования и субтипирования патогенных штаммов Yersinia enterocolitica
Аннотация: Провели сравнительное исследование трех молекулярных методов (гель-электрофореза в пульсирующем поле (PFGE), риботипирование и рестрикционный анализ плазмид (REAP) вирулентности) для типирования штаммов Yersinia enterocolitica. Показано, что существует высокая степень корреляции между результатами, полученными всеми этими методами. Все штаммы на основании полученных данных подразделены на 3 кластера. Внутри III кластера можно выделить отдельные группы штаммов, больше или меньше связанные между собой. Метод PFGE является перспективным для эпидемиологических исследований. Ил. 4. Табл. 4. Библ. 26

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.25
Рубрики: YERSINIA ENTEROCOLITICA (BACT.)
СУБТИПИРОВАНИЕ
МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕТОДЫ
PFGE
REAP

Доп.точки доступа:
Guiyoule, A.; Carniel, E.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 99.03-04Б4.136

Use of multilocus enzyme electrophoresis to examine genetic relationships amongst isolates of Mycobacterium intracellulare and related spacies [Text] / Mohammad M. Feuzabedi [et al.] // Microbiology. - 1997. - Vol. 143, N 4. - P1461-1469 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Использование электрофореза мультилокусных ферментов для исследования генетических связей между изолятами Mycobacterium intracellulare и родственными видами
Аннотация: Использован электрофорез мультилокусных ферментов для оценки генетических связей у австралийских клинических изолятов и контрольных штаммов Mycobacterium intracellulare. Кроме того, определили генетическую связь между названными бактериями и австралийскими изолятами микобактерий, полученных от больных ВИЧ, а также контрольными штаммами M. scrofylaceum и другими микобактериями. Техника PFGE была использована для выяснения возможности дальнейшей дифференциации между родственными штаммами. Австралия, Sch. of Veterinary Studies, Murdoch Univ., Murdoch, Western Australia 6150. Ил. 2. Табл. 3. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.25.09
Рубрики: MYCOBACTERIUM INTRACELLULARE (BACT.)
АВСТРАЛИЙСКИЕ КЛИНИЧЕСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВЯЗИ
МЕТОДЫ
PFGE
МУЛЬТИЛОКУСНЫЕ ФЕРМЕНТЫ
ЭЛЕКТРОФОРЕЗ

Доп.точки доступа:
Feuzabedi, Mohammad M.; Robertson, Ian D.; Cousins, Debby V.; Dawson, David J.; Hampson, David J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 00.11-04Б4.145

Typages compares de Staphylococcus caprae par trois techniques moleculaires: Amplification de l'espace intergenique 16-23S (ITS), amplification genique aleatoire (RAPD) et electrophorese en champ pulse (PFGE) [Text] / A. Kodjo [et al.] // Rev. med. vet. - 1999. - Vol. 150, N 1. - P27-32 . - ISSN 0035-1555
Перевод заглавия: Сравнительное типирование Staphylococcus caprae с помощью трех молекулярных методик: амплификация межгенных участков 16-23S (ITS), случайная генная амплификация (RAPD) и электрофорез в импульсном поле (PFGE)
Аннотация: Девяносто пять штаммов, принадлежащих к роду Staphylococcus caprae (88 штаммов, выделенных от коз, и 7 штаммов, выделенных от человека), были подвергнуты молекулярному типированию с помощью амплификации межгенных участков 16-23S (ITS), случайной амплификации полиморфной ДНК (RAPD) и электрофореза в импульсном поле (PFGE). Для сравнения в исследование включили дополнительно тридцать восемь типовых видов рода Staphylococcus. Результаты RAPD указывали на высокую гомогенность штаммов вида S. caprae, в то время как методика ITS для данного вида была несколько более информативной и позволяла различать штаммы по их зоологическому происхождению. Т. о., эти две методики представляют интерес в плане идентификации S. caprae, однако их разрешающая способность оказалась недостаточной, в отличие от методики PFGE, к-рая является молекулярным методом выбора для эпидемиологического прослеживания. Считают, что RAPD следует рассматривать как наиболее интересный таксономический маркер - быстрый, точный и применимый для скрининга и текущей идентификации вида Staphylococcus caprae. Франция, Unite de Microbiol. et d'Epidemiol., Ecole Nationale Veterinaire de Lyon, 1, Avenue Bourgelat, F-69280 Marcy l'Etoile. Библ. 18

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS CAPRAE (BACT.)
МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
ITS
RAPD
PFGE

Доп.точки доступа:
Kodjo, A.; Larcher, C.; Villard, L.; Richard, Y.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI05) 03.05-04И8.87

Genotypic analysis of Staphylococcus aureus from milk of dairy cows with mastitis in Argentina [Text] / F. R. Buzzola [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2001. - Vol. 126, N 3. - P445-452 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Генотипический анализ Staphyloccocus aureus из молока больных маститом коров в Аргентине
Аннотация: Оценили генотипический состав и генеалогические связи Staphylococcus aureus, выделенных из молока больных маститом коров в Аргентине в 1987-97 годах. Для этого 112 изолятов из 21 района Аргентины исследовали методами SmaI PFGE-типирования, автоматизированного EcoRI-риботипирования и рестриктазного анализа плазмидных ДНК (REAP). Обнаружили 4 кластера PFGE-полос из 13 риботипов. Показали наличие определенной связи между PFGE-генотипами и риботипами. REAP-анализ был полезен для дискриминации штаммов с идентичными PFGE-генотипами и риботипами. В исследованном материале выявили 2 наиболее распространенных штамма S. aureus и проследили изменения в их распространении на протяжении 8 лет. Аргентина, Dep. de Microbiol., Fac. de Med., Univ. de Buenos Aires, Paraguay 2155 P-12, (1121) Buenos Aires. Ил. 5. Библ. 31

ГРНТИ	34.23.59

ВИНИТИ 341.23.59.02.25
Рубрики: STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
МОЛОКО
КОРОВЫ БОЛЬНЫЕ МАСТИТОМ
АРГЕНТИНА 1987 Г. - 1997 Г.
ГЕНОТИПИЧЕСКИЙ СОСТАВ
ГЕНЕАЛОГИЧЕСКИЕ СВЯЗИ
МЕТОДЫ SMAI PFGE-ТИПИРОВАНИЕ
АВТОМАТИЗИРОВАННЫЙ ECORI-РИБОТИПИРОВАНИЕ
ПЛАЗМИДНЫЕ ДНК
РЕСТРИКТАЗНЫЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Buzzola, F.R.; Quelle, L.; Gomez, M.I.; Catalano, M.; Steele-Moore, L.; Berg, D.; Gentilini, E.; Denamiel, G.; Sordelli, D.O.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.130

Genomic relatedness within five common finnish Campylobacter jejuni pulsed-field gel electrophoresis genotypes studied by amplified fragment length polymorphism analysis, ribotyping, and serotyping [Text] / Marja-Liisa Hanninen [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2001. - Vol. 67, N 4. - P1581-1586 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Геномное родство Campylobacter jejuni финского происхождения, исследованное в 5 распространенных PFGE-генотипах с помощью анализа полиморфизма длин амплифицированных фрагментов, риботипирования и серотипирования
Аннотация: Провели сравнительное исследование 35 штаммов Campylobacter jejuni с помощью анализа PFGE-образцов, образцов полиморфизма длин амплифицированных фрагментов (AFLP), HaeIII-риботипов и теплостабильных (HS)-серотипов. Эти штаммы были выделены из людей и кур в 1997-98-ом г. в Финляндии и представляли собой 5 распространенных SmaI/SacII - PFGE - генотипических групп. Показали высокий дискриминирующий уровень PFGE, AFLP и HaeIII-риботипирования, позволивший распределить исследованные штаммы в одни и те же генотипические группы. Дискриминирующий уровень серотипирования был ниже, т. к. идентичные серотипы были обнаружены в разных генотипических группах. В целом, результаты проведенного исследования предполагают наличие генетически родственных групп C. jejuni, колонизирующих людей и кур. Финляндия, Dep. of Food and Environmental Hygiene, Fac. of Veterinary Med., Univ. of Helsinki, and Helsinki Univ. Central Hosp. Diagnostics, 00014 Univ. of Helsinki. Ил. 4. Табл. 1. Библ. 33

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: CAMPYLOBACTER JEJUNI (BACT.)
ШТАММЫ
ВЫДЕЛЕНИЕ
ЛЮДИ
КУРЫ
ФИНЛЯНДИЯ
ГЕНОМНОЕ РОДСТВО
МЕТОДЫ
PFGE-ОБРАЗЦЫ
МЕТОД AFLP
HAEIII-РИБОТИПЫ

Доп.точки доступа:
Hanninen, Marja-Liisa; Perko-Makela, Paivikki; Rautelin, Hilpi; Duim, Birgitta; Wagenaar, Jaap A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.132

Suitability of PCR fingerprinting, infrequent-restriction-site PCR, and pulsed-field gel electrophoresis, combined with computerized gel analysis, in library typing of Salmonella enterica serovar enteritidis [Text] / Javier Garaizar [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2000. - Vol. 66, N 12. - P5273-5281 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Применимость ПЦР-фингерпринтирования, ПЦР с использованием редкого сайта рестрикции и гель-электрофореза в пульсирующем поле в комбинацию с компьютеризированным анализом геля для создания библиотеки типирования Salmonella enterica серовара Enteritidis
Аннотация: Исследовали 212 штаммов Salmonella enterica различных сероваров и фаготипов методами ПЦР-фингерпринтирования, ПЦР с использованием редкого сайта рестрикции (IRS-ПЦР) и PFGE с целью создания компьютеризированной библиотеки типирования серовара Enteritidis. При этом сравнивали результаты, полученные в 3 лабораториях различных исследовательских центров. Межлабораторная воспроизводимость результатов была низкой для первого из указанных методов исследования, а для второго метода достигала 100% при низкой степени дискриминации. При использовании PFGE была показана как высокая воспроизводимость результатов (93,3%), так и высокая степень дискриминации. Авторы рекомендуют использовать этот метод в сочетании с компьютеризированным анализом ДНК-профилей в эпидемиологических исследованиях Salmonella серовара Enteritidis. Испания, Dep. of Immunol., Microbiol. and Parasitol., Basque Country Univ., 01080 Vitoria-Gasteiz. Табл. 3. Ил. 4. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
ШТАММЫ
КОМПЬЮТЕРИЗИРОВАННАЯ БИБЛИОТЕКА ТИПИРОВАНИЯ СЕРОВАРА ENTERITIDIS
МЕТОДЫ
МЕТОД ПЦР-ФИНГЕРПРИНТИРОВАНИЯ
IRS-ПЦР
PFGE

Доп.точки доступа:
Garaizar, Javier; Lipez-Molina, Nuria; Laconcha, Idoia; Baggesen, Dorte Lau; Rementeria, Aitor; Vivanco, Ana; Audicana, Ana; Perales, Ildefonso

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.06-04Б2.144

Random amplification of polymorphic DNA versus pulsed field gel electrophoresis of SmaI DNA macrorestriction fragments for typing strains of vancomycin-resistant enterococci [Text] / den Braak Nicole van [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2000. - Vol. 192, N 1. - P45-52 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Сравнение метода случайной амплификации полиморфной ДНК с использованием пульс-электрофореза SmaI макрорестрикционных фрагментов ДНК для типирования устойчивых к ванкомицину энтерококков
Аннотация: Сравнили два метода типирования устойчивых к ванкомицину энтерококков (VRE)-случайную амплификацию полиморфной ДНК (RAPD) и пульс-электрофорез рестриктов ДНК (PFGE). Собрали коллекцию из 100 штаммов Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis, Enterococcus avium, Enterococcus gallinarum и Enterococcus casseliflavus (50 изолятов из Нидерландов, 50 - из Англии). Штаммы анализировали, используя стандартные протоколы RAPD и PFGE анализов и компьютерные методы интерпретации результатов. Показали, что типирование VRE двумя данными методами привело к получению хорошо сопоставимых результатов по выделению кластеров ДНК анализируемых штаммов. Нидерланды, Erasmus Univ. Med. Centre Rotterdam EMRCR, Dep. of Med. Microbiology and Infectious Diseases, Dr. Molevaterplein 40, 3015 GD Rotterdam

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ДНК
АМПЛИФИКАЦИЯ
ПОЛИМОРФИЗМ
РЕСТРИКТЫ ДНК
УСТОЙЧИВОСТЬ
ВАНКОМИЦИН
МЕТОДЫ
ПЦР-КАРД
ПУЛЬС-ЭЛЕКТРОФОРЕЗ (PFGE)
ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ
ENTEROCOCCUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
van, den Braak Nicole; Power, Eddy; Anthony, Richard; Endtz, Hubert Ph.; Verbrugh, Henri A.; van, Belkum Alex

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 03.08-04Б4.78

Osek, Jacek.
Clonal analysis of Escherichia coli strains isolated from pigs with post-weaning diarrhea by pulsed-field gel electrophoresis [Text] / Jacek Osek // FEMS Microbiol. Lett. - 2000. - Vol. 186, N 2. - P327-331 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Клональный PFGE-анализ штаммов Escherichia coli, выделенных из свиней с диареей грудного возраста
Аннотация: 82 штамма Escherichia coli, выделенных из свиней с диареей грудного возраста, исследовали с помощью анализа полиморфиза длин фрагментов рестрикции (RFLP) хромосомной ДНК с использованием NotI и XbaI. Рестрикционные профили показали высокую степень полиморфизма среди изолятов различных серогрупп и близкое родство штаммов в пределах одной и той же серогруппы. Кроме того, показали, что некоторые штаммы с идентичными детерминантами вирулентности представлены разными типами PFGE. Авторы рассматривают RFLP- и PFGE-анализы хромосомной ДНК как чувствительные молекулярные методы для определения клональной природы и генетических различий у штаммов E. coli, связанных с диареей грудного возраста свиней. Польша, Dep. of Microbiology, National Veterinary Research Inst., Partyzantow 57, 24-100 Pulawy

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ИЗОЛЯТЫ
СВИНЬИ
ДИАРЕЯ
КЛОНАЛЬНЫЙ PFGE-АНАЛИЗ

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 03.11-04Б4.151

Study of an outbreak of Enterobacter cloacae sepsis in a neonatal intensive care unit: The application of epidemiologic chromosome profiling by pulsed-field gel electrophoresis [Text] / Shu-Chih Liu [et al.] // J. Offender Rehabil. - 2002. - Vol. 35, N 3-4. - P381-385 . - ISSN 1050-9674
Перевод заглавия: Исследование вспышки сепсиса, вызванного Enterobacter cloaceae в отделении интенсивной помощи новорожденным: применение PFGE для эпидемиологического хромосомного профилирования
Аннотация: Описано эпидемиологическое исследование 11 случаев сепсиса, вызванного Enterobacter cloaceae со сходной антимикробной чувствительностью, в отделении интенсивной помощи новорожденным в Тайване с октября 1996 г. по март 1997 г. В исследовании использовали PFGE-анализ XbaI- и NotI-рестриктов ДНК бактерий-изолятов. Показали, что вспышка сепсиса была вызвана двумя генотипами E. cloaceae. Тайвань, Shu-Chih Liu, MS, MD, Chung Shan Medical & Dental Coll. Hosp., Div. of Infectious Diseases, Dep. of Pediatrics, 120 Le Te Street., Taichung. Ил. 8. Табл. 1. Библ. 16

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.15.05
Рубрики: ЭПИДЕМИИ
СЕПСИС НОВОРОЖДЕННЫХ
ENTEROBACTER CLOACEAE (BACT.)
ГЕНОТИПЫ
PFGE-АНАЛИЗ
XBAI
NOTI РЕСТРИКТЫ
ТАЙВАНЬ
1996-1997 ГОДЫ

Доп.точки доступа:
Liu, Shu-Chih; Leu, Hsieh-Shong; Yen, Muh-Yong; Chou, Ming-Chih

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.02-04Б4.62

Soares, A. R.
Molecular epidemiology of Salmonella enteritidis phage type 1b and 6a isolates in Portugal [Text] / A. R. Soares, J. Machado // Epidemiol. and Infec. - 2003. - Vol. 131, N 1. - P607-612 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Молекулярная эпидемиология изолятов Salmonella enteritidis фаготипов 1b и 6a в Португалии
Аннотация: Salmonella enterica серотип Enteritidis является важным сероваром, включившим 76% изолятов сальмонелл в Португалии в 2001 году. Для лучшего понимания эпидемиологии сальмонеллезов 47 изолятов S. enteritidis фаготипа (ФТ) 1b и 6a были проанализированы с помощью электрофореза с меняющимся импульсом (PFGE). Геномная ДНК была подвергнута макрорестрикции с помощью рестриктазы Xba 1. Для изолятов ФТ 1b наблюдали только 3 различных образца, а для ФТ 6a наблюдали 10 образцов гидролиза. Главный образец среди изолятов ФТ 1b, по-видимому, совершенно похож на главный образец среди изолятов ФТ 6a. Но когда два образца были проанализированы с помощью Bionumerics, показали, что они имели некоторые различия. Заключили, что в 2001 году существовал один доминирующий образец для изолятов ФТ 1b и ФТ 6a в Португалии. Португалия, Enterobactereaceae Unity, Bacteriology Center, National Inst. of Health Dr. Ricardo Jorge, Lisbon. Библ. 31

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.13
Рубрики: SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОТИП ENTERITIDIS
ЭПИДЕМИОЛОГИЯ
САЛЬМОНЕЛЛЕЗ
ИЗОЛЯТЫ
ФАГОТИП 1B
6A
ЭЛЕКТРОФОРЕЗ
PFGE
ДНК
ГЕНОМНАЯ
МАКРОРЕСТРИКЦИЯ
РЕСТРИКТАЗА XBA

Доп.точки доступа:
Machado, J.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.03-04Б4.44

Influence of transferable genetic determinant on the outcome of typing methods commonly used for Enterococcus faecium [Text] / Guido Werner [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 4. - P1499-1506 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Влияние транспортируемых генетических детерминант на результаты исследований по типированию методами, обычно используемых для Enterococcus faecium
Аннотация: Ряд методов, используемых для молекулярного типирования Enterococcus faecium spp. и родственных грамположительных бактерий включает макрорестрикционный анализ с использованием электрофореза с импульсным током (PFGE), быструю амплификацию полиморфной ДНК (RAPD) и анализ полиморфизма длины амплифицированного фрагмента (AFLP). Чтобы протестировать влияние транспортируемых детерминант на результат исследований по типированию различными методами, обычно используемых для анализа энтерококков, выбрали гомогенную коллекцию из 24 трансконъюгатов, полученных в результате скрещиваний на фильтрах с антибиотикорезистентным Enterococcus faecium. AFLP, RAPD и PFGE идентифицировали модельные бактерии как обладающие близким родством. Наблюдали определенные различия в разрешающей и дискриминирующих мощностях тестируемых методов. При использовании PFGE определили, что 22 из 24 трансконъюгатов обладали менее, чем трехзонным различием от образца реципиента и были охарактеризованы как близкородственные. Протестировали три различные RAPD ПЦР. В двух реакциях получили идентичные образцы для всех трансконъюгатов и реципиента. Одна RAPD ПЦР позволила получить идентичный образец для 18 трансконъюгатов и реципиента и ясно отличающийся образец для 6 оставшихся трансконъюгатов, что связано с появлением нового фрагмента. Появление нового фрагмента является результатом приобретения гена tetL. AFLP позволил объединить все трансконъюгаты в группу главного родства. Процент сходства в значительной степени зависел от метода, используемого для подсчета коэффициента сходства. Образцы фрагментов переваренных плазмид позволяют определить наличие неидентичных плазмид в большинстве трансконъюгатов. Рекомендуют выбрать PFGE для типирования. Несмотря на это более мощные достижения AFLP, позволяющие получать образцы со сравнимой дискриминирующей мощностью, обусловливают преимущество этого метода на PFGE. Фингерпринты плазмид позволяют осуществлять более подробную дифференциацию энтерококковых изолятов, обладающих идентичными макрорестрикционными образцами и идентичными образцами, полученными при использовании ПЦР для типирования. Германия, Robert Korh Institute, Wernigerode Branch, 38855 Wernigerode. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.19.99
Рубрики: ENTEROCOCCUS FAECIUM (BACT.) МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
МЕТОДЫ
PFGE
RAPD
AFLP
ТРАНСПОРТИРУЕМЫЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ
ВЛИЯНИЕ НА

Доп.точки доступа:
Werner, Guido; Willems, Rob J.L.; Hildebrandt, Biancan; Klare, Ingo; Witte, Wolfgang

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.04-04Б2.212

Influence of transferable genetic determinant on the outcome of typing methods commonly used for Enterococcus faecium [Text] / Guido Werner [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 4. - P1499-1506 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Влияние транспортируемых генетических детерминант на результаты исследований по типированию методами, обычно используемых для Enterococcus faecium
Аннотация: Ряд методов, используемых для молекулярного типирования Enterococcus faecium spp. и родственных грамположительных бактерий включает макрорестрикционный анализ с использованием электрофореза с импульсным током (PFGE), быструю амплификацию полиморфной ДНК (RAPD) и анализ полиморфизма длины амплифицированного фрагмента (AFLP). Чтобы протестировать влияние транспортируемых детерминант на результат исследований по типированию различными методами, обычно используемых для анализа энтерококков, выбрали гомогенную коллекцию из 24 трансконъюгатов, полученных в результате скрещиваний на фильтрах с антибиотикорезистентным Enterococcus faecium. AFLP, RAPD и PFGE идентифицировали модельные бактерии как обладающие близким родством. Наблюдали определенные различия в разрешающей и дискриминирующих мощностях тестируемых методов. При использовании PFGE определили, что 22 из 24 трансконъюгатов обладали менее, чем трехзонным различием от образца реципиента и были охарактеризованы как близкородственные. Протестировали три различные RAPD ПЦР. В двух реакциях получили идентичные образцы для всех трансконъюгатов и реципиента. Одна RAPD ПЦР позволила получить идентичный образец для 18 трансконъюгатов и реципиента и ясно отличающийся образец для 6 оставшихся трансконъюгатов, что связано с появлением нового фрагмента. Появление нового фрагмента является результатом приобретения гена tetL. AFLP позволил объединить все трансконъюгаты в группу главного родства. Процент сходства в значительной степени зависел от метода, используемого для подсчета коэффициента сходства. Образцы фрагментов переваренных плазмид позволяют определить наличие неидентичных плазмид в большинстве трансконъюгатов. Рекомендуют выбрать PFGE для типирования. Несмотря на это более мощные достижения AFLP, позволяющие получать образцы со сравнимой дискриминирующей мощностью, обусловливают преимущество этого метода на PFGE. Фингерпринты плазмид позволяют осуществлять более подробную дифференциацию энтерококковых изолятов, обладающих идентичными макрорестрикционными образцами и идентичными образцами, полученными при использовании ПЦР для типирования. Германия, Robert Korh Institute, Wernigerode Branch, 38855 Wernigerode. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: ENTEROCOCCUS FAECIUM (BACT.) МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
МЕТОДЫ
PFGE
RAPD
AFLP
ТРАНСПОРТИРУЕМЫЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ
ВЛИЯНИЕ НА

Доп.точки доступа:
Werner, Guido; Willems, Rob J.L.; Hildebrandt, Biancan; Klare, Ingo; Witte, Wolfgang

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.05-04Б4.94

Listeria monocytogenes isolates from invasive infections: Variation of sero- and genotypes during an 11-year period in Finland [Text] / Susanna Lukinmaa [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 4. - P1694-1700 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Изоляты Listeria monocytogenes из инвазивных инфекций: вариация серо- и генотипов в течение 11-и летнего периода в Финляндии
Аннотация: Штаммы Listeria monocytogenes, выделенные из 314 больных листериозом в течение 11 лет в Финляндии, были проанализированы методами O:H серотипирования и гель-электрофореза в пульсирующем поле (PFGE). С помощью серотипирования исследованные штаммы разделили на 5 серотипов, среди которых наиболее распространенными были 1/2а (53%) и 4b (27%), а с помощью PFGE- генотипирования - на 81 PFGE-генотипов, среди которых преобладающим был PFGE тип 1 (серотип 1/2a), составлявший 23% от всех исследованных штаммов. Была создана база данных PFGE- профилей для быстрой идентификации и отслеживания инфекционных кластеров L. monocytogenes. Финляндия, Nat. Public Health Inst., Lab. of Enteric Pathogens, Mannerheimintie 166, FIN-00300 Helsinki. Табл. 3. Ил. 2. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.23
Рубрики: БОЛЕЗНИ
ЛИСТЕРИОЗ
ВОЗБУДИТЕЛЬ
ДИАГНОСТИКА
ГЕНОТИП
СЕРОТИПИРОВАНИЕ
PFGE - ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
ИНФЕКЦИОННЫЕ КЛАСТЕРЫ
ВАРИАЦИИ
LISTERIA MONOCYTOGENES (BACT.)

Доп.точки доступа:
Lukinmaa, Susanna; Miettinen, Maria; Nakari, Ulla-Maija; Korkeala, Hannu; Siitonen, Anja

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.05-04Б4.203

Possible relationship of PFGE patterns of Moraxella catarrhalis between hospital- and community-acquired respiratory infections in a community hospital [Text] / Hironori Masaki [et al.] // Microbiol. and Immunol. - 2003. - Vol. 47, N 6. - P379-385 . - ISSN 0385-5600
Перевод заглавия: Возможная связь PFGE-образцов штаммов Moraxella catarrhalis, выделяемых при госпитальных респираторных инфекциях в общественном госпитале и респираторных инфекциях, приобретенных вне госпиталя
Аннотация: Описали исследование молекулярного анализа штаммов Moraxella catarrhalis, изолированных в общественном госпитале. Спланировали изучение таким образом, чтобы исследовать возможную связь PFGE-образцов штаммов M. catarrhalis, полученных при госпитальных респираторных инфекциях и респираторных инфекциях, приобретенных вне госпиталя. Наблюдали нозокомиальную вспышку, вызванную M. catarrhalis между сентябрем 2000 года и сентябрем 2001 года. В течение периода исследований изолировали 40 штаммов M. catarrhalis из 32 пациентов с респираторными инфекциями (26 штаммов из 18 пациентов внутри госпиталя и 14 штаммов и 14 пациентов вне госпиталя). Сравнили PFGE-образцы 40 штаммов M. catarrhalis, изолированных из респираторного тракта исследованных пациентов. Геномные типы M. catarrhalis были классифицированы на три PFGE-образца (A, B и C). Интересно, что при нозокомиальной вспышке, вызванной M. catarrhalis наблюдали наличие среди штаммов 2 PFGE-образца (A и B). Из трех образцов два образца (A и B) были обнаружены как у пациентов в госпитале, так и у пациентов вне госпиталя. Два подтипа образца B (B1 и B4) были одновременно обнаружены как у пациентов в госпитале, так и у пациентов вне госпиталя. Наши результаты показали, что PFGE со SmaI-хромосомным переваром является подходящим методом для установления межштаммового родства M. catarrhalis. Предполагают, что при вспышке, вызванной M. catarrhalis изредка встречаются разнообразные PFGE-образцы. Результаты показали, что PFGE-образцы изолятов M. catarrhalis были сходными у пациентов госпиталя с респираторными инфекциями и пациентов вне госпиталя. Анализ подтипов позволил предположить, что могла существовать некоторая связь между инфекцией, вызванной M. catarrhalis в госпитале и инфекцией, вызванной M. catarrhalis вне госпиталя. Япония, Dep. of Internal Med. and Microbiol., Tagami Hospital, Nagasaki, Nagasaki 851-0251. Библ. 27

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.15.07
Рубрики: БОЛЕЗНИ
РЕСПИРАТОРНЫЕ ИНФЕКЦИИ
ВОЗБУДИТЕЛЬ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНОТИП
PFGE-ОБРАЗЦЫ
РАЗЛИЧНЫЕ ШТАММЫ
MORAXELLA CATARRHALIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Masaki, Hironori; Asoh, Norichika; Kawazoe, Kaneo; Watanabe, Kiwao; Onizuka, Tomoko; Shimogama, Seiji; Yamaryo, Takeshi; Watanabe, Hiroshi; Oishi, Kazunori; Nagatake, Tsuyoshi

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.06-04Б4.57

Pulsed-field gel electrophoresis typing of oxacillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from the United States: Establishing a national database [Text] / Linda K. McDougal [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 11. - P5113-5120 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Пульс-электрофорез для типирования оксациллинрезистентных изолятов Staphylococcus aureus из США: создание национальной базы данных
Аннотация: Оксациллинрезистентные штаммы Staphylococcus aureus (ORSA) являются вирулентными патогенами, вызывающими болезни в обществе и в стационарах. Использовали Sma I-переваренную геномную ДНК, разделенную посредством пульс-электрофореза (PFGE), чтобы охарактеризовать 957 изолятов S. aureus и создать базу данных на основании анализа PFGE-образцов. Кроме PFGE-образцов штаммов из США, база данных содержит образцы штаммов репрезентативных эпидемических типов из Англии, Канады и Австралии, прежде описанных ORSA-изолятов клональных типов, 13 ванкомицинрезистентных изолятов S. aureus с промежуточным уровнем резистентности (VISA) и два ванкомицинрезистентных изолята с высоким уровнем резистентности, vanA-положительные штаммы (VRSA). Среди изолятов из США были идентифицированы 8 вариантов, обозначенные PFTUSA100-PFTUSA800, 7 из которых включали как ORSA, так и оксациллинчувствительные изоляты S. aureus. За исключением PFT пар USA 100 и USA 800, и USA 300 и USA 500, каждый из PFTs имел уникальный тип мультилокусной последовательности и spa - типовое звено. PFTUSA 100, прежде обозначенный как Нью-Йорк/Токио клон, был наиболее общим PFT в базе данных, представляя 44% ORSA изолятов. Изоляты USA100 были обычно мультирезистентными и включали все, кроме одного из U.S. VISA штаммов и обоих VRSA изолятов. Мультирезистентные ORSA изоляты из PFTs USA200, USA500 и USA600 характеризовались PFGE-образцами, сходными с PFGE образцами для прежде описанных эпидемических штаммов из Европы и Австралии. PFTs USA300 и USA400 содержали изоляты, резистентные к 'бета'-лактамным лекарственным препаратам и эритромицину. В базе данных США было заметно отсутствие прежде описанных PFGE-типов Brazilian и EMRSA 15. Полученные результаты позволяют предположить, что в США существует ограниченное число ORSA-генотипов. США, Division of Healthcare Quality Promotion, Centers for Dis. Control and Prevention, Atlanta, Georgia 30333. Библ. 69

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: АНТИБИОТИКОУСТОЙЧИВОСТЬ
ОКСАЦИЛЛИН
МЕХАНИЗМ
ГЕНОТИП
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
МЕТОД PFGE РЕСТРИКТОВ
БАЗА ДАННЫХ
СОЗДАНИЕ
STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
McDougal, Linda K.; Steward, Christine D.; Killgore, George E.; Chaitram, Jasmine M.; McAllister, Sigrid K.; Tenover, Fred C.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.06-04Б4.150

Sabbuba, N. A.
Molecular epidemiology of Proteus mirabilis infections of the catheterized urinary tract [Text] / N. A. Sabbuba, E. Mahenthiralingam, D. J. Stickler // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 11. - P4961-4965 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Молекулярная эпидемиология инфекций, вызванных Proteus mirabilis, у пациентов с катетером в мочевом тракте
Аннотация: Микроорганизм Proteus mirabilis подвергает опасности пациентов, которым оказывают помощь, используя длительное пребывание катетера в мочевом пузыре. Этот микроорганизм образует кристаллические бактериальные биопленки в катетерах, которые блокируют ток мочи, вызывая недержание, обусловленное просачиванием, или болезненное расширение мочевого пузыря, обусловленное задержкой мочи. Если не будут предприняты меры блокада катетера может привести к пиелонефриту и септицемии. Рассмотрели эпидемиологию инфекций, обусловленных использованием катетера и вызванных Proteus mirabilis. Для исследования использовали пульс-электрофорез (PFGE) Not I рестрикционных переваров бактериальной ДНК. Показали, что этот метод обладает большими дискриминирующими возможностями, чем классический фенотипический метод Dienes. Показали, что 42 изолята из различных источников окружающей среды и 10 из 12 изолятов крови, мазков ран и образцов из средней мочи госпитализированных пациентов имели различные генотипы. Анализ набора из 55 изолятов P. mirabilis из различных клинических источников и источников окружающей среды позволил идентифицировать 49 различных генотипов и 43 Dienes типов. Индекс дискриминации был 0,993 для метода PFGE и 0,988 для метода Dienes. Применение метода PFGE к изолятам, полученным при инфекциях мочевого тракта, связанных с использованием катетера, подтвердило, что штаммы представленные в кристаллических катетерных биопленках, были идентичны штаммам, изолированным из мочи тех же самых пациентов. Анализ образцов, полученных от пациентов, для лечения которых в домашних условиях был использован катетер, позволил обнаружить, что одиночный генотип P. mirabilis может персистировать в мочевом тракте, несмотря на многочисленные смены катетера, периоды отсутствия катетера и антибиотикотерапию. Великобритания, Cardiff School of Biosciences, Cardiff University, Cardiff. Библ. 21

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.15.15
Рубрики: БОЛЕЗНИ
ИНФЕКЦИИ МОЧЕВОГО ПУЗЫРЯ
ВОЗБУДИТЕЛЬ
ДИАГНОСТИКА
МЕТОДЫ
МЕТОД PFGE
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
PROTEUS MIRABILIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Mahenthiralingam, E.; Stickler, D.J.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.10-04Б2.178

Genotypic instability of campylobacters from human and poultry sources [Text] / A. M. Ridley [et al.] // Res. Vet. Sci. - 2001. - Vol. 70, прил. A. - P4 . - ISSN 0034-5288
Перевод заглавия: Нестабильность генотипирования кампилобактерий у человека и домашней птицы
Аннотация: В эпидемиологических исследованиях кампилобактерий применяются различные методы генотипирования - как определение одного локуса, так и определение селектированных фрагментов целого генома. Но все методы отмечают нестабильность генотипирования кампилобактерии. В данной работе использовали два метода генотипирования при исследовании образцов от человека и домашней птицы - fla-типирование AFLP и PFGE. Результаты показали наличие вариаций, свидетельствующие о геномной нестабильности, достаточно редкой в образцах, взятых у человека. Тем не менее, полученные данные свидетельствуют о том, что штаммы кампилобактерий могут мутировать в стрессовых условиях. Великобритания, Veterinary Lab. Agency (Weybridge), New Haw, Addlestone, Surrey KT15 3NB

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: КАМПИЛОБАКТЕРИИ
ВЫДЕЛЕНИЕ ЧЕЛОВЕК
ДОМАШНЯЯ ПТИЦА
ГЕНОМ
ТИПИРОВАНИЕ
FLA
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ
МЕТОДЫ
AFLP PFGE

Доп.точки доступа:
Ridley, A.M.; Toszeghy, M.; Cawthraw, S.; Newell, D.G.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.10-04Б4.178

Nosocomial neonatal outbreak of Serratia marcescens - analysis of pathogens by pulsed field gel electrophoresis and polymerase chain reaction [Text] / K. Steppberger [et al.] // Infection. - 2002. - Vol. 30, N 5. - P277-281 . - ISSN 0300-8126
Перевод заглавия: Вспышка носоглоточной инфекции новорожденных, вызванной Serratia marcescens. Анализ патогенов с помощью PFGE и ПЦР
Аннотация: Оценили две техники ДНК - типирования Serratia marcescens, вызвавших вспышку носоглоточной инфекции в отделении интенсивной помощи новорожденным (NIOU) в Лейпциге в сентябре-ноябре 1998 года. Клинические изоляты были генотипированы с помощью PFGE - анализа и ПЦР - фингерпринтированния. Показали, что ПЦР и PFGE имеют сравнимые возможности в отношении воспроизводимости результатов типирования и дискриминации клинических изолятов. Рассматривается возможность использования этих методов в клинике для контроля инфекционных агентов. Германия, Children's Hospital, Univ. of Leipzig, Oststr. 21-25, D-04317 Leipzig. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.15.19
Рубрики: БОЛЕЗНИ
ИНФЕКЦИИ НОСОГЛОТКИ
НОВОРОЖДЕННЫЕ
ВОЗБУДИТЕЛЬ
ДИАГНОСТИКА
МЕТОДЫ
PFGE-АНАЛИЗ
ПЦР-ТИПИРОВАНИЕ
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
SERRATIA MARCESCENS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Steppberger, K.; Walter, S.; Claros, M.C.; Spencker, F.B.; Kiess, W.; Rodloff, A.C.; Vogtmann, C.

1-20 21-40 41-49

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска