СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ<.>)

Общее количество найденных документов : 17
Показаны документы с 1 по 17

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.11-04Б2.218

Панина, Е. М.
Статистический анализ полных бактериальных геномов: палиндромы и системы рестрикции-модификации [Текст] / Е. М. Панина, А. А. Миронов, М. С. Гельфанд // Молекул. биол. - 2000. - Т. 34, N 2. - С. 246-252 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: В геномных последовательностях широкого спектра бактерий практически отсутствуют 4, 5 и 6-буквенные палиндромы. Значительную долю таких полиндромов составляют сайты узнавания рестриктаз данного или близкого вида бактерий. Большую роль здесь играет горизонтальный перенос генов, к-рые кодируют системы рестрикции-модификации (P-M-системы). В организмах, практически изолированных от действия подобных систем (например, в микоплазмах), подобное явление не наблюдается. На основе 33 доступных геномов бактерий были исследованы общие тенденции в предпочтении и "избегании" олигонуклеотидов у представителей различных бактериальных семейств. Полученные данные дают дополнительный материал для изучения родственных связей внутри и между сложившимися таксономическими группами. Россия, Государственный научный центр Российской Федерации ГосНИИгенетика, Москва, 113545. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМЫ
ПОЛНЫЕ ГЕНОМЫ
ПАЛИНДРОМЫ
ВСТРЕЧАЕМОСТЬ
СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ДНК
СТАТИСТИКА
ЦЕПИ МАРКОВА
БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Миронов, А.А.; Гельфанд, М.С.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.01-04Б2.214

Role and mechanism of action of C'СИММЕТР'PvuII, a regulatory protein conserved among restriction-modification systems [Text] / Roy M. Vijesurier [et al.] // J. Bacteriol. - 2000. - Vol. 182, N 2. - P477-487 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Роль и механизм действия C*PvuII, регуляторного белка, консервативного в системах рестрикции-модификации
Аннотация: Система рестрикции-модификации (РМ) PvuII относится к системам типа II, в которых рестриктаза и метилтрансфераза являются независимыми активными белками. Система PvuII кодируется плазмидами и ее перенос в клетки др. хозяев связан с экспрессией только гена метилтрансферазы, что приводит к защите хозяйской ДНК до появления эндонуклеазной активности. Регуляторный ген pvuIIC находится между противоположно ориентированными генами рестриктазы (pvuIIR) и метилтрансферазы (pvuIIM), причем pvuIIC ориентирован так же, как pvuIIR и частично перекрывается с ним. Продукт pvuIIC-C*PvuII действует in trans и необходим для экспрессии генов pvuII. Показано, что преждевременная экспрессия pvuIIC предотвращает закрепление генов PvuII, и согласуется с моделью, согласно которой C*PvuII необходим для задержки экспрессии pvuIIR, важной для защиты ДНК новой хозяйской клетки. Противоположно направленные транскрипты pvuIIC и pvuIIM перекрываются на 60 н. в 5'-концевой области, что указывает на возможность того, что их гибридизация может играть регуляторную роль. Установлено также, что C*PvuII является последовательность-специфичным белком, который взаимодействует с промотором pvuIIc и стимулирует транскрипцию 2 генов системы РМ в виде полицистронной мРНК. Для активаторов транскрипции необычно расположение участка связывания C*PvuII, перекрывающего - 10 гексамер в промоторе, и точек инициации транскрипции pvuIICR. США, Ctr Molec. Med. Genet., Wayne St. Univ. Sch. Med., Detroit, MI 48201. Библ. 68

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
РЕСТРИКТАЗА CXPVUII
ФУНКЦИИ
МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ
ПЛАЗМИДЫ

Доп.точки доступа:
Vijesurier, Roy M.; Carlock, Leon; Blumenthal, Robert; Dunbar, Joan C.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 02.07-04Б1.101

Characterisation of the structure of ocr, the gene 0.3 protein of bacteriophage T7 [Text] / C. Atanasiu [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2001. - Vol. 29, N 14. - P3059-3068 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Характеристика и структура ocr, гена белка 0.3 бактериофага T7
Аннотация: Продукт гена 0.3 фага T7, ocr, является ингибитором ферментов систем рестрикции-модификации типа I. Изучали массу, стабильность, форму и поверхностный заряд ocr. Этот белок является димером, гидродинамическое поведение которого эквивалентно поведению вытянутого эллипсоида с соотношением осей 4,3'+-'0,7:1 и массой 27 кД. Белок устойчив к денатурации, удаление C-концевых остатков снижает его стабильность. На поверхности белка локализованы 6 остатков - N4, D25, N43, D62, S68 и W94. Отрицательно заряженные боковые аминокислотные цепи, окружающие W94, входят в состав очень кислого C-конца, расположенного после W94. Ocr может вытеснять короткий ДНК-дуплекс из сайта связывания ферментов типа I. Предполагается, что ocr обладает размером и формой, которые позволяют эффективно блокировать сайты связывания рестриктаз типа I, а также содержит большое отрицательно заряженное пятно на поверхности. Это распределение зарядов может быть комплементарно распределению заряда в сайте связывания ДНК ферментами рестрикции-модификации типа I. Великобритания, Dep. Chem., Univ. Edinburgh, King's Build., Edinburgh EH9 3JJ. Библ. 47

ГРНТИ	34.25.17

ВИНИТИ 341.25.17.09.11
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ T7
БЕЛОК
OCR
ПРОДУКТ ГЕНА 0.3
СТРУКТУРА
ХАРАКТЕРИСТИКА
СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ИНГИБИТОРЫ

Доп.точки доступа:
Atanasiu, C.; Byron, O.; McMiken, H.; Sturrock, S.S.; Dryden, D.T.F.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.07-04Б2.223

Analysis of type I restriction modification systems in the Neisseriaceae: Genetic organization and properties of the gene products [Text] / Andrzej Piekarowicz [et al.] // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 41, N 5. - P1199-1210 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Анализ систем рестрикции-модификации типа I у Neisseriaceae: генетическая организация и свойства продуктов генов
Аннотация: Экспрессия клонированного в Escherichia coli фрагмента ДНК, кодирующего локус hsd (хозяйская специфичность ДНК) Neisseria gonorrhoeae, приводит к образованию активной системы рестрикции-модификации (РМ) - NgoAV. Этот фрагмент кодирует 8 открытых рамок считывания (ОРС). ОРС1, hsdM, кодирует метилазную субъединицу (HsdM); OPC2 - гомолог dinD; ОРС3 и 4 - гомологи hsdS, а ОРС5 - эндонуклеазную субъединицу hsdR. Эндонуклеазная и метилазная субъединицы обладают высоким уровнем сходства с РМ-системой EcoR12411, т. е. относится с системам РМ типа IC. Специфичность к последовательности системы РМ.NgoAV обеспечивается только ОРС3, которая узнает палиндром GCAN[8]-TGC. Структура ОРС3 почти идентична структуре 5'-укороченных генов hsdS систем EcoDXXI или EcoR124. Анализ секвенированных последовательностей позволил с высокой степенью вероятности идентифицировать локус hsd, высокогомологичный локусу РМ.NgoAV, в 2 штаммах N. meningitidis. Однако значительные различия в структуре и организации генов hsdS этих систем указывают на то, что если они обладают функциональной активностью, то должны иметь сайты узнавания, отличные от сайтов др. гонококков. США, Dep. Cell Biol. Molec. Genet., Univ. Maryland, Colledge Park, MD 20742. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ТИП I
АНАЛИЗ
ГЕНЫ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
ПРОДУКТЫ
ФУНКЦИИ
NEISSERIA GONORRHOEAE (BACT.)

Доп.точки доступа:
Piekarowicz, Andrzej; Klyz, Aneta; Kwiatek, Agnieszka; Stein, Daniel C.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.90

Alteration of the specificity of Pst I restriction endonuclease [Text] / Guo-lin Zou [et al.] // Wuhan Univ. J. Natur. Sci. - 2000. - Vol. 5, N 3. - P361-365 . - ISSN 1007-1202
Перевод заглавия: Изменение специфичности эндонуклеазы рестрикции PstI
Аннотация: С помощью электрофореза изучали влияние различных факторов на специфичность рестриктазы PstI. Установлено, что специфичность фермента не изменяется при отклонениях от оптимальной концентрации одного из компонентов реакционной системы - Трис HCI, Mg{2+} или Na{+}, а также величины pH или замене Mg{2+} на Mn{2+}. Однако, при одновременном изменении концентрации 2-х компонентов отмечено изменение в специфичности фермента. Внесение глицерина или диметилсульфоксида в реакционную смесь приводит к восстановлению специфичности PstI, тогда как диметилметилформид, гликоль и этанол на нее не влияют. С помощью клонирования и секвенирования были получены фрагменты ДНК содержащие сайты узнавания PstI, в которых крайние нуклеотиды 6-членника были заменены (1C'-'A, 6G'-'T). Установлено, что описанные выше изменения в специфичности действия PstI выражается в том, что фермент вместо 6-членной последовательности CTGCA{'- ВНИЗ'}G узнает 4-х членный сайт TGCA{'- ВНИЗ'}. КНР, Col. Life Sci., Wuhan Univ., Wuhan 430072. Библ. 9

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ЭНДОНУКЛЕАЗА РЕСТРИКЦИИ PSTI
СПЕЦИФИЧНОСТЬ ДЕЙСТВИЯ

Доп.точки доступа:
Zou, Guo-lin; Gao, Cheng-zhuo; Pi, Xin-chun; Zhang, Jun-jin

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.08-04Б2.167

Evidence for horizontal tranfer of SsuDAT1I restriction-modification genes to the Streptococcus suis genome [Text] / Tsutomu Sekizaki [et al.] // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 2. - P500-511 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Доказательство горизонтального переноса генов рестрикции-модификации SsuDAT1I в геном Streptococcus suis
Аннотация: Штаммы Streptococcus suis серотипов 1 и 2, выделенные от свиней, различаются наличием системы рестрикции-модификации (РМС), изошизомера РМС DpnII S. pneumoniae, узнающей сайт 5{'}-GATC-3{'}. Секвенирование генов, кодирующих РМС S. suis DATI, названную SsuDAT1I, показало, что в эту систему входят гены 2 метилтрансфераз, ssuMA и ssuMB, как и в РМС DpnII. Аминокислотные последовательности (ПС) M.SsuMA и M.SsuMB на 70 и 90% идентичны ПС M.DpnII и M.DpnA соотв. Однако РМС SsuDAT1I содержит гены 2 рестриктаз - изошизомеров, ssuRA и ssuRB. Аминокислотные ПС R.SsuRA и R.SsuRB на 49 и 72% идентичны ПС R. Dpn1I и R.LlaDCHI Lactococcus lactis subsp. cremoris DCH-4 соотв. Гены SsuDAT1I перекрываются и окружены генами биосинтеза пуринов: purF-purM-purN-purH-ssuMA-ssuMB-ssuRA-ssuRB-purD-purE. GC-состав в области генов SsuDAT1I (34,1%) ниже, чем в области генов pur (48,9%), что указывает на горизонтальный перенос генов системы SsuDAT1I. Во фланкирующих ПС не найдены длинные концевые повторы или транспозоны. Сравнение ПС генов ssuDAT показало, что только ПС от 53 п. н. выше гена ssuMA до 5 п. н. ниже ssuRB встроилась между генами purH и purD, причем сайт инсерции не является сайтом узнавания SsuDAT1I. Предполагается, что система SsuDAT1I могла интегрироваться в хромосому S. suis посредством незаконной рекомбинации. Япония, Lab. Molec. Bacteriol., Nat. Inst. Animal Hlth, 3-1-1 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-0856. Библ. 60

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.07.03
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
СИСТЕМА SSUDAT1I
ГЕНЫ
ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС
STREPTOCOCCUS SUIS (BACT.)
НЕЗАКОННАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ

Доп.точки доступа:
Sekizaki, Tsutomu; Otani, Yoshiko; Osaki, Makoto; Takamatsu, Daisuke; Shimoji, Yoshihiro

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.09-04Б2.179

Comparative genomics of the restriction-modification systems in Helicobacger pylori [Text] / LinLee-Fong LinLee-Fong [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2001. - Vol. 98, N 5. - P2740-2745 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Сравнительная геномика систем рестрикции-модификации у Helicobacter pylori
Аннотация: Геном Helicobacter pylori состоит из 1,64-1,67 млн. п. н. Секвенировали геномы 2 штаммов H. pylori, 26695 и J99, и выявили в них более 20 предполагаемых систем рестрикции-модификации (P-M), которые занимают более 4% всего генома. Изучали биохимическую активность 14 P-M-систем типа II шт. 26695. Оказалось, что менее 30% этих систем полностью функциональны, что соотв. результатам, полученным при изучении шт. J99. Примерно 99% генов систем P-M одинаковы у 2 штаммов, однако в каждом штамме функционально активны разные наборы генов, причем все штаммоспецифичные гены P-M активны, тогда как большинство общих генов неактивны. Это соотв. предположению о более позднем приобретении штаммоспецифичных генов от др. бактерий в результате горизонтального переноса. Т. обр., штаммы H. pylori характеризуются исключительным разнообразием систем P-M, которое поддерживается приобретением новых систем и инактивацией или делетированием старых. США, New England Biolabs, Inc., 32 Tozer Road, Beverly, MA 01915. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: ГЕНОМИКА
СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)

Доп.точки доступа:
LinLee-Fong, LinLee-Fong; Posfai, Janos; Roberts, Richard J.; Kong, Huimin

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.10-04Б2.123

Weiserova, Marie.
A novel mutant of the type I restriction-modification enzyme EcoR124I is altered at a key stage of the subunit assembly pathway [Text] / Marie Weiserova, Christina F. Dutta, Keith Firman // J. Mol. Biol. - 2000. - Vol. 304, N 3. - P301-310 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Новый мутантный фермент рестрикции-модификации типа I EcoR1241, у которого изменена ключевая стадия в пути сборки субъединиц
Аннотация: Субъединица (СЕ) HsdS системы рестрикции-модификации типа I Escherichia coli играет важную роль в активности как метилазы (МТазы), так и эндонуклеазы. Эта СЕ отвечает за связывание с ДНК, а также содержит консервативные последовательности, необходимые для белок-белковых взаимодействий. Наиболее важно взаимодействие между HsdS и HsdM (метилирование), которое приводит к сборке независимой МТазы с стехиометрией M[2]S[1]. Проанализировали влияние замены Trp212'-'Arg на дистальной границе центрального консервативного участка СЕ HsdS EcoR1241 на активности рестриктазы и МТазы. Показано, что эта мутация влияет на способность HsdS взаимодействовать с HsdM и продуцировать функциональную МТазу. Последствием этого является снижение связывания мутантной МТазы с ДНК, которое восстанавливается только после связывания рестриктазной СЕ HsdR с МТазой. Т. обр., HsdR действует как шаперон, обеспечивающий не только связывание фермента с ДНК, но и восстановление метилирующей активности, а при достаточно высоких концентрациях HsdR и рестрикционной активности in vitro. Великобритания, Biophys. Lab. Univ. Portsmouth, Sch. Biol. Sci., St. Michael's Bld, Portsmouth PO1 2DT. Библ. 34

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.17
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ТИП I
ECOR1241
СУБЪЕДИНИЦА HSDS
МУТАЦИЯ TRP212'-'ARG
НАРУШЕНИЕ СБОРКИ
СИНТЕЗ МЕТИЛАЗЫ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Dutta, Christina F.; Firman, Keith

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.10-04Б2.133

Murray, Noreen E.
Type I restriction systems: Sophisticated molecular machines (a legacy of Bertani and Weigle) [Text] / Noreen E. Murray // Microbiol. and Mol. Biol. Rev. - 2000. - Vol. 64, N 2. - P412-434 . - ISSN 1092-2172
Перевод заглавия: Системы рестрикции типа I: сложные молекулярные машины (наследство Бертани и Вейгла)
Аннотация: Обзор. Описаны следующие компоненты бактериальных систем рестрикции-модификации типа I: 1) субъединицы специфичности HsdS (вариабельность, консервативные последовательности, симметрия, ассоциация субъединиц, специфичность в отношении ДНК и молекулярные модели); 2) субъединицы метилирования HsdM (активный центр, дискриминация состояния метилирования и связывание с ДНК); 3) рестрикционные субъединицы HsdR и комплексы R-M (связывание с ДНК, узнавание метилированного состояния, сборка комплекса и транслокация по ДНК). Рассмотрены контролируемая хозяином модуляция рестрикционной активности (самозащита и протеолитич. контроль) и механизмы, с помощью к-рых плазмиды и фаги избегают рестрикцию (обнаружение, распределение, разнообразие и эволюция). Великобритания, Inst. Cell and Mol. Biol., Univ. Edinburgh, Edinburgh EH9 3JR. Библ. 197

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ТИП I
КОМПОНЕНТЫ
СУБЪЕДИНИЦЫ СПЕЦИФИЧНОСТИ HSDS
СУБЪЕДИНИЦЫ МЕТИЛИРОВАНИЯ HSDM
РЕСТРИКЦИОННЫЕ СУБЪЕДИНИЦ HSDR
КОМПЛЕКСЫ R-M

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.08-04Б2.80

Murphy, Mark.
Lack of regulation of the modification-dependent restriction enzyme McrBC in Escherichia coli [Text] / Mark Murphy, Stefanie Schmid Nuoffer, Thomas A. Bickle // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 6. - P1794-1795 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Отсутствие регуляции зависимой от модификации фермента рестрикции McrBC в Escherichia coli
Аннотация: Известно, что снижение рестрицирующей способности рестриктазы типа I EcoKI происходит в результате появления повреждений в ДНК. Снижение активности рестриктазы является следствием протеолиза субъединицы HsdR ClpXP-АТФ-зависимой протеазой. Показано, что активность фермента, зависимого от модификации ДНК, McrBC не изменяется при повреждениях ДНК, хотя он и чувствителен к ClpAP. Швейцария, Div. Mol. Microbiol., Biozentr. Univ. Basel, CH-4056 Basel. Библ. 15

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.02
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ТИП I
ПОВРЕЖДЕНИЕ ДНК
РЕСТРИКТАЗЫ
HSDR (ECOKI)
MCRBC
АКТИВНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Nuoffer, Stefanie Schmid; Bickle, Thomas A.

11.

Патент 6403354 Соединенные Штаты Америки, МКИ C12N 9/22.

Method for cloning and expression of BstYI restriction endonuclease and BstYI methylase in E. coli and purification of BstYI and M.BstYI enzymes [Текст] / Shuang-yong Xu [и др.] ; New England Biolabs, Inc. - № 09/766055 ; Заявл. 19.01.2001 ; Опубл. 11.06.2002
Перевод заглавия: Метод клонирования и экспрессии BSTYI эндонуклеаза рестрикции и BSTYI метилаза в E. coli и очистка ферментов BSTYI и M.BSTYI
Аннотация: Получены библиотеки геномной ДНК Bacillus stearothermophilus после ее гидролиза различными сочетаниями крупнощепящих рестриктаз (ClaI, NsiI, PvuI, EcoRI и SphI) в составе векторов pUC19 или pBR322. Осуществлен скрининг этих библиотек и выделены клоны, содержащие фрагменты ДНК, кодирующие гены эндонуклеазы рестрикции bstYI и метилазы M.bstYI. Описаны системы экспрессии рекомбинантных ДНК в Escherichia coli и схемы выделения рекомбинантных белков BstYI и метилазы M.BstYI. США, New EnglandBiolabs, Inc., Beverly, MA. Библ. 18

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
РЕСТРИКТАЗА BSTYI
МЕТИЛАЗА M.BSTYI
ВЫДЕЛЕНИЕ
ОЧИСТКА
ГЕНЫ
ГЕН РЕСТРИКТАЗЫ BSTYI
ГЕН МЕТАЛИЗЫ M.BSTYI
КЛОНИРОВАНИЕ
BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Xu, Shuang-yong; Samuelson, James; Pelletier, John; Sibley, Marion; Wilson, Geoffrey G.; New England Biolabs; Inc.
Свободных экз. нет

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.08-04Б2.245

Helicobacter pylori interstrain restriction-modification diversity prevents genome subversion by chromosomal DNA from competing strains [Text] / Rahul A. Aras [et al.] // Nucl. Acids Res. - 2002. - Vol. 30, N 24. - P5391-5397 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Межштаммовое разнообразие систем рестрикции-модификации Helicobacter pylori препятствует нарушению целостности генома хромосомной ДНК из компетентных штаммов
Аннотация: Известно, что штаммы Helicobacter pylori обладают большим числом генов систем рестрикции-модификации, и кроме того, каждый штамм имеет индивидуальный набор этих систем, как функционально активных, так и представленных фрагментарно. Около половины изученных штаммов H. pylori содержат систему рестрикции-модификации типа IIs - HpyII, узнающую последовательность GAAGA и ограниченную прямыми повторами. Рекомбинация между этими повторами может привести с одной стороны к вырезанию кассеты, а с другой стороны, штаммы, у которых отсутствует hpyIIRM, могут получать эту кассету в результате естественной трансформации. Показано, что естественная трансформация и механизмы, подобные конъюгации, могут участвовать в переносе больших (4,8 т. п. н.) фрагментов хромосомной ДНК между штаммами H. pylori; что неактивные или фрагментарные системы hpyIIRM могут быть реактивированы в результате рекомбинации с функциональной аллелью, а также что разнообразие систем рестрикции-модификации H. pylori лимитирует проникновение фрагментов хромосомной ДНК, размер которых превышает 1 т. п. н. США, Dept. Med. & Microbiol., New York Univ. Sch. Med., New York, NY. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
МНОЖЕСТВЕННОСТЬ
РЕКОМБИНАЦИЯ
КОНЪЮГАЦИЯ
ЭВОЛЮЦИЯ
HELICOBACTER PYLORI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Aras, Rahul A.; Small, Aaron J.; Ando, Takafumi; Blaser, Martin J.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.12-04Б2.211

Characterization of AloI, a restriction-modification system of a new type [Text] / Egle Cesnaviciene [et al.] // J. Mol. Biol. - 2001. - Vol. 314, N 2. - P205-216 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Характеристика AloI, системы рестрикции-модификации нового типа
Аннотация: Из Acinetobacter Iwoffi Ksb 4-8 выделен и охарактеризован бифункциональный полипептид AloI с M[r]=143 kD, осуществляющий рестрикцию и метилирование последовательности 5'GGA(N)[6]GTTC 3'). В зависимости от кофакторов, AloI расщепляет обе цепи ДНК на расстоянии 7 нуклеотидов от 5'-конца и 12-13 нуклеотидов от 3'-конца узнаваемой последовательности, метилируется же адениновый остаток с образованием (N)[6]-метиладенина. Рестрицирующая активность AloI зависит от ионов Mg{2+} и не зависит от АТФ и/или S-аденизилметионина, метилирующая активность зависит от присутствия S-аденизилметионина и ионов Ca{2+}. C-концевая и центральная часть AloI гомологичны субъединицам HsdS и HsdM системы рестрикции-модификации I типа, соответственно. N-концевая часть белка содержит предполагаемый эндонуклеотический мотив DX[n]EXK эндонуклеаз рестрикции. Предсказанная аминокислотная последовательность AloI в значительной степени гомологична белкам рестрикции-модификации HeaIV и CjeI в N-концевом и центральном доменах, но не в С-концевом домене. Полагают, что эволюция AloI включала слияние эндонуклеазы и 2 субъединиц HsdS и HsdM, ферментов рестрикции I типа. Согласно структуре и функциональным свойствам, AloI может рассматриваться как наиболее типичный представитель группы HaeIV-подобных эндонуклеаз. Описание этих ферментов открывает новые возможности в конструировании эндонуклеаз с заданной специфичностью. Литва, Inst. Biothechnol., Graiciuno 8, 2028 Vilnius. Библ. 43

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ALOI СИСТЕМА
ВЫДЕЛЕНИЕ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ACINETOBACTER IWOFFI (BACT.)
KSB 4-8

Доп.точки доступа:
Cesnaviciene, Egle; Petrusyte, Maryte; Kazlauskiene, Ruta; Maneliene, Zita; Timinskas, Albertas; Lubys, Arvydas; Janulaitis, Arvydas

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.11-04Б2.141

Analysis of the genome sequence of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 reveals the molecular basis of an autochthonous intestinal organism [Text] / M.Andrea Azcarate-Peril [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74, N 15. - P4610-4625 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Анализ геномной последовательности Lactobacillus gasseri ATCC 33323 выявил молекулярную основу эндемичного кишечного организма
Аннотация: Определили полную геномную последовательность Lactobacillus gasseri АТСС 33323 неотипа человеческого происхождения и нативных видов из желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) новорожденных. Свободный от плазмид геном имел размер в 1 894 360 п. н. и кодировал 1810 генов. Содержание ГЦ-пар составило 35,3%, подобно близко родственным видам L. johnsonii NCC 533 (34%) и L. acidophilus NCFM (34%). Две копии профага LgaI (40086 п. н.) интегрированы тандемно в хромосому. L. gasseri кодирует две системы рестрикции и модификации ограничивающие инфекцию бактериофагов, а также оперон продукции гетерополисахаридов высокой сложности. Присутствует уникальный альтернативный сигма фактор, подобный таковому из B. coccae АТСС 43185. Выявили большое количество генов мукус-связывающих белков (14) среди актобацилл, секвенированных к настоящему времени. Результаты сравнения штамма ATCC 33323 с другими штаммами L. gasseri показали высокую внутривидовую вариабельность генома, важную для выживания в экологической нише ЖКТ. США, Dep. of Food, Bioprocessing and Nutrition Sciences and Southeast Dairy Food Research Center, North Carolina State Univ., Raleigh, North Carolina 27695. Библ. 105

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: LACTOBACILLUS GASSERI (BACT.)
ШТАММ ATCC 33323
ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГЦ-ПАРЫ
ПРОФАГИ
СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
СТРУКТУРА
ВНУТРИВИДОВАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
СВЯЗЬ
ВЫЖИВАНИЕ
ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНЫЙ ТРАКТ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Azcarate-Peril, M.Andrea; Altermann, Eric; Goh, Yong Jun; Tallon, Richard; Sanozky-Dawes, Rosemary B.; Pfeiler, Erika A.; O'Flaherty, Sarah; Buck, B.Logan; Dobson, Alleson; Duong, Tri

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.11-04Б4.82

Analysis of the genome sequence of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 reveals the molecular basis of an autochthonous intestinal organism [Text] / M.Andrea Azcarate-Peril [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 2008. - Vol. 74, N 15. - P4610-4625 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Анализ геномной последовательности Lactobacillus gasseri ATCC 33323 выявил молекулярную основу эндемичного кишечного организма
Аннотация: Определили полную геномную последовательность Lactobacillus gasseri АТСС 33323 неотипа человеческого происхождения и нативных видов из желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) новорожденных. Свободный от плазмид геном имел размер в 1 894 360 п. н. и кодировал 1810 генов. Содержание ГЦ-пар составило 35,3%, подобно близко родственным видам L. johnsonii NCC 533 (34%) и L. acidophilus NCFM (34%). Две копии профага LgaI (40086 п. н.) интегрированы тандемно в хромосому. L. gasseri кодирует две системы рестрикции и модификации ограничивающие инфекцию бактериофагов, а также оперон продукции гетерополисахаридов высокой сложности. Присутствует уникальный альтернативный сигма фактор, подобный таковому из B. coccae АТСС 43185. Выявили большое количество генов мукус-связывающих белков (14) среди актобацилл, секвенированных к настоящему времени. Результаты сравнения штамма ATCC 33323 с другими штаммами L. gasseri показали высокую внутривидовую вариабельность генома, важную для выживания в экологической нише ЖКТ. США, Dep. of Food, Bioprocessing and Nutrition Sciences and Southeast Dairy Food Research Center, North Carolina State Univ., Raleigh, North Carolina 27695. Библ. 105

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.23
Рубрики: LACTOBACILLUS GASSERI (BACT.)
ШТАММ ATCC 33323
ГЕНОМ
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
ГЦ-ПАРЫ
ПРОФАГИ
СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
СТРУКТУРА
ВНУТРИВИДОВАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ
СВЯЗЬ
ВЫЖИВАНИЕ
ЖЕЛУДОЧНО-КИШЕЧНЫЙ ТРАКТ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Azcarate-Peril, M.Andrea; Altermann, Eric; Goh, Yong Jun; Tallon, Richard; Sanozky-Dawes, Rosemary B.; Pfeiler, Erika A.; O'Flaherty, Sarah; Buck, B.Logan; Dobson, Alleson; Duong, Tri

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.01-04Б2.143

In vitro CpG methylation increases the transformation efficiency of Borrelia burgdorferi strains harboring the endogenous linear plasmid lp56 [Text] / Qiang Chen [et al.] // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 24. - P7885-7891 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: In vitro CpG метилирование усиливает эффективность трансформации штаммов Borellia burgdorferi, содержащих эндогенную линейную плазмиду lp56
Аннотация: Крайне низкая эффективность трансформации штаммов Borrelia burgdorferi, возбудителя болезни Лайма, препятствующая изучению возможных факторов вирулентности, определяется наличием двух систем рестрикции-модификации. Гены, кодирующие эти системы BBE02 и BBQ67, локализованы на линейных плазмидах lp25 и lp56, соответственно. Рестрикционные барьеры других бактерий удавалось преодолеть путем in vitro метилирования ДНК перед трансформацией. Челночные плазмиды метилировали CpG метилазой M. SssI перед электропорацией в штаммы, обладающие различными системами рестрикции-модификации. Показано, что для штамма B. burgdorferi, содержащего lp56, in vitro метилирование вектора увеличивает его трансформирующую способность на порядок. Протективное действие in vitro метилирования экзогенной ДНК для трансформации B. borgdorferi было продемонстрировано на примере комплементации мутанта боррелий, неспособных к экспрессии фибронектин- и глюкозаминогликан-связывающего адгезина BBK32. США, Dep. Mol. Genet. & Microbiol., Univ. Massachusetts Med. Sch., 55 Lake Av. North, Worcester, Massachusetts 01655. Библ. 39

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.09
Рубрики: ТРАНСФОРМАЦИЯ
ЭФФЕКТИВНОСТЬ
СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
ДНК
МЕТИЛИРОВАНИЕ
ДНК ЭКЗОГЕННАЯ
МЕТИЛИРОВАНИЕ IN VITRO
ПРОТЕКТИВНОЕ ДЕЙСТВИЕ
BORRELIA BURGDORFERI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Chen, Qiang; Fischer, Joshua R.; Benoit, Vivian M.; Dufour, Nicholas P.; Youderian, Philip; Leong, Joh M.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.05-04Б2.134

Veiga, Helena.
Inactivation of the SauI type I restriction-modification system is not sufficient to generate Staphylococcus aureus strains capable of effciently accepting foreign DNA [Text] / Helena Veiga, Mariana G. Pinho // Appl. and Environ. Microbiol. - 2009. - Vol. 75, N 10. - P3034-3038 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Инактивация системы рестрикции-модификации I типа SauI несущественна для приобретения штаммами Staphylococcus aureus способности эффективно акцептировать чужеродную ДНК
Аннотация: Генетические манипуляции со Staphylococcus aureus ограничены тем, что имеется только один штамм RN4220, который способен легко акцептировать чужеродную ДНК. Ранее было показано, что инактивация гена hsdR системы рестрикции-модификации I типа SauI определяет высокую эффективность трансформации штамма RN4220.Однако, делеции в этом гене у трех различных штаммов S. aureus не влияли на изменение их трансформируемости. Очевидно, высокая частота включения экзогенной ДНК в клетки RN4220 объясняется присутствием других неизвестных факторов, необходимых для данного "трансформируемого" фенотипа. Португалия, Lab. Bact. Cell Biol., Inst. Tecnol. Quimica & Biol. (ITQB), Univ. Nova de Lisboa (UNL), Oeiras. Библ. 22

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.09
Рубрики: СИСТЕМЫ РЕСТРИКЦИИ-МОДИФИКАЦИИ
РЕСТРИКТАЗА SAUI
ИНАКТИВАЦИЯ
ДНК ЧУЖЕРОДНАЯ
АКЦЕПТИРОВАНИЕ
STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
ШТАММ RN 4220
ТРАНСФОРМИРУЕМОСТЬ

Доп.точки доступа:
Pinho, Mariana G.

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска