СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=РРНК 16S<.>)

Общее количество найденных документов : 149
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 97.06-04Б2.15

Определение филогенетического положения Sulfobacillus thermosulfidooxidans на основании анализа 5S и 16S рибосомной РНК [Текст] / Т. П. Турова [и др.] // Микробиология. - 1995. - Т. 64, N 3. - С. 366-374 . - ISSN 0026-3656
Аннотация: Была определена нуклеотидная последовательность гена рРНК 16S типового штамма Sulfobacillus thermosulfidooxidans VKM-1269. Этот микроорганизм относится к группе термофильных ацидофильных хемолитотрофных бактерий, способных использовать элементарную серу и ионы железа в качестве единственных источников энергии. С помощью сравнительного анализа последовательностей рРНК 16S было установлено филогенетическое положение изучаемого организма как представителя грамположительных бактерий. Кроме того, было показано, что Sulfobacillus образует единую филогенетическую группу с видами нового рода Alicyclobacillus. Предполагается, что Sulfobacillus-Alicyclobacillus представляют самостоятельную эволюционную ветвь внутри клостридиального подразделения грамположительных бактерий. Россия, Ин-т микробиологии РАН, Москва

ГРНТИ	34.27.15

ВИНИТИ 341.27.15.09
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
SULFOBACILLUS THERMOSULFIDOOXIDANS (BACT.)
РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Турова, Т.П.; Полтораус, А.Б.; Лебедева, И.А.; Булыгина, Е.С.; Цаплина, И.А.; Богданова, Т.И.; Каравайко, Г.И.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 97.10-04Б4.25

Gram-positive, catalase-positive cocci from dry cured iberian ham and their enterotoxigenic potential [Text] / Mar Rodriguez [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62, N 6. - P1897-1902 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Грамположительные каталазо-позитивные кокки из сухой упакованной Иберийской ветчины и их энтеротоксигенный потенциал
Аннотация: Иберийская ветчина - сухой мясной продукт, вызреваемый при естественных неконтролируемых условиях в течение 18-24 месяцев. Грамположительные каталазо-позитивные кокки (ГПКП) - основная микробная популяция при созревании ветчины. Поскольку нек-рые из этих микроорганизмов продуцируют энтеротоксины, необходимы адекватная характеристика и токсикологические исследования. С помощью физиологических и биохимических тестов характеризовали 1327 ГПКП, выделенных из Иберийской ветчины на разных стадиях созревания. У нек-рых изолятов определяли ГЦ-содержание, картину распределения рестрикционных фрагментов 16S рРНК, наличие стафилококковых энтеротоксинов A, B, C и D. Большинство изолятов идентифицировано как Staphylococcus spp. и Micrococcus spp. Неидентифицированные ГПКП оказались умеренно галофильными и имели 42-52% ГЦ-пар. Спектр штаммов стафилококков в одном образце был довольно широк. 2 штамма Staphylococcus xylosus, 1 штамм Staphylococcus cohnii и 4 неидентифицированных микроорганизма с 42-52% ГЦ-пар гибридизовались с нек-рыми ДНК-зондами энтеротоксинов C и D. S. xylosus, гибридизующийся с зондом для энтеротоксина C, реагировал с энтеротоксинами C и D в иммунологических тестах. У нек-рых неидентифицированных штаммов обнаружен энтеротоксин D. Нек-рые токсигенные штаммы, обнаруженные в готовом продукте, представляют опасность для здоровья покупателей. Испания, Higiene y Technol. de los Alimentos, Fac. de Veterinaria, Univ. de Extremadura, 10071 Caceres. Библ. 27

ГРНТИ	34.27.49

ВИНИТИ 341.27.49.13.07
Рубрики: ЭНТЕРОТОКСИНЫ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
ДНК-ЗОНДЫ
ГЕНОМ
ГЦ-СОДЕРЖАНИЕ
РРНК 16S
РЕСТРИКЦИОННЫЕ ФРАГМЕНТЫ
ПИЩА
ИБЕРИЙСКАЯ ВЕТЧИНА
STAPHYLOCOCCUS (BACT.)
MICROCOCCUS (BACT.)
ВЫДЕЛЕНИЕ
ТОКСИЧНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Rodriguez, Mar; Nunez, Felix; Coroba, Juan J.; Bermudez, Elena; Asensio, Miguel A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.03-04Б2.200

Critical evaluation of membrane supports for use in quantitative hybridizations [Text] / Lutgarde Raskin [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1996. - Vol. 62, N 1. - P300-303 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Критическая оценка мембранных подложек, используемых в количественной гибридизации
Аннотация: Авторы исследовали количественное содержание рРНК 16S с помощью гибридизации при использовании мембранных фильтров Magna Graph (Micron Separation, Inc.), Magna Charge (MSI), Magna (MSI), Immobilon-N (Millipore Corp.) и Nytran (Schleicher Schuell Inc.) в качестве подложек для иммобилизации нуклеиновых кислот. Уровень обнаружения при использовании мембран Magna Charge и Immobilon-N был в 20-50 раз лучше, чем при использовании мембран Magna Graph, Magna и Nytran. Вариабельность гибридизационного сигнала для отдельных мембран составляла 10-50%. Для мембран Magna Charge и Immobilon N была показана самая низкая вариабельность. США, Dep. of Civil Engineering, Univ. of Illinois at Urbana-Champaign, 3221 Newmark Civil Engineering Laboratory. 205 North Mathews Ave., Urbana, IL 61801. Ил. 5. Библ. 11

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ
РРНК 16S
ИММОБИЛИЗАЦИЯ
УРОВЕНЬ ОБНАРУЖЕНИЯ
МЕТОДЫ
МЕМБРАННЫЕ ФИЛЬТРЫ

Доп.точки доступа:
Raskin, Lutgarde; Capman, William C.; Kane, Matthew D.; Rittmann, Bruce E.; Stahl, David A.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.06-04Б2.214

A molecular comparison of culturable aerobic heterotrophic bacteria and 16S rDNA clones derived from a deep subsurface sediment [Text] / Darrell P. Chandler [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 1997. - Vol. 23, N 2. - P131-144 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Молекулярное сравнение культивируемых аэробных гетеротрофных бактерий и клонов рДНК 16S, полученных из глубокого подповерхностного осадка
Аннотация: Чтобы оценить эффективность основанных на ПЦР методов изучения микробного разнообразия и филогении в глубоком (188 м) подповерхностном осадке (ГПО), сравнены профили длины рестрикц. Фрагментов (ПДРФ) генов рРНК 16S (I), полученных из валовой ДНК микробного сообщества и из отдельных бактериальных культур. Филогенетич. родство между генами I обогатительных культур и индивидуальных клонов определено секвенированием генов I. ПДРФ библиотек ПЦР-клонов отвечают за 64% выделенных изолятов и за 55% оцененного культивируемого разнообразия. Эти данные показали, что большинство культивируемых аэробных гетеротрофных бактерий в ГПО может быть охарактеризовано клонами I, полученными из прямо экстрагированной ДНК, но все же основанные на ПЦР методы не описывают все организмы в данном образце ГПО. США, Battelle Pacific Northnest Nat. Lab., Richland, WA 99352. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: РИБОСОМНЫЕ ГЕНЫ
ГЕНЫ
РРНК 16S
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
СРАВНЕНИЕ
ВАЛОВАЯ ДНК МИКРОБНОГО СООБЩЕСТВА
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ КУЛЬТУРЫ
ПОДПОВЕРХНОСТНЫЕ ОСАДКИ
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Chandler, Darrell P.; Li, Shu-Mei; Spadoni, Christina M.; Drake, Gwendolyn R.; Balkwill, David L.; Fredrickson, Jim K.; Brockman, Fred J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 98.09-04Б2.181

A molecular comparison of culturable aerobic heterotrophic bacteria and 16S rDNA clones derived from a deep subsurface sediment [Text] / Darrell P. Chandler [et al.] // FEMS Microbiol. Ecol. - 1997. - Vol. 23, N 2. - P131-144 . - ISSN 0168-6496
Перевод заглавия: Молекулярное сравнение культивируемых аэробных гетеротрофных бактерий и клонов рДНК 16S, полученных из глубокого подповерхностного осадка
Аннотация: Чтобы оценить эффективность основанных на ПЦР методов изучения микробного разнообразия и филогении в глубоком (188 м) подповерхностном осадке (ГПО), сравнены профили длины рестрикц. Фрагментов (ПДРФ) генов рРНК 16S (I), полученных из валовой ДНК микробного сообщества и из отдельных бактериальных культур. Филогенетич. родство между генами I обогатительных культур и индивидуальных клонов определено секвенированием генов I. ПДРФ библиотек ПЦР-клонов отвечают за 64% выделенных изолятов и за 55% оцененного культивируемого разнообразия. Эти данные показали, что большинство культивируемых аэробных гетеротрофных бактерий в ГПО может быть охарактеризовано клонами I, полученными из прямо экстрагированной ДНК, но все же основанные на ПЦР методы не описывают все организмы в данном образце ГПО. США, Battelle Pacific Northnest Nat. Lab., Richland, WA 99352. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.01-04Б2.274

The phylogenetic position of the Thermococcus isolate AN1 based on 16S rRNA gene sequence analysis: A proposal that AN1 represents a new species, Thermococcus zilligii sp. nov. [Text] / R. S. Ronimus [et al.] // Arch. Microbiol. - 1997. - Vol. 168, N 3. - P245-248 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Филогенетическое положение изолята AN1 Thermococcus, основанные на анализе последовательности гена рРНК 16S: предложение, что AN1 представляет новый вид Thermococcus zilligii sp. nov
Аннотация: Клонирован и секвенирован ген рРНК новозеландского изолята AN1 Thermococcus. Обнаружено присутствие сигнатурных последовательностей, показывающих, что штамм AN1 представляет новый вид в р. Thermococcus. Изолят AN1 отличается от других термококков более низкими концентрацией NaCl и температурой, оптимальными для роста. Он имеет необычный состав липидов мембраны и необычную чувствительность к антибиотикам. Предложено считать штамм AN1 представителем нового вида T. zilligii (типовой штамм DSM 2770). Новая Зеландия, Thermophile Research Unit., Univ. of Waikato, Hamilton. Библ. 29

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
ГЕНЫ
КЛОНИРОВАНИЕ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
СИГНАТУРНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
THERMOCOCCUS (BACT.)
ИЗОЛЯТ AN1
НОВЫЙ ВИД
ФИЛОГЕНИЯ
ТАКСОНОМИЯ

Доп.точки доступа:
Ronimus, R.S.; Reysenbach, A.-L.; Musgrave, D.R.; Morgan, H.W.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.154

Yamada, Yuzo.
The phylogeny of acetic acid bacteria based on the partial sequences of 16S ribosomal RNA: The elevation of the subgenus Gluconoacetobacter to the generic level [Text] / Yuzo Yamada, Ken-ichiro Hoshino, Tetsuya Ishikawa // Biosci., Biotechnol. and Biochem. - 1997. - Vol. 61, N 8. - P1244-1251 . - ISSN 0916-8451
Перевод заглавия: Филогения уксуснокислых бактерий, основанная на частичных последовательностях рибосомной РНК 16S: повышение подрода Gluconoacetobacter до уровня рода
Аннотация: Секвенирован сегмент рРНК 16S длиной 156 н. (положения 1220-1375) из 36 штаммов уксуснокислых бактерий, относящихся к р. Acetobacter, Gluconobacter и Acidomonas. Штаммы видов Gluconobacter, имеющих убихинон Q[10], разбиты на 2 подгруппы: 1) типовые штаммы G. oxydans - типового вида р. Gluconobacter; 2) G. cerinus - между к-рыми число нуклеотидных различий n=4. Имеющие Q[9] виды, классифицированные в подрод Acetobacter р. Acetobacter, филогенетически не очень далеки от р. Gluconobacter. Рассчитанное значение n равно 6-9 между типовыми штаммами G. oxydans и G. cerinus и типовыми штаммами A. aceti и A. pasteurianus. Имеющие Q[10] виды, классифицированные в подрод Gluconoacetobacter р. Acetobacter, филогенетически очень далеки от указанных видов Acetobacter и Gluconobacter (n=8-14). Штаммы имеющих Q[10] и ассимилирующих метанол видов р. Acidomonas занимают филогенетически изолированное положение: для типового штамма Acidomonas methanolicus типового вида р. Acidomonas n=9-16. Полученные данные позволили повысить статус подрода Gluconoacetobacter до нового р. Gluconoacetobacter с типовым видом G. liquefaciens. Другими родами уксуснокислых бактерий являются Acidomonas, Acetobacter и Gluconobacter. Япония, Dept. of Applied Biol. Chem., Faculty of Agriculture, Shizuoka Univ., Shizuoka 422. Библ. 40

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
УКСУСНОКИСЛЫЕ БАКТЕРИИ
ГЕНОТИП
РИБОТИПИРОВАНИЕ
РРНК 16S
GLUCOACETOBACTER

Доп.точки доступа:
Hoshino, Ken-ichiro; Ishikawa, Tetsuya

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.273

Bensing, Barbara A.
Pheromone-inducible expression of an aggregation protein in Enterococcus faecalis requires interaction of a plasmid-encoded RNA with components of the ribosome [Text] / Barbara A. Bensing, Gary M. Dunny // Mol. Microbiol. - 1997. - Vol. 24, N 2. - P295-308 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Индуцируемая феромоном экспрессия белка агрегации у Enterococcus faecalis требует взаимодействия кодируемой плазмидой РНК с компонентами рибосомы
Аннотация: Перенос конъюгативной плазмиды pCF10 из донорных штаммов Enterococcus faecalis индуцируется пептидным феромоном cCF10 (I), секретируемым реципиентными клетками, требует экспрессии белка агрегации Asc10 (II), кодируемого геном prgQ, и позитивно регулируется генами prgQ-R-S. С использованием транскрипц. слияний подтверждено, что транскрипция prgB идет по механизму сквозного считывания с промотора prgQ. Кодируемая prgQ РНК Q[L] (III) длиной 530 н., содержащая рРНК-подобные домены, требуется для продукции II. III и I взаимодействуют соотв. с рибосомными белками L6 и S5. Мутац. анализ III показал, что III прямо взаимодействует с рРНК 16S. III присутствует в рибосомах, транслирующих мРНК prgB, и I может позитивно влиять на ассоциацию III с рибосомами. Эти данные позволяют предположить, что позитивные регуляторные молекулы действуют постранскрипционно на полицистронную мРНК и модифицируют популяцию рибосом, усиливая индуцированную I трансляцию prgB. США, Dep. of Microbiol., Univ. of Minnesota, Minneapolis, MN 55455. Библ. 49

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК АГРЕГАЦИИ CCF10
СИНТЕЗ
ПЛАЗМИДЫ
ПЛАЗМИДА PCF10
СТРУКТУРА
ТРАНСЛЯЦИЯ
МРНК ГЕНА PRGQ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РРНК 16S
МЕХАНИЗМ
ENTEROCOCCUS FAECALIS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Dunny, Gary M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.277

Lodmell, J. Stephen
A conformational switch in Escherichia coli 16S ribosomal RNA during decoding of messenger RNA [Text] / J.Stephen Lodmell, Albert E. Dahlberg // Science. - 1997. - Vol. 277, N 5330. - P1262-1267 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Конформационный переключатель в рибосомной РНК 16S Escherichia coli во время декодирования матричной РНК
Аннотация: Получены доказательства существования конформац. переключателя (КП) в рРНК 16S (I), влияющего на связывание тРНК с рибосомами и декодирование мРНК. В КП участвуют 2 альтернативно спаренные структуры в области 912 I. Переключение облегчается рибосомными белками S5 и S12 и сопровождается значительным изменением структуры I. Химич. зондирование обнаружило усиление или ослабление модификации сайтов I, к-рые расположены рядом с сайтами, сшивающимися с мРНК. Полученные данные показали, что КП влияет на взаимное расположение кодона и антикодона и на правильную селекцию тРНК в рибосомном А-сайте. США, Dep. of Molecular and Cell Biol. and Biochem., Brown Univ., Providence, RI 02812. Библ. 75

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РИБОСОМЫ
СТРУКТУРА
ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ
РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
КОНФОРМАЦИЯ
ИЗМЕНЕНИЕ
КОНФОРМАЦИОННЫЙ ПЕРЕКЛЮЧАТЕЛЬ
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Dahlberg, Albert E.

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.285

Зависимость уровня экспрессии гена В E. coli от структуры участка инициации трансляции (TIR) [Текст]. III. Сайты комплементарного взаимодействия TIR с 16S pPHK / А. И. Гуревич [и др.] // Биоорган. химия. - 1997. - Т. 23, N 11. - С. 888-894 . - ISSN 0132-3423
Аннотация: Выявлены сайты вероятного комплементарного взаимодействия участка инициации трансляции (TIR) с 16S рРНК. Изучено значение этих сайтов для уровня экспрессии генов. Высокий уровень экспрессии гена зависит не только от комплементарного взаимодействия TIR с 16S рРНК в сайтах, проксимальных к инициирующему кодону (с ASD ('ДЕЛЬТА'G-8...-10 ккал/моль) и с DB) и расположенных в области -15...+20 мРНК, но и от комплементарных взаимодействий в дистальных сайтах нетранслируемой ветви TIR (mTIR). Среди них сайт UB1, комплементарно взаимодействующий с экспонированным участком 452-490 петли 440-490 16S рРНК, может располагаться в области mTIR -15...-50. В области mTIR -50...-70 могут располагаться сайты UB2 и UB3, взаимодействующие соответственно с экспонированными участками 478-488 петли 440-490 16S рРНК и 520-532 петли 520-540 16S рРНК, причем сайт UB3 значительно эффективнее. Для достижения высокого уровня экспрессии суммарная свободная энергия комплементарного взаимодействия сайтов UB1, UB2 и UB3 с 16S рРНК должна быть выше -20 ккал/моль. Россия, Институт биоорганич. химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, 117871, Москва, ГСП-7, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
УЧАСТОК ИНИЦИАЦИИ
ТРАНСЛЯЦИИ TIR
ГЕНЫ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
УРОВЕНЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ИНИЦИИРУЮЩИЙ КОМПЛЕКС

Доп.точки доступа:
Гуревич, А.И.; Есипов, Р.С.; Качалина, Т.А.; Каюшин, А.Л.; Коростелева, М.Д.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.374

Preparation and characterization of a uniformly {2}H/{15}N-labeled RNA oligonucleotide for NMR studies [Text] / E. P. Nikonowicz [et al.] // Nucl. Acids Res. - 1997. - Vol. 25, N 7. - P1390-1396 . - ISSN 0305-1048
Перевод заглавия: Приготовление и характеристика равномерно меченного {2}H/{15}N олигонуклеотида РНК для изучения методом ЯМР
Аннотация: С использованием ферментативных методов получен олигонуклеотид РНК (I), содержащий сайт связывания (СС) рибосомного белка S8 из рРНК 16S Escherichia coli, с однородным обогащением {15}N и однородным обогащением {2}H во всех необмениваемых положениях. СС длиной 44 н. образует в растворе шпильку и нуждается в Mg{2+} для правильного сворачивания. Сравнены скорости восстановления продольного намагничивания обмениваемых протонов (ОП) в обогащенных {2}H /{15}N I и в шпильке I. Найдено, что дипольная релаксация {1}H-{1}H вносит важный вклад в восстановление продольного намагничивания ОП. Дейтерирование менее сильно влияет на ширину резонансных линий ОП. Это показывает, что химич. обмен с H[2]O остается преобладающим механизмом релаксации поперечного намагничивания. Тем не менее, дейтерирование шпильки I повышает чувствительность метода ядерного усиления Оверхаузера (NOE) по сравнению с полностью протонированной шпилькой и упрощает 2-мерные спектры ЯМР. Увеличение отношения сигнал:шум облегчает отождествление резонансов аминогрупп остатков Ц и нескольких пуринов и дает возможность идентифицировать пики NOE, не наблюдающиеся в спектрах полностью протонированной шпильки. США, Dep. of Biochem. and Cell Biol., Rice Univ., Houston, TX 77005. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РИБОСОМЫ
СТРУКТУРА
БЕЛОК-РНК ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
МЕХАНИЗМ
РИБОСОМНАЯ РНК
РРНК 16S
БЕЛОК S8
САЙТ СВЯЗЫВАНИЯ
СТРУКТУРА
ЯДЕРНЫЙ МАГНИТНЫЙ РЕЗОНАНС
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Nikonowicz, E.P.; Michnicka, M.; Kalurachchi, K.; DeJong, E.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.391

Phenotypic heterogeneity of mutational changes at a conserved nucleotide in 16 S ribosomal RNA [Text] / Frances T. Pagel [et al.] // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 267, N 5. - P1113-1123 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Фенотипическая гетерогенность мутационных замен консервативного нуклеотида в рибосомной РНК 16S
Аннотация: Сконструированы делеция и все возможные замены остатка Ц[1054] в высококонсервативном выступе петли 34 в рРНК 16S (I) Escherichia coli. Обнаружены различные фенотипы 3 разных замен нуклеотидов в этом положении, включающие супрессию нонсенс-кодонов в разных средах и при разных температурах, зависящую от температуры летальность, уровень экспрессии мутантных I, профиль рибосом при центрифугировании в градиенте концентрации сахарозы, ассоциацию мутантных субъединиц 30 S с субъединицами 50 S и влияние на действие супрессорных тРНК. Отмечено, что описанная ранее мутация этого сайта I является не делецией, а заменой Ц[1054]'-'А. Сконструированная делеция Ц[1054] не супрессирует мутации trpA. Полученные данные показали, что сквозное считывание терминирующих кодонов в результате мутаций в положении 1054 является результатом дефекта по терминации пептидных цепей, а не уменьшения общей точности трансляции. США, Dep. of Molecular Genetics, Univ. of Texas Cancer Center, Houston, TX 77030. Библ. 54

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
ПЕТЛЯ 34
Ц[1054]
ЗАМЕНЫ
ФЕНОТИПИЧЕСКАЯ ГЕТЕРОГЕННОСТЬ
ТЕРМИНАЦИЯ
ПОЛИПЕПТИДНЫЕ ЦЕПИ
ДЕФЕКТ
ТЕРМИНИРУЮЩИЕ КОДОНЫ
СКВОЗНОЕ СЧИТЫВАНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Pagel, Frances T.; Zhao, Song Q.; Hijazi, Katthryn A.; Murgola, Emanuel J.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.392

In vivo determination of RNA structure-function relationships: Analysis of the 790 loop in ribosomal RNA [Text] / KangSeok Lee [et al.] // J. Mol. Biol. - 1997. - Vol. 269, N 5. - P732-743 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Определение структурно-функциональных взаимоотношений РНК in vivo. Анализ петли 790 в рибосомной РНК
Аннотация: С использованием нового генетич. подхода одновременно мутированы все положения в петле 790 (П-790) между положениями 786 и 796 рРНК 16S (I) Escherichia coli и отобраны функциональные мутанты I in vivo. Найдено, что функциональны 90 из 262144 мутантных I. Анализ позволил отличить нуклеотиды, непосредственно участвующие в синтезе белка, от нуклеотидов, участвующих в поддержании структуры П-790. Среди функциональных мутантных I положения 789 и 791 инвариантны и наблюдается ковариация нуклеотидов в основании П-790 (положения 787-788 и 794-795). Изучение методом ЯМР и термодинамич. анализ модельных П-790 in vitro обнаружил спаривание остатков 787 и 795 и 788 и 794. Функциональный анализ in vivo мутантов со всеми возможными нуклеотидами в положениях 787 и 795 показал, что стабильное спаривание остатков 787 и 795 предотвращает ассоциацию субъединиц. США, Dep. of Biol. Sci., Wayne State Univ., Detroit, MI 48202. Библ. 58

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РИБОСОМЫ
СТРУКТУРА
РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
ПЕТЛЯ 790
СТРУКТУРА
ФУНКЦИЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Lee, KangSeok; Varma, Shikha; SantaLucia, John; Cunningham, Philip R.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.243

RNA components of Escherichia coli degradosome: Evidence for rRNA decay [Text] / Dmitri A. Bessarab [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 6. - P31757-3161 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: РНК-компоненты деградосомы Escherichia coli: доказательство распада рРНК
Аннотация: Деградосома РНК (ДСР) у Escherichia coli, кроме белковых компонентов, включая РНКазу E (I), содержит также РНК. РНК, найденная в ДСР, состоит из фрагментов рРНК 16S и 23S с дискретными размерами в диапазоне 100-2800 н. Деградация рРНК в ДСР вызвана расщеплением (A+Y) - богатых однонитевых областей в рРНК 16S и 23S под действием I. В ДСР содержится и рРНК 5S, к-рая образуется в результате процессинга I предшественника 9S. Однако в ДСР отсутствуют тРНК, к-рые не расщепляются I in vitro. Эти данные доказали, что в растущих клетках E. coli распад зрелых рРНК происходит в ДСР при участии I. Тайвань, Inst. Mol. Biol., Acad. Sinica, Nankang, Taipei 115. Библ. 47

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
РРНК 23S
(A+Y) - БОГАТЫЕ ОБЛАСТИ
ДЕГРАДАЦИЯ
РНКАЗА E
ДЕГРАДОСОМА
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Bessarab, Dmitri A.; Kaberdin, Vladimir R.; Wei, Chia-Li; Liou, Gunn-Guang; Lin-Chao, Sue

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.223

Mutations in RNAs of both ribosomal subunits cause defects in translation termination [Text] / Alexey L. Arkov [et al.] // EMBO Journal. - 1998. - Vol. 17, N 5. - P1507-1514 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Мутации в РНК обеих рибосомных субъединиц вызывают дефекты по терминации трансляции
Аннотация: Доказано, что рРНК субъединиц 30S и 50S рибосомы Escherichia coli участвуют в катализе гидролиза пептидил-тРНК (I). Во время терминации синтеза белка. Так, в системе терминации трансляции in vitro мутации C1054A в спирали рРНК 16S и G199A в ГТФазном центре рРНК 23S вызывают дефект по гидролизу I в присутствии освобождающего фактора RF2, но не фактора RF1. Это согласуется со свойствами соответствующих мутантов E. coli in vivo. Полученные данные позволяют предположить, что рРНК обеих субъединиц рибосомы играют роль молекулярных передатчиков сигнала терминации трансляции. США, Dep. Mol. Genetics, Univ. Texas M. D. Anderson Cancer Ctr., Houston, TX 77030. Библ. 45

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ТЕРМИНАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
РРНК 23S
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Arkov, Alexey L.; Freistroffer, David V.; Ehrenberg, Mans; Murgola, Emanuel J.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.281

Uchino, Yoshihito.
Phylogenetic position of the marine subdivision of Agrobacterium species based on 16S rRNA sequence analysis [Text] / Yoshihito Uchino, Akira Yokota, Junta Sugiyama // J. Gen. and Appl. Microbiol. - 1997. - Vol. 43, N 4. - P243-247 . - ISSN 0022-1260
Перевод заглавия: Филогенетическое положение морской подгруппы видов Agrobacterium, основанное на анализе последовательностей 16S рРНК
Аннотация: Краткое сообщение. Род Agrobacterium включает две группы видов: сухопутные и фитопатогенные (A. tumefaciens, A. rhizogenes, A. radiobacter, родственные быстрорастущим клубеньковым бактериям Rhizobium и Sinorhizobium) и морские, образующие звездообразные агрегаты (A. atlanticum, A. ferrugineum, A. gelatinovorum, A. meteori, A. stellulatum). Путем анализа последовательностей 16S рРНК показано, что A. atlanticum, A. ferrugineum, A. gelatinovorum, A. meteori неродственны сухопутным агробактериям: они входят в подгруппу альфа-3 протеобактерий (сухопутные формы входят в подгруппу альфа-2) и наиболее близкими к ним формами являются Rhodobacter и Roseobacter. В то же время A. stellulatum и вновь идентифицированный вид A. killense входят в альфа-2 подгруппу, хотя занимает промежуточное положение между Rhizobium и Bradyrhizobium (медленнорастущие клубеньковые бактерии). Япония, Institute of Molecular and Cellular Biosciences, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113. Библ. 17

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: AGROBACTERIUM
МОРСКАЯ ПОДГРУППА
ФИЛОГЕНИЯ
РРНК 16S
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Yokota, Akira; Sugiyama, Junta

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.110

A PCR detection method for rapid identification of Melissococcus pluton in honeybee larvae [Text] / V. A. Govan [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - P1983-1985 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Использование ПЦР для быстрой идентификации Melissococcus pluton в личинках пчел
Аннотация: Метод ПЦР использовали для амплификации специфических последовательностей генов рРНК Melissococcus pluton из чистых бактериальных культур, грубых клеточных лизатов и непосредственно из инфицированных личинок пчел. ПЦР-праймеры для этой цели были сконструированы на основании данных о нуклеотидной последовательности рРНК 16S M. pluton. Показали, что использованный метод позволяет проводить быструю и высокоспецифичную детекцию M. pluton из чистых культур и инфицированных личинок пчел. ЮАР, Department of Microbiology, University of the Western Cape, Private Bag X17, Bellville 7535. Ил. 3. Библ. 20

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: MELISSOCOCCUS PLUTON (BACT.)
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ КУЛЬТУРЫ
ЛИЧИНКИ ПЧЕЛ
ПЦР
ПЦР-ПРАЙМЕРЫ
КОНСТРУИРОВАНИЕ
РРНК 16S
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Govan, V.A.; Brozel, V.; Allsopp, M.H.; Davison, S.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.03-04Б2.305

Godon, Jean-Jacques.
Une carte d'identite moleculaire pour les microeboueurs [Text] / Jean-Jacques Godon, Rene Moletta // Biofutur. - 1998. - N 178. - P38-40 . - ISSN 0294-3506
Перевод заглавия: Молекулярное удостоверение личности для микробов-очистителей
Аннотация: До настоящего времени мало интересовались микрофлорой, развивающейся в очистных сооружениях. Однако эффективность очистки зависит от наших знаний о свойствах и взаимодействиях многочисленных микробов, принимающих в ней участие. Это новое направление экологии микроорганизмов стало бурно развиваться после того, как в нем начали использовать молекул.-биологич. методики. С их помощью можно получить идентификационную генетич. карту каждого вида, не прибегая к культивированию. С этой целью используют последовательность 16S рРНК, идентифицируя не только виды, присутствующие в сложной микробной экосистеме, но и их количественное соотношение. Наиболее удивительным результатом этих исследований оказалось открытие огромного разнообразия каждой экосистемы, напр., в активированных отходах гор. станций очистки было идентифицировано 60 видов микробов. Франция, Infa, Lab. de biotechnologie de l'environnement, av des Etangs, 11100 Narbonne. Библ. 10

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.11.99
Рубрики: ОЧИСТНЫЕ СООРУЖЕНИЯ
ОЧИСТКА
ЭФФЕКТИВНОСТЬ
МИКРООРГАНИЗМЫ
СВОЙСТВА
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
ЗОНДЫ
РРНК 16S
ЭКОСИСТЕМЫ

Доп.точки доступа:
Moletta, Rene

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.03-04Б2.308

Rapid diversification of marine picophytoplankton with dissimilar light-harvesting structures inferred from sequences of Prochlorococcus and Synechococcus (cyanobacteria) [Text] / Ena Urbach [et al.] // J. Mol. Evol. - 1998. - Vol. 46, N 2. - P188-201 . - ISSN 0022-2844
Перевод заглавия: Быстрая диверсификация морского пикофитопланктона с неодинаковыми собирающими свет структурами, выведенная из последовательностей Prochlorococcus и Synechococcus (Cyanobacteria)
Аннотация: Культивируемые изоляты планктонных цианобактерий Prochlorococcus и морских Synechococcus относятся к одному морскому пикопланктонному клейду (МППК). В МППК две глубоко ответвляющиеся линии Prochlorococcus, 2 линии морских Synechococcus кластера А и одна линия морских Synechococcus кластера В проявляют точки дивергенции с небольшими расстояниями между ними. Это согласуется с почти одновременной диверсификацией морских линий, использующих в кач-ве фотосинтетич. системы дивиниловый хлорофилл b и фикобилисомы. Анализ последовательности рРНК 16S, включая данные для 18 членов МППК, согласуется с анализом последовательностей генов pSbB, petB и petD для 5 штаммов Prochlorococcus и одного штамма морских Synechococcus кластера А. Частоты нуклеотидов в 3-их положениях кодонов и межгенных областях широко варьируют среди членов МППК. Тем не менее стандартные и новые филогенетич. методы не обнаружили в этой группе различной картины ветвления и не сгруппировали Prochlorococcus с хлоропластами и др. содержащими хлорофилл b прокариотами. Изоляты Prochlorococcus из поверхностных вод стратифицированных олиготрофных провинций океана преобладают в линии, проявляющей низкую частоту Г+Ц в сильно вариабельных положениях. США, R. M. Parsons Lab., Massachusetts Inst. Technol., Cambridge, MA 02139. Библ. 70

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: МОРСКОЙ ПИКОФИТОПЛАНКТОН
PROCHLOROCOCCUS
SYNECHOCOCCUS
ТОЧКИ ДИВЕРГЕНЦИИ
РРНК 16S
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
АНАЛИЗ
ГЕНЫ PSBB
ГЕНЫ PETB
ГЕНЫ PETD
ФИЛОГЕНИЯ

Доп.точки доступа:
Urbach, Ena; Scanlan, David J.; Distel, Daniel L.; Waterbury, John B.; Chisholm, Sallie W.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI20) 00.03-04И3.258

A PCR detection method for rapid identification of Melissococcus pluton in honeybee larvae [Text] / V. A. Govan [et al.] // Appl. and Environ. Microbiol. - 1998. - Vol. 64, N 5. - P1983-1985 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Использование ПЦР для быстрой идентификации Melissococcus pluton в личинках пчел
Аннотация: Метод ПЦР использовали для амплификации специфических последовательностей генов рРНК Melissococcus pluton из чистых бактериальных культур, грубых клеточных лизатов и непосредственно из инфицированных личинок пчел. ПЦР-праймеры для этой цели были сконструированы на основании данных о нуклеотидной последовательности рРНК 16S M. pluton. Показали, что использованный метод позволяет проводить быструю и высокоспецифичную детекцию M. pluton из чистых культур и инфицированных личинок пчел. ЮАР, Department of Microbiology, University of the Western Cape, Private Bag X17, Bellville 7535. Ил. 3. Библ. 20

ГРНТИ	34.33.19

ВИНИТИ 341.33.19.49.15.39.99
Рубрики: MELISSOCOCCUS PLUTON
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ КУЛЬТУРЫ
ЛИЧИНКИ ПЧЕЛ
ПЦР
ПЦР-ПРАЙМЕРЫ
КОНСТРУИРОВАНИЕ
РРНК 16S
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Govan, V.A.; Brozel, V.; Allsopp, M.H.; Davison, S.

1-20 21-40 41-60 61-80 81-100 101-120

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска