СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=РИБОСОМА<.>)

Общее количество найденных документов : 81
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-40 41-60 61-81 81-81

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 97.04-04Я6.51

A model of protein synthesis based on cryo-electron microscopy of the E. coli ribosome [Text] / Joachim Frank [et al.] // Nature. - 1995. - Vol. 376, N 6539. - P441-444 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Модель синтеза белка, основанная на криоэлектронной микроскопии рибосомы E. coli
Аннотация: Для изучения структуры одиночных рибосом Escherichia coli, уловленных во льду, использована криоэлектронная микроскопия с последующей реконструкцией изображений. На основании 4300 проекций реконструирована 3-мерная структура рибосом 70S с разрешением 25 А. Обнаружены следующие особенности этой структуры: 1) в "шейке" субъединицы 30S имеется канал, ведущий в межсубъединичное пространство; 2) чашевидная платформа субъединицы 30S образует полость в главном теле рибосомы, в к-рую ведет канал; 3) на дне каньона между субъединицами начинается туннель в субъединице 50S, к-рый разветвляется на 2 туннеля, выходящих на поверхность частиц 50S в разных точках; Канал и туннели, вероятно, являются путями соотв. для входящей мРНК и вновь синтезируемой полипептидной цепи. На основании этих данных предложена 3-мерная модель организации синтеза белка. США, Wadsworth Center, New York Dep. of Health, Albany, NY 12201-0509. Библ. 24

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.07.15
Рубрики: РИБОСОМЫ
РИБОСОМА 70S
СТРУКТУРА
КРИОЭЛЕКТРОННАЯ МИКРОСКОПИЯ
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Frank, Joachim; Zhu, Jun; Penczek, Pawel; Li, Yanhong; Srivastava, Suman; Verschoor, Adrlana; Radermacher, Michael; Grassucci, Robert; Lata, Ramani K.; Agrawal, Rajendra K.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI49) 99.04-04Я6.82

Vichitta, Christopher V.
Regulation of the ribosome-membrane junction at early stages of presecretory protein translocation in the mammalian endoplasmic reticulum [Text] / Christopher V. Vichitta, Tianli Zheng // J. Cell Biol. - 1997. - Vol. 139, N 7. - P1697-1708 . - ISSN 0021-9525
Перевод заглавия: Регуляция соединения рибосома-мембрана на ранних стадиях пресекреторной транслокации белков в эндоплазматической сети млекопитающих
Аннотация: С использованием набора составных белков изучали мембранную топологию сигнальной последовательности (СП) на всех стадиях транслокации белков млекопитающих сразу после таргетинга и до отделения СП. Образование устойчивого к протеазам соединения рибосома-мембрана (СРМ) зависит от типа предшественника и стадии транслокации. Вновь синтезируемая полипептидная цепь связывается с мембраной независимо от рибосомы, преимущественно электростатич. силами. Мембранная топология СП одинакова для всех интермедиатов транслокации. Гидрофобный кор СП доступен на цитозольной стороне мембраны на всех стадиях сразу после таргетинга и вплоть до отделения СП. Удаление рибосомы из связанных интермедиатов не нарушает последующую транслокацию, так что активное состояние проводящего белок канала сохраняется и в отсутствие связанной рибосомы. Предложена модель, описывающая регуляцию СРМ вновь синтезированной белковой цепью. США, Dep. Cell Biol., Dake Univ. Med. Ctr., Durham, NC 27710. Библ. 53

ГРНТИ	34.19.17

ВИНИТИ 341.19.17.07.13
Рубрики: ЭНДОПЛАЗМАТИЧЕСКАЯ СЕТЬ
ТРАНСЛОКАЦИЯ БЕЛКОВ
ПРЕСЕКРЕТОРНАЯ СТАДИЯ
СОЕДИНЕНИЕ РИБОСОМА-МЕМБРАНА
МОДЕЛИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Zheng, Tianli

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.388

Mapping the messenger RNA within the elongating ribosome [Text] : [Pap.] Ist Eur. Conf. Neutron Scattering (ECNS'96), Interlaken, 8-II Oct., 1996 / R. Junemann [et al.] // Physica. B. - 1997. - Vol. 234-236. - P193-195 . - ISSN 0921-4526
Перевод заглавия: Картирование матричной РНК в элонгирующей рибосоме
Аннотация: Для изучения положения мРНК в элонгирующей рибосоме использован метод вариации протонного спинового контраста. С использованием искусственного фрагмента мРНК определено положение центра массы мРНК, покрытой рибосомой, для состояний до и после трансляц. транслокации. Показано, что центр массы мРНК при транслокации смещается на 12'+-'5 A и что радиус вращения мРНК равен 12'+-'3 A. Эти данные являются независимым вкладом в улучшение структурной модели лигандов РНК в элонгирующей рибосоме. Германия, MPI fur Molekulare Genetics, AG Ribosomen, D-14195 Berlin. Библ. 11

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РНК МАТРИЧНАЯ
ПОЛОЖЕНИЕ
ЭЛОНГИРУЮЩАЯ РИБОСОМА
МЕТОДЫ
МЕТОД ВАРИАЦИИ ПРОТОННОГО СПИНОВОГО КОНТРАСТА

Доп.точки доступа:
Junemann, R.; Wadzack, J.; Burkhardt, N.; Schmitt, M.; Zhao, J.; Stuhramnn, H.B.; Nierhaus, K.H.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.06-04Б2.448

Mangroo, Dev.
Escherichia coli initiator tRNA: Structure-function relationships and interactions with the translational machinery [Text] : [Pap.] Int. Conf. Struct. and Funct. Ribosome, Victoria, May 20-25, 1995 / Dev Mangroo, Xin-Qi Wu, Uttam L. RajBhandary // Biochem. and Cell Biol. - 1995. - Vol. 73, N 11-12. - P1023-1031 . - ISSN 0829-8211
Перевод заглавия: Инициаторная тРНК Escherichia coli: структурно-функциональные взаимоотношения и взаимодействие с аппаратом трансляции
Аннотация: Обзор, посвященный изучению мутантных инициаторных тРНК (I) Escherichia coli. Перепроизводство метионил-тРНК-трансформилазы специфически спасает активность мутантных I, дефектных по формилированию, но не мутантов, дефектных по связыванию с P-сайтом. Гиперпродукция фактора инициации IF2 повышает активность всех мутантных I с антикодоном ЦУА, но не I с антикодоном ГАЦ. Гиперпродукция IF3 не влияет на активность всех мутантных I. Изучен мутант I с заменой антикодона ЦАУ'-'ЦУА, к-рый инициирует синтез белка с УАГ, а не с АУГ. В отличие от I дикого типа, эта мутантная I имеет остаток 2-метилтио-N{6}-изопентениладенозина (II) рядом с антикодоном, важный для активности I в инициации. В мутанте miaA E. coli, дефектном по биосинтезу II, мутантная I гораздо менее активна, в инициации из-за дефекта по связыванию с рибосомным P-сайтом. США, Dep. of Biol., Massachusetts Inst. of Technol., Cambridge, MA 02139. Библ. 55

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РНК ТРАНСПОРТНАЯ
ИНИЦИАТОРНАЯ
СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ ВЗАИМООТНОШЕНИЯ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С
P-УЧАСТОК
РИБОСОМА
МУТАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wu, Xin-Qi; RajBhandary, Uttam L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 99.07-04А1.88

Briones, Carlos.
Functional phylogeny: The use of the sensitivity of ribosomes to protein synthesis inhibitors as a tool to study the evolution of organisms [Text] : pap. ISSOL Meet., Orleans, Oct., 1996 / Carlos Briones, Kostadin Koroutchev, Ricardo Amils // Orig. Life and Evol. Bios. - 1998. - Vol. 28, N 4-6. - P571-582 . - ISSN 0169-6149
Перевод заглавия: Функциональная филогения: использование чувствительности рибосом к ингибиторам синтеза белка как средства для изучения эволюции организмов
Аннотация: Исследовали чувствительность рибосом (Рс) 40 видов архебактерий и эукариот к 40 различным ингибиторам синтеза белка (ИСБ), имеющим разные точки приложения в Рс. Кривые зависимости доза-эффект для различных ИСБ обнаруживают сходство для организмов, принадлежащих к одной филогенетической группе, что позволяет использовать ИБС как средство анализа эволюции организмов. Полученные результаты согласуются с данными изучения последовательностей 16S- и 18S-рРНК. Испания, Ctr Biol. Mol., Univ. Autonoma, Cantoblanco, 28049-Madrid. Библ. 45

ГРНТИ	34.03.17

ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: ФИЛОГЕНИЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ
РИБОСОМА
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К ИНГИБИТОРАМ СИНТЕЗА БЕЛКА
КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ АНАЛИЗ
ЭВОЛЮЦИЯ
АРХЕБАКТЕРИИ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Koroutchev, Kostadin; Amils, Ricardo

РЖ ВИНИТИ 34 (BI48) 99.08-04Т2.386

Burghardt, Helena.
On the target of a novel class of antibiotics, oxazolidinones, active against multidrug-resistant gram-positive bacteria [Text] / Helena Burghardt, Karl-Ludwig Schiz, Mathias Muller // FEBS Lett. - 1998. - Vol. 425, N 1. - P40-44 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: О мишени для нового класса антибиотиков - оксазолидинонов, активных против устойчивых к многим лекарствам грамположительных бактерий
Аннотация: Изучено влияние оксазолидинона DuP 721 (I) на индивидуальные стадии трансляции белка. I не мешает инициации трансляции на стадиях связывания мРНК и образования преинициирующих комплексов 30S. I дозозависимым образом ингибирует опосредованное пуромицином освобождение {35}S-формилметионина из инициирующих комплексов 70S. В ингибировании участвует связывание I с большой рибосомной субъединицей. I связывается с субъединицами 50S из грамположительных бактерий вдвое сильнее, чем из грамотрицательных бактерий. Германия, Inst. Biochem. und Molekularbiol., Univ. Freiburg, D-79104 Freiburg. Библ. 18

ГРНТИ	34.45.21

ВИНИТИ 341.45.21.95.11.45
Рубрики: ОКСАЗОЛИДИНОНЫ
ВЛИЯНИЕ НА
ТРАНСЛЯЦИЯ
БЕЛОК
СВЯЗЫВАНИЕ
РИБОСОМА 50S
S-ФОРМИЛМЕТИОНИН
ОСВОБОЖДЕНИЕ
ИНИЦИИРУЮЩИЙ КОМПЛЕКС 70S
ИНГИБИРОВАНИЕ
ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Schiz, Karl-Ludwig; Muller, Mathias

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.221

Burghardt, Helena.
On the target of a novel class of antibiotics, oxazolidinones, active against multidrug-resistant gram-positive bacteria [Text] / Helena Burghardt, Karl-Ludwig Schiz, Mathias Muller // FEBS Lett. - 1998. - Vol. 425, N 1. - P40-44 . - ISSN 0014-5793
Перевод заглавия: О мишени для нового класса антибиотиков - оксазолидинонов, активных против устойчивых к многим лекарствам грамположительных бактерий
Аннотация: Изучено влияние оксазолидинона DuP 721 (I) на индивидуальные стадии трансляции белка. I не мешает инициации трансляции на стадиях связывания мРНК и образования преинициирующих комплексов 30S. I дозозависимым образом ингибирует опосредованное пуромицином освобождение {35}S-формилметионина из инициирующих комплексов 70S. В ингибировании участвует связывание I с большой рибосомной субъединицей. I связывается с субъединицами 50S из грамположительных бактерий вдвое сильнее, чем из грамотрицательных бактерий. Германия, Inst. Biochem. und Molekularbiol., Univ. Freiburg, D-79104 Freiburg. Библ. 18

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ОКСАЗОЛИДИНОНЫ
ВЛИЯНИЕ НА
ТРАНСЛЯЦИЯ
БЕЛОК
СВЯЗЫВАНИЕ
РИБОСОМА 50S
S-ФОРМИЛМЕТИОНИН
ОСВОБОЖДЕНИЕ
ИНИЦИИРУЮЩИЙ КОМПЛЕКС 70S
ИНГИБИРОВАНИЕ
ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ

Доп.точки доступа:
Schiz, Karl-Ludwig; Muller, Mathias

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.11-04Б2.160

Escherichia coli 70 S ribosome at 15 A resolution by cryo-electron microscopy: Localization of fMet-tRNA{Mef}[f] and fitting of L1 protein [Text] / Arun Mahorta [et al.] // J. Mol. Biol. - 1998. - Vol. 280, N 1. - P103-116 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Рибосома 70S Escherichia coli, [изученная] с разрешением 15 A методом криоэлектронной микроскопии: локализация формилметионил-тРНК{fmet}[f] и установление положения белка L1
Аннотация: Более 29 000 проекций рибосомного комплекса, полученных методом криоэлектронной микроскопии, использованы для построения 3-мерной карты рибосомы 70S Escherichia coli, в к-рой Р-сайт занят формилметионил-тРНК{fmet}[f] при использовании мРНК, содержащей кодон AUG. Поверхностное разрешение этой карты (14,9 A) сделало возможным прямо и однозначно согласовать рентгеноструктурные данные о тРНК с картой электронной плотности. Это позволило установить положения кодон-антикодонового взаимодействия и пептидилтрансферазного центра рибосомы. При таком разрешении один из хорошо разрешенных доменов соотв. рентгеновской структуре рибосомного белка L1. США, Wadworth Ctr., New York State Dep. Hlth., Allany, NY 12201-0509. Библ. 51

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РИБОСОМЫ
РИБОСОМА 70S
БЕЛОК L1
ФОРМИЛМЕТИОНИЛ-ТРНК{FMET}
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
КРИОЭЛЕКТРОННАЯ МИКРОСКОПИЯ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Mahorta, Arun; Penczek, Pawel; Agrawal, Rajendra K.; Gabashvill, Irene S.; Grassucci, Robert A.; Junemann, Ralf; Burkhardt, Nils; Nierhaus, Knud H.; Frank, Joachim

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.01-04Б2.267

Visualization of elongation factor G on the Escherichia coli 70S ribosome: The mechanism of translocation [Text] / Rajendra K. Agrawal [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 11. - P6134-6138 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Визуализация фактора элонгации G на рибосоме 70S Escherichia coli: механизм транслокации
Аннотация: Методом 3-мерной криоэлектронной микроскопии фактор элонгации EF-G (I) визуализирован в комплексе рибосома-I-ГДФ-фузаровая к-та. Сравнение с кристаллич. структурой комплекса I-ГДФ обнаружило большое изменение конформации, ассоциированное главным образом с доменом IV, к-рый по форме имитирует антикодоновое плечо тРНК в структурно гомологичном комплексе фенилаланил-тРНК{фен}, EF-Tu и аналога ГТФ. Кончик этого домена занимает положения, перекрывающиеся с антикодоновым плечом тРНК в А-сайте. Это позволяет предположить что I смещает тРНК из А-сайтов в Р-сайт в результате физич. взаимодействия с антикодоновым плечом. США, Wadsworth Ctr., New York State Dep., Albany, NY 12201-0509. Библ. 37

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ФАКТОРЫ
ФАКТОР ЭЛОНГАЦИИ EF-G
КОМПЛЕКС
РИБОСОМА 70S - ГДФ-ФУЗАРОВАЯ КИСЛОТА
ДОМЕН IV
ТРАНСЛОКАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Agrawal, Rajendra K.; Penczek, Pawel; Grassucci, Robert A.; Frank, Joachim

10.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.12-04Б2.369

Promotion of Met-tRNA[i]{Met} binding to ribosomes by yIF2, a bacterial IF2 homolog in yeast [Text] / Sang Ki Choi [et al.] // Science. - 1998. - Vol. 280, N 5370. - P1757-1766 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Продвижение связывания метионил-тРНК{мет} с рибосомным белком yIF2 - гомологом бактериального IF2 у дрожжей
Аннотация: Доставка инициаторной метионил-тРНК{мет}[i] (I) в рибосомы катализируется структурно не похожими друг на друга факторам инициации трансляции IF2 (II) у прокариотов и eIF2 у эукариотов. Белок FUN12 (YAL 035w) у Saccharomyces cerevisiae кодирует белок, на 48% гомологичный II Escherichia coli и названный yIF2 (III). Разрушение гена FUN12 не устраняет жизнеспособность клеток дрожжей, но сильно замедляет рост. Рибосомы 80S из штамма fun12'ДЕЛЬТА' являются неактивными, т. к. не содержат мРНК. Экстракт клеток fun12'ДЕЛЬТА' в 15 раз менее активен в трансляции, чем экстракт клеток дикого типа. Показано, что III участвует в общей инициации трансляции, вызывая связывание I с рибосомами. Т. обр. механизмы синтеза белка у про- и эукариотов более похожи, чем считалось ранее. США, Lab. Eykaryotic Gene Regulation, NICHHD, NIH, Bethesda, MD 20892-2716. Библ. 30

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.11.21.07.03
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
МЕТИОНИЛ-ТРНК[I]{МЕТ}
ДОСТАВКА
РИБОСОМА
МЕХАНИЗМ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РИБОСОМНЫЙ БЕЛОК YIF2
ФУНКЦИЯ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Choi, Sang Ki; Lee, Joon H.; Zoll, Wendy L.; Merrick, William C.; Dever, Thomas E.

11.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.01-04Б2.305

Mutations that alter initiation codon discrimination by Escherichia coli initiation factor IF3 [Text] / C. Sacerdot [et al.] // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 288, N 5. - P803-810 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Мутации, изменяющие дискриминацию инициирующих кодонов фактором инициации IF3
Аннотация: Выделены мутации в структурном гене infC фактора инициации IF3 (I) Escherichia coli. Из 21 мутанта 7 образуют стабильные варианты I, неспособные комплементировать штаммы с хромосомной делецией 'ДЕЛЬТА'infC и дефектные по дискриминации неканонич. инициирующих кодонов, таких, как АУУ и АЦГ. Два мутанта с наиболее сильными дефектами по дискриминации или комплементации имеют соотв. замены D106N (IA) или P176L (IB) в С-концевом домене I, отвечающем за связывание с рибосомной субъединицей 30S (PC-30). Способность связываться с РС-30 понижена у IB и неожиданно оказалась повышенной у IA. Дефект IA можно объяснить способностью неспецифически связываться с др. мишенями, в частности с РС-50, к-рая обычно не узнается I. У IA заменен кислый остаток D106, к-рый может играть негативную дискриминирующую роль в предотвращении взаимодействий с неродственными РНК. Франция, Inst. Biol. Physico-Chim., 75005 Paris. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: МУТАЦИИ
ГЕН ФАКТОРА ИНИЦИАЦИИ IF3 INFC
ДЕФЕКТНЫЕ ПО ДИСКРИМИНАЦИИ ИНИЦИИРУЮЩИХ КОДОНОВ
С-КОНЦЕВОЙ ДОМЕН
ЗАМЕНЫ
СВЯЗЫВАНИЕ
РИБОСОМА 30S
ESCHERICHIA COLI

Доп.точки доступа:
Sacerdot, C.; de, Cock E.; Engst, K.; Graffe, M.; Dardel, F.; Springer, M.

12.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 01.02-04Б1.88

Сизова, Д. В.
Участки внутреннего связывания рибосомы вирусных и клеточных РНК [Текст] / Д. В. Сизова, И. Н. Шатский // Молекул. биол. - 2000. - Т. 34, N 2. - С. 181-192 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Обзор. В последние годы исследование механизма внутренней инициации трансляции в клетках эукариот все чаще привлекает внимание мол. биологов. За десятилетие, прошедшее с того момента, когда возможность связывания рибосомной 40S-субчастицы с участком РНК, значительно удаленным от 5'-конца молекулы, была обнаружена у пикорнавирусов, накопилось немало примеров вирусных и даже клеточных РНК, способных к внутреннему связыванию рибосомной 40S-субчастицы. Суммированы данные о расположении, строении и функциональных особенностях участков внутреннего связывания рибосомы (IRES-элементов), содержащихся в вирусных и клеточных РНК, а также о белках, способных прочно и высокоспецифично связываться с IRES-элементами. Обсуждается вопрос о невозможности выведения единой модели строения и функционирования вирусных и клеточных IRES-элементов. Россия, Ин-т физико-химической биол. МГУ, Москва, 119899. Библ. 111

ГРНТИ	34.25.19

ВИНИТИ 341.25.19.09
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ВНУТРЕННЯЯ ИНИЦИАЦИЯ
РИБОСОМА
СУБЧАСТИЦА 40S
IRES-ЭЛЕМЕНТЫ
СТРУКТУРА
ФУНКЦИИ
ЭУКАРИОТЫ
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 111

Доп.точки доступа:
Шатский, И.Н.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.243

Initiation of Escherichia coli ribosomes on matrix coupled mRNAs studied by optical biosensor technique [Text] / Maria Karlsson [et al.] // Biochimie. - 1999. - Vol. 81, N 10. - P995-1002 . - ISSN 0300-9084
Перевод заглавия: Инициация рибосом Escherichia coli на мРНК, сопряженных с матриксом, изученная оптическим биосенсорным методом
Аннотация: Инициация синтеза белка рибосомами Escherichia coli на мРНК, прикрепленных к поверхности (мРНК{*}), изучена методом поверхностного плазменного резонанса на приборе BIACORE 2000. мРНК окисляли периодатом и сопрягали гидразином с поверхностью сенсорного чипа СМ5. Инициирующие комплексы рибосом 70S с мРНК{*} и формилметионил-тРНК{фмет} (I) собирали на мРНК{*} последовательным добавлением субъединиц 30S и 50S в присутствии соответствующих факторов инициации и I. Показано, что эти комплексы эффективно образуются на мРНК{*} только в присутствии тРНК. Комплексы 70S - мРНК{*} - I более стабильны, чем комплексы с деацилированными тРНК. Эффективное образование и медленная диссоциация зрелых инициирующих комплексов 70S - мРНК{*} - I объясняется стабилизацией взаимодействия рибосомных субъединиц в присутствии I. Швеция, Dep. Cell and Mol. Biol., Biomed. Ctr., 75124 Uppsala. Библ. 35

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ТРАНСЛЯЦИЯ
РИБОСОМЫ
ИНИЦИАЦИЯ
КОМПЛЕКС
70S РИБОСОМА
МРНК
ОБРАЗОВАНИЕ
ВЛИЯНИЕ
ТРНК
МЕТОДЫ
ОПТИЧЕСКИЙ БИОСЕНСОРНЫЙ МЕТОД
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Karlsson, Maria; Pavlov, Michael Yu.; Malmqvist, Magnus; Persson, Bjorn; Ehrenberg, Mans

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.250

Pape, Tillmann.
Induced fit in inital selection and proofreading of aminoacyl -tRNA on the ribosome [Text] / Tillmann Pape, Wolfgang Wintermeyer, Marina Rodnina // EMBO Journal. - 1999. - Vol. 18, N 13. - P3800-3807 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Индуцированное соответствие в начальной селекции и коррекции аминоацил-тРНК на рибосоме
Аннотация: Точность отбора аминоацил-тРНК (I) бактериальной рибосомой определяется начальной селекцией гидролиза ГТФ фактором элонгации EF-Tu и коррекцией после гидролиза ГТФ. Определены константы связывания с А-сайтом почти родственных I. Сравнение с данными для родственных I обнаружило дополнительный важный вклад в дискриминацию I конформац. сопряжения по механизму индуцированного соответствия. Найдено, что 2 стадии перестройки, лимитирующие химич. реакции связывания с А-сайтом: активация ГТФазы (перед гидролизом ГТФ) и аккомодация к А-сайту (перед образованием пептидной связи) - для родственных I идут гораздо быстрее, чем для почти родственных I. Высказано предположение, что родственные кодон-антикодоновые взаимодействия, более эффективные, чем почти родственные, индуцируют особую конформацию декодирующего центра рРНК 16S, к-рая в свою очередь способствует активации ГТФазы и аккомодации I к А-сайту и ускоряет химич. стадии. Индуцированное соответствие может вносить вклад в точность всех программированных матрицами систем. Германия, Inst. Mol. Biol., Univ. Witten/Herdecke, D-58448 Witten. Библ. 38

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ
МЕХАНИЗМ
РИБОСОМА
АМИНОАЦИЛ-ТРНК
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ТОЧНОСТЬ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wintermeyer, Wolfgang; Rodnina, Marina

15.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.251

Williams, Kelly P.
Resuming translation on tmRNA: A unique mode of determing a reading frame [Text] / Kelly P. Williams, Kimberly A. Martindale, David P. Bartel // EMBO Journal. - 1999. - Vol. 18, N 19. - P5423-5433 . - ISSN 0261-4189
Перевод заглавия: Возобновление трансляции на тмРНК: уникальная мода определения рамки считывания
Аннотация: Бактериальная рибосома переключается с мРНК, не имеющей стоп-кодона в рамке считывания, и возобновляет трансляцию на тмРНК SsrA (I). Показано, что рибосома доходит до последнего 3'-концевого кодона в дефектной мРНК и использует его перед переключением. Первый триплет, транслируемый в I ("возобновляющий кодон"; ВК) определяется на 2 уровнях: отдаленный элемент I ограничивает выбор ВК узким окном, а локальные 5'-элементы обеспечивают окончательный точный выбор. С использованием метода рандомизации - селекции выровнены последовательности I из разных видов. Показано, что триплет УА (А/Г), обычно узнаваемый как стоп-кодон освобождающим фактором RFI, сохраняется на расстоянии 2 н. с 5'-стороны от ВК. Центральный аденозин в этом триплете необходим для активности I. Рамка считывания I определяется не так, как в мРНК: первый транслируемый кодон I не узнается специальным антикодоном тРНК. США, Dep. Biol., Indiana Univ., Bloomington, IN 47405-3700. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
РИБОСОМА
ТМРНК
ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ
ИНИЦИИРУЮЩИЙ КОДОН
ЛОКАЛИЗАЦИЯ
РАМКА СЧИТЫВАНИЯ
ОПРЕДЕЛЕНИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Martindale, Kimberly A.; Bartel, David P.

16.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.02-04Б2.257

Macbeth, Mark R.
Characterizaton of in vitro and in vivo mutations in non-conserved nucleotides in the ribosomal RNA recognition domain for the ribotoxins ricin and sarcin and the translation elongation factors [Text] / Mark R. Macbeth, Ira G. Wool // J. Mol. Biol. - 1999. - Vol. 285, N 2. - P567-580 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Характеристика in vitro и in vivo мутаций неконсервативных нуклеотидов в домене узнавания риботоксинов рицина и сарцина и факторов трансляции в рибосомной РНК
Аннотация: В олигорибонуклеотидах, имитирующих сарцин-рициновый домен (СРД) рРНК 28S (I) крысы сконструировали делеции пар неконсервативных, сближенных, но не связанных водородной связью остатков Ц4317 и Ц4333 или У4316 и Ц4322. Эти делеции не влияют на депуринизацию А4324 под действием рицина (II) и разрыв фосфодиэфирной связи с 3'-стороны от Г4325 под действием сарцина (III). Одновременная делеция всех 4 остатков уменьшает расщепление III, но не влияет на депуринизацию под действием II. Удаление из I неканонич. пары А4317*А4333 устраняет узнавание II и III. Делеция из олигонуклеотида, имитирующего СРД рРНК 23S Escherichia coli (IV) остатков У2653 и Ц2667, соответствующих У4316, Ц4317 и Ц4331, Ц4332 в I, или замена У2653'-'Г, создающая уотсон-криковскую пару Г2653-Ц2667, уменьшают расщепление под действием III и слегка увеличивают депуринизацию под действием II. Нарушение действия III вызвано стабилизацией мутантных олигонуклеотидов: T[m] равна 60'ГРАДУС' для РНК дикого типа, 65'ГРАДУС' для мутанта У2653'-'Ц2667 и 69'ГРАДУС' для мутанта У2653Г. Экспрессия мутантного гена IV, лишенного У2653 и Ц2667, летальна in vivo, а мутация У2653Г ухудшает рост. Мутантные рибосомы имеют пониженную активность в синтезе белка, а рибосомы с мутацией У2653Г устойчивы к III. Связывание фактора элонгации трансляции EF-G (V) с олигонуклеотидами, имеющими двойную делецию У2653/Ц2667, понижено. Уменьшение эффективности рибосом можно объяснить влиянием этой делеции на сродство V к СРД. Эти данные позволили предположить, что СРД в рибосомах требует существования области структурной гибкости для оптимальной эффективности. США, Dep. Biochem. and Mol. Biol., Univ. Chicago, Chicago, IL 60637. Библ. 32

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ТОКСИНЫ
РИБОТОКСИНЫ
САРЦИН
РИЦИН
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
РРНК 28S
РИБОСОМА
СТРУКТУРА
ФАКТОРЫ ЭЛОНГАЦИИ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wool, Ira G.

17.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI15) 01.04-04В2.448

Promotion of Met-tRNA[i]{Met} binding to ribosomes by yIF2, a bacterial IF2 homolog in yeast [Text] / Sang Ki Choi [et al.] // Science. - 1998. - Vol. 280, N 5370. - P1757-1766 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Продвижение связывания метионил-тРНК{мет} с рибосомным белком yIF2 - гомологом бактериального IF2 у дрожжей
Аннотация: Доставка инициаторной метионил-тРНК{мет}[i] (I) в рибосомы катализируется структурно не похожими друг на друга факторам инициации трансляции IF2 (II) у прокариотов и eIF2 у эукариотов. Белок FUN12 (YAL 035w) у Saccharomyces cerevisiae кодирует белок, на 48% гомологичный II Escherichia coli и названный yIF2 (III). Разрушение гена FUN12 не устраняет жизнеспособность клеток дрожжей, но сильно замедляет рост. Рибосомы 80S из штамма fun12'ДЕЛЬТА' являются неактивными, т. к. не содержат мРНК. Экстракт клеток fun12'ДЕЛЬТА' в 15 раз менее активен в трансляции, чем экстракт клеток дикого типа. Показано, что III участвует в общей инициации трансляции, вызывая связывание I с рибосомами. Т. обр. механизмы синтеза белка у про- и эукариотов более похожи, чем считалось ранее. США, Lab. Eykaryotic Gene Regulation, NICHHD, NIH, Bethesda, MD 20892-2716. Библ. 30

ГРНТИ	34.29.15

ВИНИТИ 341.29.15.17.17
Рубрики: ТРАНСЛЯЦИЯ
МЕТИОНИЛ-ТРНК[I]{МЕТ}
ДОСТАВКА
РИБОСОМА
МЕХАНИЗМ
РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
РИБОСОМНЫЙ БЕЛОК YIF2
ФУНКЦИЯ
SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)

Доп.точки доступа:
Choi, Sang Ki; Lee, Joon H.; Zoll, Wendy L.; Merrick, William C.; Dever, Thomas E.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.07-04Б2.247

Three-dimensional (3D) mapping of elongation factor-G (EF-G) on the E. coli 70S ribosome: The mechanism of translocation [Text] : abstr. 13th Int. Biophys. Congr., New Delhi, 19-24 Sept., 1999 / Rajendra K. Agrawal [et al.] // J. Biosci. - 1999. - Vol. 24, Suppl. 1. - P146 . - ISSN 0250-5991
Перевод заглавия: Трехмерное картирование фактора элонгации G на рибосоме 70S E. coli: механизм транслокации
Аннотация: Методом криоэлектронной микроскопии визуализирован фактор элонгации EF-G E. coli в состояниях с ГТФ или ГДФ на рибосоме 70S. Кончик домена IV EF-G и антикодоновое плечо тРНК на А-сайте до транслокации взаимодействуют с одним и тем же сайтом рибосомы. Гидролиз ГТФ необходим для связывания EF-G с предтрансляционным комплексом и для завершения трансляции. Обнаружены большие конформационные изменения в рибосоме, ассоциированные со связыванием EF-G и с зависящим от EF-G гидролизом ГТФ. В состоянии с ГДФ стебель L7/L12 удлинен и его основание соединено с доменом G' в EF-G. В состоянии с ГТФ стебель расщепляется на 2 субдомена и соединение отсутствует. При связывании EF-G головка субъединицы 30S перемещается относительно субъединицы 50S. США, Wadsworth Ctr., SUNY, Albany, NY 12201-0509

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: ФАКТОРЫ
ФАКТОР ЭЛОНГАЦИИ ТРАНСЛЯЦИИ EFG
ВИЗУАЛИЗАЦИЯ
РИБОСОМА 70S
ТРЕХМЕРНОЕ КАРТИРОВАНИЕ
МЕХАНИЗМ ТРАНСЛОКАЦИИ
МЕТОД КРИОЭЛЕКТРОННОЙ МИКРОСКОПИИ
ESCHERICHIA COLI (BACT.)

Доп.точки доступа:
Agrawal, Rajendra K.; Heagle, Amy B.; Penczek, Pawel; Grassucci, Robert; Frank, Joachim

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.247

Functional insights from the structure of the 30S ribosomal subunit and its interactions with antibiotics [Text] / Andrew P. Carter [et al.] // Nature. - 2000. - Vol. 407, N 6802. - P340-348 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Функциональные сведения из структуры рибосомной субъединицы 30S и ее взаимодействий с антибиотиками
Аннотация: Обсуждаются функциональные следствия, вытекающие из определения 3-мерной структуры субъединицы 30S рибосомы Thermus thermophilus с разрешением 3 A. Описана структура сайтов A, P и E и спирали 27 переключения точности в субъединице 30S. Определена 3-мерная структура комплексов субъединицы 30S с антибиотиками паромомицином, стрептомицином и спектиномицином, интерферирующими с декодированием и транслокацией. Эти данные установили структурную основу действия этих антибиотиков и позволили предложить модель, объясняющую роль универсально консервативных остатков A1492 и A1493 рРНК 16S в процессе декодирования. Великобритания, MRC Lab. Mol. Biol., Cambridge CB2 2QH. Библ. 46

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РИБОСОМА
СУБЪЕДИНИЦА 30S
ТРЕХМЕРНАЯ СТРУКТУРА
АНТИБИОТИКИ
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
МЕХАНИЗМ
THERMUS THERMOPHILUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Carter, Andrew P.; Clemons, William M.; Brodersen, Ditlev E.; Morgan-Warren, Robert J.; Wimbrly, Brian T.; Ramakrishnan, V.

20.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.03-04Б2.248

Structure of the 30S ribosomal subunit [Text] / Brian T. Wimberly [et al.] // Nature. - 2000. - Vol. 407, N 6802. - P327-339 . - ISSN 0028-0836
Перевод заглавия: Структура рибосомной субъединицы 30S
Аннотация: Кристаллич. структура субъединицы 30S рибосомы из Thermus thermophilus определена с разрешением 3 A. Эта структура содержит все упорядоченные области и 20 ассоциированных с рибосомой белков и составляет 99% рРНК 16S и 95% рибосомных белков. Рассмотрены общая структура субъединицы 30S, структуры доменов рРНК 16S и взаимодействия рибосомных белков с РНК. Великобритания, MRC Lab. Mol. Biol., Cambridge CB2 2QH. Библ. 50

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.09.09.07
Рубрики: РИБОСОМА
СУБЪЕДИНИЦА 30S
СТРУКТУРА
РЕНТГЕНОСТРУКТУРНЫЙ АНАЛИЗ
РНК РИБОСОМНАЯ
РРНК 16S
РНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ
THERMUS THERMOPHILUS (BACT.)

Доп.точки доступа:
Wimberly, Brian T.; Brodersen, Ditlev E.; Clemons, William M.; Morgan-Warren, Robert J.; Carter, Andrew P.; Vonrhein, Clemens; Hartsch, Thomas; Ramakrishnan, V.

1-20 21-40 41-60 61-81 81-81

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска