Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
в найденном
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>S=ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА<.>)
Общее количество найденных документов : 92
Показаны документы с 1 по 20
 1-20    21-40   41-60   61-80   81-92 
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.03-04Б2.284

   

    Dissection of the transcription machinery for housekeeping genes of Bradyrhizobium japonicum [Text] / Christoph Beck [et al.] // J. Bacteriol. - 1997. - Vol. 179, N 2. - P364-369 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Анализ механизма транскрипции генов "домашнего хозяйства" у Bradyrhizobium japonicum
Аннотация: У медленнорастущих клубеньковых бактерий сои (Bradyrhizobium japonicum) клонирован ген sigA, который кодирует 'сигма'{80}-субъединицу РНК-полимеразы. Гомология продукта этого гена с белком SigA Rhizobium meliloti составляет 72%, а с белком Escherichia coli - 51%. В составе C-конца этого белка обнаружен уникальный участок (24 аминокислотных остатка), богатый пролином и аланином, к-рый отсутствует у других бактерий. Мол. м. белка составила 90 кД. Очищенный белок может индуцировать транскрипцию генов "домашнего хозяйства" rrn и groESL. Из оперона rrn был выделен промотор, в к-ром в системе in vitro были получены мутанты с нарушенным связыванием белка SigA. Таким образом, система транскрипции генов "домашнего хозяйства" у ризобий люцерны сходна с системами других бактерий. Германия, Microbiol. Inst., Eidgenossche Technishe Hochschule, ETH-Zentrum, CH-8092 Zurich. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ "ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА"

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ ГЕНЫ

ГЕН СУБЪЕДИНИЦЫ СИГМА 80 РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ SIGA

КЛОНИРОВАНИЕ

ХАРАКТЕРИСТИКА

BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Beck, Christoph; Marty, Roger; Klausli, Sonja; Hennecke, Hauke; Gottfert, Michael


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI50) 99.05-04И3.54

    Ckark, Denise V.

    Repetitive arrays containing a housekeeping gene have altered polytene chromosome morphology in Drosophila [Text] / Denise V. Ckark, Joy F. Sabl, Steven Henikoff // Chromosoma. - 1998. - Vol. 107, N 2. - P96-104 . - ISSN 0009-5915
Перевод заглавия: Измененная морфология повторяющихся мотивов, включающих ген "домашнего хозяйства", в политенном [комплексе] дрозофилы
Аннотация: Исследовано значение активности отдельных генов в формировании локальных параметров политенных хромосом у D. melanogaster. В кач-ве модели использовали локус prat, расположенный в диске 65А10. Этот локус включает крупный блок высокоповторяющейся ДНК, а также ген, продукт к-рого играет важную роль в контроле биосинтеза пуринов. Для модификации тест-сегмента применен направленный мутагенез, опосредованный мобильным P-элементом. Для визуального маркирования использован ген prat слитый с геном brown. По-видимому, структура тест-локуса (в частности, число копий кодирующих последовательностей в нем) и активность промотора способны влиять на организацию хроматина в политенной хромосоме. Считается, что эта вариабельная структура хроматина отличается от известных производных - пуфов, хромоцентров и т. п. - и представляет новое образование, связанное с особенностями политенного хроматина. Канада, Dep. Biol., Univ. New Brunswick, Fredericton, New Brunswick E3B 6E1. Библ. 56
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.33.19.29.07
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
ПОЛИТЕННЫЕ КОМПЛЕКСЫ

ЛОКУС PRAT

ВЫСОКОПОВТОРЯЮЩИЕСЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ХРОМАТИН

СТРУКТУРА

DROSOPHILA MELANOGASTER


Доп.точки доступа:
Sabl, Joy F.; Henikoff, Steven


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.258

    Bowman, William C.

    A bacterial ATP-dependent, enhancer binding protein that activates the housekeeping RNA polymerase [Text] / William C. Bowman, Robert G. Kranz // Genes and Dev. - 1998. - Vol. 12, N 12. - P1884-1893 . - ISSN 0890-9369
Перевод заглавия: Бактериальный АТФ-зависимый, связывающийся с энхансером белок, активирующий РНК-полимеразу домашнего хозяйства
Аннотация: У Rhodobacter capsulatus связывающийся с энхансером белок NtrE (I) активирует in vitro транскрипцию с промотора гена nifA1 направляемую холоферментом E'сигма'{70} РНК-полимеразы (II), в к-рый входит главная 'сигма'-субъединица 'сигма'{70}, а не минорная субъединица 'сигма'{54}. Активация транскрипции под действием I требует связывания АТФ, но не его гидролиза. Для активации необходима также олигомеризация I на тандемных сайтах связывания с центрами в положениях -102 и -135 в случае суперспирализованной матрицы ДНК. Однако I не активирует II E'сигма'{70} Escherichia coli на промоторе nifA1. США, Dep. Biol., Washington Univ., St. Louis, MO 63130. Библ. 46
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

ЭНХАНСЕРНЫЙ БЕЛОК NTRE

ФУНКЦИЯ

RHODOBACTER CAPSULATUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Kranz, Robert G.


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.08-04Б2.313

   

    Estimating recombinational parameters in Streptococcus pneumoniae from multilocus sequence typing data [Text] / Edward J. Feil [et al.] // Genetics. - 2000. - Vol. 154, N 4. - P1439-1450 . - ISSN 0016-6731
Перевод заглавия: Оценки рекомбинационных параметров у Streptococcus pneumoniae из данных мультилокусного типирования последовательностей
Аннотация: Метод мультилокусного типирования последовательностей, основанный на секвенировании внутренних фрагментов длиной 'ЭКВИВ'450 п. н. из 7 генов домашнего хозяйства, применен к 575 изолятам Streptococcus pneumoniae. Обнаружено несколько клональных комплексов, каждый из которых представлен одной группой изолятов с идентичными аллелями во всех 7 генах и однолокусными вариантами, отличающимися от этой группы только в одном из этих локусов. Сравнение вариантных и типичных аллелей в каждом из клональных комплексов позволило оценить, что рекомбинация порождает новые аллели в 10 раз чаще, чем мутация, и что одиночный нуклеотидный сайт изменяется в результате рекомбинации с вероятностью, в 50 раз большей, чем в результате мутации. Великобритания, Dep. Zool., Univ. Oxford, Oxford OX1 3FY. Библ. 31
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.13.03
Рубрики: РЕКОМБИНАЦИЯ
РЕКОМБИНАЦИОННЫЕ ПАРАМЕТРЫ

ОЦЕНКА

ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

НОВЫЕ АЛЛЕЛИ

ВОЗНИКНОВЕНИЕ

ВЛИЯНИЕ

РЕКОМБИНАЦИЯ

МУТАЦИЯ

СРАВНЕНИЕ

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Feil, Edward J.; Smith, John Maynard; Enright, Mark C.; Spratt, Brian G.


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.03-04Б2.347

    Lake, James A.

    Mix and match in the tree of life [Text] / James A. Lake, Ravi Jain, Maria C. Rivera // Science. - 1999. - Vol. 283, N 5410. - P2027-2028 . - ISSN 0036-8075
Перевод заглавия: Смешивание и соответствие в древе жизни
Аннотация: Обзор. Анализ полных геномных последовательностей протеобактерии Escherichia coli, цианобактерии Synechocystis, архея Methanococcus и эукариота Saccharomyces cerevisiae показал, что все гены можно разбить на два функциональных суперкласса: 1) информационные гены, участвующие в транскрипции, трансляции и родственных процессах; 2) операционные гены, участвующие в домашнем хозяйстве. Эукариоты приобрели информационные гены от организма, более близко родственного Methanococcus, чем протео- и цианобактериям, а операционные гены - от протеобактерий, родственных E. coli. Это подтвердило теорию химерной эволюции и смешанного происхождения эукариотич. геномов. Обсуждается роль горизонтального переноса генов и химеризма в эволюции про- и эукариотов. США, Mol. Biol. Inst., Univ. California, Los Angeles, CA 90095. Библ. 18
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.33
Рубрики: ГЕНОТИП
ПОЛНАЯ НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ПРОКАРИОТЫ

ЭУКАРИОТЫ

ХИМЕРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ

СМЕШАННОЕ ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЭУКАРИОТ

ГЕНЫ

ГЕНЫ ИНФОРМАЦИОННЫЕ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ГОРИЗОНТАЛЬНЫЙ ПЕРЕНОС

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Jain, Ravi; Rivera, Maria C.


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.04-04Б2.330

   

    Differential expression of house-keeping genes of Aspergillus nidulans during sexual development [Text] / Hyo-Young Jeong [et al.] // Gene. - 2001. - Vol. 262, N 1-2. - P215-219 . - ISSN 0378-1119
Перевод заглавия: Дифференциальная экспрессия генов домашнего хозяйства Aspergillus nidulans в ходе полового развития
Аннотация: Из хромосомоспецифичных космидных клонотек Aspergillus nidulans клонировали гены rpl3 и rpl37, кодирующие рибосомные белки RPL3 и RPL37, расположенные в хромосомах I и III соотв. Оба гена присутствуют в геноме в одной копии. Белки RPL3 и RPL37 состоит из 392 и 92 аминокислотных остатков соотв. Изучили экспрессию генов rpl3 и rpl37, а также еще 2 генов домашнего хозяйства - rps16 и 'гамма'-актина в ходе полового развития A. nidulans. Характер экспрессии всех 4 генов изменялся одинаково. Экспрессия генов достигала максимума через 2 ч после индукции полового развития, затем снижалась и вновь возрастала через 30-40 ч. Ю. Корея, Inst. Basic Sci., Division Biol. Sci., Chonbuk Nat. Univ., Chonju, Chonbuk 561-756. Библ. 23
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.21.03.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ГЕНЫ RPL3

RPL37 ГЕНЫ

ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ЭКСПРЕССИЯ

РАЗВИТИЕ

ПОЛОВОЕ

ASPERGILLUS NIDULANS (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Jeong, Hyo-Young; Cho, Ga-Bee; Han, Kyu-Yong; Kim, Jungmi; Han, Dong Min; Jahng, Kwang-Yeop; Chae, Keon-Sang


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.05-04Б2.198

   

    Analysis of the chromosome sequence of the legume symbiont Sinorhizobium meliloti strain 1021 [Text] / Delphine Capela [et al.] // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2001. - Vol. 98, N 17. - P9877-9882 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Анализ хромосомной последовательности симбионта бобовых Sinorhizobium meliloti, штамм 1021
Аннотация: Определена полная нуклеотидная последовательность хромосомы штамма 1021 клубеньковых бактерий люцерны (Sinorhizobium meliloti). Она состоит из 3 654 135 п. н. и имеет содержание ГЦ-пар 62,7%. Для 59% из 3341 обнаруженных открытых рамок считывания на основании гомологии с имеющимися последовательностями определены кодируемые функции. По сравнению с мегаплазмидами, хромосома ризобий люцерны характеризуется низким содержанием повторов: только для двух генов обнаружены высоко гомологичные копии (свыше 90% идентичности). Транспозируемые элементы составляют лишь 2,2% последовательности, несколько типов коротких палиндромных повторов (RIME1, RIME2, C) распределены по хромосоме. Хромосома содержит полный набор генов домашнего хозяйства (репликация ДНК, репарация, рекомбинация, клеточные деления, транскрипция, трансляция, биосинтез аминокислот и азотистых оснований), за исключением 2 генов, локализованных на мегаплазмиде pSymB2. Кроме того, на хромосоме обнаружены гены транспорта аминокислот и пептидов, циклаз нуклеотидов, а также гомологи некоторых генов вирулентности патогенов животных и растений. Гены, кодирующие рРНК (rrn), представлены в 3 копиях, для них содержание ГЦ-пар составляет 54,4%. Кроме того, выявлены 3 дополнительных сегмента с пониженным содержанием ГЦ-пар, которые, по-видимому, были приобретены в результате недавно происшедших актов горизонтального переноса генов. Франция, Lab. de Biologie Moleculaire des Relations Plantes-Microorganismes, Unite Mixte de Recherche (UMR) 215 Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique, Chemin de Borde Rouge, BP27, F-31326 Castanet Tolosan Cedex. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ХРОМОСОМЫ
НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ

ОТКРЫТЫЕ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ

СТРУКТУРА

ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ГЕНЫ ТРАНСПОРТА АМИНОКИСЛОТ

ПЕПТИДЫ

ГЕНЫ ПАТОГЕННОСТИ

ГЕНЫ РРНК RRN

SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Capela, Delphine; Barloy-Hubler, Frederique; Gouzy, Jerome; Bothe, Gordana; Ampe, Frederic; Batut, Jacques; Boistard, Pierre; Becker, Anke; Boutry, Marc; Cadieu, Edouard


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.08-04Б4.130

   

    Collaborative consensus for optimized multilocus sequence typing of Candida albicans [Text] / M. -E. Bougnoux [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 11. - P5265-5266 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Межлабораторное сотрудничество в области оптимизированного типирования мультилокусных последовательностей Candida albicans
Аннотация: Восемьдесят шесть изолятов Candida albicans были исследованы при помощи метода типирования мультилокусных последовательностей (MLST) в двух различных лабораториях. В результате этой работы, были установлены нуклеотидные последовательности фрагментов десяти генов "домашнего хозяйства". Анализ полученных данных во всех возможных комбинациях из 5, 6, 7, 8 и 9 фрагментов, показал, что совокупность фрагментов AAT1a, ACC1, ADP1, MPIb, SYA1, VPS13 и ZWF1b является минимальным набором, позволяющим создавать уникальные типы диплоидных последовательностей у всех 86 изолятов. Франция, Lab. de Parasitologie - Mycologie, Service de Microbiol., Hopital Ambroise-Pare, Univ. Versailles Saint - Quentin en Yvelines, Boulogne - Billancourt. Библ. 21
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.09
Рубрики: БОЛЕЗНИ
КАНДИДОЗЫ

ВОЗБУДИТЕЛЬ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ГЕНОТИП

МУЛЬТИЛОКУСНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ОПТИМИЗИРОВАННОЕ ТИПИРОВАНИЕ

ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

CANDIDA ALBICANS (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Bougnoux, M.-E.; Tavanti, A.; Buchier, C.; Gow, N.A.R.; Magnier, A.; Davidson, A.D.; Maiden, M.C.J.; d'Enfert, C.; Odds, F.C.


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.09-04Б2.288

   

    Collaborative consensus for optimized multilocus sequence typing of Candida albicans [Text] / M. -E. Bougnoux [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 11. - P5265-5266 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Межлабораторное сотрудничество в области оптимизированного типирования мультилокусных последовательностей Candida albicans
Аннотация: Восемьдесят шесть изолятов Candida albicans были исследованы при помощи метода типирования мультилокусных последовательностей (MLST) в двух различных лабораториях. В результате этой работы, были установлены нуклеотидные последовательности фрагментов десяти генов "домашнего хозяйства". Анализ полученных данных во всех возможных комбинациях из 5, 6, 7, 8 и 9 фрагментов, показал, что совокупность фрагментов AAT1a, ACC1, ADP1, MPIb, SYA1, VPS13 и ZWF1b является минимальным набором, позволяющим создавать уникальные типы диплоидных последовательностей у всех 86 изолятов. Франция, Lab. de Parasitologie - Mycologie, Service de Microbiol., Hopital Ambroise-Pare, Univ. Versailles Saint - Quentin en Yvelines, Boulogne - Billancourt. Библ. 21
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.11.17.03
Рубрики: БОЛЕЗНИ
КАНДИДОЗЫ

ВОЗБУДИТЕЛЬ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ГЕНОТИП

МУЛЬТИЛОКУСНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

ОПТИМИЗИРОВАННОЕ ТИПИРОВАНИЕ

ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ЛОКАЛИЗАЦИЯ

CANDIDA ALBICANS (FUNGI)


Доп.точки доступа:
Bougnoux, M.-E.; Tavanti, A.; Buchier, C.; Gow, N.A.R.; Magnier, A.; Davidson, A.D.; Maiden, M.C.J.; d'Enfert, C.; Odds, F.C.


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.11-04Б2.254

    Viscidi, Raphael P.

    Genetic diversity of Neisseria gonorrhoeae housekeeping genes [Text] / Raphael P. Viscidi, James C. Demma // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 1. - P197-204 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие генов домашнего хозяйства Neisseria gonorrhoeae
Аннотация: Метод мультилокусного типирования основан на генетической вариации генов домашнего хозяйства. Авт. охарактеризовали генетическое разнообразие 18 локусов генов домашнего хозяйства Neisseria gonorrhoeae. Секвенировали примерно 17500 н., захватывающих 18 локусов из 24 изолятов N. gonorrhoeae. Включая полностью секвенированный штамм FA1090 и 3 уникальных последовательности gln4 из GenBank, число аллелей, идентифицированных в 18 локусах, изменялось от 2 до 18 и составило в среднем 8,3 аллеля на локус. Большинство полиморфных сайтов распределялись по гену произвольным образом, что согласуется с представлением об эволюции последовательностей ДНК в результате точковых мутаций. Обнаружено несколько кластеров мутаций и инсерций или делеций, возникших, по-видимому, в результате событий рекомбинации. Показано, что локусы abcZ и gpdh подверглись действию позитивного отбора. Каждый из 25 охарактеризованных штаммов имел уникальный профиль аллелей не менее, чем 3 локусов (pilA, abcZ, pip или pgi2). Молекулярное типирование, основанное на профиле аллелей генов домашнего хозяйства, позволяет лучше разделить изоляты, чем секвенирование гена porB или типирование гена opa. Аллельные профили локусов pilA, abcZ и serC парных штаммов от 16 половых партнеров были идентичными. Сделан вывод, что мультилокусное типирование N. gonorrhoeae, основанное на фрагментах 500--600 п. н. локусов 7 генов домашнего хозяйства, должно включать локусы pilA, abcZ, serC, glnA, gdh, gnd и pip. США, Stanley Division Develop. Neurovirol., Dep. Pediatrics, Johns Hopkins Univ. Sch. Med., Baltimore, MD 21287. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: NEISSERIA GONORRHOEAE (BACT.)
ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

МУЛЬТИЛОКУСНОЕ ТИПИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Demma, James C.


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 04.12-04Б4.113

    Viscidi, Raphael P.

    Genetic diversity of Neisseria gonorrhoeae housekeeping genes [Text] / Raphael P. Viscidi, James C. Demma // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 1. - P197-204 . - ISSN 0095-1137
Перевод заглавия: Генетическое разнообразие генов домашнего хозяйства Neisseria gonorrhoeae
Аннотация: Метод мультилокусного типирования основан на генетической вариации генов домашнего хозяйства. Авт. охарактеризовали генетическое разнообразие 18 локусов генов домашнего хозяйства Neisseria gonorrhoeae. Секвенировали примерно 17500 н., захватывающих 18 локусов из 24 изолятов N. gonorrhoeae. Включая полностью секвенированный штамм FA1090 и 3 уникальных последовательности gln4 из GenBank, число аллелей, идентифицированных в 18 локусах, изменялось от 2 до 18 и составило в среднем 8,3 аллеля на локус. Большинство полиморфных сайтов распределялись по гену произвольным образом, что согласуется с представлением об эволюции последовательностей ДНК в результате точковых мутаций. Обнаружено несколько кластеров мутаций и инсерций или делеций, возникших, по-видимому, в результате событий рекомбинации. Показано, что локусы abcZ и gpdh подверглись действию позитивного отбора. Каждый из 25 охарактеризованных штаммов имел уникальный профиль аллелей не менее, чем 3 локусов (pilA, abcZ, pip или pgi2). Молекулярное типирование, основанное на профиле аллелей генов домашнего хозяйства, позволяет лучше разделить изоляты, чем секвенирование гена porB или типирование гена opa. Аллельные профили локусов pilA, abcZ и serC парных штаммов от 16 половых партнеров были идентичными. Сделан вывод, что мультилокусное типирование N. gonorrhoeae, основанное на фрагментах 500--600 п. н. локусов 7 генов домашнего хозяйства, должно включать локусы pilA, abcZ, serC, glnA, gdh, gnd и pip. США, Stanley Division Develop. Neurovirol., Dep. Pediatrics, Johns Hopkins Univ. Sch. Med., Baltimore, MD 21287. Библ. 22
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.17
Рубрики: NEISSERIA GONORRHOEAE (BACT.)
ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

МУЛЬТИЛОКУСНОЕ ТИПИРОВАНИЕ


Доп.точки доступа:
Demma, James C.


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 05.05-04Б4.70

   

    Comparative phylogenies of the housekeeping genes atpD, infB and rpoB and the 16S rRNA gene within the Pasteurellaceae [Text] / Henrik Christensen [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 5. - P1601-1609 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Сравнительные филогенетические анализы генов "домашнего хозяйства" atpD, infB и rpoB и 16S рРНК в рамках Pasteurellaceae
Аннотация: Филогению последовательностей гена "домашнего хозяйства (HG) и 16S рРНК сравнивали для усовершенствования классификации бактериального сем. Pasteurellaceae и знаний об эволюционных связях его членов. Сравнивались частично установленные последовательности HG atpD, infB и rpoB у 28, 36 и 28 представительных таксонов Pasteurellaceae, соответственно. Анализ всех HG показал монофилию представителей р. Gallibacterium, тогда как члены Mannheimia, Actinobacillus sensu stricto и коровой группы Pasteurella sensu stricto образовали монофилетические группы с 2 из 3 HG. Представители Mannheimia, Actinobacillus sensu stricto, [Haemophilus] ducreyi и [Pasteurella] trehalosi образовали монофилетическую единицу на основании анализа всех 3 HG, в противоположность филогении, полученной благодаря анализу 16S рРНК, где эти таксоны располагались на отдельных направлениях филогенетического древа. Филогенетические данные, полученные путем сравнения HG, значительно отличались от аналогичных данных, полученных анализом 16S рРНК, что показал тест на соотношение правдоподобия. Низкая степень сравнимости также проявлялась между индивидуальными филогенетическими данными, полученными при анализе HG. Оценка видообразования, проведенная при сравнении последовательностей 16S рРНК и HG, привела в рез-те к совершенно различным сценариям эволюции для членов Pasteurellaceae. Филогения, основанная на HG, подтвердила обнаруженное множество ассоциаций между Mannheimia, Actinobacillus sensu stricto и [Pasteurella] trehalosi из позвоночных и парнокопытными животными. Дания, Dep. of Veterinary Microbiol., Royal Danish Veterinary and Agric. Univ., 1870 Frederiksberg C. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.99
Рубрики: PASTEURELLACEAE (BACT.)
УТОЧНЕНИЕ КЛАССИФИКАЦИИ

ГЕНЫ

ГЕНЫ "ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА"

СРАВНЕНИЕ С 16S РРНК


Доп.точки доступа:
Christensen, Henrik; Kuhnert, Peter; Olsen, John Elmerdahl; Bisgaard, Magne


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 05.06-04Б2.11

   

    Comparative phylogenies of the housekeeping genes atpD, infB and rpoB and the 16S rRNA gene within the Pasteurellaceae [Text] / Henrik Christensen [et al.] // Int. J. Syst. and Evol. Microbiol. - 2004. - Vol. 54, N 5. - P1601-1609 . - ISSN 1466-5026
Перевод заглавия: Сравнительные филогенетические анализы генов "домашнего хозяйства" atpD, infB и rpoB и 16S рРНК в рамках Pasteurellaceae
Аннотация: Филогению последовательностей гена "домашнего хозяйства (HG) и 16S рРНК сравнивали для усовершенствования классификации бактериального сем. Pasteurellaceae и знаний об эволюционных связях его членов. Сравнивались частично установленные последовательности HG atpD, infB и rpoB у 28, 36 и 28 представительных таксонов Pasteurellaceae, соответственно. Анализ всех HG показал монофилию представителей р. Gallibacterium, тогда как члены Mannheimia, Actinobacillus sensu stricto и коровой группы Pasteurella sensu stricto образовали монофилетические группы с 2 из 3 HG. Представители Mannheimia, Actinobacillus sensu stricto, [Haemophilus] ducreyi и [Pasteurella] trehalosi образовали монофилетическую единицу на основании анализа всех 3 HG, в противоположность филогении, полученной благодаря анализу 16S рРНК, где эти таксоны располагались на отдельных направлениях филогенетического древа. Филогенетические данные, полученные путем сравнения HG, значительно отличались от аналогичных данных, полученных анализом 16S рРНК, что показал тест на соотношение правдоподобия. Низкая степень сравнимости также проявлялась между индивидуальными филогенетическими данными, полученными при анализе HG. Оценка видообразования, проведенная при сравнении последовательностей 16S рРНК и HG, привела в рез-те к совершенно различным сценариям эволюции для членов Pasteurellaceae. Филогения, основанная на HG, подтвердила обнаруженное множество ассоциаций между Mannheimia, Actinobacillus sensu stricto и [Pasteurella] trehalosi из позвоночных и парнокопытными животными. Дания, Dep. of Veterinary Microbiol., Royal Danish Veterinary and Agric. Univ., 1870 Frederiksberg C. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.15.03
Рубрики: PASTEURELLACEAE (BACT.)
УТОЧНЕНИЕ КЛАССИФИКАЦИИ

ГЕНЫ

ГЕНЫ "ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА"

СРАВНЕНИЕ С 16S РРНК


Доп.точки доступа:
Christensen, Henrik; Kuhnert, Peter; Olsen, John Elmerdahl; Bisgaard, Magne


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.02-04Б2.176

    Nielsen, K. Klitgaard

    Real-time quantitative reverse transcription-PCR analysis of expression stability of Actinobacillus pleuropneumoniae housekeeping genes during in vitro growth under iron-depleted conditions [Text] / K.Klitgaard Nielsen, M. Boye // Appl. and Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 71, N 6. - P2949-2954 . - ISSN 0099-2240
Перевод заглавия: Количественный ПЦР-анализ стабильности экспрессии генов домашнего хозяйства Actinobacillus pleuropneumoniae во время роста in vitro в условиях недостатка железа
Аннотация: Разработали и протестировали чувствительный и воспроизводимый метод исследования генной экспрессии легочного патогена Actinobacillus pleuropneumoniae при помощи количественной ПЦР с использованием обратной транскриптазы. Экспрессию генов изучали in vitro во время экспоненциальной и ранней стационарной фазы роста в среде с добавлением железа и без него. Стабильность экспрессии пяти генов glyA, triA, pykA, recF и rhoAP оценивали на основе средней вариабельности. Все гены домашнего хозяйства стабильно экспрессировались при данных условиях. Для корректировки пяти генов использовали среднее геометрическое. Выявили три гена, участвующие в поглощении железа (tbpA, exbA и fhuD), ген белка теплового шока groEL и кворум-сенсорный гена luxS. Уровень экспрессии контрольных генов tbpA, exbA и fhuD свидетельствовал о регулировании сверху в условиях ограничения железа. Полученные результаты свидетельствуют в пользую применения RT-ПЦР для исследования экспрессии генов. Дания, Danish Inst. for Food and Veterinary Res., Copenhagen. Библ. 33
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БОЛЕЗНИ
БОЛЕЗНИ ДЫХАТЕЛЬНЫХ ПУТЕЙ

ВОЗБУДИТЕЛЬ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ДИАГНОСТИКА

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ТРАНСКРИПЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

ИОНЫ ЖЕЛЕЗА

ACTINOBACILLUS PLEUROPNEUMONIAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Boye, M.


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.166

   

    Genetic analysis of housekeeping genes reveals a deep-sea ecotype of Alteromonas macleodii in the Mediterranean Sea [Text] / Arantxa Lopez-Lopez [et al.] // Environ. Microbiol. - 2005. - Vol. 7, N 5. - P649-659 . - ISSN 1462-2912
Перевод заглавия: Генетический анализ генов домашнего хозяйства выявил экотип Aleromonas macleodii в Средиземном море
Аннотация: Исследовали генетическое разнообразие 19 штаммов Aleromonas macleodii, выделенных из разных географических областей (Тихий и Индийский океан и различные части Средиземного моря) и на разных глубинах (до 3500 м). Для каждого штамма провели секвенирование фрагментов гена 16S рРНК, спейсерного района между генами 16S и 23S рДНК, генов gyrB и rpoB. Для характеристики геномов использовали метод полиморфизма длин амплифицированных фрагментов ДНК. Разнообразие штаммов отражалось в наличии кластера штаммов, выделенных из глубины Средиземного моря и двух изолятов из Черного моря. Полученные результаты свидетельствуют как о существовании общего распределения родов, так и экотипов, адаптированных к специфическим условиям - глубине и солености воды. Испания, Division de Microbiol., Univ. Miguel Herandez, Campus de San Juan, 03550 San Juan de Alicante
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: МОРСКИЕ БАКТЕРИИ
ЭКОТИПЫ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ГЕНОТИП

ГЕНОТИПИРОВАНИЕ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ALEROMONAS MACLEODI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Lopez-Lopez, Arantxa; Bartual, Sergio G.; Stal, Lucas; Onyshchenko, Olga; Rodriguez-Valera, Francisco


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.04-04Б2.244

   

    An unusual primary sigma factor in the Bacteroidetes phylum [Text] / Didier Vingadassalom [et al.] // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 56, N 4. - P888-902 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Необычный сигма-фактор в Bacteroides phylum
Аннотация: Наличие промоторов генов домашнего хозяйства с уникальными последовательностями в Bacteroides fragilis привело к выводу о существование особого первичного сигма-фактора. Обнаружили, что единственный rpoD-подобный ген, наблюдаемый в геноме B. fragilis, имеет аналог в Bacteroides phylum. Он кодирует белок 'сигма'{ABfr} и является первичным сигма-фактором. Данные сигма-факторы необычны, поскольку они отсутствуют в районе 1.1, имеют уникальную структуру из 29 идентичных аминокислот и являются только RpoD-факторами, которые кластеризуются с RpoS-факторами. 'сигма'{ABfr} не поддерживает инициацию транскрипции с любого промотора, когда он является частью гетерологичного холоэнзима, не только с типичного промотора B. fragilis, но и с промотора lacUV5 или РНК I. Франция, INSERM E 0004, Lab. de Recherche Mol. sur les Antibiotiques, Univ. Paris VI, 75270 Paris. Библ. 72
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

ФАКТОР СИГМА ABFR

СИНТЕЗ

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

BACTEROIDES PHYLUM (BACT.)


Доп.точки доступа:
Vingadassalom, Didier; Kolb, Annie; Mayer, Claudine; Rybkine, Tania; Collatz, Ekkehard; Podglajen, Isabelle


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.07-04Б2.263

   

    Genetic characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus [Text] / Keiichi Hiramatsu [et al.] // Vaccine. - 2004. - Vol. 22, прил. 1. - S5-S8 . - ISSN 0264-410X
Перевод заглавия: Генетическая характеристика метициллинрезистентных штаммов Staphylococcus aureus
Аннотация: Была проанализирована структура генома у вида Staphylococcus aureus. Геном состоял из двух доменов. Первый домен, происходивший из бактериальных видов - предков, содержал домашние гены, которые характеризовались самой высокой гомологией с генами видов Bacillus. Второй домен содержал гены, ответственные за вирулентность и резистентность к лекарствам. Эти гены, по-видимому, были приобретены из других бактериальных видов через латеральный генный перенос. Второй домен включает генетическую информацию, которая делает S. aureus известным госпитальным патогеном. Япония, Dep. of Bacteriol., Juntendo Univ., 2-1-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo, Japan 113-8421. Библ. 7
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03.03
Рубрики: ГЕНОМ
СТРУКТУРА

ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ЭВОЛЮЦИЯ

STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hiramatsu, Keiichi; Watanabe, Shinya; Takeuchi, Fumihiko; Ito, Teruyo; Baba, Tadashi


18.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 06.07-04Б4.83

   

    Genetic characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus [Text] / Keiichi Hiramatsu [et al.] // Vaccine. - 2004. - Vol. 22, прил. 1. - S5-S8 . - ISSN 0264-410X
Перевод заглавия: Генетическая характеристика метициллинрезистентных штаммов Staphylococcus aureus
Аннотация: Была проанализирована структура генома у вида Staphylococcus aureus. Геном состоял из двух доменов. Первый домен, происходивший из бактериальных видов - предков, содержал домашние гены, которые характеризовались самой высокой гомологией с генами видов Bacillus. Второй домен содержал гены, ответственные за вирулентность и резистентность к лекарствам. Эти гены, по-видимому, были приобретены из других бактериальных видов через латеральный генный перенос. Второй домен включает генетическую информацию, которая делает S. aureus известным госпитальным патогеном. Япония, Dep. of Bacteriol., Juntendo Univ., 2-1-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo, Japan 113-8421. Библ. 7
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.19.09
Рубрики: ГЕНОМ
СТРУКТУРА

ГЕНЫ

ГЕНЫ ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА

ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ

ИДЕНТИФИКАЦИЯ

ЭВОЛЮЦИЯ

STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hiramatsu, Keiichi; Watanabe, Shinya; Takeuchi, Fumihiko; Ito, Teruyo; Baba, Tadashi


19.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 06.07-04Б4.89

   

    Multilocus sequence analysis and comparative evolution of virulence-associated genes and housekeeping genes of Clostridium difficile [Text] / Ludovic Lemee [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 10. - P3171-3180 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Мультилокусный анализ последовательностей и сравнительная эволюция генов, связанных с вирулентностью, и генов "домашнего хозяйства" у Clostridium difficile
Аннотация: Проведен мультилокусный анализ последовательностей генов фактора колонизации (cwp66, cwp84, fbp68, fliC, fliD, growTL и slpA), токсинов A и B (tcdA и tcdB), положительного регулятора токсинов A и B (tcdD) и парных токсинов (cdtA и cdtB) у 29 изолятов Clostridium difficile различного происхождения. Гены, связанные с вирулентностью, демонстрируют умеренный полиморфизм, сравнимый с полиморфизмом генов "домашнего хозяйства", тогда как гены cwp66 и slpA полиморфны в значительно большей степени. Установлено, что изоляты, вызывающие псевдомембранные колиты у человека, не образуют обособленную группу; парные токсины были обнаружены у 5 изолятов и их присутствие не связано с клиническим происхождением. С другой стороны, токсигенные изоляты A-B+ образуют гомогенную группу, отстоящую от других изолятов. Кластерный анализ показал, что изоляты из животных и человека образуют общую диффузную группу. Таким образом, установлена клональная структура рассматриваемой популяции C. difficile, в которой отсутствует хозяйская специфичность. Можно говорить о ко-эволюции генов токсинов A и B и парных токсинов с генами "домашнего хозяйства", тогда как гены флагеллина, cwp66 и slpA могли претерпеть рекомбинацию и/или селективное давление внешней среды. Франция, Gr. Rech. Antimicrobiens (GRAM EF 2656, IFR 23), Univ. Rouen, Fac. Med.-Pharm., 22 Boulevard Gambetta, F-76183 Rouen Cedex. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ГЕНЫ

ГЕНЫ ВИРУЛЕНТРОСТИ

ПОЛИМОРФИЗМ

ГЕНЫ "ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА"

ПОЛИМОРФИЗМ

ЭВОЛЮЦИЯ

ИЗОЛЯТЫ

ЧЕЛОВЕК

ЖИВОТНЫЕ

CLOSTRIDIUM DIFFICILE (BACT.)

ВОЗБУДИТЕЛИ ПСЕВДОМЕМБРАННЫХ КОЛИТОВ


Доп.точки доступа:
Lemee, Ludovic; Bourgeois, Ingrid; Ruffin, Elodie; Collignon, Anne; Lemeland, Jean-Francois; Pons, Jean-Louis


20.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.08-04Б2.293

   

    Multilocus sequence analysis and comparative evolution of virulence-associated genes and housekeeping genes of Clostridium difficile [Text] / Ludovic Lemee [et al.] // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, N 10. - P3171-3180 . - ISSN 1350-0872
Перевод заглавия: Мультилокусный анализ последовательностей и сравнительная эволюция генов, связанных с вирулентностью, и генов "домашнего хозяйства" у Clostridium difficile
Аннотация: Проведен мультилокусный анализ последовательностей генов фактора колонизации (cwp66, cwp84, fbp68, fliC, fliD, growTL и slpA), токсинов A и B (tcdA и tcdB), положительного регулятора токсинов A и B (tcdD) и парных токсинов (cdtA и cdtB) у 29 изолятов Clostridium difficile различного происхождения. Гены, связанные с вирулентностью, демонстрируют умеренный полиморфизм, сравнимый с полиморфизмом генов "домашнего хозяйства", тогда как гены cwp66 и slpA полиморфны в значительно большей степени. Установлено, что изоляты, вызывающие псевдомембранные колиты у человека, не образуют обособленную группу; парные токсины были обнаружены у 5 изолятов и их присутствие не связано с клиническим происхождением. С другой стороны, токсигенные изоляты A-B+ образуют гомогенную группу, отстоящую от других изолятов. Кластерный анализ показал, что изоляты из животных и человека образуют общую диффузную группу. Таким образом, установлена клональная структура рассматриваемой популяции C. difficile, в которой отсутствует хозяйская специфичность. Можно говорить о ко-эволюции генов токсинов A и B и парных токсинов с генами "домашнего хозяйства", тогда как гены флагеллина, cwp66 и slpA могли претерпеть рекомбинацию и/или селективное давление внешней среды. Франция, Gr. Rech. Antimicrobiens (GRAM EF 2656, IFR 23), Univ. Rouen, Fac. Med.-Pharm., 22 Boulevard Gambetta, F-76183 Rouen Cedex. Библ. 52
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.23
Рубрики: ВИРУЛЕНТНОСТЬ
ГЕНЫ

ГЕНЫ ВИРУЛЕНТРОСТИ

ПОЛИМОРФИЗМ

ГЕНЫ "ДОМАШНЕГО ХОЗЯЙСТВА"

ПОЛИМОРФИЗМ

ЭВОЛЮЦИЯ

ИЗОЛЯТЫ

ЧЕЛОВЕК

ЖИВОТНЫЕ

CLOSTRIDIUM DIFFICILE (BACT.)

ВОЗБУДИТЕЛИ ПСЕВДОМЕМБРАННЫХ КОЛИТОВ


Доп.точки доступа:
Lemee, Ludovic; Bourgeois, Ingrid; Ruffin, Elodie; Collignon, Anne; Lemeland, Jean-Francois; Pons, Jean-Louis


 1-20    21-40   41-60   61-80   81-92 
 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)