Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Jin, Ding Jun$<.>)
Общее количество найденных документов : 17
Показаны документы с 1 по 17
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI11) 96.10-04Б1.238

    Clerget, Michel.

    A zinc-binding region in the 'бета'' subunit of RNA polymerase is involved in antitermination of early transcription of phage HK022 [Text] / Michel Clerget, Ding Jun Jin, Robert A. Weisberg // J. Mol. Biol. - 1995. - Vol. 248, N 4. - P768-780 . - ISSN 0022-2836
Перевод заглавия: Связывающая цинк область в субъединице 'бета'' РНК-полимеразы участвует в антитерминации транскрипции фага HKO22
Аннотация: В антитерминации транскрипции у ламбдоидного фага HKO22 участвуют nut-подобные сайты и клеточные белки, с целью идентификации к-рых выделили 14 мутантов Escherichia coli, специфически дефектных по росту фага HKO22. Мутации картированы в гене rpoC 'бета''-субъединицы (I) РНК-полимеразы (II). Секвенирование показало, что мутации вызывают замены арг[77]'-'лей, тир[75]'-'асн и глу[86]'-'лиз или вал в кластере 4 высококонсервативных остатков цис, связывающих Zn{2+}. Изучено влияние замены тир[75]'-'асн на антитерминацию у HKO22 in vivo. Эта замена значительно уменьшает сквозное считывание (СС) сильного 'ро'-независимого терминатора, расположенного за промотором P[L] и аналогом nutd у фага HKO22. Мутантная II in vitro, в отличие от II дикого типа, неспособна к эффективному СС 'ро'-независимого терминатора, расположенного за аналогом nutd. Высказано предположение, что домен связывания Zn{2+} в I взаимодействует с антитерминаторными сайтами фага HKO22 и подавляет терминацию транскрипции. Это взаимодействие возможно в отсутствие других белков. США, Lab. of Molecular Genetics, Inst. of Child Health and Human Development, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 53
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.25.21.07
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ HKO22

СИНТЕЗ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

СУБЪЕДИНИЦА*БЕТА-

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Jin, Ding Jun; Weisberg, Robert A.


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.219

    Jin, Ding Jun.

    A mutant RNA polymerase reveals a kinetic mechanism for the switch between nonproductive stuttering synthesis and productive initiation during promoter clearance [Text] / Ding Jun Jin // J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271, N 20. - P11659-11667 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Мутантная РНК-полимераза обнаруживает кинетический механизм для переключения между непродуктивным запинающимся синтезом и продуктивной инициацией во время освобождения промотора
Аннотация: Во время инициации транскрипции на промоторе galP2 галактозного оперона Escherichia coli, при к-рой образуется транскрипт с последовательностью фффАУУУЦ на 5'-конце, РНК-полимераза (I) участвует в непродуктивном "запинающемся" синтезе (НЗС), чувствительном к концентрации УТФ. У мутанта RpoB3449 (IA) НЗС резко уменьшен и увеличена скорость продуктивной инициации из-за повышенной скорости освобождения промотора по сравнению с I дикого типа. Это демонстрирует прямую связь между освобождением промотора и продуктивной транскрипцией. Изучен механизм, с помощью к-рого IA изменила переключение между НЗС и продуктивной инициацией во время освобождения промотора. По-видимому, у IA повышена эффективность включения ЦТФ в положении +5 транскрипта galP2, что приводит к уменьшению НЗС. Это показывает, что скорость включения остатка Ц после нескольких остатков У важна для освобождения промотора galP2. IA вызывает "нормальный" НЗС на мутантном промоторе galP2, содержащем остаток Г в положении +5, так что у IA изменилось связывание Ц в этом контексте. Показано, что само положение +5 последовательности мРНК galP2, а не природа нуклеотида в этом положении, важно для переключения между 2 альтернативными путями во время инициации транскрипции. Обсуждается модель контрольной точки для переключения между непродуктивной и продуктивной инициацией во время освобождения промотора. США, Lab. of Molecular Biol., NCI, NIH, Bethesda, MD 20892-4255. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
ИНИЦИАЦИЯ

НЕПРОДУКТИВНЫЙ ЗАПИНАЮЩИЙСЯ СИНТЕЗ МРНК

ПРОДУКТИВНАЯ ИНИЦИАЦИЯ

ПЕРЕКЛЮЧЕНИЕ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI



3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.08-04Б2.244

    Zhou, Yan Ning.

    The rpoB mutants destabilizing initiation complexes at stringently controlled promoters behave like "stringent" RNA polymerases in Escherichia coli [Text] / Yan Ning Zhou, Ding Jun Jin // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol. 95, N 6. - P2908-2913 . - ISSN 0027-8424
Перевод заглавия: Мутанты rpoB, дестабилизирующие комплексы инициации на строго контролируемых промоторах, ведут себя как "строгие" РНК-полимеразы у Escherichia coli
Аннотация: У Escherichia coli гены, контролируемые строгим ответом (СО), интенсивно транскрибируются во время быстрого роста, но "выключаются" в условиях ограничения по питательным веществам. Изучены взаимодействия между нормальной и мутантными РНК-полимеразами (I) с изменениями в 'бета'-субъединице (ген rpoB) и 4 строго контролируемыми промоторами (rrnB-P1, pyrB1, rpoD-P1 и rpoD-P2). Показано, что эти взаимодействия характеристически нестабильны и возможны переходы между относительно стабильным и метастабильным состояниями. Мутантные I проявляют дальнейшее ослабление взаимодействия на строгих промоторах in vitro и ведут себя как "строгие" I в условиях СО in vivo. Эти мутанты I могут также активировать экспрессию др. генов, обычно требующих СО. Высказано предположение о сопряжении стабильности нек-рых инициирующих комплексов I с транскрипцией строго контролируемых промоторов. Эта уникальная особенность координирует экспрессию генов, позитивно и негативно регулируемых СО. США, Lab. Mol. Biol., Nat. Canc. Inst., NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 39
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ
МУТАНТЫ RPOB

"СТРОГИЕ" РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ

IN VIVO

ТРАНСКРИПЦИЯ

КОМПЛЕКСЫ ИНИЦИАЦИИ

СТРОГО КОНТРОЛИРУЕМЫЕ ПРОМОТОРЫ

ДЕСТАБИЛИЗАЦИЯ

IN VITRO


Доп.точки доступа:
Jin, Ding Jun


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.02-04Б2.199

    Sukhodolets, Maxim V.

    RapA, a novel RNA polymerase-associated protein, is a bacterial homolog of SWi2/Snf2 [Text] / Maxim V. Sukhodolets, Ding Jun Jin // J. Biol. Chem. - 1998. - Vol. 273, N 12. - P7018-7023 . - ISSN 0021-9258
Перевод заглавия: Новый ассоциированный с РНК-полимеразой белок RapA является бактериальным гомологом Swi2/Snf2
Аннотация: Идентифицирован новый белок Escherichia coli, ассоциированный с РНК-полимеразой (I) и названный RapA (II). II имеет мол. м. 110 кД, обладает АТФазной активностью и соочищается с холоферментом I в виде комплекса 1:1. Очищенный до гомогенности II также образует комплекс с I и ведет себя как субъединица I. АТФазная активность II стимулируется при связывании с I. Т. обр. II и I взаимодействуют как физически, так и функционально. II является гомологом семейства Swi/Snf эукариотич. белков, участвующих в активации транскрипции, перестройке нуклеосом и репарации ДНК. США, Lab. Mol. Biol., NCI, NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 48
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БЕЛОК
БЕЛОК RAPA

АССОЦИАЦИЯ

RНК-ПОЛИМЕРАЗА

ОЧИСТКА

ХАРАКТЕРИСТИКА

ГОМОЛОГ

БЕЛКИ SWI/SNF

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Jin, Ding Jun


5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 00.08-04Б2.216

   

    Multiple regions on the Escherichia coli heat shock transcription factor 'сигма'{32} determine core RNA polymerase binding specificity [Text] / Daniel M. Joo [et al.] // J. Bacteriol. - 1998. - Vol. 180, N 5. - P1095-1102 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Множественные области в факторе транскрипции 'сигма'{32} теплового шока у Escherichia coli определяют специфичность связывания с минимальным ферментом РНК-полимеразы
Аннотация: Изучена способность связываться с минимальным ферментом РНК-полимеразы (I) Escherichia coli очищенных продуктов 9 дефектных аллелей гена rpoH, кодирующего субъединицу 'сигма'{32} (II). Все мутации расположены за пределами областей 2.1 и 2.2 связывания с I. Методами транскрипции in vitro и седиментации в градиенте конц-ии глицерина определены константы диссоциации K[d] комплексов II-I. Мутанты II разбиты на 3 класса. Мутанты класса 1 не отличаются от II дикого типа по сродству к I. Влияние мутаций класса 2 заметно лишь в условиях конкуренции между II и 'сигма'{70}. Мутации класса 3 значительно понижают сродство II к I. Две точечные мутации класса 3 затрагивают остатки, расположенные далеко друг от друга: один в консервативной области 4.2, а второй - в блоке RpoH, консервативном только среди 'сигма'-факторов теплового шока. Эти данные позволили предположить, что 1) несколько областей II участвует в связывании с I; 2) контактные участки для I неодинаковы у разных 'сигма'-факторов. США, Dep. Mol. and Cell Biol., Univ. California, Berkeley, CA 94720. Библ. 35
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
ТЕПЛОВОЙ ШОК

МЕХАНИЗМ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

ФАКТОР СИГМА 32

СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ СООТНОШЕНИЕ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Joo, Daniel M.; Nolte, Audrey; Calendar, Richard; Zhou, Yan Ning; Jin, Ding Jun


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.12-04Б2.263

    Cabrera, Julio E.

    Growth phase and growth rate regulation of the rapA gene, encoding the RNA polymerase-associated protein RapA in Escherichia coli [Text] / Julio E. Cabrera, Ding Jun Jin // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 20. - P6126-6134 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Регуляция фазой роста и скоростью роста гена rapA, кодирующего ассоциированный с РНК-полимеразой белок RapA у Escherichia coli
Аннотация: Изучены промоторы гена rapA Escherichia coli, кодирующего ассоциированный с РНК-полимеразой (I) белок RapA из семейства геликазоподобных белков SWI/SNF, его регуляция in vivo и взаимодействие с I in vitro. Показано, что экспрессия rapA зависит от фазы роста и максимальна в ранней экспоненциальной фазе. Для инициации транскрипции на промоторе rapA используется ЦТФ, в не пурины, как на большинстве промоторов E. coli. Показано, что промотор rapA регулируется скоростью роста in vivo и образует характеристически нестабильные комплексы инициации in vitro. За эти эффекты отвечает ГЦ-богатая дискриминаторная последовательность между положениями -10 и +1 промотора rap. США, Lab. Mol. Biol., Nat. Canc. Inst., NIH, Bethesda, MD 20892. Библ. 44
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ
АССОЦИИРОВАННЫЙ С РНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ БЕЛОК RAPA

СИНТЕЗ

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕН РЕГУЛЯТОРНОГО БЕЛКА RAPA

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

ВЛИЯНИЕ

ФАЗА РОСТА

СКОРОСТЬ РОСТА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Jin, Ding Jun


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 04.03-04Б2.177

   

    Escherichia coli SspA is a transcription activator for bacteriophage P1 late genes [Text] / Anne-Marie Hansen [et al.] // Mol. Microbiol. - 2003. - Vol. 48, N 6. - P1621-1631 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Escherichia coli SspA - транскрипционный активатор для поздних генов бактериофага P1
Аннотация: Ранее сообщали, что белок A (SspA) Escherichia coli, связанный с РНК-полимеразой, важен для литического роста бактериофага P1. В отличие от P1 ранних промоторов, P1 поздних промоторов не узнается РНК-полимеразой. Показали, что фаго-кодируемый ранний белок Lpa необходим для поздней транскрипции P1 in vivo. В данной работе продемонстрировали, что SspA - транскрипционный активатор для P1 поздних генов. В мутанте sspA нет ограничения Lpa, но транскрипция генов P1 нарушена. Показали, что SspA/Lpa необходимы для транскрипционной активации позднего промотора Ps in vitro. SspA и Lpa облегчают связывание полимеразы с ДНК позднего промотора Ps. Активация поздней транскрипции SspA/Lpa зависит от голоэнзима, содержащего 'сигма'{70}, но не 'сигма'{s}. Сделан вывод, что SspA действует как транскрипционный переключатель от ранних к поздним генам во время литического роста P1. Таким образом, работа впервые объяснила функцию связанного с РНК-полимеразой белка SspA. США, Lab. of Mol. Biol., Nat. Cancer Inst., Nat. Inst. of Health, 37 Convent Drive, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892-4264. Библ. 65
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: БАКТЕРИОФАГИ
ФАГ P1

ЛИТИЧЕСКИЙ РОСТ

АКТИВАЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ ПОЗДНИХ ГЕНОВ SSPA

ПРОМОТОР PS

ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hansen, Anne-Marie; Lehnherr, Hansjorg; Wang, Xiandong; Mobley, Victoria; Jin, Ding Jun


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.03-04Б2.322

   

    SspA is required for acid resistance in stationary phase by downregulation of H-NS in Escherichia coli [Text] / Anne-Marie Hansen [et al.] // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 56, N 3. - P719-734 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: SspA требуется для устойчивости к кислоте в стационарную фазу при регуляции снизу H-NS Escherichia coli
Аннотация: Исследовали роль SspA в экспрессии генов в Escherichia coli. Показали, что белок SspA важен для выживаемости клеток во время кислотно-индуцированного стресса. SspA ингибирует накопление в стационарную фазу H-NS, регулятора, который обычно функционирует как репрессор, дерепрессируя таким образом многочисленные защитные стрессовые системы, включающие системы кислотного стресса и голодания. Образцы генной экспрессии регулона H-NS изменялись в мутанте sspA, приводя к кислотно-чувствительным и гипермобильным фенотипам. Таким образом показали, что SspA - общий регулятор, действующий на H-NS и играющий важную роль в стрессовом ответе E. coli во время стационарной фазы. Полученные результаты свидетельствуют, что экспрессия регулона H-Ns чувствительна к малым изменениям клеточного уровня H-Ns, подготавливая клетку к ответу на изменения окружающей среды. Поскольку SspA и H-NS высоко консервативны в грамотрицательных бактериях, среди которых много патогенов, обсуждается общая роль SspA в стрессовом ответе и патогенезе. США, Transcription Control Section, Gene Regulationand Chromosome Biology Lab., Center for Cancer Res., Nat. Cancer Inst. at Frederick, NIH, Bidg. 469, PO Box B. Frederick, MD 21702. Библ. 78
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
КИСЛОТНЫЙ СТРЕСС

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛОК КИСЛОТОУСТОЙЧИВОСТИ SSPA

СИНТЕЗ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ H-NS

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hansen, Anne-Marie; Qiu, Yu; Yeh, Norman; Blattner, Frederick R.; Durfee, Tim; Jin, Ding Jun


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 06.03-04Б4.76

   

    SspA is required for acid resistance in stationary phase by downregulation of H-NS in Escherichia coli [Text] / Anne-Marie Hansen [et al.] // Mol. Microbiol. - 2005. - Vol. 56, N 3. - P719-734 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: SspA требуется для устойчивости к кислоте в стационарную фазу при регуляции снизу H-NS Escherichia coli
Аннотация: Исследовали роль SspA в экспрессии генов в Escherichia coli. Показали, что белок SspA важен для выживаемости клеток во время кислотно-индуцированного стресса. SspA ингибирует накопление в стационарную фазу H-NS, регулятора, который обычно функционирует как репрессор, дерепрессируя таким образом многочисленные защитные стрессовые системы, включающие системы кислотного стресса и голодания. Образцы генной экспрессии регулона H-NS изменялись в мутанте sspA, приводя к кислотно-чувствительным и гипермобильным фенотипам. Таким образом показали, что SspA - общий регулятор, действующий на H-NS и играющий важную роль в стрессовом ответе E. coli во время стационарной фазы. Полученные результаты свидетельствуют, что экспрессия регулона H-Ns чувствительна к малым изменениям клеточного уровня H-Ns, подготавливая клетку к ответу на изменения окружающей среды. Поскольку SspA и H-NS высоко консервативны в грамотрицательных бактериях, среди которых много патогенов, обсуждается общая роль SspA в стрессовом ответе и патогенезе. США, Transcription Control Section, Gene Regulationand Chromosome Biology Lab., Center for Cancer Res., Nat. Cancer Inst. at Frederick, NIH, Bidg. 469, PO Box B. Frederick, MD 21702. Библ. 78
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.13.07.07
Рубрики: УСТОЙЧИВОСТЬ
КИСЛОТНЫЙ СТРЕСС

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

БЕЛОК КИСЛОТОУСТОЙЧИВОСТИ SSPA

СИНТЕЗ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ H-NS

ФУНКЦИЯ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hansen, Anne-Marie; Qiu, Yu; Yeh, Norman; Blattner, Frederick R.; Durfee, Tim; Jin, Ding Jun


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 08.10-04Б2.31

   

    Toward a hyperstructure taxonomy [Text] / Vic Norris [et al.] // Annual Review of Microbiology. Vol.61. 2007. - Palo Alto (Calif.), 2007. - P309-329 . - ISBN 0066-4227
Перевод заглавия: К таксономии гиперструктур
Аннотация: Клетки бактерий содержат так наз. гиперструктуры - разнообразные ансамбли макромолекул, молекул, ионов, занимающие значительную часть их пространства и играющие важную роль в жизнедеятельности клетки, от репликации ДНК и клеточного деления до процессов хемотаксиса и секреции. Взаимодействия между гиперструктурами составляют уровень организации, промежуточный между макромолекулярным и клеточным. Для его изучения необходима классификация гиперструктур, разработке к-рой посвящена статья. Обсуждается классификация, основанная на форме гиперструктур и на процессах, в к-рых они участвуют. К последним относятся процессы транскрипции-трансляции, белок-белковые взаимодействия, связывание хромосомного сайта с белком, образование мембранных структур. Отмечается, что классификация должна также отражать пространственно-временные изменения гиперструктур в процессах созревания, старения и т. п. - т. наз. траектории. Наконец, необходима классификация взаимодействий суперструктур, охватывающая молекулы, ответственные за суперскручивание ДНК, молекулы АТФ, ГТФ, фосфолипиды, элементы цитоскелета и т. д. Концепция гиперструктур должна стать частью биологии систем. Франция, Dept. Of Sci, Univ. de Rouen, 76821 Mont Saint Aignan Cedex. Библ. 144
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.07.05
Рубрики: БАКТЕРИАЛЬНЫЕ КЛЕТКИ
ГИПЕРСТРУКТУРЫ

ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ ГИПЕРСТРУКТУРАМИ

КЛАССИФИКАЦИЯ ГИПЕРСТРУКТУР

ТРАНСКРИПЦИЯ

ТРАНСЛЯЦИЯ

БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

ОБЗОРЫ

БИБЛ. 144


Доп.точки доступа:
Norris, Vic; den, Blaauwen Tanneke; Doi, Roy H.; Harshey, Rasika M.; Janniere, Laurent; Jimenez-Sanchez, Alfonso; Jin, Ding Jun; Levin, Pera Anne; Mileykovskaya, Eugenia; Minsky, Abraham; Misevic, Gradimir; Ripoll, Camille; Saier, Milton; Skarstad, Kirsten; Thellier, Michel


11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 09.10-04Б2.171

   

    Regulation of cell growth during serum starvation and bacterial survival in macrophages by the bifunctional enzyme SpoT in Helicobacter pylori [Text] / Yan Ning Zhou [et al.] // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 24. - P8025-8032 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Регуляция клеточного роста во время сывороточного голодания и выживания бактерий в макрофагах бифункциональным энзимом SpoT в Helicobacter pylori
Аннотация: Показали, что ген spoT Helicobacter pylori кодирует бифункциональный энзим с гидролазной активностью и ранее описанной активностью (p)ppGpp синтетазы. Наличие активности определяли введением гена в relA и spoT дефектные штаммы Escherichia coli. Также установили, что SpoT опосредует ответ на сывороточное голодание, которое не только ограничивает рост, но и поддерживает спиральную морфологию H. pylori. Нуль-мутант spoT мог расти с более высокой плотностью, чем штамм дикого типа на среде без сыворотки. Полученные результаты привели к заключению, что SpoT в Helicobacter pylori играет важную роль для внутриклеточной выживаемости в микрофагах во время фагоцитоза. Обсуждается уникальная роль (p)ppGpp для клеточного роста во время сывороточного голодания, в ответе на стресс и персистентности H. pylori. США, Nat. Cancer Inst.-Frederick, Nat. Inst. of Health, Frederick, Maryland. Библ. 57
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
СЫВОРОТОЧНОЕ ГОЛОДАНИЕ

ВЫЖИВАНИЕ В МАКРОФАГАХ

ФЕРМЕНТЫ

БИФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ ФЕРМЕНТ ГИДРОЛАЗА/СИНТЕТАЗА SPOT

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Zhou, Yan Ning; Coleman, William G.; Yang, Zhaoxu; Yang, Yi; Hodgson, Nathaniel; Chen, Fuxiang; Jin, Ding Jun


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.11-04Б4.73

   

    Regulation of cell growth during serum starvation and bacterial survival in macrophages by the bifunctional enzyme SpoT in Helicobacter pylori [Text] / Yan Ning Zhou [et al.] // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, N 24. - P8025-8032 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Регуляция клеточного роста во время сывороточного голодания и выживания бактерий в макрофагах бифункциональным энзимом SpoT в Helicobacter pylori
Аннотация: Показали, что ген spoT Helicobacter pylori кодирует бифункциональный энзим с гидролазной активностью и ранее описанной активностью (p)ppGpp синтетазы. Наличие активности определяли введением гена в relA и spoT дефектные штаммы Escherichia coli. Также установили, что SpoT опосредует ответ на сывороточное голодание, которое не только ограничивает рост, но и поддерживает спиральную морфологию H. pylori. Нуль-мутант spoT мог расти с более высокой плотностью, чем штамм дикого типа на среде без сыворотки. Полученные результаты привели к заключению, что SpoT в Helicobacter pylori играет важную роль для внутриклеточной выживаемости в микрофагах во время фагоцитоза. Обсуждается уникальная роль (p)ppGpp для клеточного роста во время сывороточного голодания, в ответе на стресс и персистентности H. pylori. США, Nat. Cancer Inst.-Frederick, Nat. Inst. of Health, Frederick, Maryland. Библ. 57
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.07.09
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
СЫВОРОТОЧНОЕ ГОЛОДАНИЕ

ВЫЖИВАНИЕ В МАКРОФАГАХ

ФЕРМЕНТЫ

БИФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ ФЕРМЕНТ ГИДРОЛАЗА/СИНТЕТАЗА SPOT

СТРУКТУРА

ФУНКЦИЯ

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Zhou, Yan Ning; Coleman, William G.; Yang, Zhaoxu; Yang, Yi; Hodgson, Nathaniel; Chen, Fuxiang; Jin, Ding Jun


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 11.08-04Б2.182

   

    Polyphosphate binds to the principal sigma factor of RNA polymerase during starvation response in Helicobacter pylori [Text] / Zhao Xu Yang [et al.] // Mol. Microbiol. - 2010. - Vol. 77, N 3. - P618-627 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: У Helicobacter pylori при ответе на голодание полифосфат связывается с основным сигма-фактором РНК-полимеразы
Аннотация: Helicobacter pylori обитает в слизистой желудка - бедной питательными веществами среде, и для успешного выживания эта бактерия должна адекватно реагировать на стрессы, связанные с голоданием. У H. pylori нет альтернативных 'сигма'-факторов, индуцируемых при голодании. Удалось показать, что в голодной среде H. pylori образует полифосфат, к-рый непосредственно связывается с основным 'сигма'-фактором РНК-полимеразы. In vivo и in vitro показано, что полифосфат связывается с положительно заряженным богатым лизином участком (участком Р) на N-конце основного 'сигма'-фактора. Мутанты H. pylori, не способные связывать полифосфат, при голодании погибают. Похожий участок Р обнаружен в 'сигма'-факторах других патогенных бактерий, что позволяет предположить, что данный механизм регуляции транскрипции может использоваться и у других микроорганизмов. США, (Jin D.J.) Natl. Cancer Inst., Natl. Inst. of Health, Frederick, MD
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ

ПОЛИФОСФАТ

СВЯЗЫВАНИЕ

'СИГМА'-ФАКТОР РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ

СТРЕСС

ГОЛОДАНИЕ

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)

СЛИЗИСТАЯ ЖЕЛУДКА


Доп.точки доступа:
Yang, Zhao Xu; Zhou, Yan Ning; Yang, Yi; Jin, Ding Jun


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 11.08-04Б4.274

   

    Polyphosphate binds to the principal sigma factor of RNA polymerase during starvation response in Helicobacter pylori [Text] / Zhao Xu Yang [et al.] // Mol. Microbiol. - 2010. - Vol. 77, N 3. - P618-627 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: У Helicobacter pylori при ответе на голодание полифосфат связывается с основным сигма-фактором РНК-полимеразы
Аннотация: Helicobacter pylori обитает в слизистой желудка - бедной питательными веществами среде, и для успешного выживания эта бактерия должна адекватно реагировать на стрессы, связанные с голоданием. У H. pylori нет альтернативных 'сигма'-факторов, индуцируемых при голодании. Удалось показать, что в голодной среде H. pylori образует полифосфат, к-рый непосредственно связывается с основным 'сигма'-фактором РНК-полимеразы. In vivo и in vitro показано, что полифосфат связывается с положительно заряженным богатым лизином участком (участком Р) на N-конце основного 'сигма'-фактора. Мутанты H. pylori, не способные связывать полифосфат, при голодании погибают. Похожий участок Р обнаружен в 'сигма'-факторах других патогенных бактерий, что позволяет предположить, что данный механизм регуляции транскрипции может использоваться и у других микроорганизмов. США, (Jin D.J.) Natl. Cancer Inst., Natl. Inst. of Health, Frederick, MD
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.29.25.15.99
Рубрики: ТРАНСКРИПЦИЯ
РЕГУЛЯЦИЯ

ПОЛИФОСФАТ

СВЯЗЫВАНИЕ

'СИГМА'-ФАКТОР РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ

СТРЕСС

ГОЛОДАНИЕ

HELICOBACTER PYLORI (BACT.)

СЛИЗИСТАЯ ЖЕЛУДКА


Доп.точки доступа:
Yang, Zhao Xu; Zhou, Yan Ning; Yang, Yi; Jin, Ding Jun


15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.02-04Б2.313

    Jin, Ding Jun.

    Characterization of the termination phenotypes of rifampicin-resistant mutants [Text] / Ding Jun Jin, William A. Walter, Carol A. Gross // J. Mol. Biol. - 1988. - Vol. 202, N 2. - P245-253
Перевод заглавия: Характеристика фенотипов терминации у мутантов, устойчивых к рифампицину
Аннотация: Мутации, обуславливающие устойчивость к рифампицину (Rif{r}), локализованы в гене rpoB, который кодирует 'бета'-субъединицу РНК-полимеразы E. coli. Исследовали влияние 17 Rif{r}-мутаций (с известными последовательностями) на терминацию транскрипции. Эффекты каждой мутации определяли при 3 типах терминаторов: простом терминаторе, требующем только РНК-полимеразы (1) и сложном терминаторе, для которого необходимы также Rho- или Tau-белки (2 и 3). Почти каждая из Rif{r}-мутаций приводила к нарушению терминации на одном или более из этих терминаторов. Мутации со сходным фенотипом располагались в гене RpoB в виде кластеров. 2 мутации супрессировали дефекты терминации в штаммах с дефектными аллелями rho15. Обсуждается роль 'бета'-полипептида РНК-полимеразы в терминации транскрипции. Ил. 2. Табл. 5. Библ. 26. США, Dep. of Bacteriology Univ. of Wisconsin, Madison, WI 53706.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
МУТАНТЫ ПО УСТОЙЧИВОСТИ К РИФАМПИЦИНУ

МУТАЦИИ

МУТАЦИИ ГЕНА RHOB

ВЛИЯНИЕ

ТРАНСКРИПЦИЯ

ТЕРМИНАЦИЯ

РНК-ПОЛИМЕРАЗА

ПОЛИПЕПТИДЫ*БЕТА-

РОЛЬ


Доп.точки доступа:
Walter, William A.; Gross, Carol A.


16.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.07-04Б2.246

    Jin, Ding Jun.

    Characterization of the pleiotropic phenotypes of rifampin-resistant rpoB mutants of Escherichia coli [Text] / Ding Jun Jin, Carol A. Gross // J. Bacteriol. - 1989. - Vol. 171, N 9. - P5229-5231 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Характеристика плейотропных фенотипов мутантов rpoB Escherichia coli устойчивых к рифампицину
Аннотация: Мутация rpoB Escherichia coli, к-рая придает клеткам устойчивость к рифампицину, влияет на целый ряд фенотипич. проявлений: изменение скорости роста, способность поддерживать рост нек-рых бактериофагов и т. д. Получили коллекцию из 17 аллелей мутации rpoB и провели ее анализ. Показали, что мутантные аллели имеющие одинаковый фенотип объединены в кластеры на хромосоме. Кроме того, нек-рые разл. фенотипы детерминируются одним и тем же локусом. Пологают, что аллельные варианты мутации rpoB обусловлены ее влиянием на терминацию и антитерминацию транскрипции. Библ. 19. США, Dep. of Bacteriol., Univ. of Wisconsin, Madison, WI 53706.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.15
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ШТАММ МС 4100

ТРАНСКРИПЦИЯ

МЕХАНИЗМ

МУТАНТЫ

МУТАНТЫ RPOB

АЛЛЕЛЬНОСТЬ

УСТОЙЧИВОСТЬ

РИФАМПИЦИН

ФЕНОТИПЫ

ПЛЕЙОТРОПНОСТЬ


Доп.точки доступа:
Gross, Carol A.


17.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.04-04Б2.187

    Hager, Dayle A.

    Use of Mono O high-resolution ion-exchange chromatography to obtain highly fure and active Escherichia coli RNA polymerase [Text] / Dayle A. Hager, Ding Jun Jin, Richard R. Burgess // Biochemistry. - 1990. - Vol. 29, N 34. - P7890-7894 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Использование ионообменной хроматографии с высоким разрешением на моно-Q для получения высокоочищенной и активной РНК-полимеразы из Escherichia coli
Аннотация: Описан метод получения высокоочищенного и активного холофермента ДНК-зависимой РНК-полимеразы ('альфа'[2]'бета''бета'''сигма'{7}{0}'омега') из Е. coli, позволяющий отделить холофермент от корфермента ('альфа'[2]'бета''бета'''омега'). Метод прост, воспроизводим и м. б. осуществлен при комнатной т-ре. Он состоит в последовательной хр-фии на колонках с ДНК-целлюлозой, сефакрилом S-300 и препаративной колонке с ионообменником моно-Q для ВЭЖХ. Элюция с последнего носителя проводится пологим градиентом конц-ии NaCl (0,35- 0,5 М) с низкой скоростью (1 мл/мин). Кор-фермент элюируется при конц-ии NaCl 0,38 М, а холофермент - 0,4 М. Очищ. таким способом холофермент имеет частоту 99%, сохраняет по крайней мере 90% активности от макс. возможной и содержит стехиометрическое кол-во субъединицы 'сигма'{7}{0}. Библ. 21. США, Burgess R. R. McArdle Lab. for Cancer Res., Univ. of WI, Madison, WI 53706.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.17.09.15 + 341.27.17.09.09.07
Рубрики: РНК-ПОЛИМЕРАЗА
ДНК-ЗАВИСИМАЯ РНК-ПОЛИМЕРАЗА

ОЧИСТКА

ВЭЖХ

MONOQ

ESCHERICHIA COLI (BACT.)

ХОЛОФЕРМЕНТ

КОР-ФЕРМЕНТ

РАЗДЕЛЕНИЕ


Доп.точки доступа:
Jin, Ding Jun; Burgess, Richard R.


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)