СибНСХБ

Вид поиска

Область поиска

в найденном

Найдено в других БД

Формат представления найденных документов:
библиографическое описание	краткий	полный

Отсортировать найденные документы по:
автору	заглавию	году издания	типу документа

Поисковый запрос: (<.>S=MLVA<.>)

Общее количество найденных документов : 26
Показаны документы с 1 по 20

1-20 21-26

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 07.12-04Б4.150

A regional outbreak of S. Typhimurium in Denmark and identification of the source using MLVA typing [Text] / M. Torpdahl [et al.] // Eurosurveillance. - 2006. - Vol. 11, N 4-6. - P134-136 . - ISSN 1025-496X
Перевод заглавия: Региональная вспышка заболевания, вызванная S. typhimurium, в Дании и идентификация источника с использованием MLVA типирования
Аннотация: В Дании в рамках национальной системы контроля кишечных инфекций человека все изоляты Salmonella typhimurium в настоящее время субтипируются, используя фаготипирование, антибиограмное типирование и PFGE. Однако различающаяся способность PFGE не всегда достаточно высока для установления различий между определенными фаготипами и не всегда можно отделить имеющие и не имеющие отношения изоляты. Поэтому с 2004 г. для контрольного типирования S. typhimurium применяется MLVA. В мае-июне 2005 г. методом MLVA было идентифицировано 26 случаев инфекции, вызванной S. typhimurium. Изоляты были полностью чувствительными и имели один из наиболее часто встречающихся в Дании фаготипов (DT 12) и PFGE типов. Используя методы MLVA и PFGE проведено сравнение изолятов S. typhimurium DT 12 от рутинного контроля животных и пищевых продуктов для сравнения с изолятами от людей. Результаты типирования показали, что изоляты от свиного стада и соответствующей скотобойни, расположенной в районе, где произошла вспышка заболевания, имели те же MLVA и PFGE типы, что и изоляты от людей. В противоположность этому у всех других исследованных изолятов DT 12, имевших тот же профиль PFGE, были другие MLVA типы. Заключение о том, что свиное стадо являлось источником инфекции людей, было подтверждено информацией от пациентов. Сделан вывод, что MLVA может вносить существенный вклад в контроль и исследование вспышек заболеваний, вызванных S. typhimurium, так как без типирования методом MLVA эта вспышка могла быть не определена или ее происхождение могло остаться не отслеженным. Дания, Statens Serum Inst. Dep. of Bacteriology, Mycology & Parasitology, Copenhagen. Библ. 10

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59 + 761.03.43.05.07
Рубрики: ИНФЕКЦИИ
КИШЕЧНЫЕ
ВСПЫШКИ
ЧЕЛОВЕК
КОНТРОЛЬ
ДАНИЯ
SALMONELLA TYPHIMURIUM (BACT.)
СУБТИПИРОВАНИЕ
ИЗОЛЯТЫ
ЖИВОТНЫЕ
ПИЩЕВЫЕ ПРОДУКТЫ
МЕТОДЫ
MLVA
PFGE

Доп.точки доступа:
Torpdahl, M.; Sorensen, G.; Ethelberg, S.; Sando, G.; Gammelgard, K.; Porsbo, L.J.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.05-04Б4.62

Outbreak of Salmonella typhimurium infection traced to imported cured sausage using MLVA-subtyping [Text] / K. Nygard [et al.] // Eurosurveillance. - 2007. - Vol. 12, N 1-3. - P86-87 . - ISSN 1025-496X
Перевод заглавия: Вспышка инфекции, вызванная Salmonella typhimurium, отслеженная до импортированных вяленых колбас, используя субтипирование MLVA
Аннотация: В ноябре 2006 г. у пациента в Норвегии была диагностирована инфекция, вызванная Salmonella typhimurium. Опрос показал, что вероятным источником была вяленая колбаса, купленная им на ярмарке между Кельном (Германия) и Осло (Норвегия). Исследованные изоляты, полученные от пациента и колбасы, были отнесены к фаготипу DT208 и имели практически идентичные профили MLVA (различие в одном локусе). Изоляты были устойчивы к тетрациклинам, но чувствительны ко всем другим тестированным антимикробным средствам. Было идентифицировано еще 3 пациента, инфицированных S. typhimurium, который имел тот же фаготип и профиль MLVA. Сделан вывод, что принимая во внимание небольшой размер вспышки, она по всей вероятности была вызвана одной партией колбасы. Однако невозможно определить точный размер вспышки, так как типирование MLVA не осуществляется во всей Европе. Авторы предлагают лабораториям здравоохранения и специалистам в пищевой области продолжать мониторинг этого вопроса. Норвегия, Norwegian Inst. of Public Health (Nasjonalt folkehelseinstitutt), Oslo. Библ. 7

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59 + 341.27.49.13.07
Рубрики: ИНФЕКЦИИ
SALMONELLA TYPHIMURIUM
ВСПЫШКИ
НОРВЕГИЯ
ПИЩЕВЫЕ ПРОДУКТЫ
КОНТАМИНАЦИЯ
ТИПИРОВАНИЕ
MLVA
УСТОЙЧИВОСТЬ
ТЕТРАЦИКЛИН
ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
АНТИБИОТИКИ

Доп.точки доступа:
Nygard, K.; Lindstedt, B.-A.; Wahl, E.; Jensvoll, L.; Kjelso, C.; Molbak, K.; Torpdahl, M.; Kapperud, G.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 08.05-04Б4.270К

Цыганкова, Е. А.
Разработка методического подхода к генетическому типированию штаммов сибиреязвенного микроба [Текст] / Е. А. Цыганкова. - Саратов : Рос. н.-и. противочум. ин-т "Микроб", 2007. - 30 с. : ил.
Аннотация: Разработанный методический подход к генетическому типированию сибиреязвенного микроба Bacillus anthracis, основанный на сочетанном анализе маркеров MLVA, PCR-RFLP и SNR в нашей модификации, дает возможность сравнивать как штаммы, выделенные в разных географических регионах, так и дифференцировать изоляты из нескольких и даже одной вспышки сибиреязвенной инфекции

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.25.08 + 341.27.59
Рубрики: BACILLUS ANTHRACIS (BACT.)
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
МАРКЕРЫ
MLVA
ПЦР-RELP
SNR
ГЕОГРАФИЧЕСКИЕ РЕГИОНЫ
РАЗНЫЕ
ВСПЫШКА
СИБИРЕЯЗВЕННЫЕ ИНФЕКЦИИ
Свободных экз. нет

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.03-04Б4.142

Фенотипические и генетические особенности культурально-морфологических вариантов Bacillus anthracis [Текст] / О. И. Цыганкова [и др.] // Ж. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2008. - N 4. - С. 6-11 . - ISSN 0372-9311
Аннотация: Проведен сравнительный анализ MLVA-генотипов 6 штаммов и 40 их вариантов сибиреязвенного микроба, различающихся по как капсуло- и токсинообразованию, гемолитической, протеолитической и лецитиназной активности, питательным потребностям, чувствительности к сибиреязвенным бактериофагам, вирулентности, иммуногенности, а также наличию генов капсуло- и токсинообразования. Результаты филогенетического анализа характеристик пяти хромосомных и плазмидного локуса pXO1aat вариабельных для данной выборки культур B. anthracis показали, что все штаммы разделяются на два главных кластера - A и B. Кластер A составляют 5 генотипов, а кластер B - 1 генотип. Все высоковирулентные исходные штаммы и варианты с характерным фенотипом Cap (CO[2]){+}(O[2]){-}Tox{+}ProtA{+}Hly{+}Lec{-}Trp{+} имели в четырех группах идентичный генотип, в пятой группе он отличался только по локусу yrrA. Все исходные штаммы и варианты с наиболее атипичным комплексом фенотипических свойств Cap (CO[2]){+}(O[2]){+}Tox{-}ProtA{-}Hly{-}Lec{-}Trp{-} имели также одинаковый генотип, относящийся к кластеру B и отличающийся характеристикой пяти хромосомных VNTR-локусов и локуса pXO1aat от свойственного типичным штаммам. Отсутствие продукции токсина in vitro у них не было связано с утратой генетических детерминант компонентов токсина. Большие размеры ампликонов локуса pXO1aat (135 и 132 п. н.) имели культуры с типичными свойствами, одним из которых была способность к продукции токсина in vitro, наименьший (123 п. н.) - атоксигенные исходные штаммы и варианты с комплексом атипичных свойств и идентичным хромосомным генотипом. Все исходные культуры выделены на территории России, их генотипы описаны впервые. Россия, Ставропольский научно-исследовательский противочумный ин-т. Библ. 12

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.21
Рубрики: BACILLUS ANTHRACIS (BACT.)
ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
VNTR-ЛОКУСЫ
MLVA-ГЕНОТИПЫ
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Цыганкова, О.И.; Еременко, Е.И.; Цыганкова, Е.А.; Буравцева, Н.П.; Рязанова, А.Г.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 09.04-04Б4.20

Establishment of a genotyping scheme for Coxiella burnetii [Text] / Sanela Svraka [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2006. - Vol. 254, N 2. - P268-274 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Разработка схемы генотипирования для Coxiella burnetii
Аннотация: Coxiella burnetii - агент, вызывающий Q-лихорадку,отличается высокой инфекционностью и относится к категории биологического оружия. Для быстрой идентификации этой бактерии разработали метод анализа вариабельного числа тандемных повторов в множественных локусах (MLVA). Охарактеризовали 60 изолятов Coxiella burnetii и 5 вариантов, полученных при пассажах в лаборатории. С помощью VNTR-маркеров выявили полиморфизм, ведущий к 9 уникальным типам MLVA, принадлежащим к 5 различным кластерам. Показали высокую разделяющую способность системы и стабильность отобранных VNTR-маркеров, что свидетельствует о возможности применения разработанного метода в эпидемиологических исследованиях. FEMS Microbiol. Letters, 2006, v. 254, p. 268

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: БОЛЕЗНИ
Q-ЛИХОРАДКА
ВОЗБУДИТЕЛЬ
ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНОТИП
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
МЕТОД MLVA
ЭПИДЕМИАЛОГИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
COXIELLA BURNETII (BACT.)

Доп.точки доступа:
Svraka, Sanela; Toman, Rudolf; Skultely, Ludovit; Slaba, Katarina; Homan, Wieger L.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 10.01-04Б4.123

A multi-state outbreak of Salmonella Saintpaul in Australia associated with cantaloupe consumption [Text] / S. A. Munnoch [et al.] // Epidemiol. and Infec. - 2009. - Vol. 137, N 3. - P367-374 . - ISSN 0950-2688
Перевод заглавия: Произошедшая в нескольких штатах Австралии вспышка заболевания, вызванного Salmonella Saintpaul, которая была связана с потреблением канталупы
Аннотация: В октябре 2006 г. в штатах Новом Южном Уэльсе и Виктории, а также в Австралийской Столичной Территории произошла вспышка заболевания, вызванного Salmonella enterica серовар Saintpaul. Специфические для этой вспышки штаммы S. Saintpaul были идентифицированы методом MLVA в образцах фекалий 36 больных. Заболевание было связано с потреблением канталупы, с кожи которой были выделены S. Saintpaul с характерным для вспышки профилем MLVA. Сделано заключение, что практики выращивания и переработки канталупы могут представлять потенциальную угрозу для здоровья и требуют принятия нормативно-правовых и образовательных мер. Австралия, Hunter New England Population Health, Hunter New England Area Health Service, Wallsend, NSW. Библ. 24

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59 + 341.27.49.13.99
Рубрики: ВСПЫШКИ
ИНФЕКЦИИ
SALMONELLA ENTERICA (BACT.)
СЕРОВАР SAINTPAUL
ШТАММЫ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
СВЯЗЬ
КАНТАЛУПА
ПОТРЕБЛЕНИЕ
МЕТОД MLVA
ШТАТЫ АВСТРАЛИИ

Доп.точки доступа:
Munnoch, S.A.; Ward, K.; Sheridan, S.; Fitzsimmons, G.J.; Shadbolt, C.T.; Piispanen, J.P.; Wang, Q.; Ward, T.J.; Worgan, T.L.M.; Oxenford, C.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 11.06-04Б4.35

Use of multiple-locus variable number tandem repeat analysis and phage typing for subtyping of Salmonella Enteritidis from sporadic human cases in the United States [Text] / S. Cho [et al.] // J. Appl. Microbiol. - 2010. - Vol. 108, N 3. - P859-867 . - ISSN 1364-5072
Перевод заглавия: Использование мультилокусного анализа числа вариабельных тандемных повторов и фаготипирования для субтипирования Salmonella Enteritidis от спорадических случаев заболеваний человека в США
Аннотация: Используя мультилокусный анализ числа вариабельных тандемных повторов (MLVA) и фаготипирование, изучали генетическое разнообразие среди 245 изолятов Salmonella Enteritidis, выделенных от спорадических случаев заболeваний человека в штатах Мичиган, Миннесота, Нью-Йорк и Вашингтон между 2000 г. и 2007 г. для оценки взаимоотношения между фаготипами (РТ) и локусами с вариабельным числом тандемных повторов (VNTR). Было идентифицировано 94 типа MLVA и 22 различных РТ. Специфические РТ были ассоциированы с преобладающим аллелем для определенных локусов VNTR. Кластерный анализ с использованием минимального остовного дерева продемонстрировал 2 крупных кластера (I, II) и 1 небольшой кластер изолятов. РТ8, 13а, 13 и 34 было значимо связаны с кластером I MLVA. РТ 1, 4, 6а и 18 были значимо связаны с кластером II MLVA. США, Nat. Food Safety and Toxicology Center, Michigan State Univ., East Lansing

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: SALMONELLA ENTERITIDIS (BACT.)
СУБТИПИРОВАНИЕ
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ
МЕТОДЫ
ВАРИАБЕЛЬНЫЕ ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
MLVA
ФАГОТИПИРОВАНИЕ
СПОРАДИЧЕСКИЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
ЧЕЛОВЕК

Доп.точки доступа:
Cho, S.; Whittam, T.S.; Boxrud, D.J.; Bartkus, J.M.; Rankin, S.C.; Wilkins, M.J.; Somsel, P.; Downes, F.P.; Musser, K.A.; Root, T.P.; Warnick, L.D.; Wiedmann, M.; Saeed, A.M.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 11.10-04Б4.105

Кулаков, Ю. К.
Генетическая характеристика изолятов Brucella melitensis из Монголии, России и Азербайджана [Текст] / Ю. К. Кулаков // Молекул. генет., микробиол. и вирусол. - 2011. - N 2. - С. 8-12 . - ISSN 0208-0613
Аннотация: Проведено сравнительное генетическое изучение изолятов В. melitensis, выделенных от людей и животных в Монголии, России и Азербайджане, на основе современных методов типирования. 28 изолятов В. melitensis из Монголии (n = 18), России (n = 6) и Азербайджана (n = 4) были изучены с использованием двух методик: а) ПЦР с праймерами на видо- и биоварспецифические дифференцирующие мишени генов белков бруцелл; б) MLVA (multiple locus variable number tandem repeats analysis) с 12 парами праймеров на известные локусы генома бруцелл. В ПЦР на дифференцирующие генетические мишени все изученные изоляты характеризовались как В. melitensis, биовар 2. Метод MLVA-типирования изолятов В. melitensis выявил 7 идентичных и 5 вариабельных локусов. Дендрограмма, построенная на основе данных MLVA-12-типирования 28 изолятов, выявила 25 генотипов и объединила их в генетически родственный кластер вместе с референтным штаммом В. melitensis 63/9, биовар 2. MLVA-генотипы были отнесены к различным аймакам Монголии, областям России и Азербайджана. Установлена циркуляция 2 изолятов на нетипичных для В. melitensis хозяевах - верблюде и яке. Генетическая характеристика географически удаленных изолятов B. melitensis из Монголии, России и Азербайджана определила их родство. Вместе с тем с помощью метода MLVA показано генетическое разнообразие этих изолятов, относящихся к 25 генотипам с индексом вариабельности Hunter and Gaston discriminatory index (HGDI) 0,9841. Для совершенствования системы эпидемиологического надзора за бруцеллезом в России необходимо проводить MLVA-типирование изолятов, выделяемых на приграничных территориях как с Монголией (Сибирский федеральный округ: в республиках Тыва, Бурятия и Иркутской области), так и с Азербайджаном (Южный федеральный округ: в республиках Дагестан, Калмыкия и Ставропольском крае)

ГРНТИ	34.27.29

ВИНИТИ 341.27.29.07.11
Рубрики: BRUCELLA MELITENSIS (BACT.)
ИЗОЛЯТЫ
ЛЮДИ
ЖИВОТНЫЕ
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ НАДЗОР
МОНГОЛИЯ
РОССИЯ
АЗЕРБАЙДЖАН
МЕТОДЫ
ПЦР
MLVA-ТИПИРОВАНИЕ

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 12.03-04Б4.36

Рязанова, А. Г.
Использование методов молекулярного типирования Bacillus anthracis в Референс-центре по мониторингу за возбудителем сибирской язвы [Текст] / А. Г. Рязанова // Пробл. особо опас. инфекций. - 2011. - N 4. - С. 68-70 . - ISSN 0370-1069
Аннотация: Представлены результаты молекулярного типирования Bacillus anthracis в рамках деятельности Референс-центра по мониторингу за возбудителем сибирской язвы. Обобщен опыт использования генотипирования при проведении эпидемиологического расследования вспышек сибирской язвы. Отмечено, что MLVA-генотипирование с анализом от 8 до 25 VNTR-локусов при изучении штаммов B. anthracis, выделенных в Российской Федерации и на сопредельных территориях, позволяет проводить корректное сравнение генотипов с данными всемирной MLVA-базы данных. Определены основные задачи Референс-центра по разработке подходов к генотипированию возбудителя сибирской язвы, к числу которых относится изучение возможности использования дополнительных методов генотипирования, таких как анализ SNP, SNR с оценкой вариабельности описанных локусов и поиском новых полиморфных областей

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.21
Рубрики: BACILLUS ANTHRACIS (BACT.)
ВОЗБУДИТЕЛЬ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ
МЕТОДЫ
MLVA-ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
VNTR-ЛОКУСЫ
SNP-АНАЛИЗ
РЕФЕРЕНС-ЦЕНТР ПО МОНИТОРИНГУ

10.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 12.08-04Б4.32

MLVA-генотипирование метициллинрезистентных штаммов золотистого стафилококка, циркулирующих в специализированных стационарах географически удаленных регионов России [Текст] / А. Е. Гончаров [и др.] // Инфекции в хирургии. - 2011. - Т. 9, N 3. - С. 28-30
Аннотация: Генетическая структура метициллинрезистентных штаммов золотистого стафилококка, изученная методом MLVA, характеризовалась сравнительно высокой гомогенностью. 35 из 55 изученых штаммов (63,64%) были отнесены к одной из трех клональных линий, причем одна из них была представлена изолятами ранее идентифицированного нами эпидемического клона BT2007. Ранее отмечалось, что методика MLVA-типирования в использованном нами варианте не уступает по разрешающей способности методу пульс-электрофореза. На наш взгляд, данная методика относительно проста в исполнении, экономична и может быть применена практическими лабораториями, использующими метод полимеразной цепной реакции, в комплексе с другими методами молекулярно-генетического типирования при осуществлении эпидемического надзора за внутрибольничными инфекциями стафилококковой этиологии, включая инфекции, обусловленные метициллинрезистентными штаммами стафилококков. Россия, Санкт-Петербургская гос. медицинская академия им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: ЗОЛОТИСТЫЙ СТАФИЛОКОКК
МЕТИЦИЛЛИНРЕЗИСТЕНТНЫЕ ШТАММЫ
STAPHYLOCOCCUS AUREUS (BACT.)
ГЕНОТИПИРОВАНИЕ
МЕТОДЫ
MLVA-ТИПИРОВАНИЕ
ПЦР
ВНУТРИБОЛЬНИЧНЫЕ ИНФЕКЦИИ
ЭПИДЕМИЧЕСКИЙ НАДЗОР

Доп.точки доступа:
Гончаров, А.Е.; Колоджиева, В.В.; Суборова, Т.Н.; Сатосова, Н.В.; Хорошилов, В.Ю.; Агапов, К.А.; Зуева, Л.П.

11.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 13.02-04Б4.27

Кулешов, К. В.
Разработка и апробация методики MLVA-анализа с целью субтипирования изолятов S.enteritidis [Текст] / К. В. Кулешов, С. И. Браславская, А. Т. Подколзин // 7 Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием "Молекулярная диагностика - 2010", Москва, 24-26 нояб., 2010. - М., 2012. - Т.2. - С. 350-353 . - ISBN 978-5-903926-14-5
Аннотация: Субтипирование изолятов Salmonella enteritidis проводили методом MLVA (анализ локусов хромосомной ДНК бактерий, вариабельных по числу тандемных повторов). Для сравнения использовали результаты макрорестрикционного анализа (PFGE) данных штаммов. Методика MLVA-анализа показала высокую производимость, чувствительность и дифференцирующую способность. Комбинация MLVA с PFGE является наиболее оптимальной схемой субтипирования изолятов S. enteritidis в целях эпиднадзора за сальмонеллезами. Россия, Центр. НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: SALMONELLA ENTERIDIS (BACT.)
ТИПИРОВАНИЕ
МЕТОД MLVA
ПРИМЕНЕНИЕ
ЭФФЕКТИВНОСТЬ

Доп.точки доступа:
Браславская, С.И.; Подколзин, А.Т.

12.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 13.02-04Б4.34

Использование MLVA (multiple locus variable tandem repeats analysis) в систематике возбудителя бруцеллеза [Текст] / Ю. К. Кулаков [и др.] // Молекул. генет., микробиол. и вирусол. - 2012. - N 2. - С. 30-34 . - ISSN 0208-0613
Аннотация: В современной системе мероприятий по борьбе с бруцеллезом возрастающее значение приобретают методы, позволяющие проводить молекулярно-генетическую дифференциацию штаммов одного вида. Метод MLVA (multiple locus variable number tandem repeats analysis) был выбран для молекулярно-генетической дифференциации до штаммового уровня и одновременного установления генетического родства изучаемых штаммов. Цель работы состояла в типировании методом MLVA штаммов трех патогенных для человека видов бруцелл с анализом стабильности выбранных локусов, в выявлении различий между ними и соответствия данных, полученных этим методом и фенотипическим методом дифференциации бруцелл, для использования метода MLVA в систематике возбудителя бруцеллеза. Двадцать шесть штаммов бруцелл, представляющих референтные (n = 15), вакцинные (n = 2), полевые штаммы трех патогенных видов бруцелл - B. melitensis (n = 3), B. abortus (n = 2), B. suis (n = 2) - и изоляты (n = 2) с неясным таксономическим положением были типированы методом MLVA с 9 парами праймеров на известные вариабельные локусы генома бруцелл. Проведен анализ стабильности выбранных локусов, их отличий по Hunter-Gaston discrimination index (HGDI) и соответствия получаемых данных фенотипическим методам идентификации. Метод MLVA подтверждает результаты фенотипических методов идентификации, стабильность выбранных локусов у большинства референтных и вакцинных штаммов с высоким индексом вариабельности HGDI 0.9969 для всех локусов. Дендрограмма на основе данных MLVA-типирования позволила распределить штаммы бруцелл в родственные кластеры в соответствии с их таксономическим видовым и биоварным положением и формированием 25 генотипов. Штаммы B. melitensis сформировали кластер, родственный референтному штамму B. melitensis 63/9 биовар 2. Австралийские изоляты Brucella 83-4 и Brucella 83-6, выделенные от мышевидных грызунов, сформировали удаленный от других штаммов бруцелл кластер

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: BRUCELLA (BACT.)
ВОЗБУДИТЕЛЬ БРУЦЕЛЛЕЗА
СИСТЕМАТИКА
ШТАММОВАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
ГЕНОТИПЫ
MLVA-ГЕНОТИПЫ
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ НАДЗОР
МЕТОДЫ
MLVA

Доп.точки доступа:
Кулаков, Ю.К.; Ковалев, Д.А.; Мисетова, Е.Н.; Головнева, С.И.; Ляпустина, Л.В.; Желудков, М.М.

13.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 13.02-04Б4.184

Кулаков, Ю. К.
Молкулярно-генетическая характеристика изолятов бруцелл, выделенных от собак и оленей в различных регионах России [Текст] / Ю. К. Кулаков, Л. Е. Цирельсон, М. М. Желудков // Молекул. генет., микробиол. и вирусол. - 2012. - N 4. - С. 28-33 . - ISSN 0208-0613
Аннотация: Цель работы - сравнительная молекулярно-генетическая характеристика изолятов бруцелл, выделенных от собак и оленей в России, с использованием современных методов типирования. Изоляты от собак (n = 19) и оленей (n = 2) были изучены методом ПЦР с праймерами на видо- и биоварспецифические дифференцирующие мишени бруцелл и MLVA (multiple locus variable number tandem repeats analysis) с 12 парами праймеров на известные вариабельные локусы генома бруцелл. В ПЦР на дифференцирующие генетические мишени изоляты от собак были охарактеризованы как B. canis, а оленьи изоляты - как B. suis биовар 4. Метод MLVA-типирования изолятов показал 5 идентичных и 7 вариабельных локусов. Дендрограмма на основе данных MLVA-12-типирования объединила все изоляты в генетически родственный кластер вместе с референтными штаммами B. canis RM6/66 и B. suis 1330, Tomsen, 686, 40 биовары 1-4. Было выявлено 17 MLVA-генотипов у изолятов с индексом вариабельности Hunter and Gaston discriminatory index (HGDI) = 0,9842. Молекулярно-генетическая характеристика географически удаленных друг от друга российских изолятов B. canis и B. suis подтверждает существующее положение о близком генетическом родстве этих видов бруцелл. Вместе с тем методом MLVA показаны генетическое разнообразие этих изолятов и привязанность родственных генотипов к географическому региону первичного выделения. Для совершенствования системы эпидемиологического надзора за бруцеллезом в России необходимо проводить MLVA-типирование изолятов, выделяемых от собак и оленей, представляющих эпидемическую опасность для человека

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: BRUCELLA CANIS (BACT.)
BRUCELLA SUIS (BACT.)
ИЗОЛЯТЫ
ВЫДЕЛЕНИЕ
СОБАКИ
ОЛЕНИ
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА
ГЕНОТИПЫ
МЕТОДЫ
ПЦР С ПРАЙМЕРАМИ
MLVA
ЭПИДНАДЗОР

Доп.точки доступа:
Цирельсон, Л.Е.; Желудков, М.М.

14.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 13.03-04Б2.140

Использование MLVA (multiple locus variable tandem repeats analysis) в систематике возбудителя бруцеллеза [Текст] / Ю. К. Кулаков [и др.] // Молекул. генет., микробиол. и вирусол. - 2012. - N 2. - С. 30-34 . - ISSN 0208-0613
Аннотация: В современной системе мероприятий по борьбе с бруцеллезом возрастающее значение приобретают методы, позволяющие проводить молекулярно-генетическую дифференциацию штаммов одного вида. Метод MLVA (multiple locus variable number tandem repeats analysis) был выбран для молекулярно-генетической дифференциации до штаммового уровня и одновременного установления генетического родства изучаемых штаммов. Цель работы состояла в типировании методом MLVA штаммов трех патогенных для человека видов бруцелл с анализом стабильности выбранных локусов, в выявлении различий между ними и соответствия данных, полученных этим методом и фенотипическим методом дифференциации бруцелл, для использования метода MLVA в систематике возбудителя бруцеллеза. Двадцать шесть штаммов бруцелл, представляющих референтные (n = 15), вакцинные (n = 2), полевые штаммы трех патогенных видов бруцелл - B. melitensis (n = 3), B. abortus (n = 2), B. suis (n = 2) - и изоляты (n = 2) с неясным таксономическим положением были типированы методом MLVA с 9 парами праймеров на известные вариабельные локусы генома бруцелл. Проведен анализ стабильности выбранных локусов, их отличий по Hunter-Gaston discrimination index (HGDI) и соответствия получаемых данных фенотипическим методам идентификации. Метод MLVA подтверждает результаты фенотипических методов идентификации, стабильность выбранных локусов у большинства референтных и вакцинных штаммов с высоким индексом вариабельности HGDI 0.9969 для всех локусов. Дендрограмма на основе данных MLVA-типирования позволила распределить штаммы бруцелл в родственные кластеры в соответствии с их таксономическим видовым и биоварным положением и формированием 25 генотипов. Штаммы B. melitensis сформировали кластер, родственный референтному штамму B. melitensis 63/9 биовар 2. Австралийские изоляты Brucella 83-4 и Brucella 83-6, выделенные от мышевидных грызунов, сформировали удаленный от других штаммов бруцелл кластер

ГРНТИ	34.27.21

ВИНИТИ 341.27.21.05.15
Рубрики: BRUCELLA (BACT.)
ВОЗБУДИТЕЛЬ БРУЦЕЛЛЕЗА
СИСТЕМАТИКА
ШТАММОВАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
ГЕНОТИПЫ
MLVA-ГЕНОТИПЫ
ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ НАДЗОР
МЕТОДЫ
MLVA

Доп.точки доступа:
Кулаков, Ю.К.; Ковалев, Д.А.; Мисетова, Е.Н.; Головнева, С.И.; Ляпустина, Л.В.; Желудков, М.М.

15.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 13.05-04Б4.26

Молекулярное типирование методом MLVA типичных и генетически измененных природных штаммов Vibrio cholerae биовара эльтор [Текст] / Т. А. Кульшань [и др.] // Пробл. особо опас. инфекций. - 2012. - N 4. - С. 39-43 . - ISSN 0370-1069
Аннотация: Показана возможность дифференциации методом MLVA типичных и генетически измененных штаммов Vibrio cholerae биовара эльтор, различающихся вирулентностью и эпидемическим потенциалом. Установлено значительное генетическое разнообразие геновариантов, обусловленное, видимо, как их поликлональным происхождением, так и продолжающимися изменениями генома под влиянием меняющихся факторов окружающей среды

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: VIBRIO CHOLERAE (BACT.)
БИОВАР ЭЛЬТОР
MLVA ТИПИЧНЫЕ ШТАММЫ
ГЕНЕТИЧЕСКИ ИЗМЕНЕННЫЕ ШТАММЫ
МОЛЕКУЛЯРНОЕ ТИПИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Кульшань, Т.А.; Краснов, Я.М.; Лозовский, Ю.В.; Смирнова, Н.И.

16.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 13.06-04Б4.6

К вопросу генотипирования возбудителя бруцеллеза [Текст] : докл. [Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием "Современные аспекты природной очаговости болезней", посвященная 90-летию ФБУН "Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций" Роспотребнадзора, Омск, 1-2 нояб., 2011] / Д. А. Ковалев [и др.] // Нац. приоритеты России. - 2011. - N 2. - С. 161-162 . - ISSN 2221-7711
Аннотация: Использованы 26 штаммов бруцелл трех основных патогенных видов (B. melitensis, B. abortus, B. suis), представленных 14 известными референтными, двумя вакцинными, восемью полевыми штаммами и двумя австралийскими изолятами, выделенными от мышевидных грызунов Австралии, имеющими неясное таксономическое положение. Схема MLVA-типирования включала анализ вариабельных тандемных повторов штаммов бруцелл в ПЦР с праймерами, ограничивающими 9 VNTR-локусов из обеих панелей (мини- и микросателлитная) MLVA-15. Анализ полученных данных показал, что MLVA-типирование, проведенное по девяти локусам, позволяет систематизировать штаммы бруцелл в соответствии с существующим таксономическим положением видов бактерий рода Brucella. Россия, ФГУЗ "Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт" Роспотребнадзора

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.05
Рубрики: БРУЦЕЛЛЕЗ
BRUCELLA SP. (BACT.)
ПАТОГЕННЫЕ ВИДЫ
ГЕНОМ
ВАРИАБЕЛЬНЫЕ ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ЛОКУСЫ VNTR
АНАЛИЗ
МЕТОДЫ
MLVA-ТИПИРОВАНИЕ

Доп.точки доступа:
Ковалев, Д.А.; Кулаков, Ю.К.; Ляпустина, Л.В.; Мисетова, Е.Н.; Головнева, С.И.

17.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 13.06-04Б4.15

Панферова, Ю. А.
Применение панели локусов тандемных повторов переменной копийности для типирования штаммов Coxiella burnetti [Текст] : докл. [Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием "Современные аспекты природной очаговости болезней", посвященная 90-летию ФБУН "Омский научно-исследовательский институт природно-очаговых инфекций" Роспотребнадзора, Омск, 1-2 нояб., 2011] / Ю. А. Панферова, Н. К. Токаревич // Нац. приоритеты России. - 2011. - N 2. - С. 158-159 . - ISSN 2221-7711
Аннотация: Проведена дискриминация штаммов коксиелл на генотипические кластеры с помощью метода мультилокусного анализа тандемных повторов переменной копийности (MLVA). Панель из шести локусов тандемных повторов позволяет с высокой долей вероятности установить источник происхождений штаммов C. burnetii. Россия, ФБУН "НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера", Санкт-Петербург

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: COXIELLA BURNETTI (BACT.)
ШТАММЫ
ТИПИРОВАНИЕ
ЛОКУСЫ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ПЕРЕМЕННАЯ КОПИЙНОСТЬ
АНАЛИЗ
ЛИХОРАДКА КУ
МЕТОДЫ
MLVA

Доп.точки доступа:
Токаревич, Н.К.

18.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 13.08-04Б4.75

Генотипический анализ карбапенем-устойчивого штамма Acinetobacter baumannii [Текст] / А. Е. Гончаров [и др.] // Перм. мед. ж. - 2011. - Т. 28, N 6. - С. 95-99 . - ISSN 0136-1449
Аннотация: В отделениях реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ) г. Перми выделен интегрон-позитивный штамм Acinetobacter baumannii, устойчивый к имипенему и меропенему. С помощью анализа вариабельных тандемных повторов генома (MLVA) доказано клональное родство пермского штамма с представителями всемирной эпидемической линии II A. baumanni. Россия, Санкт-Петербургская государственная медицинская академия им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург. Библ. 13

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: ЛЕКАРСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ
ИМИПЕНЕМ
МЕРОПЕНЕМ
ГЕНОМ
ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ
ВАРИАБЕЛЬНЫЕ
MLVA
ACINETOBACTER BAUMANNII (BACT.)
КАРБАПЕНЕМ-УСТОЙЧИВЫЙ ШТАММ

Доп.точки доступа:
Гончаров, А.Е.; Еремеева, М.И.; Зубарева, Н.А.; Соломенный, А.П.

19.

РЖ ВИНИТИ 34 (BI14) 14.01-04Б4.88

Анализ вспышки сибирской язвы в Омской области в 2010 г. [Текст] / Г. Г. Онищенко [и др.] // Ж. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2012. - N 5. - С. 33-36 . - ISSN 0372-9311

ГРНТИ	34.27.59

ВИНИТИ 341.27.59
Рубрики: СИБИРСКАЯ ЯЗВА
ЭПИЗООТИЧЕСКИЙ ОЧАГ
ЭПИДЕМИЧЕСКИЙ ОЧАГ
BACILLUS ANTHRACIS (BACT.)
МЕТОДЫ
MLVA

Доп.точки доступа:
Онищенко, Г.Г.; Куличенко, А.Н.; Рязанова, А.Г.; Демина, Ю.В.; Крига, А.С.; Еременко, Е.И.; Цыганкова, О.И.; Цыганкова, Е.А.; Буравцева, Н.П.; Аксенова, Л.Ю.; Головинская, Т.М.

20.

РЖ ВИНИТИ 76 (BI14) 14.09-04Б4.11

Применение молекулярно-генетических методов для характеристики клинических изолятов бруцеллезного микроба [Текст] / Л. И. Шакирова [и др.] // Эпидемиол. и вакцинопрофилакт. - 2014. - N 2. - С. 54-59 . - ISSN 2073-3046
Аннотация: Выполнено методом MLVA-14 типирование 24 изолятов бруцелл, выделенных от больных людей на территории Республики Дагестан и Республики Калмыкия в 2012 - 2013 годах. Произведена оценка корреляции полученных результатов c классической схемой идентификации и дифференциации бруцелл. Определено распределение генотипов бруцелл на данных территориях

ГРНТИ	76.03.43

ВИНИТИ 761.03.43.05.11
Рубрики: BRUCELLA (BACT.)
КЛИНИЧЕСКИЕ ИЗОЛЯТЫ
ВЫДЕЛЕНИЕ
ИДЕНТИФИКАЦИЯ
МЕТОДЫ
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
MLVA-14

Доп.точки доступа:
Шакирова, Л.И.; Ляпустина, Л.В.; Головнева, С.И.; Швецова, Н.М.

1-20 21-26

"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"

© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)

rtvarBDview(" результаты поиска","20190607010228","4682442");

Вид поиска