Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска

Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Dixon, Ray$<.>)
Общее количество найденных документов : 14
Показаны документы с 1 по 14
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 90.08-04Б2.352

    Austin, Sara.

    Characterisation of the Klebsiella pneumoniae nitrogen-fixation regulatory proteins NIFA and NIFL in vitro [Text] / Sara Austin, Neville Henderson, Ray Dixon // Eur. J. Biochem. - 1990. - Vol. 187, N 2. - P353-360 . - ISSN 0014-2956
Перевод заглавия: Характеристика в системе in vitro белков NifA и NifL, регулирующих азотфиксацию у Klebsiella pneumoniae
Аннотация: Активация транскрипции гена nifH (структурный ген редуктазы динитрогеназы) в системе in vitro (S30) осуществляется водорастворимым белком NifA, к-рый взаимодействует с UAS-последовательностью, расположенной в 200 п. н. "вверх по течению" от сайта инициации транскрипции. Это взаимодействие предшествует узнаванию промотора гена nifH сигма-54 субъединице РНК-полимеразы (кодируется геном ntrA), к-рая осуществляет транскрипцию nif-генов. Белок NifA инактивируется в результате взаимодействия с водорастворимым белком NifL, pпроисходящего в присутствии кислорода и(или) м аммония. Сконструированы штаммы Escherichia coli-сверхпродуценты белков NifA и NifL. Библ. 39. Великобритания, Agriculture and Food Res. Council Inst. of Plant Sci. Res. Nitrogen Fixation Lab., Univ. of Sussex, Brighton.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.02.17
Рубрики: KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)
АЗОТФИКСАЦИЯ

МЕХАНИЗМ

ГЕНЫ

ГЕНЫ АЗОТФИКСАЦИИ NIF

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

РЕГУЛЯТОРНЫЙ БЕЛОК NIFA

РЕГУЛЯТОРНЫЙ БЕЛОК NITL

КЛОНИРОВАНИЕ

СИНТЕЗ IN VITRO


Доп.точки доступа:
Henderson, Neville; Dixon, Ray


2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 02.04-04Б2.227

   

    Concerted inhibition of the transcriptional activation functions of the enhancer-binding protein NIFA by the anti-activator NIFL [Text] / Jason Barrett [et al.] // Mol. Microbiol. - 2001. - Vol. 39, N 2. - P480-493 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Согласованное ингибирование функций активации транскрипции под действием связывающегося с энхансером белка NIFA антиактиватором NIFL
Аннотация: Регуляторный флавопротеин NIFL (I) Azotobacter vinelandii ингибирует активацию транскрипции под действием связывающегося с энхансером белка NIFA (II), образуя комплекс I-II. II состоит из 3 доменов: 1) N-концевого домена с неизвестной ф-цией; 2) центрального домена, требующегося для сопряжения гидролиза нуклеотидов с активацией холофермента 'сигма'{N} РНК-полимеразы (III); 3) C-концевого домена связывания с ДНК. Показано, что укороченные варианты II, не имеющие N-концевого домена или состоящие только из центрального домена, чувствительны к ингибированию I, но в отличие от II дикого типа продолжают гидролизовать нуклеотиды в присутствии I. I может ингибировать у II ф-цию связывания с ДНК. Высказано предположение, что I ингибирует II по согласованному механизму, контролируя связывание с ДНК, каталитич. активность и связывание с III и предотвращая активацию транскрипции в неблагоприятных условиях окружающей среды. Великобритания, Dep. Mol. Microbiol., John Innes Ctr., Colney Lane, Norwich NR4 7UH. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ГЕНЫ ФИКСАЦИИ АЗОТА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ NIFA

СТРУКТУРА-ФУНКЦИИ ВЗАИМООТНОШЕНИЕ

БЕЛОК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)


Доп.точки доступа:
Barrett, Jason; Ray, Pampa; Sobczyk, Andre; Little, Richard; Dixon, Ray


3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.02-04Б2.239

   

    DNA binding activity of the Escherichia coli nitric oxide sensor NorR suggests a conserved target sequence in diverse proteobacteria [Text] / Nicholas P. Tucker [et al.] // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 19. - P6656-6660 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: ДНК-связывающая активность сенсора окиси азота NorR Escherichia coli предполагает наличие консервативной последовательности - мишени в разных протеобактериях
Аннотация: Показали, что сенсор окиси азота NorR Escherichia coli связывается с промоторным районом транскрипционной единицы norVW, образуя, по крайней мере, два различных комплекса, определяемых при помощи гель-ретардации. Идентифицировали три сайта связывания для NorR и два сайта связывания фактора интеграции хозяина в межгенном районе norR-norV. Использовали последовательность для сайтов связывания NorR для поиска новых членов регулона NorR E. coli и показали, что такие сайты связывания сохраняются в других протеобактериях. Великобритания, John Innes Cntre, Colney, Norwich and Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxston, Cambridge. Библ. 26
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ОКИСЬ АЗОТА

МЕХАНИЗМ

БЕЛОК

СЕНСОР ОКИСИ АЗОТА NORR

ДНК-БЕЛКОВОЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

СПЕЦИФИЧНОСТЬ

ПРОМОТОРЫ

ПРОМОТОР NORVW

СТРУКТУРА

ESCHERICHIA COLI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Tucker, Nicholas P.; D'Autreaux, Benoit; Studholme, David J.; Spiro, Stephen; Dixon, Ray


4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 91.04-04Б2.597

    Dixon, Ray.

    Genetic regulation of nitrogen fixation [Text] / Ray Dixon // Nitrogen and Sulphur Cycles. - Cambridge, 1988. - P417-438 . - ISBN 0-52135199-5
Перевод заглавия: Генетическая регуляция азотфиксации
Аннотация: В обзоре суммированы данные об организации и регуляции активности генов азотфиксации (nif-гены) у Klebsiella pneumoniae. Центральную роль в активации транскрипции этих генов играет ntrA, кодирующий специфическую 'ро'{5}{4}субъединицу РНК-полимеразы. Отмечено, что гены, гомологичные ntrA, участвуют в регуляции транскрипции различных генетич. систем Pseudomonas. Сравнивается регуляция nifгенов у Azotobacter и K. pneumoniae. У клубеньковых бактерий механизмы регуляции активности генов nif иные, чем у свободноживущих азотфиксаторов: ген ntrC участвует в регуляции транскрипции nif-генов при симбиозе с растениями лишь у Azorhizobium, но не участвует у Rhizobium и Bradyrhizobium. Кроме того, у ризобий выявлены fix-гены, участвующие в активации транскрипции nif-генов (fixLJ) и отсутствующие у свободноживущих азотфиксаторов. Библ. 101. Великобритания, AFRC, Inst. of Plant Sci. Res., Div. of Nitrogen Fixation, Univ. of Sussex, Brighton BN1 9RQ.
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.31.05
Рубрики: KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)
PSEUDOMONAS (BACT.)

AZOTOBACTER (BACT.)

RHIZOBIUM (BACT.)

BRADYRHIZOBIUM (BACT.)

АЗОТФИКСИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ

СВОБОДНОЖИВУЮЩИЕ ФОРМЫ

СИМБИОНТЫ

АЗОТФИКСАЦИЯ

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ

ГЕНЫ

ГЕНЫ АЗОТФИКСАЦИИ NIF

ГЕНЫ FIX

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ



5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.09-04Б2.252

   

    Isolation and properties of the complex between the enhancer binding protein NIFA and the sensor NIFL [Text] / Tracy Money [et al.] // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, N 15. - P4461-4468 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Выделение и свойства комплекса между связывающимся с энхансером белком NIFA и сенсором NIFL
Аннотация: У Azotobacter vinelandii активация оперона nif связывающимся с энхансером белком NIFA (I) контролируется сенсорным белком NIFL (II) в ответ на изменения уровня O[2] и связанного азота in vivo. Показано, что адениновые нуклеотиды способствуют образованию ингибиторного комплекса очищенных I и II in vitro. Это позволяет выделить комплекс I-II, к-рый может быть выделен и из экстрактов клеток, экспрессирующих I и II, в присутствии MgАТФ. Удаление нуклеотида вызывает диссоциацию этого комплекса. Опыты с укороченными белками показали, что в АТФ-зависимой стимуляции образования комплекса I-II участвуют N-концевой домен I и C-концевой домен II. Великобритания, Nitrogen Fixation Lab., John Innes Ctr., Norwich Res. Park, Colney, Norwich NR4 7UH. Библ. 27
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
ОПЕРОН NIF

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

БЕЛОК NIFA

БЕЛОК NIFL

КОМПЛЕКС

ОБРАЗОВАНИЕ

СТРУКТУРА

ФУНКЦИИ

AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)


Доп.точки доступа:
Money, Tracy; Jones, Tamera; Dixon, Ray; Austin, Sara


6.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 06.10-04Б2.288

    Reyes-Ramirez, Francisca.

    Mutant forms of the Azotobacter vinelandii transcriptional activator NifA resistant to inhibition by the NifL regulatory protein [Text] / Francisca Reyes-Ramirez, Richard Little, Ray Dixon // J. Bacteriol. - 2002. - Vol. 184, N 24. - P6777-6785 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Мутантные формы транскрипционного активатора Azotobacter vinelandii NifA устойчивы к ингибированию регуляторным белком NifL
Аннотация: Выделили мутанты NifA Azotobacter vinelandii, устойчивые к ингибирующему действию NifL. Выделили мутации как в аминоконцевом домене GAF, так и в каталитическом домене AAA+NifA. Некоторые мутанты блокировали ингибирование NifL в ответ на статус как азота, так и окисления-восстановления, тогда как другие мутантные белки NifA были способны разделять формы Nifl при различных внешних условиях. Свойства мутантного белка NifA-Y254N in vitro соответствовали фенотипу in vivo и показывали, что NifA-Y254N не отвечает на азотный сигнал при взаимодействии NifL с GlnK, но отвечает на окисленную форму NifL в присутствии АДФ. Полученные результаты привели к заключению, что различные конфомеры NifL могут генерироваться в ответ на различные события сигнальной трансдукции, а домены GAF и AAA+NifA оба участвуют в ответе на NifL. Великобритания, Dep. of Molecular Microbiology, John Innes Centre, Norwich NR4 7UH. Библ. 36
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: СИГНАЛЬНАЯ ТРАНСДУКЦИЯ
МУТАНТЫ

ТРАНСКРИПЦИОННЫЙ АКТИВАТОР NIFA

ДОМЕНЫ GAF

ДОМЕНЫ AAA+NIFA

УЧАСТИЕ В

УСТОЙЧИВОСТЬ

ИНГИБИРОВАНИЕ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

РЕГУЛЯТОРНЫЙ БЕЛОК NIFL

AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)


Доп.точки доступа:
Little, Richard; Dixon, Ray


7.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 10.11-04Б2.118

   

    NtrC-dependent regulatory network for nitrogen assimilation in Pseudomonas putida [Text] / Ana B. Hervas [et al.] // J. Bacteriol. - 2009. - Vol. 191, N 19. - P6123-6135 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: NtrC-зависимая регуляторная цепь ассимиляция азота у Pseudomonas putida
Аннотация: Установлено, что у Escherichia coli и Pseudomonas putida белки NtrC, чувствительные к азоту, функционально эквиваленты. У P. putida присутствует единственный P[II] - подобный белок, кодируемый геном glnK, чья экспрессия регулируется азотом. Перед 'сигма'{N}-зависимым промотором glnK обнаружены два смежных сайта связывания NtrC. В опытах in vitro с очищенными белками показано, что транскрипция glnK непосредственно активируется NtrC и что для формирования открытого комплекса на этом промоторе обязателен хозяйский фактор интеграции. Также изучена транскрипция генов P. putida, ортологичных генам codB, dppA и ureD энтеробактерий, экспрессия которых регулируется Nac и является 'сигма'{70} зависимой. Установлено, что у генов codB и ureD P. putida промоторы 'сигма'{N}-зависимы и их индукция азотом осуществляется непосредственно NtrC, тогда как активация промотора гена dppA происходит по-другому. Полагают, что у P. putida, по сравнению с эубактериями, регуляторная цепь ассимиляции азота существенно проще и включает ауторегуляцию glnK по типу обратной связи, использующую NtrC в качестве посредника. Испания, Centro Andalux de Biol. & Desarrollo, Univ. Padlo de Olavide/CSIC, Carretera de Utrera, Km 1 41013 Seville
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АССИМИЛЯЦИЯ АЗОТА
РЕГУЛЯТОРНАЯ ЦЕПЬ

ГЕНЫ

ГЕН GLNK

ПРОМОТОР

АУТОРЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

РЕГУЛЯТОР NTRC

PSEUDOMONAS PUTRADA (BACT.)


Доп.точки доступа:
Hervas, Ana B.; Canosa, Ines; Little, Richard; Dixon, Ray; Santero, Eduardo


8.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 03.08-04Б2.195

    Reyes-Ramirez, Francisca.

    Role of Escherichia coli nitrogen regulatory genes in the nitrogen response of the Azotobacter vinelandii NifL-NifA complex [Text] / Francisca Reyes-Ramirez, Richard Little, Ray Dixon // J. Bacteriol. - 2001. - Vol. 183, N 10. - P3076-3082 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Роль азотных регуляторных генов в азотном ответе комплекса NifL-NifA Azotobacter vinelandii
Аннотация: Изучена роль PII-подобных белков передачи сигнала Escherichia coli в азотном контроле регуляторной системы NifL (I) - NifA (II) Azotobacter vinelandii in vivo. А отличие от данных, полученных ранее с I Klebsiella pneumoniae, белки PII и GlnK E. coli не требуются для уменьшения ингибирования под действием I Azotobacter vinelandii в условиях ограничения по азоту. Разрушение обоих генов gln и ntrC E. coli приводит к полной утрате азотной регуляции активности II под действием I. Мутанты glnB ntrC и glnB glnK ntrC накапливают высокий внутриклеточный уровень 2-оксоглутарата (III) в условиях избытка азота. Предложена модель, согласно к-рой азотный контроль системы I-II A. vinelandii достигается в ответ на уровень III и взаимодействие с PII-подобными белками в условиях избытка азота. Великобритания, Dep. Mol. Microbiol., John Innes Ctr., Norwich NR4 7UH. Библ. 38
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
ГОЛОДАНИЕ ПО АЗОТУ

МЕХАНИЗМ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

АЗОТНЫЕ РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ NIFL-NIFA

СИНТЕЗ

ФУНКЦИЯ

СТРУКТУРА

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕНЫ МЕТАБОЛИЗМА АЗОТА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯЦИЯ

AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)


Доп.точки доступа:
Little, Richard; Dixon, Ray


9.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 07.05-04Б2.229

   

    The NifL-NifA system: A multidomain transcriptional regulatory complex that integrates environmental signals [Text] / Isabel Martinez-Argudo [et al.] // J. Bacteriol. - 2004. - Vol. 186, N 3. - P601-610 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Система NifL-NifA: мультидоменный транскрипционный регуляторный комплекс, интегрирующий сигналы окружающей среды
Аннотация: В обзоре проанализировали последние результаты исследований регуляторного комплекса бактерий NifL-NifA, отвечающего на многочисленные внешние сигналы и интегрирующего их для формирования адаптивного ответа. Представлены данные по структуре доменов, лигандам связывания, описаны механизмы взаимодействия NifL-NifA и регуляции азота, участие системы окисления-восстановления и механизм ингибирования NifL. Показаны отличия в системах сигнального межклеточного сообщения между бактериями Klebsiella pneumoniae и Azotobacter vinelandii. Великобритания, Dep. of Mol. Microbiol., John Innes Center, Norwich NR4 7UH. Библ. 104
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
АДАПТИВНЫЙ ОТВЕТ

ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА

ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

ГЕНЫ АДАПТИВНОГО ОТВЕТА

ТРАНСКРИПЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

МУЛЬТИДОМЕННЫЙ РЕГУЛЯТОРНЫЙ КОМПЛЕКС NIFL-NIFA

KLEBSIELLA PNEUMONIAE (BACT.)


Доп.точки доступа:
Martinez-Argudo, Isabel; Little, Richard; Shearer, Neil; Johnson, Philip; Dixon, Ray


10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.216

    Dixon, Ray.

    The oxygen-responsive NIFL-NIFA complex: A novel two-component regulatory system controlling nitrogenase synthesis in 'гамма'-proteobacteria [Text] / Ray Dixon // Arch. Microbiol. - 1998. - Vol. 169, N 5. - P371-380 . - ISSN 0302-8933
Перевод заглавия: Отвечающий на кислород комплекс NIFL-NIFA: новая двухкомпонентная регуляторная система, контролирующая синтез нитрогеназы у 'гамма'-Proteobacteria
Аннотация: Обзор. У 'гамма'-Proteobacteria регуляция экспрессии генов nif фиксации азота на уровне транскрипции осуществляется комплексом, состоящим из связывающегося с энхансером белка-активатора NIFA (I) и сенсорного белка NIFL (II), к-рый ингибирует активность I в ответ на источники фиксированного N и концентрацию O[2] в среде. Ингибирование I под действием II связано с прямым белок-белковым взаимодействием. II содержит ФАД, состояние окисления к-рого контролирует транскрипц. активацию под действием I. Образование ингибиторного комплекса регулируется также отношением АТФ/АДФ. Великобритания, Nitrogen Fixation Lab., John Innes Ctr., Norwich NR4 7UH. Библ. 66
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АЗОТФИКСАЦИЯ
МЕХАНИЗМ

ФЕРМЕНТЫ

НИТРОГЕНАЗА

СИНТЕЗ

РЕГУЛЯЦИЯ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

КОМПЛЕКС NIFL-NIFA

ФУНКЦИЯ

ГАММА-PROTEOBACTERIA (BACT.)



11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.09-04Б2.285

   

    The redox- and fixed nitrogen-responsive regulatory protein NIFL from Azotobacter vinelandii comprises discrete flavin and nucleotide-binding domains [Text] / Erik Soderback [et al.] // Mol. Microbiol. - 1998. - Vol. 28, N 1. - P179-192 . - ISSN 0950-382X
Перевод заглавия: Отвечающий на редокс-состояние и связанный азот белок NIFL из Azotobacter vinelandii состоит из дискретных флавинового и связывающего нуклеотиды доменов
Аннотация: Регуляторный флавопротеин NIFL (I) Azotobacter vinelandii модулирует активность транскрипционного активатора NIFA (II) в ответ на O[2] и связанный азот in vivo и АДФ in vitro. Ограниченный протеолиз показал, что I состоит из стабильного N-концевого домена (N-КД) и С-концевого домена (С-КД), защищенного от расщепления трипсином в присутствии АТФ или АДФ. АТФ (K[d]=130 мкМ) защищает I в окрестности сайтов связывания нуклеотидов (ССН), а АДФ (K[d]=16 мкм) - весь С-КД. Очищенный N-КД имеет такой же спектр поглощения, как целый I, и восстанавливается дитионитом Na, т. е. является доменом связывания флавина. Изолированный N-КД не ингибирует II, как и фрагмент С-КД длиной 160 остатков с ССН. Удаление первых 116 остатков I с консервативным S-мотивом (PAS-подобным доменом) устраняет редокс-ответ, но не способность ингибировать активность II в ответ на АДФ in vitro и на уровень связанного азота in vivo. Великобритания, Nitrogen Fixation Lab., John Innes Centre, Norwich Research Park, Colney, Norwich NR4 7UH. Библ. 34
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.25
Рубрики: АДАПТАЦИЯ
O[2]

СВЯЗАННЫЙ АЗОТ

МЕХАНИЗМ

РЕГУЛЯТОРНЫЕ БЕЛКИ

ФЛАВОПРОТЕИН NIFL

ФУНКЦИЯ

AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)


Доп.точки доступа:
Soderback, Erik; Reyes-Ramirez, Franscisca; Eydmann, Trevor; Austin, Sara; Hill, Susan; Dixon, Ray


12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 01.12-04Б2.174

    Dusha, Ilona.

    The upstream region of the nodD3 gene of Sinorhizobium meliloti carries enhancer sequences for the transcriptional activator NtrC [Text] / Ilona Dusha, Sara Austin, Ray Dixon // FEMS Microbiol. Lett. - 1999. - Vol. 179, N 2. - P491-499 . - ISSN 0378-1097
Перевод заглавия: Область, расположенная выше гена nodD3 Sinorhizobium meliloti, содержит энхансерные последовательности транскрипционного активатора NtrC
Аннотация: Экспрессия генов нодуляции nodABC Sinorhizobium meliloti регулируется в ответ на уровень фиксированного азота (аммиака). Ранее предполагалось, что ответ на статус азота опосредуется двухкомпонентной системой NtrB/NtrC, которая контролирует транскрипцию гена nodD3, кодирующего позитивный регуляторный белок, активатор транскрипции nodABC. С использованием футпринтинга ДНКазой I и анализа сдвига ЭФ-подвижности подтверждено, что NtrC, фосфорилированный NtrB, способен взаимодействовать с энхансерными последовательностями, расположенными выше гена nodD3. Предлагается модель, согласно которой функция NtrC состоит в регуляции транскрипции с 2 промоторов, расположенных в 5'-направлении от гена nodD3, в ответ на уровень фиксированного азота. Великобритания, Nitrogen Fixation Lab., John Innes Ctr, Colney, Norwich NR4 7UH. Библ. 30
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ГЕНЫ
ГЕН NODD3

ВЫШЕЛЕЖАЩАЯ ОБЛАСТЬ

ЭНХАНСЕРЫ

АКТИВАТОР ТРАНСКРИПЦИИ

NTRC

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ

SINORHIZOBIUM MELILOTI (BACT.)


Доп.точки доступа:
Austin, Sara; Dixon, Ray


13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 99.05-04Б2.224

   

    Torsional constraints on the formation of open promoter complexes on DNA minicircles carrying 'сигма'{54}-dependent promoters [Text] / Matloob Qureshi [et al.] // Biochemistry. - 1997. - Vol. 36, N 40. - P12303-12316 . - ISSN 0006-2960
Перевод заглавия: Торсионные ограничения на образование открытых промоторных комплексов на миникольцах ДНК, несущих зависящие от 'сигма'{54} промоторы
Аннотация: В отсутствие интеркалятов индивидуальные топоизомеры миниколец (МК) ДНК, содержащих 'сигма'{54}-зависимые промоторы nifL и nifF, можно разделить методом электрофореза, но при высокой отрицательной суперспирализации эта ДНК проявляет аномальное электрофоретич. поведение, указывающее на структурный переход. В присутствии фосфорилированного белка-активатора NTRC, АТФ и холофермента E'сигма'{54} РНК-полимеразы обнаружены сдвиги дискретных топоизомеров МК, связанные с образованием открытых промоторных комплексов (ОПК). На промоторе nifL ОПК образуются на всех отрицательно сверхскрученных топоизомерах и на кольцевой ДНК с однонитевым разрывом, но не на топоизомере с 'ДЕЛЬТА'Lk=0 и на положительно суперспирализованной ДНК. МК, несущие 'сигма'{54}-зависимый промотор glnAp2, не разрешаются методом электрофореза. С использованием сочетания футпринтинга KMnO[4] и релаксации ДНК-топоизомеразой I найдено, что, в отличие от промотора nifL, ОПК gln Ap2 образуется не только на отрицательно сверхскрученных топоизомерах, но и на релаксированной ДНК МК и на топоизомере с 'ДЕЛЬТА'Lk=+1. Эти данные указали на существование термодинамич. барьера для образования ОПК на МК с промотором nifL, но не с промотором glnAp2. Великобритания, Nitrogen Fixation Lab., John Innes Centre, Colney Lane, Norwich NR4 6SY. Библ. 42
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: ПРОМОТОРЫ
ПРОМОТОР E СИГМА 54 РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ

ОТКРЫТЫЙ КОМПЛЕКС

ОБРАЗОВАНИЕ

ТОРСИОННЫЕ ОГРАНИЧЕНИЯ

ESCHERICHIA COLI


Доп.точки доступа:
Qureshi, Matloob; Eydmann, Trevor; Austin, Sara; Dixon, Ray


14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 12.08-04Б2.173

   

    Transcriptional profiling of nitrogen fixation in Azotobacter vinelandii [Text] / Trinity L. Hamilton [et al.] // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, N 17. - P4477-4486 . - ISSN 0021-9193
Перевод заглавия: Транскрипционное профилирование фиксации азота в Azotobacter vinelandii
Аннотация: Считалось, что ряд nif-кодируемых компонентов участвуют в работе систем Vnf и Anf при фиксации азота в Azotobacter vinelandii. Транскрипционное профилирование, проведенное в культуре Azotobacter vinelandii при азот-фиксирующих условиях с различными металлами (Мо или V) выявило дискретные компоненты генов, связанных с каждой системой нитрогеназы и степень перекреста между этими системами. Помимо этого, изменения уровней транскриптов генов, не участвующих непосредственно в фиксации азота, обеспечили ясную картину интеграции центральных метаболических процессов и чувствительного к кислороду процесса фиксации азота в этом облигатном аэробе. Выявлены значительные отличия между Мо-зависимым и Мо-независимым диазотрофным ростом, свидетельствующие о важной роли Мо в диазотрофном росте культуры. США, Dep. of Chemistry and Biochemistry and Astrobiology Boigeocatalysis Research Center, Montana State Univ., Bozeman, Montana 59717
ГРНТИ  
ВИНИТИ 341.27.21.09.09.03
Рубрики: АЗОТФИКСАЦИЯ
МО

V МЕТАЛЛЫ

ТРАНСКРИПЦИОННОЕ ПРОФИЛИРОВАНИЕ

ГЕНЫ

ГЕНЫ, СВЯЗАННЫЕ С НИТРОГЕНАЗОЙ

ДИСКРЕТНЫЕ КОМПОНЕНТЫ

ВЫЯВЛЕНИЕ

AZOTOBACTER VINELANDII (BACT.)

ДИАЗОТРОФНЫЙ РОСТ


Доп.точки доступа:
Hamilton, Trinity L.; Ludwig, Marcus; Dixon, Ray; Boyd, Eric S.; Dos, Santos Patricia C.; Setubal, Joao C.; Bryant, Donald A.; Dean, Dennis R.; Peters, John W.


 




© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)