Главная Назад


Авторизация
Идентификатор пользователя / читателя
Пароль (для удалённых пользователей)
 

Вид поиска
Область поиска
Найдено в других БД
Формат представления найденных документов:
библиографическое описаниекраткийполный
Отсортировать найденные документы по:
авторузаглавиюгоду изданиятипу документа
Поисковый запрос: (<.>A=Кель, А. Э.$<.>)
Общее количество найденных документов : 15
Показаны документы с 1 по 15
1.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 96.12-04А3.661

   
    Компьютерная система "AutoGene" для автоматического анализа нуклеотидных последовательностей [Текст] / А. А. Птицын [и др.] // Молекул. биол. - 1996. - Т. 30, N 2. - С. 432-441 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Описана компьютерная система "AutoGene" для автоматического анализа нуклеотидных последовательностей; в ее состав входит ряд программ для комплексного анализа нуклеотидных последовательностей: выявления ALU- и LINE-элементов, поиска гомологий по банкам данных нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, выявления функциональных сигналов, предсказания потенциальных промоторных областей, экзонов, участков полиаденилирования. Реализованы возможность задания гибкого сценария работы системы и удобная выдача на экран компьютера результатов работы нескольких программ одновременно. Россия. Ин-т цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск. Библ. 28
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.17
Рубрики: НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ
АВТОМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ
КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА

Доп.точки доступа:
Птицын, А.А.; Рогозин, И.Б.; Григорович, Д.А.; Стрелец, В.Б.; Кель, А.Э.; Миланези, Л.; Колчанов, Н.А.

2.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.04-04А3.834

   
    Компьютерный анализ конформационных особенностей ДНК ТАТА-боксов промоторов эукариот [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // Молекул. биол. - 1997. - Т. 31, N 4. - С. 733-740 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Разработан метод выявления локальных конформационных особенностей сайтов связывания транскрипционных факторов, основанный на использовании конформационных параметров гексануклеотидных дуплексов B-формы ДНК и компьютерной системы SITEVIDEO. Проведенный анализ содержащих TATA-бокс последовательностей выявил наличие участков в промоторах, на к-рых средние значения ряда конформационных параметров B-формы ДНК значимо отличаются от их значений для случайных последовательностей. Установлено, что ДНК TATA-боксов имеет более низкий по сравнению со случайными последовательностями угол спирального вращения, меньшее расстояние между соседними парами оснований вдоль оси спирали ДНК, более широкий минорный желобок и более узкий главный. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, 630090. Библ. 34
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.09.99
Рубрики: ДНК
B-ФОРМА
ПРОМОТОРЫ
TATA-БОКСЫ
КОНФОРМАЦИОННЫЕ ОСОБЕННОСТИ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Пономаренко, Ю.В.; Кель, А.Э.; Колчанов, Н.А.; Карас, Х.; Вингендер, Э.; Скленар, Х.

3.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 99.06-04А3.9

   
    Компьютерное моделирование последовательностей ТАТА-боксов промоторов эукариот [Текст] / М. П. Пономаренко [и др.] // Докл. РАН. - 1997. - Т. 355, N 4. - С. 557-561 . - ISSN 0869-5652
Аннотация: К числу ключевых элементов промоторов эукариотических генов, транскрибируемых РНК-полимеразой II, относятся TATA-боксы, к-рые являются сайтами связывания TATA-связывающего белка (TBP). В работе с помощью технологии Site Video осуществлено исследование нуклеотидных последовательностей TATA-боксов и выявлены их контекстные особенности, определяющие эффективность TBP-TATA-связывания. На основе учета выявленных контекстных особенностей построен компьютерный метод оценки аффинности TBP к TATA-содержащему району промотора по его нуклеотидной последовательности. С помощью этого метода осуществлено компьютерное моделирование нуклеотидных последовательностей, обладающих максимальной аффинностью к TBP. Показано, что модельные последовательности достоверно сходны с TATA-содержащими районами природных промоторов по консенусам, по частотам нуклеотидов и по др. характеристикам. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск. Библ. 9
ГРНТИ  
34.55.15
ВИНИТИ 341.55.15.09
Рубрики: ДНК
ПРОМОТОР
TATA-БОКС
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
TATA-СВЯЗЫВАЮЩИЙ БЕЛОК
АФФИННОСТЬ
КОМПЬЮТЕРНЫЙ МЕТОД ОЦЕНКИ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Пономаренко, М.П.; Савинкова, Л.К.; Кель, А.Э.; Колчанов, Н.А.

4.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 01.03-04А3.654

   
    GeneExpress: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот [Текст] / Н. А. Колчанов [и др.] // Биофизика. - 1999. - Т. 44, N 5. - С. 837-841 . - ISSN 0006-3029
Аннотация: Текущая версия интегратора GeneExpress включает 5 основных информационно-вычислительных систем: 1) базу данных TRRD по регуляторным районам транскрипции эукариотических генов с программой ScanGroup для распознавания и анализа сайтов связывания транскрипционных факторов; 2) базу данных ACTIVITY по количественной активности функциональных сайтов ДНК и РНК с базой знаний по программам их предсказания; 3) базу данных LeaderRNA по влиянию лидерных последовательностей мРНК на эффективность их транскрипции; 4) базу данных SAMPLES по выборкам нуклеотидных последовательностей экспериментально установленных функциональных сайтов ДНК и их множественным выравниваниям с программами распознавания этих сайтов по их консенсусам, частотным матрицам и статистически значимым особенностям конформации их B-спирали ДНК; 5) базу данных GeneNet по генным сетям и путям сигнальной трансдукции, к-рая осуществляет интеграцию всех остальных информационно-вычислительных систем на основе взаимосвязей между описываемыми в них биологическими процессами и явлениями, http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/systems/GeneExpress/. Россия, Ин-т цитологии и генетики СО РАН, 630090, Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева 10. Библ. 1
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.15.02
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
ИНТЕГРАТОР GENEEXPRESS
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ

Доп.точки доступа:
Колчанов, Н.А.; Пономаренко, М.П.; Кель, А.Э.; Кондрахин, Ю.В.; Фролов, А.С.; Колпаков, Ф.А.; Горячковская, Т.Н.; Кель, О.В.; Ананько, Е.А.; Игнатьева, Е.В.

5.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 01.08-04А3.57

   
    Базы данных по регуляции экспрессии генов эукариот [Текст] / Е. А. Ананько [и др.] // 2-й Съезд. биофизиков России, Москва, 23-27 авг., 1999. - М., 1999. - Т.3. - С. 928-929 . - ISBN 5-201-14417-9
ГРНТИ  
34.03.23
ВИНИТИ 341.03.23.09.09
Рубрики: БАЗЫ ДАННЫХ
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
РЕГУЛЯЦИЯ
ЭУКАРИОТЫ

Доп.точки доступа:
Ананько, Е.А.; Подколодная, О.А.; Игнатьева, Е.В.; Кель, А.Э.; Колпаков, Ф.А.; Кель-Маргулис, О.В.; Меркулова, Т.И.; Подколодный, Н.Л.; Фролов, А.С.; Григорович, Д.А.; Степаненко, И.Л.; Горячковская, Т.Н.; Ромащенко, А.Г.; Колчанов, Н.А.

6.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI28) 14.03-04Н3.84

   
    Снижение цитотоксического действия Nutlin3 на клетки H292 немелкоклеточного рака легких, инфицированного микоплазмой [Текст] / У. А. Боярских [и др.] // Технол. жив. систем. - 2013. - Т. 10, N 7. - С. 45-51 . - ISSN 2070-0997
Аннотация: Выявлено, что длительное персистирование микоплазмы вида M. hyorhinis в культуре клеток Н292 приводит к снижению чувствительности клеток к цитотоксическому Nutlin3. Другим проявлением микоплазменной инфекции была эпителиально мезенхимальная трансформация культуры клеток. Сравнение транскрипционных профилей, инфицированных и неинфицированных микоплазмой клеток, показало активацию интерферон-зависимого сигнально пути JAK-STAT, сигнального пути NF'каппа'B и, вероятно, сигнального пути TGFb, а также активацию р53-зависимых механизмов апоптоза. Основным первичным механизмом, обусловливающим устойчивость инфицированных микоплазмой клеток к действию Nutlin3, вероятнее всего, является активирвоание сигнального NF'каппа'B. Россия, Ин-т хим. биол. фунд. мед., СО РАН, Новосибирск. Библ. 15
ГРНТИ  
76.29.49
ВИНИТИ 761.29.49.55.07.09.99
Рубрики: ОПУХОЛИ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ
РАК ЛЕГКОГО НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНЫЙ
ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ СРЕДСТВА
NUFLIN3
МИКОПЛАЗМА
ТРАНСКРИПТОМ
АПОПТОЗ
IN VITRO

Доп.точки доступа:
Боярских, У.А.; Жечев, Д.А.; Козлов, В.А.; Сметанина, М.А.; Кель, А.Э.; Филипенко, М.Л.

7.
РЖ ВИНИТИ 76 (BI29) 14.03-04Н1.115

   
    Снижение цитотоксического действия Nutlin3 на клетки H292 немелкоклеточного рака легких, инфицированного микоплазмой [Текст] / У. А. Боярских [и др.] // Технол. жив. систем. - 2013. - Т. 10, N 7. - С. 45-51 . - ISSN 2070-0997
Аннотация: Выявлено, что длительное персистирование микоплазмы вида M. hyorhinis в культуре клеток Н292 приводит к снижению чувствительности клеток к цитотоксическому Nutlin3. Другим проявлением микоплазменной инфекции была эпителиально мезенхимальная трансформация культуры клеток. Сравнение транскрипционных профилей, инфицированных и неинфицированных микоплазмой клеток, показало активацию интерферон-зависимого сигнально пути JAK-STAT, сигнального пути NF'каппа'B и, вероятно, сигнального пути TGFb, а также активацию р53-зависимых механизмов апоптоза. Основным первичным механизмом, обусловливающим устойчивость инфицированных микоплазмой клеток к действию Nutlin3, вероятнее всего, является активирвоание сигнального NF'каппа'B. Россия, Ин-т хим. биол. фунд. мед., СО РАН, Новосибирск. Библ. 15
ГРНТИ  
76.29.49
ВИНИТИ 761.29.49.19.19
Рубрики: ОПУХОЛИ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ
РАК ЛЕГКОГО НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНЫЙ
ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ СРЕДСТВА
NUFLIN3
МИКОПЛАЗМА
ТРАНСКРИПТОМ
АПОПТОЗ
IN VITRO

Доп.точки доступа:
Боярских, У.А.; Жечев, Д.А.; Козлов, В.А.; Сметанина, М.А.; Кель, А.Э.; Филипенко, М.Л.

8.
Патент 0002509808 Российская Федерация, МКИ C12Q 1/68.

   
    Способ определения чувствительности клеток немелкоклеточного рака легких к действию препаратов, реактивирующих белок р53 [Текст] / М. Л. Филипенко [и др.] ; ИХБФМ СО РАН. - № 2012146004/10 ; Заявл. 30.10.2012 ; Опубл. 20.03.2014
Аннотация: Изобретение относится к области онкологии и молекулярной биологии. Предложен способ определения чувствительности клеток немелкоклеточного рака легких к действию препаратов, реактивирующих р53 белок, включающий выделение РНК из образцов, синтез кДНК генов CDKN1A, ВТG2 и E2F1 методом обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции с детекцией результатов в режиме реального времени с последующим определением соотношения количества кДНК гена E2F1 к количеству кДНК гена CDKN1A или гена BTG2, где при величине соотношения E2F1/CDKN1A3 или E2FI/BTG21,5 считают клетки немелкоклеточного рака легких чувствительными к препаратам, реактивирующим белок р53. Изобретение может быть использовано при лечении онкологических заболеваний.Ил.3. Табл.3
ГРНТИ  
76.29.49
ВИНИТИ 761.29.49.55.07.05.99
Рубрики: ОПУХОЛИ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ
РАК ЛЕГКОГО
ХИМИОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ СРЕДСТВА
ГЕНЫ-СУПРЕССОРЫ
Р53
РЕАКТИВАЦИЯ
IN VITRO

Доп.точки доступа:
Филипенко, М.Л.; Боярских, У.А.; Сметанина, М.А.; Кель, А.Э.; ИХБФМ СО РАН
Свободных экз. нет
9.
Патент 0002509808 Российская Федерация, МКИ C12Q 1/68.

   
    Способ определения чувствительности клеток немелкоклеточного рака легких к действию препаратов, реактивирующих белок р53 [Текст] / М. Л. Филипенко [и др.] ; ИХБФМ СО РАН. - № 2012146004/10 ; Заявл. 30.10.2012 ; Опубл. 20.03.2014
Аннотация: Изобретение относится к области онкологии и молекулярной биологии. Предложен способ определения чувствительности клеток немелкоклеточного рака легких к действию препаратов, реактивирующих р53 белок, включающий выделение РНК из образцов, синтез кДНК генов CDKN1A, ВТG2 и E2F1 методом обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции с детекцией результатов в режиме реального времени с последующим определением соотношения количества кДНК гена E2F1 к количеству кДНК гена CDKN1A или гена BTG2, где при величине соотношения E2F1/CDKN1A3 или E2FI/BTG21,5 считают клетки немелкоклеточного рака легких чувствительными к препаратам, реактивирующим белок р53. Изобретение может быть использовано при лечении онкологических заболеваний.Ил.3. Табл.3
ГРНТИ  
76.29.49
ВИНИТИ 761.29.49.03.05
Рубрики: ОПУХОЛИ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ
РАК ЛЕГКОГО
ХИМИОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ
ПРОТИВООПУХОЛЕВЫЕ СРЕДСТВА
ГЕНЫ-СУПРЕССОРЫ
Р53
РЕАКТИВАЦИЯ
IN VITRO

Доп.точки доступа:
Филипенко, М.Л.; Боярских, У.А.; Сметанина, М.А.; Кель, А.Э.; ИХБФМ СО РАН
Свободных экз. нет
10.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI07) 89.04-04А1.98

    Колчанов, Н. А.
    Конвергентное происхождение повторов в генах, кодирующих глобулярные белки. Моделирование конвергентного возникновения прямых повторов [Текст] / Н. А. Колчанов, А. Э. Кель, В. В. Соловьев // Ж. общ. биол. - 1988. - Т. 49, N 6. - С. 723-728
Аннотация: Для выяснения относит. роли различных факторов, влияющих на наличие повторов в генах, кодирующих глобулярные белки, исследована стохастическая модель эволюции полинуклеотидных последовательностей, кодирующих глобулярные белки. Моделировалась эволюция группы макромолекул под действием случайного мутирования и отбора, направленного на возникновение гена, к-рый имеет частоты использования кодонов, характерные для реальных генов E. coli, и кодирует белок, содержащий 'альфа'-спирали с х-ками, близкими к тем, к-рые наблюдаются для реальных 'альфа'-спиралей. Показано, что таких ограничений, накладываемых на первичную структуру генов со стороны пространственной структуры кодируемых ими белков, а также со стороны системы трансляции (в виде неравномерности частот использования кодонов), достаточно для возникновения в генах прямых повторов с х-ками, близкими к реальным. СССР, Ин-т цитологии и генетики СО АН СССР, Новосибирск. Библ. 5.
ГРНТИ  
34.03.17
ВИНИТИ 341.03.17.27.02
Рубрики: МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ
ГЕНЫ
ГЛОБУЛЯРНЫЕ БЕЛКИ
МАТЕМАТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ
НУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
МУТАЦИИ
ОТБОР
БЕЛКИ
СТРУКТУРА
ТРАНСЛЯЦИЯ

Доп.точки доступа:
Кель, А.Э.; Соловьев, В.В.

11.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.349

    Кель, А. Э.
    Теоретический анализ механизмов возникновения делеций ДНК в геномах прокариот на основе прямых повторов [Текст] / А. Э. Кель, Н. А. Колчанов, В. В. Соловьев // Молекул. биол. - 1989. - Т. 23, N 1. - С. 184-192 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: Теоретически рассмотрен механизм возникновения делений на основе неправильного спаривания комплементарных участков ДНК, входящих в прямые повторы. Построена количественная зависимость частот возникновения делеций от таких параметров фланкирующих их повторов, как нуклеотидный состав повторов, количество нарушений гомологии и расстояние между повторенными фрагментами. Оказалось, что используя эту зависимость, можно достоверно оценить реальные частоты возникновения делений в последовательности гена lacI Escherichia coli по картине распределения повторов в этом гене. Библ. 10.
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПРОКАРИОТЫ
ГЕНЫ
ГЕН LACI
ДЕЛЕЦИИ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ПРЯМЫЕ ПОВТОРЫ
ТЕОРЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

Доп.точки доступа:
Колчанов, Н.А.; Соловьев, В.В.

12.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.06-04Б2.350

    Колчанов, Н. А.
    Статистическое доказательство связи делеций ДНК в геномах прокариот с прямыми повторами [Текст] / Н. А. Колчанов, А. Э. Кель, В. В. Соловьев // Молекул. биол. - 1989. - Т. 23. - С. 175-183 . - ISSN 0026-8984
Аннотация: С помощью метода статистических весов проведен компьютерный анализ локализации делеций в последовательности lacI гена Escherichia coli. Выявлена достоверная статистическая связь мест локализации делеций с расположением наиболее совершенных прямых повторов с наименьшим расстоянием между повторяющимися фрагментами. Статистический анализ не выявил достоверной связи мест локализации делеций с предполагаемыми участками узнавания гиразы, chi-участками и другими возможными местами рекомбинации. По-видимому, в геномах прокариот преобладает механизм возникновения делеций на основе повторов. Библ. 26.
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.09.03.03
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
ПРОКАРИОТЫ
ГЕНЫ
ГЕН LACI
ДЕЛЕЦИИ
КОРРЕЛЯЦИЯ
ПРЯМЫЕ ПОВТОРЫ
МАШИННАЯ ОБРАБОТКА

Доп.точки доступа:
Кель, А.Э.; Соловьев, В.В.

13.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI12) 89.08-04Б2.383К

    Кель, А. Э.
    Нестабильность геномов прокариот по отношению к повторам. 2. Эволюция геномов прокариот [Текст] / А. Э. Кель, Н. А. Колчанов, В. В. Соловьев. - Препр. - Новосибирск : [б. и.], 1988. - 38 с. : ил.
Аннотация: На основании полученных авторами ранее данных о зависимости частот делеций и дупликаций в геномах прокариот от параметров фланкирующих их повторов, построена стохастическая модель эволюции различных повторяющихся последовательностей в геномах прокариот. Оказалось, что в ходе эволюции протяженные кластеры тандемных повторов и протяженные диспергированные повторы должны элиминироваться из генома за 10{3}-10{5} поколений. Этот феномен назван структурной нестабильность геномов прокариот по отношению к повторам. Сравнение темпов перестроек ДНК на основе прямых повторов в различных районах генома E. coli показало, что потенциальная частота возникновения делеций и дупликаций в регуляторных зонах выше, чем в кодирующих частях генов. Предполагается, что такие характерные особенности геномов прокариот как низкое содержание различных повторов, отсутствие тандемно организованных кластеров повторов и др. можно объяснить нестабильностью этих геномов. Ил. 6. Табл. 3. Библ. 40. Ин-т цитологии и генетики СО АН СССР, Новосибирск.
ГРНТИ  
34.27.21
ВИНИТИ 341.27.21.02.09
Рубрики: ESCHERICHIA COLI (BACT.)
НЕСТАБИЛЬНОСТЬ ГЕНОМА
ДЕЛЕЦИИ
ДУПЛИКАЦИИ
КОНЦЕВЫЕ ПОВТОРЫ
ЭВОЛЮЦИЯ
СТРУКТУРА ГЕНОМА
ОБЗОРЫ
БИБЛ. 40

Доп.точки доступа:
Колчанов, Н.А.; Соловьев, В.В.
Свободных экз. нет
14.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 90.09-04А3.14

    Кель, А. Э.
    Компьютерное моделирование процесса трансляции [Текст] / А. Э. Кель, И. В. Ищенко, Л. В. Омельянчук // Компьютер. анал. структуры, функции и эволюции генет. макромолекул. - Новосибирск, 1989. - С. 155-167
Аннотация: Описывается компьютерная модель процесса трансляции, учитывающая влияние вторичной структуры мРНК на элонгацию рибосом. Дается описание вторичной структуры мРНК, обсуждаются особенности моделирования элементарных актов трансляции. В предлагаемой модели движение группы рибосом вдоль матрицы описывается с помощью пошагой стохастической процедуры. Описываются входные и выходные данные модели. Отмечается возможность ее использования для оценивания эффективности процесса трансляции мРНК с учетом параметров ее вторичной структуры (энергетическая стабильность шпилек, кол-во комплементарных пар в них, конкретное расположение шпилек в мРНК, время их плавлени я и т. д.). Приводится пример использования модели для оценки константы плавления. СССР, ИЦиГ СО АН СССР, г. Новосибирск. Библ. 13.
ГРНТИ  
34.55.15
ВИНИТИ 341.55.15.09
Рубрики: ИМИТАЦИОННЫЕ МОДЕЛИ
МАКРОМОЛЕКУЛЫ
МРНК
ТРАНСЛЯЦИЯ
ЭЛЕМЕНТАРНЫЕ АКТЫ
ПЛАВЛЕНИЕ

Доп.точки доступа:
Ищенко, И.В.; Омельянчук, Л.В.

15.
РЖ ВИНИТИ 34 (BI38) 90.09-04А3.508

   
    Компьютерная система анализа функциональных сайтов в полинуклеотидных последовательностях [Текст] / А. Э. Кель [и др.] // Компьютер. анал. структуры. функции и эволюции генет. макромолекул. - Новосибирск, 1989. - С. 221-242
Аннотация: Описывается 1-ая часть компьютерной системы, ориентированной на поиск закономерностей в распределении олигонуклеотидов и повторов различных типов в функциональных сайтах. На основе обучающей выборки функциональных сайтов в процессе работы системы производится вычисление большого кол-ва х-к, отражающих насыщенность определенными олигонуклеотидами и повторами функциональных сайтов. Информативность каждой х-ки оценивается с помощью комплекса программ статистического анализа. Из всего множества х-к выбирается набор информационно значимых. На их основе возможен поиск в нуклеотидных последовательностях функциональных сайтов определенного типа. Существенно, что в предлагаемом подходе производится автоматический выбор определенного набора информационно-значимых х-к без задания жесткого априорного предпочтения тем или иным х-кам и без формирования жесткой модели исследуемого функционального сайта. В качестве иллюстрации проводится анализ 2-х выборок функциональных сайтов прокариотических генов. ИЦиГ СО АН СССР, г. Новосибирск. Библ. 13.
ГРНТИ  
34.05.25
ВИНИТИ 341.05.25.09.17
Рубрики: АВТОМАТИЗАЦИЯ ИССЛЕДОВАНИЙ
КОМПЬЮТЕРНЫЕ СИСТЕМЫ
МАКРОМОЛЕКУЛЫ
ПОЛИНУКЛЕОТИДНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ
ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ САЙТЫ

Доп.точки доступа:
Кель, А.Э.; Пономаренко, М.П.; Орлов, Ю.Л.; Мищенко, Т.М.; Колчанов, Н.А.
 
Описание базы
Стандартный
По словарю
Расширенный
Профессиональный
Распределенный
ГРНТИ



"Электронные каталоги и базы данных библиотек СО РАН"
© Международная Ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий
(Ассоциация ЭБНИТ)